3UQNA

Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with oxamic acid at 1.9 angstrom resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
TIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Acinetobacter baumannii
publication title Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from Acinetobacter baumannii complexed with Oxamic acid at 1.9 Angstrom resolution
rcsb
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
total genus 112
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2011-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uqnA00
3NQ2A 1A5AA 1GG1A 3BG5A 3BLEA 5DY3A 1H63A 3VCRA 2CLMA 5F4WA 2KZHA 3TDFA 2H6RA 4PH6A 1GQNA 3IVSA 2YX0A 1W5MA 3NL6A 2GPTA 3W7NA 5AC6A 4UIOA 4Z0SA 3RFAA 1H7WA 2BX7A 2WSQA 1EB3A 3DFOA 2ZDRA 1P4CA 4K7YA 1A5SA 3G1YA 4UTKA 1EX5A 4HSOA 3G1VA 4K8HA 1P1XA 2ZA3A 4IGHA 3W7KA 3KHJA 2JKPA 3HPZA 4XBSA 4CQ8A 3KOFA 1XBVA 5K9CA 2WSYA 1BWLA 4O28A 3LDVA 3U6WA 3EWXA 5BRBA 1A50A 1M7OA 4LVDA 3VI2A 3P60A 5BMXA 3TUUA 3BARA 3QQ0A 4CCEA 4LUJA 4O52A 4TX9A 1WV2A 1HFBA 2NUYA 2B4GA 3HGOA 4UR8A 1WOAA 5KINA 3GNDA 4JTFA 2R8WA 4XZ9A 3W1UA 4CCDA 1AK5A 3AJXA 4UTTC 4KFPA 3W1QA 1QCWA 3NZ1A 1IIHA 3V75A 4IMDA 2V8ZA 3G18A 1KTNA 2XN0A 1IXQA 1C9DA 1KFKA 1H1YA 1H1ZA 3E96A 4IPIA 4LT9A 4ALDA 3W2KA 1MO0A 1YADA 3WK3A 4UCGA 5K4ZA 3B8DA 5K7JA 4O50A 2ZQ0A 3IVUA 4UTHA 2V9DA 4JIPA 1XM3A 4XQ6A 2B7PA 3WK0A 1I2RA 2DZSA 4FNRA 5EY5A 4OBTA 2YFOA 3IRDA 3LTSA 3M0ZA 1XBZA 1TMHA 3G1XA 5F1UA 2ZRXA 3TFXA 2WO5A 2V81A 1F2JA 1QO5A 2FPTA 3M41A 1DQWA 1FXQA 1XC4A 3LI0A 2VKZG 1B4KA 3DENA 1QFEA 1RVGA 3IIOA 3W1PA 5AYYA 4NJKA 2GVGA 3I68A 2YYUA 3B03A 5CGQA 7TIMA 4LVBA 1H5YA 4O0KA 1QOPA 3PWAA 5HWNA 3B06A 1TV7A 3SY5A 2Y88A 1TTJA 3LLFA 1JQVA 1JUBA 4RZ6A 1L6SA 1GPWA 1KV5A 2Y61A 4O12A 5F2MA 1OVDA 1GVQA 2VFHA 1L6YA 4JY8A 1FDZA 4FNTA 2C19A 2ZRWA 4NJJA 1KM3A 4Y96A 4PEKA 4JNMA 3IIXA 3LHUA 3TCEA 3GAYA 1SU5A 1DJQA 1H7XA 2Y7FA 4IX0A 2QUVA 3LXCA 4C1KA 4HNUA 4ZQRA 1UASA 3MI2A 2RH9A 5CZJA 2VOMA 2NX9A 2XN2A 4AF0B 1IGSA 1ZAIA 2DZUA 1ALDA 3QPZA 3AO0A 3DAQA 4K36A 3QEZA 3EXSA 3W76A 1VS1A 4JTGA 1LM1A 4LRSA 2GJNA 1ICSA 2I1OA 2ZRVA 2LLEA 3QQ1A 3W73A 2A1YA 1KW1A 5HINA 1M5WA 3L9CA 3CM4A 1HG3A 1FQ0A 1K8XA 3K30A 2QCDB 4O16A 3STGA 3ZR4A 3ZWSA 1G6CA 3PG8A 4Y6GA 5D03A 3RLUA 4JTHA 1OYAA 3Q2DA 2NXIA 3M43A 1VGAA 3GAKA 1NFBA 3TW6A 2P10A 4ZQNA 3IIPA 4YXGA 2A7RA 1GOXA 5AFDA 1WBHA 5I3KA 3EX6A 2FPYA 5DCBA 1FX6A 4S1FA 5C2XA 4GNJA 3C2VA 3W6YA 3G0XA 1Z44A 4MIMA 2VFDA 3GR7A 4GJ1A 3JRKA 1JRBA 3G3MA 3MYPA 1X8FA 3DHFA 3PF3A 1W1ZA 2NZLA 4FEZA 2PRHA 4FNPA 5F1VA 1Y0EA 3P62A 3GX9A 3BW2A 3I65A 4DXVA 1M6JA 3LBMA 1XDLA 2E68A 3UZ5A 3W7GA 1IXNA 5LHEA 1GWJA 1SFLA 2ZRZA 5AHLA 2RFGA 4UTWA 1GT8A 4ICNA 4UNLA 3W86A 2FLIA 4GUJA 1JVNA 5F4XA 1NF7A 3TMQA 4GRSA 3N9RA 3NZRA 2VC6A 3QMRA 2I14A 3DFSA 4QM1A 3UWUA 1B9BA 4LU0A 4Z1CA 4AF0A 2E6DA 3BG3A 1LDCA 4PFMA 3UXDA 2I9EA 3W7CA 3GK0A 3BW3A 3NPUA 1W8SA 4NJHA 3IIVA 3PR2A 1D9EA 3LHVA 4WOZA 2YCEA 2QCDA 2QEZA 1HO4A 5K9DA 3I7QA 5D38A 4LS2A 2J9XA 4X3ZA 3BG9A 3PG9A 2R91A 4UTTA 3HPXA 2DJXA 4L4MA 1TQXA 4UMBA 3USBA 3LHWA 3HMJG 2F7FA 1KBIA 2V0TA 4Y90A 1X1OA 5K4XA 5G5IA 3CEUA 3O15A 3TK7A 1XBXA 3I6RA 2ZA2A 3OBKA 2QUUA 4EOUA 5DBTA 1GZGA 1RQHA 2G97A 4XKYA 3BGJA 1ZAJA 3PUOA 2TMDA 3GDLA 1FWRA 2A85A 3HG3A 3L0KA 1G67A 2B7OA 5HR7A 1ZALA 1JCXA 1GYLA 3LHYA 1SW3A 3UPBA 1W5QA 2A2IA 3IGSA 3ELFA 2B7NA 3E12A 3EX4A 1FWWA 5TIMA 4LS0A 4M6PA 2X30A 1FCUA 1TJPA 3ABRA 4UFLA 1HO1A 4GUFA 5BW6A 1XUZA 4KFOA 4AMAA 2NXHA 1NAL1 5D04C 2ZZ6A 3LM7A 4YL2A 4O8RA 1EPXA 1WXJA 5CKSA 3A23A 3CB8A 1T99A 5F2LA 3EB2A 1YPFA 2C16A 4HNTA 3R89A 1YXDA 3MHGA 1I8JA 3PUDA 1DL3A 4GFSA 5C5YA 3TV8A 3EWZA 3E49A 4QITA 2DZVA 4JTJA 4AH7A 3CU2A 2JKAA 4LC8A 4IMEA 3HJZA 3ATZA 3WJSA 3EWBX 3ABQA 4IXHA 1Q6LA 5TQLA 3STCA 3MI3A 3STEA 3WK2A 3MBDA 4BR1A 3B0PA 4DPQA 5BNKA 1UB3A 4RJEA 4NX5A 3BK0A 3NR0A 3C2FA 3LB0A 4QSHA 3W7LA 3IV3A 4O57A 2Z0IA 1W3TA 1S5TA 2NWSA 1UCWA 1TIMA 1DORA 2V5LA 5K9XA 3QSRA 3HO8A 1TRDA 3TH6A 1A53A 3SGUA 2BXVA 2ATMA 3MBFA 3HOJA 1GVOA 2A5HA 4HPXA 1KBJA 2Y7DA 1DHPA 1XFBA 4Z0JA 3INPA 3TJXA 3KX6A 3S1XA 3A9IA 1EP3A 1XCFA 4LVAA 3GDRA 5U7SA 4QJ1A 3G1SA 2DJLA 3UWZA 5AN7A 1OYBA 1IXOA 1QDSA 4ZQPA 3BLIA 4X9SA 4FF7A 4E38A 3UWVA 2A0NA 2DU2A 3EKZA 1FY6A 1TSIA 2H3BA 1KFJA 1PE1A 4JGDA 1QPOA 3LCXA 4GUIA 2EHHA 5KZEA 1A5CA 3W1NA 4QAIA 5A8GA 1Q6OA 2QJGA 4NXSA 4IX2A 1F05A 3O8AA 2VEMA 3UZJA 4JX4A 3NL5A 1KFEA 4R53A 2CU0A 1EP1A 1CW2A 4BK9A 5I3FA 3G24A 3H53A 3W1LA 4WY0F 3T55A 3S5ZA 1RQEA 3LGEA 5FF7A 4KKXA 4FHAA 4HSNA 2BTMA 4Z1AA 4OE7A 5D37A 3HB9A 1TB3A 4JR5A 1W56A 4Q33A 1WAUA 3P81A 1SW7A 1TCDA 3HF3A 3UXAA 4NJGA 1OFOA 4DF0A 2QAFA 5KTLA 2PE4A 4D2JA 2FFCA 1AW2A 1WBJA 3HG5A 2CLOA 1F5ZA 4L4LA 3GR8A 3G22A 4NNCA 2NWRA 5AYZA 4AWTA 2DORA 3GKFA 1LCOA 4KWVA 4UMCA 3SIZA 3S1VA 1SW0A 1SFJA 1T8XA 3KRUA 4DBEA 4FIRA 3RU6A 2QKFA 3NAVA 4QISA 5CPNA 1WDWA 3THQA 1RR2A 4O18A 4IOTA 3TC6A 1IXPA 1B57A 4ADSA 1BKSA 2FJKA 4OHQA 3IEBA 3FJ6A 4DELA 3W7OA 2G95A 5FF2A 1QMLA 3LLDA 1VCVA 1VZWA 4HHPA 4GE8A 1GTEA 3BVJA 3TR2A 1FWSA 1H60A 1JCYA 3CIWA 1KTBA 4FXSA 1JUKA 1F6PA 1HL2A 4JTUA 2WJZA 1GJPA 5K3VA 5HNRA 2GQAA 2YSWA 1H61A 4IXXA 2PCQA 4O13A 1AMKA 3W9ZA 3LV5A 4MY8A 2JGYA 1H7NA 3PB0A 1ONRA 4N4QA 3MHFA 4G1KA 1KM2A 3W1MA 3L0NA 5G1TA 4CCCA 1FCVA 3L0GA 3B04A 4TR9A 2QJHA 1D3HA 4MLRA 4C1LA 5DY2A 3QM3A 4O14A 1F73A 3U8GA 1LYXA 3GNNA 1HTIA 3P84A 3ANYA 2O7QA 4NZFA 2ZA1A 2C0AA 2PC4A 5FF0A 3CIXA 4AXKA 2WKJA 3HG2A 4FB7A 3MMTA 4QNWA 4ONVA 1J2WA 1ADOA 4MFEA 6ALDA 3PBYA 3KVKA 3G0UA 1FWNA 3QH2A 4ZQOA 5LKYA 1FDJA 3SGZA 4CNNA 1U5JA 1TYGA 1I2QA 3PY2A 3R5EA 1F74A 4PL2A 2TSYA 1TRIA 3C2RA 1G7UA 4MY1A 3QC3A 2CLLA 2RDWA 3A24A 3W7MA 4JYDA 4A21A 2QCCA 3LTPA 2ALDA 2C18A 5LHFA 3ZFHA 4E2BA 1YXCA 2CZFA 4JX6A 4MOZA 5HJLA 4AAJA 3QSTA 3ABSA 4WZHA 4NU7A 2Z6JA 5E93A 3T4CA 2E77A 1S5VA 4AVFA 4HN4A 1OF8A 2YXGA 3Q37A 2HSAA 1I45A 4OGZA 1CI1A 1SSGA 1MXSA 3G1DA 4Q32A 4I7UA 2FPVA 4QIUA 4JDBA 3LOTA 3UQNA 1LBFA 1H7PA 1VLIA 4LUIA 4BI7A 5G1YA 3THAA 4NUWA 1JCNA 4JTLA 1FXPA 2QCEA 1LRQA 4LY8A 5IM51 1ME7A 5F4SA 4XTDA 4RR4A 3A21A 5GVJA 3SSJA 3W2LA 3CHVA 5LZLA 1RQBA 4A22A 4HPJA 4RX0A 1ZY9A 4JD4A 4RV8A 4O15A 1BWKA 2NUXA 3HPSA 3O16A 3W2MA 3M1ZA 1N55A 2YZRA 4N02A 2V30A 3NPXA 2W6RA 4IMFA 3DI0A 3DFPA 3UY8A 4DO6A 4JXCA 5AC7A 5CSRA 3LHZA 2X16A 3W7JA 2QCNA 1GVRA 1OX6A 3MP4A 4BI6A 3W23A 3PS7A 4ADUA 1ML1A 1W37A 4EF9A 1VYPX 3A5VA 4IJBA 1OFQA 1KV8A 1RPXA 5BMWA 1TO3A 4HT3A 3QFEA 1QO2A 4O1CA 4GUGA 4MYAA 1VYRA 1WOBA 3KVMA 2Z2UA 5D05A 3JR2A 2J9ZA 4AHQA 1KM5A 2R94A 2VFEA 4X22A 4AHOA 2YYTA 1PCWA 1JR1A 4JTTA 3SECA 5KZMA 1LLWA 1TPVA 5KMYA 1QPQA 4KWWA 1BEUA 4NNBA 1F6KA 1W0MA 3PUEA 1KLYA 1P0KA 2A21A 3BO9A 1EIXA 1U83A 2Q8ZA 1OK6A 2VEIA 1UBSA 2OZ0A 1KFCA 3EKLA 3IGUA 5CG7A 1OX4A 3GVGA 3S5NA 3KVLA 4ORIA 3LXBA 5A5WA 2DZTA 1J5TA 4R33A 2V2CA 3KXQA 4NJIA 4XKYB 4O0ZA 3W7PA 5DLCA 3L5LA 3QYQA 2A7NA 4X2RA 1XL9A 4AB4A 2R14A 5KZDA 4AWSA 1EEPA 5TBOA 4M7TA 3BGGA 1I2NA 1KM4A 5CZTA 4O4VA 1R2TA 1QWGA 2BWGA 1DVJA 1TV5A 3F03K 3IIZA 2A6LA 5L6UA 1OABA 5U4NA 5D02A 1SSDA 3FKKA 1ZJIA 3LXAA 1W3NA 2HTMA 1DOSA 2CWNA 5LSMA 4DF2A 1DJNA 4JY9A 3NVTA 1TTPA 4FXRA 5G4WA 3OIXA 1OX5A 3P74A 1AL8A 1K8ZA 2RDTA 1SPQA 3HGJA 1QPRA 1ICPA 3PC0A 3W7EA 3P7YA 5EKYA 3D0CA 3TXVA 3G3DA 3N19B 2BZNA 4PTNA 4MPQA 4JIQA 5AHMA 5AHEA 4WOQA 4FNSA 2AAMA 2TRSA 2ZZ2A 1VLWA 1YLVA 1ME8A 2E1DA 5I3JA 3R8RA 2FB2A 1R30A 1Q6RA 3M7WA 4AHPA 2QCFA 3C8FA 1JCJA 1O95A 1SR9A 2PURA 3C2EA 3M5XA 5AYXA 2G5WA 1Q3NA 2ISVA 4EWND 3OA3A 2Y6ZA 1OFDA 1WQ5A 4RXGA 3N3MA 1TPWA 2X1SA 3C4UA 4Z1BA 4MY9A 4UR7A 2H3DA 3FIGA 1JJKA 5FI8A 5HMSA 1OF6A 2YR1A 3S5YA 3QW3A 3LI1A 1KM0A 3LX9A 1AL7A 3N9SA 1LLZA 1ZCOA 4GWEA 3TQKA 3NQDA 2J27A 1FWTA 3MP3A 1XBYA 5DXYA 3WJWA 2QCMA 3PSVA 3ZS4A 1GG0A 2P0OA 2FIQA 2CZDA 4MJMA 3W7DA 2Y85A 3NA8A 3O07A 1MZHA 2GVLA 2F84A 1VQTA 5KITA 1H50A 3F1QA 5I3IA 1LTDA 3W7IA 3M5ZA 4OV4A 3EX3A 3C56A 4B5NA 3STFA 2GQ9A 2GVJA 3DBPA 3LCGA 3DI1A 4N2YA 1FBAA 1QPNA 2H90A 5E1QA 5IBXC 4IMGA 2CLEA 5FEXA 1O4UA 4LVGA 1LROA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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