3SURA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with nag-thiazoline.
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
molecule tags Hydrolase
source organism Paenibacillus
total genus 191
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3surA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3surA02
3ARVA 3ARUA 4NRRA 1JDDA 8CGTA 3CZLA 2EXOA 1PIGA 4NRSA 1QOXA 1TZ7A 1K9EA 2ZX8A 1W9DM 3RIKA 2VX7A 1E6XM 2G3MA 4UOJA 5FKYA 4FLQA 1J01A 4HMCA 4D6JA 1W9UA 4ML4A 4AZHA 2W92A 1WZKA 2WHMA 1XSJA 3GXFA 3NCOA 4ZENA 4KMQA 1QI0A 2XYLA 4PYSA 3EMCA 1TVNA 1H2JA 3WFLA 1FH8A 1BYDA 3ZJ6A 3WENA 4WIWA 4B3KA 1PX3A 1VF8A 1XC6A 5D4YA 4PMUA 4AMCA 3FHAA 1J10A 3W24A 3ALGA 1GORA 3MSGA 4MB1A 1BGGA 4W84A 1BFNA 3AICA 3MMWA 2XM2A 1CWYA 1QHOA 2Q8XA 3BC9A 3MS8A 4MAZA 4J3WA 2O9RA 2WCAA 1CXFA 4LGXA 4Y7EA 4EAMA 2VVNA 4D6FA 4W7WA 3TONA 1YHTA 5A94A 4EKJA 2E8ZA 4UZUA 1S46A 1KGUA 1ISYA 3L2MA 2CKRA 3VIKA 1V0NA 5CLWA 3THDA 4J3VA 1UR1A 4P8VA 3ZIZA 3A47A 4HOZA 1JZ7A 1HKJA 4V28A 3KL0A 1TMQA 3LPFA 3AFBA 1UD2A 2CHOA 4U5KA 4PN2A 2BVYA 2CKSA 1E0XA 1KB3A 3VIMA 1UH3A 3VGDA 5BXPA 3ZJ8A 1E5JA 4YHGA 4J3UA 1E6ZA 2PI6A 1E4MM 2GDUA 3NDZA 5D9PA 2BY1A 3RM8A 1VJZA 3BCFA 2WBKA 2VURA 2D23A 3DYOA 3M46A 2EBNA 4CN6A 3A4XA 2J7HA 3AMLA 3VGHA 2PC8A 3CUHA 2W62A 1SR0A 2JE8A 1JI2A 3WNLA 2A3CA 3ZSTA 1HN1A 1R87A 1M53A 2D2OA 2V3DA 2BXZA 4FLRA 3B8SA 3MUAA 1EHAA 1H49A 3L4XA 2XHYA 4HPHA 4JCMA 1XH0A 2JIWA 1E3ZA 3IK2A 4UQEA 1M03A 5CPTA 4E8CA 1CYGA 4NZCA 2G3JA 3UETA 4OJYA 3ZJKA 5ABHA 1HVQA 4TX6A 1CTNA 4UFKA 2J7GA 4MB5A 4UOQA 1ISXA 2YKKA 1VFFA 1U33A 2BVTA 2CBIA 3CUFA 2WANA 5I2UA 4MPKA 3AIEA 1NWSA 3B9AA 3NIYA 1MW3A 3WD1A 5CGTA 3WEZA 5I5RA 1RD6A 1E6PA 3MV01 4FK9A 2DEPA 1ECEA 4JZ5A 3ARPA 4AD4A 4W86A 4B16A 1C8YA 2WC3A 5CGMA 3CTTA 1XSKA 4PCTA 2WSKA 3AMKA 3CUGA 2WXDM 2XVPA 1WZMA 5E6ZA 1BG9A 3OLDA 1E9LA 3CUIA 1JNEA 4DUWA 4A3HA 3UEQA 5E0FA 4DWSD 5AC4A 3NYDA 2XIIA 4HOXA 4FLOA 3N18A 4DM1A 1XHGA 2J7CA 1OT1A 4JFVA 4D6IA 1JZ2A 1LQ0A 3SURA 1W2VA 4AZ6A 1FA2A 3EBVA 1MW2A 4UNIA 1AQ0A 3UERA 4GI9A 5M5DA 1R7AA 1GVIA 4X9YA 4OBSA 3GZAA 9CGTA 5A6LA 1H0IA 4MNMA 1G5AA 3WD0A 4YPJA 1JD7A 2YL5A 3AMDA 5A8QA 4U5IA 1BSIA 3W25A 3OIHA 1QI3A 2VCBA 1LWJA 3AS3A 1NOFA 4AEFA 1E15A 1BF2A 1XH1A 4V27A 4GINA 3SUUA 2VVSA 2O9OA 1GPFA 1MYRA 3WNPA 4NSBA 4PTXA 1SMAA 4JAWA 4JKMA 2E40A 1JI1A 2ZUVA 4KGLA 4UFLA 4N42A 4TOQA 3WQWA 1GQJA 3BAYA 3SCPA 3CMJA 4TVDA 3VIPA 1CXLA 3CIVA 2MANA 3CGTA 4BS0A 4A4AA 2J4GA 2O92A 2WCSA 1ZB5A 2DGAA 3AXXA 1JF5A 1BVNP 5LA0A 3PBGA 4QLLA 2BHZA 3ARTA 3ZT6A 5I24A 2FGLA 2WZEA 1WKYA 3VX0A 2YL9A 4BQ4A 1HJUA 4M82A 2WYSA 4P8XA 5GNZA 3AXHA 4AIOA 4CD7A 1W3JA 1MXGA 1DWFM 1GCYA 3VMOA 4AYSA 2DH3A 1UUQA 3AXIA 1XCWA 1LLOA 1K6AA 1LJYA 4ATDA 2WKLA 2OYKA 1K9FA 4ZE5A 1V3KA 3F5LA 2FHFA 2QHAA 2PWDA 4C90A 1ESWA 4CCDA 4UQCA 3T0AA 1Q6CA 2PF0A 4JHZA 1C91A 4W85A 1GOKA 1V3LA 5IXEA 1TFVA 3U5UA 5E6YA 1FP8A 2ZX7A 4GZEA 1C93A 1V6XA 3U7VA 5I79A 1XV8A 1E4IA 4GZJA 3VIGA 1AQHA 1JZ8A 2DH2A 3VDAA 1W1PA 3WDIA 4B9YA 1OINA 1B0IA 3POCA 4M8UA 4PBGA 3WF2A 1JD9A 4XZBA 4GXPA 3N11A 1XRVA 3AROA 4HA3A 1ZBCA 2BY0A 3OGSA 4W8LA 4OUEA 5FOOA 4IM4A 3WF0A 3AIRA 3KWXA 4CGTA 3ZM8A 1B3YA 2WBGA 2Y2WA 3N1AA 4PMQA 1KXQA 2Y4SA 2CYGA 1UD5A 3TTQA 3N15A 2WMIB 3WIJA 2OYMA 2A3BA 4M80A 3AHYA 4CKQA 4JKKA 1DEDA 2F2HA 3AIVA 2DPEA 3T2PA 2GK1A 2J25A 4D72A 1CXHA 3WL1A 4PMZA 2UY4A 3MANA 1CLXA 1HJQA 5I0DA 4A3YA 2YDRA 2ZX5A 3U7BA 1BYBA 1JZ6A 7TAAA 1CXKA 1L0PA 1Q6GA 5LYRA 4H2CA 5I3DA 2VI0A 1OD0A 3VGFA 1V02A 1CPUA 1UH4A 3VD7A 5JBFA 2DIEA 5D9MA 3D3AA 3ZO9A 2XIBA 1QI4A 3VPLA 4E8DA 3WUBA 2QV4A 2OSYA 5EBAA 3HJEA 5A2CA 1VFMA 4P7OA 3WQ8A 1QW9A 4Z2GA 2ZX9A 1MWOA 2W63A 2E0PA 1UR8A 1NWTA 2A3AA 1PX8A 4P7RA 4ACZA 3ZJ7A 1WO2A 1E72M 1XSIA 3CZKA 3BSHA 2DT3A 4U2YA 2EPKX 2VQUA 1DP0A 1LL6A 2OWCA 3CHCA 5CQ1A 4AXNA 4JL1A 1BHGA 2BY2A 4P8WA 4URIA 2YBTA 3BMVA 2FHCA 3VNZA 2WB5A 1C90A 1JDCA 5BXSA 5D8WA 4HPGA 2O9TA 4YHEA 3WF4A 5A6KA 4UR9A 4JKLA 1C92A 4UZSA 1QHPA 3B9DA 2DSUA 1V6UA 5A1AA 2ZXQA 5CG0A 5AYIA 2VCCA 2HVMA 3CZ8A 4M1RA 8A3HA 1UD4A 2W61A 3N04A 3N9KA 4U31A 1E56A 4WKHA 4XZWA 3PZVA 3TTOA 4MDPA 3VDCA 3AYSA 3W26A 3CMGA 3UR8A 1FHLA 3PZUA 3O6AA 2CIPA 6A3HA 3QOMA 4ATLA 1N82A 4W93A 3THCA 4AD0A 4M29A 5IFPA 3GXMA 3VGBA 1KWGA 3WBAA 4CU7A 3AHXA 1F4AA 4UQBA 5IFTA 1O6IA 2J62A 1V0KA 3NUKA 5A6BD 2DSZA 2WSPA 3ZR6A 1GQKA 3LPPA 1CGTA 1W9BM 3ZMRA 1GZJA 2OWXA 2VO5A 3FXYA 4CD4A 1OD8A 3WH9A 1E6NA 1E1FA 3GH4A 3M07A 3JUGA 1FOBA 2BFGA 3DC0A 1W1TA 1KFWA 3CHFA 5FCZA 4AW7A 4HU8A 2CCRA 1VAHA 4N0RA 1C8QA 1EDGA 1BGAA 5DO8A 4UQ9A 5HPOA 1HT6A 4FF5A 4GIAA 3RJXA 4PMDA 2G3IA 2EPNA 1BAGA 1K9TA 1MFVA 2CITA 2WZHA 4JFUA 4D71A 4UFHA 5FL1A 3MMDA 1CBGA 4TTGA 3SUSA 4UQDA 2BXYA 2XM1A 1K9DA 1U30A 4QLJA 1JFXA 1G01A 1EGZA 3CHDA 5M17A 1E5NA 1MQPA 3F5KA 4QDMA 4EE9A 5A6AA 3VTRA 1BTCA 4MTVA 4QCEA 3W4RA 3KE0A 1QI5A 4X0NA 3OZPA 1B2YA 3CZJA 1PAMA 1UG6A 1VEMA 3WQ5A 1FP9A 4NI3A 3VM7A 3GM8A 5JUVA 2TAAA 1B9ZA 2EPMX 4AZBA 2WVVA 4H8UA 4JFTA 5CPQA 1H09A 3VOCA 1NP2A 5I23A 4CVWA 3N17A 2XGIA 1UWSA 3VDHA 4JCLA 1NH6A 4HA1A 1C8XA 1SMDA 3WQVA 2VRQA 4MJ4A 1UWUA 3W37A 4GQRA 3WNMA 4TTUA 2HISA 3DHUA 2EPOA 2WVSA 2QF8A 2Z1KA 1BQCA 5A8PA 3NJ3A 3UCQA 5F7UA 4PMRA 4GO8A 3AZTA 3SCUA 4PTWA 1H1NA 1KCKA 1PJ9A 3QGVA 1BYAA 1L8NA 2J78A 3SUVA 1RPKA 3AIWA 1OGGA 3KL5A 3BAKA 1J0HA 1HKKA 5A95A 3T08A 1GVYA 4K68A 1KGXA 3FHQA 4JFWA 3I3DA 4JIEA 3IJ8A 4RE2A 2XVGA 2D1ZA 2D24A 1NOUA 4QAWA 3BCDA 2Y24A 2WVTA 3PTQA 4DWSC 4MB4A 4WSJA 3W38A 1GUVA 3II1A 4KWUA 1PEZA 3BAXA 2J7DA 2VR4A 4MADA 4S3KA 4WLCA 2ZIDA 3QHMA 3WKZA 2V5DA 3WD2A 4U3CA 4KGJA 1QW8A 1JYWA 7CGTA 2UY2A 2GJRA 1W1VA 3WDHA 2VX4A 1BPLB 2VTFA 1UD6A 2XSAA 6TAAA 4IPNB 2W5FA 4OKDA 5JBDA 1Z32X 2WNWA 3QOKA 1DWHM 1E4LA 4JL2A 1GQIA 3CPUA 3QHOA 3SEPA 1J0YA 3AS2A 4W7UA 3PZNA 3WDRA 4UFMA 2ZUTA 1XYZA 3GTNA 4MDOA 5A8MA 3VD3A 4CU6A 1V08A 2NW0A 1H5VA 2W67A 3OLGA 4WK9A 1FH7A 3IJ9A 4QP0A 4BZYA 2C7FA 3S6TA 2YLLA 2OWWA 3UG4A 3UR7A 1LL7A 2V3EA 3NSMA 1V3MA 1KGWA 1SYTA 2DDXA 1TCMA 3BGAA 4NF7A 4PTMA 2YDSA 2EPLX 2VMFA 1CECA 2ESCA 2ZE0A 3WNKA 4DM2A 4D6CA 1B1YA 2QMKA 1W9VA 2PB1A 1VIWA 1DWJM 4MAVA 2OYLA 5BRQA 3VNYA 1E0VA 2FHBA 3KEHA 2B31A 2DSVA 1LG1A 2IXVA 2D0HA 1UKOA 1V02E 3WY1A 5BYWA 2YL6A 4AZCA 1OIMA 5EFDA 1I1WA 2WKGA 5C71A 4TUFA 3PZ9A 4W8AA 3WF3A 3IAQA 1MFUA 3EDEA 3K1DA 3WN6A 1UQZA 1W3HA 5CJ5A 1V0LA 2PBGA 5LA1A 1FFQA 5ABEA 4LPCA 5BRPA 2E9BA 1NARA 1CEOA 4IUGA 5BXRA 3GYCA 1XH2A 4H7VA 2CBVA 5CPSA 5DT5A 3AJ7A 2CEQA 3AS0A 5E0CA 3OG2A 1QNSA 3L2LA 1B30A 2ZWZA 1H3GA 5IHSA 4LYRA 4ATWA 1B3XA 1HVXA 3MKKA 1ISVA 1E6SM 2DQXA 4XB3A 3U57A 2XUCA 1FFRA 1NOWA 5CXPA 3VMNA 1QBBA 3LMYA 1UQYA 2ZWYA 2XJ7A 2OLHA 1G1YA 1H41A 1U2YA 5E09A 3W53A 3T09A 5ABFA 2GK1B 4RE3A 2JEPA 4F8XA 4HOWA 3K46A 1AVAA 1B90A 2FH8A 2XFRA 1OIFA 5C8BB 1TE1A 3LPOA 4PMVA 1EDQA 3TOPA 4XX6A 3B9EA 2ZICA 1QI2A 3WDQA 3K8MA 3NDYA 4Z2JA 4UFIA 2WZIA 4Q22A 1MVYA 3CBWA 1HX0A 2J8GA 4L4PA 1JAEA 3K8KA 1LL4A 2CHNA 4DWSA 1CDGA 4W7VA 3T2OA 4BQ2A 4H8HA 3APGA 4QCFA 4ACZB 4EK7A 4D6HA 5KZ6A 4PSPA 1KWKA 2E8YA 4AIEA 2QMJA 2ZUWA 5HNNA 4E4PA 1UWQA 2XFFA 1E43A 4P8UA 1J0IA 3L4VA 2YLAA 3OZOA 4H04A 1WDQA 5ABGA 1KXHA 1JFHA 3DYPA 1JNDA 4B15A 5C70A 3WELA 3VIIA 1VRXA 3OLEA 5TD4A 2GVYA 1GJUA 5HPCA 2YBUA 4B9ZA 2V5CA 5A69A 1WPCA 4ZXLA 2BVDA 2J77A 3AISA 3WMSA 1R86A 1QBAA 3W0KA 1HXJA 3L4ZA 1UR4A 5M3WA 3WMBA 1NWRA 3AIQA 2WVUA 5A8NA 3EMZA 1J0KA 4DUVA 3K8LA 5ECUA 3BMWA 1J18A 3VGEA 3AYRA 1MXDA 1KXTA 2VZVA 4WF7A 3RJYA 4D1JA 3BLKA 1W3KA 5E9AA 2IUZA 2FH6A 2WMFA 1W3LA 3UG3A 2X0YA 2ZUNA 3GH5A 3NSNA 1AMYA 1VEOA 1F4HA 4MNJA 2WW5A 3W28A 4Z2IA 1PZ3A 4E2OA 1HJSA 2JIEA 1UKPA 2PWEA 1IT0A 3FNDA 1PIFA 1JZ5A 3VIJA 2ZUUA 4GKLA 2YDQA 5JIWA 2J79A 1ZS2A 2E3ZA 4AD2A 3VIOA 2XWDA 3SCVA 2X1IA 4RL3A 2GJXA 1PZ2A 4S3JA 3RMEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ARV A;  3ARU A;  4NRR A;  1JDD A;  8CGT A;  3CZL A;  2EXO A;  1PIG A;  4NRS A;  1QOX A;  1TZ7 A;  1K9E A;  2ZX8 A;  1W9D M;  3RIK A;  2VX7 A;  1E6X M;  2G3M A;  4UOJ A;  5FKY A;  4FLQ A;  1J01 A;  4HMC A;  4D6J A;  1W9U A;  4ML4 A;  4AZH A;  2W92 A;  1WZK A;  2WHM A;  1XSJ A;  3GXF A;  3NCO A;  4ZEN A;  4KMQ A;  1QI0 A;  2XYL A;  4PYS A;  3EMC A;  1TVN A;  1H2J A;  3WFL A;  1FH8 A;  1BYD A;  3ZJ6 A;  3WEN A;  4WIW A;  4B3K A;  1PX3 A;  1VF8 A;  1XC6 A;  5D4Y A;  4PMU A;  4AMC A;  3FHA A;  1J10 A;  3W24 A;  3ALG A;  1GOR A;  3MSG A;  4MB1 A;  1BGG A;  4W84 A;  1BFN A;  3AIC A;  3MMW A;  2XM2 A;  1CWY A;  1QHO A;  2Q8X A;  3BC9 A;  3MS8 A;  4MAZ A;  4J3W A;  2O9R A;  2WCA A;  1CXF A;  4LGX A;  4Y7E A;  4EAM A;  2VVN A;  4D6F A;  4W7W A;  3TON A;  1YHT A;  5A94 A;  4EKJ A;  2E8Z A;  4UZU A;  1S46 A;  1KGU A;  1ISY A;  3L2M A;  2CKR A;  3VIK A;  1V0N A;  5CLW A;  3THD A;  4J3V A;  1UR1 A;  4P8V A;  3ZIZ A;  3A47 A;  4HOZ A;  1JZ7 A;  1HKJ A;  4V28 A;  3KL0 A;  1TMQ A;  3LPF A;  3AFB A;  1UD2 A;  2CHO A;  4U5K A;  4PN2 A;  2BVY A;  2CKS A;  1E0X A;  1KB3 A;  3VIM A;  1UH3 A;  3VGD A;  5BXP A;  3ZJ8 A;  1E5J A;  4YHG A;  4J3U A;  1E6Z A;  2PI6 A;  1E4M M;  2GDU A;  3NDZ A;  5D9P A;  2BY1 A;  3RM8 A;  1VJZ A;  3BCF A;  2WBK A;  2VUR A;  2D23 A;  3DYO A;  3M46 A;  2EBN A;  4CN6 A;  3A4X A;  2J7H A;  3AML A;  3VGH A;  2PC8 A;  3CUH A;  2W62 A;  1SR0 A;  2JE8 A;  1JI2 A;  3WNL A;  2A3C A;  3ZST A;  1HN1 A;  1R87 A;  1M53 A;  2D2O A;  2V3D A;  2BXZ A;  4FLR A;  3B8S A;  3MUA A;  1EHA A;  1H49 A;  3L4X A;  2XHY A;  4HPH A;  4JCM A;  1XH0 A;  2JIW A;  1E3Z A;  3IK2 A;  4UQE A;  1M03 A;  5CPT A;  4E8C A;  1CYG A;  4NZC A;  2G3J A;  3UET A;  4OJY A;  3ZJK A;  5ABH A;  1HVQ A;  4TX6 A;  1CTN A;  4UFK A;  2J7G A;  4MB5 A;  4UOQ A;  1ISX A;  2YKK A;  1VFF A;  1U33 A;  2BVT A;  2CBI A;  3CUF A;  2WAN A;  5I2U A;  4MPK A;  3AIE A;  1NWS A;  3B9A A;  3NIY A;  1MW3 A;  3WD1 A;  5CGT A;  3WEZ A;  5I5R A;  1RD6 A;  1E6P A;  3MV0 1;  4FK9 A;  2DEP A;  1ECE A;  4JZ5 A;  3ARP A;  4AD4 A;  4W86 A;  4B16 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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