3T78A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis indole glycerol phosphate synthase (igps) in complex with 5-fluoroanthranilate
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
259
structure length
257
Chain Sequence
TVLDSILEGVRADVAAREASVSLSEIKAAAAAAPPPLDVMAALREPGIGVIAEVKRASPSAGALATIADPAKLAQAYQDGGARIVSVVTEQRRFQGSLDDLDAVRASVSIPVLRKDFVVQPYQIHEARAHGADMLLLIVAALEQSVLVSMLDRTESLGMTALVEVHTEQEADRALKAGAKVIGVNARDLMTLDRDCFARIAPGLPSSVIRIAESGVRGTADLLAYAGAGADAVLVGEGLVTSGDPRAAVADLVTAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Insights and Inhibition of Mycobacterium tuberculosis Indole Glycerol Phosphate Synthase (IGPS): an Essential Enzyme for Tryptophan Biosynthesis
rcsb
molecule keywords Indole-3-glycerol phosphate synthase
molecule tags Lyase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 97
structure length 257
sequence length 259
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3t78A00
3W1UA 5TBOA 2JGQA 3W73A 4UTKA 5F1VA 3A23A 3LX9A 2FFCA 3S8HA 1LTDA 1QPRA 4RKAA 4AEOA 2AQWA 3DENA 4CNNA 2PCQA 1A5BA 3PG9A 3MHGA 1VS1A 2OT1A 4FO4A 3P5ZA 1ZJIA 3P8JA 4K6AA 3LGEA 4UTMA 5IBXA 2CLIA 2DORA 2FPYA 2YXGA 3HGJA 4O1DA 1L2UA 4CNPA 4HPJA 2ZFAA 3WJYA 5DCBA 5HJLA 1KFEA 1RQBA 4O52A 4ML9A 3TSMA 4AWUA 4N2YA 1VCGA 1FDYA 1DV7A 1GVSA 4LS1A 3TW6A 2A0NA 2QCNA 3TUUA 1M7PA 5FEXA 4ZQMA 3G0SA 3FOKA 3B03A 3CWOX 3UWVA 2W6RA 2V0TA 3TH6A 1DJQA 5F4WA 3SI9A 2CLHA 1JCLA 1XKYA 1R47A 2NXIA 5F2LA 4ZQCA 2E6FA 3W7OA 2RHGA 3E49A 3RF9A 3SGZA 5LKYA 3HBLA 3GYEA 2ISSA 2B7NA 1KM5A 1PS9A 3Q37A 4UIOA 1GT8A 1VR6A 3GX9A 3SECA 3GR8A 3HGOA 3EWXA 3WK3A 3LCFA 3IGSA 2ZRXA 5GVJA 1GVRA 4ZQPA 1GTEA 2E6YA 3P61A 3C4UA 2V2CA 2OT0A 2ZA1A 2ABBA 3Q2DA 4N9DA 5AFDA 1RV8A 2DU2A 3IGXA 2TSYA 4BR1A 2XN2A 4RV8A 3W23A 4O17A 3CIXA 3GKFA 1VJIA 3PB2A 1T8XA 1YLVA 5KZEA 4I7WA 4AWSA 3TMLA 5EBUA 1W3IA 4X3ZA 2ALDA 2YSWA 1TTQA 1AL8A 3GLCA 3QM3A 3DAQA 1GOXA 1DORA 1FCVA 2NWRA 4R7JA 4ADTA 3LDVA 4UR7A 5KITA 2HS8A 1C29A 5AHFA 1DQXA 1KM0A 3EWUA 5EY5A 3B04A 4MLRA 1KFCA 1Q45A 1UUOA 5G4EA 5KINA 3O05A 1G67A 4GXMA 4JY9A 3I68A 3PWAA 3FKKA 1VCFA 5F4SA 3TC6A 2XN0A 4XTIA 1TMHA 2LLEA 4LV9A 3QQ0A 2GJNA 2A85A 4ONVA 4FX8A 4DBEA 3W7LA 3YPIA 5AYZA 1JUBA 3TK7A 3W6YA 1CW2A 1OK6A 4PH6A 4MIMA 3UXAA 1LROA 1IIGA 1QO2A 3HB9A 1QDSA 5D2WA 2G95A 4IMDA 3LCLA 2NUXA 2X1RA 1SQ7A 1ICPA 1FWNA 4QJ1A 1O94A 2RDUA 3HG2A 1RZMA 4K36A 4K37A 3DKJA 1KM6A 4CCCA 1TPH1 5LZLA 5IBXC 5I3KA 3DBPA 2ZRVA 5IM51 1F76A 2NZLA 2A6LA 1QOPA 5LSMA 1K03A 3PBWA 2PRMA 3NQ6A 4LWWA 1K7EA 3DFSA 3QFEA 3NQCA 3JRKA 1X7FA 1TPEA 3ZR4A 4GC4A 4LVBA 1AG1O 4IMGA 1NSJA 5EA9A 1ZENA 1B9BA 1L6YA 2GPTA 4WOQA 2YCEA 1LDCA 3FFSA 3R5EA 2CLLA 4MY8A 5DBUA 5AHIA 2C19A 3LCGA 3S5ZA 3LHVA 1B4KA 3BG9A 1S5TA 1Q6QA 1WAUA 2Y89A 1LOSA 4MKNA 4UTHA 2WSYA 3LLFA 1TYGA 3L5MA 1JCNA 3EWBX 3P8IA 5G5IA 3PUEA 5F4XA 1WA3A 1UBSA 3NQFA 4NJKA 4N9CA 3S5YA 1XBVA 3DFTA 1FDZA 1G4SA 1I2OA 2R14A 3EEGA 3QRHA 4EF8A 3T4CA 2VC6A 3THQA 5FEWA 3BLEA 4OHQA 5MHBA 3QJAA 4CNOA 1XI3A 4GFSA 3N3MA 4MVAA 2WPBA 3GIYA 2O7SA 4BFAA 1UB3A 2C18A 1LRNA 3LI0A 3ATYA 1OX6A 4RLIA 1FBAA 3TXVA 4RX0A 3SW6A 1PIIA 2HTMA 1TPDA 3CEPA 3QZEA 3NQAA 1KW1A 3G22A 2NX1A 3LM7A 2ISWA 4X22A 4IXHA 1I8JA 1TSIA 2RDTA 4A3UA 4Z1DA 1EA0A 3T7VA 2CLMA 1KBJA 1Q6OA 1Z48A 1ALDA 4HNTA 4CCEA 2JGYA 3FS2A 1H50A 3G3MA 4GNJA 1Z41A 2WKJA 1KBIA 3O1NA 3G1YA 2QUVA 5K4ZA 5FF4A 1VYSX 3I65A 3HPSA 4JIPA 3MO7A 1F74A 3T55A 4EVZA 4Y8FA 1OYCA 2I1OA 1BTMA 1H7NA 1KLYA 5AHNA 3W7NA 4EIVA 3MI3A 1IXPA 4M7TA 3UXDA 1DL3A 1H1YA 1QCWA 5D02A 2E6AA 1OX4A 5FEPA 2ZRUA 3SZ8A 5C6MA 1JUEA 3TX9A 3PVFA 2G5WA 4JTEA 1TPC1 4RCXA 2ZZ5A 3S1VA 4JTTA 1KM2A 4FNSA 1SW3A 6ALDA 4XTDA 3AJXA 2V5LA 4XQ6A 4U28A 1GVFA 2Y70A 1EUAA 4WX2A 3FEMA 4NJHA 1R30A 4C1LA 2WNNA 3B0UX 2DJXA 5G1YA 2Z2UA 2H3BA 2P10A 3M7WA 3LRKA 1H5YA 2DZTA 3EKZA 2QJHA 4JX6A 5T26A 5AYYA 3WFAA 3KVKA 3GNDA 5EPDA 3WJWA 4G1KA 1BEUA 4NZJA 1WOBA 1OFEA 5D09A 4DBDA 1KFJA 4YCOA 1Y0EA 2PC4A 2F84A 4JTGA 1ZFJA 3WK1A 3TFXA 4O1AA 1O60A 3BW4A 1TV5A 2X16A 3EX6A 3STEA 1H7PA 3KAOA 4WXZA 4JIQA 5AN7A 5LHFA 3NZRA 1SPQA 1G69A 1EP3A 1XC4A 4JDYA 2XFWA 1SZEA 1X1OA 2RDWA 2V8ZA 2ZTKA 4W9TA 4FNUA 4FNPA 1EIXA 2OJPA 1GVOA 1DQWA 1L6SA 3TJLA 4HSNA 1OFRA 3NGJA 3D0CA 2A2IA 1TPVA 1SO4A 4NUWA 1TTIA 2R8WA 4JXCA 3VE7A 1W5PA 3KVMA 1SFLA 3L0GA 4A22A 4RXGA 3MHUA 1C9DA 1OFAA 2PURA 2ZZ6A 3NO5A 3QW4B 5BMXA 1AW1A 1TRDA 3HO8A 1UJPA 3HGRA 2AGKA 1TCDA 2P0OA 3S9YA 2H8XA 3KXQA 3QSRA 4GWEA 4M6VA 4Z0SA 5D32A 1GYLA 5FI8A 3EWWA 1LP6A 4PFMA 4LW7A 3W75A 4NJGA 4HNUA 2QCDA 1KLZA 2YW4A 1JULA 1FX6A 3QQ1A 4UTTA 2YGYA 1LORA 3NPWA 3W2JA 4S2BA 4LVAA 3W76A 1FCBA 1OFOA 3EX2A 3SSJA 1AK5A 1JVNA 2BXVA 3DKLA 5BW6A 1LYXA 1SSGA 2E5CA 3H55A 5G4WA 3LHYA 5D2VA 3STCA 3C61A 1EWDA 3G3DA 3ZFHA 1EX5A 1W8SA 4QITA 1F5ZA 1BKSA 3OBKA 4RXFA 4IMEA 1NEYA 4M19A 4Y90A 1IIHA 2OX1A 4MY9A 5LNWA 3A5VA 5D2YA 1QPQA 4IXXA 1PHQA 4ZQRA 4EOUA 5KMYA 3QEZA 3F4NA 3W7DA 1VLIA 4N02A 4JY8A 3C3NA 3UY8A 2ABAA 5AOUA 1MZHA 3NYZA 4NNCA 4WJEA 1XXXA 4AH7A 3P82A 4PTNA 4AMAA 5G2IA 2DP3A 3UWZA 3PF3A 4O0ZA 3W86A 4O28A 4O1BA 4UR8A 3LCWA 1QFEA 4BF9A 1PHWA 3L67A 4JYFA 4UFHA 1XL9A 3L0NA 3W7JA 3DFNA 4E2DA 2NXGA 1QPNA 1F7BA 1N55A 1MEWA 4IUOA 2Z1BA 1GPWA 1B57A 3ABOA 1OJXA 4UTWA 4FB7A 3AO0A 3EXSA 1F6PA 3B8DA 4U4MA 1XFBA 4R33A 1HO1A 3W7MA 3QMRA 4UFKA 3SGUA 2VEPA 2FJKA 1YDNA 2ISVA 2RH9A 4LVFA 1ML1A 3GXNA 1A53A 1D3HA 3U2OA 3S1XA 4I7VA 3C2RA 2BLEA 4E0CA 3LOTA 1EP2A 3PY2A 5EKYA 2FLIA 2VEIA 4AF0A 2QCLA 3G18A 5I3JA 5EMUA 3LTPA 4LUJA 2D73A 5DELA 1GEQA 3C2FA 3HPXA 5CZ0A 4B5NA 4S1FA 4JTSA 1YDVA 4TR9A 2FB2A 2BTMA 1RQEA 1OK4A 4DPPA 1W0MA 5F2GA 5LNVA 5KZDA 5HMSA 4NQ1A 4P61A 4FIRA 3TE9A 1SZFA 4A2RA 3U8GA 3PB0A 4LC8A 2BX7A 4FEZA 2ATMA 2QF7A 3ELFA 4E38A 4UCGA 2YR1A 2YYTA 4O1CA 5AHMA 4JTFA 4NNBA 5K3VA 4YWIA 3BK0A 2Z0IA 4LVDA 4OBTA 5LGXA 3G1HA 1HO4A 4WZHA 1WOAA 2E09A 3DFQA 5D37A 5G1TA 3T78A 1K02A 4UTTC 2YYUA 1G7UA 1KFKA 4FXSA 2GQ8A 1P1XA 1XM3A 2QAPA 1IF2A 2Q8ZA 4XUGA 3L5AA 3MI2A 2JBMA 1HUVA 4AHPA 3ANYA 3GDMA 4C1KA 3KVLA 5HR6A 4O10A 1PV8A 2NXHA 1TTJA 1YDOA 3KRSA 3TU9A 3HOJA 3IEBA 2CZEA 3KOFA 3TA6A 1W56A 5KSWA 2EPHA 3KHJA 1T0OA 2VFIA 4GUJA 5CSRA 5D03A 1GG1A 4UNKA 5DCEA 3PUOA 3P5YA 3H53A 8TIMA 4K7YA 1NF0A 2B7QA 3LTYA 1ME7A 3CU2A 4UFLA 1TV7A 3BG3A 1TPWA 1BWLA 1H51A 1W31A 4TMBA 1LCOA 3QSTA 5E1QA 4ORMA 2ZZ7A 3L5LA 1D9EA 5K2ZA 1OYBA 2Q3OA 4GE8A 5I3HA 4K39A 2Y7DA 4CQ9A 3O63A 2Y61A 3TIMA 3O07A 2FPVA 3MJYA 5U7SA 5HINA 1ZY9A 4IOTA 4MJZA 4JTLA 1OFDA 2GUUA 4H4IA 5C5YA 3E96A 2TYSA 3MHFA 1QWGA 1LOLA 5D04C 3L66A 3IIPA 3N14A 1GZGA 3NQ7A 4O0KA 4WY0A 3LBMA 1JR1A 1MO0A 2QKFA 5D38A 3G1AA 4UTWC 3UY7A 1H1ZA 1R2SA 4UMAA 5F2IA 1W5MA 3TSBA 3P60A 1K7XA 5AC7A 4XZ9A 4ZZ9A 3G1DA 3JR2A 2X1SA 3NQEA 4UMBA 1FWSA 3ABRA 1P4CA 3B4UA 1G6CA 4JTIA 3P81A 3E02A 1TPFA 3E9AA 1JUKA 3BVJA 4QNWA 4UTUA 4AAJA 3W7IA 4JYEA 1KV5A 3OA3A 2C3ZA 3V1PA 5AC6A 4JNMA 2O7QA 5CSSA 3VKJA 4OV9A 4O57A 3CB8A 5SWUA 1TJRA 3BG5A 3C2OA 1M6JA 3LI1A 2CLKA 1QOQA 3EX1A 1F05A 4AWTA 2J9YA 2QDHA 2JKAA 3E12A 3M41A 3VI2A 4P2VA 3LTSA 1Q6LA 3PS7A 1OFBA 4BWLA 5K9DA 3L9CA 1XDMA 4IMCA 2DZVA 4NVTA 3N19B 1PVNA 2C15A 4J9JA 1B3OA 1RR2A 3MW7A 3PBVA 3A24A 5E93A 3TR2A 1OF8A 3W1QA 2XN1A 1UUMA 1K8YA 1QO5A 4NJIA 4WUIA 3S1WA 1QPOA 3OHIA 1TO3A 4IMFA 1RD5A 3S5OA 1F6KA 3GDRA 3T40A 3RMJA 4NXSA 3NXFA 2A4AA 1G4EA 4NNAA 3RLUA 1AMKA 3S5NA 4RR4A 3PM6A 4A29A 1YPFA 2AAMA 1VCVA 4K8EA 5CG7A 3FKRA 2DZPA 5HR7A 7TIMA 3G0XA 3M47A 1DBTA 4R53A 2E5DA 2JKPA 2VELA 3DXIA 3W1PA 4JEQA 1EPXA 5AHLA 4O53A 1XBZA 3MI6A 1WYIA 3MYOA 3CLMA 4ORIA 3G8RA 1R2RA 3LXCA 4MYAA 2A21A 3MBDA 1I2PA 3NVTA 4LRTA 2QJIA 2KZHA 1C8VA 3HMJG 5TQLA 2VXNA 4JX4A 3CC1A 3LHZA 4OT7A 3F4WA 4WOZA 1UASA 1SO6A 3UPWA 3NQ2A 1LOQA 3M0ZA 1ICQA 3ZWSA 1OFQA 1T96A 1YXDA 3E0IA 2WV8A 2WJZA 4QNEA 4ZQNA 3W07A 4LTSA 4JN6A 1B4EA 1CX9A 2DZSA 3HG3A 1YYAA 3C0JA 1SZNA 3GR7A 2ZTJA 3QPZA 3W7QA 4BI5A 4I7UA 5I3GA 2HMCA 1J2WA 2CZ5A 4XBKA 4CQ8A 4KFNA 3S0CA 3TQVA 2H3DA 4I9AA 2EF9A 3RK8A 2QCFA 2GJLA 3U6WA 1ME9A 1IXQA 1S5WA 1YTEA 4JTUA 3MYPA 1TQJA 2QCGA 3TROA 4OE7A 4PA8A 2VFFA 1LRQA 4O19A 3TFCA 4MUZA 3EX3A 3PG8A 1MEHA 5LNRA 1M7OA 4Y9AA 2Z6IA 3ZWTA 4TIMA 1KTCA 3I7RA 3M1ZA 3CIWA 1YTDA 4DPQA 2QCHA 1QR7A 2B7OA 3VE9A 4DO5A 1XUZA 1H63A 4MPQA 3VFLA 3O06A 4UFIA 4X9SA 3W2NA 2TPSA 3W1LA 1XUUA 2C14A 5DY3A 3O6DA 3W70A 4LC6A 2QDGA 3IRDA 1KFBA 3FYPA 3KRZA 4AF0B 4BWLC 2V30A 5AB3A 4JDBA 1SFJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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