3TSB | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	490
structure length	490
Chain Sequence	QSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSESGVISDPFFLTPEHQVYDAEHLMGKYRISGVPVVNNLDERKLVGIITNRDMRFIQDYSIKISDVMTKEQLITAPVGTTLSEAEKILQKYKIEKLPLVDNNGVLQGLITIKDIEKVIEFPNSAKDKQGRLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKGSKDRYFQEGNKKLVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLESHPHHVQITKEAPNYS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Bacillus anthracis inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in action: the first bacterial series of structures of phosphate ion-, substrate-, and product-bound complexes. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Bacillus anthracis
total genus	148
structure length	490
sequence length	490
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-09-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3tsbA00

1N7KA 5DBUA 3N2MA 2A4AA 3UWWA 2ZBTA 3T44A 3G0UA 3HB9A 4AVFA 3SJ3A 1EB3A 3IVTA 2E6AA 3LM7A 4N02A 1K7EA 2V0TA 1AL8A 3IIZA 4O4VA 4UTIA 3GK0A 4BI7A 2C18A 4MZ8A 2E5BA 4DO5A 1OHLA 2A85A 3W2KA 1TTPA 3LCXA 1F6PA 2CLOA 2WNNA 1VLIA 1J2WA 5KZDA 4ML9A 2QCEA 3E96A 4MY9A 4O0ZA 4FX6M 3R2GA 4JTJA 5D38A 3G22A 1FCBA 2XN0A 1XBXA 5K3VA 2NUWA 4IPIA 2VEMA 2XN1A 3G1HA 1NVMA 4K7VA 3PG8A 4RX0A 1WQ5A 4M7SA 3TA6A 2HSAA 2DORA 2X2GA 3L68A 2Z6IA 4EVZA 3NGJA 4IOTA 1KV5A 2Y7DA 4I7VA 2OCZA 4OBTA 4M6PA 1FQ0A 1R2TA 3NPVA 3BW3A 3JR2A 1IIHA 1DOSA 3KRZA 4ONVA 1H1ZA 1FXQA 3KHJA 1J4EA 2E77A 3TKFA 4Y96A 2TSYA 5D04C 5I3JA 3G1YA 4P2VA 1H1YA 3FYOA 3GKFA 3TQVA 4NUWA 2H8XA 3L0GA 3MYPA 4K38A 1TPH1 2QUVA 4NX5A 4O53A 4YWIA 3UWUA 4X9SA 1GG1A 1VYRA 4YL2A 2H8ZA 1GTEA 3MHGA 2CLFA 1JQXA 3CIXA 4NJGA 4QQ3A 4O1CA 3LB0A 3H53A 1LRTA 2YX0A 4IXHA 2ZCGA 5CPNA 4I7UA 3I65A 2AAMA 1EIXA 3DKLA 5KZEA 1SZEA 3FKRA 4UIOA 3P81A 5D33A 5K9XA 1G6CA 1HL2A 3VI2A 1QPOA 3L0NA 3SZ8A 3DZ1A 1M7PA 3O15A 3S1XA 3HPSA 4Y9AA 1KBJA 2WOQA 3IGXA 2ZA3A 3SGZA 3W7GA 3TU9A 4BWLA 3O1NA 1JCYA 3P60A 4UFLA 2QCGA 3DFPA 4HNNA 1JRBA 4FIQA 3TXVA 3O6YX 1KM2A 2FIQA 4UR7A 2NWSA 5CPMA 5CSSA 4JTFA 3P80A 3HQ1A 1KA9F 2ZRXA 1RVGA 2QCCA 2UV8G 2ZZ5A 3DENA 1W56A 4WZHA 5SWUA 4FNQA 3UZ5A 4PCFA 3EWXA 1A5CA 4O0KA 2C15A 3IGUA 4NT0A 2YZRA 3LCHA 2C1HA 1I2RA 3NL6A 4NVTA 4Y6GA 2PCQA 3PBVA 2QCNA 3TJXA 1WV2A 2G5WA 3GAYA 4R7JA 3WJWA 5G5IA 4QAIA 5TIMA 5G2IA 2NUXA 2WSRA 1YTEA 1YXYA 3GNDA 5ABTA 3N3MA 3CEUA 1LP6A 3M47A 3DKJA 3PG9A 1Y0EA 4K37A 4KWVA 3HGSA 1UASA 3GXTA 2B7OA 4CQ9A 3TW6A 1W5OA 5EBUA 3TDFA 1WDWA 3QQ1A 4BFAA 4I9AA 4JTLA 1IIGA 3W7CA 3BW4A 1FDZA 1TPEA 4HNVA 3B4UA 5AYXA 2QUUA 2QCHA 1B4KA 4IJBA 4QSHA 1G7UA 5AHFA 4N9EA 3BPWA 5HQEA 2VEKA 3C2RA 3QMRA 5LGZA 3STEA 2YSWA 4QNEA 2WNZA 5CSRA 3FA5A 3ABRA 4DELA 1VZWA 1HO4A 1L6YA 2EHHA 3BLFA 4GFSA 1QCWA 4LS1A 4ZZ9A 1XDLA 2IQTA 3LLDA 2BTMA 4RJEA 2DJLA 1XUUA 3LBCA 4CQ8A 3GDRA 5AHLA 3S5ZA 3W1LA 3TUUA 3DGRA 1O5KA 1VLWA 2VKZG 4O52A 2GVGA 4MLJA 3LGEA 4HPJA 2VC6A 4UTWC 3DI0A 2W6RA 3F4WA 1XI3A 4MYAA 3W07A 4AB4A 1VQTA 5EMUA 4LNYA 1BWKA 3W1UA 4FXRA 5AB3A 4GUIA 3G3MA 1LLZA 1OX5A 2J9XA 1GT8A 2BX7A 3T40A 3W2NA 4FXSA 3OEXA 4RK8A 3UNDA 3PF3A 1IXNA 1ME9A 4CQAA 1MO0A 3LI0A 4K6AA 4MKNA 2CZ5A 3W1QA 2ISVA 3ATZA 4M5PA 1EX5A 2V2HA 3LCLA 2A6NA 3NA8A 5I3KA 2R94A 3F4NA 1TPB1 4O14A 1LOSA 1KFCA 1H61A 3P82A 2QDHA 1GVFA 3W7DA 1L6WA 3NQ6A 4N4PA 3RU6A 1C8VA 4M6VA 2VEIA 4NZFA 3C4UA 1PHQA 4UTUA 3U8GA 4UTMA 4U28A 3EWZA 4RXGA 3NEVA 2CLEA 4GWEA 4FHAA 3MP3A 3MUXA 2PRMA 4MY8A 4O1AA 3DFTA 1G69A 1VPXA 2RH9A 2TYSA 4PEKA 5D2XA 2JGYA 4DPQA 3Q2DA 5D2VA 5HWMA 4LC6A 1NF7A 5C55A 3NQMA 3UXAA 2NUYA 4YLWA 1LOQA 3MI6A 5F1UA 5FEZA 1KFBA 4LU0A 1EP2A 5LNSA 2J9YA 3CT7A 2A21A 4HT3A 5AC7A 1A50A 2X1RA 1X8FA 3IV3A 3LV6A 3NVTA 2ATSA 4N6EA 5BNKA 4Z08A 1R46A 1D9EA 4WJEA 2DZPA 3OHIA 3T4CA 3W7HA 1G4SA 4JXCA 2E6YA 1TIMA 3N14A 3UWYA 4Q4KA 2VXNA 5HNRA 1HTIA 4DO4A 3W1MA 4O28A 2RDWA 5BMWA 4NNBA 4IMCA 3JRKA 3OVRA 2Z0IA 2Q3OA 3E49A 4KKXA 3EB2A 3O07A 4UNLA 2J24A 1EWDA 4O12A 5CZJA 5LNRA 3BW2A 3B8DA 4UMCA 4MOZA 1QO2A 1RQBA 3TFXA 1ZNNA 2H6RA 3PVFA 3M7WA 2GUUA 1W3NA 2WKJA 4LW7A 2C13A 1IGSA 4IMEA 4KWWA 1KBIA 3NQGA 3R89A 3B03A 1LBMA 1Q3NA 2QUTA 3GIYA 3G1FA 1S5TA 3PSVA 1YPFA 4LVBA 5D05A 4LOCA 1PE1A 2DP3A 3HMJG 2QR6A 2R14A 4MZYA 1S5WA 5D2WA 1WXJA 3MMTA 2B0MA 2FLIA 1Q45A 2Z2UA 4O1DA 5A8GA 2Q3RA 3M0ZA 1V5XA 3W2UA 2BXVA 4ALDA 3QC3A 1XC4A 4O57A 4U4MA 4Y90A 3I7QA 3W72A 3VKJA 3MJYA 1ZAJA 4S1FA 3LERA 1OFAA 3TIMA 1OFQA 3GDMA 5FEXA 3IRDA 1XBZA 1KLYA 4XTDA 2Y88A 3NQFA 3HGOA 3ZS4A 3MW7A 3WJSA 3P61A 1A5SA 1O95A 2QJGA 4Z0SA 1F5ZA 4H6KA 1YXDA 4WY0F 2F84A 5D2YA 3S5OA 8TIMA 1S5VA 2B7NA 3W75A 3W86A 4KFNA 1GOXA 4AMAA 3CWNA 5E1QA 3H55A 5F2GA 3TFCA 3KOFA 3ZFHA 1RQEA 1Z48A 5G4WA 5AYZA 5K4ZA 5EY5A 3DFOA 3LHVA 3W7EA 1XKYA 5FESA 1EUNA 4AHPA 5HR6A 1GG0A 4TO8A 4ZMGA 4L4MA 1AW1A 3BVJA 3NQEA 1K3UA 4AAJA 5G2HA 4FB7A 1VC4A 5D37A 3Q37A 3S1VA 2WJZA 4N9CA 5F2MA 2YYTA 1QAPA 1NSJA 2J27A 1QPRA 2E6DA 3UWVA 1VR6A 5DCEA 3P84A 3RNDA 3HF3A 2GQ9A 1TQJA 2EPHA 3LCFA 4B5NA 3L5MA 3RFAA 3HGRA 3W7RA 2Y6ZA 3VFLA 3FFSA 1LCOA 3TV8A 4Q32A 4MY1A 2E5DA 4N9BA 1Q6QA 2JKAA 4E38A 1LRNA 1TREA 3SFKA 2WSQA 1QPQA 1GEQA 3W1RA 1ME8A 2CW6A 2OZ0A 3CM4A 4UTTC 1J5TA 4PC8A 3DU0A 3QW4B 3RLUA 1R2SA 4FNRA 4PL2A 1LOLA 3STCA 3T7VA 1EEPA 4HSNA 1OJXA 2RHGA 3L66A 2BSLA 4FF7A 1B4EA 3KVKA 1N8FA 1T96A 2HTMA 4XKYA 4PTNA 1GPWA 1YADA 3UD6A 2XFWA 2CLMA 3LCIA 2O7QA 4RZ6A 5L9FA 1KFLA 3KVJA 5HR7A 5I3GA 2OX1A 1GVSA 1VYSX 3WJXA 5MHBA 3M44A 2AGKA 3INPA 5I3IA 3PR2A 4UTLA 2EF9A 4IMFA 1H7NA 3QW3A 1JUEA 1F05A 4M6QA 3WK2A 3MI2A 1F2JA 4CCCA 2VOMA 3C56A 3A23A 3EXSA 4OQVA 4A2SA 4L4LA 1SSDA 4IWWA 3B05A 2G96A 4LV9A 3DFNA 4LC8A 4TU1A 3C6CA 5E93A 3R8RA 2DZUA 3W88A 4N4QA 1VCVA 4ZQRA 3ZWTA 4O19A 2H90A 4JTSA 4DF1A 3KFTA 3TK7A 4ADTA 4WXZA 3CU2A 5EPDA 5K9CA 3A5VA 2J6XA 2YCEA 4A2RA 1SO6A 2NXIA 3W87A 3P8JA 4YCOA 3OA3A 2I9EA 5K9DA 5DCBA 1SU5A 4JYEA 3DH7A 1TV5A 1JCMP 1LRQA 3W85A 2ZRYA 5FF3A 3S8HA 4H4IA 4O10A 3HG3A 3S1UA 3D0CA 2ZYFA 3QYQA 3SECA 3A9IA 4MFEA 2KZHA 4UUIA 3BGGA 4OWGA 4IMDA 3NO5A 3O06A 4WOQA 4P61A 3CEPA 1MEWA 1SZGA 3TROA 1QMLA 1EWEA 4MIMA 1CX9A 4AWUA 5FF0A 1BKSA 4FNTA 5TQLA 1FWNA 4JY8A 1JULA 1XCFA 5AC8A 2C0AA 5H91A 1P5BA 1C9DA 4BI5A 3TC6A 1W5QA 4UFMA 1OF8A 2FFCA 5DCDA 3NL5A 4O17A 4NQ1A 3H54A 4DBEA 3QMSA 3GYEA 1F76A 1W5NA 4O15A 1FUYA 5HWNA 3W2LA 2W0UA 1FCQA 1TMHA 5DY3A 5AN7A 4GC4A 5IBXC 3L21A 3MO7A 2NLIA 4LUJA 4A3UA 2X30A 1HO1A 1TPDA 3M41A 1TSIA 3NOEA 3OVPA 3N34A 3CLMA 3SSJA 5KTLA 4EF8A 1YTDA 1T99A 1QOQA 1MEHA 4IUOA 3GLCA 2C14A 3EKLA 1P1XA 1HFBA 1PL9A 2ABBA 3P67A 4K39A 2AQWA 1R47A 1C29A 3W7IA 3UXDA 3Q58A 3W83A 4UFHA 3STFA 5DBTA 2TRSA 3E0IA 4XKYB 3IIVA 1B9BA 4QNWA 3WJYA 3AJXA 5G2WA 1EUAA 3USBA 2NZLA 3AO0A 4IQLA 1G4TA 2Y61A 4UNKA 5C6MA 2B7PA 4BK9A 4AF0A 2V82A 1G67A 3QSRA 4N6FA 4HNUA 4RZ4A 2JGQA 3TMLA 3FJ6A 4DQWA 4POCA 1OYCA 4FNUA 5LKYA 4NXSA 3V75A 3W1NA 4ZVJA 3CB8A 2A5HA 1W37A 5LSMA 3RF9A 2D73A 2NV1A 1AMKA 1I2PA 1FWRA 3RMJA 4E2DA 3LHUA 4LTSA 4FNPA 3VNDA 2QDGA 5LGXA 3IIXA 4DXVA 3CPRA 1Q6LA 1RZMA 4JEQA 3FJLA 4O16A 4AEOA 1P0NA 3CHVA 1CW2A 3BV4A 4LVGA 2VEPA 3G3DA 1DQXA 3LOTA 1SO5A 4OU1A 3C3NA 3OVQA 3NQVA 3C2EA 4JYFA 1V7YA 3M5VA 1PCKA 3NQ7A 4JIPA 4JX4A 4WOZA 3O6DA 1ML1A 3G0XA 5F2IA 3TCEA 3O8AA 5FF4A 1BWLA 1T0OA 2BZNA 3R12A 1ADOA 4AH7A 3PUDA 1GYNA 1LROA 5A5WA 3SI9A 3W7PA 4JX6A 4E0CA 3PB2A 4J9JA 1ZFJA 3W7JA 3TQKA 3QFEA 4WD0A 3WFAA 4EOUA 2H3BA 2ISSA 2NWRA 4NJHA 2QCLA 4LS0A 2PC4A 3C0JA 1I8JA 1Q6OA 3IIPA 2A1YA 3OIXA 3LX9A 1KM6A 2YW3A 1IXPA 5TBOA 1W0MA 1PS9A 1GVRA 5K7JA 1SQ7A 3G1SA 2CU0A 3RK8A 6TIMA 2FPYA 5AC6A 2GVJA 3DFQA 2I1OA 4JTTA 4ZQPA 3NPUA 5HUOA 3SY5A 2CWNA 3W2JA 2YW4A 1JCXA 4NJKA 3KX6A 1NF0A 4IGHA 1TCDA 2VFHA 4JYDA 1TJPA 4JTUA 3PM6A 1PHWA 1I2QA 4W9TA 2DZXA 1W3IA 4XZ9A 3M16A 1JUKA 1OFDA 3W7LA 2WPBA 1U83A 1A53A 4DEFA 4CCDA 3LHYA 4X3ZA 5D02A 3W7QA 3LXAA 3W9ZA 3A21A 3DBPA 3NQDA 4XWUA 5AYYA 2X1SA 2ZA2A 2GOUA 3MHUA 2NX3A 1OABA 4CCEA 3L65A 1VGAA 1QOPA 3UY8A 2CZFA 2H3DA 3W2MA 1JQVA 3NG3A 1JVNA 3TQ0A 1UB3A 5F4WA 1K03A 4AF0B 4WY0A 2ZA1A 4JY9A 3LCWA 3M5ZA 4O1BA 1D3GA 3K30A 2A2IA 1OYBA 4GUJA 4GRSA 3GB6A 1ZALA 1P4CA 3FS2A 5DY2A 5H2ZA 3BLIA 1TB3A 3GAKA 1KFKA 3FLUA 2BWGA 1M5WA 2P0OA 1IF2A 1W54A 4A29A 2Y70A 2PURA 1OX4A 3G0SA 5AHNA 2ZQ0A 4E2BA 5C5YA 1K7XA 3FEMA 4Z0JA 1AL7A 1VJIA 1W5PA 3Q94A 1PVNA 1UCWA 3G1XA 3TR2A 5BOOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3TSBA

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