3SUWA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with nhac-cas
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
molecule tags Hydrolase
source organism Paenibacillus
total genus 193
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suwA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suwA02
1MW0A 5E6ZA 3ZJKA 1C93A 3MUIA 3TTQA 1OM0A 1MW3A 5A8MA 2VVNA 1K9EA 3CPUA 3VIGA 2VCAA 3MUAA 4AY1A 1BHGA 2OWWA 4UQAA 2NT1A 4PBGA 4CKQA 5IFTA 3L4ZA 2XSAA 3WMBA 2PB1A 3MU7A 3VMPA 1TG7A 1JYNA 3WD4A 3WQ5A 1QHOA 4PMDA 4WKFA 4D6CA 1JD7A 2V38A 4CU7A 3ARWA 4GI9A 4JL1A 4TX6A 1AQ0A 3L4VA 3MUZ1 2XYLA 3CUGA 7TAAA 1E5JA 5M3WA 1MQPA 2WHJA 1V3MA 1JFXA 2X1IA 1E4MM 2WMIA 2WZHA 4V2XA 4ATWA 4AEEA 3GDBA 3VD5A 2UWFA 1V6XA 3AMDA 1B3WA 3BAIA 3RDKA 1J0JA 5I6SA 3VMOA 5CJ5A 4OOUA 1CGYA 3W6MA 3BXWA 3ZM8A 1R7AA 3VM7A 1UZ1A 1VEMA 1HJWA 5BWFA 1ITXA 4NZCA 1CLVA 1PAMA 5CZKA 3LPPA 2VRJA 4HOZA 1JF5A 2IXUA 1OBAA 4HA1A 4XX6A 2BHYA 2ZICA 1HKKA 2IUZA 4OUEA 5I0DA 4LGXA 5FIPA 4E8CA 5AY7A 3TONA 5HOSA 1HKMA 1JG9A 4AZIA 1LWJA 3SCPA 4AD0A 4PUEA 2ZUVA 1KXTA 3TTOA 5EMYA 2J7EA 2OWXA 4DM2A 4QCFA 4Z2LA 3W27A 3EYPA 4UZUA 2JF7A 4HZ7A 2PF0A 5FOOA 5A8OA 2WHKA 4MTVA 2WM0A 4CD5A 1Q6FA 2UY3A 1E5NA 5DT5A 2E0PA 1W2VA 2QLYA 1E1FA 4TX8A 2VX5A 2UY5A 2ZUNA 4OBSA 4C7DA 1C8YA 5HNNA 3SCVA 2VQTA 3N04A 2VJXA 4ACYA 1XSKA 3F5KA 1PEZA 2D24A 4DM1A 2DT2A 1XRVA 3SCOA 3SCSA 3IK2A 1B3XA 4GO9A 1BSIA 1UA7A 2F8QA 4A4AA 5GNYA 3KL3A 5IXEA 3WELA 1UR0A 1OCQA 1C7TA 1V0MA 1HL8A 3L4WA 1GJUA 1QNQA 3W28A 2J79A 3UR8A 1E40A 5CPSA 3PHAA 2ZXAA 4H04A 4BS0A 1XH1A 5KZ6A 1CIUA 4J3XA 1VIWA 1WPCA 3ZO9A 1U30A 1EDGA 1NOWA 3VD7A 3ARPA 4V28A 1KQYA 2CITA 5HDRA 1BGGA 1XV8A 1V3LA 3ZT7A 4F9JA 2WCSA 1JXJA 1E3XA 1KBBA 3AHVA 1JDAA 4S3JA 4UOZA 4HMCA 3VDCA 1OT1A 3QR3A 4CN6A 1E9LA 2G8ZA 5JBEA 4W8AA 3HN3A 3WIJA 4H8VA 1BGAA 2JIWA 3OGRA 4KGLA 1KGWA 1W3JA 2BVTA 3WNLA 4UOJA 1OD8A 1V08A 2WC7A 1IZKA 4W7WA 2CIPA 3F5LA 4CGTA 3WY1A 2X0YA 2CYGA 4JKMA 5E70A 1XD1A 2GK1B 3CUFA 4UQ9A 2XWEA 4GXPA 3SEPA 3HU7A 2W5FA 3GZAA 3FN9A 1H41A 2WAGA 1XCWA 4PRWA 3VU2A 5EFDA 4AD2A 3VUPA 4HU8A 5IDIA 3MUY1 3OLEA 3OG2A 4W5UA 4JKKA 1KR0A 2D0GA 2DQXA 1EDTA 2XFRA 4D6HA 4IUGA 3ALGA 5DFAA 3VGHA 5LA2A 4PTVA 1ZL1A 2DIEA 1KWGA 3EDFA 3WEZA 3AICA 4HA3A 2MANA 3WNOA 1GNXA 3N18A 5I2UA 3W82A 4BZYA 1W3HA 3WNMA 3T0AA 3PBGA 2EPLX 4W5ZA 3UEQA 3DC0A 2BV9A 2PBGA 2QMKA 2DSKA 3WEMA 3NUKA 1TR1A 4FF5A 3F4VA 3AZRA 3AXHA 1Q6GA 3VMNA 1JL8A 2D0HA 1J11A 5BRQA 2VX7A 4JHZA 3OGVA 1KGUA 3UERA 1TA3B 1NM9A 2BY3A 4GPNA 3U57A 4UQBA 3IANA 4U5IA 4W85A 2D22A 2ZXDA 2YL6A 3LMYA 1F4HA 3BCFA 1CXKA 1A47A 2Z1SA 8CGTA 2E8YA 1RPKA 1SMAA 1MYRA 1UD2A 1WAWA 1RP9A 4XZWA 4PEEA 1EQCA 2PWHA 2C7FA 1PIGA 3M07A 4UQCA 1ECEA 1H49A 2VTFA 2DT0A 3CZJA 4D71A 3W81A 4AD1A 2BHUA 1OWQA 3THDA 4FK9A 1VRXA 2G3JA 2DT1A 5D4YA 1UWTA 2XUCA 3AXIA 5ABFB 3PTQA 3N17A 4QAWA 1WE5A 1UR2A 1BG9A 1V6YA 2DH2A 3DHPA 1W9UA 1VB9A 1W9DM 3VD9A 2E3ZA 4KGJA 4PMZA 3AHYA 3BH4A 3N9KA 3QOKA 3VX0A 1KQZA 4TVCA 3NDZA 1R8LA 4P8XA 4QCEA 4W93A 4GQQA 1AVAA 4MDOA 3VGEA 3BSGA 4Q7NA 1JZ5A 3PZOA 1UZ4A 2YBUA 1IV8A 1WZMA 2A3EA 1PX3A 5GQBA 1HT6A 4JFTA 4J27A 1CGWA 1CTNA 4H8UA 1V0NA 3VNYA 3CH9A 3NSMA 3J7HA 3AISA 1E6ZA 4FLOA 3T08A 4A3YA 3KZSA 5A95A 1VF8A 1QI5A 3TA9A 5FKYA 3NDYA 3BLKA 3VKKA 2ZXBA 3SCRA 2VCCA 4HOXA 1NWRA 4WKHA 1ITCA 2JIEA 4GQRA 3EMZA 3N1AA 5DF0A 3WDHA 3VINA 2D3LA 3VO0A 4CD4A 4H41A 4QDMA 1H0GA 1QI4A 1US2A 2VO5A 1UR1A 4HMDA 1G0CA 1GPFA 4RE3A 1VFFA 2G3MA 4DWSC 3CZKA 1OIMA 3PN8A 3JUGA 2CPUA 2G3IA 3AFBA 4TVUA 3II1A 2WMHA 2W92A 4CUCA 1WZKA 1G1YA 1WDRA 1LF1A 4J28A 2EEXA 4ZENA 1JF6A 2WVUA 1M04A 2WK2A 1FP8A 2O9RA 5E0CA 3CO4A 2CKSA 2QV4A 1UR8A 3AIVA 1HN1A 6TAAA 2CERA 1UH4A 1WB0A 4MNLA 3VNZA 1QNRA 3W53A 1W1TA 2A3BA 3CHFA 3MMDA 2X8RA 4LX4A 1V03A 1QI3A 4E4PA 1PIFA 2W66A 1OB0A 5CGMA 3D5HA 3T2PA 2E8ZA 4FMVA 1KB3A 3AJ7A 2GJXA 2GDVA 2VX6A 4JIEA 2J8GA 2VZTA 3EDEA 1CGUA 3A4WA 5HBFA 1VFUA 5A6LA 3QHMA 1TVNA 2D23A 3W25A 1X6LA 1UWSA 5GPRA 4OJYA 4U2ZA 3WD3A 2YBTA 1X6NA 4QFUA 3T0DA 3O6AA 2XFFA 1EDQA 1KXVA 1P6WA 1Q6CA 1TE1A 3EMQA 1BAGA 2AMGA 1CLXA 3FAWA 4M1RA 1NWTA 3BAXA 1ODZA 4B15A 8A3HA 5D9PA 4Z2KA 2Y2WA 5ABHA 1SYTA 2O9OA 3CZGA 3NSXA 4AZGA 2EPMX 2XVPA 2GJRA 3OBAA 1U2YA 1EO5A 4N42A 3FHAA 4YHGA 2QPUA 1HJXA 4X0VA 2J25A 4PMNA 3ARXA 1HJQA 1C8XA 2HVMA 4A3HA 1JNEA 1XSIA 2ZIDA 5CGTA 5I78A 1V6VA 3AZTA 1FH7A 2YA1A 1JYXA 4P8UA 3MSDA 2VUYA 2E4TA 5I5RA 1ZJBA 1HXJA 4AZ5A 2CXGA 4NF7A 4M56A 3U5UA 1W3LA 1MXGA 5A8NA 1E6SM 4XUYA 5A8QA 3BAWA 2YLLA 4FLSA 3EDJA 2OSXA 3VOCA 5M03A 1FH8A 4ATLA 3SCQA 2VC9A 1DHKA 1CXHA 3MS8A 1M7XA 2D20A 3WNKA 4IPLA 1B90A 1VEPA 1J12A 2JE8A 2J7DA 3MV01 3ZT6A 4D6IA 4K68A 4X9YA 2GFTA 2VT0A 2WHMA 5A3HA 2FHBA 3BMVA 5A2BA 4M80A 1R86A 1ISVA 5A6JA 4MJ2A 3WD1A 3AIEA 1CXIA 1V6UA 3AYRA 4P7NA 1I1WA 4EE9A 1VENA 3WDJA 3WH7A 1NH6A 3M7SA 5GNXA 1C90A 1VJSA 2CBVA 3AROA 3CTTA 2XTKA 1W91A 2OSWA 4W87A 2GSJA 1E6NA 3PZIA 1V0KA 2W63A 4ML4A 2CHNA 3SIMA 1E72M 1D7FA 4URIA 4RE4A 1E43A 3ARUA 5BXRA 3VIIA 5A2AA 3UG3A 2UY2A 1L8NA 3MMUA 1UD6A 2WWCA 1PBGA 1XSJA 4YPJA 3AHZA 4F9DA 2RGMA 4F79A 2E9BA 2FH6A 1R85A 2WYSA 1E6QM 2D1ZA 3ZR6A 1UYQA 1B30A 2E40A 5I23A 3BAKA 2UY4A 2RGLA 3WDRA 1E4LA 2WMJA 3AIRA 4D6JA 2VI0A 3HJEA 4UFLA 2VZOA 1DEDA 1H09A 1NOFA 3WQ6A 1CEOA 1GQJA 1XCXA 4CVUA 2QMJA 2W62A 1W3KA 3AIQA 2YJQA 4WK9A 4J3SA 1GOKA 2G4FA 2CETA 4LXFA 4PUDA 2F2HA 4Z2IA 5C70A 2WC4A 4GZJA 4PMVA 1W1PA 5D9OA 4D6DA 2ZUTA 4UR9A 3UETA 1J0HA 4MAVA 3K1DA 1QHZA 4WSJA 4FLRA 3MANA 4C91A 2J74A 4BQ2A 3CZEA 4Z2GA 1GQLA 1UD4A 3WFLA 1QNPA 1E0XA 1GORA 1WKYA 1UHVA 2J77A 1M03A 1MQRA 3WF2A 4OIFA 4QLLA 4TOQA 1EHAA 2XM2A 5IHRA 5D8ZA 5A94A 2BS9A 5C71A 2PWDA 3CHCA 4ZXOA 2GDUA 3VIOA 1Q6EA 3T2OA 3KWXA 3ZR5A 4PYSA 3PZMA 4B3KA 1QBBA 2YKKA 2FH8A 1EOKA 4GINA 2WB5A 2BVDA 3AZSA 3A3HA 1OGGA 1C8QA 3VILA 1BG4A 1OGSA 3APGA 1KBKA 3U5YA 1HVQA 2CESA 4W8BA 1WDPA 2D2OA 3LPFA 5CSUA 3ARQA 1H11A 3AQUA 1BFNA 3B9DA 4JFSA 4WIWA 3BLPX 2C0HA 4Z2JA 1UKTA 3AIBA 1V3KA 1E71M 1Q6DA 1M53A 3WH5A 3CMGA 4D6GA 2ZX5A 2DH3A 4D6FA 3GH7A 4JZ5A 4PMOA 1FHLA 1X1NA 3NYDA 3T2QA 1V3IA 1JZ8A 3ZMRA 4B9YA 1RP8A 4HU0A 1CXFA 2CCRA 4GIAA 1BYCA 1TMQA 4RE2A 3VGGA 3FNDA 2WCAA 1KR1A 2XVLA 4MJ4A 4DUXA 1W1VA 2WLZA 2DSVA 3ZSTA 3VVGA 1KCLA 4D6EA 1EQPA 4PMQA 1JGIA 4DUWA 3CUJA 4ZFMA 1ISXA 1CGVA 2WZEA 3K4AA 1W1YA 4WKAA 1GCYA 3S6TA 4HOWA 2CNCA 2ESCA 3WDIA 1G5AA 1UR9A 1JIBA 2X0HA 3VIPA 3K46A 3VIMA 1K9TA 2VCBA 2WVTA 1W32A 2WHLA 4OBRA 4RL3A 3RO8A 3RPMA 1E0WA 1JDDA 1EOMA 4AYSA 3PTMA 2VURA 9CGTA 5JBDA 1ISWA 1J0YA 3MO4A 2F61A 1OT2A 1KXHA 3IJ7A 2YLAA 3U7VA 1QPKA 2BFGA 1EGZA 1GHSA 3SUSA 2V3EA 4PTMA 2W4XA 1L0PA 1ZBVA 1ZJAA 3CUIA 5CG0A 4MNJA 4LYPA 3GNOA 1R7OA 1FOBA 1A3HA 1C92A 1UKPA 3L4TA 3ZIZA 4JAWA 1DWAM 4LQ1A 1FP9A 3RM8A 1NP2A 2NSXA 2ZX9A 4NRSA 1HJSA 1HVXA 4J3WA 4MADA 1CXEA 3CLWA 3POCA 2W67A 1GUVA 2ZX8A 2OWCA 3VDHA 3W38A 5A2CA 2XIIA 1BYDA 1J01A 5AYBA 4TTUA 1W9VA 1OSEA 2DSUA 4BQ3A 1LLOA 2J75A 2OSYA 4JKLA 4PCSA 5FL1A 3PZ9A 4HA4A 1J10A 3PTKA 1UUQA 4P8WA 2BHZA 4JFVA 3CMJA 3CHEA 3GH4A 3WMSA 3GXDA 1UKSA 2A3HA 3ECQA 1J0ZA 2FGZA 2WMIB 4AMCA 1JZ2A 1I1XA 3AXXA 2WKGA 4OZOA 2BXYA 1LG1A 1V3JA 1J0IA 1Z32X 3L2MA 1H2JA 5JIWA 4UFJA 4AZ7A 1FHDA 1E4IA 2PBOA 4GZIA 3AS1A 1GW1A 3N13A 3UG5A 2WCGA 1E73M 1MQQA 3AMLA 1ZS2A 3WDQA 1UD8A 2BY0A 3WN6A 3WDPP 2VMFA 1BQCA 3WQWA 4PMUA 2ZUMA 1BTCA 2Y5EA 5DEZA 3FY1A 4PTXA 1GHRA 2TAAA 2DSWA 3O9NA 1B3ZA 4YN5A 4CD7A 3GM8A 3EBVA 1JYVA 5E0FA 1B2YA 5ECUA 3PZNA 4W86A 4U31A 5JIPA 1PPIA 3ARVA 4ZE5A 2CHOA 2J62A 3UR7A 4C90A 3NIYA 2WWDA 3GH5A 4AWEA 4AISA 5C8BB 2J7CA 1MVYA 1KGXA 2HISA 2WMGA 4W84A 4WJXA 1DWIM 4KRTA 5IHSA 2VZVA 1QW8A 3QOMA 5BXTA 4CCCA 2JEQA 1AQHA 1CBGA 4LPCA 4GI8A 3GYCA 4F66A 1VBRA 5GNZA 1ZU8A 3L4YA 5BXSA 4UFKA 1UQYA 1R87A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MW0 A;  5E6Z A;  3ZJK A;  1C93 A;  3MUI A;  3TTQ A;  1OM0 A;  1MW3 A;  5A8M A;  2VVN A;  1K9E A;  3CPU A;  3VIG A;  2VCA A;  3MUA A;  4AY1 A;  1BHG A;  2OWW A;  4UQA A;  2NT1 A;  4PBG A;  4CKQ A;  5IFT A;  3L4Z A;  2XSA A;  3WMB A;  2PB1 A;  3MU7 A;  3VMP A;  1TG7 A;  1JYN A;  3WD4 A;  3WQ5 A;  1QHO A;  4PMD A;  4WKF A;  4D6C A;  1JD7 A;  2V38 A;  4CU7 A;  3ARW A;  4GI9 A;  4JL1 A;  4TX6 A;  1AQ0 A;  3L4V A;  3MUZ 1;  2XYL A;  3CUG A;  7TAA A;  1E5J A;  5M3W A;  1MQP A;  2WHJ A;  1V3M A;  1JFX A;  2X1I A;  1E4M M;  2WMI A;  2WZH A;  4V2X A;  4ATW A;  4AEE A;  3GDB A;  3VD5 A;  2UWF A;  1V6X A;  3AMD A;  1B3W A;  3BAI A;  3RDK A;  1J0J A;  5I6S A;  3VMO A;  5CJ5 A;  4OOU A;  1CGY A;  3W6M A;  3BXW A;  3ZM8 A;  1R7A A;  3VM7 A;  1UZ1 A;  1VEM A;  1HJW A;  5BWF A;  1ITX A;  4NZC A;  1CLV A;  1PAM A;  5CZK A;  3LPP A;  2VRJ A;  4HOZ A;  1JF5 A;  2IXU A;  1OBA A;  4HA1 A;  4XX6 A;  2BHY A;  2ZIC A;  1HKK A;  2IUZ A;  4OUE A;  5I0D A;  4LGX A;  5FIP A;  4E8C A;  5AY7 A;  3TON A;  5HOS A;  1HKM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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