3QM3A

1.85 angstrom resolution crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase (fba) from campylobacter jejuni
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
355
structure length
350
Chain Sequence
AMGVLDIVKAGVISGDELNKIYDYAKAEGFAIPAVNVVGTDSINAVLEAAKKVNSPVIIQFSNGGAKFYAGKNCPNGEVLGAISGAKHVHLLAKAYGVPVILHTDHAARKLLPWIDGLIEANAQYKKTHGQALFSSHMLDLSEESLEENLSTCEVYLQKLDALGVALEIELGCTGGDNTGIDNSKLYTQPEDVALAYERLGKISDKFSIAASFGNVHGVYKPGNVSLQPEILKNSQKFVKDKFALNSDKPINFVFHGGSGSELKDIKNAVSYGVIKMNIDTDTQWAFWDGVREYELKNRAYLQGQIGNPEGDDKPNKKYYDPRVWLRSGEESMIKRLEIAFEDLNCINKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title 1.85 Angstrom Resolution Crystal Structure of Fructose-bisphosphate Aldolase (Fba) from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Campylobacter jejuni
total genus 140
structure length 350
sequence length 355
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qm3A00
5AN7A 4DPQA 1RVGA 2F7FA 3VKJA 1SW7A 3LXCA 4XUGA 1QFEA 3NQFA 3TH6A 2CZFA 4MIMA 4O12A 2E5BA 3C56A 1JCYA 3EWBX 1U5JA 4M7SA 1QDSA 4JEQA 3PB2A 1A50A 5C2XA 3S42A 3M16A 2BXVA 3M0ZA 1OF8A 3QMTA 3TAKA 4FXRA 3FLUA 3SI9A 4EOUA 1O95A 2QUUA 5HMSA 1G4SA 1SZNA 3EXSA 3DHFA 5CPOA 1TO3A 2A2IA 1C8VA 3KVMA 4JX5A 5D05A 2E09A 3THQA 2P10A 4N02A 4IMFA 1A5CA 2QCHA 4JDBA 3DFOA 2GQ8A 1EUNA 1O5XA 4OV4A 2YFNA 3U8GA 3WK3A 3PBUA 1ZNNA 3S0CA 1C9DA 5EBUA 2NWRA 3NZRA 5D2WA 3WFAA 4QJ1A 2TSYA 3EX4A 3UXAA 1K03A 1NVMA 2J24A 4HPXA 1UASA 4I9AA 3UYCA 4TMCA 3LDVA 5H2ZA 5DBUA 2V5BA 1YTEA 2WSQA 3JRKA 3KX6A 3NPWA 3QW4B 4O0KA 3UNDA 5AC6A 3EX1A 4JY8A 3EX3A 3T55A 3NGJA 2I9EA 4O17A 1WOAA 4QISA 3LB0A 5LHFA 2QR6A 4FNRA 3PG9A 1HUVA 3A9IA 1AMKA 4IMDA 4RJEA 1OF6A 1ME7A 4NJIA 4HNUA 1H60A 3DFQA 5K7JA 3IEBA 2CFFA 3CPRA 3SJ3A 3C2EA 4O28A 4NT0A 5CSSA 1ME9A 2ISWA 3L0GA 3FKKA 4D2JA 3TKFA 3TMQA 1TRIA 4OWGA 1P5BA 3QW3A 2PRMA 2RFGA 3O15A 2Y7DA 2V0TA 3EX6A 2Y7FA 3GIYA 1O5KA 2DP3A 4UFKA 1NAL1 4M7TA 2GPTA 3MI6A 2H6RA 4O0ZA 2A6LA 1B4EA 1ME8A 1YDVA 4PA8A 4LT9A 1WQ5A 1Z48A 4LC6A 5F1VA 2FFCA 3YPIA 3G1XA 2VXNA 4UFLA 3MWAA 5FEXA 1GVRA 1KFLA 2ISVA 4BWLC 1WOBA 3A23A 3IRDA 4Z0SA 5EKYA 3TNOA 3L5AA 3W85A 3W7LA 1Y0EA 1F2JA 1I2PA 2NX1A 3DGRA 3B04A 3PVFA 4EVZA 4GJ1A 1FDJA 4N9DA 3G0UA 3MI2A 2X1TA 1FXPA 1Q3NA 3MO7A 3EWYA 4UIOA 4Q32A 3SY5A 3T44A 1KM2A 2Y70A 1LYXA 4U28A 1ICQA 5HWNA 4O10A 1OX4B 1K8XA 3IGUA 2QAPA 4UTTA 1T0OA 3T40A 2QCCA 3LGEA 5D2XA 1P1XA 4TIMA 3W22A 1LTDA 1SZEA 4JYFA 4WY0F 4QNEA 1PHQA 3LCLA 3W76A 4K38A 1FQ0A 4BI5A 2E6AA 4O52A 5MHBA 3W1UA 4IOTA 4GE8A 5FEZA 8TIMA 3QMRA 1V7YA 3NG3A 3NM1A 3HPSA 3TFCA 4FNQA 1NF7A 1J5TA 5I3JA 5IM51 1TB3A 3N2MA 3O63A 1VLIA 1XL9A 3CC1A 4FF7A 3C4UA 3E49A 4K8HA 4QM1A 1IF2A 3FEMA 3W2LA 1AW5A 4OE7A 1FWWA 1W5PA 3KVJA 4IX2A 3W1MA 1H5YA 3W1RA 1OFOA 1DHPA 1OFRA 4ZQOA 3W86A 5BRBA 1FY6A 2OCZA 5CGQA 3IGXA 4LRSA 3I7SA 3PC0A 4XKYB 5J5DA 3CLMA 5C55A 5D37A 4FNSA 3STFA 4FNUA 3TR2A 5KZMA 3RLVA 1VS1A 1W54A 1FWRA 4GXMA 3I7RA 4ZQRA 2UV8G 5CSRA 5FF2A 1RV8A 4ADUA 3UQNA 1W5QA 4PFMA 4IXXA 1OFDA 4ORMA 4O13A 1GT8A 4BI7A 5KMYA 5LGZA 1RQEA 2V2HA 3M5VA 4FXSA 3MYPA 1GYNA 1QCWA 5AHLA 3C2RA 3G1YA 4AHOA 5SWUA 2RDUA 5I3FA 1GVFA 4KKXA 4WD0A 4JYEA 4RXFA 2H3BA 3FJLA 3W84A 3FYOA 5BNKA 1OK6A 1OFAA 4LV9A 1H7NA 2PE4A 3Q58A 1HG3A 1ZAHA 1R2SA 3V75A 5K9XA 4HSNA 1QOQA 2YSWA 2YGYA 4ZQNA 5D04C 5J5RA 4R33A 3EXRA 5LNSA 4HT3A 3KFTA 2E5DA 3P82A 4WOZA 5G5IA 2LLEA 1M7OA 3UZJA 4LY8A 2QUTA 1TPEA 1W5OA 3M1ZA 3A21A 2YCEA 3G1DA 1WAUA 3PS7A 3DAQA 3F4WA 1EWEA 1X1OA 3Q37A 3O8AA 1VR6A 2Z0IA 4EWND 2C13A 4DBEA 4UNLA 3LTYA 3HG5A 4JIQA 3MUXA 4LU0A 3HG4A 2P1FA 1KTCA 5AYYA 1SUXA 3G1VA 3BW3A 3TJLA 4Z1AA 1W5NA 3FJ6A 2YDAA 4BI6A 2ZBTA 1OG0A 1H7OA 3NQ8A 2GVLA 3NL2A 3W1XA 1G7VA 4RKAA 3EB2A 4QAIA 2ZZ3A 3SIZA 4K6AA 4DO6A 3O6YX 2CZ5A 1BWKA 1I4NA 5HNRA 2YXGA 3U6WA 3O6DA 1TTJA 5CZ0A 3W7MA 3WK1A 4B5NA 1ZAJA 1JVNA 4E2BA 2ZTJA 3ATZA 3M5XA 4YCOA 1Z42A 5AOUA 1R2TA 4OGZA 2J27A 3NQEA 2ZZ4A 4M6VA 3UXDA 4PH6A 1K7XA 3TUUA 3D0CA 3E0IA 1W56A 4GC4A 4QITA 4MZ8A 4AHQA 1Q6RA 3G3MA 2QCDB 1R46A 5F2MA 2FB2A 1KFEA 4A21A 5EY5A 3TSBA 2Q8ZA 4I7VA 2HS8A 3LCXA 3NQGA 2QDGA 2NV1A 5C6MA 4WOQA 5KZDA 4JX4A 4DELA 1TJPA 1VC4A 2VELA 1JUKA 3CB8A 4OHQA 1IXQA 5HR7A 3GKFA 3ATYA 2RH9A 1H51A 4UTWA 5CPMA 1XBYA 3UWQA 2NXHA 1LRNA 1LOLA 1FWTA 5LKYA 3W2NA 4JYDA 3DKJA 3UY8A 4K39A 3GX9A 1O4UA 4O4WA 1FWNA 3BLFA 1WBHA 3LHTA 4XWUA 2Q3OA 2WNZA 1MZHA 3LRLA 4C1KA 4DQWA 3BG5A 1VLWA 4MUZA 3DFPA 1EWDA 3W1NA 5D30A 1MEIA 5GVJA 3IIXA 2C19A 3OVQA 3S5YA 3ZR4A 4DEFA 3A22A 3NQ6A 3STEA 1KA9F 1YADA 5L9FA 2A7RA 4AXKA 3ABSA 1EIXA 3LHZA 4UTTC 1BKSA 4GNJA 3G1AA 2CW6A 3V1PA 1AK5A 1S5VA 3IIVA 3L65A 1H7RA 3BG3A 4MY8A 5LGXA 3G3DA 2B4GA 5AHMA 3DH7A 5F2LA 4GUFA 3HF3A 5AYZA 1Z44A 1S3HA 2W79A 2W0UA 3QPZA 3W7DA 4H4IA 3LHYA 5DBTA 4JIPA 4ZQCA 1SR9A 5TIMA 3WJWA 1OX5A 3GZ3A 2BLEA 2PC4A 2DJLA 1B3OA 2ZYFA 3LV6A 3QMSA 2V30A 3LLFA 3QFEA 1MSSA 2YZRA 2FDSA 4CNOA 5LZLA 2Y7EA 3L66A 3B03A 4UFMA 4NJHA 1Q6QA 5K9CA 3BG9A 2C14A 4ZL1A 1DKWA 1OX6A 3FA5A 4NZJA 4MKNA 1SSGA 4JXCA 1TQJA 2G96A 2ZDRA 3QSRA 3KHJA 5BMXA 1KW1A 4R7JA 1CI1A 2X2GA 3M44A 4PODA 4C1LA 3TDFA 4X2RA 1GVSA 4DF0A 2X1UA 3UWWA 2GQAA 1XBXA 3DFNA 3SGZA 4NNCA 3S8HA 3P7YA 4NX5A 4MY1A 4OV9A 3P60A 4AAJA 3S1UA 3C52A 4QNWA 3W87A 3GDLA 5FF4A 3TXZA 1B9BA 3W75A 3QF0A 2V81A 1SO3A 3OBKA 1KM5A 2CLEA 3B0UX 2E77A 4JTKA 3M9YA 2VFDA 1ZHAA 4NUWA 3GXPA 3P62A 1OX4A 1PHWA 4CQAA 3CWOX 1S5TA 3T7VA 1W1ZA 2GVGA 2KZHA 3MP5A 3QRHA 5F4XA 3QJAA 2V8ZA 4FO4A 1ONRA 3HQ1A 2XN0A 3R8RA 2QAFA 1R2RA 2YFOA 5LHEA 1VQTA 3P8JA 4KFPA 3SGUA 2Q3RA 1ZCOA 3FYPA 2NLIA 1GOXA 4UTIA 2JKPA 1UBSA 2BTMA 4NXKA 3C2VA 3MHGA 2JGYA 3IIOA 1A5BA 4KWWA 3PWAA 2C1HA 1HO4A 3GDKA 2E6DA 1ZAIA 3LV5A 5LSMA 1R47A 3P5YA 4IWWA 1N7KA 4QSHA 1TV7A 4Z1BA 4FB7A 2P0OA 4XKYA 2QJIA 1V5XA 2G5WA 5KZEA 5E0KA 1FUYA 1YXYA 1XFBA 4FNTA 4JN6A 3WK0A 2ZRUA 2EHHA 1N55A 3GDTA 3N34A 4X3ZA 3G1SA 2ALDA 4O14A 1VPXA 1I2RA 2EF9A 1I45A 5DCEA 2WJZA 3VE7A 2GUUA 1HL2A 2GQ9A 5CPNA 4S1FA 3IVUA 4Y8FA 2QJHA 2JKAA 3MYOA 2W6RA 1TPVA 4M19A 3UWVA 1LBFA 2BSLA 3M6YA 3S1XA 1VRDA 3W72A 4JTIA 4LUJA 2PRHA 1OFEA 1GYLA 1AW2A 4MOZA 2R94A 3NL5A 4JTHA 5EMUA 5KSWA 3HGJA 4UTJA 3ZFHA 3PY2A 2RDTA 2Y85A 2ZRYA 4W9TA 5G1TA 1RQBA 1LBMA 1LZOA 4LNYA 1GWJA 5G1YA 4UC5A 5HR6A 4AWSA 3RK8A 5KITA 2C16A 1H61A 3HG3A 1ZY9A 4ZVJA 2X1RA 4K37A 1LORA 1WX0A 4UTWC 3OG3A 3BLIA 2V2DA 1QPOA 3GXNA 3W70A 1W0MA 2ZZ7A 5DY2A 3ABOA 5HWMA 3DFSA 3GB6A 4IX0A 4LV4A 1FCVA 4DPPA 3OA3A 3W07A 4DO5A 1PCWA 4FX6M 1YTKA 3TW7A 1KV8A 3MBDA 4PCFA 2PURA 2YW3A 1OFPA 1TQXA 3VFLA 5LNWA 4PL1A 1PVNA 2QDHA 1X8FA 2RHGA 2R91A 3N73A 3NAVA 5FI8A 4RZ6A 4IGHA 1TPUA 5LNUA 2ABBA 1B57A 1W3TA 2DZXA 1OABA 4WY0B 1MEHA 1XUUA 4ZQPA 1K3UA 2ZZ5A 3L2IA 4JR5A 3GNDA 1JQXA 3M41A 4UUIA 4JTTA 3FOKA 3K30A 4G1KA 3CEPA 4DF1A 4N6EA 3RNDA 5BMWA 1TV8A 1KM6A 1OYBA 2Y61A 4JTSA 1G69A 1QAPA 5F4SA 1W31A 3GR8A 2FPYA 5AC7A 4EF8A 3R13A 3I68A 3KAOA 4J9JA 4FNPA 1WA3A 2V5LA 2Z2UA 1KV5A 1K02A 2QCDA 3WJZA 4L4MA 5FEPA 6ALDA 2X16A 3GNNA 1QOPA 4A29A 3BGGA 4QIUA 1F5ZA 4E0CA 3LXAA 3IVSA 5K9DA 1TYGA 1TREA 2OT0A 3KOFA 1UCWA 1KFJA 3LOTA 3HGSA 3EWXA 1YTDA 2RDWA 3AO0A 1PIIA 1TPDA 3JR2A 1X7FA 4FX7A 1GZGA 2JK2A 2QCMA 3USBA 1QNVA 1OJXA 4O16A 5BW6A 4Z0JA 1QO2A 1I2OA 3G18A 4BR1A 1HO1A 1EA0A 3EXTA 3PUEA 3TE9A 1F6PA 2XFWA 3E02A 1JULA 5DCBA 4DO4A 2YPIA 3S9YA 5H91A 2VFIA 2GVJA 3HGRA 1BTMA 1F73A 2R14A 4HPJA 5CKSA 3LBMA 4LS1A 4PEKA 4TMBA 6TIMA 4AWTA 4CNNA 3B4UA 5BOOA 3TK7A 3LM7A 1S5WA 1EEPA 3HO8A 4I7UA 3VE9A 1YLVA 4ZMGA 1IIHA 2DU2A 1HFBA 4HN4A 4N2YA 4GUGA 2E5CA 1SU5A 2VEPA 4GUHA 2NUXA 2O7SA 3N3MA 5L6UA 5AB3A 2CWNA 2PRLA 1LLWA 4OQVA 1FCUA 3P81A 3F4NA 3HB9A 3W1TA 1EUAA 2JGQA 1YDOA 4XBKA 3RLUA 3MHUA 3MI3A 2VFEA 3H53A 3LI0A 1YXCA 1KFCA 4ONVA 3L67A 2NV2A 4M5PA 1TMHA 3S5NA 3LLDA 3MBFA 4JGDA 3G1FA 5AHFA 2YYTA 3W7OA 3BK0A 4RZ4A 5D2TA 1H7PA 4K7YA 1NEYA 3PULA 4OU1A 4O1AA 2E68A 5DY3A 4LW7A 4N6FA 3MP3A 1P0NA 4CCEA 1AG1O 1DBTA 3LRMA 1F74A 3UPWA 4UCGA 5EL1A 4H6KA 5C54A 5AHNA 1XBVA 4A2RA 3LHVA 1Q6LA 4LVBA 3G1HA 5HUPA 1I2NA 3PUOA 4HKPA 4XBSA 3EX2A 3W1LA 3LCFA 2EKCA 3CIWA 2VFHA 5LNRA 1FCBA 1H50A 1N8FA 3L9CA 3BW4A 4O50A 1GJPA 1GQNA 4Y90A 2GJNA 5AFDA 2J6XA 4UTKA 1EP2A 3S1VA 1IXPA 3PBVA 3QQ0A 4Q33A 1SFLA 2O7QA 1UJPA 3P8IA 1C29A 3Q94A 4MPQA 3N14A 3NOEA 1J4EA 1VJIA 2FIQA 2E6YA 2NX9A 5F1UA 4O4VA 1MXSA 1F05A 3FKRA 3PR2A 4IMGA 3LBCA 4MY9A 1H7WA 2A7NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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