3TX9A

Oye1 complexed with 2-(hydroxymethyl)-cyclopent-2-enone
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLWVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
publication title Studies of Enantioselectivity in OYE1
rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
total genus 156
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2011-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tx9A00
3P74A 3KVKA 4N9CA 3HG3A 3N14A 5BOOA 1Z42A 3N73A 2C13A 3W7JA 2LLEA 2QCMA 3IIXA 1FWTA 4JX4A 3PBVA 1EP3A 3CM4A 3FFSA 3MWAA 2DZTA 2RDUA 3WK1A 5EBUA 5E0KA 3IIPA 3ATYA 3QFEA 5HINA 3MI3A 1HO1A 4IPJA 1RD5A 2Y7EA 4WY0B 5AHIA 4RK8A 4IOTA 2WKJA 4UTIA 1A5CA 5FF7A 4XKYB 1DVJA 3EX6A 1GWJA 1KA9F 3L0KA 4X3ZA 3OVRA 2B7OA 4FHAA 2E5BA 1G69A 3NQ2A 4MLRA 2DP3A 3C61A 4KFNA 1HFBA 3IVSA 5AYYA 1M7OA 1TV7A 3F4NA 1TCDA 4O57A 4RXFA 5CZTA 3MUXA 3PSVA 3M16A 4OGZA 3KRZA 4ZQMA 1TV5A 1EP2A 2HTMA 3U8GA 5D09A 3EX3A 1Q6OA 2H3DA 3W83A 2NX9A 2A6LA 3C2EA 3GX9A 4O1CA 2TPSA 1YPFA 4AWTA 4BI5A 2OZ0A 1QR7A 2X30A 4Y9AA 3KVLA 4IGHA 2YFNA 4N4QA 5A5WA 4M7SA 4K7VA 2CLHA 3GXPA 2B4GA 3OG3A 5D37A 3GR8A 3NPWA 3TSDA 4UMAA 5E93A 1P4CA 1JR1A 4D2JA 5LGZA 3W1MA 4CCDA 2QAPA 8TIMA 1W0MA 1JCMP 1G4PA 4NX0A 3GKAA 3MHUA 4JYFA 2GQ9A 3S5ZA 3NZ1A 1ME8A 2DZPA 1EUAA 1XXXA 1I2OA 2CW6A 3PBYA 1LBLA 4UCGA 1FX6A 4IX0A 4NXKA 3UXAA 4HIBA 1TO3A 3TCEA 5DCDA 2ZZ1A 1GT8A 2C15A 2V5LA 3DU0A 4UTLA 3P80A 6ALDA 2GQ8A 2I9EA 1LLWA 4UR7A 1H63A 3NM1A 3W1RA 3KX6A 4JY8A 1LP6A 2RHGA 1OX5A 4OV4A 2E09A 4BWLA 2Z0IA 4RR4A 3PUOA 3O15A 4AH7A 4NZFA 2GPTA 1TPUA 3TV8A 1PHWA 3UY8A 5ABTA 2CLLA 3QEZA 4Q32A 5CG7A 5T26A 3W1AA 5G5IA 1GVSA 4TMCA 1KFCA 1MSSA 3M6YA 3R8RA 3IEBA 3NQEA 4NJHA 3GNNA 3LRLA 4R34A 5I3JA 1SU5A 2NX3A 1O4UA 2X16A 1TSIA 1JJKA 5HJLA 1N8FA 4RV8A 5D33A 4S2BA 2ZZ3A 1GG0A 3EEGA 3CPRA 1H7WA 2GJNA 3GZ3A 3S8HA 3N3MA 3OBKA 3QH2A 3LHZA 1TPWA 3V1PA 5LSMA 3GK0A 3GDLA 2D73A 5G2IA 3LV5A 3TMLA 3DENA 1H62A 1WX0A 3G0UA 2G96A 1YDVA 1EPXA 4IXHA 5BRBA 4LW7A 1KTNA 1W54A 5FF3A 1DOSA 1QWGA 3FJ6A 2Y89A 3BLIA 4O12A 3UNDA 3UZJA 3M0ZA 4N6EA 3GDTA 4UFKA 4WY0F 3G1AA 3WJWA 3IV3A 3OVQA 1O94A 5AYXA 1LM1A 2NX1A 3ZFHA 2CLOA 4NVTA 1B9BA 1PV8A 1PIIA 3TMQA 3MP5A 1TQJA 3EWUA 3C4UA 1TV8A 3C2OA 3QQ1A 4OBTA 5AHEA 3ZWTA 4HKPA 4N02A 5G4EA 2FPVA 3QW3A 4DEFA 3DH7A 4AVFA 3L67A 3L9CA 1SW3A 4E2DA 3KRSA 2WSYA 5CZ0A 4NJGA 3VFLA 1G4TA 4JY9A 3S1WA 2E1DA 4S1FA 1NFBA 3CTLA 4OWGA 1ADOA 1SSGA 1WBJA 2PC4A 3W9ZA 4BK9A 3D0CA 4HNUA 2VFHA 2YXGA 1UBSA 4KWWA 3FS2A 1YTDA 2QCCA 2TRSA 1JCJA 3VNDA 3UWWA 4NJKA 1ZNNA 3NR0A 1WQ5A 1LDCA 3P5ZA 3STCA 5FF2A 4XBSA 3P7YA 3C56A 4Z1AA 3W2NA 1FY6A 1K03A 5HWNA 3UWUA 3W1UA 3ZS4A 4CCCA 2OCZA 3NL3A 2AAMA 1A5BA 1VRDA 2CLFA 2PRMA 5I3KA 1KV5A 2CWNA 3PB2A 4ORMA 4Z0SA 2YGYA 1KM5A 2DJXA 1JUKA 2E68A 3NQCA 4BI6A 1KM4A 4Q4KA 3W72A 7TIMA 3TJXA 3QPYA 4FX6M 1OFOA 3G18A 1WAUA 5LNRA 4IXXA 1R30A 4KKXA 2EF9A 2W79A 4JTFA 1JCXA 1J2WA 1OG0A 1GQNA 1OYBA 1CW2A 1EWEA 1G7VA 1H60A 4IPIA 2RDTA 4HN4A 5KITA 4JTLA 3LCGA 1WA3A 3UZ5A 3W7LA 4Z08A 3TJLA 2CLIA 3TXZA 3L0GA 4DXVA 2XN0A 4MZ8A 2NXGA 4LUJA 1AG1O 1BTMA 4UNLA 2ZZ4A 3O6DA 5CPMA 4AXKA 2ABBA 1BKSA 1G7UA 3F1QA 3M1ZA 3L5LA 5F4SA 1RZMA 1A5AA 2DZSA 3DFTA 2WO5A 3MP4A 3G3DA 3W2UA 2ISVA 4DF2A 5K9DA 1L6YA 2RH9A 1JUBA 4YCOA 3DFSA 2EKCA 4XTDA 4MLJA 4BWLC 2FIQA 3E96A 3WJSA 3O8AA 3N2XA 4N9DA 1EEPA 3A5VA 1FXQA 3TW6A 5CPOA 3PC0A 3QW4B 3L21A 4H4IA 2ZZ2A 4NZJA 3G0SA 2BZNA 1SUXA 1S5VA 2R94A 3EWWA 3M5VA 3ZR4A 1JRBA 2E5CA 2Q3RA 2F7FA 4NNCA 4RXGA 4ADUA 1MEWA 4CQ8A 2ZTJA 5HUOA 3PF3A 3HG2A 2Y85A 1TPB1 1VS1A 5G1YA 1GZGA 3EWYA 3RNDA 4XZ9A 2X1TA 2VFEA 3C2RA 2ZZ6A 4ZZ9A 1K3UA 4K39A 5TIMA 5K9CA 2VENA 1DL3A 1W5QA 3N9RA 5D38A 3HGSA 4GE8A 3TUUA 4HSNA 1TB3A 3P67A 1Z44A 2Z6JA 1LBMA 5D30A 3W7HA 4UUIA 1LORA 1VH7A 3FLUA 4ZVJA 1YDNA 3LXBA 4GXMA 2B7PA 2Z6IA 3IRDA 3P8JA 3C2VA 3LHVA 5D05A 5AYZA 3LRMA 2WOQA 2A7PA 4JXCA 3ANYA 2NLIA 3T78A 4CNPA 1GJPA 3LRKA 3TIMA 5LKYA 5C55A 1R47A 3CWNA 3M41A 4O50A 2H3BA 2FB3A 4IX2A 3CB8A 3LHYA 3TQ0A 4AMAA 1Z48A 4O54A 4QNWA 1JQXA 1K8XA 4IMEA 1YXDA 1JCYA 1WDWA 1VCVA 2VXNA 1G6CA 2DZWA 2YW4A 5FEXA 2GVJA 1P0KA 2V0TA 3M5YA 2X1RA 2NXIA 3GDRA 1B4EA 4DO6A 4AWSA 3TQKA 1F5ZA 1Z41A 2R91A 1XUZA 1CI1A 1XDLA 3NGJA 1ONRA 3V75A 3W88A 1J5TA 4QITA 3GR7A 4WQ6A 1TYGA 2VELA 2ZZ7A 1RQBA 3P5YA 3BW2A 3BG5A 4M6QA 3THAA 1LLZA 1EB3A 4LRTA 5EL1A 3UPBA 3SI9A 4E38A 4LY8A 1W3NA 4PL2A 3B05A 1MO0A 4JTEA 4AEOA 4YCPA 2FQIA 4O0KA 2JKAA 1GVRA 3M43A 2JKEA 1TQXA 2ZRVA 4OHQA 5DELA 3NPVA 4S2CA 3LLFA 4QISA 1NF7A 1VZWA 2VFIA 3UWVA 3UWQA 1QMLA 5K9XA 1W1ZA 1FQ0A 3GLCA 2CLKA 3RF9A 3LM7A 2AQWA 2ZRUA 3LCIA 3VE9A 3WK2A 3RMJA 4UTHA 4DPPA 1K7EA 1SFLA 2JK2A 3W07A 3HF3A 2ZTKA 1XKYA 1OFRA 2NV2A 2NUXA 4UXDA 1LTDA 2DZUA 1TTPA 3G8EA 3TW7A 5I3IA 3Q94A 3G1SA 1THFD 1EA0A 1OFQA 5FESA 2NUWA 1UASA 4AB4A 1QO5A 1K02A 1W5NA 3S6DA 5LNVA 5BNKA 1HTIA 5L6UA 2QCLA 1PE1A 1RR2A 2QCEA 1K8YA 2CZEA 3LCHA 2OX1A 3SY5A 4DQWA 5AHLA 1A53A 5U7SA 3T44A 2BWGA 4X9SA 5D04C 2H8XA 2VC6A 2Q8ZA 2NXHA 2FJKA 1L6WA 3QSRA 3LOTA 4HNTA 1OK6A 3A23A 3FYPA 2J88A 3U2OA 4O1AA 1KM3A 1X1ZA 3E12A 3JS3A 1IXPA 1MEHA 5IBXA 1MZHA 1AMKA 3WK0A 3GB6A 3EX4A 4FNPA 1YXCA 1ZY9A 1RPXA 4JX5A 4AHQA 4K36A 3LTSA 4RJEA 4U28A 4TIMA 3MYOA 3BARA 4YMZA 4MVAA 5C5YA 1G4EA 2W0UA 1C29A 1W5PA 4RX0A 1GVOA 2J9XA 1ML1A 2E77A 3W7CA 3BG9A 1KTBA 4HHPA 1LRQA 1XBXA 3INPA 3W84A 3KAOA 3PR2A 3NVTA 5LHEA 1P1XA 1Q3NA 2OJPA 1W56A 4JS3A 4MY9A 3KFTA 1B3OA 1N7KA 4WOQA 4MPQA 1KLZA 3UWYA 3WJXA 4I7VA 1V7YA 5HWMA 3G1HA 1EUNA 4JTGA 4PL1A 4O8RA 1XBYA 3USBA 4GUJA 3I7QA 1OK4A 4WZHA 1RVGA 5LNUA 4R33A 5AOUA 1SR9A 3IGSA 1VGAA 4TO8A 3JR2A 3L68A 4LRSA 1CX9A 4GRSA 4Z1DA 3M7WA 3W76A 1VPXA 2ATSA 4O11A 2B7QA 2O7SA 4LC8A 2FLIA 4X22A 2AGKA 4MKNA 2ABAA 3NA8A 5LNWA 4Z1CA 4WOZA 5I3FA 5J5RA 2VEIA 5CPNA 1OX6A 1XUUA 4DO4A 2A1YA 1M5WA 3GYEA 5F2IA 2QDGA 5TBOA 1I2NA 4JTSA 4M7TA 4B5NA 1H61A 1QO2A 3I6RA 4O0ZA 1P5BA 4LVDA 3S1XA 1TPEA 2I14A 1DV7A 3L2IA 4G1KA 1XL9A 4HNVA 4I7UA 3GAKA 3OEXA 4XBKA 1KM6A 2R8WA 4FNRA 5SWUA 3MYPA 5F1VA 1I2RA 4O14A 1DQWA 1ZCOA 3W3OA 1I2PA 1Q6LA 4L4MA 1F7BA 3GAYA 1YLVA 1W3IA 1O60A 1GVFA 2PURA 1JULA 1PCKA 3UQNA 2A5HA 3PULA 2FFCA 1LOLA 2Y63A 3LERA 4O10A 3TAKA 5D2YA 3S5YA 2H6RA 3GXTA 2A4AA 3LV6A 4JIPA 3A9IA 5F4WA 1Y0EA 4LVGA 1WOAA 3NQ7A 3ABOA 3TNOA 2QF7A 2V2CA 3W87A 1UUOA 3CEUA 4OT7A 2JGQA 2YR1A 3HIJA 3O16A 5CSSA 3QMTA 2DU2A 4O53A 1SPQA 3WJYA 1H1YA 4Z1BA 3CIWA 4ZQNA 5G4WA 1ZFJA 1AW5A 4ZMGA 1W8SA 4O4WA 5HR7A 1IXNA 1QPQA 4NUWA 3R89A 4ML9A 4N9BA 1JQVA 2BSLA 3F4WA 1FDYA 3B0VC 1NVMA 2UV8G 5K2ZA 1SO5A 5LNSA 4LNYA 1I2QA 2TYSA 4AHOA 1ICQA 1TTIA 1H51A 1H7OA 3LHWA 3P8IA 4ADTA 2B7NA 4N6FA 4XKYA 4CNNA 3L66A 1J4EA 3S5OA 3S0CA 3UPWA 1F73A 5CZSA 5IBXC 1SZFA 4WD0A 1LZOA 1UCWA 3KHJA 3BG3A 1SO4A 2E6AA 1YTKA 2PE4A 5C6MA 4YWIA 4LVAA 2ZCGA 1PVNA 5DBUA 5CKSA 4LVBA 4MUZA 4A22A 1VC4A 1H5YA 2FPYA 3F03K 1WOBA 3PG9A 5LHFA 1LOQA 3NQGA 2JKPA 2ALDA 3PVFA 5I3GA 3HGJA 3W7IA 2ZFAA 1C8VA 3LXCA 2CFFA 2RDWA 4UC5A 1H50A 3ZWSA 5FF4A 2OT1A 1LCOA 3HPSA 5AHFA 4O1BA 3S5NA 3DI0A 3DI1A 1ME9A 2G95A 3ATZA 3DZ1A 3PBUA 1FWSA 3EB2A 2X1UA 4UTWA 2WV8A 3Q2DA 3W1PA 4MZYA 3TH6A 3VKJA 1X8FA 4EVZA 4L4LA 1H7RA 5HNRA 4K6AA 3CC1A 3I65A 4K8HA 5DCEA 2NUYA 1L2UA 2YYUA 1LRNA 3NPXA 5KTLA 1LROA 3PS7A 4MFDA 3BGJA 3WFAA 4N2YA 3HO8A 2EGZA 1OF6A 4FIRA 4PC8A 1ZAJA 3DBPA 1PS9A 1LBFA 1TJRA 2A7RA 5H2ZA 4GJ1A 1TPDA 3QC3A 3QPZA 1EIXA 4PODA 2B0MA 3HPXA 3BLFA 4O13A 3LTYA 4ZQPA 1D3HA 1FCVA 2WJZA 3SJ3A 3TSMA 2PRLA 4QQ3A 2Q3OA 4DF1A 5J5DA 3VE7A 2E6YA 2WQPA 1SW7A 1HO4A 4GWEA 4JTUA 2C18A 2NWSA 3E02A 5KMYA 6TIMA 3MW7A 1XCFA 3O1NA 4Q33A 5AB3A 3EX2A 3NNTA 3PAJA 1YTEA 4LS1A 3VI2A 3NQ6A 3UY7A 3QJAA 3LBMA 5FI8A 4BI7A 3EWZA 3HG4A 1XFBA 1TRIA 3T4CA 1WYIA 3G1FA 3U6WA 1VLWA 1KBJA 5K4ZA 4JX6A 2Z1BA 1JVNA 5DBTA 3BPWA 2QUVA 3QMSA 1S3HA 4NJJA 4MY1A 3EX1A 3E49A 5TQLA 3NOEA 3EWXA 3N19B 4PH6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H9Z A;  4N9C A;  1BQC A;  3HG3 A;  3B3D A;  3N14 A;  3IPW A;  3N73 A;  3VGF A;  3W7J A;  3IK4 A;  3UR5 A;  2LLE A;  3KBN A;  3T0D A;  3ME3 A;  4HNC A;  3HQO A;  2GJX A;  3CM4 A;  3FFS A;  2BB0 A;  2D2G A;  2RDU A;  1GGO A;  1F3W A;  5EBU A;  1E0X A;  5E0K A;  5HIN A;  4F40 A;  3QLD A;  3EOO A;  5CLW A;  1HO1 A;  3VCN A;  2FMO A;  2FGL A;  3T0B A;  4UTI A;  2PDF A;  3M46 A;  2D0G A;  4AEE A;  3EX6 A;  1KA9 F;  2PDI A;  4X3Z A;  4X2P A;  3OVR A;  2J66 A;  4WDX A;  4MLR A;  5AKQ A;  5IXE A;  4L4P A;  3WLJ A;  3HTW A;  4Q8Q A;  3N12 A;  4HCD A;  3CAK A;  1TCD A;  4O57 A;  3LEN A;  2J74 A;  1RH9 A;  5BU9 A;  4YS1 A;  3PFR A;  4OGZ A;  1GQI A;  1UR2 A;  1XYM A;  1H2J A;  3U8G A;  4ZGY A;  3ITX A;  3W83 A;  3C2E A;  1LQ2 A;  1YPF A;  2OZ0 A;  1QR7 A;  4Y9A A;  2G8Z A;  5I2U A;  2IW0 A;  1XS2 A;  5T91 A;  1XRS A;  1QI3 A;  4C6O A;  4C7G A;  4Y8E A;  4IGH A;  1V03 A;  2YFN A;  3NO3 A;  2B4G A;  3OG3 A;  5CGM A;  3GR8 A;  3BJT A;  4GCX A;  3VD5 A;  3TSD A;  4PUM A;  3W1M A;  4CCD A;  2ZE0 A;  4A6G A; 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 4TOQ A;  3KOW A;  2ACR A;  1BGG A;  3AYT A;  4POC A;  1CGY A;  4Q3M A;  3I6T A;  1L6S A;  3K8K A;  4BF7 A;  1UB3 A;  9XIA A;  1TV4 A;  1AH0 A;  4XTI A;  1KQY A;  3CAQ A;  1SFJ A;  3OLG A;  3L4X A;  3W2L A;  1R46 A;  5FEW A;  3MMD A;  1NDV A;  3M0M A;  3HQN A;  4REQ B;  4E2O A;  4PSR A;  4P61 A;  3O05 A;  3FXY A;  2YZ5 A;  4I6V A;  1O7A A;  4WKA A;  4HGX A;  3N1A A;  1LRT A;  1EJV C;  2WSR A;  1Y5W A;  2ZAD A;  3GZA A;  4V1Y A;  2DUA A;  5CC5 A;  4AIE A;  1OYC A;  5DY3 A;  4A2R A;  4QAW A;  3DN5 A;  1J8V A;  1O5K A;  2B81 A;  1KGW A;  1FRB A;  2G3I A;  4ATD A;  1XIM A;  4YXG A;  1V93 A;  2BHU A;  3I4K A;  3APG A;  3TC7 A;  2IPG A;  4GBU A;  1WXJ A;  3AO0 A;  4Z2J A;  1M04 A;  4MWA E;  1XYF A;  4L7Z A;  4PB3 A;  5A6S A;  4QIU A;  4UTF A;  2O9O A;  2VKZ G;  1JI1 A;  3GU9 A;  3P74 A;  3KVK A;  3WLN A;  1T7L A;  4GPN A;  3ARU A;  5BOO A;  1RSC A;  1Z42 A;  2C13 A;  3URB A;  3IIX A;  1FWT A;  4DM1 A;  3DYM A;  3PBV A;  1VJS A;  1PX3 A;  3MWA A;  4A8I A;  2HVM A;  3QFE A;  2QQ6 A;  1RD5 A;  4ILS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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