3TX9 | Genus

Total Genus 156

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	156
sequence length	399
structure length	399
Chain Sequence	SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLWVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Studies of Enantioselectivity in OYE1 rcsb
molecule keywords	NADPH dehydrogenase 1
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Saccharomyces pastorianus
total genus	156
structure length	399
sequence length	399
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-09-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3tx9A00

2CLLA 3W9ZA 3MHGA 2R14A 1O94A 1LM1A 3QF0A 2A21A 1W3NA 2OX1A 3Q94A 2G96A 1P4CA 3MWAA 1YTKA 4HIBA 4N6EA 3S1WA 3TC7A 4LUIA 3W71A 1VLIA 3QZEA 5G2HA 5CG7A 3B03A 1S5TA 2WNZA 4CLMA 3S9YA 3GZ3A 3C2OA 3YPIA 5C55A 4Q4KA 2JGYA 3DZ1A 1UUMA 3HO8A 3P5ZA 3O6CA 4XWUA 3M7WA 1H50A 1FCVA 5AC8A 1X1ZA 4WY0F 3EX6A 1AG1O 1RPXA 3L0GA 4NU7A 4DELA 1F73A 1VYSX 2GVJA 3MYPA 4JDBA 3MMTA 1SW3A 1X1OA 3JRKA 3T40A 3LBMA 1LLZA 5HR7A 4AB4A 1TRIA 4ICNA 5HULA 3DXIA 2DZSA 1V5XA 3DI0A 3NVTA 1XBYA 5KMYA 3W6YA 2FTPA 2FPVA 3FYPA 1PV8A 1LBLA 3THAA 3MI3A 3NZRA 1IXPA 4KFPA 3EWWA 1LRNA 1FDZA 3PM6A 4UFHA 2FDSA 4M7SA 1EA0A 1F5ZA 4IMCA 1EUAA 4O4WA 1ZHAA 3LCIA 1I4NA 4NNCA 3BVJA 1BWKA 2Y63A 3O1NA 1LRTA 1PCWA 3NQVA 3W2LA 3C3NA 3HGJA 1EPXA 3L2IA 4OGZA 4TU1A 1QPOA 1OFEA 2C13A 2ZYFA 3LERA 1HL2A 1S5WA 2QCFA 5F1VA 3M1ZA 1L6WA 2G97A 3G24A 1OFPA 2QCEA 4JTKA 1FY6A 3CTLA 3FS2A 5K4ZA 2A1YA 4FNUA 3CWNA 2QKFA 1G6CA 3I6RA 3TXVA 4FXRA 1GG1A 1Q6QA 1HFBA 4FO4A 3NQFA 3VCRA 3QM3A 2H8XA 3BLFA 5F4SA 4OWGA 4K7VA 1AW5A 4LY8A 1K8YA 3GIYA 1RZMA 4JDYA 3F4NA 2WOQA 3W74A 3UPWA 3NAVA 1TPDA 2Y7FA 1GWJA 2OCZA 3UWVA 3TMLA 3EWZA 4BFAA 4W9TA 3GK0A 2VXNA 1GVQA 4PA8A 4UTMA 1OYBA 3W7OA 5IM51 1WOAA 3VE7A 1VGAA 5KSWA 2YXGA 1DJNA 4A22A 3QH2A 1OK6A 2TMDA 3A23A 2QDGA 5L6UA 2E6YA 3Q58A 2FLIA 1AL7A 4Y96A 3W85A 3BV4A 4LVBA 3TFXA 2CLHA 2VFHA 5I3JA 4WOQA 4NX0A 3HG5A 3U8GA 3OIXA 1LP6A 3W7LA 4S1FA 4ZQNA 4ADTA 2Q8ZA 3N14A 4RXFA 4YXGA 1GVFA 1JCYA 1GYNA 5AYXA 2GQAA 3STFA 1TPWA 2J9ZA 1WV2A 4RLIA 3G0SA 1TPB1 3NQAA 2ZZ6A 3QYQA 4FIQA 3IIZA 1SFLA 4JY8A 3U6WA 2DZVA 5FEXA 1CW2A 4GNJA 2R94A 3QQ0A 1BEUA 1X6UA 3TROA 3C2FA 4MUZA 4O14A 4YWIA 1FWWA 2Z6JA 4IGHA 4JN6A 3VE9A 4TX9A 3BO9A 1OFQA 5FEPA 4MFEA 1HG3A 4QSHA 3PSVA 3W23A 4BR1A 1ZAJA 2QUUA 1ME8A 2FFCA 1JUEA 4TIMA 3VKJA 1T8XA 3R2GA 4GC4A 3HB9A 3UQNA 2PCQA 4RK8A 3Q37A 1LCOA 1A5BA 1TTPA 1YDOA 2TYSA 1XC4A 2QF7A 1JR1A 2E68A 1XKYA 1FDJA 1UUOA 1OYAA 1W5NA 3VFLA 3BLIA 4Y90A 5G1TA 3W1LA 2G95A 4E38A 3OVRA 3QMRA 4O0KA 3SIZA 3MP4A 4AWTA 1SO6A 1H1ZA 3M5XA 2W0UA 1SU5A 3TV8A 4LVGA 3LI0A 3CWOX 4IMEA 4LWWA 1Z42A 5FEZA 1LOLA 4N9BA 3SJ3A 1DKWA 5HNRA 4ZQRA 3LHZA 1JVNA 3O07A 3THQA 3W7DA 1KM2A 4HNUA 5EY5A 2YZRA 3GDKA 4NJJA 3IGUA 1TMHA 2C14A 2NXGA 4ZQMA 3W7RA 3LM7A 3T44A 3DBPA 1VJIA 4A2SA 2WO5A 3HG4A 2HS6A 2H3DA 4LW7A 1N7KA 1XBXA 3MBFA 4IX0A 4PL1A 1Q45A 3EX3A 1NF0A 2V30A 1OG0A 3PB2A 5AYZA 4BF9A 4A2RA 3SR7A 4FX6M 1M7PA 2QUVA 2RDTA 3TQKA 3W1PA 4XBKA 3G1XA 4L4LA 4Q33A 3QW3A 4MZ1A 3E12A 1CX9A 3NQCA 1KM3A 3ABSA 1QO5A 3W2MA 1S3HA 4A29A 5G2IA 4N9EA 1EIXA 2YYUA 3QJAA 2RDUA 4K8EA 3O6DA 3W07A 4FX8A 8TIMA 2QAPA 5CZSA 4DBDA 2FPYA 3GAYA 4BI6A 1KBIA 1KFCA 3P61A 2YR1A 4ML9A 3NPVA 3MHUA 2DZUA 4TMCA 1J2WA 3HPSA 4CNPA 2J24A 4NJGA 3KRSA 3OA3A 1KW1A 2W6RA 5U7SA 5SWUA 2ZBTA 1IGSA 1P5BA 1NFBA 3ZWSA 1X8FA 1F6KA 2Y7EA 3LRMA 4Z08A 1I2RA 1BWLA 4DEFA 3W7PA 1VR6A 5D03A 1JQVA 3QQ1A 3W1AA 3W7EA 4HPJA 1UCWA 3M5YA 3KHJA 1FDYA 3MI2A 1BKSA 4U4MA 1YXCA 2VENA 1M7OA 4HT3A 4PH6A 1TTIA 1PE1A 4M6QA 4JTFA 1WBJA 4FHAA 3NPWA 4HPXA 1VS1A 4O28A 2BSLA 3BARA 1SO3A 1QFEA 2CZDA 3TW7A 1O5KA 3EX2A 3G1AA 5D09A 2ALDA 3Q2DA 1AK5A 4O19A 3NPUA 3W84A 3IGXA 4IPJA 1YTEA 3W87A 4FIRA 3B06A 4AH7A 1I2OA 4ADUA 3T78A 1DL3A 2ZRUA 1DQXA 1L6YA 3LV6A 4JIQA 2YDAA 2ZTJA 1FCUA 1G69A 3ZFHA 1R47A 3W1NA 3DFPA 2Y88A 2J9XA 1W3TA 2A4AA 3GDRA 3DU0A 3M6YA 3GR8A 3L0KA 1HUVA 1W5PA 1V7YA 1K7FA 3CEPA 3P67A 3UWYA 2E77A 2JK2A 3G22A 1KLYA 4JYEA 4H4IA 4ZQCA 3L9CA 1XBVA 1TV8A 1EEPA 2EAWA 3EB2A 3KVJA 4Z1AA 3M9YA 3MHFA 1GTHA 4JTTA 1H7RA 4OV4A 1Q6OA 1OK4A 5KZEA 2XN2A 5CSRA 3FOKA 4CCCA 3LCXA 1EP2A 1OVDA 4N4PA 4O53A 3IVUA 4JICA 1I8JA 2JKEA 4QQ3A 1TYGA 2P0OA 1P0KA 1LOQA 2CLKA 4NZJA 4LVFA 3LCWA 3MUXA 3KVKA 2QDHA 3TFCA 5EL1A 3NYZA 4WX2A 2X1SA 3T7VA 3UD6A 2ABBA 4R53A 2VFFA 3O06A 1YPFA 4YL2A 5HUPA 3NL6A 2DORA 1GVOA 4K8HA 3IIPA 3MBDA 4M19A 5K9CA 1KM1A 3LV5A 3NQMA 5G4EA 2EF9A 5E93A 1UBSA 3W1MA 3C0JA 1JJKA 4ADSA 3TW6A 5LKYA 5GVJA 2EHHA 3PG8A 3O8AA 3LDVA 1JCJA 3LCFA 2FQIA 1O4UA 4AEOA 3TSMA 1SUXA 1KLZA 3HJZA 4O13A 3FIGA 2GJNA 2C0AA 2O7QA 4K38A 4NXKA 2FPTA 3PR2A 3W72A 3BW3A 1Q6RA 5C5YA 3HG3A 4O10A 3NOEA 2GQ9A 5F2LA 3TX9A 3L5MA 1SO5A 5CPLA 3KAOA 3STCA 3QEZA 3I7QA 1H7PA 2OJPA 3DH7A 3P62A 4UFIA 3K30A 1NEYA 3IVTA 4JX4A 4GUFA 1GQNA 2CLFA 3DENA 2V81A 1R46A 3W2KA 4O8RA 4LVAA 4UTIA 4GE8A 1JCXA 1ZALA 4D2JA 1ME7A 1Z44A 1I2PA 1KM4A 2O7SA 4X9SA 3TNOA 2NWSA 3C2VA 5HWNA 2WSYA 4QIUA 3FKRA 2A5HA 1TCDA 2ZRXA 3GB6A 3RNDA 3W7MA 3GXTA 2C15A 4EF9A 1EWEA 3NQ7A 2QCMA 1OFAA 4RZ4A 2FJKA 4QAIA 2DJXA 2ZDRA 3LX9A 1LORA 3HQ1A 2QCCA 1TB3A 3W2UA 3L68A 1S5VA 1QAPA 3BGJA 2C18A 1VYRA 3MI6A 4OE7A 1DJQA 3G0UA 1GPWA 3IIXA 3TQ0A 4A3UA 1TPC1 2QAFA 2FIQA 2VEMA 3GXNA 1A5CA 4NJKA 1OFDA 1RQHA 4O11A 4O50A 5K9XA 1H5YA 1VYPX 5AC7A 4RZ5A 4PTNA 2VEIA 1DQWA 3C2RA 2NUWA 4G1KA 4MYXA 4YMZA 1HTIA 4FNSA 3W1UA 2GVLA 1LZOA 3ZWTA 1WOBA 2ZTKA 4Y6GA 5LNRA 3ZR4A 4IXHA 1F7BA 4YLWA 2NX1A 4DO4A 4JR5A 1H7WA 2FB2A 1H63A 2B7QA 3PWAA 2OMAA 4JTUA 1H61A 3M47A 1DHPA 1J4EA 4LS0A 1MXSA 4MKNA 5F2MA 3NL3A 1LRQA 1PS9A 4NVTA 4TMBA 3GDMA 4IQLA 3W86A 1Z41A 3M41A 2AQWA 5AHMA 2HTMA 3S6DA 3L67A 4AHQA 5FF2A 3LHVA 3GXPA 3O63A 3DHFA 5D2TA 4LS1A 1SPQA 5KINA 3PS7A 4POCA 2R8WA 2YFOA 3V75A 3NEVA 3TXZA 3GX9A 3W1XA 1K02A 1KFEA 4O15A 4PEKA 5F4WA 3G8EA 3UWQA 1G4TA 2ZA1A 4K39A 4O12A 1ZCOA 4ALDA 3CQ0A 1W0MA 3EXTA 3TKFA 5L9FA 3C6CA 4P2VA 3CT7A 3C52A 1GVRA 1IXNA 3G1VA 4JXCA 3I68A 4IPIA 4RZ6A 3S5NA 2D73A 1KBJA 4XTIA 2VOMA 1DBTA 3TSDA 2DZPA 3R13A 1TV7A 2WNQA 2NXHA 5CPOA 3G3MA 4UMCA 1ZJIA 2ZZ7A 3PULA 5G5IA 3O16A 3TAOA 2NX3A 1G4SA 4O1DA 2ATSA 3BG5A 3HOJA 3W2NA 1KFBA 2JKAA 2BWGA 1FBAA 3SW6A 3UWWA 3E96A 3L0NA 4RKAA 2Y6ZA 5DXXA 4N2YA 5CPNA 4ORMA 2XFWA 3G1YA 5BW6A 1PCKA 2ATMA 4K6AA 5DXYA 2C19A 3L65A 2J27A 3DFOA 5HWMA 4UIOA 4XKYA 1TREA 4B5NA 3B0PA 4MLJA 2ZFAA 4X22A 3S42A 3UWUA 2CFFA 4UNLA 2ZQ0A 4GUIA 1AW1A 1ICQA 2DJLA 1B4EA 1QPNA 2YFNA 2CLMA 2WPBA 3C2EA 2E09A 2ZA3A 3N2XA 3KXQA 1Q6LA 4KFNA 5FF3A 4UUIA 4DF1A 1TPH1 3WK1A 4MLRA 4UFJA 2E6DA 3FKKA 2B4GA 2QUTA 1QDSA 4GRSA 3INPA 4O4VA 5HMSA 1EP1A 2H8ZA 1I2QA 3BLEA 3GNDA 2GJLA 2YW3A 1W54A 2PE4A 4EOUA 3WJXA 1LOSA 4MZ8A 2ABAA 1AW2A 3UY7A 4OT7A 1VCGA 1YLVA 1Q3NA 1NSJA 4IMGA 1OX6A 3RLVA 3AJXA 3BGGA 2RFGA 5C6MA 1B57A 2LLEA 3STEA 1WYIA 3EX1A 4E2BA 5FF0A 1MZHA 3N3MA 4C1LA 2Y7GA 2OT1A 3BG9A 2VKZG 3QSRA 4GXMA 2NUYA 2AAMA 3NA8A 4R7JA 1LBMA 1OX4A 1UJPA 1JQXA 1TIMA 5G1YA 5KZDA 2VEKA 4BI5A 2CW6A 1H1YA 4TO8A 4AVFA 1FXQA 1LLWA 4H6KA 5C2XA 4LRTA 3HPZA 3TQVA 1T0OA 1FQ0A 5BMWA 2JBMA 4DQWA 5J5DA 4PL2A 2QCGA 3A5VA 1FUYA 5H91A 2CLOA 4FF7A 3F03K 3RFAA 4FEZA 1O95A 3DFSA 3NXFA 3TC6A 5DCDA 1W56A 5I3GA 1MEWA 4DF0A 4KWVA 3W7NA 4O57A 1YPIA 4GUJA 1WAUA 4JY9A 5D04C 3HGRA 4O0ZA 4I7WA 1EWDA 4AMAA 4GUHA 2BZNA 2C1HA 2UV8G 3N9SA 5D2WA 1O5XA 3C56A 2VFEA 5CZJA 1K3UA 1SFJA 1I45A 3H54A 2Z1BA 1Y0EA 3M0ZA 2QJGA 2J9YA 3LXCA 4K37A 4NZFA 1WBHA 1OFRA 2V9DA 1B3OA 3QC3A 4A21A 1XDMA 5TIMA 4ZL1A 3MYOA 2BLEA 3LCHA 3WK2A 3PF3A 2XN0A 1MEIA 4UCGA 4HHPA 2YW4A 4P61A 3NM1A 1A53A 1YDVA 4NJIA 2GUUA 5LZLA 4AXKA 1K7XA 4DBEA 3GNNA 3DI1A 2PRLA 3NR0A 4M7TA 5K7JA 2DZXA 3SI9A 2V2HA 3P82A 3R12A 4Z0JA 4RR4A 3LOTA 2Q3OA 4HNTA 2J88A 2G5WA 3B8DA 2H90A 2B7OA 4DF2A 3N19B 5D38A 1VC4A 3DFTA 3PAJA 3SSJA 4ZZ9A 1ONRA 1MEHA 5D32A 1W1ZA 3NDOA 5LNWA 1C8VA 5LSMA 5DY3A 4Y8FA 2X16A 2Q8LA 4HSOA 2B7PA 2E6FA 2E5DA 4XZ9A 1GEQA 2HMCA 3UNDA 2QR6A 3KVMA 5CZ0A 3S0CA 2V2DA 2A0NA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TX9A

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Chord Diagram

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