3TCEA

Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
TIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Acinetobacter baumannii
publication title Crystal structure of the complex of Dihydrodipicolinate synthase from Acinetobacter baumannii with 5-Hydroxylysine at 2.6 A resolution
rcsb
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
total genus 116
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2011-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tceA00
2EAWA 2A1YA 5G2WA 4RZ5A 4WXZA 2JKEA 1AK5A 4ZQOA 3SFKA 3DGRA 3N9SA 3CHVA 4LS2A 2Y89A 4UTTC 5IBXC 1OFAA 4NVTA 3NPWA 4IGHA 4BFAA 4KWVA 4ADTA 1P5BA 4MOZA 1G7UA 2NV2A 2VENA 3WK3A 1VH7A 3KVLA 3INPA 4MZ8A 4UXDA 1EWEA 3MYPA 2C0AA 3LTSA 3PB2A 4A22A 3JR2A 2UV8G 4ZQCA 1I2RA 1QPQA 3NVTA 1CW2A 3LHZA 4IXHA 1SO4A 5D03A 1XFBA 3B05A 3UZ5A 2Y62A 4IWWA 3IGUA 1B4KA 4RR4A 1UBSA 3MP3A 1L2UA 1NF7A 3USBA 2C3ZA 1F73A 2E5CA 3HPSA 1VYPX 4RCXA 1G4EA 1L9WA 3E02A 3NQVA 5AHMA 3TJLA 2YSWA 5LGXA 4RXFA 2Z1BA 3TDFA 2B4GA 5L9FA 3SGUA 4KKXA 4LV9A 3FKKA 3MHFA 3CPRA 3THQA 3DFTA 1IIHA 3UXDA 1HL2A 1TTQA 1R2SA 4GUIA 5MHBA 3BARA 2GVJA 2E1DA 3BO9A 1KV5A 2GQAA 3NQEA 2QAFA 1OF6A 3P80A 1IXNA 3M43A 1XBZA 5C6MA 1HUVA 4CCEA 3O6YX 3TMQA 4CLMA 1OYCA 3NQ6A 1A50A 1PL9A 5EKYA 4U4MA 4N6FA 4Q33A 3QRHA 5EL1A 1DQWA 4ADUA 5D02A 3P84A 3NQAA 2ZYFA 2YFNA 2E6YA 3W07A 5D04C 1ICQA 3FOKA 1RQEA 3O63A 2AAMA 3MBDA 4Q4KA 3STCA 3W87A 2ZRYA 3IIZA 4AMAA 3HF3A 3EX3A 3LXBA 3R12A 1WQ5A 1R47A 3B03A 2BSLA 2ZA1A 1C29A 4JYDA 3DFNA 1M6JA 3LHYA 3U8GA 5DN1A 4MLJA 1TPC1 1GVRA 1G6CA 3KVKA 1XBVA 4IOTA 1GQNA 3O15A 3BG3A 3UY7A 4CQAA 5CPOA 5J5RA 2C13A 3HGSA 5DBUA 1SW0A 5K7JA 3W1TA 1VS1A 2QCLA 3PUDA 2GOUA 1E51A 3CWNA 2OJPA 1LDCA 1UASA 2GJNA 3PVFA 4FNTA 4XQ6A 4YLWA 4I7VA 4Y6GA 4A21A 5HUPA 2BLEA 4U28A 1L6SA 2C15A 4DO5A 5LNRA 2CZEA 2J88A 1O94A 4WJEA 4ONVA 3EKZA 3G22A 4L4LA 3YPIA 4UTUA 1R30A 4I7UA 4QAIA 5F1UA 4IPIA 1HO4A 5K9CA 1DQXA 1FY6A 1PVNA 4ZZ9A 3VNDA 2C18A 4RXGA 2Y63A 4QM1A 3UWWA 1OX4A 2QCFA 2VFDA 1LLWA 4NJHA 1B4EA 1GOXA 2KZHA 4AXKA 2CW6A 1FWRA 4CNOA 1FX6A 2CU0A 1KFLA 3M44A 1OABA 2CLKA 1TPH1 1EPXA 4PL1A 2V9DA 3S1VA 4IUOA 4JD4A 1KTNA 3TQVA 2C6QA 5HWJA 3RMJA 5CPLA 3W2MA 2QJIA 1BTMA 4ZQRA 2XN2A 2VFEA 4MY8A 4BR1A 3M41A 3A21A 4K38A 1RQBA 2NXHA 2ZA2A 2FPTA 4RK8A 2C14A 4RKAA 1TPWA 4LNYA 1DV7A 2E68A 4A29A 1Q6QA 4UNKA 3QW3A 3W74A 1EP2A 5F2MA 1C8VA 3PF3A 2Y88A 3PS7A 3G0XA 4O50A 4YMZA 2R14A 1GJPA 3FEMA 3W83A 5AHNA 4LRTA 5G2IA 1QCWA 4MKNA 3DFSA 1GZGA 4AF0A 4JTKA 2OCZA 1V7YA 3QMSA 5SWUA 3T55A 3TSDA 3G18A 4BWLA 3O05A 3NZRA 3R13A 1G67A 3LCHA 4HNTA 3QPYA 3M47A 2RKXA 1BWLA 2ZQ0A 2TSYA 3G1SA 3DHFA 1HO1A 3V75A 3DI1A 1VLIA 3W7NA 1KM1A 5U4NA 2ZA3A 2EHHA 3DXIA 5LNUA 3PC0A 3EWXA 3BVJA 1MSSA 3B0PA 4P61A 3PBUA 1FWTA 1W8SA 5AHLA 1GVOA 1KTBA 2DZTA 1TPVA 4OV4A 3OG3A 3G1DA 1I2QA 3S42A 4GNJA 3NG3A 1O4UA 4UTWC 4HHPA 3IVUA 1NFBA 1TREA 3T7VA 1SR9A 2PRHA 4UFJA 2Q3OA 3AJXA 3ZFHA 3P8JA 4K8EA 3C4UA 1DVJA 2A6NA 4UR7A 2NV1A 5A5WA 3S1WA 3CC1A 2PE4A 3A9IA 3LX9A 3MI6A 2CFFA 1FCVA 3QFEA 4S2CA 1VCVA 1Q6LA 1H51A 1LP6A 4YCPA 2G97A 1AW5A 2F7FA 3UWYA 2I1OA 3FIGA 2ABBA 1VLWA 2Y7FA 1FCBA 2HTMA 1GG0A 3GDKA 1XUZA 5K3VA 1YYAA 4JIPA 3MP4A 3B0VC 3LXAA 3Q2DA 3R8RA 3TIMA 4S1FA 6TIMA 1VRDA 4JN6A 5KINA 1TIMA 3LCWA 3SR7A 3D0CA 5HR7A 1Y0EA 4A3UA 2Y6ZA 3OA3A 4JTEA 2E6AA 3LI1A 5KITA 1XM3A 3W7RA 2X1SA 5J5DA 1XXXA 3G1XA 3MW7A 4M6PA 4O4VA 4FNSA 4LOCA 1DJNA 3BLFA 1W3TA 2VXNA 3QSRA 1W1ZA 4GUHA 4UFKA 2FB2A 4NZFA 3W1MA 4POCA 3V1PA 2EF9A 4E38A 3RK8A 4FF7A 3T78A 1ADOA 3DU0A 3DKLA 2Q8ZA 4UUIA 4E2BA 1AL8A 3TFCA 1ME7A 5F2IA 5K9XA 2WPBA 1YPFA 2GQ9A 4FIQA 4LC8A 1W5OA 2NX9A 1XUUA 4M5PA 1DHPA 4ADSA 4JTGA 1TO3A 3RLUA 1F5ZA 1GEQA 1S5VA 3LCIA 3W7KA 3WJYA 4OE7A 1QPNA 4AH7A 2ZBTA 2VEKA 1X1OA 3QSTA 4LS0A 3W88A 3VE7A 5F2GA 2A85A 3SY5A 1KBJA 1SZFA 1WOBA 2RDWA 4TIMA 4HT3A 4JY9A 4RLIA 3W75A 2DJXA 3TAKA 3EXSA 5KTLA 3LERA 2CLMA 4FNPA 4NNCA 1Z44A 3EX6A 3HO8A 1A5AA 3QEZA 3GNNA 4I7WA 4AEOA 1H7RA 1G4TA 3FJLA 5HULA 5HINA 3R5EA 1M7PA 2V30A 3MO7A 1ZALA 2PC4A 4QQ3A 1OJXA 2ISWA 4OHQA 3ATYA 4Z0SA 2P1FA 4X3ZA 4WZHA 4KWWA 4GRSA 4GWEA 3W7CA 3C2VA 3PBVA 1N8FA 1H7OA 4O52A 3UXAA 3PUEA 4NU7A 4M7TA 4AB4A 3LHWA 4Z1BA 3EB2A 3JS3A 1QOQA 1TTJA 4UNLA 3GZ3A 3STEA 3LV5A 1Q6RA 2X1UA 1LBFA 4JXCA 2R8WA 1KFEA 3S5YA 4Z0JA 5AHIA 1WAUA 3HGOA 3BW3A 1Q3NA 3G1FA 5K9DA 2JKAA 3L9CA 5AFDA 2QEZA 2ABAA 2ISSA 1EUAA 1FDJA 2V5BA 3TH6A 1YTDA 4JR5A 3VFLA 3KHJA 4LU0A 3UWUA 3GXTA 4UMBA 4AVFA 4EOUA 5AYXA 2ATSA 4QITA 3E96A 4UTKA 8TIMA 3ANYA 1P4CA 4K39A 2Q3RA 4JTFA 5F4XA 1TRDA 2A6LA 1ICSA 4X9SA 1WA3A 2RDUA 1TRIA 3L65A 2DZXA 2C1HA 3F4WA 1TV7A 1ZAIA 4K36A 1KBIA 3I7SA 3I68A 3ZS4A 5TIMA 1XL9A 1FXPA 1LM1A 5AHEA 5E0KA 4JGDA 4LTSA 3TJXA 2H3BA 2Z6JA 2XN1A 3LXCA 1B3OA 3W9ZA 2QCNA 1B9BA 1WX0A 3FFSA 3G3DA 1P0NA 3WFAA 3S1UA 3LB0A 5CGQA 4CQ8A 2NX3A 2NLIA 1DL3A 3G8RA 2ZRUA 5D32A 1H7XA 5DXYA 3P5YA 4UR8A 2LLEA 4MVAA 2ISVA 3LBCA 4LC6A 4AHOA 5FEZA 1LOQA 2A0NA 2XN0A 2RH9A 5HWNA 3ELFA 4LW7A 4MFDA 1JUKA 2DZPA 1FCQA 2NXIA 1Z42A 1KW1A 3L21A 3TROA 5LNWA 3QW4B 4HPJA 3UY8A 4L4MA 3W7GA 5AHFA 1D3HA 2TMDA 3UQNA 3BLEA 3UNDA 4O14A 1MZHA 2GPTA 5DLCA 2QR6A 4HN4A 1VPXA 2GQ8A 3MWAA 4O0KA 2A5HA 4JYEA 1S5WA 1K7FA 4ICNA 1F76A 5LNVA 2OZ0A 3NR0A 3Q58A 3TSMA 4ALDA 4LWWA 5F2LA 3Q94A 4UMCA 5BNKA 3OVRA 1XBXA 1OYBA 2VFHA 3LTYA 3A22A 3GLCA 3U2OA 5CZTA 1IGSA 3CTLA 3IRDA 3N14A 3SZ8A 4OBTA 5LHEA 5D2XA 1GG1A 4ORMA 1TPEA 1H1ZA 4HKPA 4EF8A 1UUOA 3QQ0A 2CLFA 1DKWA 3TC6A 3FKRA 4QJ1A 3SSJA 3PR2A 4Y96A 3IGXA 4H6KA 3BW4A 1H63A 4FB7A 3LLFA 3RLVA 5D05A 1VHCA 1GT8A 1WV2A 2ZZ7A 3W22A 3M7WA 3C6CA 3P60A 1FWSA 3WJSA 1FQ0A 2E09A 4N4QA 4O12A 4NUWA 5I3HA 4WY0F 4IMGA 1YADA 2JGYA 1ZJIA 4IXXA 3KVJA 3MHUA 5DXXA 3IVSA 4JTJA 3M5XA 4O54A 1W37A 2QCDA 2CLIA 1OX6A 3H55A 5EMUA 5BMXA 1A5SA 1UJPA 4X22A 1AW1A 3W7MA 1HFBA 3HQ1A 1T99A 1ME9A 1WOAA 1L6YA 1I8JA 5KSWA 2CWNA 2G95A 1AW2A 4N2YA 5EYWA 3QF0A 2WV8A 3GB6A 4LRSA 3BGGA 2YPIA 4ZL1A 3SECA 3RF9A 4O1AA 2C16A 4IMDA 1FWNA 3CQ0A 3N2XA 1CI1A 2Y70A 3S5ZA 2DU2A 2EGZA 5K4ZA 3CM4A 5DY2A 1MEWA 3BPWA 1PE1A 5CZSA 4XUGA 3S5OA 4C1LA 3PY2A 2RHGA 4UTMA 2J9YA 3HJZA 3L5MA 2ZCGA 3NQDA 5KZEA 4N02A 1YXYA 3MHGA 3NQ8A 3IIOA 2YFOA 4UTTA 5IBXA 4ZQMA 3RNDA 1JUBA 3TA6A 2B7PA 5DCDA 5E1QA 1QFEA 2G96A 5G1YA 2VEPA 4PFMA 7TIMA 3F1QA 2A7RA 1M7OA 1GTEA 4JTLA 5AB3A 1XDLA 4Y9AA 1JUEA 1TSIA 3W7LA 2EKCA 4RJEA 2X30A 3C3NA 4C1KA 2NZLA 2A7NA 3VKJA 3G1VA 2TPSA 4CNPA 4OWGA 3S5NA 3C2EA 4JYFA 5EY5A 3KFTA 4NNBA 5BW6A 5KMYA 1R2RA 5BOOA 5TBOA 3NQGA 4DF2A 1TQXA 3KVMA 4PL2A 1K8ZA 1EIXA 1J5TA 1X8FA 1LYXA 4IPJA 4NX5A 3KRSA 2JBMA 4WQ6A 5EBUA 2GVLA 3TQKA 5CZJA 2J6XA 1I2OA 1S5TA 3NO5A 3HGRA 1EWDA 5FESA 2GJLA 1T0OA 3IIVA 3C2RA 2FLIA 2WQPA 2G5WA 3P67A 2Y61A 1FUYA 4K7VA 4WXYA 4WD0A 2B7OA 2V82A 1GWJA 3K30A 3O06A 2YZRA 1EUNA 4O18A 3A5FA 3W70A 1G7VA 2QCGA 4CQ9A 3EWYA 3W2NA 3VE9A 4AHQA 2H6RA 1TYGA 5T26A 1Z48A 1X7FA 1SW7A 4G1KA 2CZFA 3WJXA 4RV8A 5CSRA 2ZZ2A 3WK1A 3OVQA 4OV9A 3ABSA 3FLUA 2YW3A 4AWSA 3DAQA 3S1XA 2RFGA 2DZUA 3UWVA 1QAPA 1TJPA 2HS6A 4PC8A 3MI2A 2E6DA 2I14A 4AHPA 1OFRA 2ZRVA 2ZRXA 1EEPA 3B04A 5L6UA 4M6QA 1IXPA 4AWUA 2WSRA 1TCDA 3UWZA 4GUGA 5LHFA 1VZWA 4JTIA 2WSQA 5F4SA 2A4AA 3M9YA 1PS9A 4GUFA 1DOSA 4MYAA 3C8FA 1W54A 2NXGA 2TYSA 4LVFA 3DFQA 4MFEA 4K7YA 4EVZA 3N3MA 3RU6A 4TR9A 1BWKA 2J27A 3FYOA 3P8IA 1HG3A 2CLEA 5AC6A 3W23A 1LTDA 1SZGA 3GKFA 3P7YA 4UC5A 2D73A 5AOUA 3EXTA 4HSNA 2PCQA 1PHWA 1QPRA 3L5AA 3TXZA 1O95A 4O1BA 1XC4A 1SSDA 1W3NA 3O8AA 4OT7A 2PRLA 1KV8A 4DF1A 1RZMA 3O1NA 3EKLA 4ZMGA 4NZJA 3W7HA 3H54A 5D2VA 3PWAA 3IVTA 3PM6A 3DZ1A 3EX4A 3GDLA 1JRBA 3EEGA 4KFNA 3VCRA 1KFBA 3U6WA 2Z2UA 3TQ0A 2QCMA 1SFJA 3TCEA 1JCLA 1LBMA 3HG5A 2DP3A 3ZWSA 1TPB1 2FTPA 2H8ZA 3QJAA 2TRSA 2B7NA 3PBWA 3W2JA 1UCWA 4YWIA 3W2KA 2YXGA 3W7EA 4UFIA 3TSBA 3C2OA 1F6PA 1WXJA 4DQWA 4JDYA 4E2DA 4J9JA 1O5KA 3W1QA 3EWUA 1KLYA 3EX1A 3M6YA 1EA0A 1H7WA 3NYZA 4XZ9A 2FFCA 4Z08A 2XFWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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