3QR3 | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	329
structure length	329
Chain Sequence	MGVRFAGVNIAGFDFGCTTDGTCVTSKVYPPLKNFTGSNNYPDGIGQMQHFVNEDGMTIFRLPVGWQYLVNNNLGGNLDSTSISKYDQLVQGCLSLGAYCIVDIHNYARWNGGIIGQGGPTNAQFTSLWSQLASKYASQSRVWFGIMNEPHDVNINTWAATVQEVVTAIRNAGATSQFISLPGNDWQSAGAFISDGSAAALSQVTNPDGSTTNLIFDVHKYLDSDNSGTHAECTTNNIDGAFSPLATWLRQNNRQAILTETGGGNVQSCIQDMCQQIQYLNQNSDVYLGYVGWGAGSFDSTYVLTETPTSSGNSWTDTSLVSSCLARKG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Hypocrea jecorina
publication title	A structural study of Hypocrea jecorina Cel5A. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endoglucanase EG-II
total genus	129
structure length	329
sequence length	329
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2011-02-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3qr3A00

4BS0A 5E9AA 5IFTA 1C7TA 1J9YA 1BPLB 1WDPA 4V27A 3BSHA 1UZ4A 5LA2A 1LWJA 2D0FA 3AIVA 1H5VA 2DSKA 1C93A 3L2MA 3SCSA 2HVMA 2GDUA 3GXFA 4CN1A 4AD5A 4M8UA 1JZ8A 2VI0A 3IAPA 3AIWA 3F5KA 2CBIA 4RE4A 2VVSA 2V3GA 4H41A 3WEZA 1J0KA 1EO5A 1IZKA 3QHMA 3VUPA 3OIHA 3WQ8A 2JEPA 3GXMA 4Z2JA 1B3XA 4PYSA 1E72M 5A94A 2XSBA 5CLTA 2VCCA 3DYMA 3VPLA 1GZJA 1UG6A 3MU7A 5I6SA 4C7DA 1W32A 1E40A 2EBNA 2RGMA 3L4TA 2NT1A 3ZT5A 3CZEA 4PSRA 1FA2A 4UFJA 3AS1A 3BAXA 2C8NA 4CD5A 1KR1A 1ZJBA 4TVDA 1LL4A 5D9OA 4MJ2A 2WXDM 3AIRA 2FH8A 1UWIA 1GVIA 3WIJA 4PMRA 1EOMA 2A3BA 3LPOA 4LXFA 4NI3A 4AZ6A 3PZNA 3WUFA 2D0GA 1PZ2A 1VFUA 4JKLA 4UQDA 2GJRA 3WMSA 1RD6A 2W67A 3WMBA 3WUBA 1H49A 1UWSA 1W3JA 4J3VA 4P7NA 1UA7A 3WF4A 4AY1A 2JFEX 4D1IA 3WSUA 3O2LA 4YHEA 3EDKA 1MFUA 2YL5A 1B2YA 1CENA 1BG4A 3ALFA 3SCTA 4JZ5A 3GM8A 4GPNA 5DF0A 2QLYA 5CXPA 2OSXA 1U33A 2F61A 3WF2A 3VDCA 1AQ0A 2AOSA 4OIFA 4X0NA 1V3JA 2J7EA 1E6PA 4W93A 3WNNA 5A6SA 2A3CA 2CNCA 4WK9A 2WKGA 3AJ7A 4KH2A 4D72A 3KL5A 4EANA 1FHLA 1TG7A 1OB0A 4E2OA 1XH1A 3RJXA 3AHYA 3ARUA 2JALA 4PUEA 4E8CA 1V0MA 5GNYA 3ZM8A 2W66A 2WLZA 1CXKA 1KFWA 4PTVA 3POHA 2Y5EA 4UQAA 1UZ1A 4HZ6A 1KXVA 3DYOA 3WQ5A 3UCQA 4Z2LA 1HJWA 1DWGM 3WELA 3B9AA 3U7VA 2ZX7A 4M82A 2WZHA 5IFPA 4CD6A 4MADA 3D5HA 2MANA 4WIWA 4CU7A 3WH7A 3KE0A 4GXPA 1KBKA 1E4LA 3OGSA 4F9JA 2Z1SA 1W9XA 2J78A 1CGTA 2WVVB 1MQPA 2GJXA 2OSWA 4NF7A 1ECEA 2WMHA 1K9EA 1NWUA 1QI4A 1UWTA 2GJPA 2D20A 1WO2A 2V5DA 3QOMA 1OSEA 4J3SA 5BYWA 2FH6A 2VCAA 4GQRA 2VRQA 1CXEA 1JZ5A 1FFRA 1EGZA 2V38A 1ISXA 3AROA 1D7FA 1E56A 5A8OA 4AZGA 3NCOA 2EPMX 3T09A 4AW7A 1UWUA 4RL3A 3WDHA 1QI2A 2QPUA 2UY4A 1UOKA 1FFQA 3O9NA 4CCEA 3WEMA 4ZE4A 2J25A 3VOCA 3L4WA 1TVPA 1BYBA 1KWGA 2YLLA 3FY1A 3OZOA 2WCAA 4RE2A 1UA3A 5A2BA 3ARSA 2XIBA 2VC9A 2EJ1A 4P8VA 5BROA 4FLOA 2ZUVA 4U5IA 4AIOA 1GQJA 3GBDA 4TOQA 4AZCB 5HBFA 1W3HA 5C70A 4CVWA 8A3HA 1JDAA 1TCMA 2DT0A 1KGXA 4M80A 4C7FA 1LL6A 2D23A 4P8UA 3UG4A 1W1PA 2DIJA 4QCEA 4DM1A 1QBAA 2J7HA 4WKHA 1X6LA 1B3VA 1JFXA 3RM8A 4AEFA 3ZJ8A 3W6LA 2CYGA 2A3HA 2YDSA 4A4AA 2WNWA 1CEOA 5BXPA 3MANA 2YDRA 4GINA 3VGHA 4Z2IA 1HJVA 2OYMA 1JI1A 4WSJA 1C8QA 4L4OA 4XX6A 3ZMRA 1B1YA 4JFUA 1HKIA 1KWKA 1W2VA 4UR9A 2OWWA 4UZUA 4AD1A 1XRVA 3VNYA 2PB1A 1GORA 3BMVA 3MUY1 3IJ9A 4W8LA 1UD4A 2VZOA 2X0HA 5I24A 3IANA 2E3ZA 5ABFA 4JCMA 3WBAA 3NSXA 3WFLA 1NOUA 1OT1A 3EMZA 2BHUA 1F4HA 4H8HA 1O7AA 4LYRA 2WMKA 3CUHA 1C7SA 3PZ9A 3OLDA 1JXJA 2YKKA 2WBGA 3WNPA 3VMNA 1DWHM 1DHKA 4HMCA 1QHOA 4NSBA 5A2CA 4XB3A 3PZUA 1FHDA 3T0BA 2HISA 4GZJA 2G3MA 4AYSA 2WSPA 3ZT7A 5DT5A 3VNZA 2VT0A 1PX4A 3VX1A 5A6LA 5A6BA 2VURA 4OBRA 3VGGA 2PWFA 1NWTA 3ZO9A 5I5RA 1CGVA 1LG1A 1XSJA 4Z2GA 4B9ZA 5A95A 1LL7A 1NP0A 1C8YA 5BXRA 1VJZA 3UG3A 2X05A 1ISYA 3APGA 3VM7A 5A3HA 3K4DA 3WDJA 2FGLA 1BG9A 3TTQA 1J12A 5JBFA 1GQLA 4C7GA 3A4WA 1E0WA 2DT3A 3DECA 4OKDA 3VGEA 4ACYA 2X8RA 1E1EA 3B9DA 4UZSA 4UFIA 1S46A 3KZSA 3PZTA 1JD9A 4H04A 1K9TA 2ZXBA 3GXDA 2ZXAA 4PCSA 3AMDA 3WD0A 4EKJA 2YDQA 3TA9A 3GNPA 2XM2A 1MFVA 1B3ZA 3CUIA 5D4YA 2ZIDA 4P7LA 4IUGA 1XHGA 4S3JA 2ZUWA 4LX4A 3WY1A 4PMYA 1TE1A 4WSKA 2GJXB 2G3JA 2DQXA 3QHOA 2UY3A 1HN1A 1W9UA 3AOFA 4GI9A 2BVDA 5JBDA 2ZXQA 4F66A 2CKSA 4FLSA 3VM5A 1JAEA 2D2OA 2D3LA 5A2AA 2ZE0A 1G9HA 3WKZA 4MB4A 3B8SA 2WSKA 5CJ5A 3FXYA 3JUGA 1J18A 4JKKA 1CDGA 1OM0A 4AD0A 3OB8A 1R8LA 1PX3A 3BLKA 4X9YA 2CERA 1R86A 1UKPA 4GZIA 1UWRA 1B0IA 4BF7A 1AMYA 4U2ZA 2WC4A 3PZOA 3T2QA 2WMIB 4CD8A 1E73M 3WQVA 1FP8A 1VEMA 2WC7A 2EPNA 3CBWA 4W8BA 3SCUA 3CZ8A 2XYLA 4B3KA 1H2JA 2XVNA 4JKMA 3RILA 4QAWA 4EK7A 5A8NA 1UD5A 4OZOA 3M46A 1BVNP 4PMOA 3CZKA 3VIFA 5EFFA 1UKTA 2J4GA 3BAYA 4H7VA 3PZQA 3WQ4A 2XVLA 5HPCA 2O9RA 3WNKA 1I75A 1UH3A 1TVNA 3AZSA 4CU8A 1ODZA 4UFKA 4MJ4A 3WUGA 2BV9A 1NWSA 1VB9A 1W1TA 3CLWA 2XWEA 3VDBA 4N42A 2E9MA 1G0CA 5CZKA 3AXXA 4V28A 5ABFB 1E5JA 3N13A 4KGJA 5A6AA 1UR9A 4LQ1A 4U5KA 2WW5A 4UOJA 4MDOA 1B31A 1B9ZA 1TUXA 1BHGA 4PMZA 1GOIA 3L2LA 2QMKA 3WD3A 3WNLA 1V3KA 5E09A 2GVYA 3W37A 3EYPA 1JAKA 5HNNA 2XM1A 4V2XA 5DFAA 3WNOA 1BTCA 2E9LA 1HJSA 5ABEA 1W9DM 1TFVA 3SEPA 1XYZA 1VBUA 4MTVA 3GNOA 3EDJA 1F4AA 4GIAA 2F2HA 1HX0A 2WPGA 4AZ5A 2D0HA 2DIEA 1V02A 3VD9A 3CUFA 1UKSA 1MXDA 5AY7A 4AISA 5D9PA 2WVSA 3EBVA 4AZBA 2W92A 5CSUA 2X1IA 4HZ8A 3RCNA 4AD3A 2PWDA 1EHNA 1JG9A 5IXEA 4OOUA 4HZ7A 3LPFA 2WWDA 4MAVA 3LMYA 1SFSA 3TTOA 1GQIA 3KEHA 4E4PA 1QNRA 1I1WA 2EPKX 5ECUA 3W25A 1QOXA 1MW1A 5CQ1A 3QGVA 4DM2A 4DWSD 4GI8A 3N11A 3QHNA 3ARVA 4D6CA 1OD0A 3MO4A 1V0NA 5AYBA 1R7AA 1UKOA 4PTWA 4UFMA 1ESWA 4HMDA 2ZXDA 2YA1A 1GJWA 3SCWA 1V02E 2X2YA 2CKRA 1PIFA 4F8XA 4HU0A 4JL1A 1VFOA 2VRJA 3S6TA 1UYQA 3CH9A 1Z32X 3AXHA 3I3EA 3AIUA 4PCTA 1IZJA 2W63A 1A47A 5DT7A 3VU2A 1W9PA 4LYPA 4TX6A 1N82A 2WMGA 3SURA 4ZFMA 5D8ZA 3MMWA 3TP4A 2EPOA 1Q6EA 4YPJA 4W86A 1VEPA 1W9VA 2EO7A 5C71A 4MAZA 1W2PA 1H1NA 1UR1A 3VIOA 3AHZA 2XIIA 1XSIA 1ZBVA 4QCFA 4UQCA 1MQRA 4AWEA 5M03A 1XSKA 1UD6A 1Q6FA 2VR5A 3IJ8A 4W8AA 1IT0A 2VMFA 1V3HA 1E43A 2VVNA 2YLAA 2VTFA 4UCFA 3RMEA 5DEZA 5CG0A 4D6EA 2XVKA 2GK1A 3GZAA 2B31A 4PRWA 5IDIA 1GVYA 1BYDA 1B3WA 2VQTA 4P7QA 1PIGA 4TXEA 3ZIZA 4NRRA 1UR4A 3IAQA 1VIWA 3CZGA 5A69A 6TAAA 1EIBA 4MB3A 4M24A 1H3GA 5IHRA 1KGWA 3E1F1 4HA1A 4HP5A 1EA9C 4D6IA 4FLQA 2EQDA 2ZOXA 1LWHA 3WF3A 1CBGA 4J3XA 4Q22A 3U5YA 2W4XA 1M03A 4QLKA 1FP9A 1PBGA 3POCA 4CN4A 4M1RA 4D6JA 5FD0A 3WFZA 3W81A 1FH7A 3ARZA 4D1JA 1HXJA 1OBAA 4TUFA 4Z2HA 1GHSA 4U33A 4X0VA 4J27A 1E4IA 5A1AA 1W1VA 1E70M 1K6AA 4BCEA 5ABHA 3IJ7A 4MNJA 3ALGA 2XSAA 2WANA 2G3NA 3VINA 3G6MA 3NUKA 1JGIA 4IM4A 3WQ6A 3QOKA 1GQKA 1I1XA 2D1ZA 3ARPA 2WLYA 3VTRA 3AMGA 4TVUA 3ZJKA 3A47A 3AI0A 3UR8A 3RPMA 3K4AA 2PC8A 2WAGA 1E9LA 1OIFA 3AISA 1QNPA 1HL9A 4GZEA 3VD4A 4W87A 3WD4A 2WC3A 3WF0A 2CITA 1J0JA 5CGTA 4CCDA 1SMAA 1CGYA 4W84A 1JZ3A 4A3HA 2J7GA 3VIGA 2A3AA 2UY2A 1H11A 1FOBA 4NRSA 4UQBA 1E71M 2EXOA 2NT0A 4AEEA 3AIQA 3BAKA 1VBRA 1ZU8A 2BY3A 1SMDA 5M17A 2GDVA 5FCZA 1UD2A 1PAMA 2Y4SA 2V3EA 5CLWA 1GUVA 5JIWA 1XD0A 3F5LA 3KL3A 3THDA 1MYRA 3LPPA 1G01A 1JYXA 4D6DA 3K46A 3NDYA 4WKAA 2CHNA 3BH4A 1US3A 1EXPA 1XH2A 4HA4A 3CHCA 1R87A 2XPKA 4WKFA 1E6XM 3F5JA 2WCGA 3D3AA 1JZ2A 1HP4A 3HN3A 3FN9A 2V5CA 1UWQA 1UR8A 2JIEA 4S3KA 1Q6GA 1VJSA 3OLEA 1ZBKA 3K8KA 4P8XA 5D9MA 3WUEA 2AMGA 2VZSA 3AMCA 1WB0A 1ITXA 2VNCA 1QVBA 1D2KA 2ZX9A 6CGTA 4U3CA 2WBKA 3VX0A 1ZS2A 2VR4A 4BQ2A 2VX4A 1CZ1A 4MNKA 4XV0A 3VIKA 2D24A 1XCXA 4PBGA 4ZE5A 1OINA 2F8QA 3N12A 4ZXOA 3CGTA 2VCBA 4PMQA 3NDZA 1LJYA 3W53A 1KQYA 2JE8A 1V3MA 1JNDA 1EQPA 1JIBA 3ARRA 2E8ZA 4W88A 5JUVA 5C8BB 4PMDA 3AYRA 3AXIA 1ISZA 1HT6A 3U57A 5HPOA 5I78A 1HKJA 3K8LA 3UG5A 1WDRA 1W91A 3L4XA 3SCOA 1QW9A 1U2YA 3QR3A 1DEDA 1UQYA 3ZQ9A 1TA3A 2BHYA 3GDBA 4BQ5A 2ZUTA 2WCSA 3HJEA 3RDKA 4B3LA 1V3IA 3N9KA 5IHSA 3EDEA 4W5ZA 1MW0A 1EQCA 2E40A 3AS0A 2G3IA 1CXLA 1G1YA 1XGZA 1WAWA 1E15A 1KXQA 3WH9A 1X1NA 3FHQA 3EMQA 1W3LA 5KZ6A 4WJXA 4KGLA 3OA5A 3M6DA 5AC5A 4ATWA 2Z1KA 3MUZ1 4J3WA 4M81A 1JZ4A 2BVYA 3PTMA 1EH9A 3NIYA 4HOZA 4HOWA 4HMEA 3VDHA 4UQ9A 1HKMA 3AQUA 5I3DA 3DYPA 4CKQA 2G8ZA 4WLCA 5CGMA 1ZBCA 1VFMA 3O6AA 4WF7A 4D6HA 2DH2A 1K9FA 4CD4A 3UEQA 3RJYA 4UFHA 4R27A 3I3BA 2YL9A 1V03A 4TVCA 2OWXA 3MUAA 2YOCA 5E0CA 2WB5A 3NJ3A 1V6XA 1SYTA 2ZWYA 5E0FA 3CZJA 4AMCA 4UNIA 4M29A 4GO9A 4PMXA 1QHPA 1OGBA 4KWUA 4TTGA 4KRUA 1GCYA 2V3FA 1XD1A 1J0IA 5CPSA 1NOFA 2WHKA 2CPUA 5LA1A 4EE9A 2GUYA 3K8MA 1EDQA 1AQMA 4OUEA 3ZSTA 2XWDA 1HJXA 5AC4A 1GOWA 1HF6A 4W7VA 3WDQA 2ZUUA 3EDDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1XYF A;  4W5U A;  2FGZ A;  4W7W A;  2CBV A;  1V6Y A;  2DSZ A;  3BSG A;  4B9Y A;  3BLP X;  3MUI A;  1PPI A;  5A8P A;  3B9E A;  3BGA A;  5FL1 A;  2QPS A;  1WDQ A;  1E6N A;  1JDD A;  4W7U A;  2VO5 A;  3ZR5 A;  2WVV A;  4UTF A;  4U3A A;  1CIU A;  1E0X A;  4OBS A;  1B90 A;  3M7S A;  4ML4 A;  2J8F A;  3OGR A;  4JAW A;  1GHR A;  2ZIC A;  3A6O A;  4FK9 A;  3BC9 A;  2VUY A;  4XZW A;  3VIM A;  2XTK A;  3ZT6 A;  1ISW A;  4JFW A;  1W1Y A;  4MPK A;  2VZU A;  1NAR A;  2WWC A;  2YBU A;  2DSU A;  2WMF A;  3SUW A;  1JDC A;  3L4V A;  3UR7 A;  1HVX A;  3N1A A;  1JYN A;  2PF0 A;  3FAX A;  4IPL A;  3AHX A;  3RM4 A;  3K1D A;  3N17 A;  3WEN A;  4XZB A;  3PTQ A;  2GFT A;  3PZV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3QR3A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations