3SW6A

Crystal structure of methanothermobacter thermautotrophicus orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 5-fluoro-6-azido-ump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Methanothermobacter thermautotrophicus orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 5-fluoro-6-azido-UMP
rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3sw6A00
4DF1A 3R2GA 1XUUA 2H90A 2RDWA 5F4XA 1G4SA 3L2IA 2DZPA 4H4IA 3LRMA 1G67A 1P5BA 1TPEA 3MW7A 3RLVA 1ZNNA 4K8EA 3G0UA 2Z6IA 3DKLA 3P81A 1PV8A 3QMSA 2FIQA 3BG9A 3KOFA 4LS2A 5EA9A 1X1ZA 4L4MA 4LNYA 1Q3NA 3TDFA 3DHFA 1OJXA 1QPRA 3IVSA 2RFGA 3T55A 3MWAA 1I2RA 4E38A 4BF9A 4FO4A 4IOTA 5IBXC 3EWYA 3SIZA 4A22A 2C18A 1VCFA 4LV4A 5AYZA 3W1RA 3I7RA 4IMFA 4LC6A 4I7VA 5HQEA 3M5VA 5DELA 3GX9A 1UASA 1XBYA 3P62A 3CPRA 1SFJA 3QF0A 4YL2A 2CZDA 2ZZ4A 3S1UA 3GDLA 1VLWA 2QDGA 2YX0A 4UR8A 3TH6A 1OFAA 2ZCGA 3NZRA 4HNTA 3LCHA 4JEQA 1LRQA 3OA3A 2NLIA 3NPWA 3B8DA 3LBMA 1ZALA 3UWUA 5D38A 3CB8A 2Y7GA 4RZ4A 4CQ9A 2Y62A 4ORMA 1I2NA 4POCA 3STCA 5TIMA 1W56A 2IQTA 3DFSA 3NM3A 3L68A 4GUIA 3EX6A 1R2TA 4JTFA 4Z0SA 2ALDA 1IXNA 3W86A 3CWNA 3M5ZA 4IQLA 3NAVA 2DJXA 1RV8A 1TSIA 4NZFA 1THFD 4NJGA 3USBA 2FPTA 3GB6A 2V2DA 3W7LA 1LLZA 1VCGA 2QCHA 2Y88A 2PCQA 1QOPA 4DO5A 5H2ZA 4DXVA 1ME9A 4M6VA 3ZFHA 4ZQCA 4UCGA 1LOSA 2TRSA 4AF0B 3PBYA 2JGQA 4HNUA 5F1VA 3TCEA 3MUXA 3ZR4A 3ZWSA 4HSNA 1FDZA 1EUNA 5EPDA 3C0JA 2VEMA 1KM4A 3EXTA 1FUYA 3HGJA 3DBPA 1FCUA 2NUXA 3PR2A 1WDWA 3DFPA 3E02A 3NZ1A 1W3IA 4LVFA 1YPIA 3O6CA 4UTHA 3FFSA 3A24A 1AW5A 1KM5A 2A7PA 4K38A 3NXFA 2EAWA 2P10A 1SW0A 1YYAA 1FCVA 3LI0A 4R34A 4Z1AA 1VPXA 1YPFA 3MI2A 2ZRZA 4JY9A 3SJ3A 4K7VA 2BZNA 5LSMA 2WSQA 1ZENA 2AAMA 3ATYA 3FA5A 2WSRA 1XCFA 1EX5A 3EWWA 5EBUA 1FWRA 1R46A 4Y8FA 4WY0A 4RZ6A 2RKXA 3TKFA 5FF7A 1X1OA 3GR8A 3TX9A 3KVKA 1TRDA 3LCXA 3W2KA 2ZTJA 3EKZA 4FIRA 5FF4A 1XBXA 2QUUA 2A2IA 5DXXA 2V5LA 4N9EA 3C8FA 4UTJA 1GEQA 2FQIA 4HSOA 2E77A 4OQVA 2J88A 4UTTA 4RK8A 3SI9A 5HJLA 2VEIA 4AWSA 4UC5A 2GJNA 3W74A 2A5HA 3GYEA 1PS9A 2QCNA 1AL7A 3PF3A 1VR6A 4X2RA 1LM1A 3E12A 3PBUA 3JS3A 5G4EA 3NQEA 4U28A 3TU9A 2YCEA 4AHOA 3CIWA 4CQAA 4MFDA 2V8ZA 4UMBA 2QCMA 3UWQA 1LROA 5AHFA 3LLFA 4O0ZA 5D03A 2X2GA 1R2SA 3OVQA 3S1VA 1O5KA 1W5NA 4K39A 3N2XA 4NNBA 2RDTA 5D02A 3A23A 2ZQ0A 4O50A 4LY8A 3TE9A 1WV2A 4UTMA 1DV7A 1TMHA 5CPLA 1YXDA 1L6YA 3S8HA 2AGKA 1BEUA 1V5XA 3CU2A 1ZAJA 3VFLA 3LCLA 1KBJA 8TIMA 1YADA 1JCYA 4I7WA 4AHPA 1H50A 3QYQA 1GTEA 5AYXA 3O06A 4E2DA 4KWVA 3I7QA 5F1UA 1QNVA 3BARA 3MBFA 1GVRA 3OEXA 5LNRA 1H51A 1H61A 1ZJIA 1IIGA 3Q2DA 1OX5A 1GYLA 3QPYA 4GBUA 4UFKA 2Y63A 2WOQA 1M7PA 3G8EA 5FEWA 3G1AA 1W3TA 4RV8A 1KFJA 4IMEA 4JTKA 1VGAA 3THQA 3IVTA 4JIQA 3M41A 4LVAA 3PG9A 1VH7A 1LBLA 4GXMA 2H8XA 5HNRA 2PRLA 5F2GA 3S6DA 3A21A 4BWLA 4MIMA 3GXPA 3UZJA 1J5TA 4O53A 3IGSA 3PG8A 1B4KA 1VQTA 3GNDA 3OIXA 4J9JA 3LTSA 2GQ9A 4MJMA 3A22A 1OFPA 3N73A 4M6QA 5DXYA 3EWZA 5E1QA 2DZUA 3T78A 2H8ZA 3O8AA 4MZ1A 1B3OA 3U8GA 1JCJA 4RJEA 3NVTA 4HT3A 3L5AA 3V75A 1KFCA 3HOJA 2G97A 4O52A 4UFJA 2V9DA 3SZ8A 3W71A 2C13A 4OHQA 3VI2A 2C6QA 1FXPA 2E5BA 4O16A 4CCEA 1T99A 1K02A 5BMXA 4OWGA 2DU2A 4FNUA 2CLMA 5GVJA 4DEFA 5L9FA 2FFCA 2OT1A 4AH7A 2J9ZA 4S2BA 4CCDA 4D2JA 2EF9A 3A5VA 3F1QA 4N9DA 3TR2A 1G4TA 4ZQMA 3Q94A 1EP3A 1Q6OA 2FPVA 3ABRA 4GJ1A 4A2RA 3LTYA 1OG0A 3IEBA 5EKYA 2VFHA 4O15A 3VE7A 2LLEA 3FIGA 5EY5A 4WUIA 5C54A 4N6EA 2GVGA 3GDRA 2V81A 4QQ3A 3HMJG 2YR1A 4EOUA 3PSVA 3G1DA 1D3HA 3LHVA 3L9CA 1VYRA 1UB3A 4UTWC 3TA6A 1H60A 5FF3A 1MEIA 1TPFA 3B06A 1XKYA 2A6NA 3A9IA 1HFBA 4X9SA 3G1XA 1D3GA 4JTGA 1W54A 5I3KA 2YXGA 1O94A 2KZHA 4ZQNA 4LU0A 5K3VA 2NXIA 4GC4A 4MY8A 5DBTA 3W1PA 1OYBA 3P8IA 5HWNA 4ZMGA 1VYPX 1OFBA 1YTEA 3GK0A 4ZVJA 4GE8A 1JQXA 3I7SA 3RU6A 2VOMA 5J5DA 5C55A 1FWWA 2Y61A 3DFOA 4LV9A 1KV8A 3G0SA 1OK4A 2EHHA 5LGXA 1RPXA 2WKJA 5CSRA 4R33A 3NL2A 2OMAA 3EX3A 1OFQA 1EIXA 3C2OA 3LGEA 2ZA3A 3W7QA 2YFNA 4PFMA 3L21A 2DZTA 1UUMA 3W1TA 1KBIA 3HG3A 3LV5A 1SPQA 3UQNA 3VCRA 1IXOA 3P74A 4BI7A 1DVJA 2TMDA 3TIMA 5BW6A 3UNDA 2FJKA 4XZ9A 3W2LA 1OFDA 2YW3A 1TTJA 5AN7A 3TW7A 3C2FA 2P1FA 3P84A 5E93A 1S5VA 3LM7A 3M43A 2TSYA 2HSAA 1PCWA 2YFOA 1DJNA 3MI3A 5G2HA 5MHBA 5KSWA 4N9CA 3W22A 1RR2A 4KFOA 4DO6A 3TROA 1H7RA 3PB0A 1OF8A 1H7PA 3MJYA 4C1KA 2FDSA 1GTHA 4RLIA 1LLWA 2WSYA 5A5WA 1G4PA 3MBDA 4JTJA 4P61A 3RLUA 3EWBX 1QO2A 3TSMA 3KVLA 2NX3A 1FWTA 3QEZA 4XQ6A 5KZMA 1KTBA 3BW4A 3NQAA 3HB9A 5BRBA 5FF0A 2C19A 1H1ZA 1O60A 2G95A 3HPXA 5KTLA 2YZRA 4FF7A 1YDNA 3W7GA 4GWEA 4EF9A 3PVFA 1VCVA 3G24A 2QJIA 1TQXA 1KM6A 3LCWA 2GOUA 4IXXA 3E9AA 1LORA 3S1XA 3H55A 3KX6A 1TTQA 1IXQA 4M7SA 1RZMA 2QKFA 3UYCA 4JS3A 3S5OA 3O07A 4JYDA 3W76A 1RQHA 5KINA 5AB3A 4ORIA 5TQLA 1QPOA 3GVGA 3UZ5A 1GVSA 1QCWA 1SZGA 3C2RA 4JX4A 3NEVA 4LW7A 4JTLA 3MI6A 1CI1A 2B4GA 1TV5A 3ATZA 3HQ1A 5H91A 4IMGA 2QUVA 3W7DA 1K7EA 3M7WA 4AF0A 2ZRVA 1FDJA 2YYUA 1TTIA 3DU0A 3TSDA 4LS1A 2PE4A 2QCGA 2R8WA 2R91A 4EF8A 4KFNA 1KW1A 1B9BA 2DZSA 3OVRA 4ONVA 1BWLA 1ZFJA 2NXHA 3KRUA 3GNNA 4LTSA 5DCDA 1UBSA 1W5OA 4IPIA 1FWSA 3W2NA 1HUVA 4LVDA 2FLIA 3FYPA 5AYYA 3ELFA 1Y0EA 1VRDA 1C8VA 3W87A 3KRZA 3QM3A 4UFLA 3EB2A 2JBMA 4H3DA 3IIZA 1NSJA 4KFPA 3NQ2A 3TAOA 1JUBA 4G1KA 4B5NA 1SSDA 1WOBA 3M16A 5AC8A 3TNOA 4NXSA 5D2VA 4QISA 2A85A 1UJPA 4R7JA 3G3DA 5ABTA 2J27A 5T26A 1TJPA 3P7YA 4PL1A 3DI0A 5F2IA 3W6YA 1H62A 4DO4A 4PH6A 2E09A 4DF0A 5AOUA 3WJSA 1SR9A 4WXZA 4S2CA 3NQ8A 5FI8A 1OF6A 4QIUA 4Y6GA 3TMLA 4JYEA 2A7RA 3B0VC 1OX4B 4E2BA 4Q33A 2VENA 4CNPA 5KZEA 3BLIA 4WZHA 2DZWA 5F4SA 3GKFA 3TK7A 2ZZ7A 3T44A 2W79A 1DQXA 1GVQA 3DZ1A 4NJKA 1TQJA 2QDHA 1WXJA 5BMWA 3UY7A 4AAJA 5F2MA 3WJYA 4UTIA 3LHYA 3N19B 3HIJA 4GUGA 4CLMA 2WNNA 1R47A 4OU1A 3QW3A 5BOOA 1PVNA 3S9YA 3NQVA 3W7RA 5D2WA 3IIVA 1KFEA 2VFDA 2Y85A 4YCPA 5D04C 3TXZA 5D32A 1OYAA 3P82A 4FXRA 4XTIA 3WJXA 1JRCA 3NQ6A 4BR1A 2RH9A 3EWUA 4OT7A 4JDYA 1OVDA 1GWJA 2OT0A 1T8XA 3DENA 1FX6A 1Q6LA 3MP3A 3W7EA 4WXYA 1ZCOA 3GDTA 3LCIA 1TYGA 4JTIA 3EKLA 1QR7A 4RXGA 1OHLA 3IIOA 5HUPA 4N6FA 3EX4A 3I68A 3NQCA 4AWTA 3N9RA 2Q3OA 1SZEA 3LXCA 5G1YA 1JCXA 1H1YA 1OFEA 3HG5A 3RFAA 3GDKA 2Q8LA 3GXTA 4TR9A 1Z42A 3LRLA 3B0UX 3GDMA 4NNCA 3PBWA 5K9CA 1I4NA 2X1TA 4IXHA 1A5AA 4WOQA 2D73A 3BVJA 2ZRXA 5HULA 2VFIA 2PRMA 5AC7A 3S42A 1KM3A 2E6DA 4BK9A 3CQ0A 2ZA2A 1XDLA 3NR0A 5IM51 5I3JA 3OHIA 1VHCA 3LCGA 3BV4A 3QJAA 4LVBA 3N2MA 1GPWA 4Q32A 2QF7A 1XFBA 1M5WA 1W3NA 2VEKA 1SU5A 3S5ZA 2RDUA 2NWRA 4AEOA 3W70A 3PAJA 1CX9A 1SO4A 2ATMA 1KLYA 2B0MA 2GQAA 4UTTC 1FY6A 3QSRA 2AQWA 1LP6A 1FXQA 3SECA 4JTUA 4A29A 1GZGA 4C1LA 1ZY9A 4FNTA 4IMDA 3BW2A 1B57A 5J5RA 1XI3A 3BW3A 1YLVA 1A50A 1EWDA 4HIBA 2VFFA 3TQVA 1X7FA 2GJLA 3IIXA 3W75A 1H7XA 3BLEA 4WY0F 1X8FA 3W73A 3WFAA 2XN2A 3LHWA 5K4XA 2Y7FA 4YCOA 3ZWTA 2ZZ3A 4O17A 1JR1A 1O4UA 2VEPA 3G1FA 3TQ0A 1W8SA 1DBTA 3PBVA 4PA8A 4XKYB 1S5TA 1EPXA 4RR4A 4YLWA 3UD6A 3PC0A 1B4EA 1LTDA 4TO8A 4NJJA 3SGUA 4QNWA 1PHQA 3SGZA 3GZ3A 3KAOA 1QFEA 2H6RA 2A7NA 3ABOA 5DCBA 3WK3A 4FNRA 1TV8A 3FKKA 3NA8A 4HHPA 3O63A 4YXGA 3INPA 3MHGA 4M5PA 3VKJA 3C3NA 1ME8A 3HGOA 1JRBA 3UWVA 3BGJA 5HUOA 3W23A 1DKWA 3WK1A 2Z1BA 3MYPA 3W7PA 1SZNA 1SO6A 5I3GA 2E6FA 4RXFA 4BI6A 2V30A 2WO5A 1J4EA 1I2PA 3HG4A 1TPUA 1ME7A 3MYOA 1HG3A 3LLDA 4AB4A 1AK5A 1VZWA 2EGZA 3PY2A 3EX2A 3JRKA 3KFTA 2A1YA 5HR6A 1K7FA 2QCDB 4I7UA 1YDOA 4BWLC 3HF3A 4O11A 3M6YA 3F03K 4O28A 5EYWA 1TPC1 2Z0IA 3NNTA 2GPTA 1WQ5A 3NPUA 1JVNA 4Z08A 4UIOA 3TMQA 3KVJA 4LS0A 1JUKA 2C3ZA 4FHAA 2NUWA 4CNOA 2DP3A 2ZBTA 4NJIA 3A5FA 4MYAA 3MHUA 2B7PA 4O1BA 1ICSA 5D2YA 5D09A 5FESA 1DORA 1DHPA 3LXAA 1A5SA 4NUWA 3F4NA 1VJIA 2YDAA 5LGZA 2BX7A 4QJ1A 3NL5A 4TIMA 2QCCA 3V1PA 1VLIA 2CW6A 4MJZA 2ZZ2A 2ZZ6A 1RQBA 2V82A 1H5YA 1W1ZA 2GUUA 3W1LA 2NX1A 3HJZA 5D30A 5AFDA 4GUFA 4IUOA 3CEUA 5K2ZA 1OABA 1E51A 3LBCA 4XBKA 1EWEA 1ZAHA 3RK8A 4QM1A 1XC4A 1SSGA 2A21A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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