3UWZA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Staphylococcus aureus
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 83
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwzA00
2Q3RA 4PCFA 3BG9A 3PBYA 3RFAA 1TREA 3P5YA 4QNEA 1FWRA 3LHTA 4HNUA 1H63A 2Y7FA 3KOFA 3W1TA 4DELA 4H4IA 1C9DA 3W2UA 2A2IA 5L9FA 4NJIA 1H7RA 1GOXA 4BF9A 1MSSA 3LBCA 4IMCA 4IQLA 2YW3A 1JCYA 2R14A 3SR7A 4LNYA 1WDWA 3W7OA 1L2UA 5D09A 2FDSA 1ME8A 2ZRXA 3DAQA 3L2IA 4PH6A 3QC3A 1WQ5A 1OYAA 4E2DA 1QOQA 1Z48A 1F7BA 3S42A 3W7KA 3NZ1A 1T8XA 3EX2A 3LHYA 3DKLA 2CZ5A 3RLVA 3G1XA 1WAUA 3N19B 4NUWA 1GVOA 4AHQA 3W86A 1IF2A 3D0CA 3L66A 1QO2A 2E5DA 3G18A 1VH7A 5TIMA 5H2ZA 6ALDA 1LM1A 3HPXA 3PAJA 1RR2A 1L6WA 1VYPX 1KBJA 2OT1A 2NUXA 4LY8A 3EX3A 1HO4A 5KINA 1W5MA 4FNPA 2NXGA 2ZRUA 2A6NA 4UTLA 4NJJA 3EWBX 4FXRA 4IX2A 2J6XA 4AF0B 4XKYA 1B9BA 4NX0A 2YFNA 4UTWA 2NUWA 3PB2A 3L0GA 1H7WA 3UNDA 4UTKA 3NAVA 4HPXA 2Q8ZA 3B03A 5CKSA 5K4XA 3QPYA 4FNQA 1TQJA 2DP3A 4JTFA 4WUIA 3S5NA 1JJKA 1TYGA 1WBHA 1F73A 2Y61A 4KWVA 3N3MA 4JX4A 1HG3A 3BW2A 1ZFJA 3AJXA 1LLWA 4R7JA 4AB4A 4AWUA 3QPZA 2HS8A 1LRTA 2QCNA 3RF9A 4Q4KA 1VLWA 4K8HA 3W1LA 3QQ0A 2EF9A 4OV4A 1XBZA 3FYOA 4UTHA 3TC7A 5TBOA 2HS6A 2ZA1A 4LVAA 3LB0A 1ICSA 4N9DA 4EIVA 5LZLA 3C8FA 2H6RA 1D3HA 2VXNA 1EB3A 2PRLA 4PC8A 3W22A 4Y6GA 5EKYA 3HOJA 4JR5A 3BLEA 4LVDA 4O15A 2WNZA 2Z6JA 4OE7A 1OX4B 2C19A 3UWWA 2ZDRA 3I65A 1VHNA 4DXVA 3L65A 5BMXA 3F03K 3LTSA 3PY2A 1AL8A 4O10A 1EEPA 2GVLA 4BWLC 1VGAA 2YFOA 1OFBA 4AMAA 1A5BA 2ZRWA 3NQVA 2FB3A 3STEA 1DQWA 1NAL1 3GK0A 4IXXA 1K7XA 3W2JA 3VNDA 1GEQA 8TIMA 1KV8A 2R8WA 3S6DA 4Z08A 4UMCA 3ZR4A 2RDUA 4MZ8A 3NO5A 1JULA 1EP2A 2Y85A 3GDKA 3VFLA 1QDSA 2A21A 4FNRA 3LX9A 4UC5A 2TYSA 4LUJA 5C5YA 4OU1A 2QDHA 4P2VA 3RMJA 1TPDA 4NVTA 1A5CA 1TMHA 2PCQA 3ABRA 2Y89A 3EEGA 2Y7DA 4HNVA 1LBFA 4Z0SA 3LCHA 4LVBA 4WD0A 4AF0A 4WQ6A 3NM1A 3W1NA 4Z1AA 5KSWA 3G1SA 2QUTA 3FOKA 3C61A 3LV6A 3QSRA 3MBDA 4DPQA 2VFHA 1NEYA 5K2ZA 5F2MA 1O5KA 3VCRA 4JTEA 4LV4A 3TJXA 4JTHA 3H53A 3GKFA 5CZJA 3HIJA 3DI1A 4LVGA 3MP3A 3STGA 4CNNA 1NSJA 4ZVJA 4WX2A 2QJHA 4ICNA 5HINA 2ZCGA 1UBSA 3JS3A 4IOTA 3W7IA 5D2VA 2NXIA 4N4PA 4LC8A 4XBSA 1SPQA 4A21A 4Z1DA 1GZGA 5D38A 1FWWA 1GYNA 3L5AA 3ABSA 3O06A 3EX1A 3WJZA 1MEHA 4WY0A 2QR6A 3M16A 5DCEA 4U28A 4GXMA 5DXYA 4YWIA 1TPC1 3KVJA 1TPFA 5K4ZA 3SZ8A 3W1AA 1TPH1 5KZDA 4J9JA 3G24A 2G96A 1RVGA 3BV4A 1GQNA 1LOSA 1FCUA 3TQVA 2WNNA 1SSDA 3QEZA 1LORA 3GB6A 4LTSA 3FFSA 3SIZA 5F4XA 1W3NA 2ABBA 1UUOA 1I2QA 1TV5A 1SSGA 2YX0A 3PULA 3B8DA 3NQGA 4O0ZA 3DFNA 1X8FA 3U2OA 3FJLA 3N2MA 3HBLA 1KA9F 3LI0A 3CC1A 5C6MA 3PSWA 3DFOA 5LGZA 1P0KA 3LLDA 3C4UA 2TPSA 1LBMA 1YYAA 5K7JA 3EKZA 4ORMA 3H54A 4RV8A 2YXGA 3KRSA 5L6UA 4A2SA 1CX9A 3SGUA 5CZSA 5LHFA 3OHIA 4IXHA 1TB3A 3W2LA 5G1TA 3NEVA 4HHPA 1YTDA 3UYCA 3W7DA 2ZTKA 2JGQA 2C16A 4WXYA 3IIPA 2VELA 4GUJA 5FF2A 4WXZA 4DF1A 3L67A 3W7GA 4PA8A 1JUKA 1X1ZA 2YDAA 4Y90A 3KXQA 4FB7A 1XC4A 3C52A 3G1AA 3WK2A 1DHPA 4MOZA 3UZ5A 4XZ9A 5FEZA 2E6YA 1EA0A 1TTQA 3LM7A 1W5PA 5D2XA 3R12A 4MZ1A 1SO5A 1SO4A 2ZBTA 3BK0A 3C56A 3DFSA 3DHDA 3LV5A 3C3NA 3HPZA 4DBEA 2VOMA 1JCJA 3C2VA 2EKCA 3L68A 4O14A 4E0CA 4MKNA 4K7YA 3C2OA 3EB2A 4WJEA 2QCLA 1AG1O 2JBMA 4DBDA 3TU9A 4O28A 3RK8A 3C2RA 3WFAA 1F6KA 2GOUA 1KTNA 3EX4A 3UWQA 3PUOA 3IEBA 3P5ZA 2GQ8A 4OHQA 5E0KA 1G4PA 1S3HA 2Z2UA 2E6AA 1TCDA 2ZTJA 1OX6A 1OYCA 3M5YA 5D05A 1VCVA 3M6YA 1J2WA 4HNTA 2ABAA 3V75A 4BI6A 5F2GA 4IMFA 4IMGA 3DU0A 4K38A 3HGRA 4HPJA 1TPB1 4PFMA 5KZEA 2VEPA 2Y70A 4YXGA 2YR1A 2E68A 5I3KA 3UZJA 3L9CA 2AQWA 1YTKA 4MJMA 1WXJA 1H62A 5DBTA 3O6DA 5HWNA 3NPVA 2J9ZA 1DQXA 1DJQA 2WNQA 2GQAA 1OYBA 1OG0A 1YLVA 2ATSA 2TRSA 4IUOA 4O1DA 3TC6A 2PURA 3G3MA 3MUXA 3UWUA 1XL9A 2FPTA 4NJGA 5A5WA 3NQMA 4ZQMA 1LLZA 3QQ1A 4M6PA 4N9CA 3ATYA 4GRSA 3TV8A 3TXZA 3S1VA 4N2YA 3SSJA 1J5TA 3GR8A 3EWZA 3THAA 5E1QA 5KMYA 2YYTA 3Q58A 4PL2A 2Z0IA 4NNCA 3ABQA 3W75A 2VFDA 5AOUA 4HKPA 4ZQPA 3NQCA 2QCFA 1QAPA 4LRSA 1XBYA 1DL3A 1D3GA 1I2RA 3UXDA 4AWTA 1ONRA 1O95A 2QAFA 1SW0A 3N2XA 5EL1A 4CQAA 4BK9A 4E2BA 2X1UA 3LXBA 3KX6A 5DCDA 1DBTA 4CQ8A 3TR2A 2QEZA 3TCEA 1VHCA 3I7SA 1EP3A 1GVSA 2H8XA 1VLIA 1X7FA 4ZL1A 4TMCA 3G1YA 2ZRVA 4YMZA 4MFEA 4X22A 1T99A 1FX6A 4TO8A 2E09A 3CTLA 3O1NA 4Z1BA 3L5MA 1QNVA 2B7OA 1TTPA 2HMCA 2V2DA 3B06A 4OQVA 2CZEA 1SR9A 1S5WA 5EPDA 2I14A 3IRDA 3W7JA 1UJPA 1I45A 1ZY9A 1AW1A 4AEOA 3G22A 3W7MA 4WOZA 4GUFA 1WYIA 3M5ZA 1L9WA 3QMTA 3CIXA 1K8YA 2GVGA 4RZ5A 3E96A 3LRMA 4TR9A 4K8EA 2ZZ4A 2E5CA 1IXQA 2B4GA 2WPBA 5D2TA 2R94A 3OA3A 3P8JA 2A7RA 3SJ3A 4DF0A 1BKSA 4MYAA 4NJKA 1SQ7A 3NM3A 3C0JA 5K9CA 2VEIA 2B0MA 3O8AA 1G67A 1M5WA 1U83A 5KTLA 4LUIA 3MI3A 3LHWA 3P62A 4JTLA 1WA3A 1HUVA 5C54A 1XKYA 1HL2A 1SFLA 1EUAA 4L4LA 3TH6A 1H5YA 3KRUA 3SI9A 1KTBA 4NXKA 3EWWA 4NX5A 5LNRA 1DKWA 3L0KA 5AN7A 3JR2A 1ZNNA 3IIVA 1ALDA 2X30A 1FDJA 3R8RA 2OX1A 1W54A 4O53A 3WK1A 4S2CA 3M7WA 3PB0A 1LTDA 5F2LA 2AGKA 3CHVA 3U8GA 3F4WA 3W1XA 5AYYA 5LSMA 2V30A 4LWWA 4I7WA 1PHWA 1F6PA 3G1VA 4O54A 2OMAA 1SU5A 1Z42A 3NNTA 3NXFA 1VC4A 3HG5A 3SECA 3M44A 4ZQOA 1TPWA 1XBXA 5IM51 4MY9A 3MHGA 2NWRA 2JKEA 4K6AA 5BMWA 1OK6A 5H91A 2HTMA 1TSIA 4HT3A 3MHFA 1KLZA 4M5PA 1CW2A 3GNNA 4Q32A 4K7VA 2CFFA 3NPXA 3N34A 4ORIA 5IBXA 5DN1A 4Z0JA 3VE9A 3P84A 4RR4A 3TUUA 2A7NA 3B0UX 2C13A 3W3OA 1KTCA 1R30A 1SO6A 1SO3A 4DO5A 3CWNA 2X1SA 1NF0A 2BLEA 5AHIA 3EWUA 5F1VA 4JX6A 4RCXA 2YZRA 4O0KA 2YYUA 1X6UA 4N6FA 3IVTA 1YPFA 3DZ1A 3NQ6A 1QPRA 1QOPA 4UTTC 1XCFA 2XN2A 2NUYA 5FI8A 2WSQA 4RK8A 3NQ8A 4M19A 3GIYA 5FF0A 1VYRA 1EUNA 2A4AA 1W5NA 3CU2A 3IGXA 2C1HA 4AVFA 3EXRA 3CEUA 2DJLA 4PL1A 1QWGA 4NQ1A 1JCLA 3CLMA 2DJXA 3PWAA 3TDFA 1FWTA 1EWEA 2RKXA 1H50A 2V9DA 1K7FA 3B4UA 3T44A 1H1ZA 4X2RA 5J5RA 1WX0A 2V2CA 3P74A 1PCKA 2QCGA 1UB3A 5AFDA 1B3OA 4XBKA 3W7RA 3FA5A 2RDWA 5FF3A 3T4CA 1LRQA 1VQTA 1XFBA 1LYXA 1TV8A 3LRLA 3MYOA 4I7VA 3W7EA 3PR2A 2F7FA 3NQFA 4UCGA 2BZNA 3NL3A 1OABA 2QCCA 3G8EA 3NL5A 4K39A 1ML1A 4FX6M 4R53A 5HQEA 4X3ZA 3TJLA 3NQEA 3HMJG 1LOLA 1TPUA 5D03A 4XUGA 2NZLA 3V1PA 1GVRA 5G2HA 4FIRA 4ONVA 3PBWA 1IXOA 3S9YA 5LHEA 1ZAJA 3BLIA 3LI1A 1UUMA 3L5LA 3OG3A 5AYXA 4FNUA 1QPQA 2NX3A 3SFKA 1EX5A 3W87A 5D33A 3QFEA 2X16A 3NZRA 2VFEA 1Q6RA 1ME9A 1SZFA 3GVGA 4TIMA 4QJ1A 4DPPA 5KITA 1RD5A 3N9RA 1EWDA 1G7UA 4JTGA 4CCDA 3GDMA 3W2KA 2WSRA 1O94A 4JYEA 4FO4A 3PG9A 3UY8A 4JNMA 4JD4A 1W5QA 1HFBA 1KFKA 4M7TA 4AHOA 2DZPA 4N9EA 4LV9A 3BGJA 1K8XA 4Z1CA 1I2OA 3W7NA 3TSBA 3W6YA 4GJ1A 3GAKA 1M6JA 3K30A 3ZWTA 4GUHA 2A1YA 3N73A 3TAOA 3KVMA 3HG4A 1Q6LA 3KRZA 4JTUA 4YCOA 4OT7A 3BPWA 4IPIA 1JRBA 1OFPA 2VENA 1Y0EA 3WJWA 2QDGA 3HF3A 3LERA 1W0MA 4QNWA 1DJNA 4QAIA 3A24A 4N4QA 1K03A 2FPVA 3W76A 2G5WA 4UXDA 4M6QA 4W9TA 4A29A 3B0VC 4KWWA 4S1FA 3PUDA 3M41A 2TSYA 3FJ6A 4X9SA 5HUOA 4GFSA 2CLEA 4OV9A 3BLFA 1P5BA 4FEZA 3TROA 3UD6A 4MVAA 3T7VA 2ATMA 4NNBA 1KLYA 5KZMA 4BR1A 2ZZ3A 1S5TA 2DZXA 3QW3A 3LHZA 1ZENA 3ANYA 3W2NA 2GUUA 5CZTA 5K9XA 1KM0A 4AHPA 5A8GA 2B7NA 3UPWA 2FFCA 4MY1A 3E0IA 3QF0A 1OX4A 3DGRA 1O60A 2ZZ5A 4XWUA 3EWYA 4LW7A 3QMSA 1DVJA 5CG7A 2VEMA 1AK5A 2P0OA 2QCEA 4UNKA 2ZRZA 1YXCA 3F1QA 5CPLA 3UY7A 3GXTA 1F5ZA 3G8RA 3HB9A 2X1RA 5DY3A 3NG3A 4KKXA 1R2SA 2Z6IA 3CEPA 1H7XA 1THFD 3GNDA 1TIMA 3DI0A 4B5NA 2JGYA 5AC6A 2GJNA 5F4WA 1H61A 1GG1A 3DH7A 1E51A 2QF7A 4UMBA 5ABTA 3PVFA 3EXSA 3M5XA 4FF7A 5G4WA 1H1YA 3VE7A 1FWNA 2QCHA 3MYPA 1QMLA 5EY5A 4CLMA 2Y88A 5AB3A 2VFGA 5I3HA 1ADOA 3TX9A 3MJYA 3EX6A 3GKAA 3CIWA 3G1HA 1CI1A 1JCMP 4YL2A 5HR7A 3Q2DA 4JX5A 1KM1A 1HO1A 1LCOA 2CU0A 2E6FA 1OVDA 3EKLA 1LZOA 3KVLA 3P82A 4LT9A 4UFHA 3IIZA 1M7PA 4DO4A 1SZNA 1A5AA 4N9BA 5LGXA 3PS7A 3NQ2A 1BTMA 1J4EA 4D2JA 2WSYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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