3VTRA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 e328a complexed with tmg-chitotriomycin
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTNHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVAPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERFVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural insights into cellulolytic and chitinolytic enzymes revealing crucial residues of insect beta-N-acetyl-D-hexosaminidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
molecule tags Hydrolase/antibiotic
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 194
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3vtrA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3vtrA01
4JKKA 2Q8XA 1ISVA 1B30A 4DUXA 1V6XA 1NARA 1W32A 2WCSA 1I75A 4HZ6A 3HU7A 4J3VA 2D0FA 4XUYA 4J3WA 3AYSA 1MQRA 1WDSA 2JF7A 1FA2A 1UR4A 1KR1A 6TAAA 3IJ9A 4FK9A 5A1AA 1HJUA 2XVLA 1TMQA 1RPKA 5CPSA 1OCQA 3AIQA 3BCFA 3BGAA 2W91A 2XFRA 2PBGA 4X0VA 4LQ1A 2DIJA 1G5AA 3ZJ7A 1UG6A 1F4HA 1C8YA 4J3SA 3VKKA 1KCLA 2DIEA 4E2OA 1W9PA 1KGXA 4UFJA 1GZJA 2XM2A 1BFNA 1ODZA 4PBGA 2PC8A 1LG2A 2V3EA 4D6FA 3CHFA 5BXPA 1DWFM 1X1NA 4GPNA 4P8WA 1HVQA 2NW0A 1M01A 1DTUA 4AY1A 2D22A 1DWIM 5DO8A 1D2KA 3WF3A 3RDKA 1Q4NX 5IFPA 2CYGA 3WH6A 1UKOA 3MSGA 5CGTA 3MMWA 2OYKA 5I2UA 3AZTA 1KXVA 1PX4A 3WMCA 4P7NA 4XB3A 3GYCA 1JFHA 2WMIB 3CH9A 5LYRA 1MQPA 3A4XA 3ZR6A 1UHVA 4Q7NA 4UQBA 1CXEA 3PZUA 1Q6CA 1K6AA 4EANA 2CBUA 1ZBVA 1E0VA 1WDRA 3VM7A 3W38A 1HX0A 1GPFA 2D23A 1AVAA 2BV9A 4PMRA 1HF6A 1UA7A 1H41A 2QHAA 4U3AA 3BCDA 1C7SA 2DSVA 1ZBWA 3WFLA 1E6NA 4QP0A 1V02E 1OINA 1BG9A 5AYBA 5IXEA 3W24A 4NRRA 2FDMA 3WY1A 1DWGM 5AC4A 3W28A 3L4VA 3N04A 1NOWA 2VT0A 2A3AA 2JALA 3EDFA 4PUDA 3SEPA 2IXUA 1ZS2A 3WFZA 4WSJA 3L4YA 3GNRA 4C7GA 2WANA 1CENA 3PZTA 1TR1A 4W8BA 3FNDA 2JEPA 3AICA 4PMUA 2WC3A 2XVNA 4GQQA 1FHLA 2QF8A 1RP8A 2WPGA 4AD5A 1LWHA 1GOKA 2VO5A 4KRTA 3AS3A 4JFUA 2G3IA 4JFWA 1PIGA 4DWSA 1E71M 1BF2A 2HISA 1Q6EA 3VIHA 5I23A 3WF0A 5HDRA 1JYVA 4P7LA 1EO5A 1B2YA 4H8HA 1H2JA 2CIPA 4AISA 1V6UA 2GDUA 4M81A 1E6PA 3AHTA 4GINA 3M07A 3VDCA 1XH0A 3KL0A 1Q6DA 2ZICA 2PWGA 1H4PA 4BZYA 3W6MA 3ZSTA 4LYRA 4OKDA 4IPNB 1SR0A 3WF2A 4MB4A 3L2LA 3PTMA 1XRVA 3EDDA 1VF8A 4PMXA 1H11A 1QI0A 4FLRA 4N0RA 5A6AA 1UD6A 7CGTA 2MANA 4AZCA 1CLVA 3IK2A 2ZOXA 1E73M 1OM0A 3B9EA 1K9TA 4P8XA 1JZ4A 4OBSA 4DUVA 1CXIA 1EOKA 3MUAA 4H8VA 1FH8A 1C8XA 3VGBA 3AXXA 4RE3A 3SCQA 2EPNA 1EIBA 1TVPA 3BLKA 4UFHA 4KGJA 1GQIA 3WQ4A 4NF7A 2CHOA 1CBGA 4KRUA 4AD0A 2EXOA 3AHYA 4BS0A 1JI2A 3J7HA 4JFSA 4CGTA 1EH9A 4IM4A 1E4NA 2JEQA 1UH4A 3AIUA 3KL5A 3LPGA 2QV4A 2GFTA 1L0PA 4LX4A 3VO0A 2VVNA 2WZEA 4S3KA 5TD4A 4EAMA 2CBVA 2A3BA 2CETA 3VOCA 3GZAA 4HOWA 1BVZA 2WB5A 2FH8A 2X09A 3WNMA 3SUVA 3VPLA 2J7FA 2WCAA 4E4PA 1OIFA 3AHVA 1LLOA 1KWKA 4XX6A 2OSWA 3WUEA 2PB1A 3AIEA 3A4AA 4ATLA 1QI2A 4M82A 3T08A 5FL1A 4W8AA 1B0IA 3VM5A 1J12A 2J77A 3CZKA 1ZBKA 1W3LA 3MO4A 1E43A 3WMBA 3F4VA 4JL2A 2CITA 2G4FA 3T2PA 5JBDA 1MXDA 1JGIA 1W3HA 1KQYA 2ZUWA 3AXIA 1XGZA 2DGAA 3VNYA 3VIMA 3VD3A 2J7HA 1YHTA 1ZB5A 3WDRA 3QOKA 5A8OA 2YA1A 3IANA 5CLWA 5GQBA 1R8LA 1MW0A 2XWEA 2WHMA 3OZOA 4GZEA 1TFVA 2BXYA 2VTFA 4AZ5A 1B1YA 3VD4A 4GZIA 1XH2A 3VGFA 2PI6A 4UCFA 1OIMA 4JFTA 3SIMA 4AD1A 2FGZA 4E8DA 5HBFA 2PF0A 3FXYA 4F8XA 1VJZA 2FHCA 4BQ2A 4BQ5A 2E8YA 4V2XA 1UQZA 2XFYA 2ZWYA 3PZNA 7TAAA 4UOZA 4OZOA 2J79A 1CXKA 3VIGA 3U5UA 2WMFA 3NDYA 5CZKA 1AQ0A 1HVXA 2VMFA 2OWWA 4PMQA 3AIVA 2ZX6A 2GJXB 3ZT5A 4AD3A 2J74A 2ZXQA 3OGSA 4JAWA 3FAXA 5ABFA 4BQ3A 1FHDA 1V0NA 1TA3B 2EQDA 3LPFA 3OIHA 5M17A 2YKKA 1BPLB 3BXWA 1W1YA 1HT6A 5D9NA 1QNSA 1R87A 2O9OA 3AZSA 4DWSD 2W66A 4F66A 4CCDA 2J25A 3ARXA 1GORA 3OG2A 2Y8KA 4WLCA 4AIOA 1NOFA 3SUUA 2E8ZA 3VILA 1OSEA 2WW5A 2X8RA 1PAMA 4PSPA 4UOQA 2BHZA 1BG4A 2EPKX 2BS9A 3SCNA 3AQUA 5GNYA 3SCTA 1ISZA 4D6HA 4D6EA 2J78A 1UH2A 3AIRA 3MUY1 5GNXA 4TTUA 4PMZA 4AD4A 1HKIA 1E0XA 2F8QA 1HJVA 2A3HA 5LA1A 2ZUTA 1DP0A 2WKGA 4D6IA 1KGWA 3BMWA 3HN3A 3EMQA 1K9DA 3U5YA 3L4TA 4PTVA 2O9TA 4NSBA 5A2AA 1QI5A 1WAWA 2BFGA 1RH9A 1UD4A 1QNOA 1QI4A 1JZ6A 4BF7A 3CBWA 2YL5A 3ZJ8A 3WUGA 3OLEA 1LL6A 4LYQA 2FHBA 4B15A 5I77A 4RL3A 2J7DA 3WNPA 8A3HA 2VZTA 3KWXA 2OWXA 2VOTA 4GKLA 3OGVA 4P7QA 6CGTA 3RIKA 1KQZA 1XV8A 4Z2JA 1H49A 1V08A 1JD9A 2XWDA 1NWTA 2QPSA 1KWGA 3TTSA 3N11A 4AIUA 4ZXLA 2DT1A 3CZ8A 3WNLA 2VURA 3BAJA 3MKKA 1V3JA 1O7AA 2WXDM 4AZ7A 3AXHA 4R5EA 5KEZA 3RJXA 4HMEA 1PZ3A 1QHZA 5CSUA 3ARSA 4ATWA 1H0GA 3GXMA 4B3KA 1UZ1A 1ISXA 2CERA 2CEQA 1K9FA 2J47A 2EO7A 1J01A 5FKYA 1MFUA 3F5LA 1M7XA 1B3XA 1UD8A 1V3IA 5M5DA 1JZ3A 3QHNA 4E8CA 2WSPA 3WQ8A 1ITXA 4W8LA 2WZIA 1K9EA 1WP6A 1E72M 4OIFA 3TONA 3WQ6A 3CZEA 5EFFA 1IT0A 1R86A 4CU8A 3POCA 4HA1A 1F4AA 2UWFA 2VX6A 3L4XA 5D8ZA 2WNWA 1W9UA 4HMDA 3QHOA 2OYMA 3SCUA 3CHCA 5A6SA 5AYIA 4M1RA 3OLGA 3VIKA 3WD1A 4ML4A 3AS0A 5A6KA 2XVPA 2ZIDA 1UUQA 3BAXA 3PTQA 3VD7A 4K68A 4GI8A 3GBDA 3MANA 5GPRA 4MDPA 4U5IA 3NYDA 1UWUA 1CLXA 3WF4A 1CXHA 1QNPA 4GQRA 4UFLA 3EMZA 4AZGA 4AZ6A 1JDDA 1CGWA 3NSNA 3O6AA 1GJUA 1W1VA 2WVVB 3WDJA 3ARVA 5E6YA 4MJ4A 3OB8A 2YBUA 1W9VA 3VGEA 3DYOA 4CD8A 1E5NA 3PN8A 2YLAA 1WDQA 2DSZA 3VGHA 4KMQA 1VIWA 2UY4A 4WIWA 3AZRA 3CO4A 4S3JA 1OD8A 3BAWA 2CNCA 1E55A 1GQJA 2F2HA 4KWUA 2UY3A 4JHOA 3ZR5A 1WNOA 2CPUA 2W61A 3W82A 2WMJA 3UERA 2GJRA 1FFRA 5HPCA 2OWCA 4RE4A 1ZJBA 1J9YA 1OBAA 2NT1A 1GONA 4FLQA 4LXFA 1JL8A 4PEEA 3KL3A 4WK9A 5A8PA 5BWFA 3ZT7A 1I1XA 3VIPA 3W27A 2WMHA 4PMDA 3WNKA 5EMYA 1V0LA 2O9RA 4NI3A 4ACZB 2A3CA 4J3TA 2Y4SA 1UWQA 3DHUA 4D6JA 3AIBA 1QBBA 1GOMA 3CZJA 4QCFA 2X0HA 2VUYA 4PMYA 3AMCA 3WH8A 3PZQA 4HZ7A 3W0KA 2TAAA 1VENA 3GTNA 2J8GA 3BSGA 4P8VA 1B31A 4PCSA 1A47A 1J0JA 3UCQA 2NT0A 4QFUA 2WMKA 4F79A 4ZXOA 2X1IA 2X05A 2XIIA 5D8WA 3T2QA 1HIZA 1PBGA 1WB0A 2CESA 4MNMA 4XV0A 1JZ7A 3AIWA 1KCKA 3WDQA 3DHPA 5C71A 1LG1A 1ITCA 4W7UA 1WZLA 3ECQA 4B16A 2BHYA 1US2A 2RGLA 4J3UA 1OT1A 2V5DA 4W5UA 4A3YA 2XGIA 1BVNP 1UR0A 3FHQA 1QOXA 2WC4A 4MB1A 1JI1A 5DT7A 2QMJA 4MB5A 3AHZA 2VRKA 1B9ZA 1B3WA 2WZHA 3N18A 4KH2A 2GK1B 5IHSA 4A3HA 3W37A 4UQ9A 5A2BA 2B31A 3WF1A 3A4WA 3F5KA 1EQCA 2Z1KA 1JZ2A 1XSKA 2EJ1A 1R7OA 1UH3A 1QW8A 2YIHA 1DEDA 4JKMA 1Q6FA 3BAIA 3N15A 2XGBA 1V3MA 5BCAA 1CGYA 2E4TA 3VIFA 1M53A 2ESCA 3WH9A 7A3HA 1J11A 2Y2WA 1J0YA 3T0DA 3N17A 3WENA 2PWHA 4D71A 1CIUA 1C93A 1QHPA 5EBAA 3UR8A 3WEOA 3K4AA 4V28A 5CSYA 2E9BA 4YPJA 3F5JA 4CD5A 2J62A 1UWRA 3VGGA 1CXLA 3RILA 2WC7A 2WVSA 1QPKA 3TP4A 1NH6A 4HA3A 5A6LA 2OSYA 3WDIA 1FH7A 3VDBA 2ZUMA 4PYSA 5JIPA 1HN1A 1NP0A 1EXPA 1LWJA 2DT0A 4PTXA 3MV11 1B3YA 1PEZA 2E40A 4QLKA 1CEOA 3GNPA 4MDOA 1KR0A 3O2LA 1J0KA 1DWHM 4CVWA 3PZOA 2GUYA 4HU0A 1D3CA 3II1A 3JUGA 2VCBA 4ZE4A 1AMYA 4W85A 1C3FA 4BA0A 3ZO9A 2ZUUA 2UY2A 1P6WA 3ZSSA 2ZX9A 3APGA 2FHFA 2W62A 2AMGA 2X2YA 2UY5A 4AD2A 4CUCA 2VX5A 3SCVA 1UKQA 1V3KA 4TX8A 1E56A 2ZX5A 3WD3A 3ARWA 4W7WA 4ZE5A 5JBEA 4CD7A 3NSMA 3SCPA 4PMOA 1JNEA 1E1EA 5E0FA 1UR9A 2JFEX 4A4AA 2VC9A 4M29A 4Z2KA 5E70A 3GXFA 1RD6A 1US3A 4F9JA 4B3LA 1UD5A 1C7TA 1ZJAA 1GUVA 3M6DA 3ARQA 5M3WA 1H1NA 3SCOA 2VZSA 3SUWA 3AMDA 3SURA 2J8FA 1PJ9A 1EO7A 4H2CA 2BY3A 2EPMX 2G41A 2VR4A 5CXPA 5AY7A 2YBTA 2VRQA 4QLLA 4D1JA 2C8NA 4CN4A 1CDGA 3CZGA 4J27A 3QR3A 3VNZA 1VFUA 1E3XA 1KBBA 4JFVA 1HJSA 1I1WA 3GM8A 2YJQA 4QLJA 1LL4A 2G3NA 3ARYA 4PTMA 3RMEA 2DT3A 5EFDA 3S2CA 1JF5A 3BMVA 4JCMA 2DSWA 5DEZA 4J7RA 3BC9A 3MMDA 5DF0A 3CTTA 1R85A 2D20A 3WQ5A 5A6BA 3VINA 5A8MA 4UOJA 3UESA 1KB3A 3AFBA 5I5RA 5HOSA 4WKAA 4W7VA 3UG4A 2YLLA 1N82A 3VTRA 4CN6A 2PWFA 4YHGA 3KEHA 4N42A 2WHJA 2IXVA 3UETA 1XC6A 4JCLA 4FF5A 5BRPA 2D2OA 5FOOA 3U57A 1GVYA 3CPUA 4C7DA 4GO8A 5DMYA 3VGDA 3K8KA 4PSRA 5GNZA 4X9YA 1GQLA 4P8UA 1X6LA 3B9DA 1MW2A 4M24A 1EGZA 2FGLA 4RE2A 2BVDA 3A3HA 3ZIZA 3W25A 2BVTA 4MAZA 1B3ZA 3RPMA 3CMGA 1V02A 3WMSA 1VBRA 1LQ0A 2ZWZA 3GH4A 3K8LA 4AXNA 3DC0A 5JBFA 4UQAA 2VQTA 1JD7A 5CG0A 1HXJA 3POHA 1CECA 1GHRA 1SYTA 2W92A 3L4ZA 1DWJM 1C92A 1E70M 1EHNA 2IUZA 3AMGA 1VEPA 1SFSA 1RP9A 3ARTA 8CGTA 4W86A 3GXIA 4PMVA 4CCEA 3A6OA 5I79A 4LPCA 2WMIA 1JG9A 2DSUA 1V6WA 4IUGA 2EPOA 2JF6A 4DWSB 2WWCA 2CHNA 2BY1A 1W9DM 1MYRA 3NIYA 1XCWA 3ARZA 2W67A 2D1ZA 4R27A 4D6CA 4NZCA 1U33A 2FH6A 2BVYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JKK A;  2Q8X A;  1ISV A;  1B30 A;  4DUX A;  1V6X A;  1NAR A;  1W32 A;  2WCS A;  1I75 A;  4HZ6 A;  3HU7 A;  4J3V A;  2D0F A;  4XUY A;  4J3W A;  3AYS A;  1MQR A;  1WDS A;  2JF7 A;  1FA2 A;  1UR4 A;  1KR1 A;  6TAA A;  3IJ9 A;  4FK9 A;  5A1A A;  1HJU A;  2XVL A;  1TMQ A;  1RPK A;  5CPS A;  1OCQ A;  3AIQ A;  3BCF A;  3BGA A;  2W91 A;  2XFR A;  2PBG A;  4X0V A;  4LQ1 A;  2DIJ A;  1G5A A;  3ZJ7 A;  1UG6 A;  1F4H A;  1C8Y A;  4J3S A;  3VKK A;  1KCL A;  2DIE A;  4E2O A;  1W9P A;  1KGX A;  4UFJ A;  1GZJ A;  2XM2 A;  1BFN A;  1ODZ A;  4PBG A;  2PC8 A;  1LG2 A;  2V3E A;  4D6F A;  3CHF A;  5BXP A;  1DWF M;  1X1N A;  4GPN A;  4P8W A;  1HVQ A;  2NW0 A;  1M01 A;  1DTU A;  4AY1 A;  2D22 A;  1DWI M;  5DO8 A;  1D2K A;  3WF3 A;  3RDK A;  1Q4N X;  5IFP A;  2CYG A;  3WH6 A;  1UKO A;  3MSG A;  5CGT A;  3MMW A;  2OYK A;  5I2U A;  3AZT A;  1KXV A;  1PX4 A;  3WMC A;  4P7N A;  4XB3 A;  3GYC A;  1JFH A;  2WMI B;  3CH9 A;  5LYR A;  1MQP A;  3A4X A;  3ZR6 A;  1UHV A;  4Q7N A;  4UQB A;  1CXE A;  3PZU A;  1Q6C A;  1K6A A; 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 3ZST A;  4LYR A;  4OKD A;  4IPN B;  1SR0 A;  3WF2 A;  4MB4 A;  3L2L A;  3PTM A;  1XRV A;  3EDD A;  1VF8 A;  4PMX A;  1H11 A;  1QI0 A;  4FLR A;  4N0R A;  5A6A A;  1UD6 A;  7CGT A;  2MAN A;  4AZC A;  1CLV A;  3IK2 A;  2ZOX A;  1E73 M;  1OM0 A;  3B9E A;  1K9T A;  4P8X A;  1JZ4 A;  4OBS A;  4DUV A;  1CXI A;  1EOK A;  3MUA A;  4H8V A;  1FH8 A;  1C8X A;  3VGB A;  3AXX A;  4RE3 A;  3SCQ A;  2EPN A;  1EIB A;  1TVP A;  3BLK A;  4UFH A;  4KGJ A;  1GQI A;  3WQ4 A;  4NF7 A;  2CHO A;  1CBG A;  4KRU A;  4AD0 A;  2EXO A;  3AHY A;  4BS0 A;  1JI2 A;  3J7H A;  4JFS A;  4CGT A;  1EH9 A;  4IM4 A;  1E4N A;  2JEQ A;  1UH4 A;  3AIU A;  3KL5 A;  3LPG A;  2QV4 A;  2GFT A;  1L0P A;  4LX4 A;  3VO0 A;  2VVN A;  2WZE A;  4S3K A;  5TD4 A;  4EAM A;  2CBV A;  2A3B A;  2CET A;  3VOC A;  3GZA A;  4HOW A;  1BVZ A;  2WB5 A;  2FH8 A;  2X09 A;  3WNM A;  3SUV A;  3VPL A;  2J7F A;  2WCA A;  4E4P A;  1OIF A;  3AHV A;  1LLO A;  1KWK A;  4XX6 A;  2OSW A;  3WUE A;  2PB1 A;  3AIE A;  3A4A A;  4ATL A;  1QI2 A;  4M82 A;  3T08 A;  5FL1 A; 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