3UR7A

Higher-density crystal structure of potato endo-1,3-beta-glucanase
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
321
structure length
316
Chain Sequence
QPIGVCYGKIANNLPSDQDVIKLYNANNIKKMRIYYPHTNVFNALKGSNIEIILDVPNQDLEALANPSNANGWVQDNIRNHFPDVKFKYIAVGNEVDPGRESGKYARFVGPAMENIYNALSSAGLQNQIKVSTSTYSGLLTNTYPPRDSIFREEYKSFINPIIGFLARHNLPLLANIYPYFGHIDNTNAVPLSYALFNQQRRNDTGYQNLFDALVDSMYFATEKLGGQNIEIIVSESGWPSEGHPAATLKNARTYYTNLINHVKRGAGTPKKPGKTIETYLFAMFDENEKKGEASEKHFGLFNPDQRPKYQLNFNH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Two high-resolution structures of potato endo-1,3-beta-glucanase reveal subdomain flexibility with implications for substrate binding
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Solanum tuberosum
total genus 113
structure length 316
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 2011-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ur7A00
3D3AA 2EBNA 4ACZA 4UQAA 1TA3B 3SCNA 3ARPA 4QP0A 2DT3A 4GXPA 4F79A 2W4XA 1JFHA 1AQMA 2YL6A 5D8WA 1JZ7A 4QAWA 3SCTA 3A4XA 1XSIA 3FY1A 2NW0A 3CBWA 3NCOA 4UZUA 1UWQA 5KZ6A 1FP9A 1HF6A 1JYWA 1W9XA 2V3DA 4L4PA 2GSJA 4JCMA 3RIKA 4W88A 3CUHA 1NH6A 3VIGA 4H8HA 4PUEA 3EDEA 3T2OA 1OD0A 2ZOXA 1E4MM 2G3MA 2UY2A 1C3FA 3WDPP 2WKLA 4XX6A 4Z2IA 1RH9A 3NJ3A 3OLEA 3VUPA 5A69A 1KQYA 1DWHM 2F2HA 2BHZA 2XFFA 2WW5A 1HJUA 1VAHA 3EDKA 2YOCA 2E4TA 5A3HA 4AYSA 1BYBA 1B1YA 2VRQA 2BY0A 4UCFA 1XV8A 1K9EA 3EMQA 2DSWA 2WC4A 2XGIA 3LPOA 1G1YA 4UR9A 2A3CA 4AZCA 5A6KA 5IFTA 7TAAA 1ZB5A 3GNOA 1SMAA 6TAAA 1ESWA 2DSZA 1PAMA 1NP2A 2J7EA 3WH7A 3AHVA 2V3EA 2JFEX 1MW1A 2EQDA 3FW6A 3RPMA 2Y2WA 1LL4A 4PMUA 1Q6GA 4D6JA 1H4PA 2WMIA 3VM7A 5A1AA 4E2OA 2ZUTA 2DIEA 3MUIA 4RL3A 3SCOA 1XRVA 1QI5A 1CPUA 1WDPA 5EFFA 2WBGA 2WLYA 2W92A 4BQ2A 2IUZA 3WL1A 1NWSA 1BFNA 3VDCA 4AEFA 1LWHA 4EK7A 3GH7A 2WHLA 3WH5A 1WDSA 4DM2A 1WAWA 1U33A 1QNSA 2DPEA 3A3HA 1R7AA 4RE3A 5IHSA 1H11A 3BLPX 4H7VA 2XM2A 1UD2A 3AS0A 1W9PA 4MNMA 4OOUA 1B3WA 4AW7A 1OGBA 2JE8A 4AIUA 5BRPA 1ZBWA 5JBEA 4GIAA 5CJ5A 4W84A 3M46A 4B3KA 2GUYA 3EBVA 1LL7A 2E8YA 3PZOA 4JZ5A 1ISZA 3PN8A 3NDZA 1KBBA 1OINA 1LF1A 2XGBA 4HMEA 3UR7A 5I2UA 1OIMA 2OYMA 1CIUA 4M8UA 1DWJM 4CN1A 4JHZA 4D6HA 1E6RA 1HVXA 4WF7A 3WD3A 3W0KA 1EXPA 3ZT6A 2BS9A 3CPUA 1UD5A 2WMGA 3VGDA 3AJ7A 4DWSD 1HL9A 4OZOA 3T0BA 2ZXQA 4WIWA 3OBAA 3ZSSA 1CLVA 2J74A 3GYCA 4PUDA 4CD5A 3L4TA 1NWUA 2AOSA 5ABGA 4W85A 3T2PA 4AD2A 2AMGA 4FLQA 1R8LA 1KCLA 5EFDA 1BYCA 2ZX5A 5BCAA 3BAYA 5JBFA 3WQ6A 1CXKA 4FF5A 3UG5A 4GI9A 1GZJA 3MSGA 4LYRA 3CHDA 3RM4A 2WHKA 1KQZA 5JIWA 4PCSA 4PRWA 1J18A 3VDBA 1KR1A 2O92A 3AROA 5D9OA 5TD4A 3W82A 2CBVA 1ISWA 2WAGA 3T0AA 2WMJA 1V3LA 1UQZA 3VGFA 3WF3A 2D24A 3FHAA 3CHEA 4HA3A 3ZMRA 2PI6A 4NRRA 1J0YA 3VIOA 4D6CA 2JEPA 1WE5A 1M03A 4UQCA 3CZEA 1UR2A 4M81A 2YLLA 1OWQA 5D9MA 1QNOA 3WF2A 4MB1A 4D71A 2PBOA 5I6SA 1VEOA 5ABFB 1E56A 2XG9A 4YN5A 1JXKA 3WQ8A 3DHUA 2ZIDA 3UERA 2YL9A 3AIRA 1HJSA 1J0KA 1FA2A 1UD6A 1VF8A 2QMJA 3RJXA 1HXJA 1V6UA 2D0FA 2V3GA 4LQ1A 3B9EA 1C91A 2VL4A 4EAMA 4WKHA 3VDAA 4PYSA 1E6PA 1E4IA 4OOZA 1FP8A 3K8LA 3POHA 2DT1A 2XVKA 1QNRA 1GOIA 2C8NA 3E1F1 2OSWA 1Q4NX 2YA0A 5A8PA 5HOSA 3WY1A 2G41A 3TTSA 2XVLA 4UFLA 3APGA 3WQ4A 1HKMA 1PPIA 2WB5A 5GPRA 5CLWA 3WSUA 2J7DA 3OZPA 1E5NA 1Q6FA 2EXOA 1JZ3A 2YA2A 1BQCA 5D4YA 1J11A 1PZ2A 1XYFA 4V2XA 3VVGA 2WSPA 3HJEA 4J7RA 4W7VA 3VOCA 2X0YA 4UQBA 2DEPA 3QHOA 2D23A 4Z2JA 3AIEA 5IHRA 1NOUA 1V3IA 3SCUA 3VU2A 3MMUA 5CZKA 4URIA 1HJXA 1QOXA 4D6GA 3K8KA 2CBIA 3VMNA 1BSIA 4AZIA 3W6MA 3OLGA 2X2YA 2ZE0A 1WO2A 5I79A 7A3HA 5A8MA 3CGTA 2O9TA 4JFSA 2XVPA 1WB0A 1E73M 1UWIA 1ZS2A 3T2QA 1S46A 2MANA 4QDMA 1UZ4A 4C7GA 2WCGA 3N9KA 1XHGA 2J7FA 3WQ5A 4PMXA 1W3KA 5I3DA 3MANA 3OG2A 4NF7A 2EPLX 1UZ1A 3VMOA 1C93A 2WNWA 2VZTA 2VX7A 5HBFA 1CWYA 2OSYA 1C92A 1D2KA 2VMFA 1QI4A 1W1YA 5DO8A 2XIIA 3F4VA 5I24A 1HP5A 3WFZA 3I3EA 2J47A 4F66A 1GQJA 4MNKA 3L4ZA 4HZ6A 1KXHA 2J25A 5CSYA 3AS1A 1FFRA 4MB5A 5CPSA 3VNZA 1NWTA 4J3WA 3T0DA 1ZBVA 1SYTA 3BSHA 1JD9A 2FH6A 5HDRA 1TUXA 1B90A 1HVQA 8CGTA 1R87A 1V6WA 5A95A 5EMYA 2WMKA 3WDRA 1UWTA 3DECA 5M5DA 5LA1A 3L4VA 3OB8A 1JZ4A 1FH8A 1G94A 1VFFA 2WK2A 4CU7A 1K6AA 5AC4A 1OT2A 3AI0A 4GQQA 1TA3A 5LYRA 1MFVA 4AZBA 1XGZA 1PJ9A 3HMCA 4Z2KA 4ACYA 1E6NA 3PZNA 1OGSA 1V0LA 5IXEA 2ZX8A 1IT0A 4CD8A 4M1RA 3U5UA 2BY2A 4HMDA 1LLOA 3CUIA 1RD6A 1W32A 2Z1KA 2G8ZA 3GTNA 1TVPA 4W5UA 2XWDA 3SCPA 1QVBA 2ZX7A 3SUSA 3ARSA 5GNYA 4JKLA 2FHFA 4PMZA 4UFIA 4DUWA 1CXLA 3BAWA 3NSXA 4H8UA 3L2LA 1QHPA 1KWKA 1DP0A 2VTFA 1KBKA 4UZSA 1UR8A 3AMKA 5A2CA 3WDHA 1M04A 1E5JA 1OGGA 1CZ1A 4HPHA 3EDJA 1KXVA 4Z2HA 3TONA 4HA4A 2HISA 4W86A 1E0XA 1R7OA 4KMQA 2DIJA 4MJ2A 1JDCA 4OKDA 1E9LA 4N0RA 1MXGA 4J3XA 3W37A 1HN1A 3SCRA 3EMCA 1JI2A 3VIKA 1UKSA 2JIEA 2HVMA 4J3SA 2YIHA 2C7FA 3A4AA 3VGGA 4LGXA 2V38A 3GM8A 5CGMA 1EDGA 1X6LA 1B3XA 2J8GA 4YPJA 3VX0A 3WEMA 1V0MA 3QOKA 1JYVA 5E0CA 1EHAA 4HPGA 1WCGA 5BXTA 2GJPA 2XFYA 4V28A 2PWEA 4EE9A 3N18A 4JKMA 1BYAA 1BF2A 2BXYA 2VNCA 2W67A 1J12A 1PBGA 4W5ZA 3NSNA 1MQPA 1CXFA 3K4AA 2BFGA 4EKJA 4D1JA 2FGLA 4PMOA 3K4DA 4HP5A 1F4AA 2WCSA 2VX6A 1WZAA 4UFHA 3ARZA 3CHCA 3WBEA 4TVCA 3QHMA 3RMEA 1JI1A 1V02E 1V0NA 1VBUA 5FCZA 1UKOA 3UG4A 1UH2A 1MWOA 4LXFA 4AISA 1M7XA 4WSJA 5E6ZA 3EYPA 2XTKA 4Z2GA 1EOMA 1SR0A 5FOOA 3MUAA 1E0VA 4JFUA 4P8WA 2W66A 1MW0A 1CGXA 5M17A 3ZSTA 1VB9A 3N13A 3CLWA 3SCVA 3W28A 2WMHA 3EMZA 4UQDA 4XB3A 2Y5EA 1XCXA 1V3JA 3NIYA 4TX6A 1JAKA 4M24A 3PZIA 4MADA 1D3CA 4PTMA 1GQIA 2J8FA 1HT6A 3SURA 1UH4A 5LA0A 1UWRA 3MMDA 1XH0A 2J78A 3WNMA 1Q6CA 1E15A 3EDFA 5CGTA 2GFTA 2VCAA 4JL1A 4Z2LA 2IXUA 2JEQA 1JDDA 3RDKA 5I77A 4P8UA 3TOPA 5M03A 3W26A 2D20A 2E0PA 1B3YA 3ZM8A 3I3DA 5I0DA 2WZIA 1QBAA 1HKKA 2O9RA 3KL3A 6A3HA 3WKZA 4RE2A 4CUCA 5E9AA 3WUGA 3B9DA 3KZSA 3PTQA 3CZLA 3POCA 1B0IA 1E71M 1J0HA 1LG2A 3EDDA 1OCQA 1V3MA 2EEXA 1E40A 1H49A 1E6QM 1J01A 2G4FA 2WZHA 5ABFA 2ZXBA 3GNRA 4UFMA 3OLDA 4OBRA 1GJUA 2VX5A 3SUUA 1E70M 1V6YA 4JKKA 3CO4A 2VT0A 2WC7A 3LPGA 2VURA 3BCDA 3PTMA 4PEEA 1OIFA 2ZUMA 3BAKA 3N17A 2YL8A 3G6MA 2GVYA 1MQRA 1V0KA 3OIHA 1N82A 3OZOA 1BG9A 1VFOA 1US2A 4FLRA 3PBGA 3WH9A 4KRUA 3SEPA 3RJYA 2D22A 3AYRA 2PF0A 1H0GA 2CHOA 5EB8A 5A6BD 2XVNA 3A6OA 1I1XA 5M3WA 4D6FA 1R86A 3VMPA 1AVAA 3AHTA 3WMBA 1K9FA 3ZT5A 1V08A 1L8NA 3WD4A 2CKRA 2WSKA 5A8NA 3WD1A 4JIEA 1H0IA 3WENA 4M80A 3UG3A 3CIVA 1G01A 1ECEA 2E40A 1E3XA 3JUGA 1M53A 3IJ7A 3BGAA 5DMYA 4YHGA 4DWSB 1GOOA 1ITCA 4W87A 4ACZB 5HPOA 1KGXA 4AEEA 2GJXB 3WNPA 4IM4A 3K8MA 5DF0A 4UOJA 2WCAA 4W7UA 3VGHA 1W1PA 4GINA 1W1TA 1XC6A 1KCKA 2BXZA 1CBGA 1ZJBA 3W27A 2D0HA 3UESA 2VVSA 3AIWA 2QPSA 1GOQA 5ABEA 3WN6A 1CGTA 2WWDA 1CGYA 1KB3A 1SFSA 1IZJA 1WNOA 4M82A 2YA1A 2DT2A 5A6SA 2J75A 1FHLA 4AD4A 1EHNA 1W3JA 3BMWA 3ZT7A 2EO7A 4B9ZA 4DUXA 3ZJ8A 3OGRA 2VCBA 2PB1A 3GH4A 1C7TA 3VIJA 4R5EA 2ZUWA 3TTQA 3GBDA 3AMDA 3GXIA 2QV4A 1FH7A 2ZUNA 3AIUA 4QLJA 1BHGA 3SCWA 1VBRA 2UY4A 1NWRA 1WP6A 3K46A 3KL0A 4U5IA 1HJVA 1EGZA 3PHAA 3FNDA 3U5YA 5GNZA 1NOFA 3M7SA 5FKYA 4CGTA 1X6NA 1JYXA 2JALA 1RP8A 4PMDA 4WJXA 1PZ3A 4P7LA 4B16A 3MV11 1HKJA 1GOKA 2ZWYA 3OA5A 1V02A 2YKKA 3VM5A 2J79A 2VQUA 1GOMA 3CTTA 4TVUA 3U57A 3L4UA 3AXXA 1UWUA 3WEOA 2UY3A 3PZVA 1F4HA 3WQWA 3O2LA 2Q8XA 4L4OA 4PCTA 3THCA 3VDHA 1XH2A 3ALGA 3K1DA 1QBBA 3BLKA 1NOWA 3ARRA 5JUVA 2CNCA 1UH3A 4MDOA 3LPFA 3S2CA 3OGVA 2XWEA 3AXIA 3RM8A 3BMVA 3OLIA 5A2BA 2F61A 3AQUA 4D6EA 2WHJA 1UR1A 3B8SA 1U2YA 2V5DA 4U33A 4N42A 4UQ9A 1FOBA 4IPNB 1NQ6A 2ZICA 1ITXA 2WZEA 1OSEA 4MNLA 5I5RA 3TTOA 1UD8A 1AQ0A 3BAXA 4MB4A 1XD1A 4E4PA 2ZUSA 2D3NA 4UOQA 1ZBKA 1TZ7A 4AD5A 2G3IA 5HPCA 4MNJA 2VRJA 1GCYA 1PX8A 3F5LA 3W6LA 4BQ5A 3WBAA 2Y4SA 4CU6A 1ISYA 4AC1X 5IDIA 3PZQA 3VNYA 3GBEA 1QHOA 3IAPA 3CMGA 3O9NA 2BNJA 4ZFMA 4GKLA 1UD4A 3LMYA 4NZCA 4BCEA 1KWGA 1FHDA 3VO0A 2FDMA 2GDVA 3GNPA 1W2VA 3SCSA 1C8QA 3ECQA 3AIVA 1HJQA 2D0GA 4PTXA 1V3KA 1RPKA 2NT1A 2V5CA 2FHBA 4TX8A 5F7UA 3NUKA 1CDGA 1ODZA 1QI3A 4H04A 3N12A 2A3HA 4F8XA 5KEZA 3D5HA 1W3HA 3RCNA 2J4GA 1B30A 2BY1A 1GQKA 3FAWA 1XYZA 1V6XA 2A3BA 4JHOA 4KGJA 4S3JA 1UKQA 3S6TA 1C90A 4AMCA 3ZR6A 4X0NA 1TCMA 1GW1A 2VJXA 2BV9A 3BC9A 1GOWA 2W61A 1B3VA 4GZJA 4U3CA 3VGBA 4UTFA 2W91A 1DWAM 2CYGA 3NYDA 1I75A 1TFVA 1CGWA 2X1IA 1JZ6A 2UY5A 1JGIA 2GK1B 5E0FA 1K9TA 1WDRA 1ZJAA 2WPGA 2VZUA 3VTRA 2Y8VA 3OGSA 4IISA 1DTUA 2W62A 4TXEA 2ZUUA 1UOKA 1C8XA 3AMGA 4CKQA 4WK9A 2DSUA 2VZSA 2IXVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3D3A A;  2EBN A;  4ACZ A;  4UQA A;  1TA3 B;  3SCN A;  3ARP A;  4QP0 A;  2DT3 A;  4GXP A;  4F79 A;  2W4X A;  1JFH A;  1AQM A;  2YL6 A;  5D8W A;  1JZ7 A;  4QAW A;  3SCT A;  3A4X A;  1XSI A;  3FY1 A;  2NW0 A;  3CBW A;  3NCO A;  4UZU A;  1UWQ A;  5KZ6 A;  1FP9 A;  1HF6 A;  1JYW A;  1W9X A;  2V3D A;  4L4P A;  2GSJ A;  4JCM A;  3RIK A;  4W88 A;  3CUH A;  1NH6 A;  3VIG A;  4H8H A;  4PUE A;  3EDE A;  3T2O A;  1OD0 A;  2ZOX A;  1E4M M;  2G3M A;  2UY2 A;  1C3F A;  3WDP P;  2WKL A;  4XX6 A;  4Z2I A;  1RH9 A;  3NJ3 A;  3OLE A;  3VUP A;  5A69 A;  1KQY A;  1DWH M;  2F2H A;  2BHZ A;  2XFF A;  2WW5 A;  1HJU A;  1VAH A;  3EDK A;  2YOC A;  2E4T A;  5A3H A;  4AYS A;  1BYB A;  1B1Y A;  2VRQ A;  2BY0 A;  4UCF A;  1XV8 A;  1K9E A;  3EMQ A;  2DSW A;  2WC4 A;  2XGI A;  3LPO A;  1G1Y A;  4UR9 A;  2A3C A;  4AZC A;  5A6K A;  5IFT A;  7TAA A;  1ZB5 A;  3GNO A;  1SMA A;  6TAA A;  1ESW A;  2DSZ A;  1PAM A;  1NP2 A;  2J7E A;  3WH7 A;  3AHV A;  2V3E A;  2JFE X;  1MW1 A;  2EQD A;  3FW6 A;  3RPM A;  2Y2W A;  1LL4 A;  4PMU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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