3TNOA

1.65 angstrom resolution crystal structure of transaldolase b (tala) from francisella tularensis in covalent complex with sedoheptulose-7-phosphate
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
QKSVLEQLKQVTMVVADTGDFELIKKYKPVDATTNPSLILKAVKEQKYSNLVAETISKVKANNPDLNSDDLVKEIAIEILVSFGIKILDVIEGKVSSEVDARVSFNSATTIDYAKRIIARYESNGIPKDRVLIKIAATWEGIKAAKLLQKEGINCNLTLIFDKAQAKACAEAGVYLVSPFVGRITDWQMQQNNLKTFPAIADDDGVNSVKAIYKLYKSHGFKTIVMGASFRNVEQVIALAGCDALTISPVLLEELKNRDEHLEVKLTKNDDVVTQSPQISEADFRWLMNENAMATHKLAEGIRLFTKDTIELENIIKQNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
publication title Adherence to Burgi-Dunitz stereochemical principles requires significant structural rearrangements in Schiff-base formation: insights from transaldolase complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transaldolase
total genus 144
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tnoA00
1EIXA 1IIHA 2FFCA 4O1AA 4MLRA 1O94A 2KZHA 2DZSA 3NQ7A 5GVJA 5LHFA 3PULA 5AC6A 4H3DA 3CWNA 3GDRA 3GLCA 3T40A 5L9FA 3S9YA 1R2RA 2PCQA 1OK4A 5H91A 3SECA 1SFLA 3TE9A 4HPJA 4HKPA 3W70A 2RDTA 1GG0A 4OE7A 1ZAHA 1Z42A 2Y7GA 1AW1A 3WJWA 1YTEA 1YXDA 3NQMA 4HNVA 3LHUA 2C15A 4E0CA 3TROA 1J2WA 4MJMA 3STEA 1AMKA 4UFLA 5G4EA 3W1QA 2E77A 3GDLA 3P74A 1DBTA 4WX2A 3HPZA 1H7WA 4X9SA 2ATSA 3MBFA 4FNUA 2Y7FA 2E6YA 1VLWA 3OBKA 3GZ3A 4ICNA 4LVDA 2Z2UA 3LXCA 4IOTA 1BWLA 3H54A 4Z1AA 1X1ZA 1L9WA 3KXQA 4P61A 4HSNA 4UTKA 4LV4A 5LNSA 3LGEA 4ZQRA 1IXOA 4IPJA 4IWWA 4QITA 2NLIA 1IXNA 4WUIA 4XKYA 2ZRZA 1TV8A 3P84A 5BMXA 4G1KA 4JTTA 5MHBA 1XM3A 1T8XA 2DZVA 4JN6A 1M5WA 1JRCA 4JY8A 3TW7A 4FX8A 3C56A 1LRNA 3KRZA 4LWWA 3ABRA 3ATZA 1KV5A 1SU5A 1MO0A 4WXZA 4ZZ9A 1YDOA 1BKSA 4M6QA 2YGYA 2YSWA 3GYEA 3GXTA 4AB4A 3RU6A 1OFQA 2VEIA 4EF9A 4DF1A 2RDUA 2D73A 5AYXA 4LOCA 2XFWA 3A21A 1H63A 3HF3A 2Y89A 3O06A 2JBMA 4ORMA 1LOQA 5G2HA 2YFNA 1Z44A 3BO9A 1FWRA 3DXIA 2Y6ZA 4RK8A 3SY5A 4LRTA 4KFPA 3I65A 3MP4A 4DXVA 5D32A 5FEWA 4LUIA 4ZQNA 4FF7A 1F7BA 4Y8FA 5A5WA 3G22A 2ZZ1A 3HIJA 1WOAA 5C6MA 5AYZA 4LVBA 4O50A 5TIMA 3QQ1A 2E1DA 2WNQA 3M0ZA 2NWRA 2QJGA 2I1OA 3NZ1A 1PIIA 4XTDA 2X1RA 5U7SA 3TNOA 3G1VA 3NQFA 3UWZA 4UR7A 1XBYA 4OQVA 2JKAA 2ZRUA 3PBUA 4FIQA 1UUMA 1VR6A 1TQXA 1KM2A 1WAUA 3GX9A 2JGYA 4R33A 3UWWA 4WXYA 5G2WA 3P62A 3HQ1A 3TH6A 2OT0A 4ALDA 1XBZA 1IIGA 1FCQA 3ABSA 5F2LA 1OJXA 3W2KA 2CU0A 3LM7A 1VCFA 3G3MA 3L67A 2QUUA 4I9AA 1VLIA 1LDCA 4YWIA 3I6RA 1X8FA 2V8ZA 4GJ1A 5K3VA 3JRKA 2VXNA 1DL3A 4A29A 5K9XA 1OG0A 2ZTJA 1JUKA 3LHZA 3GDTA 3NL2A 6TIMA 3HPXA 4PCFA 4RXGA 3THAA 1OX6A 2HTMA 1N55A 1KLZA 2E5DA 3LCGA 5FF3A 3IVSA 3UWYA 2QUTA 4PFMA 3W83A 1SW3A 4UCGA 5AOUA 1VPXA 1EUAA 3CC1A 1QPQA 3IIVA 3B05A 3NPUA 1LORA 4O10A 5FI8A 1L2UA 2HMCA 2VENA 3PSWA 5AFDA 1Q6QA 4O28A 4O19A 3PUDA 5G2IA 3TDFA 5F2GA 2OX1A 2QJHA 4Z0JA 4ONVA 3PG8A 1JCMP 3TUUA 1W5NA 3C2VA 3DFQA 3UY7A 1LOSA 2B7OA 4K38A 3EWWA 5LNWA 4MFEA 3S1UA 2NUWA 3S6DA 5L6UA 3W7LA 3E02A 5HWNA 2FPYA 3P7YA 1D9EA 1WBJA 2YYTA 2IQTA 4OGZA 1OK6A 1QDSA 1K8YA 5DLCA 1D3HA 2I14A 1Q45A 5D38A 4K37A 3DI0A 4HSOA 3G0XA 4RZ5A 1S3HA 2CLKA 5DCBA 1G4TA 1HUVA 5FEXA 3CU2A 8TIMA 3TV8A 2NZLA 2W79A 1GJPA 4EOUA 1Q6OA 1KFBA 3EEGA 4JX4A 5G4WA 5LZLA 3KX6A 5D30A 4PODA 3MI2A 1XBXA 3QEZA 5CZSA 3BW3A 3FLUA 3BLIA 3MJYA 3DBPA 3QFEA 4UIOA 4S2BA 5D33A 2E68A 3CHVA 3Q37A 3EX6A 5TQLA 1KFEA 3D0CA 1MEWA 4GUGA 3UXAA 1W37A 4FNQA 3FS2A 1F73A 4JTKA 1PHQA 4K36A 1NSJA 4M6VA 1UB3A 1TRDA 4AVFA 1RPXA 2PRHA 3MW7A 2GVGA 3S5NA 3B0UX 1XL9A 5EY5A 3W7NA 1JULA 3B8DA 4PC8A 4JS3A 1O4UA 1VRDA 1GTEA 3TQKA 4IMFA 4WY0F 5DBTA 3IEBA 3CTLA 3S5OA 1B9BA 5DBUA 5HUPA 4Y9AA 2NX3A 4DPPA 3K30A 4OHQA 4XQ6A 3C2OA 2YR1A 5J5RA 3BLFA 1PL9A 1T96A 1LTDA 5D05A 2YFOA 2YW3A 3HGRA 2PRLA 3O8AA 3L0NA 3NA8A 5FF2A 2A21A 4PH6A 3OEXA 1TTIA 2P10A 4A2SA 4K8HA 5CKSA 5HNRA 1OFAA 2LLEA 4FNTA 4JX5A 2DZXA 1L6YA 4K6AA 3M16A 3LV6A 1FCUA 3QW4B 3GIYA 4DQWA 3NL5A 1XFBA 3P5YA 3W2JA 3W1LA 3MWAA 4GE8A 4DF2A 2QDHA 3LXBA 4R53A 2ZA2A 3W75A 1VZWA 1FX6A 3LHWA 3NAVA 1TTQA 1WDWA 1RZMA 1G4PA 5TBOA 3QSRA 1KFLA 4EWND 4XKYB 3W7IA 4O12A 3LCXA 4AF0A 3B4UA 4CQ9A 2WSYA 2QCDA 4NXKA 3L5AA 5AHLA 2AAMA 2A4AA 4L4MA 5AHIA 3KHJA 4LS2A 5E0KA 3MI3A 3MBDA 4Z08A 4RR4A 5DXYA 3QW3A 2TPSA 2CLMA 3ZWSA 2QCGA 1KTCA 5FEZA 7TIMA 5HINA 5HR7A 1F6PA 3BGJA 3EWZA 1SPQA 5AYYA 3QM3A 4ADSA 2R8WA 2V2CA 3CWOX 5C54A 1YXYA 5EKYA 1VJIA 2J88A 3STCA 3W7QA 2PRMA 4LUJA 3O63A 5AHNA 1XUZA 1VHNA 1VYPX 3U6WA 4R34A 1C9DA 1H1ZA 4QSHA 1NF7A 3LBMA 4DBDA 1VHCA 5F4SA 3C6CA 1F05A 3NEVA 3TJLA 3HJZA 2TMDA 3OVPA 5CGQA 1VYSX 5E1QA 3LB0A 5LHEA 3RNDA 3GK0A 4NNCA 2WKJA 4FXSA 5EMUA 4CQAA 3QQ0A 5G5IA 1TYGA 5C55A 3LI0A 3U2OA 2QCFA 2A6NA 3BW4A 3PBYA 4S1FA 4E2DA 3NQ8A 3WK1A 4CCDA 4PL2A 2ZRXA 2ATMA 2WSRA 3O15A 1MEHA 3MUXA 4QIUA 4JDYA 3PBVA 2VFFA 4K7VA 2YXGA 5CG7A 1SZGA 5AC7A 3EWXA 4O57A 2Z6JA 1R2TA 3P8JA 2BWGA 2E6AA 3W7RA 3QPZA 4HT3A 3TFCA 2EKCA 4XBSA 4FNSA 4GXMA 1LOLA 1WV2A 4GRSA 4JICA 3HPSA 4OT7A 3W23A 3TXZA 4DO5A 2DJXA 2BX7A 3RF9A 2YDAA 3KFTA 3EWYA 4Y6GA 3P80A 4MJZA 1KM3A 3DGRA 4M19A 3HGOA 2P0OA 1K8ZA 3HBLA 3PVFA 1TREA 1EWEA 1TPC1 2Y7EA 5EL1A 4Z0SA 4AWTA 4N9CA 3B04A 2ZRVA 4XTIA 3LTSA 4NXSA 3GVGA 3UYCA 1LLWA 2G96A 4AHPA 1M7PA 4JTLA 1SO5A 2NXGA 3LDVA 2YPIA 3W7HA 3LXAA 2H8ZA 3PUOA 4O8RA 1XBVA 1FWSA 3IIOA 3CM4A 5EYWA 1FWWA 4OU1A 3TMLA 1RV8A 2H3BA 3B0PA 3L0KA 3B03A 2EAWA 2H3DA 1YDVA 4I7UA 5CPLA 3BLEA 1H7PA 3FYOA 4LT9A 2WQPA 1Q6RA 2OMAA 3NQEA 4NUWA 4LRSA 3S1VA 4HNUA 2TSYA 5AB3A 2A6LA 3H55A 5A8GA 1TPEA 5F1UA 3LLFA 4UFHA 4JEQA 2QCEA 5DELA 3W7JA 3C52A 1ONRA 1VYRA 4NU7A 3NM3A 3N3MA 3CIWA 2ZZ5A 5CPOA 4O0KA 1ALDA 4NQ1A 2CW6A 3PBWA 4WZHA 2ZZ6A 5FF0A 5G1YA 2O7SA 1O60A 3EX3A 4YMZA 3TAOA 2ZCGA 2VFDA 5DCDA 3LBCA 5IM51 1QPRA 2Y70A 4MVAA 1AK5A 4KWVA 3ABQA 2RKXA 4UTJA 1YYAA 2CLHA 3E96A 1QFEA 4EIVA 2I9EA 1GVSA 1WQ5A 1A50A 3ZFHA 4BI5A 4PEKA 3TAKA 3C0JA 4O16A 1JJKA 5HQEA 1U5JA 4P2VA 3W1RA 2RFGA 2QR6A 1XCFA 3PS7A 1OYBA 3W7EA 1JQXA 2EPHA 3WJZA 2ZA3A 1VS1A 4MPQA 3HGSA 3LCIA 5DY3A 4XZ9A 2WNNA 2FB3A 3MO7A 3O07A 4NX5A 2E6DA 1S5TA 3MP5A 2A5HA 1H7OA 3FEMA 1R46A 4HHPA 2TYSA 4N2YA 3DFOA 1B4EA 1FUYA 3GAYA 3CIXA 4UNKA 4JTUA 5H2ZA 4RXFA 2QJIA 2OT1A 3UPWA 4Z1DA 1QOPA 2J24A 1LCOA 4O18A 3M6YA 1GVFA 1TTPA 1JCJA 3L5MA 1AG1O 4K7YA 2Q8ZA 1XUUA 4FNPA 3LCFA 1Q6LA 3UWVA 3PC0A 3S0CA 4GC4A 3IVUA 2C16A 4UFJA 4UTTC 4FX7A 3VE9A 1S5VA 4M7SA 1AW2A 1PV8A 4O4VA 4LS1A 5CPNA 1XDLA 3SZ8A 1X6UA 1KV8A 4N6FA 2XN2A 4JIPA 5K9DA 3P8IA 3INPA 3M7WA 5LGXA 3NL6A 1QAPA 1YTKA 2ZRWA 1GVRA 3BK0A 3GKFA 1YADA 5AHFA 4LU0A 1MXSA 3MYPA 2R94A 3DZ1A 3TJXA 2VEMA 3BW2A 1GVOA 1LBLA 3A5FA 3TMQA 2WO5A 1ZY9A 3STGA 2V2DA 2GVJA 1DKWA 1TPVA 3W74A 3FJLA 3MMTA 4AF0B 3NM1A 2GJNA 3W2UA 1OYAA 2W6RA 4UTHA 2QCDB 4UXDA 3NNTA 5I3HA 4QAIA 3S42A 5KITA 2VFIA 1FBAA 1ZCOA 4FO4A 4JTJA 1W54A 4UMAA 4A2RA 5K4ZA 4MY9A 4O53A 4GUJA 1PCWA 3KOFA 1B3OA 3W1PA 3BPWA 3IV3A 4UR8A 3W2LA 4NJHA 3CB8A 1SR9A 1RQEA 1WOBA 3R2GA 3DKLA 3G1FA 3R12A 4MZ1A 3TQVA 3F4NA 3GXNA 4N9BA 1EEPA 3UXDA 3W2NA 1Y0EA 3EXRA 1TSIA 2AQWA 1I2OA 2J9YA 3TCEA 3CT7A 3TIMA 4WQ6A 2VKZG 1EA0A 2Y61A 3NYZA 3T55A 2Z0IA 2HS8A 1VCGA 1WYIA 3PSVA 3NQCA 3KVMA 3IGXA 2V82A 5F4XA 3M5XA 2QAPA 1EB3A 4ADUA 2Q3RA 3W9ZA 1BTMA 3BGGA 1C29A 4YLWA 4MOZA 4TR9A 1WBHA 1A5SA 2BLEA 2ISVA 5HUOA 4N4PA 3CEPA 3W71A 1F76A 3SSJA 1KM4A 2X1SA 4JIQA 4WY0A 2H6RA 2CLFA 3W1XA 2A7PA 3AJXA 2VC6A 4N4QA 3MHFA 1PS9A 3HG5A 1JUBA 3W6YA 5CSRA 3EKLA 5HULA 4XBKA 5I3GA 4JNMA 1OX4A 2B0MA 1SZEA 2V9DA 1JCXA 3LLDA 2FPVA 1JR1A 3TR2A 4O0ZA 4IMDA 4QQ3A 2ZZ7A 2HSAA 3L65A 4JTGA 1I2QA 4UFKA 4LC6A 2YW4A 3OVQA 2XN0A 2RDWA 5FF7A 2NWSA 3H53A 3W86A 4JGDA 1KM5A 4JYEA 1KLYA 1TPWA 4X22A 2C0AA 5BRBA 3C4UA 2NX9A 4MY1A 3TKFA 4QNWA 1GOXA 1I8JA 1LRTA 2EGZA 5HWMA 3GDMA 2V5BA 3U8GA 2ISWA 3C2EA 4CCCA 2B4GA 3FA5A 4LV9A 3THQA 3RFAA 2J27A 3P60A 3W87A 2F84A 4DO6A 1QMLA 4B5NA 4AMAA 1PCKA 5LKYA 1OFRA 1ZALA 1VQTA 3WK0A 1SUXA 3QMTA 1L6SA 3LCLA 3HMJG 1AL8A 3PAJA 3W7CA 1SO6A 2ABAA 3A24A 4OV4A 5LNUA 4NVTA 2C14A 1K3UA 3BVJA 1LZOA 2VOMA 4AHOA 3IIPA 4MLJA 3E9AA 1AW5A 2GJLA 2QAFA 1X7FA 1W5QA 5F4WA 4BK9A 4O15A 1SZFA 1YDNA 3N73A 2YX0A 4Q32A 4GUHA 4UFIA 4Z1CA 1F2JA 5LNRA 3HO8A 4ZQCA 2X1UA 1OFBA 2FDSA 5D04C 1TPUA 3G8RA 3W07A 4O11A 3M44A 3FYPA 3AO0A 1H7NA 5ABTA 1IF2A 5I3FA 5F2IA 4M6PA 4J9JA 4PTNA 1EX5A 2FQIA 5I3KA 5I3JA 5FESA 3HOJA 2FIQA 3VI2A 3LX9A 1X1OA 4RX0A 4HNNA 1QWGA 2ZYFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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