3UXAA

Designed protein ke59 r1 7/10h
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGALKDVVQLSLRRPSLRASRQRPIISLRERILEFNKRNITAIIAVYKRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLVILTEEKYFNGSYEDLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVGLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDEEDLDIALRIGARIIIISSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAASGISERNEIEELRKLGVNAFEIGSSLMRNPEKIKELIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Bridging the gaps in design methodologies by evolutionary optimization of the stability and proficiency of designed Kemp eliminase KE59.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Kemp eliminase KE59 R1 7/10H
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 86
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.-.-.-:
pdb deposition date 2011-12-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uxaA00
5C2XA 1U83A 4QNEA 3THAA 2B7OA 3CB8A 5CG7A 4DO6A 2E6FA 3EWBX 3VCRA 4ADSA 4LUJA 1FXPA 2CZEA 4PC8A 3C2VA 4HSOA 1D3GA 5FF3A 4P61A 3W83A 1W5MA 4ORIA 1EUAA 5AHNA 4BWLC 1Q45A 4O53A 2QUVA 4IXXA 3D0CA 3TKFA 3CQ0A 1QPRA 3Q58A 2ZRXA 2QCFA 1FWNA 2CLMA 4JR5A 4TX9A 3W22A 2Y7GA 2P0OA 4QM1A 3W1NA 3G8EA 2A1YA 4JXCA 1NEYA 2NUYA 5G1YA 4O8RA 1PVNA 3P7YA 2JBMA 5AFDA 3OEXA 2A21A 3HG4A 5FI8A 1ZFJA 1EIXA 4LVBA 3QZEA 3LI1A 1LRTA 3EKZA 4XTDA 1G7VA 4RV8A 3MI2A 5G4EA 3ZR4A 3N2XA 4TIMA 3B4UA 2VFHA 1BKSA 1XM3A 1SPQA 3NQAA 2Y89A 3OA3A 3NL3A 4AEOA 3BARA 1JJKA 4QAIA 3UWZA 1LRNA 4N9CA 4ORMA 3L21A 3LHVA 4O16A 2Q3OA 3WJXA 4O14A 3PS7A 1KM4A 3KVKA 1UB3A 4MY1A 4MY9A 5KZDA 3TQ0A 1OFPA 3ZWSA 4LV4A 1FDJA 2VXNA 2P1FA 2WOQA 3I7QA 3LX9A 2Q3RA 2F7FA 4HKPA 3DBPA 1FCUA 5KSWA 1JCJA 4TMCA 1ICPA 5DN1A 1C8VA 3W70A 1JUKA 2VFEA 1TV8A 1SU5A 5DBTA 1EB3A 2PRLA 2RHGA 5I3HA 2QCMA 1XBXA 2CLOA 1A50A 1LTDA 4RZ4A 4ZQPA 5DCEA 3PF3A 4A2SA 5D09A 2I1OA 4L4LA 4PODA 5AC8A 3DGRA 2PE4A 1YLVA 2YX0A 3IVTA 3BW2A 3A24A 3NQGA 1HTIA 2DZUA 4O0ZA 1KBJA 3TE9A 1Z41A 3UPBA 3KHJA 3CIXA 1LP6A 1R2RA 1GT8A 3C6CA 4CNPA 3QW3A 2VFFA 1FWWA 3H53A 1BEUA 1SZGA 3OVPA 3G1XA 3G8RA 4M7SA 3GX9A 3W2MA 2CW6A 4LV9A 3YPIA 5CZ0A 1I2QA 1LOLA 3NM1A 4UR7A 1OABA 1SZFA 1V5XA 2PCQA 5GVJA 1LORA 3SECA 2QJIA 2J6XA 3GXPA 3NXFA 1NAL1 1OX6A 3HOJA 3W1RA 2GJLA 3W1TA 3G1VA 1YADA 1MZHA 4UTMA 3W23A 5HR6A 1G4SA 2PRMA 5LHFA 2AQWA 2C19A 1RQBA 4DF1A 2X16A 1O95A 3LBCA 3T40A 3KFTA 1H7WA 3C61A 4XUGA 5DBUA 3MP3A 1G67A 7TIMA 1XKYA 4KFPA 5AHMA 3N9RA 2A85A 3C2EA 2R91A 3PSVA 1DQWA 3MYPA 2FQIA 1K7EA 5G5IA 1RR2A 1XXXA 1R30A 5K9DA 3CC1A 4CCEA 4AF0A 2H6RA 4N02A 3M43A 2VEPA 4AHPA 5TQLA 1NF0A 4K8HA 3NM3A 3L68A 4JN6A 4A2RA 3LLFA 2WKJA 5AYZA 4Z1BA 5J5DA 3NNTA 2W6RA 5DLCA 4MKNA 2B7NA 3MBFA 4EOUA 3T44A 3PWAA 1TSIA 2ISWA 4HPJA 5C6MA 1TQXA 2Y85A 3WK2A 3DFSA 2P10A 5F2IA 3GB6A 4DBEA 4PL2A 3QC3A 1TV7A 1SZEA 3LXAA 2Y63A 1GVFA 3GDLA 4UTIA 2CLLA 1XBVA 4OBTA 1H1ZA 5FEZA 4IPJA 4K7VA 3O1NA 1H63A 3NEVA 1OFEA 2XFWA 3HGRA 1HG3A 1PCWA 3H55A 1LBLA 3BG5A 1N55A 3UY7A 3GAYA 4CCDA 3RLUA 2O7QA 3UNDA 5F2GA 2QUUA 1SFJA 3MI6A 1FCBA 1K8YA 4O1CA 1JCNA 4PEKA 2GVGA 4EF9A 4AAJA 1O60A 1F5ZA 1G7UA 3GYEA 2A5HA 3QJAA 3USBA 2ZRYA 1ML1A 4K8EA 4YXGA 3QMTA 3W2LA 2DORA 3LHUA 3M0ZA 4X2RA 3R5EA 2Q8ZA 3PBYA 1XC4A 3CIWA 3W1AA 4JTLA 1F05A 3MUXA 2ABBA 2VFIA 4FXRA 3A21A 3P60A 3QMRA 3QQ0A 1ME7A 3NYZA 4O19A 3GNDA 5HNRA 3G1SA 3SI9A 1H62A 4K7YA 3NGJA 1IXPA 4UNLA 4O4WA 3MW7A 4AH7A 3VE7A 3I68A 4UMAA 5HULA 1H5YA 3M16A 4BF9A 4JTIA 3AJXA 1ZHAA 1H60A 4O0KA 4UMBA 4DPQA 3G1DA 4CQ8A 1OHLA 1KTBA 1VHCA 5I3JA 1K02A 2BLEA 1WAUA 5D2VA 2WO5A 5HJLA 5HWNA 3NPVA 1FX6A 5G2HA 4ZQMA 1PHWA 3PR2A 5AB3A 5I3IA 2ZA3A 4XKYA 3KRZA 1KM2A 3P81A 3L67A 3UWWA 5E0KA 4N9DA 2VKZG 4O1BA 3DXIA 4UCGA 1TPVA 4UTLA 3BO9A 1VLIA 1H1YA 1K7XA 2E6DA 1OF6A 1JUEA 2ZRVA 3G3MA 4ZQOA 3VFLA 4PL1A 4DO4A 2OJPA 3UWVA 4O1AA 4YWIA 3GXNA 3S1VA 4UUIA 1Z44A 1FQ0A 4O50A 3ABRA 1ZJIA 4UTUA 4FEZA 3TV8A 3V75A 1XBYA 2ZZ1A 4Y96A 3W1MA 5D05A 2GPTA 1ZAIA 3T55A 2GOUA 3NQDA 1WYIA 1EEPA 1DOSA 4DO5A 1JCYA 3PBUA 5DCDA 4O10A 3S5ZA 3W2KA 4GWEA 1FWSA 4XQ6A 3MYOA 1THFD 2C16A 4HNTA 1W31A 3B03A 3NL5A 2BX7A 4CLMA 4MJZA 4NNBA 3MWAA 2DZPA 3NL2A 1TPC1 4ICNA 1LROA 1EP1A 1XDMA 3RU6A 4RR4A 2ZRWA 5BRBA 2TPSA 4OT7A 2CZ5A 1RD5A 1C29A 5D2YA 1Q6LA 3A5VA 3I7RA 2G95A 1I2OA 4JY8A 5EBUA 3W2JA 3EX6A 4ZZ9A 3TSDA 4IMFA 2FJKA 2NLIA 3W76A 1X6UA 4RJEA 3S6DA 5DY3A 3SGUA 3TSBA 2DJLA 3PB0A 1LOQA 3BG3A 2NXHA 1P5BA 1LDCA 3KVLA 3NQMA 3O6YX 2A7PA 3OBKA 2V30A 2VEIA 3IGUA 2UV8G 3TQVA 2PC4A 3EXSA 4MFEA 3W87A 3F4WA 1UJPA 5IM51 3L5AA 2X1RA 4R7JA 3O63A 3W71A 4QJ1A 3I7SA 1C9DA 1SW7A 1W1ZA 2QAPA 4JTUA 4Q4KA 4GE8A 3NQ6A 3B05A 3FA5A 1TTJA 4JEQA 1DVJA 3HMJG 1LBMA 1KM6A 3SW6A 2H3DA 2EGZA 1OX4B 3TFCA 2QJGA 3HG3A 3W9ZA 3PSWA 3NPWA 2A7RA 1HUVA 1Q6RA 3QM3A 1OJXA 2AAMA 4NVTA 3RMJA 4GRSA 2HS6A 5LNUA 3UZ5A 5D03A 2YYTA 4AWSA 3NPXA 1A5AA 3UYCA 4Q32A 5H91A 4N9EA 3W1UA 3WJZA 3P8IA 5AYYA 4O52A 1X1OA 5D32A 4EF8A 1H7RA 2OZ0A 3U6WA 3LTPA 3DFTA 1P1XA 3IRDA 4NJHA 4JYFA 1KLZA 2GVJA 2J9XA 2EAWA 4YCOA 2OCZA 3LDVA 1TO3A 1OFRA 3GDTA 4TMBA 5KZMA 3B0VC 3PC0A 2ZZ4A 3W6YA 4NT0A 3Q94A 1BWLA 1HL2A 4FNTA 2CU0A 3NQ2A 1I2RA 5F2MA 3W1PA 3WK3A 1JCXA 1L6SA 1MSSA 4ADUA 3NDOA 5FEPA 3U2OA 3HB9A 1S5VA 5HR7A 4FXSA 3SR7A 4WY0F 4LUIA 2J9YA 2VEMA 3G1HA 1I8JA 5L6UA 4A3UA 2YCEA 1YTKA 5AN7A 1QDSA 3C8FA 1PL9A 4LVFA 4C1LA 3ABQA 1GVOA 2ZQ0A 1J5TA 1RQEA 3CM4A 4QQ3A 1YPFA 5DXXA 2V82A 3TXZA 1TJPA 1GVRA 3EX1A 2C14A 1EPXA 4L4MA 4UTWC 4CCCA 3QQ1A 4N2YA 4OQVA 4RZ5A 3OHIA 4Z1CA 4FO4A 1Y0EA 4TR9A 3LOTA 1QR7A 3KAOA 4LS1A 3TH6A 4OU1A 1LM1A 2TMDA 3N73A 3CWOX 3M5VA 3P74A 1GYNA 5LNVA 1YTEA 4D2JA 4MZ1A 1L2UA 3MMTA 3P82A 2V5BA 1Z48A 3W7IA 5FESA 1SSGA 4FB7A 1DBTA 2NX3A 3QW4B 4IQLA 2JKPA 3F03K 4UMCA 1QWGA 2G5WA 2ZTJA 1PIIA 3UXAA 4LY8A 3W88A 1B4EA 3QSRA 1SR9A 2V9DA 5CGQA 3TFXA 2V5LA 2XN1A 1LYXA 3N9SA 4C1KA 5K2ZA 4UTJA 4NZJA 5LZLA 3S5YA 3EX2A 1OYBA 2YYUA 4U4MA 3HG5A 5HWJA 2WJZA 5HQEA 4YL2A 5BOOA 3M44A 1KFJA 4TO8A 3HG2A 4ZQRA 2YSWA 5AOUA 3IVUA 3O07A 3PB2A 3KXQA 1K7FA 2WQPA 1TRIA 3LHTA 3W7HA 3BLEA 2FPTA 3PUOA 4WOZA 3CEUA 2GJNA 4ML9A 4UFKA 1ZCOA 1L6YA 2NX9A 5FF2A 5K3VA 1K03A 2E77A 2QKFA 4H6KA 2X1SA 2HSAA 4ZMGA 3FFSA 5F1UA 3B0UX 1A5BA 1TYGA 3FJLA 4R34A 1PV8A 4WUIA 3MHFA 4U28A 2J27A 2R8WA 1OYAA 1LRQA 3KVMA 3L9CA 2I9EA 5LNWA 3OG3A 1RZMA 1YYAA 5KITA 3HIJA 5U7SA 1K8ZA 3E02A 3A5FA 3W85A 3TAKA 1KW1A 3MI3A 1ZY9A 1GTHA 1TPWA 3QMSA 4LW7A 3T78A 1GZGA 4X22A 3W7KA 3M6YA 3STGA 2Z2UA 3MHGA 1CX9A 1KM1A 3I6RA 2C6QA 4KFNA 3L0KA 4JX6A 3DU0A 2A6NA 3B06A 2BWGA 4AB4A 3HPSA 3I65A 4UFHA 3UXDA 2FB2A 1TREA 2RH9A 3VE9A 2E6YA 3HGJA 3W7MA 2JK2A 2NXIA 3UQNA 1L6WA 5E93A 1G6CA 4AXKA 1IIHA 3C0JA 3HGSA 4LVAA 4RCXA 1QNVA 5D38A 3HPZA 4PCFA 1GEQA 1IXOA 2YR1A 2WSRA 2Z6JA 5HMSA 2ZZ5A 3LXCA 4HN4A 1VYPX 4JD4A 4IWWA 4X9SA 5DXYA 4AVFA 2GUUA 3FIGA 3M47A 4BI5A 2DU2A 4BR1A 2DZSA 4JIPA 3LGEA 3SSJA 2EF9A 5LNRA 3NOEA 3TMLA 1OK6A 3C56A 5CPLA 3W07A 1UASA 4UIOA 2RDTA 4CQAA 5LGZA 2FDSA 2J24A 5D30A 1OG0A 4Y9AA 3L65A 2B4GA 4M6QA 1UUOA 1H51A 3PG9A 4UFIA 1MEWA 1ZNNA 1ONRA 2DZXA 1TPB1 1AG1O 4ADTA 4JNMA 1I45A 1G69A 4RKAA 3QYQA 4KWWA 4PTNA 4Y90A 2QCLA 3CPRA 3UZJA 2NZLA 3GZ3A 1K8XA 3B04A 2W0UA 2RKXA 5G2WA 4ALDA 5LSMA 4UFMA 3HQ1A 2X1UA 3S42A 3K30A 4FIQA 5AC7A 2Y70A 4CNOA 3WK1A 2Y88A 2EPHA 2GQAA 3HGOA 3BK0A 1WXJA 1PHQA 1WBHA 3W72A 3BLFA 1YPIA 3GKAA 2E09A 3ABSA 5C5YA 4NJKA 2J88A 4O1DA 1B4KA 4MFDA 2ZCGA 3TUUA 4NXKA 1VZWA 2QEZA 3MO7A 1DQXA 4MLJA 4ZQNA 1LCOA 1OX4A 1WA3A 1EWDA 3L0NA 1KTNA 5IBXA 2X1TA 3DFNA 2H8XA 3P84A 5HUOA 3O6DA 5EPDA 3QRHA 4RZ6A 4E38A 3G18A 5H2ZA 5LHEA 4NXSA 5DCBA 3UWYA 1KTCA 1QOQA 4JTKA 2D73A 4AWUA 5KTLA 3IV3A 1EP3A 3GNNA 5CZTA 2YFNA 4LRTA 4MUZA 4LTSA 3PULA 3TJXA 4BI6A 3EWZA 1VCFA 1DL3A 5IBXC 1MEHA 1RPXA 3BW3A 5FF7A 3W7LA 5D02A 1YDNA 2ABAA 5CPMA 2CLHA 1H7XA 3LM7A 3P62A 3IEBA 1H61A 2TRSA 2ZBTA 5G2IA 1D9EA 2A7NA 4GC4A 3P5YA 5KINA 4QIUA 2OT1A 2PURA 2C15A 1U5JA 6ALDA 2CLFA 2ZA2A 3TJLA 3N2MA 1AW5A 3LV6A 3PUEA 2WSQA 3B8DA 3LRKA 1W0MA 5U4NA 4IXHA 2HTMA 2GQ8A 1HO1A 2WNQA 4N4QA 2FFCA 5HWMA 1R2TA 3P5ZA 3C4UA 2ZZ6A 2YPIA 5BMWA 4JDYA 1GVSA 1DKWA 4MZ8A 3M5XA 5FF0A 5K7JA 1GOXA 4ONVA 1VS1A 1IF2A 2ATSA 4DF2A 3C2OA 3WK0A 1OK4A 4KFOA 4JX5A 3LTSA 2WV8A 2CFFA 3W1QA 1ZENA 5CZSA 3W84A 3O05A 4E0CA 1Q6OA 2NUXA 3W3OA 4BK9A 3C52A 4G1KA 4DELA 3IIZA 4LOCA 4I9AA 2HS8A 5EKYA 4CNNA 1AW2A 2YDAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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