3R2G | Genus

Total Genus 112

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	112
sequence length	323
structure length	323
Chain Sequence	QAITFDDVLLVPSYNHHESRRVVETTSTDRLGKLTLNLPVISANMDTITESNMANFMHSKGAMGALHRFMTIEENIQEFKKCKGPVFVSVGCTENELQRAEALRDAGADFFCVDVAHAHAKYVGKTLKSLRQLLGSRCIMAGNVATYAGADYLASCGADIIKAGIGGGSVCSTRIKTGFGVPMLTCIQDCSRADRSIVADGGIKTSGDIVKALAFGADFVMIGGMLAGSAPTPGEVFQKDDGSKVKRYRGMASREAQEAFLGQMHEWKTAEGVATEVPFKENPDGIIADIIGGLRSGLTYAGADSISELQRKLNYVIVTQAGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of Inosine 5' monophosphate dehydrogenase from Legionella pneumophila rcsb
molecule keywords	Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Legionella pneumophila subsp. pneumophila
total genus	112
structure length	323
sequence length	323
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-03-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3r2gA00

1KM3A 4RR4A 3QC3A 1H1YA 1H1ZA 1DL3A 3O63A 3O15A 5GVJA 4MIMA 2ZZ7A 4GUHA 4M7TA 4LS2A 2ZZ5A 2B7OA 3WJSA 3TCEA 3LHUA 1OX4A 1JUEA 3NPWA 4NUWA 7TIMA 2ISWA 2QAFA 4S2BA 5FF4A 1WXJA 1XDMA 5I3HA 3HGRA 2GJLA 1ALDA 1LBLA 3G0UA 2GJNA 3FIGA 4HNUA 1VC4A 3W1XA 3MUXA 1RD5A 1XKYA 5AB3A 3P8JA 3ZR4A 5K7JA 2ZBTA 1SR9A 4O1DA 1RZMA 2A85A 1L9WA 3DFNA 3AO0A 3W74A 5D04C 2A2IA 3TMLA 1IXQA 5G4EA 4UFJA 3NQDA 3LBCA 2H6RA 4AH7A 1ZJIA 1I45A 2RH9A 1TRDA 3BG3A 3T4CA 3KRSA 1O4UA 5F4XA 5AFDA 4I7VA 1AL7A 5I3KA 4GWEA 5BRBA 1VYPX 2HTMA 5AC8A 1DORA 4UCGA 1KM5A 2VFEA 3O8AA 1J4EA 3HB9A 3PC0A 2ZRXA 3GNNA 2W0UA 4N2YA 3KX6A 3NM3A 5F2IA 4BK9A 5KZEA 1VCGA 1F76A 4FEZA 5FEWA 1PL9A 1IIGA 1AW2A 4MLJA 1Q45A 3BK0A 3I7QA 5LNSA 2WSRA 3L65A 3LCGA 1KFLA 3NQ2A 4PFMA 3OEXA 1LRNA 3EWYA 1LOSA 1VGAA 2ZFAA 2VXNA 1VCFA 1XUZA 2J88A 1TPVA 2E5CA 4POCA 4QQ3A 3GDLA 2Z6JA 4FF7A 3RLUA 4LTSA 1SO5A 1OK6A 2OZ0A 4AXKA 3KOFA 3M0ZA 3W7MA 5E93A 3MI3A 4JY9A 1I2QA 3N73A 1BWLA 1RPXA 3EX1A 4UTUA 1OX4B 1W56A 3B4UA 4LRSA 1KM1A 4GUGA 5AHNA 3HQ1A 2R14A 2ZRYA 4E38A 3KVLA 1C9DA 5LZLA 3DENA 3DU0A 4QAIA 3TROA 3KFTA 3MBFA 2DZSA 1Z41A 2PE4A 3PSWA 1AW1A 2B4GA 4BF9A 3M44A 1QPRA 5EKYA 3GDMA 3TA6A 1YDVA 5HQEA 1OFRA 4IXHA 1ZHAA 1ZAIA 2QEZA 3N9RA 3W1UA 1RV8A 1T96A 5IM51 3PBYA 5HUPA 5D09A 3LBMA 4MOZA 4E2BA 4JTIA 3OA3A 2DZUA 3CLMA 2ZA3A 3T7VA 2X2GA 1GVRA 3G1VA 3C2VA 3TSDA 1PE1A 1OABA 2WNZA 5DELA 4NNCA 3KRZA 2TPSA 3S5OA 3W1MA 3NXFA 1Q6RA 3THQA 4JDBA 1LRQA 1H7NA 2OMAA 3LXCA 1TIMA 1TPH1 5K9DA 1ZNNA 2ZZ1A 2JKEA 2JGYA 5G1TA 2VEPA 4XKYA 2RFGA 3IGSA 2PRMA 4AWUA 3SIZA 3HBLA 3QJAA 3EX6A 4O10A 2A6NA 2FQIA 3KHJA 3F1QA 1ONRA 3O1NA 2ZTKA 2E5BA 2A7RA 3BGJA 1PCKA 4YWIA 1VZWA 3D0CA 4IX2A 5TIMA 3TQKA 3NGJA 4RV8A 2PRHA 4IMCA 2D73A 4DQWA 1SQ7A 2ZZ2A 4TMCA 5HUOA 1AL8A 3GDRA 4A3UA 4EVZA 2E6AA 1J2WA 3QPZA 5FF3A 1P4CA 3S0CA 3ABRA 4NX5A 5EMUA 1OYCA 2NLIA 1VHCA 3NYZA 4JY8A 2NUYA 1OYBA 3B0VC 2HS8A 3UZ5A 2QCDA 4WXYA 2BLEA 3MBDA 4O4VA 4YCPA 3NZ1A 2CFFA 2NV2A 1W5QA 3EKZA 3TC6A 4GFSA 1KTCA 2B7QA 4WD0A 3C6CA 2UV8G 3G1DA 3STEA 1JQXA 1MSSA 1MEWA 4QJ1A 2B7NA 1CI1A 2P1FA 2ZRWA 4O57A 2FLIA 1TPC1 3CB8A 3UXAA 2VFIA 1LDCA 1YTKA 3U6WA 1C29A 3C2EA 1XDLA 3NNTA 4DXVA 2FPYA 1A5BA 1H5YA 3PR2A 5CSSA 3TE9A 1PVNA 3W85A 5CSRA 4JDYA 4O0ZA 3L5LA 4CQAA 2QDGA 4HPXA 3FFSA 3HGOA 3GAKA 4XKYB 3UWWA 1TQXA 5D05A 3GLCA 4BFAA 4KFNA 3RNDA 1H7OA 2ATMA 1GG0A 1W1ZA 2YR1A 1ICPA 1F05A 3LM7A 3MJYA 1KLZA 1LYXA 3EWZA 1JUBA 1TTPA 3G18A 3MMTA 3NDOA 1FXPA 5C54A 1WDWA 3DFOA 3SSJA 3LLDA 1YPIA 3E9AA 1RQHA 1UUOA 1FWNA 2Q3RA 4LUJA 1XL9A 1YDOA 2X1TA 2LLEA 2J9YA 5D38A 3NA8A 1HUVA 1A5AA 1K8YA 1K7XA 5DLCA 4GUIA 1GVSA 3Q37A 3R2GA 2QCDB 4UTJA 1SZGA 3I65A 5KZDA 2BTMA 3PBWA 3R5EA 4MYXA 4O16A 1P5BA 4NT0A 3M6YA 4UR8A 3HG2A 4CCCA 3NL5A 1T0OA 3N2MA 1TPB1 1H62A 3OVQA 4QNWA 5D30A 3LCXA 2Y7EA 3VKJA 3GDTA 4FX6M 5ABTA 2CZFA 5FF0A 5LNWA 1DQWA 3V1PA 4PEKA 4EF8A 4NU7A 4XWUA 3P82A 1ICQA 1TTIA 3LTSA 3GR7A 4YLWA 4JX5A 1DOSA 4M5PA 3FYPA 4AMAA 1AG1O 2FB3A 1SUXA 3LGEA 3OHIA 1ADOA 1QCWA 2E6YA 3HGSA 4H4IA 1K8ZA 3TSBA 1MEHA 4UNLA 4IJBA 2X16A 3L68A 4UTTC 1W3TA 2X1UA 5TBOA 2ZZ3A 5DCEA 3YPIA 1K7FA 3G8EA 2QCCA 5MHBA 3TX9A 3T55A 2NX1A 1JRCA 1N55A 1DJQA 1L2UA 1EWEA 1GEQA 4JTSA 4FNSA 3TAOA 4E0CA 4MJZA 1B4EA 3G3MA 4LC8A 3RF9A 1M7PA 4ADTA 3P8IA 1DVJA 1TYGA 3O06A 1O5KA 4IMFA 3E02A 4O4WA 2EKCA 3A9IA 3G24A 3R12A 1GOXA 3H54A 4CQ9A 1H7XA 1XBXA 1W3IA 1PHWA 3NPVA 1D9EA 4A22A 3HO8A 3OG3A 3L67A 2QCHA 2YZRA 5D2WA 1N8FA 3R13A 3W7IA 2A0NA 2VEIA 3U2OA 3L2IA 4LV9A 3M9YA 3NQ7A 1RVGA 2PCQA 1VS1A 2ZDRA 1HO4A 2NUWA 4NXSA 5CZTA 1TCDA 2R8WA 3W2LA 4ZZ9A 3CHVA 3NEVA 4M6QA 5AHLA 3LHZA 1DQXA 3NG3A 3MP5A 3VE9A 3LCIA 3W7EA 1F7BA 2V81A 3UNDA 4JYFA 2VFGA 1WA3A 3GDKA 1JRBA 3W73A 3EEGA 1KBIA 4J9JA 1FXQA 3BO9A 3W7JA 3MWAA 1NF7A 1QPNA 3ZWTA 2NV1A 4JTHA 1NAL1 1TPWA 3ZFHA 1A50A 1W8SA 2GVJA 2VENA 2H90A 3F4WA 2GQ9A 3HPSA 4NZJA 1OFAA 2NXIA 4K37A 1OF6A 2CLFA 3HIJA 2FB2A 3N9SA 1JCLA 4O17A 1SFJA 3ABSA 1H61A 5LNUA 2A5HA 3PVFA 1Z42A 2CZ5A 1L6YA 2V5LA 1DJNA 4DO4A 2QUTA 1LP6A 2G96A 5F2LA 1OX5A 1QDSA 4K8EA 3H53A 4ZVJA 2ZYFA 1SFLA 1KA9F 3TAKA 1OJXA 3LXBA 3O05A 1QR7A 1EEPA 4WOZA 4N6EA 3N2XA 4CNOA 2I9EA 4UTTA 3S8HA 5LGXA 3R8RA 4JX6A 4XZ9A 3LRLA 3W83A 2WJZA 4O1BA 1TPFA 1QO2A 1IXOA 1JCXA 5HWNA 2YW3A 3W2KA 2Q8LA 3TFXA 4C1KA 1PS9A 3G1XA 2VC6A 3ABQA 4NNAA 4IMGA 5CPOA 6TIMA 5BOOA 1ML1A 2O7SA 3G22A 4O53A 3KRUA 2Y7FA 1A5SA 1IGSA 1VCVA 4IPJA 5D03A 2A7PA 3KXQA 5AYZA 2FDSA 3SR7A 1W0MA 1VJIA 1KV8A 1MZHA 4JTJA 3M5YA 3W7KA 4Q4KA 4JTTA 5G5IA 1JVNA 3P5ZA 3A5VA 2RDUA 2V2HA 1KM4A 2VFFA 3LHYA 1PHQA 5DY2A 4IXXA 5EYWA 4N9DA 2C18A 2J6XA 2F84A 4I7WA 1PCWA 1S5VA 5U4NA 3TIMA 3G1FA 1VYSX 1ZENA 4ZQMA 3DHDA 3TU9A 4JICA 2CZDA 3DKJA 5D2VA 2ZTJA 3SZ8A 3W2MA 2WV8A 3TC7A 3QMSA 3GXTA 2V30A 3FLUA 4FNRA 1NSJA 2Z2UA 3EXSA 5CG7A 1WBHA 5AYYA 4MJMA 2PRLA 3K30A 3JS3A 1XFBA 3MYPA 1PV8A 3EKLA 3L66A 4O8RA 2GQAA 1OK4A 3W84A 3C3NA 4MUZA 4OHQA 4LY8A 3Q2DA 2EPHA 1ME7A 2C19A 1XBYA 2VFDA 1NVMA 1OVDA 3LXAA 3TJXA 4ADSA 2TMDA 4IMDA 5HULA 3S5NA 4B5NA 4O19A 5H91A 4N9CA 4UTHA 1KFCA 1O95A 1GVQA 4S1FA 3LDVA 4AB4A 3E0IA 1ZY9A 4EIVA 3IIOA 3PULA 1TPEA 3L9CA 3B8DA 1X7FA 3DAQA 3EX4A 3QMTA 4K36A 2HS6A 2JKAA 3LCHA 5LGZA 3B0PA 4HNTA 3TMQA 3RU6A 5F4WA 3LRMA 2Z0IA 3UQNA 2PURA 3N14A 3A23A 4BI7A 1KFBA 2XFWA 3C56A 4N6FA 3GXPA 1QPOA 3P7YA 2JK2A 1ICSA 1B3OA 3TUUA 1LBFA 4JD4A 3ABOA 3QYQA 1LOQA 3STGA 2QCNA 5AHIA 4QITA 1G69A 3MHFA 3EWXA 4CCDA 1FUYA 4A2SA 1VPXA 2CU0A 3N34A 3E49A 3CM4A 1L6SA 1OF8A 2ALDA 3BARA 4IPIA 3W2NA 3IIZA 2VKZG 2H8XA 2DP3A 3HG3A 2I14A 2C13A 1IXNA 1CX9A 3DFTA 1WBJA 4OV9A 1KFEA 2WNQA 5KSWA 5KZMA 1SU5A 2RKXA 1X1OA 4Z1DA 2C15A 4A29A 2OX1A 1OG0A 3LTYA 1LLZA 3ZS4A 3T40A 5AC6A 3SI9A 1TPUA 3G1YA 3LX9A 2ABBA 3TDFA 3R89A 2DJXA 4DPQA 3W7OA 1S5WA 4ONVA 3STFA 5I3JA 1K7EA 1TQJA 2CW6A 3S1VA 1EP2A 3UWYA 5AYXA 4I7UA 4M19A 3SGZA 5J5DA 1OYAA 2QUVA 3BG9A 4DO5A 2F7FA 1KFJA 3QFEA 2YW4A 1F5ZA 3M5VA 4X9SA 3DBPA 3W7QA 4FNUA 1W5MA 3GZ3A 3T44A 2E5DA 3WK1A 3W1QA 3CC1A 4NJJA 3VFLA 1EPXA 2YXGA 3GKFA 3N19B 1P0NA 3UWVA 2QCGA 4AWSA 2YDAA 1QNVA 2ISVA 1GQNA 3H55A 3FKKA 3WJZA 2J24A 2IQTA 3NQAA 1JCYA 2EGZA 4OT7A 3EXTA 3Q94A 4IUOA 1G6CA 3MI2A 5A8GA 5CKSA 2BWGA 1XXXA 1TTJA 2ZZ6A 1EUNA 1D3HA 1XM3A 4O1AA 3W75A 3TQVA 3INPA 3DFSA 3W7RA 5LHEA 3EWWA 1X1ZA 3P81A 4UFKA 2WO5A 5EBUA 5LHFA 3G3DA 8TIMA 3P5YA 3IIVA 1G67A 3CIWA 4LC6A 1SZFA 1WX0A 1QFEA 2NXHA 2H3DA 3TH6A 5U7SA 4JTKA 5SWUA 5DN1A 5CZSA 4TO8A 4D2JA 4DO6A 5EPDA 5FEXA 2CLEA 4RK8A 1LZOA 1O60A 5KMYA 4MY1A 3MO7A 5F2MA 3NQ6A 2Z6IA 1J5TA 5K3VA 4MZ1A 2X30A 2PC4A 4JTLA 5C6MA 2QJIA 2I1OA 4JIQA 4JN6A 1GVOA 2V82A 4WOQA 4GUJA 4JIPA 2CLLA 1H51A 3UYCA 3IIPA 2VEMA 1QAPA 5HJLA 4UFIA 3UXDA 1GTHA 1RR2A 4Z1AA 3CT7A 4DBDA 1SO3A 3FOKA 4YXGA 3NR0A 5BW6A 3G1AA 3ANYA 4JYEA 3KVKA 1XUUA 4LVDA 1KFKA 4A2RA 5CZ0A 4JR5A 4UUIA 1LRTA 1D3GA 4WXZA 2FFCA 3W1NA 2YCEA 4A21A 1GTEA 5IBXC 1TSIA 2ZRUA 3TW7A 3FEMA 4N9EA 2ZZ4A 4K38A 3TFCA 4M6VA 4UMBA 5FI8A 2FJKA 3DXIA 3MW7A 2DZTA 3QEZA 4AHOA 1ZFJA 3UY7A 3WJXA 3FA5A 4JTFA 3EXRA 1A53A 4GBUA 4RZ4A 1O5XA 1FCBA 5D37A 4K39A 4O11A 1FWRA 1R2RA 1FQ0A 4O12A 3P62A 3V75A 1H7RA 1XC4A 2AGKA 2B0MA 2R94A 3LI1A 3W22A 2QAPA 2NXGA 3BLFA 3KAOA 4PTNA 3B0UX 2DZXA 4O52A 4XUGA 2C0AA 4CQ8A 2ZQ0A 3GK0A 4P61A 3M47A 2C14A 4AEOA 3W07A 3SFKA 3W1PA 3W7DA 5BMXA 4C1LA 3M5XA 1K02A 3F4NA 4TR9A 2OT0A 4KWVA 3A24A 3W7PA 5K9CA 4FNQA 4R33A 1SSDA 3N3MA 1GVFA 2RDWA 3DH7A 3RMJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3R2GA

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