3SGZA

High resolution crystal structure of rat long chain hydroxy acid oxidase in complex with the inhibitor 4-carboxy-5-[(4-chiorophenyl)sulfanyl]-1, 2, 3-thiadiazole.
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
351
structure length
336
Chain Sequence
PLVCLADFKAHAQKQLSKTSWDFIEGEADDGITYSENIAAFKRIRLRPRYLRDMSKVDTRTTIQGQEISAPICISPTAFHSIAWPDGEKSTARAAQEANICYVISSYASYSLEDIVAAAPEGFRWFQLYMKSDWDFNKQMVQRAEALGFKALVITIDTPVLGNRRRDKRNQLNLEANILKAALFPKASFCWNDLSLLQSITRLPIILKGILTKEDAELAMKHNVQGIVVSNHGGRQLDEVSASIDALREVVAAVKGKIEVYMDGGVRTGTDVLKALALGARCIFLGRPILWGLACKGEDGVKEVLDILTAELHRCMTLSGCQSVAEISPDLIQFSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Rattus norvegicus
publication title High resolution crystal structure of rat long chain hydroxy acid oxidase in complex with the inhibitor 4-carboxy-5-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-1, 2, 3-thiadiazole. Implications for inhibitor specificity and drug design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hydroxyacid oxidase 2
total genus 126
structure length 336
sequence length 351
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3sgzA00
4ADSA 2WSQA 1SZGA 3NL5A 3C2RA 1ME9A 1OYCA 4W9TA 3C2FA 4UCGA 2Y7GA 1EA0A 2KZHA 3S0CA 1QR7A 3GDLA 4MJZA 1QOPA 5K9XA 1R2RA 1K8YA 1GEQA 4GUFA 5HULA 1QO5A 3BG3A 1NVMA 3GDRA 4JXCA 4O1BA 4A21A 1XL9A 2YYTA 3MO7A 1XUUA 3W83A 5KTLA 3IVUA 4XUGA 3WK3A 4K39A 3PSWA 2AQWA 1YDOA 2QUTA 3C61A 3N19B 1ICPA 3TQ0A 1KFKA 1GTHA 2OZ0A 2NXGA 2Z1BA 5HNRA 5I3IA 3O06A 4NZJA 2YYUA 2ATSA 1D3GA 1PCKA 3CLMA 4E0CA 5C5YA 4R34A 1DJQA 4IPIA 3R8RA 1KBJA 3LHUA 2CZ5A 4BWLC 1JCLA 1F6KA 3VNDA 2CLLA 1YPIA 3EXRA 1TPVA 4FNRA 4YWIA 1KV5A 3O63A 3W73A 1XM3A 3LX9A 4HNUA 4FNUA 3QH2A 1QPNA 4N9BA 2FB3A 1THFD 1EUNA 5C2XA 3L67A 3W1AA 4AEOA 2E77A 1HO4A 3O8AA 1DL3A 2CZDA 3TMQA 4AH7A 1FBAA 2Q8LA 1JRCA 1K3UA 5CSSA 3KHJA 1GTEA 1KM4A 4M5PA 3ABSA 1F2JA 5LHFA 1FX6A 3NL3A 3TUUA 3FJLA 4UTHA 5DCDA 5DBUA 1JCMP 1ZCOA 4OV9A 3I7SA 4MZ1A 4Y96A 1I2OA 4WUIA 1TTIA 4UTWC 1QFEA 2AGKA 5F4XA 2QDGA 4I7VA 3V75A 1SUXA 1SSGA 1AMKA 1W3IA 3A24A 1J5TA 1FXPA 3P61A 3FA5A 4HNVA 1SO6A 2ZZ3A 1X1ZA 4TX9A 3STFA 2PE4A 1M7OA 2E5BA 3USBA 1LCOA 4XQ6A 1U5JA 2GVJA 5G2HA 4XBSA 3WK1A 1W5MA 1OG0A 1O95A 3N73A 3GLCA 2ZYFA 2FDSA 2Y63A 1JCNA 2A7PA 2QAPA 3IIOA 3S6DA 3E0IA 1NF7A 1WXJA 2CLEA 3LCFA 3KXQA 1H63A 1W54A 3IVTA 3W70A 3LTYA 4ORMA 4NNAA 3K30A 5LNWA 1VHCA 1TJRA 1KFBA 2QUVA 3WK0A 5CGQA 4Z0JA 3IGUA 4OT7A 1KW1A 5T26A 4DQWA 4QISA 4LY8A 1YYAA 3FKRA 4CNPA 1DORA 2BTMA 4IQLA 5K4XA 4JTGA 1G4PA 1QCWA 1IGSA 4AHOA 4O28A 1W31A 2XFWA 4KFNA 5LNUA 3STGA 4N9CA 3NPXA 3W7MA 5IBXA 3SFKA 4AHPA 2BLEA 1ZENA 3Q2DA 1SR9A 2C18A 4JTUA 2R8WA 1PE1A 1R2TA 3P8JA 2YR1A 2FIQA 3M6YA 3VKJA 3KOFA 3INPA 2OT1A 3JS3A 3DENA 1YDNA 5LHEA 4JS3A 2ISVA 1F05A 4NX0A 3M0ZA 1LLWA 3W1LA 2WOQA 5CG7A 3DHFA 4N6EA 1VC4A 4KKXA 3L0KA 1P4CA 4LS0A 3M9YA 1DBTA 6TIMA 4UTIA 1BWLA 5D30A 2C14A 2W0UA 4GNJA 4Y8FA 3CEPA 1MEIA 4ORIA 2FB2A 3W07A 1YDVA 1YXCA 2GPTA 4ZQNA 4BF9A 5HQEA 1AW1A 1F6PA 4MPQA 3QW3A 3H54A 1AL7A 1K8XA 1RPXA 2Y7FA 4Z1DA 1A5AA 1DQWA 2ZA2A 1UB3A 2PC4A 3P62A 1XBXA 3E9AA 3QC3A 3PG9A 3L21A 4CLMA 1XBYA 1D3HA 1WOAA 4IOTA 3B0VC 1G4TA 3TKFA 1OFOA 3P60A 1EP3A 4JN6A 3PY2A 3R13A 4HSOA 2E6YA 3IV3A 3SY5A 3C6CA 4GC4A 3L5MA 2DJLA 5C6MA 3LLFA 5HMSA 3AO0A 1KFJA 2ZA1A 2ZA3A 3WJSA 2CU0A 1XKYA 2TMDA 1YPFA 4IX2A 3W7OA 1IXOA 3QRHA 3CIWA 1JULA 4LS1A 3THQA 2DZSA 8TIMA 2GQAA 1ICSA 4RXFA 4GJ1A 4O15A 2ABBA 3LOTA 1Q3NA 4LVAA 4O11A 3QW4B 1JJKA 3BG5A 3SSJA 5ABTA 3MYOA 2YX0A 4K37A 5AHEA 4FIRA 4JX4A 2ZQ0A 2QCDA 1DVJA 3A23A 1Q6RA 4MZYA 3BW2A 5AHFA 1KTNA 3QSTA 5K4ZA 4RZ5A 4GRSA 5DN1A 1GVSA 3TAKA 5LGXA 4UFJA 3BLEA 2ZZ4A 5J5DA 1OFQA 3S5YA 3IEBA 3TW7A 3BG9A 4XWUA 5D2TA 4K38A 4J9JA 3UWYA 5HJLA 1Q6QA 5HWMA 1TPB1 3N2MA 3P74A 3UYCA 3NM3A 2A21A 2JKAA 3G1FA 2Y89A 1IXPA 2ABAA 1TREA 1KFEA 2W79A 5AYZA 4WY0A 4KWVA 5G1TA 4UFKA 3SJ3A 3FEMA 1VPXA 1NFBA 1H7PA 3G1DA 3SGUA 4DF1A 4WXZA 3LRMA 2EGZA 4LT9A 2NXHA 3NAVA 2A6NA 4FX6M 1KLZA 1XDMA 5U4NA 1ZNNA 2QCFA 3P81A 2H3BA 4LVGA 1DJNA 4O0ZA 5G5IA 3IGXA 1LM1A 3RFAA 1ONRA 3NQVA 5TIMA 5H2ZA 4O50A 3TJLA 4N9EA 2DZXA 4AMAA 3W87A 3FOKA 1OX4B 3W86A 4AF0B 1A53A 3TJXA 4EWND 3PBWA 4K6AA 2NXIA 4PH6A 5HUPA 4MY1A 4PL1A 1TMHA 4QAIA 5AHMA 4UTMA 4UNLA 3W2LA 3UWVA 1QNVA 3C4UA 3BW4A 5IBXC 4ZQOA 4TIMA 1D9EA 1VCFA 4A3UA 4JNMA 3BPWA 4BI7A 4KWWA 3O6DA 3CB8A 3W7EA 5E93A 4JD4A 1RV8A 4Z0SA 3LBMA 3GIYA 1PS9A 4X2RA 1GVFA 2PRHA 5K3VA 1FDJA 2WSYA 1YTEA 2D73A 1UBSA 3NYZA 3O07A 4WOZA 4OU1A 2X30A 2Y70A 1ML1A 1LYXA 2EKCA 4Y9AA 2ZRUA 3W1PA 2FPYA 3LLDA 4ADTA 2DP3A 2VFIA 2XN2A 3LHTA 2R91A 3NGJA 2J6XA 4RX0A 2CLFA 1BKSA 1SW3A 2VFDA 3HOJA 4PEKA 5EYWA 1OF8A 1UUOA 3NQFA 1FCVA 1OF6A 1WBHA 2E68A 2I14A 1P5BA 4NXKA 4YL2A 1ICQA 2DU2A 5F4SA 4UTKA 3IIPA 2W6RA 5CPMA 2H90A 4AXKA 4RCXA 5TBOA 5LNVA 3TQVA 3M44A 3P5ZA 3BGGA 2FPVA 3OVQA 3LCIA 4JEQA 1LP6A 4ZQCA 1G69A 4BR1A 5CPLA 3UD6A 2G95A 3QPYA 2VOMA 3W1QA 4AWTA 1LTDA 2A6LA 1R47A 3DGRA 3ANYA 3W7NA 3G0SA 3B8DA 1FXQA 4LU0A 2NX1A 3W7DA 3W1RA 1LORA 4TO8A 4IGHA 3LDVA 1FUYA 1VYPX 1OK6A 4MFEA 5CZTA 1FCQA 4O17A 2QF7A 5F4WA 3LV5A 3W7HA 3KVKA 4M19A 1I2RA 3T44A 3BGJA 3UXAA 1KV8A 1I4NA 5AYXA 3W75A 4O13A 1AG1O 1L9WA 2HMCA 3KVMA 2C1HA 2B7PA 1QOQA 5AHLA 2ZRWA 3BLIA 1YTKA 3LV6A 3PUOA 4OGZA 3SR7A 2DZTA 3I68A 3HMJG 3GXNA 2B7QA 3G1YA 3W9ZA 5BNKA 1VR6A 1IIHA 1EUAA 1TSIA 3QZEA 1ZALA 1GVRA 3TU9A 3GZ3A 4ZL1A 5BMWA 3UWQA 1CI1A 4IUOA 1EB3A 1SU5A 2EAWA 2VC6A 4N6FA 2ZBTA 3DU0A 2CZFA 1YXYA 2VEKA 4IWWA 1QAPA 3EKZA 3LCGA 4NT0A 5J5RA 3TSBA 2CW6A 5HR7A 5F1VA 4NJHA 5D2WA 1FDZA 2XN0A 4IXHA 3LCWA 2YDAA 1LDCA 4RZ4A 1I8JA 1XUZA 4UXDA 1CW2A 5FEPA 2PURA 1OHLA 4PCFA 5DCEA 1JRBA 3NPWA 1FDYA 3TC7A 3A5VA 3KX6A 2QJHA 2V81A 2YPIA 3R12A 4YMZA 3I65A 3HGOA 4WQ6A 1E51A 4JTHA 1JCXA 4LOCA 3HB9A 3YPIA 1UUMA 3EX4A 5D32A 4HKPA 3TSMA 3M16A 3VFLA 3F1QA 4UC5A 3NL6A 4OV4A 4JTKA 3AJXA 4O1AA 5LNSA 1NF0A 3NQGA 2X1TA 3PVFA 4MUZA 2OMAA 3HG5A 2NV1A 1L6WA 2JK2A 4JICA 3DFPA 3PBVA 3HGSA 2V2HA 3DXIA 2VELA 3NQ7A 4EOUA 2YGYA 1C8VA 2CLMA 1X8FA 4O12A 3W7IA 3UZJA 4DO6A 1P0KA 3GXTA 4FNPA 4UTJA 4A22A 1H61A 3WJWA 3B0UX 3GXPA 2FFCA 3IIVA 5I3KA 5FEZA 1GYLA 1EX5A 1OFPA 5KITA 1ZFJA 3G1XA 5BMXA 3UZ5A 3LTPA 3Q58A 4O0KA 5EY5A 2ZZ2A 4HSNA 3VCRA 4IMCA 3PBUA 2QUUA 1TPH1 5EKYA 5CSRA 3GX9A 2BWGA 1M5WA 3BW3A 2NWRA 3EWUA 5LNRA 4H3DA 5SWUA 4ONVA 1OYBA 2J9YA 3RLVA 5AC8A 2PRLA 1FWNA 4I7WA 3O16A 1KA9F 3LHYA 1SW0A 5L9FA 4DPQA 3NQAA 3C56A 1AW5A 2E1DA 2QCCA 1BTMA 2WV8A 3UY8A 4RLIA 1K7XA 3C2VA 3L5LA 1LROA 3HPZA 4AB4A 2ISSA 2V8ZA 3FS2A 4NNBA 4DO5A 2QKFA 3TXZA 1R30A 5FF7A 2RDWA 4TMBA 2JKPA 4O4WA 4E2DA 3PS7A 3M41A 1SZNA 2J9ZA 3NNTA 1FCBA 4YCPA 2C13A 2YXGA 2G97A 2NV2A 3H53A 3HG2A 2QCNA 1F74A 3CU2A 3DI1A 3OVPA 2B4GA 4X22A 5DY3A 4DO4A 4TR9A 3G1VA 4WY0F 2YW4A 4S2BA 3WJXA 2RDTA 5TQLA 1QO2A 3GAKA 4WZHA 2Q3RA 1OFDA 3HPSA 2P1FA 2NUXA 2A4AA 3TROA 3OA3A 3CWNA 1RQHA 5HWJA 3N9RA 2VXNA 1EP1A 1B9BA 1S5TA 1TPDA 3W7JA 3S1XA 4EF8A 3TV8A 3E12A 3PC0A 5DBTA 3SZ8A 1T8XA 2ZZ7A 3R2GA 4N4QA 4UTLA 2V9DA 4X3ZA 4TU1A 1UJPA 3PAJA 1GVQA 3TDFA 3KRSA 1OX5A 5G2WA 3S1VA 3I6RA 1A5SA 3NA8A 1SZEA 4LV9A 4Y90A 3I7QA 3ZWTA 4BI6A 4FHAA 3CC1A 4RK8A 1HTIA 3R5EA 4RV8A 1N7KA 3S5OA 3L66A 3BARA 5DLCA 1I2QA 4ADUA 2QCHA 2Y61A 1Y0EA 4XTDA 3U8GA 1J2WA 3PWAA 3G1SA 3FYOA 4HPXA 4LVDA 3QYQA 3NQ6A 3GKFA 4UFIA 3NPUA 4OQVA 4YLWA 3N9SA 3NQDA 4E2BA 4GXMA 1O60A 5F2MA 2LLEA 1VHNA 1JQXA 4QM1A 2C15A 2NX9A 4L4MA 3R89A 1NEYA 1VJIA 3C0JA 2QAFA 5CKSA 2TSYA 2Y88A 3W1TA 1OX4A 2ZZ5A 1GYNA 1JCJA 3E49A 4HHPA 4AF0A 4MYAA 4A29A 2Y7EA 5IM51 3DFNA 4XTIA 3MI6A 4N02A 3NVTA 1LOQA 3LCXA 5I3FA 5FEWA 1EIXA 1WOBA 3W2UA 4LS2A 1TQXA 1PHWA 1W5PA 2BXVA 4GUJA 3NZ1A 1VYRA 4QQ3A 3C3NA 3S9YA 1DV7A 4FX7A 2E5DA 3M7WA 1ME8A 5MHBA 2NUYA 4O1CA 2FQIA 2ZRZA 3GKAA 2V82A 5EL1A 1KM3A 1M7PA 1TPC1 2VKZG 3FFSA 2WNZA 1XBVA 1R2SA 2DZUA 2I9EA 4Q32A 3TR2A 1O5KA 1OFAA 2YW3A 3N3MA 5FF3A 4K8HA 3GDMA 1R46A 2HSAA 4MY8A 3TFCA 5F1UA 4N2YA 3G22A 3LI1A 3ABOA 3UPWA 3CQ0A 4KFOA 1ZY9A 4O4VA 4AAJA 5AN7A 4IX0A 1YLVA 4O10A 1ME7A 1OFBA 3B05A 2TRSA 4DF0A 5LSMA 1Z48A 4LTSA 4O14A 2ZRXA 2ZTJA 3KRZA 3G8EA 1T0OA 3HG4A 3LRLA 3TC6A 1H51A 5L6UA 4C1LA 3LCLA 2V2DA 3H55A 3M1ZA 4EIVA 3DKLA 4O19A 1YADA 4JTFA 2A7NA 1SPQA 1JCYA 5BW6A 2WPBA 1SO5A 3W3OA 3TK7A 1ADOA 5G2IA 4DEFA 1FWWA 2RKXA 4IPJA 4JTIA 3FKKA 2F84A 1JVNA 5G4EA 3W2MA 1G4EA 3GNDA 2WO5A 1I2PA 4X9SA 3RNDA 3O6YX 1K7EA 3KFTA 1TV5A 3S42A 2Q8ZA 1V7YA 3Q94A 4LRTA 1IIGA 2J88A 2B7OA 1G4SA 4WOQA 3EWXA 4LNYA 4CQ8A 4UR8A 4DBEA 2ZZ1A 4OE7A 3TMLA 2ZFAA 5D09A 2C16A 4Q4KA 2DZVA 4HNNA 3PR2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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