3QR3 | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	329
structure length	329
Chain Sequence	MGVRFAGVNIAGFDFGCTTDGTCVTSKVYPPLKNFTGSNNYPDGIGQMQHFVNEDGMTIFRLPVGWQYLVNNNLGGNLDSTSISKYDQLVQGCLSLGAYCIVDIHNYARWNGGIIGQGGPTNAQFTSLWSQLASKYASQSRVWFGIMNEPHDVNINTWAATVQEVVTAIRNAGATSQFISLPGNDWQSAGAFISDGSAAALSQVTNPDGSTTNLIFDVHKYLDSDNSGTHAECTTNNIDGAFSPLATWLRQNNRQAILTETGGGNVQSCIQDMCQQIQYLNQNSDVYLGYVGWGAGSFDSTYVLTETPTSSGNSWTDTSLVSSCLARKG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	A structural study of Hypocrea jecorina Cel5A. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endoglucanase EG-II
molecule tags	Hydrolase
source organism	Hypocrea jecorina
total genus	129
structure length	329
sequence length	329
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2011-02-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3qr3A00

1GOIA 1N82A 4AD5A 4N42A 4ZENA 4CCDA 1UWRA 4WKHA 2BY2A 2DQXA 1BLIA 1O7AA 1GOMA 3MMWA 3T0DA 3W28A 1JDAA 2Z1SA 1UZ1A 1EGZA 3WL0A 2J74A 2ESCA 4Y7EA 5A8PA 4KRTA 7CGTA 2EPKX 4LYQA 1XD0A 3N04A 4DWSB 4MNLA 4KGLA 3W6MA 1QW8A 3WNPA 1E4LA 2A3BA 2GVYA 2ZXDA 3DYOA 1QW9A 3O9NA 4HPGA 3VO0A 3IJ9A 4CN4A 3G6MA 1KGWA 3ZOAA 3DYPA 1B3YA 3AIVA 3PZQA 2PWDA 2J4GA 1VBUA 3NSNA 3KWXA 1B30A 1HXJA 2CXGA 3AROA 1J18A 4M24A 1UD5A 3N11A 3WDPP 1FHLA 5D9MA 1VENA 4C7FA 3WF4A 4JFTA 1J0YA 1JI1A 4AD2A 3TA9A 4UFMA 3QOKA 2WKLA 3WMCA 3GTNA 1V0LA 1GONA 1LQ0A 2W4XA 4ATLA 4HMDA 3VVGA 1CDGA 1UKTA 1ITXA 1OGSA 3L4UA 3RILA 3AHVA 5HOSA 1I1WA 3WD3A 3OGSA 4DWSC 1M03A 1LG1A 2V3DA 5E9AA 3KL5A 2ZWZA 1JNDA 3WD2A 3TTOA 2ZXBA 4AZHA 2WMIB 3N13A 5FIPA 3RO8A 2CITA 5GNZA 3ZMRA 1HKIA 4YPJA 2X2YA 4OBSA 1G9HA 5E0FA 2XGIA 3UETA 3BAJA 1OWQA 4M56A 4H7VA 3SUUA 1GPFA 1YHTA 5A6BA 1CENA 2V5DA 2CKSA 1G0CA 1C8YA 1MQRA 3I3EA 4ZE5A 2Y8VA 2D3NA 5JBEA 3T0BA 4LXFA 3T08A 5GQBA 3EMQA 2YDQA 3WEOA 1PIGA 5BROA 1FH9A 1V3KA 2VCCA 3WMSA 2BV9A 2WM0A 5HPCA 3UCQA 2J47A 2YOCA 1UR4A 1UR9A 3IAPA 4UFHA 2WHLA 4AW7A 2PF0A 4PMYA 2XPKA 4AZ5A 4ACZA 4AD4A 1HKKA 3WH9A 2DT1A 4B16A 1W3LA 4MDOA 1E15A 5AY7A 1E70M 3T09A 1CXKA 2XWEA 3RPMA 1ZU8A 2D2OA 3IK2A 1XV8A 2QPSA 3F5LA 4OZOA 4RE3A 4PMXA 2CEQA 4TXEA 3AMLA 3MUZ1 4EANA 4CGTA 2WB5A 1BTCA 2OSYA 3U7BA 4J3VA 4F9JA 3OLDA 2VC9A 2CESA 2WPGA 3O2LA 2GDVA 1V3HA 1VFUA 2V3GA 5E09A 4W5ZA 1E6NA 1E55A 4E2OA 4UR9A 4P8WA 2GK1A 4UCFA 4D6HA 2WC3A 1ISYA 3WQ4A 1V6YA 1H41A 4IISA 3BXWA 3VIHA 1GQJA 3GH4A 5A8QA 2VO5A 4PMDA 1W1TA 2XWDA 2FH6A 1HL9A 1MFVA 3ARSA 3OZOA 1QNOA 3OGVA 3AOFA 2V3FA 4BQ4A 1XRVA 4TTGA 3KL0A 1LL4A 4KH2A 1GQIA 1JGIA 1ZJAA 3VMNA 3WUFA 2O92A 2E3ZA 2EJ1A 3W0KA 9CGTA 1JG9A 1QI0A 1OGGA 1KQZA 1GOOA 4S3JA 5M3WA 4AISA 4J3XA 5IHRA 3W81A 3BAWA 1UA7A 1A3HA 4HZ6A 1HIZA 2XVPA 4JFSA 1M04A 5BXRA 4K68A 1H2JA 1GJUA 5CJ5A 4V2XA 2WVTA 1CGTA 4M1RA 5EB8A 4PTMA 3K46A 1OD0A 2XIBA 2WYSA 5I2UA 3F5JA 2J25A 1GOKA 2FHCA 1JZ4A 3GNOA 1ZB5A 2YDRA 1MW3A 3NIYA 2J77A 3VGDA 2WKGA 1OINA 3ARPA 3AYSA 1XC6A 3F5KA 1V0KA 2HVMA 2WWCA 3UR7A 2GFTA 1EO7A 2JEQA 5CLTA 4CKQA 1LJYA 2VZUA 3GZAA 5E70A 4FLOA 5GPRA 4WJXA 3TTSA 5AC5A 1W2VA 1E5NA 4XZWA 5EFFA 2VZOA 1ZL1A 4P7OA 1ISVA 2VVSA 5BRPA 1PPIA 2DDXA 2PWHA 1NOFA 1QI4A 1UQZA 2E8YA 1NWRA 2FDMA 3PZNA 2OYLA 3WSUA 1MW1A 5IFTA 3AICA 3MSGA 1VFOA 4U3CA 2BY1A 1RD6A 1E1FA 4HPHA 1JL8A 1MFUA 1WZMA 1J0ZA 2W66A 2PWEA 3ECQA 3QHNA 4H8HA 2Y24A 2BHYA 3MV11 3WELA 3OLEA 1JI2A 1V0NA 2Z1KA 3AXIA 1HNYA 2D20A 2EQDA 1KWKA 4QDMA 2XFFA 2GJXA 1BYCA 4AWEA 2Q8XA 1BAGA 1J0JA 2OWWA 3E1F1 2Y2WA 2ZUSA 4AZ7A 4GO8A 4AC1X 3THCA 3VGBA 1E3XA 4JFVA 2NW0A 1ZJBA 1W3KA 3M7SA 3WQVA 1XH2A 4N0RA 3QR3A 3RM8A 2A3EA 2UWFA 1OSEA 3SCPA 3AYRA 3PZIA 4LQ1A 1XH1A 5FL1A 3SCRA 1W2PA 3ZJKA 2VR5A 3MKKA 4H8VA 2VVNA 3ZO9A 1BYDA 1W1VA 1JZ5A 1CGYA 1KR1A 2CERA 3AS3A 1QVBA 1VBRA 2UY2A 3QGVA 3WNLA 1B3VA 1J0HA 3MSDA 1F4HA 2X1IA 4HZ7A 3TP4A 3MANA 4BS0A 4AD3A 4OKDA 4S3KA 3GH7A 2J62A 4UQDA 1PAMA 3FHAA 3ZT6A 2WVVA 4HA1A 3DECA 3LMYA 4DUVA 3NSMA 1QHOA 4ZEPA 3EDEA 3TOPA 4PRWA 2ZUTA 5I6SA 1AVAA 1JDCA 4AIOA 1MYRA 1JFXA 4UFIA 2UY5A 1V6XA 3ZJ8A 2WNWA 4DUWA 1B3XA 4B3LA 3BC9A 3WDIA 3ZM8A 2JE8A 1BYBA 1EOKA 3VNYA 5BXSA 4W7VA 2XJ7A 1IV8A 1OT2A 4JKMA 3K4DA 3BLPX 1QBAA 1GQLA 2AMGA 5E0CA 5DT5A 3SURA 3SIMA 1MWOA 3OLIA 1PJ9A 2WLZA 5TD4A 4AY1A 5FD0A 5FL0A 4MDPA 1QNQA 2DIJA 1H1NA 1WKYA 5I3DA 1MQQA 2D3LA 3K8KA 2XTKA 4UFJA 3FXYA 4QCEA 7TAAA 1E6RA 1XSIA 1CECA 2WLYA 4DM1A 3N18A 3VIOA 3GM8A 2VRQA 3RM9A 3BCDA 2FGZA 3AXHA 1WO2A 3M6DA 1XGZA 2WC7A 1JD9A 2XSBA 2JEPA 2DT3A 3N1AA 4GI6A 1K6AA 4E4PA 1E6PA 1JAKA 1JYXA 1JAEA 3L4TA 5I0DA 1RH9A 3WIJA 1UD4A 2X0YA 3ARRA 3IAQA 2NT0A 2BXYA 1OCQA 3LPFA 4PMNA 4QFUA 4MJ4A 5A6JA 4MADA 3RIKA 2YA2A 4W89A 1CEOA 3ZQ9A 1W9PA 1UR1A 1FHDA 1V02A 4PSRA 1E6ZA 4URIA 3MV01 1R85A 5GNXA 2MANA 1NARA 2AAAA 1XSJA 2QHAA 1SFSA 4HU8A 1BHGA 3U5YA 2BVYA 1G01A 4P8UA 1W9BM 1ESWA 1Y7VA 2J78A 4IPLA 2PI6A 2YL8A 2XG9A 3SCUA 5BYWA 1AMYA 4E8DA 2WHKA 5ABGA 3CZEA 3GBEA 2RGLA 3K8LA 1QHZA 3PTKA 4D1IA 2YLLA 1ISXA 4A4AA 2QMJA 3WFLA 6A3HA 4AZBA 5IXEA 1WDRA 1W1PA 2D0FA 4WSKA 1NP0A 1K9DA 4V27A 2Y8KA 1AQMA 3IANA 5A6LA 1UWTA 3DC0A 3WDJA 1E4IA 4D72A 2WWDA 1TA3A 1MXGA 2BHZA 2D0HA 1H11A 4TTUA 1XD1A 3POHA 1ZBCA 1O6IA 4D71A 2XFYA 1IZJA 2XGBA 1CIUA 3CHFA 1W3JA 3B9AA 4R5EA 4OIFA 5ABEA 1BVZA 1UKPA 1JNEA 3WDHA 3VDHA 3GXIA 3EDKA 2ZUUA 4EAMA 4HP5A 3BAXA 4QLJA 1CXEA 1OB0A 4HA4A 2PBOA 3BCFA 1ODUA 5KEZA 3VD3A 1RP8A 2GJRA 1HP4A 1WP6A 2J7DA 3OGRA 1ISZA 4YHGA 4H04A 1E40A 5FOOA 5IFPA 1UH4A 1UUQA 3BMWA 3VIKA 2A3HA 3AHTA 3IJ7A 1HJVA 3CZJA 1CNVA 1Q6DA 2WAGA 2BY3A 4P8XA 5D9OA 5CSYA 2FGLA 1CGUA 2ZXQA 3POCA 3WQ6A 1UWIA 1L0PA 3ZIZA 2XYLA 2FHBA 3WH6A 1WZAA 1C3FA 3AIUA 4GPNA 4W86A 2YBTA 1C7TA 4PYSA 3VIGA 3CUIA 1E0WA 3ZR6A 4ML4A 4NSBA 2YA1A 2XM2A 2F8QA 2IUZA 3WNOA 3MU7A 1LLOA 1BSIA 4XUYA 1E6QM 1OBAA 3EYPA 3UERA 3CZKA 4GQQA 3WD1A 1S46A 3MUAA 4ACZB 4X0VA 1WZKA 3BSHA 2EPNA 2VQTA 3MUY1 1QHPA 1CBGA 1JIBA 5CXPA 1LF1A 2J7HA 4XX6A 3RJXA 1JZ8A 3VDCA 3T0AA 3ZSSA 1B90A 5I78A 1CXIA 5AYIA 4QAWA 1NOWA 2V3EA 4U3AA 2VRJA 3AHZA 1DWIM 3WY1A 3G6LA 1X6LA 1FOBA 4HMEA 1H09A 1RP9A 1TE1A 2JALA 3PHAA 4LYRA 2EPOA 2W91A 1KXVA 1M53A 2PB1A 2GK1B 1V6UA 2ZE0A 3FW6A 2J79A 1R8LA 1VEMA 4FMVA 2NSXA 1JF6A 4UFKA 3W4RA 5BXPA 1CTNA 4CD8A 1MW2A 3CPUA 2WBKA 2VUYA 2CKRA 4UQCA 1GQKA 1E71M 1H4PA 3AMDA 4P8VA 4CU7A 3WMBA 5BXTA 4WKFA 1MQPA 3BLKA 3VNZA 4CD6A 3WD0A 2DSWA 3SEPA 4PMUA 2WHMA 1DWAM 5DFAA 2JF7A 4Z2IA 3T2OA 5DO8A 2WZEA 1SYTA 1CLXA 3WEMA 1X1NA 4CCEA 1PIFA 3D3AA 3PZMA 2YKKA 3S6TA 4J27A 3T2QA 3SCVA 1QOXA 3PTQA 3SUWA 1J0KA 3UESA 1UOKA 3B8SA 2VZSA 2DPEA 4TOQA 2YIHA 5CGMA 4PMRA 3JUGA 1PEZA 3VM5A 1ZBWA 1LWHA 3AZSA 3RM4A 2YL5A 2W92A 3EDJA 8CGTA 2EO7A 4AZCA 5CG0A 3AMKA 5E6ZA 4MNKA 4AYSA 4HOZA 1XSKA 1ZBVA 2J7FA 2DEPA 5ABFA 3A6OA 4UQBA 4ZXOA 4B9YA 3WUEA 3VILA 4NI3A 2WZHA 5CLWA 2YJQA 5LYRA 3VGFA 3VDBA 1QBBA 4U31A 4D6CA 3PTMA 1E0XA 2XFRA 2WBGA 1V0MA 2O9RA 4J3TA 5AC4A 1UZ4A 5HPOA 1HJQA 3CLWA 3WUBA 2G3NA 1GVIA 1EOMA 1TFVA 4AZIA 1QI5A 4TVDA 1VFFA 1UD6A 4TUFA 4KWUA 1LL7A 7A3HA 3AIBA 3CZGA 2XUCA 4UQ9A 2OSXA 2VZVA 2CBUA 1V03A 1KGXA 1B9ZA 3MMDA 3AZRA 3AFBA 4L4OA 1KBKA 3J7HA 1MW0A 1CGWA 2ZX5A 3PBGA 2QV4A 3ARWA 1XH0A 3F4VA 1W9VA 1UWSA 4J3UA 2WVSA 2DSVA 5EBAA 2A3CA 3APGA 3PZ9A 4D6JA 2HISA 4GQRA 2CPUA 4PTVA 3VX0A 1UKOA 1YQ2A 4TX6A 2GJXB 1DTUA 2W61A 1QI2A 1H3GA 3AHYA 4BA0A 4GXPA 4UZSA 2VOTA 5I79A 2E40A 1C91A 4AXNA 2VNCA 1WDSA 5D4YA 4B15A 1C92A 5A69A 3WNNA 3VUPA 5HNNA 5F7UA 2ZXAA 2ZX8A 1PZ3A 1R7OA 2D1ZA 1DWHM 2ZIDA 1NH6A 3WENA 2XIIA 4MAZA 3BAYA 1BFNA 3CHDA 1HT6A 4XZBA 4UOQA 4E8CA 1UWQA 4H41A 3A3HA 2WVVB 2ZICA 5A6SA 5A6AA 2F2HA 4H2CA 3LPGA 2C8NA 2J75A 4LGXA 5DT7A 5AYBA 4JHOA 1KXHA 1WPCA 2D23A 4CCCA 3VMPA 2VQUA 1NWUA 2V38A 1P6WA 2ZOXA 4CD5A 1VB9A 2XVLA 1UYQA 1WE5A 4HMCA 4F79A 3B9DA 1TG7A 2OYKA 2OYMA 4W93A 1XYFA 3WF0A 1JF5A 4MJ2A 4QLKA 4CVWA 1WAWA 5CZKA 5D8WA 1M01A 4YN5A 3VD4A 4IUGA 5FKYA 5A6MA 4GI8A 1AQ0A 2BNJA 4RL3A 1ITCA 1KWGA 3I3BA 1BGAA 4OBRA 1EH9A 5BCAA 2E8ZA 2WSKA 3UG3A 3PZUA 3GH5A 1K9EA 5HBFA 4AEFA 3L4YA 1EIBA 4P7NA 1VFMA 1G5AA 1Q4NX 1UWUA 3PZGA 3W25A 4CU8A 2J7GA 4ACYA 1Z32X 3VGGA 1W9UA 1VF8A 1E4MM 1A47A 2E9BA 3VMOA 2OWCA 1BGGA 4DUXA 1VJSA 3PZOA 3CUFA 1GZJA 4JCLA 2GUYA 4CU6A 1CGXA 1EDGA 3CUGA 4GO9A 5KZ6A 1OT1A 3CMJA 1G94A 3ZJ7A 1NM9A 2VJXA 1KFWA 1E73M 2WMKA 1C7SA 3N15A 1J10A 3W38A 1W9DM 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CYG A;  3VDA A;  2J7C A;  3RCN A;  1BG9 A;  3WNK A;  1KB3 A;  3WH5 A;  2QMK A;  1PBG A;  4Z2L A;  1H5V A;  1R86 A;  2E0P A;  1HX0 A;  5EFD A;  1TVN A;  4Q7N A;  1J12 A;  1BG4 A;  3LPP A;  2CET A;  3QHO A;  2EEX A;  4UNI A;  3HU7 A;  1D3C A;  4W8B A;  1V6V A;  4L4P A;  4J7R A;  3EBV A;  1RPK A;  2OLH A;  4NF7 A;  5A1A A;  2YDS A;  4A3H A;  3VIM A;  1UHV A;  1KXT A;  3K8M A;  2VCB A;  4PMO A;  3NDZ A;  3AMC A;  1HKM A;  1JZ7 A;  2CNC A;  1LWJ A;  4WSJ A;  5BRQ A;  4V28 A;  2A3A A;  2YL6 A;  2E9M A;  3QHM A;  5A6B D;  3GXD A;  2W5F A;  1HF6 A;  3GNR A;  5CPT A;  1U33 A;  4HOW A;  4HU0 A;  5I24 A;  3ARV A;  2DT2 A;  2EPL X;  4P7R A;  1ZBK A;  1X6N A;  3S2C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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3QR3A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations