3W1MA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-bromoorotate
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-bromoorotate
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 107
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1mA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1mA01
2QF7A 1W5PA 3N9RA 3WK0A 4LV9A 1JULA 3P82A 4XKYA 1JRCA 5FF4A 3MO7A 5G4WA 4XBKA 4UUIA 1TQXA 3HPZA 4XQ6A 1TTIA 2E09A 1KM6A 2NX9A 2H3BA 1XM3A 1FDJA 1FDYA 4WZHA 2ZRZA 1H7NA 3TU9A 3N2MA 1FXQA 1T8XA 3CC1A 3BW4A 3CU2A 4UTWA 2RDUA 5GVJA 1M5WA 3L67A 2IQTA 3HQ1A 3P5ZA 3P81A 1VGAA 4LV4A 3IVUA 1EA0A 3GB6A 1QO5A 3DHDA 5DCBA 3S1WA 4HHPA 1A50A 3GAKA 4RLIA 3FOKA 2OZ0A 4O17A 1ICPA 2PRLA 1K7EA 4PTNA 3G1VA 3EWYA 4Z1AA 4AH7A 5AB3A 3S6DA 1FWNA 1YYAA 1JCJA 4NNAA 1C8VA 4IXXA 4M7SA 1H61A 3SSJA 3W71A 3GAYA 5TQLA 1QFEA 4FNQA 4TU1A 3PY2A 4N9DA 4Z08A 1S5WA 3KVKA 4S1FA 1KA9F 2ZZ7A 3W7HA 3MHUA 1Z41A 4UNLA 3M0ZA 4AWUA 2LLEA 4Z1CA 3SW6A 4MYXA 4LU0A 4CCCA 3C2EA 2Z0IA 3CLMA 3C2FA 3P8IA 5AHNA 2QDGA 4UMAA 2BLEA 5I3HA 3HOJA 4OT7A 1Q3NA 1P5BA 1FCBA 3EX6A 3G1SA 5DXYA 1P4CA 4JR5A 1X1ZA 1VQTA 4EF9A 2B7NA 2YFOA 3JRKA 3M5XA 3QF0A 4GWEA 4XTIA 3P74A 1OX5A 1QPOA 3PAJA 2X2GA 3CB8A 1PE1A 3W2LA 1AL7A 8TIMA 7TIMA 3WJWA 3G1HA 1HL2A 1MEWA 3KOFA 1FWTA 4DEFA 3RU6A 1HO1A 1KLZA 2CZEA 3KXQA 3EX1A 3H55A 3F1QA 1I8JA 2XFWA 4E0CA 4X2RA 2RKXA 4A29A 3MBFA 2AAMA 3B0PA 3STFA 1TPEA 1MO0A 1GOXA 4IX2A 4O1AA 4LNYA 4O50A 1OG0A 5AHMA 2E6FA 4LS1A 3M5YA 2YZRA 4O11A 2YW4A 4GC4A 5I3GA 1SUXA 5D2VA 4K7YA 1CX9A 2VFDA 4MIMA 1X1OA 3BLEA 3BG3A 4S2CA 3QQ0A 3LHWA 2V30A 3LHZA 4UFHA 1DQWA 1DJQA 1O5KA 1VCFA 1DL3A 4LVDA 3EXSA 3R13A 2YSWA 3THAA 3IRDA 2VFFA 3TROA 3INPA 3S8HA 3W75A 2JBMA 1H7XA 2Q8LA 4Z1DA 2TYSA 1ML1A 3S9YA 4PEKA 4IMDA 3ATZA 3M5VA 3LXCA 1M6JA 3W2KA 4Y9AA 1N8FA 2CU0A 4LS0A 2FJKA 5K4ZA 4NXSA 4IMCA 3TJLA 4M7TA 3NQGA 5HWMA 3TCEA 2C6QA 1R2RA 4UTWC 3W1TA 3B4UA 5AHFA 3NOEA 2TMDA 3L9CA 3TKFA 2FFCA 1TREA 3ABOA 3ANYA 3BG5A 3TUUA 3P5YA 1VR6A 3C4UA 3CIXA 5F2MA 2ZZ6A 3QPYA 3TE9A 4AF0A 4ZL1A 1L2UA 1RVGA 3L5AA 2X1UA 4BFAA 4BF9A 2VEIA 4UTTA 1TPDA 3L0KA 3FIGA 1QAPA 2DZVA 4Q32A 1L6SA 3ZFHA 3O63A 3S1UA 3VCRA 1K3UA 2KZHA 2ZRVA 3C2OA 4QAIA 4QIUA 2NXHA 2QCGA 1NFBA 1XBVA 1H62A 2G97A 2DZPA 5LZLA 1VJIA 3UPBA 3CEUA 1Z42A 2CLMA 3ZS4A 2JKPA 3L0GA 3W74A 1YDOA 5AFDA 1TO3A 3ABQA 3RF9A 1XBZA 4HNVA 1YPFA 1VCGA 3PWAA 1AK5A 3E49A 5E1QA 4GXMA 3CWNA 1KFJA 1SZNA 1GVQA 5KZMA 1FWRA 4JNMA 2E6AA 2BZNA 2ZQ0A 3NQ2A 3LRMA 4JIQA 3UZ5A 4LW7A 5LHFA 4IMFA 5D32A 4GE8A 2A2IA 1VCVA 1QPQA 1OVDA 4YWIA 5KZEA 5FF7A 1X6UA 1F74A 4Y90A 1W5NA 3MHFA 1WV2A 1XDMA 1GVOA 5AC7A 4U28A 1KM0A 1XKYA 4MZ8A 3UWYA 3TJXA 1W3NA 4WX2A 4JDYA 4EVZA 3RFAA 3TQ0A 5KTLA 3TXZA 5HNRA 1H7WA 4BWLA 3KHJA 1K7FA 1RPXA 3NEVA 4NJHA 2XN1A 5G1TA 1QO2A 3G1AA 3N3MA 4DPQA 2F84A 1IF2A 5K3VA 3DI1A 3T40A 1KLYA 3O07A 4TMCA 4LC8A 2WNNA 3H53A 4FIQA 3BGJA 3MP3A 1G6CA 3BW3A 3NDOA 3FLUA 4LRTA 1BEUA 2BXVA 1G7VA 2J9YA 1IGSA 4IQLA 3UPWA 5AHLA 2YFNA 4JYEA 5AYYA 2YCEA 4M5PA 3L66A 1KM5A 1GTHA 3GNNA 1FQ0A 2Z2UA 2GVLA 4O0KA 5CGQA 5EA9A 1PHQA 3MW7A 1HUVA 3GZ3A 3NPUA 4WY0F 3GLCA 3LM7A 2B7QA 3VKJA 5I3JA 3WJXA 1SU5A 3QMTA 1GYLA 3BW2A 2XN2A 4FX7A 4KWWA 4FNPA 2VEMA 4JTIA 3TFXA 1EEPA 3LLFA 2FPYA 3PF3A 1JCNA 2VENA 1NF7A 2Y62A 4IPIA 5CPOA 4N4PA 4QQ3A 4HN4A 3PULA 2HS6A 1YDNA 2ZZ4A 3B0VC 2ZA3A 4KFNA 2RHGA 5BMXA 2C14A 5CZSA 3EKZA 4UTTC 3G22A 3E9AA 1OFAA 1LDCA 3NPVA 2FLIA 2C3ZA 3LCWA 5BNKA 4N4QA 1P0KA 5AYZA 2Q3OA 3CIWA 5LGXA 3P62A 1Q6OA 2YYTA 4JTTA 3UWQA 5K2ZA 3TV8A 5EYWA 4ADTA 2XN0A 3W83A 2P10A 2X1TA 3VNDA 2CLKA 3L5MA 3YPIA 2J24A 4H6KA 1LZOA 3SGUA 4MJMA 4PODA 1K8ZA 4MY8A 4Q4KA 1VC4A 1WOAA 2ATSA 1PV8A 1FWWA 3PG8A 1WX0A 4UTKA 3TSMA 5KZDA 4UTLA 3LCXA 4PFMA 2X16A 1B4EA 4O0ZA 4ORMA 1GZGA 4N9CA 3O6DA 3A5FA 1F05A 4ZQPA 2TPSA 2I9EA 5D03A 5LNWA 3W85A 4UTIA 5EL1A 3U2OA 2GQAA 4C1LA 1KM3A 2RDWA 2QCFA 4KFPA 1H5YA 1HTIA 3FFSA 4HT3A 2AGKA 3W7JA 3N9SA 4IJBA 3RLVA 3JR2A 3LI0A 3HG3A 3NM3A 2ISSA 3GKFA 3IIZA 3TX9A 1SO5A 4IUOA 2C19A 2V2DA 2YGYA 4K8HA 3EWZA 4RKAA 4OV4A 5CPMA 1TTJA 3CEPA 2QCLA 5FF3A 3STGA 3O06A 5CKSA 3LRLA 5EMUA 3P60A 2GQ8A 3A24A 3S42A 2WJZA 2V82A 3HF3A 3M7WA 3MP4A 3SGZA 1EUNA 4MVAA 2VOMA 4AXKA 2R91A 4L4LA 4GUIA 3FA5A 3T4CA 1F6KA 1LTDA 3TNOA 3GDTA 1O4UA 4JXCA 3A5VA 3N73A 2Q3RA 1OFQA 2CW6A 5F2IA 3OG3A 3LTSA 2H8XA 2QJGA 2QJIA 1LRTA 1IXPA 3PBYA 3CM4A 5F4XA 2H8ZA 1I2QA 1QMLA 1UUMA 3LI1A 2DZTA 4NT0A 5LNUA 1QR7A 3W87A 3P61A 3W7IA 1KW1A 4O19A 2QCEA 4CQAA 2EKCA 2OCZA 3LHTA 3W7MA 4FNRA 3SI9A 1S5VA 2PRMA 4UFMA 3HG2A 3LCIA 3TAKA 3W2JA 3MI6A 1ALDA 3GDLA 3GXNA 4N6EA 3Q58A 4D2JA 3OA3A 2ZFAA 3TQVA 1F76A 2A6NA 2A6LA 5BOOA 4JTFA 4MJZA 1BKSA 1TPUA 3W7RA 5KSWA 3QH2A 4EOUA 3DZ1A 4FO4A 2WNZA 3HPSA 2AQWA 2ABAA 4K37A 5DXXA 4A2SA 4UFJA 1A5CA 3UWWA 1UBSA 2QR6A 3VE7A 4E2BA 1KFKA 1K02A 1OX4B 1EB3A 4FF7A 3M41A 1W31A 3NQAA 2WSYA 5C55A 4O8RA 3KRUA 3HPXA 4MYAA 3QW4B 2QCHA 1A5AA 3TQKA 2QUUA 3CPRA 2F7FA 5LSMA 4UCGA 1I2NA 2I14A 1TIMA 1A53A 4JD4A 4TMBA 1YXYA 4Z0JA 3I68A 1WA3A 3B0UX 1DV7A 2CLLA 1OFOA 1XBXA 4UTUA 3E12A 1WYIA 3GR8A 3IEBA 3N34A 4TO8A 4XBSA 5D05A 2V81A 3C56A 4HPXA 2V8ZA 5LNSA 1SZEA 3M43A 4RZ5A 5FI8A 4C1KA 3S5ZA 1OABA 2VFHA 4DO5A 3UY8A 3Q94A 2I1OA 2Y70A 1VLWA 1PIIA 3R8RA 2QCCA 4UMBA 2JGQA 1W3TA 1UJPA 4ZZ9A 2GJNA 4UC5A 1IIHA 1NF0A 4HSOA 3C52A 3NL5A 4K36A 4MFEA 4JTSA 4O53A 5D30A 3MP5A 2JKAA 3W1QA 4I7UA 4JTUA 2YR1A 3SFKA 4O52A 3S5OA 4K39A 1M7PA 2RFGA 3UD6A 1OFDA 1Q6QA 1GVFA 5D2WA 3ABRA 4MPQA 2X1SA 5AN7A 4UIOA 3QPZA 1L9WA 5I3IA 4TIMA 2RDTA 1AW2A 2O7SA 1VRDA 2YX0A 4DPPA 5CSRA 1XBYA 4RXFA 1AW5A 1TPH1 2HMCA 2FTPA 1KV5A 2A5HA 3W76A 2C15A 1K03A 1LLZA 1YLVA 2C0AA 1VHCA 3HBLA 5F4SA 4ONVA 4O12A 3G0SA 5HWJA 3QC3A 5U4NA 4YLWA 5H2ZA 1BWLA 3W23A 2G95A 1WOBA 2P1FA 4X22A 4YMZA 2DU2A 3NQ8A 5K9DA 3W1LA 3TK7A 3G8RA 3EX2A 3BK0A 4I7WA 4OV9A 2J9ZA 4NNBA 1MZHA 4KKXA 1R46A 1JCLA 3C2RA 2EAWA 4DQWA 1QOQA 3IIVA 5U7SA 1H63A 1Q6RA 1ZALA 3TW7A 4JICA 3DFTA 4O15A 1F73A 3G18A 1OFEA 3BO9A 5D2XA 5H91A 1ME8A 4A2RA 3E0IA 3EWWA 2E1DA 2A4AA 3IGUA 3KX6A 3QZEA 3S1VA 3O8AA 4IGHA 3W7LA 3QSRA 1GTEA 4MY1A 5K7JA 1ICSA 2Y85A 3TC7A 1LOQA 2A7PA 3NPWA 1I2PA 2DZUA 4S2BA 1W5QA 4BI7A 2V2CA 5DCDA 3T78A 4OHQA 1LRNA 3PVFA 4N2YA 2TSYA 4XWUA 4DO4A 2PRHA 3TIMA 3OVQA 4N02A 3TDFA 5D2TA 1GPWA 1OK4A 3RLUA 3PB0A 3W6YA 4Y6GA 2TRSA 1OFRA 4GUJA 1LM1A 1THFD 4O4WA 1KFLA 1YADA 3G3MA 3TXVA 3L68A 3FKKA 1OF6A 1YTDA 4DBDA 2BWGA 3LHYA 5ABTA 4O4VA 3ZWSA 3LTYA 1H1YA 3LV5A 5SWUA 4JTEA 1WDWA 5FEPA 4L4MA 1RD5A 1DOSA 5CZ0A 3PBWA 1OF8A 3KVLA 4B5NA 2H90A 4IMGA 3MI2A 3TW6A 1SPQA 2CWNA 2QUVA 5TBOA 1TJRA 2VC6A 1OFPA 1OYBA 2CZDA 4PL2A 2ATMA 4IX0A 4CCEA 1FCUA 3FEMA 3NO5A 3SY5A 2Y88A 2OX1A 5F1VA 2WNQA 5HQEA 3UWVA 3I7SA 5CSSA 2BSLA 1O5XA 2CZ5A 2WKJA 2OT1A 3B06A 5D37A 1OFBA 2E77A 4JS3A 1VZWA 1IIGA 3G0XA 3B8DA 1FY6A 3WK1A 1FBAA 3N19B 4AWSA 3LV6A 2Y7DA 1SR9A 3M6YA 1UUOA 1Z48A 2YPIA 5T26A 4GUHA 1TTPA 2NX3A 1Z44A 3B04A 2VXNA 5DY2A 3W86A 1SFLA 3NQEA 3SZ8A 3P8JA 3MUXA 2EGZA 2CLEA 2PURA 1SSDA 1JVNA 3FJLA 3EXTA 1KM1A 4MKNA 2GVJA 3DHFA 1OX4A 5DBUA 1MEIA 3U6WA 1G7UA 4HNNA 5CZJA 3EX3A 4GFSA 3LX9A 3W1UA 3NM1A 4R53A 5AHIA 1UASA 4PL1A 3HB9A 2ZRWA 5EY5A 2ZZ5A 4IWWA 1PVNA 4FEZA 1QDSA 4TX9A 3W7QA 5TIMA 2OMAA 4O1DA 3VFLA 5KINA 3IV3A 3WK3A 3MI3A 1LP6A 2VKZG 4LVBA 3W1MA 2NWSA 3ATYA 6ALDA 3V1PA 4UTMA 3DXIA 3HG4A 1R30A 4FXSA 4A21A 1XDLA 1DHPA 4RV8A 3P84A 3NG3A 4JTJA 2ZBTA 3R12A 2QCDB 4RXGA 2NXIA 3MBDA 2DJLA 2NUWA 2ISWA 2VFIA 2ZTKA 3JS3A 3PR2A 1X8FA 3W2MA 4WOZA 3BLIA 4JTHA 1ICQA 3NQCA 4OU1A 5AC8A 3M9YA 1TCDA 4LTSA 2QEZA 2E6DA 6TIMA 3QQ1A 5D38A 5AC6A 5I3FA 4FX8A 4ADSA 1QCWA 1ZENA 5D33A 5F2GA 2W6RA 3C2VA 2A7RA 1W54A 2ZRYA 3ZR4A 4WUIA 3M47A 1H60A 1DVJA 3PSVA 1V5XA 4MOZA 4LT9A 4UXDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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