3RNDA

W116i-oye1 complexed with 2-(hydroxymethyl)-cyclopent-2-enone
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLIVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biocatalytic Reductions of Baylis-Hillman Adducts
rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
total genus 149
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2011-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3rndA00
1XL9A 3VI2A 1I45A 2ZRWA 4O57A 3PG8A 2Y7GA 4WD0A 3NL6A 3DGRA 1VGAA 1ALDA 1LLZA 1SZFA 2QCLA 4EIVA 2DP3A 4O1AA 4MLRA 5AHLA 3C6CA 2ZZ2A 2Z1BA 3ABRA 1R46A 4RR4A 2YYUA 2ZZ3A 3WK1A 3W7MA 4UFKA 2NV1A 5AFDA 1ZHAA 2PRHA 1VC4A 1WXJA 2B0MA 3PUEA 5G1TA 1OYCA 1OJXA 4FIRA 1JUKA 1O94A 1XM3A 3O6DA 1H7RA 3EX6A 1LP6A 3T78A 1SO6A 3EWBX 2EPHA 3QFEA 4HSNA 5F4WA 1H1ZA 2NXGA 2I1OA 4Z1CA 5FEPA 3P5YA 4LTSA 2ZZ6A 2NV2A 3EWUA 2A2IA 4UR8A 4QJ1A 1XBYA 2X2GA 3DFSA 3BGGA 4FX7A 5LNWA 1PIIA 1TPVA 2Y88A 1LOQA 2YW3A 1VCGA 5EMUA 4R53A 3TC7A 3UWUA 3W72A 2VEPA 1SSDA 3HIJA 3KRSA 4PL1A 1Z42A 2R91A 4A29A 1JVNA 3NG3A 4AMAA 1W3NA 1AW2A 2NX3A 4AHOA 2FTPA 1TPUA 5C5YA 2VEKA 1B3OA 3PULA 1R2TA 4KFPA 4LUIA 4PH6A 3QRHA 2YPIA 1DJNA 1NF0A 3G8EA 4ML9A 3MBFA 3B04A 5T26A 3E9AA 1OABA 1J4EA 4JTIA 3P82A 1G4EA 3UY7A 2P1FA 2VFGA 4AWSA 4TO8A 1P5BA 3ATYA 3S1UA 4KFOA 2WNQA 3B06A 4AH7A 1KTNA 1NF7A 3M44A 4OV4A 1G4SA 4KWWA 1SSGA 3MYOA 3NQEA 1THFD 2EF9A 2IQTA 4LVDA 2ZZ5A 4WXYA 4MY8A 3I68A 2WNZA 4JTSA 3G22A 5CPNA 3HG5A 4S2BA 4JY8A 1VH7A 3QW4B 4OT7A 3T40A 4JYDA 3DH7A 4UC5A 2GUUA 1OX5A 4N2YA 4I9AA 1PCWA 3GKFA 3W7GA 3WK2A 1EA0A 3WJZA 4Z0JA 4RLIA 1O5XA 2CZ5A 3DKLA 3FA5A 1EP1A 3TSBA 5CKSA 3BLFA 1C8VA 3MJYA 1EPXA 1R47A 4O4VA 3G24A 2EHHA 4O12A 3USBA 1YXYA 2JK2A 2V0TA 2NXHA 3O07A 1OK4A 4IMEA 1RV8A 4LNYA 4GJ1A 2RHGA 1IXOA 3L5MA 3THQA 3W2LA 3NQ6A 4K7YA 3O6CA 1GVOA 2Y85A 2QKFA 3LHUA 1GYLA 4AAJA 3PWAA 1W3TA 4UTWC 1Y0EA 5AN7A 5F1VA 3C2OA 2OCZA 3GB6A 1D3HA 2ZZ4A 1DKWA 5BNKA 5D05A 2Y89A 3VFLA 4HNUA 2VC6A 4O8RA 1W54A 3W7QA 1ZAIA 4LC6A 3S1WA 1QPRA 1G67A 1TQJA 1SZNA 3M41A 2W6RA 5EA9A 5I3KA 5K7JA 4CQ9A 4IX0A 4LWWA 4MFEA 3W83A 1PS9A 3V75A 3E49A 2C19A 3TAKA 2CZFA 3MWAA 4MVAA 4OGZA 2QCNA 1VJIA 2FPTA 3LBMA 3LV5A 3T7VA 3LHYA 3WJSA 4MY9A 1H7PA 3E0IA 3W71A 3W1AA 4GC4A 1Z48A 3S5YA 4AF0A 3L0NA 3P8JA 1KFKA 2ISSA 3FKRA 3UYCA 5G4WA 4OV9A 3TU9A 2OX1A 2J27A 1P1XA 3O15A 2J9XA 8TIMA 3QC3A 1X6UA 4FO4A 3EKZA 2HS8A 3IRDA 4XTDA 3W7RA 5D2XA 1OFQA 2E6AA 3K30A 2J88A 4DBEA 4WOZA 3ABOA 2E1DA 3GR7A 3W3OA 3M16A 1SO4A 3EX1A 3W9ZA 1WOBA 2JKAA 3KVMA 4KFNA 1TRDA 3G0XA 1K7FA 2F7FA 3PY2A 3CB8A 4GE8A 3NL2A 3R12A 2H8ZA 4A22A 3L0KA 4MZ1A 4M6PA 5IBXA 3W84A 4NXSA 2QCDB 2DZWA 5AYZA 5LNVA 2ABAA 3G1AA 1OFEA 3LCFA 2P10A 4IPIA 7TIMA 1KM3A 4FXRA 3LHTA 1TB3A 4ZQCA 1FCQA 1SW0A 1NAL1 3ZWTA 2D73A 4QSHA 3NVTA 1M7OA 2YXGA 5D02A 1QNVA 3DI0A 3STCA 3W07A 1JULA 1KV8A 3NA8A 2DZSA 5KZEA 3FOKA 5HWJA 2LLEA 1H7OA 2ZRZA 3P60A 3W7OA 2RH9A 3JR2A 1EX5A 1KTCA 2ZCGA 5DCDA 4O17A 1FWWA 1FX6A 3C3NA 2JKPA 3G3DA 4JD4A 4LRSA 3NL5A 3RLUA 3R8RA 1VZWA 4IGHA 1W5QA 3NQGA 1I2PA 3NQ8A 3FS2A 3DFPA 5FF4A 2EKCA 4AB4A 1IIHA 1AL7A 2P0OA 1K8XA 2QEZA 1XDMA 4BI6A 2AQWA 4OHQA 3NPWA 1GVQA 3W2JA 4XUGA 1G6CA 5C54A 2BSLA 1HUVA 1ZJIA 3IGSA 5KITA 2E6YA 3IIVA 4J9JA 3BV4A 3MBDA 4WY0F 4GNJA 1X1ZA 3KVKA 3G1SA 3EWWA 5CG7A 3CIXA 4LS1A 1S5VA 2DZUA 5DELA 3TW6A 3TDFA 4WQ6A 4LV9A 4DF0A 4FNRA 3W1NA 2TMDA 3W88A 3GXPA 5D30A 4HNTA 2TPSA 4IX2A 2A21A 3IGXA 2ATMA 4TMBA 2OT1A 3KX6A 3B05A 4YMZA 5LNRA 2ALDA 3SI9A 2WJZA 3TFCA 2V5BA 2YSWA 4YWIA 1NEYA 1QDSA 1QOPA 3HBLA 3MP4A 4GBUA 3NQVA 4O4WA 2TRSA 1O95A 3N9SA 1KM1A 3ANYA 4JIQA 3BG3A 3W2UA 1TTPA 3RU6A 3B03A 3A22A 1WBHA 4N9CA 2JKEA 1MEWA 2HTMA 1D3GA 3UWYA 4WY0B 1GYNA 2J24A 1AK5A 4NQ1A 2C6QA 5K4ZA 3PBWA 1F2JA 3VE9A 4X22A 5I3HA 3R5EA 1A50A 1WOAA 4LRTA 4C1KA 3H55A 3N14A 3LRLA 1JQXA 2WSQA 5AHNA 2A7RA 5CPOA 1TPFA 3W23A 1YLVA 3KVLA 5AHFA 3GAKA 1G7UA 3W1LA 3LCXA 2A6NA 4QISA 4Z1BA 4X9SA 1DV7A 3HG4A 2RDTA 3NPXA 2CU0A 4UXDA 1YTKA 4DO4A 3DAQA 1WDWA 1J5TA 2ISVA 2QAFA 3M43A 1AL8A 3ELFA 4LS2A 4Y9AA 5AC7A 1G7VA 4JX4A 3SW6A 5G2WA 5IBXC 2Z6JA 1OYAA 4JIPA 3WFAA 2B7NA 3F4NA 1Z41A 3W22A 5D2YA 3S1VA 3S42A 4DQWA 3S9YA 4M6QA 3N2MA 4XBKA 4JTKA 3AO0A 1WYIA 1OG0A 4MLJA 1OFOA 2CLEA 3SJ3A 2NUXA 1TRIA 1HL2A 1I2QA 4R34A 5D37A 2G5WA 3PUOA 5HR7A 3STFA 1GQNA 3W7IA 2CLKA 4PA8A 3B0VC 1SO3A 3O1NA 3I7SA 1I2OA 1HO4A 1T8XA 4XWUA 1CX9A 4LW7A 5CGQA 2W0UA 2QJHA 4HN4A 1EB3A 1DOSA 1KM4A 4ICNA 1ZALA 4WUIA 4DEFA 5I3GA 1M7PA 2CLMA 2QCHA 3W7PA 4IXXA 1UUMA 1IXPA 3NR0A 3R13A 2H3DA 4M6VA 4UFIA 1VHCA 1LLWA 2YW4A 2WPBA 3GZ3A 1GEQA 4X2RA 4DBDA 3RLVA 3NM3A 1UUOA 3ZR4A 2CFFA 4AHQA 3OHIA 1H60A 4JXCA 3C2RA 3M5YA 2VFIA 2V2HA 3KVJA 3DU0A 3KOFA 4RZ4A 3QSTA 4LVGA 4DF1A 1OFAA 2ZRVA 4GUGA 4N6FA 4EF9A 2VFFA 3I6RA 3O63A 4HNVA 3F03K 4U4MA 2Y61A 4OWGA 3W1QA 3A21A 2V81A 4ORMA 4E38A 3Q37A 4RV8A 3EX4A 4O10A 2ZTKA 3QYQA 5F2MA 3GR8A 3LHZA 4RKAA 2V2DA 5H2ZA 3O8AA 1PV8A 4NNAA 3HJZA 3UXAA 4DO5A 1EWEA 3RF9A 1DQXA 2DZTA 3NPUA 5FF7A 2X30A 2Y62A 1W5PA 2WO5A 4HSOA 3RNDA 4NZJA 3C61A 1K02A 3G1VA 4X3ZA 5LNUA 3GLCA 4NJKA 1YPIA 2I9EA 3A5VA 2BTMA 4BFAA 2XFWA 5K4XA 2C0AA 3LCIA 3LRMA 4IMCA 3TNOA 4DELA 1ZFJA 2E77A 1MZHA 3HO8A 1W1ZA 1KW1A 1JCMP 4NZFA 2VELA 1OHLA 4AWUA 1JJKA 3BLEA 4WXZA 4UMBA 2QUTA 3RFAA 4NXKA 3BW4A 1JCXA 3T4CA 2G97A 4L4MA 3MHFA 5KINA 4EF8A 5KZMA 1GVRA 4O1DA 1LTDA 3YPIA 3C8FA 2X1TA 4JNMA 1EWDA 4MYXA 4K7VA 4K8EA 2QDHA 4NJHA 3UWZA 1FWNA 1MO0A 2ZBTA 4IUOA 3L2IA 5DXXA 3SR7A 4O50A 5G2IA 5BW6A 4TX9A 3SGZA 2GJNA 1IIGA 2E5CA 1RQHA 2CWNA 3A5FA 3M1ZA 5L9FA 3UD6A 3W86A 3MI3A 1HO1A 1ONRA 1Q6LA 1LDCA 3G0UA 5FESA 4ZZ9A 3LV6A 2ZA1A 3ABSA 1VYPX 4UFJA 5G5IA 4XTIA 2O7SA 3GNNA 4PFMA 5K3VA 1JCLA 5TIMA 3IIOA 1FXPA 1YXCA 3UPWA 1MXSA 2AGKA 3G1XA 2XN1A 3S0CA 3LDVA 3R89A 3G18A 3BGJA 3DFNA 1H1YA 5K9XA 1W5NA 2KZHA 6ALDA 3T55A 1YTDA 5CZJA 3DXIA 1JUBA 3HGRA 4MYAA 2RDUA 1AW1A 1F76A 4JTFA 3W1MA 4JTEA 5D09A 3ZS4A 4WJEA 2DZXA 5U4NA 3P67A 1TV7A 3EX2A 3TJLA 1KV5A 4Y90A 3KRZA 1ICQA 2R94A 3W85A 3UWWA 2Y7FA 5K2ZA 2BX7A 4IWWA 1LRTA 1RQBA 1IF2A 4PL2A 1TTJA 1YYAA 1I2RA 4LV4A 3HMJG 3N34A 1SO5A 1OVDA 3HB9A 4TR9A 3W1UA 1YPFA 2GQ9A 5CSRA 1U83A 1T0OA 1H61A 4ORIA 4UFLA 4PEKA 2X16A 5AYYA 2PCQA 2NX1A 2H3BA 3FKKA 1LBLA 1XFBA 3G8RA 3IIXA 1YDNA 3HPZA 5F1UA 4Z0SA 2V5LA 5I3JA 1I8JA 4NVTA 3A23A 3BG5A 3OVQA 5KTLA 5DBUA 4MFDA 3BW2A 4P2VA 1MEHA 4NX5A 5G1YA 3SZ8A 5D2VA 2VFDA 4K36A 4ADUA 4UNLA 4LVBA 1DJQA 5FF0A 4HPJA 1KFCA 2V2CA 2Z0IA 2E68A 4UTLA 4JS3A 3TMLA 3LCWA 1EEPA 3N2XA 1OX4B 2JBMA 1VLWA 1TCDA 3IIPA 3TCEA 3F1QA 3TROA 1TTQA 3S5ZA 4O11A 3L66A 4O15A 1VS1A 4MUZA 1TTIA 1L6SA 4CQ8A 3OA3A 3CLMA 1O4UA 2ZFAA 2HS6A 3CM4A 1O60A 1FUYA 3M47A 2HSAA 4LS0A 1QOQA 1XCFA 1LZOA 5AOUA 3LTPA 3B8DA 4DXVA 2QCFA 1QCWA 4K38A 4ZQOA 2DZVA 2E5BA 2Q3RA 5J5DA 1VCVA 4BI7A 3CEPA 1X1OA 3TR2A 3IIZA 1A5SA 4MOZA 3UPBA 4PTNA 5E93A 1FDJA 3KXQA 4UTKA 3ATZA 4RX0A 3PUDA 1IGSA 2V82A 1F7BA 2J6XA 2A0NA 3IVTA 3PBYA 3S8HA 4N9BA 1J2WA 1DORA 3RMJA 2Q8ZA 1WBJA 4DO6A 3EXRA 3IVSA 3QJAA 4PC8A 5HJLA 2X1SA 5AB3A 2XN0A 4TU1A 1BWKA 1VQTA 2OT0A 1Q45A 4YLWA 3NQ7A 4YXGA 3F4WA 2QR6A 4N02A 5D03A 2ABBA 2A6LA 1RVGA 3W7LA 1YDVA 1TPC1 1LBFA 4O18A 3CTLA 3W6YA 3C52A 4CNNA 3MP5A 3DFOA 3TUUA 3S1XA 4ONVA 5EY5A 3G1HA 1FXQA 3VCRA 3S5OA 4E2DA 4NNBA 4UTTA 5EYWA 2QCDA 3W87A 4EOUA 3PG9A 3TK7A 2EAWA 4QNEA 1UCWA 3TV8A 3W74A 1MSSA 2PURA 4QNWA 1ML1A 5A5WA 2A85A 3O16A 2Y70A 3QPYA 1TREA 4NJIA 1XBVA 4IXHA 1B4KA 4DF2A 3W7DA 3LI1A 4P61A 1TQXA 1Q6RA 1OFDA 4TIMA 3MHGA 3KHJA 4I7UA 3BG9A 1FWTA 3GXNA 4XZ9A 1RPXA 3P62A 5DLCA 4RK8A 5TQLA 1H62A 1KBIA 3DBPA 3NO5A 4O52A 2DZPA 3QEZA 4WZHA 5LHFA 3TQVA 1GWJA 3DENA 1DVJA 3WJWA 1W8SA 3PAJA 5LSMA 4QAIA 3TSMA 3B0UX 1K7EA 4LY8A 2PE4A 4I7VA 3IVUA 2ZZ1A 1LM1A 3QW3A 1N55A 1TV8A 3GDKA 3E02A 3W2KA 3L68A 4BF9A 2ZRUA 2B7OA 5CZTA 2BZNA 1TYGA 1JCNA 4HIBA 1XKYA 5C6MA 1LBMA 2DJLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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