3TKFA

1.5 angstrom resolution crystal structure of k135m mutant of transaldolase b (tala) from francisella tularensis in complex with sedoheptulose 7-phosphate.
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
320
structure length
310
Chain Sequence
QKSVLEQLKQVTMVVADTGDFELIKKYKPVDATTNPSLILKAVKEQKYSNLVAETISKVKANNPDLNSDDLVKEIAIEILVSFGIKILDVIEGKVSSEVDARVSFNSATTIDYAKRIIARYESNGIPKDRVLIMIAATWEGIKAAKLLQKEGINCNLTLIFDKAQAKACAEAGVYLVSPFVGRITDWQMQQNNLKTFPAIADDDGVNSVKAIYKLYKSHGFKTIVMGASFRNVEQVIALAGCDALTISPVLLEELKNRDEHLEVKLTQISEADFRWLMNENAMATHKLAEGIRLFTKDTIELENIIKQNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
publication title Adherence to Burgi-Dunitz stereochemical principles requires significant structural rearrangements in Schiff-base formation: insights from transaldolase complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transaldolase
total genus 135
structure length 310
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tkfA00
1VCFA 2GUUA 2YX0A 4K8EA 1HG3A 5BMWA 3LLDA 1KM3A 4S2BA 1TPDA 1ZAIA 3C2FA 3L2IA 5GVJA 4NXKA 2V0TA 1Q6RA 3MWAA 3O06A 3UZJA 2X1RA 3Q58A 1TPEA 1H7RA 3L5MA 1I2PA 1GVRA 2QDGA 3W85A 3NQAA 3TQVA 3C52A 2W79A 1KLZA 3DGRA 1F73A 5AHMA 3TXZA 1H7WA 1N7KA 3CB8A 4AWSA 3NQEA 4A2SA 3YPIA 1EWEA 1LDCA 5KITA 2RHGA 1RZMA 3BV4A 1R2SA 3KRZA 4NJKA 4XKYB 3GXTA 2HMCA 1YADA 4HHPA 2Y85A 1H1YA 4R53A 4DF1A 4DF2A 1H63A 3R2GA 3GDMA 4BFAA 4CCDA 4JN6A 2JKEA 4JTTA 3LI0A 3MUXA 2DP3A 4O53A 4CCCA 3PBUA 4OT7A 4TMCA 2ZA3A 1IF2A 1OK6A 4NJGA 4JTIA 2ZRUA 4JTSA 4DO4A 3IRDA 3THAA 1A5AA 1NF0A 3P60A 4MY8A 2YDAA 1TB3A 3TJXA 3TSBA 4DPQA 3NYZA 1OVDA 1FUYA 3RNDA 1TO3A 1S5VA 2GPTA 1F2JA 3L5LA 2WNZA 4A2RA 1G4SA 5AHIA 3DFQA 4FB7A 3ATYA 4MLJA 2ZZ3A 4JX4A 2GJNA 3LHZA 3M44A 3UY8A 1QCWA 2R8WA 3M16A 4WY0A 3GDLA 4UXDA 3WK2A 4JNMA 4DXVA 1XL9A 4ORMA 3UWQA 1EP1A 3DI1A 3TH6A 3W1AA 4WOZA 2B7PA 3NDOA 2JBMA 3GVGA 1JCNA 3HG4A 5EBUA 2Y89A 3W7MA 3O6DA 4AWTA 5LHFA 1VCGA 1A5CA 3G0XA 3HPXA 3TW6A 4KWVA 4GJ1A 1JVNA 1XBXA 1H7OA 1TTIA 1GWJA 3AO0A 3QFEA 3NQ2A 3UYCA 1KV8A 3UY7A 1ZAHA 1FXPA 3Q37A 4W9TA 5MHBA 3A24A 2YZRA 1YXCA 1VQTA 4O8RA 1LCOA 1LOSA 3W7NA 3W70A 4CQAA 1RV8A 3MP3A 1G7VA 1PCWA 3G0UA 3EWBX 4UTTC 2OT1A 4ADSA 3HQ1A 3MI2A 2Q3RA 4PA8A 2A85A 1JR1A 4YL2A 4JTKA 4GWEA 4UFKA 3W6YA 3NQ7A 4LUIA 3NPWA 4PL1A 1J5TA 1B9BA 3P82A 5CG7A 1SZEA 3W7LA 4JIPA 2A4AA 1A5BA 2YR1A 3GAKA 2V30A 4UTTA 1X1ZA 4NUWA 4ALDA 3P81A 5I3JA 3G1VA 5AC6A 1NVMA 3BW4A 2FB3A 4ZQMA 4Z08A 4Z1AA 4O50A 3I7QA 4FX7A 1FQ0A 1SO3A 2XN1A 4MKNA 4LVAA 1LOQA 1DHPA 5HR7A 1JRBA 1EP3A 5BRBA 3ZWSA 4UFJA 4ZQCA 5DY3A 4Z1DA 1FX6A 1PL9A 5HINA 1RD5A 3GLCA 1OF6A 3U8GA 4ZQNA 1CX9A 4MYAA 1O94A 1S5WA 2F7FA 4IMDA 1CI1A 2X30A 4LRSA 5EPDA 3BG9A 1GVSA 3ZR4A 2QUTA 4UR8A 1LOLA 3HG3A 2HTMA 3PY2A 4MZYA 2WPBA 3C2RA 2HSAA 4QIUA 1W1ZA 1LYXA 2ZA1A 1RQEA 3IIXA 2KZHA 3I6RA 4DBEA 4UFHA 1W5NA 2AAMA 1AL8A 4IGHA 2DZPA 4HSOA 3FYPA 3EX2A 3EWXA 1OYBA 1FWNA 4Q33A 3STEA 1QFEA 2ZZ2A 1KFBA 1SUXA 3INPA 5FESA 3BW3A 1W37A 1F05A 4FNTA 4U28A 4GUIA 1W0MA 1SPQA 2QCCA 2RDWA 3SGUA 5DBTA 2G5WA 2WNNA 1LM1A 4O54A 4ZL1A 3L0GA 4O18A 4NJJA 5AFDA 4OU1A 3C6CA 3KVMA 4M19A 4GUFA 2TYSA 3L65A 3GXNA 2C14A 2E5BA 3W73A 5HR6A 4Z1CA 4TX9A 1F5ZA 2C6QA 2BTMA 2FIQA 3B0UX 5KTLA 1TTJA 3KRSA 2F84A 2FPYA 4QSHA 3TAKA 5AHEA 1EPXA 1LBMA 5DCDA 2A5HA 2DZWA 3HO8A 4FNPA 4YCPA 4UFLA 5FF7A 3DENA 4XBKA 3A22A 1FXQA 3NPXA 1YDOA 1QR7A 2V9DA 1RVGA 2Z6JA 4RCXA 4O0KA 3NO5A 5DY2A 4YMZA 4LT9A 2R14A 1SFJA 2VFGA 2A7PA 1OFDA 1O95A 2J27A 3VNDA 3LTPA 5LNUA 4GUJA 4UTLA 4XQ6A 3TQ0A 2Y62A 4UIOA 4JR5A 1E51A 3NXFA 5HMSA 5K9XA 4BWLC 1NSJA 2ZTKA 1H61A 1FWWA 4O15A 3M1ZA 4HKPA 3GZ3A 3S5OA 1TPVA 3PBVA 4YWIA 1K8YA 3ATZA 4UTKA 4HNNA 3WJXA 3TIMA 3P5YA 1ZAJA 4B5NA 2FJKA 3P84A 4OWGA 3E0IA 2CZDA 2QJIA 4PFMA 3TW7A 3N2XA 4IX0A 2NZLA 3T78A 5LGZA 2OJPA 3NPUA 5C2XA 3TMLA 1VS1A 3TR2A 2QCLA 5G1TA 2VOMA 2C18A 1ONRA 2PC4A 1SFLA 4FEZA 1GVQA 3EX4A 1LTDA 3QYQA 1W56A 1HO1A 3TSMA 5IM51 1H60A 4IQLA 3MMTA 3C0JA 3VI2A 2ZRXA 4I7WA 3RFAA 5FEPA 3G22A 2GOUA 5DELA 4OQVA 2CU0A 5EL1A 5J5RA 1D3HA 4A29A 1VHCA 5CZTA 4IPJA 3UPWA 3CIXA 3W1MA 5LNVA 1P1XA 3W83A 2OT0A 3W1XA 5CZSA 5DXXA 1P5BA 2E6DA 2PRHA 3LRMA 3PUDA 2CLHA 3W7PA 4P2VA 4ZMGA 1IXQA 3C2OA 3MHFA 3NM3A 1H50A 4ML9A 2V8ZA 4EF9A 1LORA 4WZHA 1WAUA 1JULA 1SSGA 4JTHA 3DFSA 4BF9A 2C0AA 4HNVA 1FBAA 1ZHAA 1ZJIA 4A22A 4UUIA 1TPH1 1TQXA 3LTSA 4KKXA 1S5TA 1EB3A 3DKLA 4GC4A 2YYTA 4MVAA 5D37A 3I65A 2A21A 2GQ8A 1QMLA 5AHFA 4WY0B 2ZRZA 2OZ0A 3NZRA 1EEPA 1HUVA 4OBTA 4PTNA 3PG9A 3KFTA 2QCMA 3RF9A 4OGZA 2R91A 4IWWA 4C1KA 1YTDA 3LGEA 4NU7A 3KVJA 1K03A 4I9AA 4N2YA 5AC8A 4O12A 2E09A 3DFTA 3NQGA 3CC1A 2EPHA 3U6WA 2EF9A 4O17A 5AB3A 4YXGA 1FDJA 4NQ1A 3TFCA 1UUOA 1G4PA 5U7SA 1OYAA 5DLCA 4BI6A 3L5AA 2A7RA 4JTLA 3GDTA 4EVZA 5C5YA 1JCLA 3TQKA 1AK5A 4MZ8A 2E5CA 5D2XA 5KMYA 4IPIA 3STGA 3UWVA 3HIJA 2Y6ZA 3CM4A 4JX5A 1JCJA 4LRTA 1XM3A 1OX6A 3DKJA 1HL2A 2Z1BA 3E49A 5CGQA 4Z1BA 3PAJA 1G4EA 5E1QA 2QKFA 5D30A 1UB3A 3CWOX 5F2MA 4AB4A 1QO2A 1I2RA 1VH7A 3IIOA 5K9DA 1YTKA 2P0OA 3MP4A 3MI3A 5ABTA 1PCKA 2GVJA 5FF2A 3LV6A 3UWYA 2AQWA 2E68A 2ZZ4A 3ABSA 1XC4A 2NXHA 1Z41A 3M5ZA 4R34A 3MI6A 1GJPA 1PS9A 1W54A 3PBWA 5I3FA 3EX6A 1Z42A 3PULA 2QCEA 2QUUA 2FPTA 3QF0A 4AHQA 4OE7A 1T99A 4UCGA 4D2JA 3GB6A 3L66A 1XXXA 2YGYA 3QEZA 1F6PA 1C8VA 2NWRA 3G1SA 1W5QA 3B06A 2QR6A 5CZJA 1KFKA 3NZ1A 2C3ZA 2QCHA 1TPB1 2DJLA 1RR2A 3LM7A 1XBVA 2EHHA 3NL3A 5HUPA 5TIMA 2B7NA 3OEXA 1SSDA 4HNTA 5EMUA 3KX6A 3QH2A 4FIQA 4HPXA 3FLUA 5LZLA 3FJLA 4M6PA 4AHPA 2Z0IA 1I2NA 4O14A 1QO5A 4TO8A 3VE9A 1A50A 2ATMA 1Z44A 4LU0A 2ZRVA 3LHWA 2YFNA 3MBFA 2QAFA 4UMAA 3HGOA 1SW7A 4POCA 1AW5A 2Q3OA 4N9DA 4H6KA 1SZGA 3PB2A 1SW3A 1U83A 2CLFA 2DU2A 1AG1O 1VYPX 3EKZA 3L0NA 4LY8A 1QAPA 3TUUA 1OX5A 3TC7A 2TRSA 4XTDA 1W3NA 3TX9A 1KTNA 2ZCGA 1ZCOA 3HG5A 3TC6A 3W1UA 1FCQA 3LLFA 3BARA 1F6KA 3R5EA 3QZEA 4GBUA 3C2EA 5E0KA 2NX3A 1R46A 2YCEA 4G1KA 4OV9A 3W2JA 1MSSA 1Q45A 1W5PA 2IQTA 3NAVA 4M6QA 2V5LA 1DQWA 3P61A 3GX9A 5I3GA 3SECA 4TU1A 2DZTA 2PRLA 1S3HA 3PWAA 2V5BA 1TQJA 3E9AA 1AL7A 2Z2UA 4A3UA 4AHOA 1YYAA 3P5ZA 2PE4A 4EF8A 1JQVA 3GKAA 3MYPA 2V81A 3R12A 3O6YX 3LB0A 3IGUA 3I7SA 4KFPA 1XUUA 4LVGA 3LHVA 2H90A 3DXIA 3IEBA 1T0OA 4WUIA 5CZ0A 1GG1A 3EWUA 3H53A 4OV4A 1LLZA 3H55A 2H3BA 2NLIA 2R94A 2NV2A 5AOUA 3BLEA 4O4VA 2Z6IA 3EB2A 3OG3A 1TTPA 3GR7A 4O16A 1QPNA 4UTWC 3S9YA 2QCGA 1XI3A 2YYUA 4AWUA 4RZ5A 5KZEA 5F4WA 5D02A 1YPIA 1QDSA 4GRSA 1ICSA 3O16A 1FCBA 1MXSA 4RLIA 2XN0A 2WV8A 1V7YA 3CPRA 4UTWA 2Y7GA 3KOFA 5K7JA 4ADTA 2O7SA 4AAJA 3W23A 3QPYA 2RDUA 3W86A 3O8AA 1OABA 1K3UA 4MY9A 4FF7A 3GNDA 4GUHA 4DEFA 3GYEA 1WBHA 5FF0A 5K4ZA 3W22A 1ICQA 7TIMA 1GZGA 4N02A 3G1FA 3GKFA 3W7OA 3PC0A 2BZNA 1R47A 2TPSA 1LRQA 1TIMA 4O11A 2ABBA 1GPWA 1TCDA 3TMQA 1VYSX 4K38A 3GXPA 1DBTA 2B7OA 3FJ6A 4FNSA 1SZNA 2TSYA 3TFXA 5EY5A 3AJXA 4UR7A 2E6FA 1TREA 4FO4A 2A2IA 4AEOA 4QNWA 3T7VA 3STFA 3OHIA 3FS2A 5I3HA 3FIGA 1VGAA 1ZENA 3HG2A 1OX4A 5HWJA 2QJGA 5F4SA 4NNBA 2C13A 3M6YA 1LRNA 1KFEA 4ONVA 2XFWA 4NJHA 5G1YA 3W7CA 4JY8A 4RX0A 5AHNA 1RQBA 4WD0A 3MBDA 4LC8A 4JDBA 6ALDA 3G0SA 4LC6A 1TJRA 3NG3A 2QDHA 4UTMA 5H91A 3MYOA 1FDZA 4O1CA 4UTUA 1PVNA 2G96A 1WOBA 2ISWA 3NEVA 3W7GA 3H54A 5CPLA 3WJYA 4PL2A 3W7JA 5FEZA 5F1UA 3M5VA 4IJBA 1SO5A 1OFAA 3Q2DA 1K02A 4IMFA 5D05A 2NXIA 2ZQ0A 3IVUA 2YSWA 1MZHA 4L4LA 3GK0A 3OVQA 5G2IA 3NQCA 5SWUA 4M5PA 1WYIA 4FHAA 1UUMA 3ABOA 2ZYFA 1KTBA 4RR4A 5FEWA 3BGJA 4UTJA 3CIWA 3W71A 1VRDA 4MPQA 1Q3NA 5A8GA 1GVFA 1VHNA 3PUEA 1KM5A 1M7OA 4JTEA 1OG0A 3PSWA 5AN7A 3IVSA 2VFDA 5CPMA 2FTPA 2H8ZA 4Q4KA 1J4EA 4JS3A 3SIZA 2OMAA 1FWTA 4N9BA 5T26A 1P0KA 4LUJA 1EUNA 3I68A 3V75A 4E0CA 3K30A 1OF8A 3C4UA 3FKKA 1OK4A 1EP2A 4M7SA 3E96A 5D04C 4DQWA 3W2KA 3W74A 3WK0A 1ZFJA 4M7TA 4O28A 1ZALA 2Y7DA 1I8JA 1TTQA 3CEPA 2ATSA 4S1FA 1AW2A 4J9JA 2QCDA 4NX5A 3JR2A 2D73A 3O15A 4DPPA 4S2CA 3SFKA 5D38A 2I9EA 3M41A 3B4UA 5LNSA 3T4CA 1XDMA 3IGSA 2B7QA 4GE8A 1TPFA 3N2MA 4IOTA 2VEKA 1B3OA 2GVLA 4IUOA 5F2LA 2CZ5A 1LRTA 2DZSA 1H1ZA 1O60A 3S42A 5HWMA 3IVTA 3W07A 5D09A 3DFPA 3USBA 5KSWA 3SY5A 3HGSA 4X3ZA 4LV9A 5LGXA 3KHJA 1DOSA 1LBLA 3B0VC 4LV4A 1WXJA 4JY9A 4H4IA 2E77A 1BEUA 3BGGA 4BWLA 3L9CA 2WSQA 3G8RA 4LW7A 1BTMA 5K4XA 3VFLA 3DZ1A 1EIXA 3LX9A 4UTIA 1QWGA 1EUAA 1THFD 2NUWA 4LTSA 1H7NA 4QAIA 1IIHA 1MO0A 2H3DA 2W6RA 4C1LA 3M7WA 1RPXA 1X8FA 2G95A 4JEQA 2C16A 4JTFA 4E2DA 1BWKA 3P7YA 4JX6A 1GVOA 3SZ8A 5F4XA 1GG0A 3LBCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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