3R2G | Genus

Total Genus 112

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	112
sequence length	323
structure length	323
Chain Sequence	QAITFDDVLLVPSYNHHESRRVVETTSTDRLGKLTLNLPVISANMDTITESNMANFMHSKGAMGALHRFMTIEENIQEFKKCKGPVFVSVGCTENELQRAEALRDAGADFFCVDVAHAHAKYVGKTLKSLRQLLGSRCIMAGNVATYAGADYLASCGADIIKAGIGGGSVCSTRIKTGFGVPMLTCIQDCSRADRSIVADGGIKTSGDIVKALAFGADFVMIGGMLAGSAPTPGEVFQKDDGSKVKRYRGMASREAQEAFLGQMHEWKTAEGVATEVPFKENPDGIIADIIGGLRSGLTYAGADSISELQRKLNYVIVTQAGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Legionella pneumophila subsp. pneumophila
publication title	Crystal structure of Inosine 5' monophosphate dehydrogenase from Legionella pneumophila rcsb
molecule keywords	Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
total genus	112
structure length	323
sequence length	323
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-03-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3r2gA00

4MZ1A 1FCVA 2JGYA 2I9EA 5C55A 1X1OA 4ORMA 3HO8A 1GG0A 5SWUA 1GTEA 4CLMA 4BF9A 3C2RA 1I45A 1N55A 2A7NA 4FNRA 3C2FA 4LC6A 5BRBA 1VQTA 1TPH1 5D09A 3LRMA 3EX6A 3ZWTA 3P74A 2JKAA 2ZFAA 1PL9A 1RR2A 5LNVA 1CI1A 2Y88A 4MFDA 3GIYA 4K36A 1EUAA 2Y7EA 3OIXA 4JTIA 1OX4A 5FEWA 3ELFA 1AW1A 3QMSA 5D2WA 4LT9A 3IVTA 2VFIA 2CLMA 3E12A 4LU0A 3W72A 1SFJA 5HUOA 1T96A 1PHWA 5FESA 3UY7A 4NJGA 4E2DA 3DHFA 3QC3A 3LERA 4O15A 4EVZA 4Z0SA 5D30A 2E5BA 3W22A 3WK1A 3LV6A 4ZQOA 3PBUA 2VKZG 4PH6A 4YXGA 2Q3OA 4LVBA 1QPOA 5F4SA 4HSNA 4QAIA 1VGAA 1SZGA 3A9IA 5DELA 5HNRA 1G7VA 5D33A 5HWJA 2Y61A 3NM1A 4JIPA 3P62A 2X30A 3UWZA 1QOPA 3DFNA 4MFEA 1CW2A 1SZFA 3LI1A 5FEPA 4Z1CA 4R33A 1GOXA 5D02A 1O95A 3NL3A 5LNWA 3LI0A 3GLCA 4TMCA 1KA9F 1TIMA 3WFAA 2BTMA 1OX5A 2XN2A 1P0KA 1XBYA 2X16A 1LYXA 2ZZ3A 2A0NA 3MWAA 3B06A 3DFSA 1EB3A 2ZCGA 3PWAA 1DJNA 3WJXA 3VKJA 3NPWA 3F1QA 4WX2A 3KAOA 5U4NA 4WUIA 3IV3A 3SZ8A 1LLZA 1P0NA 3N14A 2V2DA 3ABSA 3IIVA 2YW4A 4L4MA 4RZ5A 4E2BA 1M5WA 1SSGA 3NQ8A 1KM0A 2CFFA 1DL3A 3MW7A 3MP3A 3G1HA 1W31A 2TYSA 4UMBA 5CSRA 1BEUA 2PRHA 2V82A 5C5YA 2DZUA 3P84A 4HIBA 1TREA 4AF0A 4X2RA 2H6RA 1ME9A 3LLFA 1F2JA 5KZMA 2W6RA 3W07A 5LNRA 3SSJA 1P5BA 2AAMA 2CU0A 2VEKA 1FWSA 3D0CA 5HWMA 1Z41A 1PVNA 3R5EA 2Z6IA 3EWWA 1KFEA 1LRNA 2V5BA 4O16A 3TW7A 3BGJA 2X1UA 3EX4A 2WJZA 2GUUA 5G1TA 1NAL1 2VELA 4WY0B 1YTEA 2A7PA 3OVQA 1LLWA 3PC0A 3HGJA 1MEWA 3HBLA 1R2SA 2FPVA 3ABQA 2NZLA 3LXAA 2ZRVA 3HPSA 1THFD 1DQXA 5I3FA 1TPFA 2V8ZA 3BO9A 4JTGA 4O1AA 1AK5A 3STGA 3W1MA 1K7XA 4DXVA 2HTMA 2FB2A 2Y70A 4B5NA 1RVGA 3NQAA 5D2TA 3CQ0A 2WNQA 3I7QA 3G1DA 5D2XA 3PG8A 1W3TA 4AWTA 3W7EA 4WJEA 1IF2A 1R2TA 5KZDA 4TR9A 4S1FA 1UB3A 3OVRA 4NX0A 3B04A 3G8RA 4RR4A 1OFEA 4WD0A 1WOAA 3GDLA 2OMAA 5I3HA 1YLVA 2V30A 4YMZA 2Y85A 1DOSA 5LHFA 3TUUA 3OBKA 4N9DA 4CCEA 1HUVA 4AB4A 4IQLA 4OU1A 3WK0A 2JK2A 2FLIA 4JICA 3M5ZA 3UZJA 3TC7A 1FWRA 1KFCA 3THQA 1W5MA 1G6CA 5I3IA 3TKFA 3O8AA 2BSLA 5FF4A 4NVTA 3TV8A 4M5PA 1D3GA 3DFPA 5BOOA 3SI9A 1VR6A 4MYAA 5FEZA 3NXFA 4JTTA 3LXBA 4NX5A 4UTKA 3IEBA 3IGXA 2TSYA 1GVOA 3TSBA 1L9WA 3NG3A 3NPXA 1N7KA 4P61A 1LRTA 3IIPA 3G1YA 1W37A 3LLDA 1H7RA 4MVAA 3E49A 3O16A 3W1PA 4M6VA 3GNNA 3DENA 5BW6A 2QEZA 2J6XA 3C8FA 4UFKA 1H62A 2V2CA 3P67A 3TCEA 4DEFA 1GVSA 2OZ0A 1IXOA 1FQ0A 4IPIA 3HMJG 2ZZ2A 3TK7A 4LV9A 2GVLA 3QYQA 4HPJA 2DZPA 3PM6A 2FTPA 3INPA 4JS3A 2FIQA 5G2IA 1B4KA 3DFTA 3UWVA 5DXYA 3MHGA 4N4PA 4IPJA 2J24A 3JR2A 1DKWA 3F4WA 4O18A 2VXNA 4IMGA 1XL9A 3LHUA 3C52A 5E1QA 3OA3A 1U83A 4ORIA 5AYZA 3TSMA 3PSVA 5D2YA 2E6AA 2CLOA 5TIMA 3Q94A 3GVGA 1XDMA 3OEXA 4JNMA 1K7FA 1FCBA 5ABTA 3W23A 3R13A 1FUYA 4XZ9A 3P60A 1TJRA 3NM3A 1DORA 4WY0F 3QPYA 4O4WA 1QDSA 3VNDA 3O05A 3U6WA 1VYRA 2C3ZA 4XKYB 1OABA 1FBAA 2VEPA 1ICPA 4NZJA 2NV1A 2QCDB 1V7YA 4M19A 4NQ1A 8TIMA 1PV8A 3L21A 4UMAA 2H3BA 2QCGA 1OJXA 5HR6A 4N6FA 1OFOA 3G1FA 2Z6JA 4EIVA 5CG7A 1G4TA 1PS9A 3TC6A 2ZRWA 3NQMA 3W73A 1F6KA 3R2GA 1TYGA 4JXCA 4GUGA 1AW2A 3P61A 3HB9A 3N19B 3B4UA 2ZDRA 1J4EA 1X8FA 2ISWA 1H5YA 4QQ3A 4S2CA 1XM3A 1J5TA 4LVFA 4TU1A 4JTKA 5D32A 4FIRA 1PCKA 4WOQA 1EIXA 1L6SA 2EF9A 1JJKA 3IVUA 5AOUA 3C4UA 4LV4A 3KHJA 1BKSA 3GDTA 3C2EA 4LVGA 1WBHA 3FKKA 3QF0A 2CLLA 4NNCA 4EF8A 5K4ZA 1YDNA 5DXXA 3TSDA 2VEMA 3GDRA 3O63A 3M44A 1FXPA 5AN7A 4ZL1A 4Y8FA 1YYAA 1YXDA 4O13A 1IXNA 1LBFA 1NF0A 3CWOX 4UFHA 4JY8A 2G96A 2GQAA 4HHPA 1VYSX 3FJLA 2PE4A 3DBPA 1ZCOA 2BZNA 1GYNA 4UFIA 2WSQA 5CZSA 3NGJA 4PEKA 2G95A 1OFBA 1J2WA 3PR2A 2QDHA 5K9DA 2PCQA 4MYXA 3IRDA 1H61A 1Y0EA 3S0CA 4CQ8A 1M6JA 3NQEA 5A8GA 4UFMA 4HN4A 3LHTA 4JD4A 1MEHA 3UPWA 3SJ3A 4KFOA 1GYLA 4C1LA 3RMJA 1FDYA 2RDTA 5L6UA 4N6EA 2BLEA 2VFDA 4OBTA 2ZRUA 3TE9A 3W86A 3BGGA 2B7PA 4C1KA 5CGQA 2QAFA 1KM1A 4ZQCA 3GKAA 2CLIA 1KV8A 4DQWA 4DF0A 3P82A 2ISVA 5AYYA 2PC4A 1VJIA 3QRHA 1GEQA 3THAA 4OT7A 1XXXA 4UFJA 3CEUA 3VCRA 3TFXA 1SSDA 3EXSA 1QO2A 3G1VA 2NXIA 3R12A 4JX4A 4R34A 4A3UA 5LNUA 5KMYA 2OT0A 4JTFA 3TMQA 4LUJA 4EF9A 5K3VA 3HF3A 1S5WA 4JN6A 3KRSA 3G24A 3PF3A 2P1FA 1VZWA 4HKPA 2WNZA 1Q6OA 4DELA 4Y9AA 4GUJA 3LOTA 4U4MA 4S2BA 4IWWA 1KBIA 4FXRA 1TPWA 3DKLA 3NYZA 4UTLA 3KVKA 1KTNA 3L0GA 3PB0A 1OYBA 4DBDA 1H50A 2ALDA 2C0AA 1B57A 1SO6A 2B4GA 2NV2A 1W0MA 4FX7A 1TO3A 4NXSA 4N02A 3GR8A 2PRLA 1H1ZA 3W83A 4YL2A 2JGQA 3LHVA 2NX1A 1VC4A 3S1WA 4RV8A 3QSRA 3STEA 3W71A 1Q6RA 2ZTKA 2RH9A 5I3KA 3HQ1A 4BWLC 2R91A 4RKAA 1G4PA 1XDLA 5C6MA 3KXQA 3BG3A 1YPFA 2WNNA 4IX0A 3TIMA 1HG3A 2AQWA 2YYUA 3GYEA 2CZEA 1RD5A 3UD6A 4HNVA 3W2KA 3W2LA 3FIGA 3TW6A 3QSTA 1RQEA 2X1TA 3LBMA 3SFKA 1G4SA 1F6PA 3MP4A 4YWIA 1TPB1 4BI7A 2VC6A 1KM6A 2CW6A 3STFA 2G97A 3W9ZA 3Q58A 3SY5A 2GVJA 4AAJA 1VHNA 2Q8ZA 1IXPA 2RDUA 2R8WA 4DPQA 1FDJA 2ZQ0A 1JCYA 1W8SA 5K7JA 1HO1A 1EWEA 3RNDA 4LRTA 4FXSA 4O1CA 3E0IA 4DO6A 2YR1A 3UWWA 3NAVA 3W2NA 1L2UA 1SW7A 3ABRA 2YDAA 3C6CA 1M7PA 4IMEA 4FNSA 3MYOA 1ZENA 4WOZA 1LBLA 1FCQA 1SO5A 4PCFA 4AEOA 3G0XA 3M41A 3ZR4A 4K7VA 2VFHA 2PRMA 2Z2UA 3UQNA 3GR7A 4TIMA 1AL8A 3DH7A 3UWYA 4IGHA 5J5DA 3UXAA 2V2HA 5G4EA 3W1UA 3S1XA 1RZMA 1FX6A 3CT7A 2YYTA 4OE7A 4EWND 4LUIA 3DGRA 4LY8A 4FNQA 4N2YA 3T78A 4XUGA 5HQEA 2XFWA 3LB0A 4QM1A 3DU0A 1DBTA 1CX9A 3HGOA 1M7OA 4CCDA 4RLIA 2Z0IA 2CWNA 3LX9A 3LHWA 4MLRA 4LRSA 3S6DA 2DORA 1LORA 2NX9A 1ZY9A 2C16A 3GK0A 4UTWA 1G7UA 5HINA 1O5KA 5AC7A 2Q3RA 4RXFA 3B8DA 1H7WA 3GNDA 1QR7A 5KINA 4IX2A 2YSWA 3B0UX 2V5LA 4GUHA 1W5NA 1TV7A 4KFPA 3WJSA 3I7RA 2GQ8A 3FYOA 1QO5A 3FFSA 4UTIA 1A5SA 4GC4A 3KRUA 2QF7A 5DN1A 4Z1DA 4LVAA 3LBCA 3PUDA 6ALDA 4KKXA 4CNPA 2ATMA 1TV8A 4PTNA 1VRDA 4KWWA 3G22A 3IIOA 1HFBA 3LXCA 1H7NA 5TQLA 4LTSA 3P80A 5AHLA 4EOUA 1I2OA 1SFLA 3G1XA 3S5YA 3W7NA 3TFCA 3EWXA 4TX9A 4UFLA 4D2JA 3WJYA 3L66A 3PSWA 4WXZA 5D38A 5EYWA 3S1UA 2YGYA 3T7VA 5AFDA 4UNKA 2GPTA 1I2NA 2DZVA 2ZA2A 5H2ZA 2A1YA 2E6FA 4UTHA 2AGKA 3LV5A 5D04C 3O06A 2EAWA 1I2RA 4XTDA 2V81A 1C29A 2ZRXA 3W7IA 1TPUA 1DQWA 4WZHA 2X2GA 3LTYA 4OGZA 5DBUA 2QDGA 2BX7A 2DJXA 1TPVA 1MEIA 5HMSA 3UPBA 4GWEA 2QUUA 3PBWA 1GT8A 4TMBA 3QH2A 4ADTA 5IBXC 3W7PA 4LS0A 1JQXA 3GZ3A 4UXDA 2VFGA 1OF8A 3B03A 4O52A 1YDOA 3C56A 3I6RA 3NL5A 3I7SA 5F1UA 1EPXA 3UWUA 1TPDA 2X1SA 4Y90A 3V75A 4IOTA 3L67A 2A85A 5CZ0A 3MI3A 4AWUA 4IMFA 4K38A 1BWKA 5AC6A 3BLFA 4M7SA 2GJNA 2GJLA 2FB3A 5G5IA 1WA3A 4K39A 2BXVA 3ZS4A 1PIIA 2E5DA 2OCZA 3W7KA 3W7JA 3P5ZA 4NJHA 1TQXA 1SR9A 3HG2A 4Z1BA 4LS2A 3M7WA 1KV5A 2QCCA 2B7NA 4Z1AA 4JX6A 4ZQNA 3IGSA 2GVGA 2P10A 2ZRZA 3FJ6A 2XN0A 4FB7A 2E77A 1BWLA 3LCXA 5EBUA 1LZOA 2XN1A 4UCGA 3HGRA 1XKYA 2A2IA 2V9DA 4ZMGA 2J9YA 1OFQA 2Y89A 2Q8LA 1IIGA 3S1VA 3HPXA 3LRKA 3O07A 3KRZA 5HR7A 4HNNA 4I7VA 4AHQA 5CPMA 3M6YA 1GVRA 1FXQA 3GB6A 3CC1A 3W7HA 3ATYA 1P4CA 1L6WA 1T8XA 3JRKA 4GXMA 4O57A 3CHVA 3DXIA 4ZQPA 1N8FA 1A5AA 2FJKA 4Q32A 4JR5A 2C6QA 5AB3A 2RDWA 2TPSA 1KM2A 1WOBA 4KWVA 3NOEA 1VLIA 4O19A 2ZTJA 5MHBA 3W7CA 3I65A 1I8JA 2DU2A 3TJLA 3KX6A 4QITA 4RXGA 4AVFA 3HOJA 1VCGA 4Z08A 2D73A 3L65A 4Q4KA 2H8ZA 4FX6M 1UASA 2WPBA 4O14A 4G1KA 4LVDA 1GQNA 3AJXA 2WKJA 2JBMA 2OJPA 5KSWA 3R8RA 5TBOA 4A2RA 1TRDA 3M5XA 2W79A 2Y7GA 4JEQA 1NEYA 3NL6A 4JIQA 1TMHA 1GVFA 4PL2A 3MO7A 1OVDA 4M6PA 1SW0A 1EUNA 5CPLA 1KFKA 3T4CA 1W56A 4JYFA 3W6YA 1SU5A 5AHEA 3NQGA 1OX4B 2RKXA 1Z42A 3CEPA 5BMXA 4O0KA 2VENA 3FOKA 2E68A 4CQAA 2QR6A 4O17A 3T44A 4NNAA 1XUZA 5HUPA 1SZEA 4O28A 4JDYA 1ZAJA 4NZFA 2CLFA 4H4IA 1JVNA 3GDMA 3B0PA 3W88A 1UUOA 1YTKA 4QJ1A 3BLIA 1XUUA 1SW3A 3MJYA 3QFEA 5HJLA 3ZFHA 2DP3A 2DZTA 2NLIA 4DBEA 2IQTA 3EKZA 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4W9TA 1QWGA 3LTSA 2ZZ7A 4HNUA 4A21A 3TQKA 2QCNA 4ZZ9A 4FNPA 3T40A 5CPOA 3W74A 1I2PA 2WO5A 4BFAA 1LOQA 2P0OA 1AMKA 2TMDA 1TV5A 3A5VA 2NUXA 4IUOA 4MJMA 1Z48A 2ZA1A 4LC8A 5FF3A 4CNNA 3BW2A 4UR7A 5FEXA 1QMLA 3G1AA 1WX0A 4OWGA 3Q2DA 4QIUA 1FDZA 3N34A 4K37A 2EGZA 3EX3A 1GG1A 4UTTA 4QSHA 4JYEA 3OHIA 1LDCA 3QZEA 1LM1A 3C0JA 2X1RA 3EWBX 3A22A 2ZZ4A 4O1BA 4IXHA 4RZ4A 1X7FA 1JCLA 2ABBA 2VFFA 1K02A 5EL1A 3N9SA 2I14A 2ZZ5A 3A23A 3HJZA 2TRSA 4AXKA 3L5LA 4RCXA 3NQ2A 5T26A 2CZFA 4JX5A 3RFAA 2HS8A 1OYCA 2JKEA 3DI0A 3MBDA 3UY8A 3GXNA 4NJJA 4O10A 4FF7A 3STCA 4WQ6A 1A5CA 3HPZA 2C1HA 3TDFA 1TTJA 3N2XA 3TXVA 5F2GA 3FA5A 3O6CA 3TMLA 1NVMA 5I3GA 4JTSA 1AG1O 1ONRA 2WQPA 3UYCA 1F73A 1TTQA 1ML1A 3NPVA 4JGDA 3E02A 3TU9A 5K9CA 1G69A 2R14A 1ME8A 1KTCA 3EX2A 1VCVA 2YFOA 3W1AA 3C2OA 2QUVA 3I68A 3M5YA 3WK2A 4ALDA 3PVFA 1A5BA 2Y62A 3QW4B 3W1QA 3W84A 2Y7FA 4OQVA 3QEZA 3ATZA 1KM4A 3CIXA 5FI8A 2C13A 4XBKA 3WJWA 5DCEA 3W85A 2E6YA 1PE1A 4MY9A 1LP6A 1VCFA 3F03K 2E5CA 4R53A 3NQ6A 1O5XA 5BNKA 2YCEA 1VS1A 3DKJA 3S42A 4E0CA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3R2GA

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