3SUTA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with pugnac
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Paenibacillus
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
total genus 192
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3sutA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3sutA02
2WHJA 3DECA 3TTSA 1QI2A 1IV8A 3PZQA 2GJXB 2WHLA 3WNNA 3SUUA 3BSHA 1NOUA 4V2XA 4HPGA 3WH8A 2A3HA 1UR2A 2BV9A 4JIEA 4MTVA 3BGAA 1WDRA 4GINA 1C7SA 3FXYA 3QR3A 1UWSA 3WF1A 3WQ8A 1LLOA 2VCCA 3WDQA 2FHFA 1LWHA 4YN5A 2FHCA 3W29A 2VVSA 3GNPA 2IXUA 1CXKA 2FGZA 4AZCB 1XRVA 3L4WA 5E0FA 1UKOA 1UWRA 4B3LA 1JZ8A 4BS0A 2J7CA 1SMDA 2D0FA 1W2VA 3GH4A 3K8KA 1QI0A 2WMJA 3WNKA 2OSXA 4J3SA 3ZR5A 1BPLB 2VO5A 1GHSA 3MMWA 1V0MA 3VGFA 1J0JA 1V6YA 3BAKA 1C8YA 1NQ6A 4NF7A 1E15A 3UG5A 1TMQA 5A8OA 3WKZA 3OZPA 1C7TA 3MMDA 1GCYA 3TTOA 3WFLA 2ZUSA 1H41A 2PWFA 2CESA 3N04A 4E8DA 2FHBA 1B2YA 5DMYA 3OGVA 1V6XA 2VL4A 3BAWA 3HN3A 3IAQA 2F61A 1QI5A 3WFZA 3ZOAA 4W8LA 4UQBA 1UR9A 3VM7A 1DWIM 4P8WA 1VFUA 3VINA 1IZJA 4UFMA 1UD2A 2BVTA 3OZOA 1QW8A 3ARWA 1KFWA 1VBUA 2OWXA 1G5AA 2CEQA 4F66A 3L4YA 1CEOA 2D24A 1EIBA 5CLTA 4XZWA 2VT0A 3AMGA 3BMWA 1W9UA 4EAMA 2XVNA 5HDRA 1EXPA 1QHOA 3CMGA 2YDSA 1LG1A 1LL6A 4KGJA 1B31A 3ZM8A 4N42A 1K9DA 2DSVA 1KWGA 1U2YA 1W9PA 2YA1A 5BCAA 3CTTA 1BG9A 2XIIA 2XM2A 4MAZA 1H0GA 5CGTA 4UQAA 4NRSA 2WSKA 2CITA 7CGTA 3M6DA 3NSMA 1BLIA 3SCRA 2CHNA 1E0WA 4CVWA 4HOZA 4MPKA 3ARRA 3GXDA 4Z2KA 3POCA 4H8VA 1MFUA 4WLCA 4J27A 3PHAA 1WDSA 4AXNA 2Y24A 4BQ5A 2J7EA 2EXOA 1UQZA 3CHDA 5IFTA 2GVYA 1HJWA 4JFTA 2XFYA 2FH6A 1FHDA 3UG4A 3NUKA 1HKMA 5A6MA 1W3LA 1HJQA 4PUDA 3UEQA 4R27A 4DWSC 4CU7A 4QLJA 1UKTA 2G3IA 1E55A 3M7SA 4HP5A 3VIFA 1C3FA 1GONA 1JF6A 4CU8A 3S6TA 1CXFA 2VZSA 4PTMA 2J62A 3ARTA 3WNLA 1CPUA 3AS2A 2X0YA 1E72M 1JI1A 1BTCA 3AXIA 1OT1A 3CZLA 2YLLA 1PAMA 4S3JA 2AMGA 2UY2A 3RJXA 4CD8A 1K9EA 3MV11 2EPMX 4AZHA 3CGTA 2YL6A 1ECEA 3BAXA 2WVUA 3U7VA 2E9MA 2TAAA 3BAIA 3GDBA 1MQRA 1ODUA 2QPUA 2YL9A 4E8CA 1XYZA 4DWSD 4AEEA 4ATDA 3BC9A 4PSRA 1FHLA 1XD0A 1J0YA 1JXJA 3DYPA 4GPNA 2WMGA 4W87A 3AOFA 1QI3A 3AYSA 1M7XA 2WHKA 7A3HA 2DSKA 2Y5EA 3ARYA 1DHKA 3QOMA 1DWFM 1FP9A 1B9ZA 4X0NA 5A8PA 5DT5A 1IZKA 1TR1A 3MO4A 4GO9A 2BY1A 4BQ3A 2XVKA 1UWIA 4UFLA 1BYDA 3ARSA 3AISA 2DSWA 2Y2WA 4C91A 2A3AA 5IXEA 1WB0A 2XYLA 3LPOA 1KXTA 3WNOA 2WPGA 4M8UA 5D9OA 3WUBA 5I24A 2JE8A 1MWOA 1B3WA 2PBGA 2XIBA 1D3CA 1R87A 1HKKA 2CBVA 3WY1A 1JDAA 4JHOA 3PZVA 3T2PA 1V3MA 3N18A 1NWSA 1XH0A 3W81A 4PMOA 5I5RA 4ZXLA 1HT6A 3VDHA 1O6IA 4S3KA 4E4PA 4KRTA 6A3HA 1HVXA 3GNOA 1R86A 5I77A 3QHMA 1E73M 2ZWZA 5DFAA 5AC5A 5I79A 2BY3A 2XSBA 2WNWA 3THCA 1H5VA 2CNCA 3WF2A 2PWEA 4AZIA 3AI0A 4D71A 2PC8A 3T09A 4UZSA 2YL5A 3OLGA 1HJXA 3AMLA 1KXVA 3BAYA 3VD3A 1QI4A 2VRJA 2XG9A 3GTNA 3SCSA 3VNYA 5A6BA 5D9MA 3TOPA 4AIUA 3ZSTA 2QLYA 1CLXA 3GH7A 2J77A 1UQYA 5GNZA 1NWUA 3PZTA 2J7BA 4CKQA 1R7OA 2VCBA 3DC0A 4LPCA 2ZUTA 4D6DA 4PMDA 1HX0A 3VIIA 3MUZ1 1CECA 2D3NA 1JYVA 4H8UA 1XYFA 1J0HA 5HBFA 2J79A 4X0VA 3VD5A 1J0KA 1DTUA 1WKYA 1V0LA 2X8RA 4X9YA 2WWCA 4FLOA 1ZU8A 3EYPA 2EPLX 3TP4A 1US3A 2VX5A 2F8QA 3HMCA 1E1EA 5M03A 3KE0A 4WKHA 3WNPA 4W7UA 1HIZA 3MSDA 1VB9A 2VQUA 5GQBA 3RO8A 2BFGA 5EBAA 1ITCA 1I1WA 1KGWA 2OSWA 2E9BA 2GUYA 2HISA 5A8MA 2WZEA 1UR1A 1J9YA 4TTGA 3EMZA 4PMQA 5A2CA 2WC7A 2WK2A 1UH4A 3K8LA 4AMCA 1XC6A 2ZWYA 4W89A 3MANA 4CUCA 1UWUA 3AIWA 4ZFMA 3VILA 2YIHA 4WK9A 4B15A 4C7GA 2E40A 2FDMA 1M03A 1V03A 4CCDA 4XZBA 4Q7NA 4KRUA 5EB8A 3FAWA 2BXZA 3I3DA 4GZIA 3NIYA 2VX6A 4AISA 4V27A 1V6VA 2X2YA 5EFDA 1F4AA 1HL9A 1S46A 3AXHA 5CPTA 1HF6A 4WSJA 4AZBA 5D9PA 2CIPA 3OGRA 4CD7A 4ZE4A 5JBEA 5JBFA 4Z2IA 1ISVA 4MJ2A 3SIMA 2OYKA 1WAWA 4AD2A 5E09A 5D8WA 3EDJA 3ARZA 3FN9A 3CO4A 5CSYA 4FLRA 2GJPA 4MDPA 3SCTA 1DEDA 3O9NA 1LF1A 1TUXA 3EMQA 4W93A 3ECQA 3UG3A 3AZSA 4Q22A 5LA2A 5C71A 2XUCA 4MNMA 1UZ1A 1VRXA 1QNQA 2C7FA 2VUYA 3N12A 4B9ZA 6CGTA 3AICA 1BHGA 1OCQA 1JFHA 3AHTA 3GXMA 2E3ZA 1UG6A 5D4YA 1BQCA 2VNCA 1QHPA 2GDUA 1E6PA 1W1YA 1E43A 1UKQA 4OBRA 1D2KA 2VZUA 1E4IA 1CENA 2ZX8A 3NDZA 1C8QA 4GI9A 4PSPA 2GJXA 2EPKX 4HA3A 1N82A 1H0IA 3ARUA 4GZEA 4J3WA 4BCEA 2PF0A 4D6HA 2YA0A 3W28A 4HPHA 5A8QA 1HNYA 2DT1A 4JCMA 5GNYA 5I6SA 3CPUA 1E6XM 1B0IA 5BXTA 1UD8A 1OGGA 2ZIDA 1JF5A 1IT0A 1NH6A 1KXQA 4FLSA 4AZCA 1ZBCA 1ITXA 3VPLA 4HMEA 3A4XA 4WKFA 5A6JA 4JL2A 1V6UA 3VDBA 5A2AA 2G41A 1VJSA 4UOJA 1QW9A 1W1TA 3PBGA 1WCGA 2ZUUA 4AW7A 1J12A 1GJWA 3PN8A 5FIPA 1FFRA 4HMDA 4CD6A 1E3ZA 1H09A 4UNIA 4IISA 4UFJA 3W27A 3WNMA 3AIQA 3WDHA 2QHAA 5F7UA 4WKAA 2MANA 1GVYA 2VTFA 4PMUA 2OWCA 2CBIA 2YBUA 3J7HA 4C7FA 4AZ5A 8CGTA 2DT0A 1XH1A 3CHFA 1US2A 3EDDA 1GOIA 1NWTA 4OIFA 4JHZA 3K46A 4D6FA 2GDVA 4P7LA 1EHAA 3T2QA 1DWJM 1OM0A 4M82A 4GXPA 1PZ3A 4LYPA 4OKDA 1CTNA 3EMCA 1ZJAA 2J7DA 3O2LA 1QBAA 1CXIA 4HOWA 3POHA 3ZJ8A 1ZL1A 1HKIA 1Y7VA 2QMKA 4P7NA 2XSAA 1FOBA 2EBNA 3HU7A 1E56A 1VFMA 2DT2A 3A4WA 3WUFA 1YHTA 1WZMA 2E0PA 1MYRA 3II1A 1TA3B 3CUHA 3IJ8A 3AIRA 1QNOA 3L4TA 2WXDM 2ZX6A 2NT1A 4UQCA 4JFUA 3OIHA 1NARA 4KMQA 4HU0A 2W5FA 3N15A 3VO0A 2XGBA 3T08A 3UETA 1XD1A 4AC1X 4D72A 4HZ7A 1W91A 1I1XA 1SYTA 5A8NA 4WSKA 1FFQA 3SCWA 4L4OA 5FD0A 3UR7A 2CETA 2WCAA 4JL1A 2BNJA 4QAWA 3WUEA 1J18A 5D8ZA 3AIVA 2ZUNA 1GOQA 4TVUA 2WVTA 4PCSA 2X09A 3VVGA 1C8XA 3QOKA 4W88A 1PEZA 2CBUA 4W5UA 2XJ7A 2VI0A 2GSJA 2WMHA 3WD0A 3W37A 2A3CA 3G6MA 1EOMA 1FP8A 1CLVA 3SUTA 1BYBA 4MADA 4P8XA 1UD4A 1UWTA 3CZEA 3RMEA 2GJRA 3VDAA 5BXPA 4HZ8A 1G01A 1E4NA 2W4XA 5E6ZA 2A3BA 4MAVA 5CXPA 2YLAA 2W91A 1JZ5A 8A3HA 3RCNA 3EDKA 4LYQA 1FH7A 3VD4A 2DGAA 3W82A 5A6BD 1LQ0A 3WEMA 1UD6A 1V3IA 1A47A 2CYGA 1X6NA 3TTYA 1KQZA 1OD0A 4OOZA 1HN1A 4CVUA 3G6LA 3WH6A 2PB1A 3PZ9A 2JIWA 1TVPA 4UFHA 2WLZA 1M04A 1W9XA 2YJQA 2WZIA 5C70A 1VEMA 3AMDA 3OLDA 3SCNA 1ZBVA 4PN2A 4U3AA 2D3LA 3PTMA 2J25A 3A6OA 2BS9A 3BSGA 5HPCA 3GBEA 1EA9C 1EO7A 5D9NA 3L4XA 4UR9A 3NCOA 2WCGA 1PZ2A 1KXHA 4EE9A 1CXLA 2OLHA 1EHNA 2VQTA 3RDKA 2CXGA 5EFFA 1CGWA 3RM8A 1PX8A 4ZXOA 4MB1A 1SMAA 1EDTA 5I2UA 5I3DA 1OINA 4M1RA 3AHYA 1PJ9A 1VJZA 1UKSA 4AD0A 2VX4A 1UD3A 4AY1A 1V02E 3CUJA 4DM2A 4JZ5A 4W86A 1AMYA 1WDQA 2V3FA 4M24A 4PMNA 4BZYA 1HJSA 6TAAA 5KZ6A 3FY1A 1CNVA 1BSIA 4YPJA 1GOOA 1XH2A 3UR8A 1HXJA 3ZQ9A 3WF0A 3T2OA 4PMYA 4M29A 4D6EA 1E71M 1W9VA 1L8NA 1I75A 3AJ7A 5CG0A 3WIJA 1XSJA 3N9KA 5FCZA 4A4AA 2WMIA 4UCFA 2DIJA 1C92A 5A6KA 2J8GA 2ZUWA 2JF6A 1ODZA 5I0DA 1U33A 3VIOA 1DWHM 4UOZA 2ZUVA 1ISXA 5TD4A 2X0HA 3WUGA 2ZXAA 2XVGA 3IANA 1WDPA 1SR0A 4GQQA 1VEPA 1Q4NX 3CBWA 3NJ3A 5CPSA 1UUQA 3AZTA 1G1YA 3GH5A 1G94A 1CXHA 2WMFA 3VX0A 3T0DA 4D6JA 2CCRA 3VX1A 1Q6EA 3AS0A 1X6LA 3B9AA 3PZUA 2XM1A 3WDJA 2BY0A 4PTWA 4Z2JA 3ALFA 5DT7A 4P8VA 1JZ6A 2ZX5A 1JDDA 3VUPA 1V3HA 2XWEA 1PIGA 1B3VA 4PTVA 4TTUA 4ATLA 5A2BA 2Y4SA 3WD2A 2YL8A 4YHEA 5ABFA 5CGMA 3PTKA 1QNPA 5E9AA 5IHRA 2XFFA 3GXIA 2WMIB 1OBAA 4EK7A 3RIKA 4ACZB 1E6QM 2BHZA 3WEOA 4UTFA 3ARPA 1CDGA 2QPSA 4RE2A 5FKYA 3MMUA 3ARVA 1JIBA 4PMVA 4F8XA 3BH4A 4H2CA 4D1JA 3AMKA 4MJ4A 2W92A 5AY7A 4JFWA 3LPGA 1GQIA 1W9DM 4W7WA 2DH3A 1XGZA 1H2JA 4GI6A 4JFVA 3VGDA 2OSYA 3VMOA 4ATWA 3W53A 3BXWA 3IJ9A 5GPRA 1KGXA 1VFOA 4FMVA 4AD3A 1JGIA 1BF2A 1ZS2A 4MB3A 3WDPP 4Z2LA 2BHYA 3WH7A 3SCOA 4TOQA 4AEFA 1DWAM 2WC4A 3N1AA 3W25A 3MKKA 4TX6A 5JIPA 4Z2GA 5ABFB 2FGLA 1MW3A 2VRQA 3I3BA 1XV8A 1GW1A 1KWKA 2JFEX 4J7RA 1KGUA 1W2PA 1J11A 4XUYA 3EDFA 4AZ7A 3PZNA 1PBGA 3W0KA 1VEOA 2JALA 2C0HA 4QCFA 3WD1A 1W3JA 3BMVA 3N11A 4U5IA 2JF7A 1H4PA 3SCQA 4AIOA 1RP8A 3QHOA 3ZJ7A 3AIBA 5AYBA 1MXDA 4ZENA 5DO8A 2EPNA 1MQQA 2J7GA 3CZ8A 2VURA 1EQPA 2WB5A 4WF7A 3AS3A 3WDRA 2YA2A 2X1IA 1UKPA 4AD4A 3VIGA 5CPQA 3VOCA 3MSGA 2WSPA 2ZX9A 5LYRA 3OBAA 2Q8XA 1CZ1A 3OGSA 1CYGA 2DDXA 2DEPA 1MXGA 3BLKA 1X1NA 4V28A 1CGUA 1K6AA 1BYCA 3SUVA 2WWDA 9CGTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WHJ A;  3DEC A;  3TTS A;  1QI2 A;  1IV8 A;  3PZQ A;  2GJX B;  2WHL A;  3WNN A;  3SUU A;  3BSH A;  1NOU A;  4V2X A;  4HPG A;  3WH8 A;  2A3H A;  1UR2 A;  2BV9 A;  4JIE A;  4MTV A;  3BGA A;  1WDR A;  4GIN A;  1C7S A;  3FXY A;  3QR3 A;  1UWS A;  3WF1 A;  3WQ8 A;  1LLO A;  2VCC A;  3WDQ A;  2FHF A;  1LWH A;  4YN5 A;  2FHC A;  3W29 A;  2VVS A;  3GNP A;  2IXU A;  1CXK A;  2FGZ A;  4AZC B;  1XRV A;  3L4W A;  5E0F A;  1UKO A;  1UWR A;  4B3L A;  1JZ8 A;  4BS0 A;  2J7C A;  1SMD A;  2D0F A;  1W2V A;  3GH4 A;  3K8K A;  1QI0 A;  2WMJ A;  3WNK A;  2OSX A;  4J3S A;  3ZR5 A;  1BPL B;  2VO5 A;  1GHS A;  3MMW A;  1V0M A;  3VGF A;  1J0J A;  1V6Y A;  3BAK A;  1C8Y A;  1NQ6 A;  4NF7 A;  1E15 A;  3UG5 A;  1TMQ A;  5A8O A;  3WKZ A;  3OZP A;  1C7T A;  3MMD A;  1GCY A;  3TTO A;  3WFL A;  2ZUS A;  1H41 A;  2PWF A;  2CES A;  3N04 A;  4E8D A;  2FHB A;  1B2Y A;  5DMY A;  3OGV A;  1V6X A;  2VL4 A;  3BAW A;  3HN3 A;  3IAQ A;  2F61 A;  1QI5 A;  3WFZ A;  3ZOA A;  4W8L A;  4UQB A;  1UR9 A;  3VM7 A;  1DWI M;  4P8W A;  1VFU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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