3UWZA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Isomerase
source organism Staphylococcus aureus
publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 83
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwzA00
1OJXA 4QAIA 1JCYA 4XQ6A 2ZDRA 3BG3A 1ZAIA 1D3GA 3M41A 3PUDA 2NXGA 1ZNNA 3BVJA 4O8RA 1OX5A 1VGAA 2V5BA 5D33A 4K8EA 3QMRA 2ZTKA 3KRZA 5AYXA 2NUXA 3P60A 3O05A 5D2WA 3S42A 1F74A 4JTSA 2XN1A 3DU0A 5CG7A 2H3BA 5FEWA 2HMCA 4IMCA 3R12A 3PF3A 1GVOA 3P62A 3G18A 1LYXA 1SZFA 1TQXA 4EF8A 3BO9A 2QJHA 5LGZA 4R53A 4Q4KA 1FY6A 3O1NA 4CNPA 2JKEA 4O54A 3WK3A 5AHMA 4L4MA 3L67A 1SZNA 5D02A 1LP6A 3GZ3A 4BWLA 4UXDA 3PB0A 3TMLA 4E0CA 2NLIA 2V2HA 2QCHA 4H6KA 2CWNA 4LS2A 1SO6A 1OF8A 3WJYA 4IXHA 1FWTA 3DKLA 3W1QA 1QPOA 2ISSA 3UWVA 3PBYA 4UTJA 5AHFA 3PG8A 2WKJA 3PUOA 5HWMA 1WYIA 5HNRA 5K9CA 2J27A 4OWGA 3A9IA 3GKFA 5A5WA 1XUUA 3DFPA 4CCCA 3QQ0A 4EWND 2ZZ6A 4N6FA 3PSVA 4PA8A 1P0NA 4ZQNA 2VXNA 4G1KA 2UV8G 3M0ZA 3KXQA 1A5SA 3BW2A 5TIMA 2RHGA 2Y7FA 4WQ6A 4UC5A 1QOPA 3GK0A 3HPSA 4IPJA 2W6RA 3CC1A 2X1TA 4IXXA 4Z1BA 3K30A 3EEGA 1GG0A 3MYPA 5FF0A 3L21A 4AB4A 4PEKA 1KFJA 4MOZA 3MP5A 3LBMA 1W5PA 3A5FA 3C6CA 3UWUA 3QM3A 3I6RA 3W7EA 1JULA 1OFPA 5CZTA 4AHQA 4K36A 1XBZA 4IPIA 5CPMA 4Y8FA 1GVFA 2ZCGA 3RK8A 2VFFA 1R46A 3OG3A 4LVGA 1OYAA 5HMSA 1B57A 3G1YA 2A7RA 2PC4A 4JTKA 1H7RA 1W3NA 2Y6ZA 1QMLA 2NX3A 1OFEA 3NXFA 3W1PA 2B0MA 3C61A 3L5MA 4FO4A 1W5QA 1ZCOA 1KBIA 5C55A 2Y7GA 2ZA2A 5EL1A 1ZY9A 2ZQ0A 3CB8A 1PHQA 3VE7A 1DJNA 3W2LA 5FF7A 4HPXA 3TE9A 4DF0A 1Z41A 3FS2A 4HKPA 2E09A 4MYXA 4BI5A 1H7NA 5DY3A 3F4WA 4YCPA 3MI6A 3D0CA 1K03A 1JCLA 1YDVA 1P1XA 2J9ZA 5AOUA 3TUUA 1AW2A 3Q2DA 4K38A 2C3ZA 1P5BA 5D2YA 3CEUA 3DGRA 4OV9A 4O17A 2CLIA 5D2XA 2J24A 4M5PA 1AMKA 4Y6GA 3ABQA 2E77A 1VYPX 1XI3A 3A5VA 1GQNA 3Q37A 4O4VA 2IQTA 2CU0A 3ELFA 3L68A 1YPFA 1TTIA 1YTDA 3M5YA 3BW4A 3P82A 3LXAA 3S9YA 1OX4A 3G22A 4AEOA 3W86A 4JIPA 3NDOA 5AHNA 1KLYA 2X2GA 4DBEA 3BV4A 4FB7A 2FQIA 2CLEA 1XDLA 3NQGA 4I7UA 4FNPA 3BW3A 2GVGA 2RH9A 3IIVA 1DORA 1JR1A 4MKNA 4MUZA 3PS7A 1HG3A 3CIWA 2XFWA 4CNOA 1YYAA 1MO0A 3KAOA 5TQLA 1F05A 3U8GA 4UFLA 1KW1A 4A2SA 5CPOA 3LI1A 1SW7A 4LVAA 3SR7A 3MWAA 2VFHA 2V81A 3B0PA 5G4EA 2ISWA 1KFLA 3CWNA 1M7OA 3P80A 2A7NA 2VFDA 3C2RA 5BMXA 5KITA 3UPBA 1FDYA 5C54A 3WJWA 2ZZ1A 5CZJA 3MO7A 4O14A 3UNDA 2V2CA 5AYZA 2HTMA 3W83A 1YXCA 4H3DA 1X6UA 3LHVA 2RDWA 4A22A 2ATSA 1G4SA 3LHUA 2P10A 1RV8A 3O6YX 4WD0A 2WSQA 3UY7A 4YL2A 4UR8A 4DO5A 1OK4A 2A6LA 3QFEA 1SR9A 3E96A 5F4WA 3S5YA 3N14A 3ATZA 3TA6A 1O60A 3G24A 5IBXC 4HNVA 4K8HA 2QCMA 4NU7A 3BLFA 5G2HA 3PR2A 1PCWA 1L6YA 5L9FA 4EVZA 1DOSA 1OF6A 1KM3A 3R5EA 1H1YA 2YX0A 2A4AA 3W1LA 4NXKA 2EKCA 1GPWA 5DXYA 3G3MA 1G4TA 2B7NA 2DZUA 5LGXA 1TTQA 3LLDA 4DELA 1U5JA 1X8FA 2DZWA 1EA0A 3W1TA 2QCFA 3SW6A 3CLMA 4BI6A 3HBLA 3NL5A 1EUNA 3EWYA 1O5KA 1G6CA 2AAMA 3KVJA 2JBMA 3W7PA 1NAL1 1VJIA 4TX9A 2YFOA 2HSAA 2QUUA 1W37A 1NF7A 1R2RA 3PG9A 4QITA 3GVGA 4RJEA 3VCRA 4NJIA 3QF0A 2RKXA 2NXHA 3G1XA 3PBWA 1OX4B 4PH6A 1GG1A 3S5NA 3M44A 5K9DA 3TDFA 1NF0A 3UY8A 4A29A 5CGQA 2E5DA 1SZGA 1JUBA 2V5LA 3W7GA 4O28A 4PC8A 4M19A 5FF3A 1I45A 4IX2A 2EHHA 1N55A 5HJLA 4NJJA 2G5WA 4N9EA 3F03K 1LRQA 1R47A 3T44A 1SFJA 4EIVA 1FCVA 3L0GA 2X1RA 4WXZA 5CKSA 2WOQA 2YSWA 1TYGA 1DJQA 3BLEA 3OIXA 3GDKA 1CX9A 4O53A 3TW6A 3PWAA 5HULA 2CLLA 5DELA 1FX6A 1KFEA 3UWZA 3QMSA 4ZZ9A 3G1DA 5AC7A 1MSSA 3S1WA 4NX0A 3RU6A 4MLRA 3TSMA 4AAJA 4BWLC 1TPB1 4B5NA 4QNWA 3N2XA 5U7SA 2YR1A 3G0SA 4LVBA 3QYQA 3T78A 3ZWSA 5J5RA 4OE7A 5F2IA 5EY5A 3W71A 2GVJA 1VLWA 1DVJA 2GJLA 1YTEA 4DF1A 1WOBA 3C8FA 3HB9A 4X2RA 3AJXA 2QAFA 2R91A 3AO0A 4ZMGA 1AG1O 1EIXA 3VFLA 4RXFA 3W84A 2ZRWA 5BNKA 3TIMA 2C18A 2VFGA 3KRUA 3HGOA 4OHQA 3EKZA 1LORA 3W1XA 2OZ0A 3T55A 4D2JA 4PL1A 1QCWA 1KM2A 1VLIA 1TPC1 3LERA 3NM1A 3IIOA 1U83A 1AW5A 2J88A 1WXJA 1NFBA 4OGZA 3MP4A 3TQ0A 2X1UA 3OEXA 4FX7A 3PY2A 3TAKA 1V5XA 1S5WA 1F7BA 3C2OA 3R13A 5BOOA 5HR6A 4KFOA 2DZTA 2J9YA 2GJNA 2QCDA 1QDSA 1A53A 4ADSA 2E6FA 3SGZA 1WBHA 3F4NA 3EB2A 4FF7A 1HO4A 3W1MA 3H54A 5I3KA 5EPDA 1JCNA 4WOQA 4IMGA 4P2VA 2NX1A 4K6AA 2X1SA 1TREA 2ZBTA 2ZRUA 4KFPA 4O4WA 1IIHA 4MFDA 5FEPA 4HNTA 1LOSA 2FB3A 1VHNA 3MHUA 4PCFA 3DHFA 1KM5A 4KWVA 4GFSA 3HPXA 1VQTA 2CZFA 3KX6A 3I65A 1I2NA 1LBFA 1FWWA 4POCA 3DH7A 3TK7A 4JX5A 1D9EA 4IGHA 1Q3NA 2RDTA 2CLHA 2GPTA 3RMJA 3USBA 4C1KA 5D09A 4O19A 4PODA 5IBXA 1DBTA 3W87A 3P84A 2F84A 4MZ8A 1ALDA 2RDUA 3TXVA 2X16A 1ML1A 1VCGA 3S5ZA 3G1SA 3EWZA 3P5YA 1W5MA 4UFJA 3WJXA 2E5BA 5G2IA 3L9CA 1GVSA 4BI7A 3LM7A 4RCXA 3R2GA 3GAYA 5G2WA 3DFOA 5I3GA 2NWRA 3FIGA 3QQ1A 1I2QA 3G8EA 3LTPA 1TJRA 2QR6A 2YYUA 3SSJA 2QCCA 3I7RA 3TMQA 3FEMA 3IGSA 3E9AA 2G97A 1YTKA 3OVQA 5CSSA 1XXXA 3NG3A 2ZRVA 5U4NA 4Z1CA 2GUUA 4QQ3A 3GDRA 3MYOA 4O0KA 4AWTA 1KM6A 2HS6A 3M5ZA 3S6DA 4MFEA 3W2JA 1R2SA 3HQ1A 1M6JA 1MXSA 3TU9A 3BK0A 3NQVA 1J4EA 3A23A 3NZ1A 3ABRA 5H91A 4K7VA 3C0JA 4LY8A 3ZR4A 3FLUA 3LLFA 1OFDA 3DAQA 2Y89A 3NNTA 4UMCA 3FYOA 3G0UA 1Q45A 2VFEA 2YZRA 1A5CA 1KFKA 3W74A 4NJGA 3W85A 1H5YA 1DL3A 3NVTA 1SUXA 1KM4A 2FIQA 3N9RA 4O52A 2A85A 1SO5A 4IJBA 2A21A 1SU5A 1YXDA 4UTIA 3DKJA 4NXSA 3B0VC 2NXIA 3TKFA 2YYTA 4CNNA 5LSMA 4AMAA 4KKXA 3HG5A 2QCEA 4JNMA 3VNDA 4AF0A 3M47A 4MIMA 2X30A 1TPH1 1VHCA 2W79A 3NZRA 3SIZA 4R7JA 2GQ9A 3W72A 3W6YA 1B4EA 3WJSA 3NL3A 4N4PA 2OT0A 3S1UA 3B4UA 1XM3A 4MY9A 1IIGA 1TCDA 1EB3A 2V0TA 5F2MA 1C9DA 1LZOA 1EP3A 4LC6A 4RZ5A 3GX9A 4JTUA 3TFCA 4AWUA 1PHWA 3NQDA 4LTSA 3LTYA 2PRHA 4GWEA 3HIJA 5AN7A 3NPVA 1FUYA 1BTMA 5D37A 4NX5A 1VYRA 1TIMA 2ZYFA 1G4EA 3P5ZA 3FFSA 1VCVA 4LWWA 5LNUA 1B3OA 1SSDA 3M7WA 3LV5A 3EXRA 3RF9A 3SZ8A 5LKYA 1SW3A 3Q94A 1EWEA 5AC6A 3V1PA 3GXPA 5LNRA 2YXGA 1T96A 1QPQA 1K8YA 1ZAHA 3STCA 4NNBA 1JUEA 4JS3A 5MHBA 1LTDA 1UCWA 4GJ1A 2I9EA 1W8SA 1THFD 2DZVA 3ANYA 3DI1A 3W2MA 4LC8A 2GQAA 1H51A 2C16A 3SJ3A 2FPYA 1UUMA 2DU2A 4I7WA 5KINA 4FNQA 3NR0A 3TQKA 1XDMA 2CLOA 1R30A 4N9CA 3E02A 1HTIA 2XN0A 2V2DA 2VC6A 3BGGA 1WX0A 5HUPA 3EX3A 1H7OA 3OA3A 3TV8A 1GVRA 1QO5A 2CW6A 1OG0A 1B4KA 3W7CA 1XUZA 1EP2A 3IVTA 3G1HA 2YGYA 3M9YA 3DXIA 1JCXA 3CQ0A 4ZVJA 3DBPA 3QPZA 4N4QA 5G4WA 1LCOA 1LM1A 2E6AA 1FWSA 3LCXA 2ZZ7A 2A5HA 3LDVA 5CPNA 2NV2A 3N73A 4RR4A 4PTNA 4A2RA 1RPXA 3HMJG 1IXPA 4IX0A 2C1HA 4XBKA 1KFBA 1GT8A 5E1QA 2FDSA 4HNUA 4U28A 3STGA 1RVGA 1AK5A 2DORA 3DHDA 3C2FA 2QEZA 4OV4A 4NJKA 3UPWA 4AF0B 5EMUA 3KFTA 3NQ7A 3KHJA 4EOUA 4UUIA 2A2IA 2JKPA 3NPUA 1OHLA 1J2WA 3LCFA 4Y9AA 3M6YA 3G1AA 2ZZ4A 5HUOA 3T4CA 3NQ6A 3HGRA 1L6SA 3E49A 1EEPA 2QAPA 5I3IA 2ZRXA 3C2EA 4ZQPA 3NPXA 4QNEA 1FWNA 4GC4A 1ZAJA 4ONVA 1QNVA 4FX6M 1EWDA 4OQVA 3P61A 4IOTA 1IXQA 2Y7DA 2WSYA 1YLVA 4TMCA 5CSRA 4BK9A 2C0AA 5KZMA 1TPFA 5HQEA 3HG4A 3MBFA 2VKZG 4Z1DA 3W7IA 2QJIA 3QJAA 3B05A 5TBOA 3W7MA 2YDAA 3IIXA 1OK6A 1VCFA 3W3OA 3P8IA 1G69A 1W1ZA 4FNUA 1WBJA 3ZS4A 4X3ZA 1I2OA 4OBTA 3W73A 1QPNA 1TPUA 4JTFA 3B06A 3ABSA 3PAJA 1XKYA 1ME9A 4A21A 1ME8A 2I14A 4UFHA 2FTPA 2QCNA 1H1ZA 4XBSA 3CU2A 4CQAA 3IVSA 3GIYA 4MYAA 4ZL1A 1OABA 4Z08A 2CLKA 1OX6A 5K3VA 3MP3A 1BWKA 3LB0A 3LX9A 3Q58A 1Q6QA 4LT9A 4ORIA 2H8ZA 4ZQMA 2E68A 2ALDA 1M5WA 1W31A 3L0KA 2QUVA 1KBJA 3PUEA 1DHPA 1QO2A 1EP1A 2DJXA 1K7XA 4FXSA 1H60A 3EKLA 1ZFJA 1LRNA 2BZNA 2O7SA 3NPWA 3SECA 5E0KA 3JR2A 3UQNA 1XBXA 1C29A 4QSHA 2A1YA 4CCDA 4UFMA 5FI8A 4EF9A 4M6VA 4XKYA 4LVDA 2GQ8A 3LCHA 4XTIA 4DPPA 2Q8ZA 4GUGA 2TRSA 2VOMA 3W1NA 3W7KA 4O13A 4WY0A 3BG9A 3FJ6A 1LDCA 1KFCA 4JYEA 4MLJA 1XCFA 3HG2A 3KRSA 3W9ZA 1TV7A 2HS8A 3WFAA 3TX9A 4NUWA 4IMEA 4JN6A 3GB6A 1GTEA 3W7DA 4JDBA 1AL7A 5LHEA 3PB2A 3BARA 3CTLA 3ZWTA 2YW4A 3LHWA 1FXPA 2OMAA 2BXVA 4RV8A 5BMWA 4Z0SA 3M1ZA 3MHGA 3W7JA 3EXSA 5I3HA 4WZHA 4MZ1A 4ZQCA 3WK2A 5DXXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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