3THAA

Tryptophan synthase subunit alpha from campylobacter jejuni.
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
AMVDFRKFYKENANVAYTVLGYPNLQTSEAFLQRLDQSPIDILELGVAYSDPIADGEIIADAAKIALDQGVDIHSVFELLARIKTKKALVFMVYYNLIFSYGLEKFVKKAKSLGICALIVPELSFEESDDLIKECERYNIALITLVSVTTPKERVKKLVKHAKGFIYLLASIGITGTKSVEEAILQDKVKEIRSFTNLPIFVGFGIQNNQDVKRMRKVADGVIVGTSIVKCFKQGNLDIIMKDIEEIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tryptophan synthase subunit alpha from Campylobacter jejuni.
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Campylobacter jejuni
total genus 78
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2011-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3thaA00
4PCFA 1KW1A 5EBUA 1QOPA 3O6DA 4FNQA 4UTJA 4GRSA 1IXQA 3NM3A 3NQ6A 5LNWA 1K7XA 3HOJA 4QJ1A 3R12A 3G24A 4JY8A 3N14A 5LGZA 2WOQA 1AL8A 5C2XA 4JIPA 2A7RA 1H7RA 4H3DA 4MYAA 3W87A 2FPYA 4J9JA 3CWNA 3WJWA 3O06A 3BARA 4JTJA 4MIMA 4CNNA 2C15A 4AB4A 3MHUA 4O12A 5E0KA 3WJXA 4U28A 1G4PA 2YYTA 4XQ6A 1UUMA 3W7GA 1F2JA 1VQTA 1IXPA 3TA6A 1XXXA 3C8FA 2ABAA 3LBCA 3LHYA 3FJ6A 4JDBA 2TYSA 3BO9A 4O57A 1W56A 2B4GA 3PVFA 1RVGA 1ZAJA 1JCJA 2EPHA 1I2RA 3RK8A 3RU6A 1OFAA 1SO4A 4BI6A 3R2GA 1SZEA 2IQTA 2EKCA 3TE9A 1K02A 4X3ZA 3IIXA 4UFJA 2A4AA 1X7FA 3BG3A 4OE7A 4LU0A 1X1OA 2OMAA 4JXCA 1ICQA 5CSSA 1MEIA 1UUOA 3NPUA 4GC4A 3OEXA 4ADSA 4HNTA 1FWNA 1KV8A 4WXYA 3S6DA 1LLZA 4AAJA 4RCXA 3UXAA 3M1ZA 3RNDA 3OA3A 1G7VA 4IPIA 4N9CA 2H3DA 2QCLA 3DH7A 3EKZA 4ADTA 1HFBA 1F76A 1WOBA 1WXJA 3W1MA 3IGSA 1VLIA 3PF3A 1KBIA 3B0PA 4XBKA 3UXDA 1N8FA 1WX0A 2BTMA 3UPWA 3PB2A 4YL2A 3TC6A 3CT7A 2Y7EA 1QNVA 2E5DA 3TSMA 3UD6A 4I9AA 4RZ5A 2ZRYA 1H7PA 1XDLA 2V81A 2Q3OA 1VYPX 2VKZG 2QCFA 5AC6A 5EYWA 1FXPA 1IF2A 3NQ2A 4QITA 3BV4A 3EX3A 3LCLA 1I4NA 4FIQA 4IMDA 4MLJA 3TW6A 4BWLC 5K9DA 2EGZA 4N02A 2QCCA 3R5EA 4IXXA 2WO5A 1GT8A 3SFKA 1XC4A 1L6SA 3NQCA 1QO2A 3TMLA 1BEUA 2GVLA 1YPFA 2RFGA 5F2LA 4KWWA 3LLFA 3S0CA 1YXCA 5AYXA 1PVNA 1FUYA 1NSJA 1WBJA 1VCFA 4NX5A 2Y6ZA 4QISA 1QO5A 1R2TA 5EPDA 3IRDA 1W54A 3BG5A 2QDGA 3M5ZA 3CB8A 4UTIA 3T4CA 4Z1BA 4IOTA 4RKAA 3G3DA 1RPXA 2RDTA 1TPH1 3PUDA 4O53A 3L21A 3SI9A 3W70A 3C2EA 5F4XA 3I65A 4U4MA 1YDVA 5I3FA 3C2VA 3W07A 3TJXA 2Y7FA 5FESA 1O94A 2WSYA 3WJSA 4KFOA 4MLRA 2W79A 4Y6GA 1VZWA 2B7OA 4LRSA 3T40A 1LORA 5A5WA 4A2SA 5HQEA 3W1UA 3IVUA 3TNOA 3JS3A 4JN6A 3QMRA 5DY3A 3STGA 3N2MA 3PBYA 3F4NA 4EVZA 4O0KA 4PA8A 3P67A 1TQXA 2Z2UA 3PB0A 3DHFA 2QKFA 3QW4B 1ZCOA 4JICA 4FNUA 4XKYA 3NQAA 3NQ7A 3SY5A 2WNQA 4LRTA 4DF2A 1GQNA 4UMAA 3L5MA 4IX0A 5AYZA 2XN2A 2A2IA 1TSIA 3UY7A 4JX5A 2CFFA 1PV8A 4LUJA 2J27A 1W5PA 1VH7A 2DZVA 3LX9A 3O63A 2C3ZA 3M44A 3L65A 3THQA 4OT7A 5AHIA 3P62A 3STEA 3EB2A 3WK2A 4O52A 3UZJA 2C6QA 3L0KA 3G8EA 3B05A 3DGRA 2RHGA 4MKNA 2YXGA 4R53A 2DU2A 3M5VA 4GXMA 2JGYA 1SR9A 4MY8A 1W5OA 3NYZA 3ELFA 4CQAA 1OYBA 1ME8A 4JTIA 4UNKA 5IBXC 1GWJA 1RQBA 1DHPA 3LRKA 1LOSA 3LRLA 5U7SA 1M7OA 3PWAA 3W7PA 5HR6A 3EWUA 4K8HA 5I3KA 1N55A 4XTDA 1ZJIA 3P5ZA 3VNDA 4K7VA 2Q3RA 1QFEA 4O28A 3W3OA 4IWWA 1XFBA 4P2VA 1OJXA 2FDSA 3S5ZA 4JR5A 3RFAA 4CLMA 1H50A 5LSMA 3KRZA 3FA5A 3IGXA 3ABSA 4GJ1A 3W73A 3LXCA 4XZ9A 3UWVA 2C1HA 1LCOA 3W9ZA 5BOOA 1EWDA 5KZDA 2VENA 2CWNA 1FCVA 2BSLA 3GR8A 4Q32A 2V9DA 5D09A 4OU1A 3MP4A 5K4ZA 3E02A 5K2ZA 2I14A 1OVDA 5E1QA 3USBA 1XDMA 2WNNA 4N4PA 3LCIA 2CLIA 3QYQA 1OK4A 2H8ZA 4N9EA 4FX6M 1CW2A 2PRMA 1SZGA 4ORMA 2B0MA 1X8FA 1AW2A 1ZY9A 2CW6A 1YXDA 1H61A 2WV8A 5LHFA 3PUOA 1RR2A 2CLEA 2FQIA 3S1XA 1L6WA 4MJZA 2DORA 1S5WA 3O8AA 1Z44A 1K8XA 3W7KA 2CZ5A 1H7WA 3NA8A 3QPZA 1H1YA 3W7NA 5FF2A 4ONVA 1PIIA 3NAVA 2E5BA 5I3JA 3W7MA 3PG8A 2Y62A 4N4QA 5EMUA 5CSRA 3TFCA 1DBTA 4LVAA 3HG3A 3A5VA 3FOKA 2DZWA 1F05A 3GVGA 4FNPA 4NNBA 2FPTA 5GVJA 2JKPA 2Q8ZA 4HNVA 2VFIA 3D0CA 1DL3A 2J6XA 3C2RA 1VHNA 2QUTA 1L9WA 4Y9AA 4CQ9A 1YDNA 1JQVA 3GDRA 3MMTA 3FKKA 2GJLA 1OG0A 3KVLA 2ZZ3A 4MY1A 1X1ZA 1UCWA 5BRBA 2XFWA 3FYPA 4CCCA 1I8JA 3EX4A 5AOUA 3JRKA 1W37A 3STFA 4WZHA 5DCDA 4PC8A 1U5JA 3TU9A 5EKYA 3W7LA 2YYUA 3I7SA 3W22A 3TX9A 3W72A 3W7EA 5LNUA 3QF0A 3QPYA 1SFLA 3ATYA 4O8RA 3NQMA 4GUFA 4JYEA 3SZ8A 1GVSA 3A24A 4LVDA 3UZ5A 5AHNA 4AEOA 1MO0A 5DCEA 3KRUA 2FTPA 2BXVA 3FKRA 4RXGA 1H63A 3W6YA 3L68A 1F6KA 1NEYA 3NVTA 3C2FA 5FEWA 1G67A 3LLDA 1DVJA 2QAFA 5D03A 4DO6A 4Z1CA 3M0ZA 3HGRA 3CIXA 3S5OA 1R47A 1S3HA 2VEKA 1OFOA 3W2LA 3W7CA 4RK8A 1BWKA 1VJIA 3EWYA 5BMWA 3TJLA 5C5YA 4HN4A 3IIZA 1EP1A 1IIHA 3M7WA 1LRQA 2GVGA 3QFEA 3Q94A 1O5XA 3NQFA 5K3VA 5HMSA 4ALDA 1W1ZA 4PTNA 3QZEA 3A5FA 1LTDA 1RQEA 3BG9A 1QPRA 3I6RA 4NZJA 4UTTA 4CNPA 4QIUA 5CKSA 3STCA 4Z1DA 1LZOA 4OBTA 5J5RA 2QJIA 3W83A 4LUIA 4O1AA 4POCA 5LGXA 4UFHA 3GNDA 3W1AA 3GKFA 3L0GA 3P74A 4M7SA 1RV8A 3C4UA 2R91A 3TQKA 3BK0A 4OWGA 5C6MA 2CLKA 5F1UA 5ABTA 1JRCA 2WQPA 3CEUA 1AK5A 1DORA 2CLOA 3T78A 3AJXA 1EPXA 1GYNA 4KFPA 3TKFA 2FIQA 2A5HA 1ZNNA 4UMCA 4UNLA 4ZQCA 5AC8A 4JTTA 3MHGA 3V1PA 4UXDA 4DF0A 4NXKA 3QRHA 4A2RA 2Y63A 3F03K 3R8RA 3WK3A 2H90A 5KZEA 3P7YA 4FO4A 2ZZ2A 1W3NA 3OVQA 3OBKA 2W6RA 5G2WA 4GBUA 3P60A 4FX8A 4UFMA 4O1BA 2ALDA 4RV8A 3NL2A 1W3TA 1G4EA 1NF0A 3MP5A 1QPOA 3CHVA 3UWZA 4I7WA 1GTHA 4AXKA 2J9XA 3CWOX 1ONRA 2E6YA 1OX5A 2OT1A 1UJPA 5TBOA 3MYOA 5KINA 3G1XA 3HGOA 4XWUA 1T96A 3NGJA 4MJMA 5AYYA 5CZ0A 3WK0A 3NZ1A 2E1DA 4DBEA 4K37A 3P80A 1B4EA 2DZPA 2E5CA 3FYOA 2NZLA 4D2JA 3W75A 3NO5A 1W3IA 1DJQA 1Z42A 2VFEA 1RD5A 4K36A 5G2HA 3R89A 3KFTA 2LLEA 3ANYA 4K8EA 4UTKA 3EWZA 4AVFA 3BW4A 3TAOA 5IM51 1TPFA 3GXTA 3TROA 3W23A 4Z1AA 4GNJA 4JNMA 5HUOA 5U4NA 3W7HA 3P61A 3S42A 4UTUA 3T7VA 3CLMA 1G6CA 4LVBA 3FS2A 1VC4A 2C18A 1LOLA 3FFSA 3FLUA 3G1HA 4MZ8A 5EL1A 3WK1A 4QAIA 1VR6A 4LS2A 2RH9A 3NXFA 1WAUA 4AHOA 5CPMA 3W2JA 4CNOA 2E6FA 3LHVA 4JGDA 3YPIA 4IX2A 4HPXA 2DZXA 3NQGA 3GX9A 4A22A 4LS1A 2AGKA 4UR8A 6TIMA 2ZYFA 3BGJA 3G8RA 4BFAA 2RDUA 4BI5A 4G1KA 3O07A 3ABQA 3QC3A 2NV2A 2BLEA 2O7QA 4HHPA 2PRLA 2A21A 1C9DA 4Z0JA 3NM1A 1C29A 4WD0A 3DZ1A 5D2YA 1K8YA 4ZVJA 4JYFA 2ZZ1A 3W84A 4MZYA 1GG1A 3C2OA 3M5YA 2OCZA 5H2ZA 5FEZA 2X1TA 4X9SA 3KAOA 3M9YA 3OIXA 2FB3A 2JK2A 4IGHA 4KKXA 4O50A 3SGZA 2C13A 3O05A 3IIVA 1JCLA 2QEZA 3DAQA 1XBVA 3QEZA 3PSVA 3UPBA 1H1ZA 4MPQA 1HO1A 2CLMA 1EUAA 4MVAA 5G1YA 3TCEA 3VE7A 1TV8A 3NEVA 1ALDA 4O10A 2YCEA 1AL7A 4LVFA 3VFLA 3A21A 1H5YA 1EWEA 1G4TA 2H8XA 3JR2A 1VCVA 1SQ7A 2DZTA 1TIMA 5K9XA 3HPZA 1CI1A 3PUEA 2ZZ5A 5EY5A 4N6EA 3L66A 5CPLA 1PCKA 4LOCA 4EF8A 4JTFA 4ZZ9A 2ISWA 4AWSA 2G95A 2NUYA 2QCEA 2KZHA 2VFHA 5D37A 3TIMA 1SPQA 3E96A 4TMCA 3UWWA 3LGEA 1EP3A 3HPSA 1GG0A 3TSDA 1WBHA 2NLIA 2P0OA 5AHFA 2E68A 1S5VA 2DJLA 2VFDA 3GNNA 3KOFA 4C1LA 3B04A 1I2NA 3G18A 2VFGA 4Y90A 1GEQA 4UIOA 3G1SA 3RLUA 3NG3A 4ZQPA 3SW6A 3NR0A 3W7RA 3GB6A 1ZENA 2BX7A 3TSBA 3W7QA 1D3GA 3VCRA 1X6UA 4S2CA 5KITA 1XCFA 3EX1A 4EOUA 2ZTKA 3U6WA 2WSRA 2VXNA 4PODA 1SFJA 3NOEA 3C56A 3WJZA 2NUXA 4O1CA 4O13A 4PEKA 1KV5A 1LRNA 1EIXA 5DY2A 4M6QA 3RMJA 5KSWA 3FJLA 3HGJA 5E93A 1WDWA 2PE4A 1WQ5A 4FNTA 3VI2A 5J5DA 5AFDA 1VYSX 1W5QA 4MZ1A 3CU2A 3NQEA 1FX6A 3M16A 2A85A 2D73A 5DN1A 2ISSA 3SIZA 3ZS4A 1F6PA 2AAMA 2NX3A 4O19A 1R30A 3Q37A 4O15A 1KLZA 3W86A 3HBLA 2C14A 2ZCGA 3B8DA 2GVJA 3DKJA 4HPJA 4LV9A 1OHLA 1P1XA 2P10A 4K38A 2ZA1A 1W5NA 3C3NA 1A5BA 3EEGA 1T0OA 4R34A 1VRDA 3PG9A 4DELA 4YXGA 4NZFA 2A0NA 2BWGA 1FWRA 2V30A 2Y85A 1XI3A 4LV4A 4QNEA 4DO5A 3PBUA 3DENA 4IMGA 3PM6A 4NNAA 3O6YX 3MJYA 1EX5A 4JTLA 3OHIA 2CZDA 4FHAA 3E49A 3A23A 4N2YA 4PL1A 3PR2A 4BI7A 1OFEA 1YLVA 1KFJA 3Q2DA 5KMYA 2Z1BA 1LDCA 1JUKA 4JS3A 5F2MA 1DJNA 1OX4B 5D2WA 1YXYA 1JJKA 2A1YA 2QCDB 2HSAA 4RR4A 1PL9A 2YFNA 1BWLA 4WUIA 5DELA 3W76A 2R94A 1ICSA 3L67A 4X22A 3HF3A 1KFLA 4UTWA 2QJGA 4NJHA 2DJXA 1SW3A 4W9TA 4AMAA 1WOAA 4E2BA 1KM5A 3TAKA 2QDHA 3MI2A 1GTEA 2V82A 1FY6A 3GYEA 1EA0A 4UMBA 1GPWA 1H7XA 5HINA 3GDMA 1SSDA 3W2MA 1YDOA 4R7JA 5K9CA 3AO0A 3R13A 4MY9A 1G7UA 5FF4A 1M6JA 2WSQA 3L0NA 2QF7A 1FDYA 3LXAA 3NDOA 1FCQA 4HNNA 4FB7A 2B7PA 3ZFHA 1GVRA 3CIWA 3G3MA 3W7OA 1TPEA 1KM0A 2A6LA 3QSRA 3TDFA 1TPB1 4MUZA 1XM3A 3PSWA 3QSTA 3DFSA 5BMXA 1KFEA 1P0KA 3KVMA 2YPIA 2NX9A 2V8ZA 4UTTC 2OX1A 3S9YA 1LYXA 4KWVA 4CQ8A 1D3HA 3FIGA 3UWQA 3CC1A 1ML1A 1NAL1 5KZMA 5D38A 4JYDA 4A29A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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