3TXZ | Genus

Total Genus 158

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	158
sequence length	399
structure length	398
Chain Sequence	SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLQVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase doi rcsb
molecule keywords	NADPH dehydrogenase 1
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Saccharomyces pastorianus
total genus	158
structure length	398
sequence length	399
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-09-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3txzA00

1I4NA 4UTLA 3T44A 3S0CA 1F6KA 2G97A 2I9EA 2P0OA 4EF9A 2NXIA 1GVRA 4PODA 4FB7A 1HL2A 3UWUA 4ADSA 1GEQA 3I65A 1YTEA 3NVTA 1JCMP 3LI0A 3GB6A 3QW3A 4JR5A 3PUDA 3HMJG 3GKFA 2E5CA 1RQHA 3KRSA 5BRBA 1XBXA 5C6MA 3WJXA 3TNOA 5MHBA 3EXTA 3QH2A 3QQ0A 1H50A 3BW2A 4O4VA 5AYXA 3ATYA 2Q8LA 3NQVA 2Z6IA 2YYTA 2ZRYA 2X16A 4MYXA 4CNPA 3UXAA 1SQ7A 2HSAA 3PSVA 3G8RA 1SSGA 4IPJA 2HTMA 3FS2A 1LRQA 4UTMA 1W54A 1F6PA 2C15A 1L6WA 1O4UA 4W9TA 5HMSA 4M19A 2XN2A 4M6PA 1XI3A 2ZRUA 2CZFA 4MIMA 1FDJA 2J9ZA 4BI6A 1EIXA 1RQBA 2W79A 3QPYA 4QNWA 3LLDA 3VE7A 3DFSA 3KRUA 3GR7A 4TIMA 4NQ1A 3WJWA 1KM3A 2VFEA 2TYSA 4R53A 3W71A 4RZ5A 5IBXC 1XL9A 5AHMA 3UY8A 3HF3A 2VEIA 3NQAA 1G69A 1W31A 2J9XA 2A2IA 4FX8A 4GNJA 4HHPA 1JULA 4LT9A 3NA8A 5D02A 4N02A 1VCVA 4DBEA 1SW0A 1LOSA 2ATSA 3BG9A 3ZWTA 1FCBA 1W5QA 5BMXA 4E2BA 2V30A 1D3HA 2DZSA 3HPXA 1KA9F 3MHFA 1D3GA 3W83A 1LYXA 3KFTA 2Q8ZA 2V2HA 2XN1A 3DXIA 3S1UA 1TREA 3C0JA 3VE9A 1ZENA 3AJXA 3FYPA 1G7VA 4LUJA 1SW7A 4N9EA 4CNNA 1ONRA 1G6CA 1GYNA 4QAIA 1G67A 2Z1BA 3HPZA 4IX0A 2VOMA 4ZL1A 5D05A 1W1ZA 4E38A 2J9YA 1HUVA 5CZJA 3PC0A 3DBPA 5KZEA 1YTDA 2ABBA 3OIXA 1WXJA 1JR1A 1AW1A 3I7SA 5IBXA 4NNAA 4WY0B 1TPC1 4O19A 3FJLA 4OV4A 2TSYA 1T99A 1SW3A 4NJHA 1YTKA 3UNDA 5BW6A 2RFGA 1DBTA 1DV7A 3I6RA 3P8JA 3MYPA 2FPTA 3W87A 1EB3A 2E5BA 5HJLA 4QJ1A 1JUEA 3GDLA 3EB2A 4YXGA 4ADUA 1UB3A 3DFTA 3ABQA 5HQEA 5F4WA 3PM6A 3R12A 3H55A 3LV5A 4MJMA 4NJGA 3MO7A 4UTHA 1KM2A 3STEA 3KHJA 2J88A 3G8EA 1L6SA 3M16A 3LBMA 5LZLA 4GFSA 1WV2A 3P60A 4BI7A 3UZ5A 3ABOA 2X1TA 1Q45A 2V2DA 1OK4A 4N6FA 2VENA 4MZYA 3NYZA 1FQ0A 3TUUA 3W1LA 1ZAIA 2QCDA 2TMDA 5K7JA 1VZWA 1YLVA 1NSJA 3NL5A 1BWLA 3SGUA 3LBCA 2H3DA 2ZA2A 1W5PA 1OFPA 4IQLA 5CG7A 5E1QA 3NO5A 3GNDA 3KRZA 2NV1A 4Q32A 1PCKA 3C2OA 1GVSA 2PRLA 3TJXA 4JTHA 2WSYA 3W1PA 2NUWA 1GPWA 3L0KA 4WY0F 4O0KA 3S5ZA 3C2EA 1QPOA 1BTMA 3C4UA 4U28A 4UTWC 1TPWA 2B4GA 1C9DA 4KWWA 4JTEA 5KZMA 1HFBA 4PFMA 2CW6A 3Q37A 4UFLA 1PIIA 2QCGA 2V82A 3NQFA 2QAFA 2Z0IA 3W2UA 3NZRA 1H60A 5FEZA 3E02A 2EPHA 2J6XA 1QO5A 3TCEA 3LCFA 3TFCA 4OHQA 5AHFA 1TPH1 4LS2A 4CQ8A 3R13A 3B4UA 3NNTA 3IIPA 4Z1AA 5FEPA 3BO9A 2BLEA 1JCYA 1AG1O 4O1DA 1EUNA 3R89A 4IUOA 2YXGA 5I3JA 2YW4A 4S2CA 2C19A 1WX0A 1RD5A 2QUTA 4KKXA 3ELFA 1AW2A 2WJZA 3HQ1A 3W1XA 1JQXA 4MKNA 2O7QA 2CFFA 3GDMA 4LS1A 5CKSA 4JTTA 4LRTA 1QMLA 3EX2A 1Z44A 5KITA 4FX6M 3KVKA 4Y6GA 1A53A 1GVFA 4AHQA 1Q6RA 1LROA 1OF8A 3C56A 3ZWSA 4XKYA 4C1LA 1OFQA 3RF9A 2DZVA 5BMWA 4AHPA 2FIQA 4FX7A 2ISVA 2C0AA 3FKKA 4EIVA 4FNPA 1A50A 2DORA 3L65A 1OYBA 1R30A 5IM51 4MZ1A 2JKPA 3LOTA 1OYAA 5EPDA 1IIGA 2YFNA 3PBUA 4O15A 2WKJA 1XDMA 2A0NA 3W1RA 3A21A 3FFSA 1QPRA 3LERA 1R46A 4O10A 4KFOA 1GVOA 2QCNA 3GDKA 3QM3A 2H8XA 2C1HA 5LKYA 1JCJA 3C2FA 3UPWA 1HO4A 1KLZA 2ZTKA 2E6AA 2Z6JA 1JCNA 4NZJA 4AAJA 4MUZA 3NL3A 4O17A 1OFOA 3TA6A 2X1RA 3O15A 1OABA 3LTPA 3QMRA 1UUMA 2NUXA 3M5YA 3ABRA 3DFOA 3YPIA 4FXRA 5L6UA 1TRDA 4UNKA 1X1OA 3PWAA 3RNDA 5AHNA 3A5VA 3HG4A 4MYAA 1IXOA 1TTPA 3S5YA 5DELA 3E0IA 2J24A 1H63A 2YCEA 5G4WA 2QUVA 2CLMA 3CC1A 8TIMA 4FIQA 1IGSA 1KV8A 4UTKA 2H90A 4JYEA 4X2RA 1LDCA 4RZ4A 3STFA 4H6KA 1H7XA 1LLZA 1VYPX 1H7RA 1VPXA 3MW7A 4NNBA 5TQLA 3W70A 4R7JA 4JYDA 1HG3A 3LHYA 5AOUA 2E09A 3SR7A 4JIQA 4UR8A 3LHZA 1SSDA 1FWSA 4I7WA 3MP5A 3NAVA 3JRKA 2TRSA 1LRNA 1RPXA 3SW6A 3W7PA 4CCCA 4Y90A 4N6EA 4ZQCA 3QF0A 3V75A 4LVBA 3BGJA 3F4NA 1GYLA 3SJ3A 3DI0A 1S5TA 3NQ8A 2A7RA 1ZJIA 1KBJA 2YYUA 3S5OA 2R91A 3LCXA 4UFHA 4LVFA 3GVGA 2FB2A 3S9YA 1EWEA 3W7GA 1TYGA 2FPYA 3W7QA 5CZSA 3STCA 3HBLA 3MHGA 2UV8G 2W0UA 4Y9AA 1IIHA 3M1ZA 2RH9A 4NU7A 1S5VA 2HS8A 4Z1DA 2RDTA 4CLMA 3O8AA 4UFKA 3GXPA 2O7SA 4JDBA 1EP2A 1VLIA 4AH7A 4GE8A 4ZVJA 1WBJA 4K37A 1TTIA 4HIBA 2VELA 3CTLA 1E51A 2FLIA 1C8VA 3O6YX 4Y8FA 5I3GA 1W5MA 3I7QA 1XCFA 1TCDA 2E6YA 5BNKA 4BI5A 1SZNA 5H91A 2ZZ7A 5D30A 1GZGA 3UWQA 5D2TA 3EXSA 4JX6A 1O94A 4HPJA 1KW1A 5C54A 6ALDA 3W75A 5H2ZA 1M7PA 3KOFA 4DPQA 5K2ZA 1TMHA 2YX0A 3G18A 3W7JA 1A5BA 1PS9A 3W73A 3E9AA 3THAA 3S6DA 3W2KA 3G24A 5CPMA 1VYRA 3Q94A 1YPIA 4JTFA 4XBKA 4XTIA 3W72A 3C2RA 1H61A 1SZEA 3W23A 4XKYB 4OQVA 2CLFA 1M7OA 3TROA 4Q4KA 1TIMA 4HSNA 1GTEA 1XFBA 1AW5A 3DGRA 4K8HA 1TQXA 4RV8A 2JKAA 1BEUA 1FDZA 3PR2A 4S1FA 4ZQRA 5I3HA 2E1DA 2Y89A 5F2LA 3TE9A 3DU0A 1LP6A 1MEHA 1Q6LA 1F7BA 3LCWA 3EWYA 1H1ZA 2QAPA 4OV9A 1W56A 1I2PA 4AB4A 3IEBA 3W6YA 4M5PA 4IXHA 1LORA 5CZ0A 2OT1A 3QC3A 5FF0A 1VR6A 1W8SA 2PRMA 4E0CA 2ZBTA 1EWDA 3W7MA 3KVMA 1J2WA 1TV7A 4IPIA 5AC7A 2GJNA 2WOQA 2D73A 4R34A 5K4XA 4RK8A 5AC8A 3VKJA 1X6UA 2BSLA 2V2CA 2FB3A 2QCLA 1TPUA 2C13A 4N2YA 5LHEA 3BLFA 1GTHA 3HGRA 3P67A 1DJNA 5ABTA 2VFFA 4FHAA 3LHVA 4DO6A 5A5WA 1SR9A 2C6QA 1XBZA 5A8GA 4IWWA 3EWBX 4HN4A 4UFMA 4WJEA 4RR4A 2PC4A 3IVUA 3LHTA 5G5IA 3L2IA 2GVJA 3SSJA 4AWSA 1D9EA 4KFNA 3SIZA 4YLWA 1H7OA 3UWZA 2Y7GA 3L21A 3P74A 1MZHA 3G1YA 1JUBA 3NQDA 3CLMA 2CZEA 5AYYA 4ZQOA 5D04C 5E93A 2E6DA 4JY8A 1THFD 4AMAA 3A22A 1J4EA 4JTIA 3A5FA 3N14A 2NX1A 1B57A 5D2YA 1SO6A 4JIPA 4A3UA 3WJYA 3NL6A 3P5ZA 2EKCA 1F73A 4OBTA 5KSWA 4OT7A 2Q3RA 4UIOA 2QCEA 3N19B 1AK5A 4UFJA 2ABAA 1K8XA 3P81A 1PE1A 3TX9A 2FQIA 3S5NA 3QSRA 4LS0A 3BVJA 3P7YA 3MMTA 3OHIA 4LC6A 3KXQA 3NQ2A 1WQ5A 2DZWA 3EX6A 3LLFA 3PULA 3FA5A 4J9JA 2DZPA 5CZTA 3W2NA 2Y61A 4JTKA 3NPVA 3NZ1A 1FWRA 3IVSA 4HNNA 3USBA 3CT7A 3CEUA 5K9CA 3PS7A 3SFKA 1H5YA 1TJPA 3TAOA 1LOQA 2R14A 4OGZA 1K8YA 5G2IA 3TH6A 4HPXA 4A2SA 1H7PA 4N9CA 2ZA3A 3N73A 4UMCA 2ISSA 3O1NA 3M44A 2ZA1A 1XBVA 2B7PA 1ZALA 1I2QA 4N4PA 2ZTJA 3DHFA 2DP3A 3UYCA 5E0KA 1N8FA 1I2RA 1SFLA 3TMQA 1RQEA 1TV5A 1K7XA 4MY9A 5F2MA 4QQ3A 5AHIA 1XM3A 3L0GA 4O28A 2F7FA 1TJRA 3THQA 1TB3A 1OK6A 3QRHA 4O54A 1P4CA 2A1YA 2TPSA 1UCWA 2Y63A 1B4EA 1O5XA 3LXAA 5FI8A 3A23A 2CLOA 3QQ1A 4FNUA 2HS6A 4LW7A 4MZ8A 4X3ZA 3VFLA 3Q58A 1TO3A 2YZRA 3M41A 2YGYA 5GVJA 4O57A 2ZYFA 5I3KA 2RHGA 3LHWA 2C18A 1LM1A 4MY8A 3STGA 3GYEA 1AL7A 4O0ZA 4HNTA 3LM7A 3W7CA 1I2OA 4PCFA 1R47A 3S8HA 4LTSA 2GQ9A 1JCLA 3W7RA 4A29A 4UTJA 5DXYA 3TJLA 4ALDA 3C2VA 4H4IA 4PTNA 3R2GA 4N4QA 1MXSA 4OE7A 3MI6A 1KTCA 2VEPA 5EYWA 1OJXA 5KTLA 3R5EA 4AVFA 4DF1A 2NV2A 3NXFA 4LVAA 1UASA 2Y62A 4XTDA 1YXCA 4GUIA 5AN7A 3GDRA 3T55A 1JUKA 3QPZA 3W76A 1ML1A 3F03K 5LGZA 1RVGA 4RXGA 3W1TA 4OU1A 3EWXA 4O1AA 4UTUA 2YW3A 4I7UA 4ZMGA 4K6AA 1WYIA 3Q2DA 1K7EA 3NR0A 4CCEA 1PVNA 4RXFA 5KZDA 3W1UA 2I14A 4RX0A 3BG3A 2QCCA 2GQAA 4FIRA 3ZS4A 3F4WA 4NXSA 3FEMA 5AHEA 3W2JA 2Y6ZA 1KFBA 3PBYA 4ZZ9A 3G1AA 2E5DA 1GQNA 2H3BA 2EGZA 4HNVA 1R2TA 1JQVA 4D2JA 3CWNA 4Y96A 5LGXA 3OEXA 3R8RA 2B7QA 1CX9A 4LRSA 5T26A 4O53A 2ZFAA 4HKPA 1GG0A 1TTJA 1VHNA 4TMCA 3AO0A 4JTUA 3KAOA 3LCIA 4JXCA 1ZHAA 5FF2A 1NFBA 1IXQA 4NZFA 3TSBA 3IGXA 3TFXA 5HWMA 1TSIA 5D2VA 3TW6A 1ME8A 3KVJA 4U4MA 3LGEA 4ML9A 1OVDA 4UTIA 2F84A 3ANYA 1IXNA 3PG9A 3TR2A 3S1WA 3IV3A 3PB0A 3W84A 3UD6A 4O50A 3RU6A 3BLIA 2NLIA 5I3IA 2NXGA 3NQMA 2GQ8A 4FO4A 4P2VA 3W7EA 3HGSA 4S2BA 3WK2A 1N55A 4R33A 6TIMA 4PL1A 4JYFA 3GDTA 3QEZA 5HWJA 2BTMA 4UMAA 1LLWA 4XZ9A 3HO8A 4TU1A 2KZHA 3FOKA 1FX6A 3M5VA 3NQCA 1DOSA 4MOZA 2CLEA 1T96A 2WNZA 1KTBA 3LTSA 4UUIA 4CQ9A 2ZCGA 4O18A 4TO8A 4HNUA 1ME7A 3DKJA 2BXVA 1TPDA 3CM4A 1W3TA 2EHHA 3CIWA 3W1AA 5FF3A 4AWUA 1A5CA 1K7FA 3DFQA 3LCGA 1M6JA 3M6YA 3VI2A 2A4AA 2Y7EA 1SU5A 3MYOA 4NJJA 4JTLA 2V9DA 4C1KA 3FLUA 3G3MA 5D03A 2DZTA 2B0MA 3OVQA 3L67A 3FYOA 3EWZA 3B03A 5TBOA 1XUZA 3UPBA 4UFIA 4RKAA 5HINA 3PVFA 1B9BA 1OHLA 2QCMA 4FF7A 4JDYA 1DQXA 3GXTA 1G7UA 1OFDA 1OF6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3TXZA

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