3SFK | Genus

Total Genus 133

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	133
sequence length	375
structure length	368
Chain Sequence	YNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Plasmodium falciparum 3d7
publication title	Structure-Guided Lead Optimization of Triazolopyrimidine-Ring Substituents Identifies Potent Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors with Clinical Candidate Potential. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus	133
structure length	368
sequence length	375
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2011-06-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3sfkA00

2QCDB 1A50A 1QWGA 4O0KA 2NXHA 4X9SA 3NGJA 1E51A 3BARA 1I2NA 2WO5A 3P5YA 3W3OA 2YW3A 2QCDA 5HULA 1TPDA 5HR6A 4LY8A 4QISA 1G7VA 2Z0IA 3LRKA 3FYOA 2WSRA 3KRSA 1JCJA 3OIXA 1SU5A 3LHZA 3N19B 1GJPA 3UWVA 1KFJA 1ZY9A 5D2YA 1SO5A 2NX1A 1DORA 3NA8A 2C0AA 3B0VC 2NX9A 3D0CA 5FEPA 4A2SA 3W70A 2ZRXA 1LLZA 4LTSA 2OZ0A 5AHLA 1Q6OA 3W1PA 2V82A 2CLKA 5AOUA 1TV8A 3GKFA 1FWWA 3NQMA 1S5VA 5K9XA 4PH6A 1XBZA 3MHUA 2X2GA 3P82A 3RLVA 1AL8A 1C8VA 4FX8A 4O19A 1D3HA 3GDKA 4OV9A 1K03A 1LOQA 3GKAA 4MJMA 1BWLA 3P80A 4RCXA 4UFKA 8TIMA 1GPWA 3KVLA 5F2MA 4MVAA 2VFEA 5U4NA 1ZENA 3CQ0A 3TX9A 2XFWA 4K7YA 2Q8ZA 3DFSA 5K4XA 1SFLA 2C16A 3VE7A 1Q6RA 4NNAA 1EIXA 1RQHA 5AHNA 4CCEA 4DF1A 1TPUA 3SSJA 1FWRA 4ADUA 3S1XA 3SECA 1ZCOA 4NZJA 3PB0A 1LM1A 1D3GA 3GK0A 5BMWA 3N2XA 4MLJA 4NT0A 2QCHA 4CCCA 3KX6A 2A6NA 1H61A 1W5NA 2E5DA 3GIYA 4O10A 3N9RA 1G7UA 1FWSA 4UTIA 3SR7A 2VEMA 1OFEA 4DBDA 1OX4A 2F84A 2VFFA 3G1SA 3H53A 4I7UA 4OV4A 1TTIA 3BO9A 3GNDA 4N9DA 1SQ7A 2TMDA 1FCQA 3A23A 2A2IA 1ZAIA 4PL1A 4I9AA 3HG3A 3RFAA 5HR7A 1QMLA 1DBTA 3WJXA 2CZFA 4WOZA 1KM5A 3LX9A 5FEZA 4R34A 4O8RA 1DQWA 3N9SA 1LBFA 2BTMA 4JEQA 4PL2A 2BLEA 3JS3A 2HS6A 5CPOA 4E2DA 3NL3A 3S1VA 1DL3A 1KM3A 4ZQMA 2RDWA 1ZALA 2Y7FA 4JD4A 3TC6A 1QPNA 3M47A 4TO8A 5E0KA 3QJAA 3TAKA 4NJJA 1RV8A 2DP3A 4RZ6A 4GUJA 5G1YA 5K9DA 1WYIA 5LNVA 1TQXA 4LOCA 2R91A 3CEPA 4JX4A 1B3OA 3W6YA 3EWXA 1ME7A 1P0KA 2NXGA 3NO5A 3OBKA 1F2JA 2HSAA 1GVFA 3LCXA 2ZZ3A 3HPZA 3TROA 2TYSA 2I9EA 3GNNA 3R89A 1LCOA 2QJGA 5D2VA 4EVZA 3KOFA 3RU6A 3W7RA 1MEWA 1PHWA 2QKFA 1PV8A 4QSHA 3STEA 1HUVA 1KA9F 3EX6A 1W54A 3PR2A 2Y89A 4UMCA 3KRZA 1GZGA 3I7QA 4RXFA 3FKKA 5CGQA 1XM3A 1OYAA 2CFFA 4LUIA 1QAPA 4FEZA 3SGUA 1OABA 3FYPA 4BI6A 4HIBA 5G4EA 2AAMA 2ZZ2A 5D04C 2G96A 1Z48A 4KWVA 1SO6A 1H63A 3FEMA 3WK2A 3VE9A 3PBUA 4RZ5A 2JKEA 4O50A 2V2CA 4DPPA 3TUUA 1QPRA 3FFSA 1OFPA 1XI3A 2P10A 1OK6A 3MUXA 1UUOA 3IVUA 1GYNA 5LZLA 5HINA 2ZA3A 1H7OA 1TYGA 3LLDA 1Q45A 4IPIA 5AHFA 3BGJA 3TKFA 3DH7A 1OK4A 2PURA 3CLMA 4UTMA 3NQ8A 3O6YX 2WNNA 3SIZA 4NUWA 4XTIA 3P74A 2WKJA 3W2KA 4BF9A 4ADTA 5KZMA 3VI2A 4AH7A 3AJXA 3GDRA 4LC6A 4DF0A 1TJPA 3O05A 1TRDA 4NNCA 3W7DA 5D05A 1ML1A 3GB6A 1O5KA 1YYAA 1GVOA 1DKWA 3STGA 3NPWA 1C9DA 2WOQA 3TQKA 1QCWA 1RD5A 2YXGA 3C4UA 3H54A 5D2WA 4Z0JA 3G1FA 3VNDA 4PC8A 3DU0A 2ZFAA 5J5DA 3W1XA 3Q58A 1H5YA 4FNTA 5LGXA 3NQGA 3USBA 2NZLA 3THQA 3PVFA 3MBDA 2D73A 3A21A 3NQCA 1XC4A 5FESA 1OX5A 4XZ9A 3DI0A 2YFNA 4WJEA 3G0UA 2JGQA 1XCFA 2EPHA 3QMSA 3W75A 4Z0SA 1TTJA 4WY0F 2YZRA 1OFQA 1KV8A 1X6UA 5G2IA 1PE1A 1VLIA 2VXNA 3LXBA 1C29A 1I2RA 3ABOA 4FNPA 2Y61A 3NPUA 3QPYA 3M16A 1OF6A 4LV4A 4GXMA 1FWNA 5C54A 4K6AA 2VFDA 3YPIA 1TREA 1BKSA 3MP3A 4NQ1A 3Q94A 5F1VA 3LERA 1SR9A 5BRBA 3C0JA 1ICSA 1I8JA 1TB3A 5TIMA 4X2RA 2X1TA 3CT7A 4O52A 4BK9A 3WJYA 1NVMA 1YXYA 3A5VA 3ATYA 4JTLA 4LVAA 1JRBA 2AQWA 4MZ8A 1HO4A 1W1ZA 4ML9A 1GT8A 1GG0A 1LTDA 3VFLA 3EKZA 3MW7A 3HBLA 4O11A 1KFBA 1M7OA 3DFTA 4JX6A 3W7OA 1LYXA 3OVQA 4ZMGA 2HTMA 3G1AA 4MY1A 2WNQA 1SZGA 4Z08A 3W1TA 4AMAA 1VYPX 3C2OA 6TIMA 5FF0A 1R2TA 4M6PA 1KFEA 2QDGA 4MUZA 3CEUA 1ZAJA 2CZEA 5EY5A 3F4WA 4AHPA 2VEKA 2I1OA 3BG5A 3W71A 1TCDA 3B06A 3DHFA 2KZHA 1JVNA 4WXYA 3TFXA 1HTIA 2ISVA 3PSWA 3UNDA 2J9YA 1TTPA 1MEIA 5BW6A 1XFBA 4XQ6A 4M19A 4RR4A 1VH7A 4U4MA 3T55A 3N34A 4WOQA 2JBMA 4EOUA 4KFNA 1LBMA 3MP5A 5C6MA 1QOQA 1WX0A 4MLRA 4MYAA 1XUZA 1ZHAA 4I7WA 4HPJA 1W5MA 2Q8LA 1KTBA 1UB3A 2A5HA 2CLMA 3TC7A 1EWEA 1YTEA 1SFJA 4JY8A 3PAJA 1OJXA 3B04A 3WK0A 1WV2A 4PODA 3DZ1A 3NQAA 2FPVA 4OQVA 4EF9A 1FXPA 5DY2A 3H55A 3O63A 3NQ7A 2J24A 5DCDA 4O17A 1UBSA 3C3NA 4O12A 3W7GA 1KBJA 3IGXA 2RDUA 1I2QA 2A7PA 1K3UA 3PM6A 2DZWA 3IGSA 5F4XA 4DBEA 4UTJA 2DZSA 4HNNA 3QMRA 4IMCA 4NU7A 2GUUA 4UC5A 1FXQA 1A53A 3N2MA 2FFCA 4YLWA 4JTSA 1TPEA 3QQ1A 3IVSA 3HIJA 3W73A 3W83A 2NUWA 4UTTC 3MMTA 2ZYFA 1H7WA 3EXRA 3UXDA 1XBVA 3LCFA 1B57A 4IPJA 1P0NA 4UMAA 2V8ZA 1JR1A 3TFCA 2W79A 2VKZG 3QPZA 4UFMA 4LS1A 4H6KA 3MI2A 2ZRYA 3W86A 3E0IA 5EL1A 4E38A 4K8EA 1R2SA 3P8IA 2B0MA 1IXPA 5DN1A 3THAA 5FF4A 3KFTA 3M9YA 2ISWA 3NPXA 2FJKA 2RHGA 3PSVA 3TK7A 2DORA 1FCVA 2A0NA 5EYWA 1GYLA 1MEHA 3B8DA 3GZ3A 3QF0A 3L5AA 5LNRA 3O1NA 2E09A 1YTKA 5AYZA 4N6EA 1H51A 3L67A 3C52A 5CPNA 4K8HA 3TQVA 3SI9A 3PUEA 2BX7A 2GOUA 4GUIA 4UCGA 2CW6A 2E68A 5AB3A 3E49A 4WY0A 1B9BA 4LNYA 4O4WA 1OF8A 3GXNA 3FS2A 3W88A 1TPB1 5DBUA 3HF3A 5G2HA 4B5NA 5KMYA 2V5BA 5DLCA 3PY2A 4I7VA 1R30A 3W76A 5I3KA 2NWRA 3F1QA 2AGKA 2YPIA 2Z6JA 3KXQA 3QSTA 1ZFJA 3EWWA 3G8EA 3ABQA 4HSNA 3Q2DA 2PRMA 7TIMA 2VENA 2ALDA 1IXOA 1VCFA 2YFOA 3R13A 2V2DA 4IQLA 3EWZA 3Q37A 1H50A 2P1FA 3WJSA 3G1VA 1DVJA 2W6RA 5D03A 1GVQA 4ZQOA 3L0GA 3P81A 4HPXA 1VR6A 1FBAA 3HGJA 3TMLA 5IM51 3L5MA 3P62A 4RK8A 3WK1A 3A9IA 4L4LA 1WDWA 1O5XA 3GAKA 2YR1A 3IIZA 3PS7A 1UASA 4KKXA 4A21A 5FI8A 1G4SA 1VS1A 1AW1A 1I4NA 3F03K 3TQ0A 3HO8A 4ZQNA 2ZRWA 3W2UA 3UPBA 3M5VA 3BW4A 4HSOA 1SZFA 3QC3A 4QNWA 1V7YA 4QAIA 4FIRA 4RX0A 4PFMA 1K7FA 3OA3A 1XUUA 1EP3A 4UFIA 4IMDA 3NZ1A 2DZUA 1VQTA 3PUOA 2GVLA 4NVTA 2ZBTA 2FB2A 1VYSX 4LS0A 1W3IA 1NSJA 4LUJA 2G5WA 1PHQA 3O16A 1L6YA 3ATZA 4GJ1A 4IUOA 4FX7A 2VEPA 1QOPA 3LOTA 4FIQA 2X16A 1T99A 2H3DA 3PG9A 4TMCA 4IXHA 1TIMA 4N2YA 5CPLA 2QF7A 3SFKA 4FNSA 4HNTA 1VRDA 1XDMA 3UPWA 5EKYA 2JKAA 1JRCA 1Z42A 2PRLA 5KINA 2DJLA 1RPXA 1WBJA 5HUPA 4XTDA 3DENA 3ZWTA 5HWMA 5FF3A 4HKPA 4JYFA 1WBHA 3GDMA 1AW5A 3DI1A 2HMCA 2VELA 1TPH1 2QCLA 3S5YA 4O1CA 5E93A 4GNJA 3LHYA 3CIWA 2Y63A 2WJZA 5D2XA 5H91A 3NPVA 4UTLA 2EHHA 4Q4KA 2WSQA 1VJIA 5G2WA 4L4MA 5DCEA 1K7EA 1GTHA 4WX2A 4M7SA 3TE9A 1HG3A 3P8JA 2Y70A 5GVJA 2FDSA 5KZDA 4A3UA 4E2BA 3C6CA 1T96A 1O4UA 4AEOA 3CU2A 1UJPA 1ZJIA 2I14A 4IOTA 4POCA 2B7NA 2Y7GA 4K39A 2X1SA 3WK3A 5CPMA 1B4EA 4IX0A 1QDSA 4O53A 3C2FA 4UIOA 3EX2A 4P61A 3LV5A 3W7IA 5K2ZA 2Z1BA 4DEFA 5HWJA 1KLYA 4J9JA 1MXSA 3LTYA 1CX9A 2Y85A 1EA0A 3W7KA 3IVTA 3RMJA 3TAOA 1NF7A 2H90A 1FDZA 2Z2UA 3STCA 4S1FA 1RZMA 3VKJA 1CW2A 3S5OA 4CQ9A 4LVBA 5IBXC 5I3GA 2ZRZA 1FX6A 1KFKA 3NYZA 3TXZA 5G4WA 2E6FA 3W7HA 4AAJA 3EX1A 1T0OA 5LHFA 3S1UA 1X7FA 1EP1A 4UTTA 1HL2A 1G69A 2VFGA 3EX3A 4EIVA 2PRHA 4ORIA 4FF7A 2PCQA 3MHGA 3G8RA 1LORA 3C61A 2OCZA 3HMJG 3OVPA 5HQEA 3L2IA 4OGZA 4GBUA 1BTMA 1CI1A 1SZNA 3TW7A 5K4ZA 3TU9A 2QEZA 3W7PA 3GVGA 3TSDA 3LBCA 1FCBA 4PEKA 5D09A 3PBVA 1M5WA 2C19A 5LNWA 1BEUA 3GR8A 5LGZA 1LOLA 3FJLA 4H4IA 3BV4A 3UQNA 3EX4A 3B03A 5D30A 3R5EA 4C1LA 1F5ZA 1JUKA 2ISSA 2OMAA 3LM7A 2QAFA 5AYXA 2VOMA 4N9BA 4NX0A 2NXIA 3N3MA 4NJKA 3QEZA 1N55A 4LVFA 1IGSA 2C18A 4RV8A 3HPSA 3NL6A 3NQ2A 2CZ5A 3CB8A 3MBFA 1OYCA 4S2CA 3NDOA 4KFPA 4AXKA 3MI6A 3W7MA 5L9FA 2FPTA 1F05A 5D02A 4PA8A 3A22A 1LBLA 4M7TA 4DQWA 1X1ZA 5MHBA 4IMGA 4WXZA 2UV8G 5F2IA 2C6QA 2EF9A 1HO1A 3E02A 3NEVA 5LHEA 3MYOA 3P61A 4JTGA 5D38A 2BZNA 3U2OA 4LVGA 5HMSA 2J88A 4JY9A 3ABRA 3S9YA 1O94A 5TQLA 3T78A 2EAWA 3N73A 3N14A 5DCBA 4IXXA 4NJHA 4FXSA 5CKSA 4R53A 3TJXA 2YYUA 3HG5A 4O57A 3LRLA 2ZRUA 4JTJA 1FDJA 5DXXA 3LI0A 3ZFHA 1I2PA 1ICPA 3PF3A 4A29A 4FXRA 4WUIA 3STFA 1OX6A 1LOSA 4MY8A 1KM1A 1KLZA 4AF0B 2OX1A 1LP6A 3CHVA 3M5ZA 5T26A 1LRQA 5AC6A 2H8ZA 1H7PA 2ZA1A 3EWBX 4UNLA 4GE8A 3IEBA 4ALDA 5AHIA 2YW4A 3GDTA 4IWWA 2R94A 3KVKA 4DO6A 1L2UA 1OFAA 4OE7A 4ADSA 2A7RA 4O13A 1SUXA 2DZTA 2NUXA 3W1QA 2J6XA 3C2EA 2A7NA 2V30A 4K38A 1L6WA 1N7KA 1K8XA 4NNBA 4BI5A 4JTHA 3NM3A 5AC7A 1ZNNA 4W9TA 1NFBA 4O4VA 4NZFA 3CPRA 3EEGA 4QJ1A 4JGDA 5C55A 2CLHA 1SW0A 3M6YA 2ZTJA 4DF2A 1V5XA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2QCD B;  1A50 A;  1QWG A;  4O0K A;  2NXH A;  4X9S A;  3NGJ A;  1E51 A;  3BAR A;  1I2N A;  2WO5 A;  3P5Y A;  3W3O A;  2YW3 A;  2QCD A;  5HUL A;  1TPD A;  5HR6 A;  4LY8 A;  4QIS A;  1G7V A;  2Z0I A;  3LRK A;  3FYO A;  2WSR A;  3KRS A;  1JCJ A;  3OIX A;  1SU5 A;  3LHZ A;  3N19 B;  1GJP A;  3UWV A;  1KFJ A;  1ZY9 A;  5D2Y A;  1SO5 A;  2NX1 A;  1DOR A;  3NA8 A;  2C0A A;  3B0V C;  2NX9 A;  3D0C A;  5FEP A;  4A2S A;  3W70 A;  2ZRX A;  1LLZ A;  4LTS A;  2OZ0 A;  5AHL A;  1Q6O A;  3W1P A;  2V82 A;  2CLK A;  5AOU A;  1TV8 A;  3GKF A;  1FWW A;  3NQM A;  1S5V A;  5K9X A;  4PH6 A;  1XBZ A;  3MHU A;  2X2G A;  3P82 A;  3RLV A;  1AL8 A;  1C8V A;  4FX8 A;  4O19 A;  1D3H A;  3GDK A;  4OV9 A;  1K03 A;  1LOQ A;  3GKA A;  4MJM A;  1BWL A;  3P80 A;  4RCX A;  4UFK A;  8TIM A;  1GPW A;  3KVL A;  5F2M A;  4MVA A;  2VFE A;  5U4N A;  1ZEN A;  3CQ0 A;  3TX9 A;  2XFW A;  4K7Y A;  2Q8Z A;  3DFS A;  5K4X A;  1SFL A;  2C16 A;  3VE7 A;  1Q6R A;  4NNA A;  1EIX A;  1RQH A;  5AHN A;  4CCE A;  4DF1 A;  1TPU A;  3SSJ A;  1FWR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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