3QM3A

1.85 angstrom resolution crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase (fba) from campylobacter jejuni
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
355
structure length
350
Chain Sequence
AMGVLDIVKAGVISGDELNKIYDYAKAEGFAIPAVNVVGTDSINAVLEAAKKVNSPVIIQFSNGGAKFYAGKNCPNGEVLGAISGAKHVHLLAKAYGVPVILHTDHAARKLLPWIDGLIEANAQYKKTHGQALFSSHMLDLSEESLEENLSTCEVYLQKLDALGVALEIELGCTGGDNTGIDNSKLYTQPEDVALAYERLGKISDKFSIAASFGNVHGVYKPGNVSLQPEILKNSQKFVKDKFALNSDKPINFVFHGGSGSELKDIKNAVSYGVIKMNIDTDTQWAFWDGVREYELKNRAYLQGQIGNPEGDDKPNKKYYDPRVWLRSGEESMIKRLEIAFEDLNCINKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 1.85 Angstrom Resolution Crystal Structure of Fructose-bisphosphate Aldolase (Fba) from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Campylobacter jejuni
total genus 140
structure length 350
sequence length 355
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qm3A00
1I2RA 1EUNA 3GKFA 4M6PA 1WQ5A 1IIGA 2C13A 5CPOA 3TW7A 1JCJA 1Q3NA 3MP4A 1M6JA 3LLFA 4WJEA 2JGYA 5F1VA 4JR5A 2GUUA 3IIPA 1P0NA 4ZVJA 3W7PA 5FEPA 4N9CA 3NXFA 3FYOA 3EX1A 4UFKA 3U6WA 1H7WA 5C6MA 3W2NA 4JXCA 3LERA 4RZ6A 3M5XA 1FBAA 1HUVA 1TTJA 1TPUA 5D38A 3W1PA 1MZHA 1PHWA 5KMYA 4Q32A 2E5BA 4H6KA 3HF3A 3G1AA 1TPVA 3P74A 2G96A 1VGAA 4O12A 2VFIA 1LOSA 1LM1A 2A21A 1PCWA 5F4XA 1JUBA 4IWWA 2YGYA 1OFPA 3GLCA 2XFWA 3QW4B 3HGJA 2QCCA 1GT8A 2H8XA 3HG4A 5AB3A 3EXSA 4K8EA 4P2VA 3HGRA 3TU9A 1OX4B 2V82A 5F2MA 4AF0A 5EMUA 4CNPA 4NZJA 1WX0A 2C14A 3HOJA 4FB7A 4JY9A 5CSSA 3FOKA 5CG7A 1YDNA 3OVRA 4P61A 4YWIA 4FNSA 2HMCA 3NL6A 1S5TA 2ZRYA 5HUOA 3UXAA 3IVSA 3GVGA 3P81A 4K39A 1TQXA 1JCNA 1GYLA 2CWNA 3TR2A 3G18A 5CPNA 3S9YA 3GDMA 3G8EA 4O13A 2E09A 3LXAA 1DVJA 1G69A 6TIMA 2PRMA 5HINA 5AFDA 3RMJA 3R12A 4PODA 3TH6A 1B4KA 4XQ6A 1VCFA 5EBUA 4W9TA 4MFEA 2A4AA 4DO4A 4Z1AA 1F2JA 4UC5A 4GRSA 3LGEA 4Y96A 1Z41A 1K3UA 3NQ7A 3TW6A 4CNNA 5LZLA 4JTGA 4X3ZA 3TQ0A 2A85A 3O6DA 1A5AA 1VPXA 4HKPA 1ICPA 3TXVA 1HL2A 1LROA 1FDJA 1NAL1 3NM3A 5D30A 3PUDA 5K9CA 3JR2A 3F4NA 4S2CA 4X9SA 3O15A 3VNDA 1Z42A 3EKZA 5E93A 1VCGA 4N02A 4UFHA 1PL9A 3EWUA 4WY0F 2ZZ2A 3O05A 4BFAA 4JN6A 2EKCA 3NQ6A 1N8FA 2A7RA 4OQVA 1UCWA 4UTMA 5D2WA 2CW6A 4JTFA 1W54A 1NSJA 3SZ8A 1L6WA 3CWNA 2VFEA 2YFNA 4Z1DA 3T44A 3LRLA 5CZ0A 3VI2A 2Q3OA 4ONVA 1ME8A 3RLUA 3PR2A 3G1DA 4HNNA 1ZCOA 3GDKA 1SR9A 2QDHA 3B0VC 2VOMA 2J24A 3NQMA 2NWSA 4N2YA 2AGKA 2BZNA 3WK1A 2CLKA 4JTUA 2R14A 3NPXA 1QCWA 2X30A 3LHTA 2PE4A 5F4WA 3RFAA 3U8GA 1F7BA 4IMFA 4BK9A 1QPOA 3WK0A 1XBZA 5LNRA 3IGXA 1ZENA 3Q2DA 4JTEA 5K2ZA 4TMBA 3BGJA 2D73A 3C3NA 3G0UA 3STCA 3W2LA 4MY9A 1I45A 4I7WA 4CCCA 1NVMA 3QZEA 4FIQA 2ATSA 3MJYA 4Z0JA 1NF0A 1PS9A 1GYNA 3E12A 2YFOA 1C29A 4O18A 2V30A 1ZHAA 1K03A 1V7YA 2WJZA 1RR2A 3Q58A 4LVGA 3T78A 5C54A 5KSWA 3R89A 3BGGA 4KKXA 1EIXA 1SFLA 2FDSA 2A1YA 4FNTA 4N6EA 3QPYA 4TR9A 2DZXA 2ZCGA 2ZA3A 1X1ZA 1IF2A 4HHPA 2YCEA 3QRHA 5D2XA 3W7RA 3MW7A 1KM1A 1M5WA 3GDLA 4NU7A 5LHFA 4O14A 4RX0A 2C6QA 4LOCA 5U4NA 1F73A 4R34A 4PC8A 1TRDA 5J5DA 2EHHA 1G4TA 1U5JA 2OT1A 4UCGA 1KFJA 3NQGA 2AQWA 3QYQA 1H1YA 3GXNA 4I7VA 1S3HA 3W84A 1LZOA 4JDBA 2GVLA 3W1RA 3O06A 3CEUA 5DXXA 3L2IA 4O57A 1QO5A 4O28A 3C56A 2W79A 5I3FA 1D3GA 3P82A 1JRBA 4WY0B 3KX6A 1KM0A 1AL8A 3VE7A 4NNCA 2AAMA 2NX1A 1F76A 3ANYA 3NQ2A 2ZZ3A 3DAQA 3MO7A 3UY8A 5AN7A 2JK2A 4M19A 2NXHA 3BV4A 4IMGA 5K4ZA 1YXYA 2QUUA 3UWVA 1LRNA 3LOTA 3BO9A 1ZAHA 4LNYA 3A5FA 1W8SA 1ZAJA 1BKSA 1HO1A 3LTSA 1FWNA 2DZUA 2ZRZA 3PG8A 3ZFHA 3HGOA 3IIZA 1BTMA 3LCFA 2CZDA 3KVMA 2A2IA 4O11A 3W76A 4Z08A 2OZ0A 1VR6A 1HFBA 5H2ZA 4O0ZA 1Q6RA 3W3OA 5D32A 4JS3A 3PWAA 2J88A 3EKLA 3QSRA 4BR1A 5LKYA 3TQVA 1M7PA 3HPSA 2VFHA 1VLWA 4LVBA 2Y7GA 4CNOA 4M5PA 1GG0A 2RDTA 3NAVA 2ZRWA 4JYFA 3E02A 4MYXA 3S1UA 5F2GA 3MBFA 3NQ8A 4EWND 3TSDA 1QPNA 2NXIA 4O0KA 3UWYA 1EB3A 4IPIA 4UFIA 1EP3A 4DBEA 3LLDA 1L6SA 2CZFA 1QOQA 1TPEA 4IJBA 1GJPA 2WOQA 1OYAA 4FNPA 4LC8A 1KM6A 2JGQA 2A6LA 4YCPA 1YDVA 2NUYA 3S6DA 1MEHA 4XZ9A 3NDOA 1JCYA 4BWLC 4R7JA 3PBYA 3G0SA 1P1XA 4GXMA 3EWWA 5CPLA 4WUIA 3M1ZA 3LCLA 3LCIA 3MP5A 3IGUA 1NF7A 1O94A 1AMKA 2DORA 3KRSA 3B0UX 3L66A 3EB2A 3NOEA 4MPQA 1H63A 1H50A 1FWTA 2FFCA 3L0NA 3M6YA 2VEMA 5SWUA 5F4SA 3HPXA 4I9AA 1SW7A 1TTQA 1L6YA 1VYSX 3RNDA 4S2BA 2NLIA 5LGZA 4DF0A 3G1SA 5F2LA 5H91A 5D05A 5GVJA 3DFNA 3GK0A 2Z6IA 3T55A 3WJWA 4LS0A 5CGQA 4ADTA 1GTEA 3N2XA 3BW2A 4X2RA 5K3VA 2BWGA 5AYZA 1GVOA 5EYWA 3M16A 3P67A 2QCEA 2GVJA 4E0CA 2VELA 2LLEA 3C2OA 1FXPA 2HS6A 1H7XA 1F5ZA 5IBXC 1MEWA 3G1FA 2V9DA 3GX9A 4YLWA 4A21A 1EWEA 1JJKA 3G1XA 3SY5A 2TYSA 1XFBA 3C61A 4PEKA 3HIJA 3ABRA 4E2DA 3M5YA 2OCZA 4GNJA 1TPWA 3W75A 4C1LA 5EKYA 2YPIA 3LI0A 2FB3A 2QJGA 4YXGA 3LM7A 3QMRA 3TROA 2ZQ0A 2ISVA 3W7MA 4RZ4A 4IMCA 5T26A 3ZWSA 1SZFA 2BTMA 3W7CA 1QR7A 1JVNA 1GZGA 3QMSA 4DO5A 1THFD 1TV7A 1O95A 4HN4A 1H7NA 2X1RA 1LOQA 2VC6A 2ZTKA 3UD6A 2TMDA 1XBYA 1OX6A 4JTJA 1R2SA 3VE9A 2YYUA 2ZA2A 5KZMA 1O5XA 1YPIA 1SO6A 5FF3A 4AMAA 4PFMA 1LBLA 2DZVA 2EGZA 4LRTA 4DQWA 4E38A 3DFQA 3CEPA 1OFQA 5D09A 2CLIA 1W5OA 5J5RA 2DJLA 1WXJA 1RQBA 1ZALA 3HG2A 1LRTA 1VZWA 1QAPA 3IIVA 1C9DA 3W1TA 1W1ZA 2CZ5A 2Z0IA 3MHFA 1GVQA 1S5WA 2WNZA 3BLFA 2QAFA 3EX3A 3SGZA 3W6YA 3DI1A 3GNNA 3LXCA 3G8RA 3UWZA 1HG3A 4PL1A 5C55A 3QF0A 1OFOA 1K02A 4LV9A 2QCDA 4LU0A 4AWUA 2WSQA 5FF4A 2VFGA 1SO4A 1FDZA 2H8ZA 3BW4A 1A53A 1I8JA 2YW4A 2ZRVA 2ZDRA 3M44A 1KTNA 3PF3A 4TIMA 3S1XA 3IEBA 3PG9A 3GNDA 1UBSA 2Z2UA 1JULA 1G67A 3TXZA 2EAWA 4YMZA 1B4EA 4FIRA 4AHOA 1YXDA 4N6FA 3NL3A 4OBTA 3SJ3A 3HB9A 3GZ3A 2OX1A 1O4UA 2TRSA 4GUJA 3MYOA 4R33A 2O7QA 4UFLA 4CQAA 3GAKA 3N2MA 3EWBX 3UWQA 4NNAA 3A22A 3PB0A 3H53A 3HGSA 1XUZA 2W6RA 2ZA1A 1SZNA 1RVGA 4ML9A 2G5WA 3DKLA 2P0OA 5E0KA 4ZQNA 2TSYA 1W5QA 3UWUA 1XUUA 3ZR4A 4QQ3A 2A0NA 3TE9A 1ME7A 4TU1A 2C16A 3MHGA 1ZFJA 2QCLA 4AF0B 4LC6A 3MMTA 1OK6A 5TBOA 3GR7A 4OWGA 1L9WA 3EEGA 4Q4KA 5F2IA 3DFSA 2BLEA 3PBUA 4IMDA 3DHDA 1TO3A 2ZYFA 4Y9AA 5AYXA 4XKYB 4HNTA 3LCWA 3DI0A 1ADOA 1G4PA 3IIXA 5AC8A 2QDGA 1G6CA 4NVTA 3G1YA 3PB2A 1NEYA 3C52A 4X22A 1SO3A 2V2DA 3LBMA 3PY2A 3O6CA 4ICNA 3PAJA 1W31A 3TQKA 1XL9A 3C2VA 1DORA 2H3BA 1TYGA 1FX6A 1WBJA 5KTLA 3UYCA 3OG3A 4RK8A 3B0PA 4UMBA 3LHVA 2RH9A 3DKJA 4HPXA 2C1HA 5BMWA 4BF9A 1GG1A 4MFDA 3TMLA 3CLMA 1FWWA 1KFEA 1FCUA 1WAUA 4M6QA 3NQFA 4OE7A 1SFJA 1OG0A 3BLIA 3LTYA 2QR6A 5G5IA 2CLOA 3C6CA 3M0ZA 1W37A 1FQ0A 1Y0EA 4XBSA 3GDTA 4S1FA 1F05A 4I7UA 5EY5A 3BARA 1EEPA 4O19A 5DBUA 4WXZA 5HWMA 3IVTA 1DL3A 4K7YA 1RQEA 3DENA 4MJMA 2Q3RA 1J5TA 1DOSA 5K7JA 2CLFA 2OJPA 4WOZA 1UB3A 3W7GA 1H61A 4YCOA 1XBVA 4LTSA 3W7KA 1I2PA 1KFCA 3W2MA 2X1UA 2YYTA 5A5WA 5G1YA 1KM5A 4CCDA 1EP1A 4DF2A 3W1NA 4QAIA 2ATMA 5G1TA 3NL5A 3DXIA 1WOBA 3P61A 1OFEA 8TIMA 3QMTA 1H51A 3UZJA 1XDMA 2I14A 3S1VA 1AW2A 4AHQA 5D33A 4UTWA 4AB4A 1AL7A 4GJ1A 3D0CA 1GVRA 2ZZ4A 4PCFA 1XCFA 1KM3A 1T99A 4ZQMA 1Z44A 2Y70A 1VH7A 4Q33A 3GDRA 1AW1A 2TPSA 3PVFA 3LCGA 4JYDA 1OYCA 1EPXA 4JX4A 3BG5A 1SPQA 3P8IA 4EVZA 3F03K 4FNUA 1TPC1 2ISSA 3ATYA 3O07A 2YXGA 1B57A 3OIXA 4MIMA 4XTDA 3W7NA 3O16A 4NX0A 5ABTA 4UR7A 5I3GA 3P5ZA 5KITA 1SU5A 1ZNNA 1MO0A 5DBTA 2Y63A 4NT0A 4NJIA 2PRLA 1VHCA 2VFFA 2PC4A 3V75A 4GC4A 5DCDA 1GQNA 2WNQA 2H3DA 3LHWA 4UFMA 2E5DA 5A8GA 1LCOA 1DJNA 3B03A 1XXXA 3LI1A 3N14A 4Z1BA 3FEMA 3EX4A 4HSOA 1LP6A 4FHAA 3B06A 3PULA 4QISA 5DY3A 2X16A 1PE1A 1GVSA 2J9YA 4LS2A 4EIVA 1KA9F 3DU0A 2BSLA 1M7OA 1O60A 4PL2A 3MYPA 4FF7A 4K8HA 5HR7A 4MY1A 3QJAA 1KM4A 3TA6A 1JQXA 3UY7A 5AC6A 1OF8A 2GQ9A 3P5YA 1I2QA 1FWSA 4MLRA 1D9EA 1T8XA 1IXOA 1ICSA 2ALDA 4PH6A 4OV9A 2ZZ7A 4GE8A 2Y89A 4HNUA 1TCDA 5DXYA 3TSMA 1QO2A 2HS8A 2JKPA 1GPWA 4U28A 4H4IA 5LHEA 1KM2A 3N9SA 5DN1A 4JIQA 2ZZ6A 4RKAA 1TPB1 3OBKA 4O1BA 2KZHA 1A5BA 5DLCA 4ZQPA 3B4UA 1QMLA 1KBIA 1CW2A 4JDYA 4PA8A 4UTIA 1BEUA 3TV8A 4UUIA 2C19A 4N4PA 3F1QA 3TC7A 1A5CA 3LHYA 4TX9A 4WOQA 4RZ5A 5LNSA 3PUOA 3LV6A 5K9XA 3A24A 1CX9A 2JKAA 3MI2A 1TRIA 4KWWA 3W88A 3TCEA 3LV5A 3HO8A 1TREA 4HT3A 1K7EA 4XUGA 1N55A 2E5CA 3L65A 3N34A 1A50A 4LWWA 1FCQA 2G95A 3NZRA 1OFAA 3B04A 4O10A 3WJZA 2RHGA 3TC6A 2G97A 4IPJA 3NR0A 1LLZA 3G1HA 2ZFAA 1UUMA 3EXTA 3LRKA 3W07A 2Y62A 1XC4A 2A6NA 2QAPA 4OHQA 1KW1A 4FX6M 3QW3A 5BRBA 4FX8A 3W71A 3TAKA 1H7RA 3S42A 1YTEA 4QNEA 4DPQA 4XTIA 3G1VA 3M7WA 2RFGA 3NGJA 2JBMA 2V2CA 3KVJA 4DBDA 3NQDA 1LBMA 3I68A 4EF9A 3DFOA 5FEZA 3G3MA 3PUEA 4ORIA 3M41A 3WFAA 1FCVA 4MVAA 5FF0A 2EF9A 1MEIA 5TIMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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