3R5EA

Transaldolase from corynebacterium glutamicum
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
360
structure length
360
Chain Sequence
MSHIDDLAQLGTSTWLDDLSRERITSGNLSQVIEEKSVVGVTTNPAIFAAAMSKGDSYDAQIAELKAAGASVDQAVYAMSIDDVRNACDLFTGIFESSNGYDGRVSIEVDPRISADRDATLAQAKELWAKVDRPNVMIKIPATPGSLPAITDALAEGISVNVTLIFSVARYREVIAAFIEGIKQAAANGHDVSKIHSVASFFVSRVDVEIDKRLEAIGSDEALALRGKAGVANAQRAYAVYKELFDAAELPEGANTQRPLWASTGVKNPAYAATLYVSELAGPNTVNTMPEGTIDAVLEQGNLHGDTLSNSAAEADAVFSQLEALGVDLADVFQVLETEGVDKFVASWSELLESMEARLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conservation of structure and mechanism within the transaldolase enzyme family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transaldolase
molecule tags Transferase
source organism Corynebacterium glutamicum
total genus 151
structure length 360
sequence length 360
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-03-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3r5eA00
1Q6LA 4Z1AA 3IIOA 1OK4A 1TTQA 5TIMA 4WUIA 2DP3A 3P80A 4Q32A 2GPTA 3DXIA 1LYXA 1XXXA 2XN1A 1QPOA 4MYAA 2Q8ZA 3P67A 3LCIA 3LHWA 3WJXA 1KM4A 2ZZ6A 3LXCA 3W2UA 1I2NA 3MP3A 1OHLA 3I6RA 3QYQA 3IEBA 3NYZA 1K7EA 4ZQNA 3QH2A 3CWNA 3S8HA 3NQ7A 3CEUA 3MO7A 2JKEA 1OYBA 4WXZA 5F2LA 2OMAA 4AHOA 3LBCA 1TJPA 4AAJA 4O28A 3UWWA 3MHUA 2YX0A 3JRKA 1DJNA 3W7JA 2XN0A 3M43A 3IVSA 3S42A 3QPYA 3BW2A 2QCMA 1TTPA 5TQLA 3B03A 3LI1A 4UFLA 3TX9A 3CHVA 4ZMGA 1H7RA 4NU7A 1HO4A 3G1SA 1WAUA 4UFKA 1AW5A 3W7OA 1C9DA 2V5LA 4RXFA 5DCEA 1I8JA 3GDRA 1MZHA 3EKZA 1M6JA 1KTNA 4UTKA 1KTCA 3NPUA 4FXRA 3UD6A 1BEUA 2EF9A 1SW7A 5KITA 5HINA 4UR7A 2QCDB 4IXXA 4OBTA 5F2MA 1LORA 1T96A 3OA3A 2ZCGA 5AYXA 3W1LA 4O15A 4BK9A 4WX2A 2WKJA 4JTTA 4O52A 3G1DA 2YPIA 1P5BA 1KM6A 3DGRA 4HNNA 5KMYA 1TMHA 4PFMA 5K2ZA 1L2UA 4UTWA 5LNVA 3ABQA 2VEKA 5G2HA 4TMBA 1TPWA 2YDAA 2FJKA 4JY9A 2EGZA 4AF0B 5LNRA 3Q94A 3CC1A 4LVBA 1W3TA 2ZRUA 3PF3A 1PCWA 3NQEA 1Z44A 3LRLA 1NSJA 4ADTA 1M7PA 3TMLA 1PVNA 1KW1A 4WY0A 3JR2A 3MUXA 4Y96A 1I45A 3M6YA 3FOKA 2H6RA 5FESA 4O16A 2D73A 4NJJA 1VGAA 3A22A 2V81A 4N9DA 4JTEA 4O18A 4GUFA 3C3NA 4MY1A 4QISA 4PL2A 5L9FA 1KFLA 1ZFJA 3BLEA 3LI0A 4XUGA 4ZQCA 2RDTA 5CPNA 5K4ZA 3GNNA 1ONRA 3PULA 3HJZA 1PHQA 3UY8A 5HWJA 4GE8A 1S3HA 1B4KA 1OFEA 1PS9A 5D03A 1R47A 5AB3A 1A50A 5DELA 5EBUA 1GZGA 3PBWA 4CCCA 3Q2DA 1K3UA 4NJHA 2QDGA 3M47A 1ZY9A 2A2IA 2HS6A 1H1ZA 4YXGA 3QRHA 1JULA 4UMBA 2VELA 3W88A 3NQMA 1RV8A 4RJEA 3GXTA 1BWKA 1V7YA 1VJIA 2OJPA 3W2JA 4JTJA 3O06A 5DN1A 2CZEA 2C19A 3L0KA 2B0MA 4XKYA 4MJMA 4MZ1A 4JX6A 1T8XA 1GT8A 4N4QA 1QPNA 3P8IA 1O94A 1N7KA 4X2RA 4Y6GA 1KLZA 4HIBA 2NZLA 1ZENA 5HUOA 4QJ1A 2ZA2A 4ADUA 3UYCA 3W7IA 4MY9A 3CM4A 2ATSA 3B0PA 4JR5A 1KA9F 1Z42A 1JRBA 4K6AA 2QUTA 2X16A 1B9BA 4S1FA 2JKPA 1H63A 4Z0JA 1H51A 2VENA 1W5QA 6TIMA 2CZDA 1F05A 3NQDA 2Y70A 1OFAA 4Q33A 5EMUA 3W1MA 1H7XA 3K30A 2GVGA 1HFBA 4XBSA 1QPQA 4C1LA 4FNSA 3NDOA 3S1UA 3NL6A 3OIXA 4UTMA 4BI6A 1XBZA 2X1SA 3KVJA 3DZ1A 2DZXA 1ICQA 1F73A 2DU2A 1G7UA 1KFCA 4MKNA 4Y8FA 3UWQA 1K8ZA 4MIMA 1GQNA 3I68A 2OT0A 3NQ6A 1H1YA 3NL3A 5LHEA 3C4UA 2Y7DA 3VFLA 2X30A 5HNRA 4JY8A 1MO0A 3L67A 3WJWA 5LNWA 3IGSA 3T78A 5I3JA 1GVQA 4K7VA 3TFCA 3Q37A 4K36A 4OQVA 4ZVJA 2QJGA 3PUOA 3ATZA 2BZNA 5D2YA 2DZWA 3GR7A 3S9YA 2Z0IA 2Z6JA 4Y90A 4N6FA 1UASA 1TPFA 1GYLA 4O1DA 1UB3A 1HO1A 3N34A 3LERA 3E12A 3T55A 3TSBA 1Y0EA 5DBUA 4DO5A 1V5XA 2ZRVA 1LRTA 1CW2A 3TW7A 5F2IA 2CWNA 4DEFA 5HJLA 3S6DA 3W7GA 1OG0A 5F4SA 3QF0A 1L6WA 2Y61A 3O05A 3RK8A 3BLIA 3DFOA 1JCNA 3G1XA 4JTSA 3EWXA 1KM3A 2Y7EA 3N73A 1GG0A 2H3BA 1K8XA 4NJGA 3ABOA 4W9TA 4TX9A 4NNCA 1ADOA 2BLEA 4A2RA 3LM7A 1TRIA 3S5OA 2NXGA 2YW4A 1RVGA 3NR0A 4JTHA 3UPBA 1R30A 1FWNA 1SZEA 5DCDA 1JUBA 1X7FA 3BV4A 3LRMA 4CLMA 4K8EA 2VFDA 3KRUA 3W7EA 5AHMA 4RK8A 1JQVA 5K7JA 2FPVA 1H7OA 1PCKA 2RFGA 2J9XA 2YSWA 4BWLC 3HF3A 2VKZG 1L6YA 4UTUA 2V5BA 3CWOX 2B7QA 3NL2A 3LGEA 4O4WA 1X1ZA 4O10A 4JICA 3ABSA 4WOZA 4PA8A 3HMJG 3BK0A 4IUOA 5KSWA 1GVOA 4JXCA 2CLHA 1H7PA 3TCEA 4EF9A 1G4SA 1LCOA 2X2GA 5CZTA 3FKRA 1W56A 2ZZ7A 2A7RA 4GJ1A 2E6YA 1RPXA 1OFBA 3BVJA 3N19B 2GVJA 3P62A 3A9IA 3NAVA 3NQ2A 4AWTA 1GYNA 1LOLA 3N2XA 1Q6OA 4RZ5A 3GR8A 1NFBA 4ORMA 3QQ1A 1B57A 3PG8A 3TAOA 3MMTA 1FXQA 2ABBA 2PRHA 3GYEA 2NX9A 3E0IA 4HN4A 1JJKA 3W7HA 5AHLA 1EP2A 1X8FA 1SQ7A 2Q3RA 2RHGA 4O12A 4KKXA 3TAKA 3W3OA 1OVDA 5C2XA 4JD4A 3LTPA 4HPJA 2RH9A 3F4NA 5BRBA 1N8FA 4ZZ9A 3TJXA 2PE4A 2CLIA 4ML9A 3PB0A 1KM5A 3P82A 2EKCA 4POCA 4Q4KA 1LBFA 1I2RA 1R2TA 4DPPA 4R34A 4FX7A 3NZ1A 3BW4A 2G95A 1IXPA 2WO5A 3UWVA 5A5WA 4DF2A 3M5VA 1H62A 2GVLA 2QCDA 1XCFA 2Y85A 4U28A 1W5MA 2B7PA 1G67A 3LHYA 4NJIA 1W5PA 3N3MA 1RD5A 2A6LA 1A5CA 2Y6ZA 1LDCA 2BTMA 1TPDA 5FF3A 2I1OA 3PAJA 1VCFA 3B4UA 3EWZA 2WQPA 3HB9A 3LB0A 5ABTA 5G1YA 2NXHA 3TE9A 5D30A 5TBOA 2QCLA 4N9BA 2X1UA 3SECA 1XUZA 4LV9A 3HOJA 1QR7A 1K7FA 3GDKA 3HO8A 3TQ0A 3NNTA 4G1KA 2QCEA 2R94A 5CG7A 2E6DA 4WQ6A 3W22A 3P5ZA 4IMCA 3LTSA 3EWBX 2ZA3A 1XDMA 5KZEA 4GUHA 3QMSA 3R2GA 3EXRA 1IF2A 4WY0F 1F7BA 2GQ9A 2QCHA 4NQ1A 2ZRYA 1AL8A 2E09A 3DI0A 3EEGA 3GB6A 4M6QA 1OFRA 1FDYA 4TIMA 1OYAA 4JNMA 4IX2A 4PH6A 4K8HA 3NQCA 4GRSA 3P61A 1DJQA 1MEIA 4J9JA 4UFHA 2DJXA 3S5ZA 1DVJA 1H50A 4H4IA 1LOQA 4M5PA 4TMCA 5HUPA 3KRSA 1VCVA 2F7FA 3HPSA 1H61A 3TW6A 2NUWA 3NL5A 2QCCA 1HG3A 4UCGA 3HGJA 2GJNA 1FDZA 3W9ZA 3W84A 1AW1A 3AJXA 2HTMA 5CKSA 1OFOA 2LLEA 3DAQA 4RX0A 4JDBA 5D37A 4O1CA 3R5EA 4DBDA 3W72A 4AWSA 2FQIA 3M16A 1I2OA 1VHNA 1EWEA 5G4EA 5AFDA 4ICNA 1QCWA 1ZCOA 2Y88A 4I7UA 3W2NA 2E1DA 3TIMA 4AHQA 2ZYFA 1WBJA 3W1PA 2J24A 4RXGA 3LRKA 5U7SA 4M6PA 1JCLA 1XI3A 1FWSA 3LXAA 5AOUA 3E9AA 2GQAA 1TV5A 3EWWA 1AK5A 1TPB1 1FCVA 3U6WA 1JCXA 4OU1A 3B06A 3PR2A 3PS7A 3RMJA 3QFEA 3G0XA 2XFWA 1G7VA 3O6CA 2TSYA 2CLOA 1ME8A 3W1NA 2YCEA 1RQEA 3M7WA 3QM3A 5G5IA 4EOUA 1YXCA 4NJKA 4QNWA 2E77A 1X6UA 3LCLA 2V30A 3KX6A 4X22A 4O57A 4RLIA 3W7MA 2FPYA 4M6VA 4E2BA 1DQWA 2Z1BA 4L4LA 3S1VA 3GLCA 4IOTA 3P60A 2GOUA 1W5NA 1QAPA 3L68A 3FFSA 2UV8G 3RLUA 4FB7A 4LRTA 1GTEA 2WNQA 4A3UA 1K03A 2H90A 4XTIA 4CQAA 3PY2A 2DZVA 3STCA 1G6CA 1SZNA 3LCGA 2HS8A 5E93A 5K4XA 4JS3A 3LCFA 4O11A 1QOQA 1GWJA 2A21A 1HL2A 5D09A 1VLWA 3TKFA 5HWNA 1J4EA 2E6FA 3W23A 3TK7A 1R2SA 3W7CA 2JK2A 1LLWA 4MOZA 3GNDA 4JEQA 1XBYA 3IIPA 3IGUA 1FQ0A 4NT0A 3NQGA 2ZTKA 5I3KA 1LP6A 3P5YA 3ZS4A 4GXMA 5I3GA 3OEXA 5GVJA 3PUEA 1NF7A 4BF9A 4RKAA 3LX9A 3HG5A 3A21A 1F2JA 2EHHA 4FIQA 4B5NA 2WPBA 4JTLA 3LCXA 1FBAA 2RDUA 3I7SA 1GVSA 1FXPA 3P74A 3L21A 4H6KA 3P81A 7TIMA 2VFHA 2ZBTA 4RR4A 1SR9A 4WOQA 8TIMA 5L6UA 4JX4A 5FF7A 1SO3A 1SW3A 1S5TA 4AB4A 1W1ZA 1GVRA 4LS2A 3GX9A 3TH6A 3TXZA 4CNPA 1GJPA 3QZEA 3VI2A 1GVFA 1LLZA 1YDOA 2OCZA 1VC4A 1ZHAA 2OX1A 2QJIA 3B04A 2CZ5A 1VYSX 3SGUA 5AC6A 2V0TA 3CEPA 4MLJA 4MFEA 2RKXA 3DFSA 1J5TA 3KHJA 3NOEA 1NAL1 3FS2A 2HSAA 1EP3A 4GWEA 3TMQA 1LBLA 1A5AA 2QCGA 3W85A 3W87A 1YPIA 3LOTA 2CLMA 2V2CA 2DORA 3O1NA 3PB2A 4GFSA 4H3DA 4KFOA 4ZQPA 1U83A 1P1XA 2CW6A 1IIGA 1JUEA 2YZRA 5HULA 1AL7A 2TMDA 4X9SA 1UUOA 2WSYA 4NX5A 2WV8A 4BI5A 3PC0A 5LGXA 2C0AA 4UTHA 2FTPA 4WXYA 1O5XA 4EVZA 1F5ZA 4FNTA 1XL9A 3EKLA 2V2DA 1EA0A 4HSOA 4UIOA 1A5BA 4UFJA 1E51A 1UJPA 1SO4A 1C8VA 1VYPX 2A5HA 5G4WA 4YWIA 2E5DA 3W2KA 1TQJA 3W7DA 5IM51 3C2OA 3G3MA 3G8EA 2A7NA 2CU0A 4A21A 5MHBA 5D2XA 5HQEA 5D02A 2YYUA 3G0UA 3NGJA 4JTUA 2Y7FA 4N6EA 3FYOA 1W3IA 3B05A 4QIUA 3M44A 1M5WA 4LW7A 4O1BA 3Q58A 2VXNA 3W1RA 2B4GA 1VLIA 3N9RA 5C55A 4MZYA 2QUVA 2TYSA 3ANYA 3NEVA 4AEOA 2FPTA 2PC4A 3W1XA 5K9DA 5KINA 4XWUA 1YDVA 3LV5A 1KV5A 1FY6A 4YMZA 3I65A 3C2RA 4AHPA 5BNKA 1OJXA 1TB3A 3WJSA 1P0KA 1WOAA 4UR8A 1SPQA 2ZZ3A 3F4WA 3HG2A 3TV8A 1RZMA 4OWGA 1SO5A 1KFEA 4ORIA 3SSJA 3LCWA 1TV7A 1NF0A 1P0NA 4WJEA 5I3FA 2ABAA 5FF2A 3VE9A 4GUIA 1S5WA 3GAYA 5BMXA 5J5DA 4LS1A 1KTBA 2KZHA 4IGHA 3A5VA 3W83A 2C13A 3NZRA 4UNKA 4O1AA 4JTIA 1FDJA 1TREA 1DORA 2V9DA 3F03K 3INPA 3EX6A 2QR6A 3HG3A 4I7WA 4IPJA 5KZDA 2J9YA 2ALDA 4JGDA 1OYCA 1D3GA 1FWWA 3KVLA 3E96A 3R13A 3UY7A 1JUKA 3NQAA 3GDLA 3SZ8A 1KV8A 3IVTA 3NG3A 3DHDA 3L0NA 3T40A 2P0OA 4UUIA 3OG3A 3BGGA 4IMDA 4DPQA 4EIVA 4LC6A 4MUZA 2G96A 5G2WA 1JR1A 4UFIA 4HPXA 4HNUA 3EXSA 3QQ0A 3PBYA 4FNUA 2EAWA 1NEYA 4HT3A 4OV9A 4YL2A 1KM1A 3V75A 3MBDA 1GTHA 3IIXA 4O13A 1MEWA 4I9AA 3L5AA 3VKJA 5DY2A 4JN6A 2VFFA 3B0VC 4LU0A 1W31A 1OF6A 2FLIA 2Z6IA 3OVRA 3W70A 4QNEA 4MJZA 2ZZ1A 4MYXA 2E6AA 5D2VA 1DL3A 5BMWA 4KWWA 2ZQ0A 5CSRA 1U5JA 5G2IA 3G8RA 3H55A 1RR2A 2H8XA 2IQTA 3M5YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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