3UY7A

Designed protein ke59 r1 7/10h with g130s mutation
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGALKDVVQLSLRRPSLRASRQRPIISLRERILEFNKRNITAIIAVYKRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLVILTEEKYFNGSYEDLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVSLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDEEDLDIALRIGARIIIISSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAASGISERNEIEELRKLGVNAFEIGSSLMRNPEKIKELIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Bridging the gaps in design methodologies by evolutionary optimization of the stability and proficiency of designed Kemp eliminase KE59.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Kemp eliminase KE59 R1 7/10H
total genus 95
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.-.-.-:
pdb deposition date 2011-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uy7A00
4FNSA 2ZCGA 4M7SA 4BWLC 4NXSA 4QNWA 2NWSA 3LXAA 1OFRA 1SZEA 1TYGA 3VNDA 4IMFA 3W72A 3NQVA 3QQ1A 2E5BA 5LZLA 4KWWA 4O17A 1E51A 3GNNA 3KRZA 1PL9A 5LNWA 2B7QA 1C29A 2IQTA 1PVNA 3M44A 4GUGA 4AH7A 4X2RA 5FI8A 4Q32A 2QCGA 3EWUA 1TTQA 2CLMA 2WV8A 3LI0A 6ALDA 3OVRA 4UMBA 2R8WA 4M19A 4A22A 4I9AA 5G2HA 1DKWA 1TPVA 3CLMA 1WBJA 5I3IA 3HPZA 1MZHA 2RHGA 3HG2A 4GC4A 5D02A 4JDBA 5E93A 5BOOA 3TU9A 4BR1A 1XXXA 5D30A 5EA9A 4FX8A 2D73A 1NF0A 3W2MA 3FEMA 1VCGA 2YGYA 3W71A 4DBDA 1GOXA 4WOQA 4HHPA 2ZFAA 1H60A 3HG5A 3PUOA 4M6VA 3S8HA 1Q6OA 1RZMA 2PE4A 1NF7A 1F2JA 3CHVA 1DJNA 1KV5A 2ALDA 2DORA 5CPNA 1R46A 4H4IA 1OF6A 4MZ1A 2CLOA 1XBYA 3WJYA 1OX5A 4O54A 3DH7A 2Y85A 1ZCOA 3TDFA 3P8JA 2DU2A 5EBUA 4JN6A 4JTFA 1LP6A 2W0UA 3BLFA 2ZA2A 4O4WA 3DENA 3TNOA 2ZRWA 2NV2A 5KMYA 3LRMA 4DF0A 1KTBA 4JNMA 2CLEA 3WK0A 4OHQA 4N9DA 3S6DA 4EVZA 3N9RA 1ICQA 1K03A 5K7JA 1ZAIA 5D2TA 1WOAA 3QPYA 4IUOA 1H7NA 3G18A 1FDJA 3CB8A 1OFEA 4YXGA 3MWAA 3PG8A 1EEPA 1GEQA 3HG3A 5K4ZA 4LUJA 4MOZA 4A3UA 1SUXA 1ZALA 1N55A 1IIGA 3VI2A 4IWWA 4L4MA 4NUWA 1TMHA 3EWXA 2GUUA 4DEFA 4UTHA 5LNVA 2ZZ1A 3I7QA 3RMJA 2E6AA 3SGUA 1JJKA 1A50A 1ZAJA 1K02A 4JTTA 3WJXA 1I4NA 4HNUA 1WYIA 3DXIA 1LOQA 3PBVA 1KFCA 3M47A 3W76A 1Y0EA 1Z41A 4O15A 1KLYA 3NQ6A 3UPWA 1TJPA 3EKLA 1YTKA 3IVTA 1FCBA 1W0MA 2ATMA 3MYPA 1SO3A 3G8EA 1VLIA 3KOFA 4CQ8A 2YX0A 3B8DA 5LKYA 2NXIA 3ABSA 1ICPA 3MP3A 3EEGA 1JCYA 4HNVA 1GVRA 4NX0A 3A23A 3KVMA 5AFDA 5J5DA 2Z6IA 1ZJIA 4ZVJA 5FEZA 4PCFA 2XN2A 2V30A 5J5RA 1LOLA 1FXQA 3LERA 1K7EA 2QCFA 4OBTA 5F4XA 3OIXA 3V75A 1H51A 4CLMA 3HIJA 2Y7DA 3QW3A 1WX0A 3QQ0A 3UZ5A 2PRLA 1GPWA 2ZTJA 2C16A 4MLRA 4NJHA 2TRSA 2ZZ4A 1JUEA 4M5PA 2A6LA 1ZENA 2XN0A 4N6FA 4N4PA 2P10A 2ZZ6A 5HMSA 3DFSA 4AWSA 4WD0A 3W85A 3W7DA 4KFNA 1QOPA 4M7TA 1T99A 4ZQMA 1YYAA 1RQEA 3YPIA 3FIGA 4DBEA 1K3UA 3A22A 2QKFA 4K38A 5CSSA 2NXGA 1W54A 3R13A 4IMEA 3PAJA 1HTIA 4N9BA 1VLWA 3P81A 2W6RA 4LOCA 3GYEA 5C55A 1JCJA 5BNKA 1TRIA 4K7VA 3W1NA 1VHCA 3JRKA 5DCEA 5D32A 1O94A 2ABAA 1AMKA 5AYYA 2QUVA 1O5KA 4TO8A 1M6JA 3N19B 2AGKA 4O1CA 4XZ9A 4KWVA 2PRHA 2DZSA 1A5CA 4HKPA 4ZL1A 3G22A 1H1YA 4WXYA 3OEXA 1G4EA 1TV7A 2WQPA 4UTUA 5D03A 3M16A 4OQVA 3TSMA 1OFPA 3G0XA 3C8FA 1M5WA 3BVJA 3W74A 1K8YA 3LCWA 5D04C 2RDUA 1KBIA 3LI1A 3W2JA 3W7PA 4JTGA 5G4WA 3SZ8A 2OJPA 1DORA 3O6YX 3RLUA 1L6WA 2ZTKA 4UUIA 1W3TA 3CEUA 3QSRA 1FBAA 1OVDA 3W83A 1G6CA 3KVKA 3WK1A 1L6YA 5LNSA 3U8GA 1Z44A 3W7OA 4DPPA 3HBLA 3M5ZA 3C4UA 4ICNA 2E68A 3NQFA 4QITA 4UFJA 5FEPA 1T96A 4PL2A 3W87A 4RZ4A 2BZNA 2NV1A 4FNPA 3P5ZA 4QM1A 1FWWA 5EYWA 3IIZA 3INPA 1OHLA 1YPIA 1VYSX 1M7PA 2QJGA 4BI6A 3IVUA 4TMCA 4HSNA 3A5VA 1HO4A 3PC0A 2Z6JA 3EX3A 1G67A 3NQ2A 4DXVA 2J24A 5HR6A 1XBVA 4NNAA 1OFDA 2YR1A 3QMSA 4JX4A 3T44A 3MHGA 1U5JA 3LCLA 1KFLA 4OGZA 5I3HA 1OYAA 3F03K 1F7BA 1RQHA 1TB3A 4LVDA 1SO6A 3B04A 5FF7A 5HR7A 1LBMA 2GVJA 1QFEA 4JY8A 1A53A 3E96A 4RX0A 1KM4A 5CPLA 3DI0A 3W7GA 3TAKA 2YZRA 1UASA 1GVQA 1EUAA 1XM3A 3TW6A 1SW7A 4LW7A 2X1SA 4JR5A 1HG3A 1FDYA 1O60A 2Q3OA 5L6UA 1WDWA 4AVFA 1YPFA 4BK9A 3G3MA 3LHUA 5LNUA 2V0TA 4UMCA 5TQLA 3PWAA 4CCCA 4I7WA 3H53A 4LY8A 2YYTA 2YSWA 3E9AA 1G4SA 1SSDA 4ADTA 3G1SA 4Z08A 5F2GA 3A21A 2CZDA 2CZEA 1VYPX 1GYNA 2EAWA 2PC4A 1S5TA 3PSWA 2FPYA 4PA8A 3NL6A 4LVFA 1MEHA 1L6SA 2Y7FA 4WXZA 1XC4A 4Y90A 3TJXA 2R94A 1VYRA 1GYLA 4S2CA 1EP2A 3BARA 5F2IA 1MXSA 1JCXA 2H3DA 3IIVA 1W5NA 2V9DA 3TMQA 3HQ1A 3GX9A 1GZGA 2CW6A 5KZEA 5HINA 4C1KA 3TH6A 3DZ1A 2X16A 3PVFA 3FLUA 1H7XA 4IQLA 1LRNA 4DF2A 5EL1A 4QISA 5K3VA 4JGDA 4NQ1A 5FF0A 1QAPA 1XUUA 3DFPA 4CNNA 3UY8A 2A1YA 4TIMA 1A5AA 1XL9A 3NQCA 5G1TA 4MPQA 1M7OA 1NSJA 3EXRA 2FB3A 4K37A 4JYFA 1SW0A 5AC6A 5TBOA 4O50A 4WY0A 2C3ZA 3THQA 1OYCA 2QUTA 4JEQA 1C9DA 4UIOA 5CZSA 3NQ8A 3I7RA 1JR1A 2WNNA 3NL2A 3QW4B 5KZMA 3LHYA 3EXSA 4N02A 3L0NA 3UZJA 3P74A 3LLFA 4RV8A 1GTHA 1FXPA 4R53A 4BI7A 1UBSA 6TIMA 2J9XA 3DHDA 2EHHA 1IXNA 1LRTA 2QF7A 3KFTA 2G5WA 3W1TA 3NOEA 3BW3A 4W9TA 1VRDA 1VC4A 2V81A 3W1RA 3LRLA 1JRCA 2GQ8A 1WA3A 4PC8A 1P4CA 4X22A 4KKXA 2OX1A 3MI3A 1UCWA 1X7FA 1R2TA 1SU5A 2YXGA 5C6MA 3TE9A 2E6DA 2FPVA 4RLIA 4Y96A 3BW2A 1V7YA 2Y7GA 3LV6A 3QM3A 3W70A 4LC6A 5G4EA 4K6AA 3PS7A 3QSTA 2C0AA 5CZJA 4O12A 1Z48A 4EF9A 3S1UA 3W9ZA 1LLWA 3U6WA 3NVTA 3BG9A 4N4QA 5HUPA 3VE9A 4PODA 3OA3A 2DZWA 2VC6A 3UYCA 1F05A 3ZFHA 1XDMA 2PRMA 2Y62A 1RR2A 4AF0B 2WPBA 1KFKA 4JTJA 2DJLA 5C54A 3N73A 3GVGA 1I2QA 1Z42A 4RXFA 1XFBA 3N14A 3LHWA 5K9CA 3V1PA 3BG3A 1IGSA 3NPVA 4Z1AA 1J5TA 2Z1BA 3C2OA 2GVLA 3UWQA 4UTJA 2FTPA 2C15A 2PCQA 3C52A 1LBLA 2ZRXA 3NR0A 1WBHA 3GKAA 3DFOA 4AB4A 2AQWA 4LS0A 2Y6ZA 3IGSA 3LGEA 2GOUA 4PL1A 1LZOA 1AW2A 5HJLA 4K7YA 3R89A 3NPWA 1LDCA 4ORMA 1I45A 4AWTA 1MO0A 3O1NA 1EUNA 4RCXA 5LGZA 1KM3A 5AHFA 3BLIA 2V8ZA 2UV8G 3SGZA 2Z0IA 3E02A 3NQ7A 4WUIA 4AEOA 3NNTA 3L0KA 1H7WA 3C2VA 3CQ0A 1TPDA 3TSBA 3K30A 5LNRA 1TSIA 1JUKA 5I3KA 2O7SA 4YLWA 3NQMA 4UFKA 2J27A 4OE7A 4R34A 5T26A 4CQ9A 2Y7EA 2B7PA 3PBUA 4JTEA 2RDWA 2CZFA 2QEZA 3WK2A 1OX4B 1SO4A 4TX9A 4NX5A 4TU1A 2DZTA 1IXQA 4UNLA 1MEIA 3W7EA 3CU2A 4FNTA 4XBSA 3PY2A 3E0IA 1OFAA 2F7FA 1DQWA 3SFKA 3UPBA 3CT7A 3SIZA 1OG0A 3TX9A 1R2RA 3FA5A 4LWWA 4JY9A 5CGQA 1KM2A 3LTYA 3DFQA 4UTLA 3G1XA 5HULA 4Y6GA 3M5YA 4LV9A 3DU0A 2DZUA 4NNCA 2YPIA 1KTNA 1QPOA 3W2KA 1FWRA 2QCDA 2CWNA 2KZHA 5G2IA 2FPTA 4LU0A 1ZNNA 4O11A 3TAOA 3GXTA 5CG7A 1QWGA 1W8SA 1W5QA 3C6CA 3P62A 3PR2A 3NPUA 4J9JA 3LM7A 3T55A 1EX5A 5EKYA 2YDAA 1EPXA 1TQXA 4IMGA 1KV8A 3LV5A 2ATSA 4IX2A 3FJ6A 3P5YA 1RQBA 1V5XA 5FF4A 5H2ZA 3UWYA 1OJXA 1QPRA 4O0KA 2OCZA 4FX6M 3KVLA 1GVOA 3GDKA 4NU7A 1OFBA 5CKSA 2VKZG 4UC5A 3HJZA 3PUDA 1B4EA 4JD4A 4UR8A 1FCQA 3S5NA 3QMRA 3UQNA 1AW1A 1KLZA 4XWUA 1HUVA 3B06A 3MI2A 3RNDA 3QFEA 3DFTA 2ZDRA 4HN4A 1J2WA 4Y9AA 3C3NA 4YL2A 1LRQA 5H91A 3PG9A 5G5IA 5E1QA 3DKLA 3S1WA 1N7KA 3O63A 4A21A 2H90A 4CNPA 2QAPA 3TIMA 1FWNA 4OU1A 3O05A 3L65A 1FX6A 3BO9A 2WO5A 5F2LA 5GVJA 4IXHA 1SZGA 3OHIA 3W1UA 5K2ZA 1P1XA 4OWGA 3W1PA 2QJIA 3IV3A 2Y88A 4IJBA 2QCDB 4KFPA 2CFFA 1YXCA 4NJIA 1ZFJA 3A5FA 2QCEA 4RK8A 5HNRA 2AAMA 4DELA 2HSAA 3M0ZA 3M43A 3TFXA 3GK0A 1S5VA 2RFGA 4JYDA 2E6FA 3UNDA 4B5NA 2WKJA 4LS1A 1TTIA 3WJZA 4QNEA 3H55A 4HT3A 5EMUA 4P2VA 2ZA1A 3SY5A 4FNRA 3W1LA 4JTIA 1LROA 1LORA 4N6EA 4GFSA 4O16A 4K39A 2VELA 4HIBA 4ZMGA 3STFA 4LC8A 4E2DA 2QCLA 2E5CA 4JTLA 1EWDA 4MZYA 2Q8ZA 5D2WA 5AYXA 2OMAA 3EX1A 3DAQA 4K8EA 2YW3A 4JTUA 2VFFA 1B57A 3QJAA 3TQVA 4QQ3A 3LX9A 3BLEA 1QR7A 4I7UA 4U28A 4ML9A 4O4VA 3I7SA 5EPDA 3LBCA 3GDRA 1VH7A 3GZ3A 3PULA 4XKYA 2WNQA 3CC1A 3KRSA 3CWNA 3VFLA 3VE7A 2ZA3A 2W79A 4MZ8A 1CI1A 3VKJA 3GNDA 2VFGA 1G7UA 5ABTA 1TREA 5F1UA 4MY9A 3GAKA 3OG3A 5DELA 2NX9A 1SFJA 4ZQPA 1VHNA 2V2HA 4XTDA 1VCVA 3M5XA 3NYZA 2H8XA 7TIMA 2ZYFA 3O15A 5FEXA 1PCWA 4K36A 2E77A 4EIVA 4O19A 3W86A 3W7IA 1UUMA 2G96A 1FWTA 1UB3A 3STCA 2J88A 1YTEA 1K8XA 2CZ5A 2CU0A 2H3BA 4BFAA 3C2RA 4IOTA 4GE8A 1ZY9A 4JYEA 1SPQA 3A24A 1U83A 3M6YA 4Y8FA 1XBXA 3EX6A 5BMXA 1IF2A 3N3MA 4LRTA 3QMTA 2GQ9A 1EB3A 2YW4A 2BX7A 5DN1A 4YCPA 3PUEA 1W1ZA 2C1HA 3HGRA 2I1OA 4GXMA 1W5OA 1VR6A 3MBDA 1GQNA 3CPRA 5SWUA 2RDTA 5AC8A 1H1ZA 2WSQA 3KHJA 1KBJA 4O8RA 8TIMA 4DQWA 3TQKA 4UTWC 1NEYA 5I3JA 3BW4A 3GDLA 3R5EA 3LCXA 2H6RA 1GVSA 3R8RA 3FYOA 5C5YA 2ZZ2A 1Q6RA 5LGXA 2VEIA 1LLZA 3Q58A 1GVFA 3FKKA 4FNQA 3TUUA 1IXOA 3BGGA 1F74A 4O14A 1QOQA 3L2IA 2C13A 1QPQA 4XKYB 3LHTA 1KA9F 3WK3A 1R30A 1ME8A 2X30A 1TQJA 3KVJA 1BWLA 5CPOA 5AN7A 4N9EA 3KRUA 4IMCA 4HPJA 4NJKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZCG A;  1XPG A;  5EML A;  4BWL C;  4GBD A;  3KWX A;  3WLH A;  1GJU A;  2Z00 A;  1OFR A;  4WLC A;  3VND A;  4IMF A;  3OLE A;  3RIL A;  3NQV A;  3UJ2 A;  2PZ0 A;  1B0I A;  3ZT5 A;  2CIT A;  5LNW A;  3LBO A;  5HJY A;  4GY7 A;  1XYC A;  1Q6C A;  3UJS A;  1KWK A;  1CXF A;  4HZM A;  4OJY A;  2CLM A;  3C3U A;  2VGF A;  3OVR A;  4UMB A;  2R8W A;  1P0E A;  1K9F A;  4JKM A;  3TWA A;  1DKW A;  1BVN P;  3HPZ A;  1UML A;  3R8H A;  5BOO A;  5E0C A;  2V3D A;  4LPC A;  1A0E A;  1OZM A;  3K1G A;  4IGN A;  1K1D A;  1YW1 A;  2HV5 A;  1Q2R A;  1XXX A;  5EA9 A;  1V0M A;  4P7R A;  4FX8 A;  2D73 A;  4BF7 A;  3WDI A;  3AHX A;  3MVT A;  3FDK A;  1GOX A;  4Z2I A;  4EE9 A;  2NT0 A;  4B2D A;  1FHL A;  4M6V A;  4F79 A;  1ZBC A;  3EDK A;  1Y65 A;  2ALD A;  3HFT A;  4LYQ A;  3ONB A;  4H4I A;  1QRQ A;  3T81 A;  1XWY A;  4MZ1 A;  1VFM A;  1UD5 A;  3A47 A;  4CU7 A;  3TYD A;  3DH7 A;  3K8L A;  3P8J A;  2IQD A;  3AMK A;  1W3L A;  2FTW A;  2W3Z A;  3PZM A;  4M29 A;  3VX0 A;  2JFE X;  1R3T A;  1S2V A;  4O4W A;  3VOI A;  3TNO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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