3TSMA

Crystal structure of indole-3-glycerol phosphate synthase from brucella melitensis
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
DILRKIEAYKREEIAAAKARLALDELKARTRDQSAPRGFLKALEAKRAAGQFALIAEIKKASPSKGLIRPDFDPPALAKAYEEGGAACLSVLTDTPSFQGAPEFLTAARQACSLPALRKDFLFDPYQVYEARSWGADCILIIMASVDDDLAKELEDTAFALGMDALIEVHDEAEMERALKLSSRLLGVNNRNLRSFEVNLAVSERLAKMAPSDRLLVGESGIFTHEDCLRLEKSGIGTFLIGESLMRQHDVAAATRALLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Brucella melitensis
publication title Crystal structure of Indole-3-glycerol phosphate synthase from Brucella melitensis
rcsb
molecule keywords Indole-3-glycerol phosphate synthase
total genus 102
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tsmA00
1SO6A 4OV4A 3LCIA 3MHGA 2E6AA 3GNDA 5KITA 1G7UA 4W9TA 3DBPA 4DXVA 1PHWA 3Q37A 5DXXA 4EOUA 1X6UA 1VGAA 3LHYA 4CCEA 1FDYA 2R14A 1TB3A 2VENA 3U2OA 4DPQA 3TXVA 3P82A 4H4IA 1AMKA 3GDKA 1A5CA 2R8WA 2A4AA 3ABSA 4MFDA 1ALDA 4YXGA 1K7XA 3B4UA 3H55A 1XBZA 3O16A 2X30A 2PE4A 2NWRA 3FIGA 4CLMA 2DZWA 3BW4A 3G0XA 4OU1A 5D2WA 3LXCA 4Z1BA 3SGZA 4NT0A 2Y61A 1IGSA 3TH6A 3EX1A 4UTTC 1KLZA 2Y7EA 4IMDA 4WY0B 3HQ1A 1GTHA 4LWWA 1H7NA 3MP3A 3B04A 4JDYA 4PTNA 2DZPA 1MZHA 1DHPA 3L2IA 3L0NA 4M7TA 4NZFA 3FYOA 1B3OA 5F2GA 3MMTA 1H1ZA 3GYEA 3SI9A 2X16A 5AHFA 3TK7A 4YL2A 2CZEA 5EA9A 1O94A 5IBXA 2C15A 1R47A 4NXKA 3W2MA 3HBLA 2VFFA 3W1TA 1GWJA 2WSRA 1W1ZA 2BXVA 2QR6A 3BPWA 5KTLA 3S8HA 4HKPA 1W8SA 4O57A 1F6PA 1B4KA 3M6YA 4HT3A 2B4GA 3JS3A 4PC8A 2ABAA 4L4LA 5C6MA 1TO3A 3H54A 3HJZA 3HMJG 1J2WA 2Z2UA 1R2RA 3B8DA 2WKJA 3M44A 4NXSA 1H7RA 4NJJA 2FJKA 4IUOA 1T8XA 3DKJA 4PFMA 1FCVA 2DU2A 3EEGA 4LVGA 4UR8A 3FJLA 3F4WA 3NQ6A 1H1YA 4MY1A 3IGUA 2XN1A 3P5YA 1YADA 1OFBA 1TPWA 3FFSA 1X1OA 4YWIA 2BTMA 1H50A 5IM51 3LGEA 1M6JA 1UUOA 1Q6QA 1V7YA 3L9CA 2F84A 1Z42A 2QUUA 4JTUA 1XCFA 4N6FA 3TAKA 4K6AA 3ABRA 3W7QA 1S5TA 1VS1A 1LORA 1XUUA 3NG3A 4DO4A 3HG3A 5F4SA 3M0ZA 1EB3A 2Y7DA 4FHAA 3UPBA 3TDFA 1TPDA 3W1QA 3KHJA 5LKYA 1TPEA 3JRKA 3N73A 1H5YA 3NL3A 5FF3A 3C2OA 1OYAA 2CLIA 1GJPA 5DXYA 3M5YA 3VNDA 1RZMA 1L6SA 2V5BA 5CZJA 3FEMA 1OF6A 1OYCA 2BLEA 1GVRA 2EAWA 1A50A 3GKAA 1ME7A 2EPHA 4LY8A 4UFMA 4AHQA 3NQFA 3W7NA 1IXNA 3QYQA 1PVNA 1NFBA 3CWNA 1EPXA 2UV8G 5LNVA 3THQA 3CC1A 2QEZA 4RCXA 1I4NA 1T99A 2VEPA 3PC0A 2CZDA 4ZQCA 4Y9AA 3ELFA 1G4SA 1KW1A 4JYDA 1JCNA 1OHLA 4ICNA 3DKLA 2A21A 4TU1A 1DJQA 2E6YA 3LBMA 3HG2A 1ADOA 1OFEA 1K03A 1HO4A 2QCLA 1LLZA 1KFLA 5CGQA 2A1YA 1JR1A 1VYSX 3UWVA 4LVFA 5LNUA 1XKYA 4LNYA 2Y62A 5TIMA 2ZZ1A 3DFTA 5D09A 3KOFA 2QUVA 5CPOA 1C29A 1DL3A 2AGKA 2FFCA 2RDWA 3Q58A 4UTUA 4ZQPA 4HN4A 5FF7A 3O6YX 3IIPA 1MXSA 1ZJIA 3W7DA 1FY6A 5G5IA 1VQTA 1F6KA 1OFDA 1FWSA 3KVJA 3ZWSA 3PG8A 1FCBA 1LOQA 4UTJA 1HFBA 3PSWA 3F1QA 3UWZA 5AYZA 3DHDA 1ZY9A 4EIVA 2WJZA 3HGRA 3O07A 3IGXA 2X1UA 2QCHA 4B5NA 2ZTJA 3RNDA 1DKWA 3CPRA 1SW3A 4JY9A 3GKFA 1TPFA 2WPBA 4NJKA 4NJIA 3O8AA 4MOZA 4X2RA 1ONRA 2NXHA 4PA8A 2RFGA 3CTLA 2CWNA 3LTSA 2TYSA 4UIOA 1VYPX 3NEVA 1F74A 2Y7GA 4UXDA 2E5CA 2NWSA 4UUIA 4MY9A 5F1VA 1ML1A 5HUOA 2VC6A 4WZHA 3KVLA 1TV7A 2ZBTA 3HIJA 3STGA 1OX6A 3QW3A 4FXSA 3UZJA 4JXCA 4L4MA 3MBFA 5C2XA 1IF2A 1AW1A 1NF0A 2GVGA 3BG3A 3I68A 1R30A 4O11A 2G5WA 4NJHA 2H3BA 3NZ1A 2TRSA 4TMCA 3N34A 3FKKA 1XM3A 5D04C 3W2LA 1SSGA 3MYOA 4O16A 2V2CA 1QOPA 1VLWA 2ISVA 2HS8A 1S5VA 1YPFA 3NM1A 3HO8A 3DHFA 1BEUA 1QR7A 3B06A 3QFEA 1W3TA 4MJMA 1K8YA 3R2GA 4BWLA 1PCKA 1EEPA 2XN2A 3C52A 4AVFA 2NXGA 1Q3NA 4HNVA 4YCOA 4GUJA 1IXPA 1RD5A 3GK0A 1WDWA 1Q6LA 2QCFA 4JTIA 5C55A 3T4CA 3ABOA 1T96A 2LLEA 5EBUA 5EY5A 5E1QA 3UWYA 5CZSA 2BZNA 3TSMA 2Q3RA 1FQ0A 5EPDA 4MYXA 5F2MA 3G18A 5E93A 2X2GA 1OYBA 1NSJA 4N2YA 4AB4A 1ZAJA 3EX4A 1TSIA 1EUNA 2F7FA 2A0NA 5HINA 3PBWA 4XBKA 3INPA 1ZALA 4HIBA 3BLEA 4O54A 1TIMA 3UZ5A 1TYGA 4CQ8A 2FPTA 3QEZA 3BARA 4KKXA 2ATMA 2E6FA 3R8RA 2WOQA 3GR7A 4JTTA 5I3HA 1G4PA 1WV2A 2V9DA 1VHCA 3FOKA 4QM1A 4UTKA 2CLHA 2J88A 4O8RA 1G67A 1JUBA 2CLKA 5D38A 4FNQA 3FKRA 3STFA 2P10A 3QW4B 3E12A 1L9WA 4X9SA 1SZFA 4H6KA 3BW2A 5LNWA 2Y89A 4K36A 5HWJA 1C9DA 5GVJA 3SFKA 4JTHA 1KM1A 4XZ9A 3W2JA 3TC7A 5FF4A 3FS2A 5FESA 4LUJA 3ABQA 4AF0B 1GVOA 3QMRA 2BX7A 3OA3A 3AO0A 5AC6A 6ALDA 3EWUA 4JTEA 3TV8A 1CW2A 4NJGA 4N4QA 3O15A 3W7MA 3EKZA 1SW7A 1YXDA 5BMXA 3T40A 3B05A 3C0JA 1W5MA 4OHQA 3O06A 4U28A 1TREA 1Y0EA 3C2EA 5HJLA 3FA5A 4FNUA 4H3DA 4UTLA 1QNVA 1OG0A 4KWVA 1KM2A 1DBTA 3IGSA 3LHZA 4IXXA 3E96A 4UNKA 3RLVA 1U83A 1PIIA 5CG7A 1GZGA 4GE8A 5G1YA 5BNKA 4X22A 4DBDA 2IQTA 3F03K 3HPSA 1XXXA 1T0OA 3LHWA 4FO4A 1QFEA 2QKFA 4OV9A 3W1LA 2V81A 4JIQA 3LTYA 3THAA 2NZLA 4IWWA 4KWWA 2V8ZA 4AXKA 4FX7A 4QSHA 4DELA 4UTWC 3GDMA 1W0MA 3QC3A 5FF2A 4J9JA 4IMEA 5AN7A 1LBLA 1FWWA 3PBYA 4O17A 3G1AA 5D33A 4HPJA 2YPIA 3LRMA 3PWAA 2OMAA 2AAMA 2RDUA 4O28A 5CSSA 3W70A 1CX9A 1ZNNA 3LHVA 3QPZA 5F2IA 1TPC1 2EGZA 2B7OA 4Q33A 1QO2A 3WK1A 5K7JA 1J5TA 1KFKA 3WJWA 3NQDA 1OX4B 1LYXA 3UY7A 2NXIA 5G1TA 1TMHA 4GC4A 1WA3A 4ADSA 1GOXA 2WSQA 3NOEA 1AW5A 3DFOA 4R53A 1AW2A 4IX2A 5D05A 4GXMA 4Z1AA 5CZ0A 1LM1A 4PCFA 4E2DA 2C13A 3P67A 3O6CA 1N55A 1JUKA 3W7EA 1FUYA 2NX3A 2Z6JA 1LRQA 1L6YA 5FEXA 5I3GA 4IMFA 1TPUA 3HB9A 2FIQA 3HOJA 1I45A 4AH7A 2C18A 2VFDA 1HTIA 1RVGA 1FX6A 3PM6A 2JBMA 2ZA1A 2TPSA 3RU6A 3EX6A 1VRDA 2I14A 3ZFHA 4JTSA 1SR9A 3IVSA 1OJXA 2J6XA 1EUAA 1FDJA 2VFEA 4LW7A 3C8FA 2OCZA 2A7RA 1UBSA 4O18A 1XBYA 2VOMA 1WOAA 3EX3A 1G7VA 2W79A 1TQXA 3KFTA 4BI6A 1FCUA 3RK8A 3IVTA 2Z0IA 1SQ7A 1K7EA 5CPLA 1B9BA 3GDLA 1KM6A 5H91A 1W5QA 4HHPA 1V5XA 3NQEA 3S1XA 3EWBX 4GUFA 3M5XA 2E6DA 5AHNA 1YTDA 1LDCA 2X1TA 3NGJA 2QAFA 3TR2A 1KM5A 3N2MA 5D32A 4OWGA 2E5DA 5AFDA 2J9ZA 4IPJA 4ZVJA 2V0TA 1F76A 4PL1A 3S5NA 1EWEA 4IQLA 4N6EA 3NAVA 1I2PA 3NL6A 2XN0A 1YYAA 2YW4A 4RK8A 3I7RA 5FEWA 1ZAIA 2GJNA 3W87A 3W72A 2C14A 3K30A 1TJPA 3FJ6A 4WOQA 1HUVA 1YDNA 1G4EA 1UCWA 3LCFA 3R13A 4FNPA 1LRNA 3SY5A 2ZYFA 2FQIA 3P7YA 2GQ9A 3W1XA 3P81A 4HNUA 5SWUA 4MZYA 3SW6A 2J9XA 2GQ8A 5KZMA 2FDSA 4WQ6A 3A23A 5FEZA 2W0UA 1VHNA 3TROA 3Q2DA 3WK3A 4UFHA 5F4WA 1WOBA 1EIXA 2NUYA 3UQNA 3OEXA 4N9CA 4R7JA 4M5PA 3L65A 3RFAA 2ATSA 1W37A 2FB2A 1GT8A 3UWWA 3QSTA 4BI7A 3TW6A 1R2TA 2ZFAA 3A21A 1SU5A 1Q45A 2JKAA 3I7QA 5HR6A 2DJXA 2QCDB 3RMJA 3TXZA 3O05A 1OFQA 3EWWA 2Q8ZA 3W85A 2J9YA 5F4XA 3QF0A 3L0KA 1TRIA 5DY3A 4OBTA 3LTPA 4NZJA 3YPIA 3G1YA 3ATYA 3N14A 3G1VA 1PS9A 2NX1A 3C2RA 1MEHA 5FI8A 4N9DA 5KINA 3STCA 2VFGA 3KXQA 1JRBA 3LV6A 1VCFA 1O60A 1FBAA 2ZCGA 3F4NA 1TTPA 1QPQA 3D0CA 5K2ZA 4CNPA 2V82A 3V75A 3GDTA 5KZDA 1QPRA 4JX6A 5HR7A 1PCWA 2C1HA 3TFCA 3CT7A 3PAJA 1Z44A 4WJEA 3L5AA 3PS7A 3BV4A 4O1DA 5HWMA 3S9YA 2P1FA 3TUUA 1GVQA 1U5JA 3PB2A 2YW3A 4X3ZA 1Z48A 3N9RA 4LRTA 2CFFA 3A5VA 5FF0A 3M41A 3M47A 1K3UA 4GBUA 3VCRA 4ONVA 1Q6RA 3W7GA 5K4ZA 2GUUA 2B0MA 1XDLA 1GPWA 3B03A 1XUZA 4XQ6A 3U6WA 2QJIA 4JTLA 1XBVA 3TKFA 3E49A 4TX9A 1XC4A 5LNRA 3L5LA 2XFWA 4S1FA 5K9CA 4K8HA 3SECA 1DOSA 4GJ1A 4AHOA 4O1BA 4BK9A 1I8JA 3SSJA 3CLMA 4WD0A 3W7OA 3W3OA 3NQ8A 4UTHA 1THFD 2JGYA 3C61A 3S1UA 2J24A 3WJSA 3MWAA 3QJAA 2A7PA 1BWLA 2YYUA 2O7QA 2GJLA 3MUXA 3CEUA 1WAUA 1JCJA 1P0KA 4RX0A 4UFLA 5KSWA 1DORA 4IJBA 4DO6A 1RQEA 5LHEA 3OVPA 2V2HA 3M5ZA 3EXTA 1GVFA 2QCMA 2JKEA 3GAYA 1OK4A 3LRKA 3B0PA 3EB2A 1JQVA 1OABA 1UUMA 2H8XA 2CLEA 4FX6M 5DLCA 5L9FA 4YCPA 4O10A 4TIMA 4O15A 2ZZ7A 4O12A 1EWDA 1SUXA 1P4CA 3NL2A 4GUHA 4K7VA 2QJHA 4RV8A 5G2IA 3LXBA 5F2LA 4N9EA 4Z1CA 4ALDA 4AWTA 2A6LA 5G4WA 3W7RA 2NV1A 2NUXA 4NVTA 3DH7A 1QPOA 1JCXA 2B7QA 3W2UA 1I2NA 3SJ3A 2ZZ5A 4LV9A 3GR8A 4NX5A 4LV4A 4RZ6A 1YTEA 1GQNA 3NPWA 4IMCA 4RLIA 1ZAHA 2NUWA 4O19A 1I2QA 5DBUA 2EHHA 1A5BA 4S2CA 5I3JA 3T7VA 2P0OA 4KFPA 4Y96A 4UTMA 3DZ1A 3QM3A 3LHTA 1KM4A 4RR4A 4NQ1A 2WQPA 5HWNA 1H7XA 1C8VA 2Y7FA 4UMAA 2YYTA 1SZGA 1WBJA 2KZHA 3MP5A 3ZWTA 3W22A 4UFKA 3IEBA 3B0VC 3W75A 3DI0A 1OVDA 3T55A 4XKYA 3B0UX 3CU2A 4WY0F 3C3NA 4Z08A 2YXGA 4E2BA 4LC6A 3GLCA 1O4UA 3R89A 3TIMA 2Y70A 3TSDA 1YXCA 4LT9A 1LBMA 3GXNA 1FWNA 1JQXA 4M19A 5LGXA 3UYCA 1LROA 3LI1A 3W86A 4EF9A 2JGQA 1GG0A 5H2ZA 1H61A 4IPIA 5K9DA 3QQ1A 2YSWA 3O1NA 3HG5A 1K8ZA 3L0GA 1ME8A 1JCMP 4CCCA 4HNNA 2TMDA 2WV8A 2VFHA 1GG1A 2CLFA 1O95A 3NDOA 3T44A 4JEQA 1OFOA 2WSYA 4O53A 4OT7A 1HO1A 2V2DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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