3SDOA

Structure of a nitrilotriacetate monooxygenase from burkholderia pseudomallei
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
443
structure length
443
Chain Sequence
GSMTRKHIHFGVLIQGAGANMNAWKHPSVPPDASVNFDFYVDRARRAENAGIAFAFIADSAYVTPKSAPHFLNRFEPISLLSALAVLTSKIGLVGTMSSSYSEPYNVARQFASLDLISGGRAGWNVVTSSIEGTGKNYGRPHPDHAQRYAIAAEHLDVVQGLWDSWDDDALVRDRATGRFFDPDKLHRLDHRGRFFSVEGPLNIRRSPQGQPVIFQAGSSDDGIDLAGRSADAVFSNGSTFDEARVFYRRVKAAAAAAGRNPDHVKVFPGIGPIVGATQQEADDKYRQVRDLLSPREALAYLSHFFQQHDFSVYPLDGPFPDIGTLGSDGFQSTTDNIKRLARERKLTLREVAYEVSTRRSNIGTSEAFIGTPEAVASEMIRWVDEGAADGFMLGLPVTGFGLDDFVDHVLPVLSARGYFDPVRRGATLRDHLGLPYKESRYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia pseudomallei
publication title Structure of a Nitrilotriacetate monooxygenase from Burkholderia pseudomallei
rcsb
molecule keywords Nitrilotriacetate monooxygenase
total genus 158
structure length 443
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.-:
pdb deposition date 2011-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 3sdoA00
1BRLB 3C8NA 4J2PA 1F07A 3B9OA 5DQPA 3FGCA 1NQKA 1BSLA 3RAOA 3SDOA 5AECA 4US5A 1EZWA 5LXEA 1NFPA 1Z69A 4UWMA 1LUCA 4US5D 3FGCB 1M41A 3B9NA 1XKJA 1BRLA 2I7GA 2B81A 3B4YA 1FVPA 1RHCA 1LUCB 1YW1A 1TVLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1AG1O 3IJIA 2XG9A 4LPCA 2HNHA 3CJPA 4C5ZA 5A6JA 3FNDA 4ZOBA 1XLDA 3WLOA 3RJYA 3PN8A 1JZ2A 3OGVA 1ME8A 1UD6A 1UA3A 4X61A 1O94A 2QGYA 1NU5A 1ZP3A 3HPXA 2X1UA 3GK0A 4ROQA 1OCNA 1YTKA 4C6QA 4F66A 1UUMA 4M5PA 3L0KA 5IBXA 3W4RA 5XIMA 1PYMA 2ADAA 1YRRA 1P6CA 2GJLA 4IPJA 1CGWA 1X7IA 2WZHA 3ITYA 2WSQA 3L66A 4BF7A 5AVNA 3GAKA 3NCOA 3QLLA 2CESA 3LBCA 3T42A 3VFLA 1XIBA 1UWSA 1U2YA 3TYDA 1Z42A 1N8IA 2Z26A 4ZE4A 2AKZA 1PIIA 4AEOA 2JIEA 3URNA 2FFIA 1XYAA 3G5EA 3SURA 3EKLA 3P80A 1J9YA 2HXUA 3BSHA 4CNTA 1YBQA 4DWSB 5FF0A 2AMGA 2OZ0A 3ECQA 1CXEA 1A50A 3ZJ6A 3A64A 1W9BM 2DQWA 3PJTA 2FZ9A 3G8RA 3HMJG 3UGRA 1KWKA 1NWTA 5I03A 1C3FA 5HQLA 2I7GA 2PGFA 5HWMA 1JCYA 3MC5A 1EHAA 2HE8A 2XUCA 1RQHA 1JCMP 3PF3A 1LF1A 1MDRA 2PS2A 4YWIA 3KS6A 2QPSA 3TN3A 5A6KA 4FF5A 4QAWA 4S1FA 4H6RA 4XKMA 2RHGA 3ATZA 2ZDSA 3WN6A 3S5OA 4JFTA 2PODA 1NOFA 3AHTA 4NXKA 3TSBA 1JCLA 2EG6A 1AH3A 4GI8A 2OPJA 3G1DA 1KKRA 2JEQA 3N4EA 3W2LA 1ISXA 4IQLA 1TIWA 3UJSA 4AXKA 3HG3A 4HKPA 1V6YA 3DHFA 3W83A 3LHZA 3LX9A 3P60A 2HZGA 4D6EA 2YDQA 1NAL1 2NLIA 3FAXA 2VX4A 4REQB 2PGEA 2X1IA 3QHOA 3A13A 2OSYA 2CLOA 2C0HA 4HHHA 4IG2B 4FXSA 5MKGA 1H51A 1MXSA 4GUHA 3NO5A 1OFOA 4K37A 4L9XA 3GUWA 1B3YA 2BNJA 1XLLA 1TMLA 5EY5A 3M5XA 1JUBA 3UZXA 1DWAM 1RJRA 1KD0A 3W7KA 2WV8A 2UY4A 4H9UA 4H9VA 1TX2A 5E0KA 4DRSA 1GVSA 2WHKA 4DJDC 3NGJA 3RGTA 1GORA 1VEOA 1V02E 4ZXOA 3GNNA 3CO8A 3WQEA 2WJEA 3WLQA 1VHNA 5FL1A 4QTGA 4NVTA 1E3ZA 3LA4A 4LNYA 2PDXA 3ICJA 3ZM8A 4AQLA 4X0NA 5LGXA 4GJIA 4RV3A 3ARUA 4DF0A 3C2RA 1K03A 4LF2A 4RXGA 4JQ2A 3PTQA 1KFKA 1F05A 4DBSA 3SUWA 4AD5A 3NNTA 1I6NA 2WBGA 4MUZA 3WUGA 1XD0A 2A6NA 3GVQA 1MW1A 4US5D 1X1NA 1R5YA 4RZ6A 3VKBA 3S5SA 3LTYA 3DG3A 4PUMA 1PKLA 3L4VA 2IQ0A 3M1ZA 1J10A 1Y8BA 3AMDA 4PFMA 3EMQA 2OEKA 3FXYA 3GSMA 4IFKB 3EOLA 2TAAA 4Q6XA 1F6PA 1F4HA 1LZOA 3TJLA 5AZ1A 3EPOA 3BG5A 1O6IA 1EOKA 5HATA 1V3LA 4ZMGA 1BD0A 3VPLA 2J78A 5CC6A 4OVXA 1KRBC 5JUVA 3T2OA 3UWUA 3W6LA 4HA0A 4WDTA 3U9IA 3VNLA 1VZWA 4Q32A 4B5WA 1W1ZA 4HK7A 4Z0SA 3N9SA 4LAMA 1OB0A 1W9UA 1EP1A 4QJ4B 2Z2BA 1WKDA 1SO5A 1H50A 3DYOA 1Q7QA 2ZRWA 5DMNA 3W0KA 5AOUA 3WF3A 4UFKA 1DHKA 3QMSA 2PLJA 3T2QA 3LCFA 5B80A 4JTLA 1PZ2A 3KCLA 2QF7A 1TELA 3CBWA 5HAOA 1JULA 3S42A 3LMZA 4R85A 4U4MA 2PWGA 2Y8KA 5FF4A 3GS6A 3ARRA 2X1RA 1R3WA 1LWHA 1ZAJA 4NNBA 4C6EA 1CWYA 1TPWA 4GA8A 4KRZA 4LYRA 4W85A 3DXIA 3S83A 1PBGA 3PZQA 4WKFA 3BOXA 1H41A 2V5CA 4GYJA 3AAMA 4I7UA 3EOUA 1E55A 4H9ZA 3ABSA 4O13A 2WNQA 1NQKA 3GWQA 4E2BA 4AUBA 1JEZA 2DT3A 1DYSA 4OT7A 1IWPA 1XIMA 3NQGA 4R88A 1EDQA 3PJUA 1HVXA 1EUAA 1WAWA 1OK4A 1DE6A 1O7AA 4OGZA 3UD6A 5LZLA 1FWCC 3T44A 1LM1A 4H00A 1VPQA 4JCLA 3OGRA 9XIMA 4WGXA 2VX6A 1BPLB 4GFSA 3COTA 2J74A 2G3NA 4O54A 2RDUA 3II1A 1OCBA 3WUEA 4GQGA 3UA4A 3P62A 1GJUA 3MI3A 3DEQA 3APGA 3IAPA 2OO0A 4B15A 2VZUA 3CLMA 5CKSA 4JIHA 3MW7A 2GJNA 5F2IA 3IIOA 4JGDA 4JQAA 1KCZA 1QDSA 2I57A 3ZVHA 1M3UA 1EZ2A 2EKCA 2Y62A 3BSGA 3WF1A 3Q2DA 2VYOA 1SVDA 5CPQA 1Q13A 1QPKA 2WQDA 1DP0A 1FP9A 1OCJA 3BLPX 4JXCA 3K8LA 4C6KA 2WYSA 4I7WA 1EPXA 4ALDA 3OTRA 3VC6A 4H41A 4Q4OA 1M53A 3VK5A 2R14A 1K77A 3TOYA 2WMJA 3GC4A 3QQWA 5TF0A 5HK4A 1P0NA 1E0VA 3TN6A 2Y7FA 5EGRA 3D47A 3UR7A 4E2DA 4R7WA 3KS5A 3SGGA 2H8ZA 1UZ1A 2VFEA 1GOXA 2YBUA 5CG7A 4K68A 3GNXA 2BVYA 4K2SA 3ZZ1A 2HBXA 4QQUA 4YIWA 2Z1VA 3W2NA 4O0ZA 5FJUA 3W7NA 4XTDA 3TCSA 3AIEA 1XRFA 3W28A 3W23A 1F3XA 3V36A 3RPMA 1EBGA 4BFAA 1IT8A 4LOCA 3T0AA 1Y5VA 4OIFA 2NQ9A 3N15A 3L21A 4MAZA 1TVLA 1XLHA 2Z2UA 1BKSA 1SM9A 2VGIA 4JKKA 2Y61A 4AY7A 3NDYA 2VRKA 1AVAA 4A2RA 1NDVA 2UV8G 4MB4A 2VFFA 3HQNA 4LX4A 4OV4A 4QS5A 4WY0F 3GXTA 1F7BA 2RDWA 1L2UA 3W2KA 3LPOA 4AY8A 3QLDA 3MV11 4C6NA 1RQEA 1K02A 1US3A 4OHQA 5A8NA 1TQXA 3S9YA 1DQUA 1KNWA 2IKGA 2XWEA 4I6VA 5TQLA 3JVAA 4M1RA 1LP6A 1FCBA 4AHQA 5IM51 3VKCA 2J7DA 3MUAA 3W2JA 3TXVA 1TPDA 5FAJA 3O06A 1BRLA 3FSUA 4QNEA 1XG4A 3S1VA 1GKQA 5M03A 3UW6A 2VDGA 3P84A 2OLHA 3DYPA 4ZQPA 3N1AA 3RILA 1VGAA 1S3TC 2BBFA 3VGGA 3UJRA 1JZ3A 3BICA 1DXFA 1QW9A 2R1NA 4HHLA 1PS9A 3A24A 1SW3A 4BEUA 4C60A 4Z2HA 4GY1A 2PDNA 1VLWA 1UD4A 4XAPA 4DYEA 4IM4A 1CT5A 4P7QA 4WEVX 3PUDA 4KEVA 1V3KA 5FJPA 3LDVA 1I1XA 5HNNA 1W31A 1BKHA 3LERA 4NG3A 4UMBA 5CGQA 4YVPA 3AQUA 3N2MA 3OBKA 1MUCA 2F38A 2VGFA 2VL4A 3QV7A 1WAUA 3BANA 2GOUA 1OFRA 5C7VA 1G7VA 3IUDA 4YNGA 4NYUA 3FGCB 3W73A 2WMIB 3VIFA 4LEFA 2OOGA 3I3DA 1M65A 2ZWYA 3W6YA 4GCXA 4S2BA 3DFQA 1H4PA 4P7LA 2XINA 3GHRA 3VD7A 4CCZA 3SCRA 3AYVA 3BCFA 3SDOA 3CGTA 4AFYA 1PE1A 5FESA 1W32A 4LQ1A 1LG1A 4QE1A 3QRHA 2NQJA 4O1AA 3M9YA 1JQXA 1TKKA 1W5QA 1HJQA 3G6LA 3WCZA 3R8RA 5C2XA 2FHBA 2J7BA 3TA6A 3LLFA 1GTEA 4O15A 4RDWA 4D6GA 4GC4A 3UF9A 2GZXA 2EPKX 1HFBA 3TN5A 3WO8A 3F4DA 1KXHA 2GWGA 2NXHA 3PB2A 3UGVA 3H22A 3F4VA 1Y7VA 4QFUA 2I56A 1K8XA 4BJHA 2DFAA 4HTBA 3E38A 4F9DA 3NGFA 2KAUC 4OV9A 1NFPA 1J6PA 3NYZA 2C1HA 4G7FA 5CXPA 3EDJA 3CL6A 4MFDA 3D5HA 2A3EA 4F0KA 3GFYA 3W84A 2QJIA 3LCXA 3DOPA 1I2PA 4LUIA 2WM1A 1UYQA 2EPLX 3HGSA 3NEVA 1G01A 3FY1A 3TCEA 1NF0A 4Y6GA 1LQ2A 1HX0A 4UNIA 3W1LA 2YFOA 2YPIA 3B8WA 1L2QA 2EPOA 5ABTA 4RLIA 2FPVA 1HJVA 2NT0A 2POZA 3GG1A 2G3IA 3ZJ7A 4MWAB 4I9TA 4BQ5A 2GVYA 4GD0A 4R9XA 4Z2GA 4YU1A 2EKGA 3GBDA 1V77A 3MYPA 3C3NA 3WDRA 2GVGA 1XIJA 3LU2A 2VHLA 2NQHA 4PMQA 4QITA 3P0XA 5CJMA 3QMTA 1LLWA 4ES4A 3H54A 4A3UA 1ODZA 5XINA 3RJXA 3BO9A 1FA2A 2BOGX 2CXEA 1H1NA 2BXZA 1BQGA 3HMCA 2A4AA 1CGXA 2BY3A 4S3FA 1H62A 4F3HA 1T41A 4EF8A 1DL3A 3VUSA 2W0UA 4O19A 4CN1A 3PBGA 3WBWA 2IS7A 1I4NA 1H3GA 2HWGA 2QZRA 1LQ0A 3D6NA 1SW7A 2YL8A 3AS1A 1QBAA 3M64A 4C6FA 2W9MA 4JIPA 4QLKA 1HJUA 3W1TA 5HULA 3LHWA 4HK6A 1EUNA 3WL0A 2O4MA 3IV3A 1G1YA 1RPKA 2NZLA 1HG3A 4Q8PA 4GGBA 5KZ6A 3CZLA 1XSKA 2EG8A 1Q66A 2V30A 5HOSA 3IJ9A 2Z6JA 3L0GA 2POTA 5BOFA 3HV8A 3ITLA 3VNJA 4JTGA 4O11A 2VQUA 3VNDA 5A5WA 3XISA 3T0DA 4TTUA 1XIEA 4P5UA 3PG8A 3WLPA 2OZTA 5LIUX 3WF4A 4QROA 4WQ6A 2C91A 3VNMA 4H04A 1OF8A 4IL2A 1VC4A 1VS1A 3TQ0A 4J9JA 5AB3A 1ISZA 1A80A 1NFGA 4B90A 3VUPA 4ECLA 3VO0A 3C2FA 4NJKA 4DO7A 3T4WA 4GUFA 1QI2A 5PTDA 2IKJA 3C2VA 1PL9A 4BCEA 4GNVA 4UTHA 3GY1A 2WC3A 3MTWA 2DIEA 5KSWA 2GQAA 3P5ZA 4M51A 4TVUA 3THAA 4Q7IA 4EACA 3OGSA 4LY4A 3EB4A 1V51A 3MKKA 2ZDRA 4Y96A 3WDPP 4J5NA 5K7JA 5BZAA 2QYGA 3VI2A 2XFWA 2O55A 8CGTA 5IHRA 1A5SA 1K8ZA 2QLYA 3LGGA 1AJ0A 1GEHA 3F4CA 1QAPA 3SGZA 3S9ZA 1MZHA 2E6FA 4QGCA 2EHHA 4L56A 3URQA 3ITGA 1E1CA 4DB7A 2EJ1A 2XVPA 3B8TA 1J2WA 3Q4DA 5BRQA 4Z2KA 4KH2A 2YA1A 1F3TA 3CUXA 1W9DM 5IRPA 2GDVA 1BSLA 1UP0A 4E2OA 5BCAA 4TQTA 1OGSA 3NAVA 2FHCA 4M29A 4MZYA 3SCOA 1MO0A 1YE4A 1MNSA 5GVJA 5SWUA 3KDNA 4XD6A 3RX4A 2PDGA 3P3BA 3QY7A 2XU2A 2R94A 5BYWA 3OLDA 2OYLA 3I65A 1YADA 3N2CA 1K7XA 1W3JA 5BRBA 2ISVA 3GM8A 3TAOA 2V82A 5DLCA 1V3IA 2O9PA 1RSCA 3OQ8A 4MNLA 4I6KA 4E0CA 1KLYA 6XIMA 3GW3A 3M5VA 1K70A 2J62A 5FA5A 4Y8EA 3DC0A 2GL5A 3SFWA 3TK7A 1OG6A 2Z2AA 4JS3A 1AJ2A 2V5DA 3UNTA 2XH7A 3E49A 3MUY1 1Q6QA 2UY2A 2GSEA 4PCNA 1DOSA 3RRAA 3MHUA 1M01A 1W8SA 1ZBWA 2Q8LA 2HROA 1R85A 2PDQA 4E3TA 3CC1A 3WSUA 1D7KA 3GLCA 1J79A 2QCLA 3BQ5A 4GZJA 3R43A 2VOTA 3A5VA 3ES8A 1Z3NA 5CC5A 2PPGA 4FNUA 4WLCA 3WQ6A 4DUOA 3R4IA 4IIEA 2FTPA 4QJ5B 2DY3A 2DT2A 3L5AA 2V2DA 4Z0JA 1EJSC 1XP3A 1CXKA 2FMOA 3LHYA 3FFSA 3MUIA 4CD6A 1VBRA 2OQLA 2CPUA 4X60A 3BWWA 4XKYB 2OEMA 4DY1A 2ZZ2A 4YPJA 3E1F1 4N6EA 1WXYA 2CZ5A 4FXFA 2XFRA 3IUIA 1V03A 3VGBA 3CL7A 3ZXWA 4Q7BA 3WQ4A 3MCOA 3U4FA 1JAEA 1UB3A 4ZBCA 3WLMA 2CBUA 3EBVA 4B3LA 5DF0A 1RLCL 2GOKA 1K8CA 1XPYA 2ISSA 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 1BRL B;  3C8N A;  4J2P A;  1F07 A;  3B9O A;  5DQP A;  3FGC A;  1NQK A;  1BSL A;  3RAO A;  3SDO A;  5AEC A;  4US5 A;  1EZW A;  5LXE A;  1NFP A;  1Z69 A;  4UWM A;  1LUC A;  4US5 D;  3FGC B;  1M41 A;  3B9N A;  1XKJ A;  1BRL A;  2I7G A;  2B81 A;  3B4Y A;  1FVP A;  1RHC A;  1LUC B;  1YW1 A;  1TVL A;
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