3W1NA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-iodoorotate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-iodoorotate
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1nA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1nA01
4CCCA 1K8XA 5F4WA 3EWYA 3P61A 3PBVA 5C5YA 1DORA 3G8EA 4WY0F 4N6FA 5AHEA 1R47A 3MHUA 1GTEA 4XKYB 4PA8A 3TDFA 3ZWTA 3W2MA 4GUGA 4ALDA 2GQAA 4ZMGA 2CLLA 1TPC1 5K7JA 1VC4A 1SUXA 4K8EA 3C4UA 1TV7A 3OVPA 5IM51 3S0CA 1H7WA 1GVFA 1TYGA 1JVNA 2ABBA 2FFCA 2OZ0A 3WJZA 5F2LA 1SR9A 2BXVA 1CX9A 4U28A 4K38A 3E0IA 2NUWA 4WXZA 6ALDA 3UWUA 1DVJA 3R89A 4Z1BA 4WXYA 2VOMA 2HMCA 4QNEA 4PL1A 3QC3A 5AC8A 5L9FA 5D38A 5KZDA 3HQ1A 3HPSA 2YCEA 3LV6A 2J9ZA 3WK1A 2YGYA 3FKRA 5LGZA 3W74A 1LBFA 4PFMA 2VEIA 4MKNA 1KFCA 2X1SA 2YPIA 4LNYA 3O8AA 1ZHAA 4UC5A 3ANYA 2V81A 2BTMA 3L5LA 4UFJA 2WOQA 1FCVA 3NQ6A 3CB8A 4UFIA 3CWNA 3O6DA 3KRSA 1T0OA 3N2MA 1EUNA 1WBHA 2VC6A 1YPIA 2OCZA 3LX9A 4M7SA 1DHPA 3L5MA 4CQAA 3NEVA 3NNTA 3EWUA 3KOFA 5AHFA 3C2FA 1O5XA 1AL7A 1KBJA 3STCA 1HO4A 3DFQA 4ZQPA 4ADTA 3LV5A 2ZRUA 1H7NA 3GR7A 2Z2UA 1PCWA 5CGQA 5CKSA 3P8IA 1ME7A 3HBLA 1TJPA 3T7VA 1MEHA 4AMAA 3SW6A 1LBLA 4GFSA 5FF7A 1PHWA 4GUIA 3MI6A 2E6DA 3GIYA 3CLMA 4A3UA 1HG3A 3W1NA 2WSQA 3ABSA 4AHQA 3P81A 4DO4A 3S5ZA 1KBIA 4LOCA 3OHIA 1XBZA 1W56A 3NO5A 4NJIA 1FDJA 1DKWA 4ORMA 2JBMA 1M6JA 5D09A 1EWEA 3MI3A 4JICA 2C19A 4N6EA 2QCNA 4IX0A 2ATSA 2XN1A 4I7UA 4J9JA 2DZTA 1IXNA 3BW3A 4DXVA 1MEIA 3JS3A 4K7YA 1TPVA 4Z0JA 3TAKA 4HNUA 1SPQA 4WUIA 1IF2A 4O54A 1MZHA 1LZOA 3UY7A 1F76A 4JY8A 1KM2A 3B0VC 3BGGA 1F2JA 1GVRA 3M43A 1KV8A 3C3NA 5LNWA 5D2WA 3VE9A 4UR7A 5D2TA 3TFXA 1LRQA 1EA0A 5D2VA 2A6NA 4AWUA 5I3GA 1U83A 1YDVA 3P60A 2YW4A 3UPWA 4NU7A 2QJIA 3S5YA 4LWWA 3C2EA 3H53A 4JTKA 3TIMA 4LY8A 4TR9A 3DHFA 1RPXA 1JCNA 3HG4A 1TPDA 3OG3A 3S1VA 5EKYA 2CLIA 3W2KA 3A9IA 3W70A 3LTYA 2ISVA 3TNOA 2A6LA 3OIXA 3GB6A 3WJYA 2Q3OA 3QMRA 3EB2A 3W7JA 2O7SA 1XBXA 3S8HA 3BO9A 4HSOA 3F4NA 2Y70A 2YFOA 3W7KA 3EKLA 4MZYA 3PR2A 2B4GA 4WX2A 3NOEA 4L4LA 3EWZA 3FYOA 3P74A 2FPVA 4XTIA 2ZZ1A 1TREA 1TPFA 2V82A 3TH6A 1XXXA 4MPQA 3KVKA 4RZ6A 2ATMA 3THAA 2EKCA 3C52A 3OVRA 5LHEA 3BG3A 3PUDA 3BVJA 2I1OA 3EX6A 1VQTA 3KRZA 1F5ZA 1P1XA 3TC7A 3TKFA 1W0MA 2GJLA 2FB2A 4OT7A 5DELA 4UIOA 1EP1A 3E12A 3UNDA 2YSWA 3L9CA 1XUZA 3P5YA 3W1QA 4XTDA 1MSSA 1S3HA 2WNNA 1VCVA 1XUUA 3W7HA 2RFGA 3NR0A 3PG8A 3CEPA 4X2RA 1K02A 1W3TA 4FX6M 5F2GA 4KFOA 3NZ1A 2KZHA 1ZJIA 3M5YA 3TA6A 4UTLA 3GDTA 2NLIA 3FA5A 1I2QA 1Q3NA 1OFQA 4OWGA 1A5SA 5H2ZA 3M6YA 1P5BA 5I3HA 3QH2A 4PC8A 3HOJA 3DI1A 3GZ3A 2Z6IA 4FNQA 1H7PA 3M1ZA 4LS2A 3QM3A 4HN4A 8TIMA 4RLIA 2R94A 4UTIA 1OHLA 3IVUA 2NUXA 3UQNA 5CZ0A 3UWWA 2X1UA 2GJNA 3KHJA 4HNTA 4NX0A 2V30A 3SY5A 3EXSA 1LOQA 3FLUA 1LP6A 3W7LA 4D2JA 1ICSA 3C2OA 4LW7A 2QEZA 3SECA 5G5IA 4LV9A 5CZJA 3UWZA 1ZCOA 4FIQA 1H63A 3TROA 4N4PA 3NQ8A 3W86A 4Z1DA 3U2OA 2R8WA 3BG9A 5D30A 2Z0IA 3EXTA 4QQ3A 3PUOA 3Q58A 4MLJA 2G95A 4ZQOA 1G67A 3MYOA 1B4EA 3H55A 5K9XA 1L6SA 3PB0A 4YWIA 1F6KA 1QWGA 5F4XA 3LHWA 2ZYFA 1FCQA 3W22A 3G1XA 1OX4A 1RV8A 4O1AA 3HPXA 1TPWA 4JXCA 3SIZA 3M47A 2HSAA 3LLDA 4JYFA 2OMAA 3LLFA 3D0CA 1W5MA 1LBMA 1YDNA 2Y7DA 5C55A 3GVGA 1XCFA 1SO5A 2DZPA 1UB3A 2CZ5A 1OX6A 1IXQA 2GUUA 3EEGA 4WY0B 5H91A 2WNZA 4LS0A 3CU2A 4DBEA 4LRSA 1YLVA 2TRSA 3DXIA 3EWBX 1G4EA 1LM1A 1X6UA 3HIJA 1L2UA 1YTEA 3LHUA 2ZZ6A 3QQ0A 3PBWA 4JX6A 2ZQ0A 3TV8A 3W1LA 4ML9A 2EAWA 2ZA1A 1TPH1 2YX0A 4BWLC 1T8XA 2QJGA 2J27A 1XL9A 4O11A 4C1LA 3LTPA 1JCJA 3IIXA 4G1KA 3W7RA 4O0ZA 4ADSA 1H50A 1LRTA 1GG0A 2WO5A 5D32A 4FNUA 3BGJA 2A4AA 1TTJA 4M6VA 4R53A 3T40A 5I3IA 3S1WA 1GYNA 4BWLA 1RQHA 4Y6GA 3DU0A 2NXGA 5D37A 3JR2A 4JTTA 4UNKA 3TSDA 2JGYA 3NM1A 3UD6A 1H7XA 1Q45A 4MJZA 2X1RA 4WOZA 3SGZA 1D3HA 2V2DA 3T78A 3MUXA 1WX0A 4LU0A 3R12A 3LXAA 3L2IA 1TV5A 4QM1A 4LC6A 3QF0A 1HO1A 1JUBA 4Y90A 1EWDA 4IOTA 1FQ0A 5KTLA 4KFNA 4X22A 1D9EA 3KXQA 2Y88A 1KTNA 2YYUA 2Y62A 5AN7A 3RLVA 3I7SA 3DZ1A 1VHCA 2QCGA 2BZNA 1W3IA 5FEPA 2LLEA 2ZTKA 4MLRA 3I7RA 2IQTA 3ABRA 3NPXA 4XUGA 3TK7A 1P0KA 1FBAA 4JX5A 2OT0A 2AAMA 1WBJA 5F2MA 1OG0A 3WK0A 4CQ9A 1FWNA 3O07A 2H6RA 3G24A 3NQ7A 3IEBA 2Y7EA 3TC6A 2GPTA 3E96A 3C56A 3S1UA 5AOUA 3PS7A 1H51A 5HULA 2VELA 4K8HA 4AHPA 1LTDA 1IIGA 3P62A 1RVGA 1Y0EA 3LHYA 4MZ8A 4JTIA 2EF9A 2QR6A 4LVFA 3QJAA 1I2NA 3LI1A 4UTJA 3W83A 5BRBA 4I7WA 3G22A 1XBVA 4UFHA 5AC6A 1UUOA 4HNNA 1FCUA 2X1TA 5E1QA 2WV8A 3W07A 2VEKA 3O63A 1YADA 2JK2A 4JTSA 1VGAA 1VYRA 1Z41A 4WD0A 3OVQA 3TSMA 5AHMA 3BLIA 1A5BA 1KLYA 2GVJA 3UZJA 4E2BA 3DKJA 1TTIA 1WA3A 1ADOA 2DZSA 3W1AA 3MBDA 1PL9A 5HWMA 1R2RA 4Q33A 1KFKA 3NA8A 1ZALA 3P82A 4LTSA 3W88A 3DFSA 1VPXA 3PVFA 3TQ0A 5DBTA 3A23A 4FHAA 4HHPA 1W5OA 4PL2A 3BARA 4S1FA 4BF9A 4GWEA 4N9BA 3RK8A 1GQNA 4FF7A 2QCCA 3S9YA 3C0JA 3SI9A 2FLIA 2Y85A 3TX9A 2E6AA 2WKJA 3PY2A 1QNVA 1EB3A 3BPWA 5D05A 4XBKA 1F05A 2ALDA 3CEUA 3FOKA 4ONVA 1OFAA 1TSIA 3I6RA 5FEXA 2R91A 1O60A 4HSNA 1JUKA 1OFEA 2CLFA 4IWWA 3TE9A 3PUEA 3NQMA 1KA9F 3KFTA 1Q6OA 1RQBA 4AEOA 2A7RA 2V8ZA 4TMBA 3VE7A 1NF7A 2DZWA 3R8RA 4A2RA 2NX3A 1EEPA 4IMGA 4JTEA 1G4SA 4IQLA 4JYDA 2XFWA 2Z6JA 4RZ4A 3TW6A 4NNCA 4YXGA 3PWAA 4KKXA 4O1BA 3CT7A 1W3NA 1H5YA 4UTWC 2G96A 3IIVA 3RNDA 3NG3A 4QNWA 4I9AA 2C3ZA 4LV4A 1SFLA 1SO3A 3SZ8A 4O0KA 4AXKA 3UPBA 4UTWA 3PG9A 1W54A 1SQ7A 2PCQA 2C6QA 1YDOA 2QCDA 3TR2A 1X1ZA 4JTHA 1L6WA 1H1YA 4MYAA 4RK8A 3W9ZA 2VEMA 2C16A 5LGXA 1P4CA 3LB0A 4JY9A 5FI8A 4UMBA 1AG1O 4NUWA 2A7PA 2JKAA 3CHVA 1W5NA 1ME8A 4ZQCA 4FIRA 3ZFHA 4LUJA 3M9YA 3HO8A 4JGDA 2VKZG 1OK6A 2Y89A 3ELFA 1KM4A 1QPNA 4K7VA 3C6CA 2OJPA 4S2CA 3O06A 2GQ8A 5DY2A 2YR1A 5F4SA 1C9DA 1PS9A 3CQ0A 4RJEA 3R2GA 2RHGA 4K37A 4ORIA 3FJ6A 3L5AA 3MJYA 4NZFA 5EPDA 1TMHA 1FUYA 3DBPA 1XC4A 4O4VA 4AF0B 2FJKA 3W7DA 1SZFA 4JYEA 2PE4A 1WOBA 3OBKA 4AWTA 1ZFJA 3UWVA 3PB2A 2HTMA 4FXSA 2OT1A 3QMTA 1BKSA 3QPYA 4AVFA 3B05A 3KAOA 1H61A 3N14A 4RR4A 2EHHA 2ZA3A 3LHZA 4PCFA 5CZSA 1P0NA 4A22A 1O94A 2AGKA 3GXPA 4DF2A 3QQ1A 3NPVA 5E0KA 1YPFA 3G18A 5ABTA 2QCHA 2C1HA 4YMZA 3W2NA 2CLEA 4JTLA 3MP5A 3NQEA 1KTCA 3NM3A 4M6PA 1N7KA 2B7PA 1G4PA 1RQEA 2V0TA 5AYXA 2QCFA 4RCXA 2ZZ7A 3INPA 4K39A 3C61A 1LOLA 1VLWA 5TQLA 4JN6A 3IVSA 3I68A 3MWAA 3DFOA 5CZTA 1W1ZA 3LCXA 1BWKA 3B03A 3RFAA 2ISSA 3HF3A 3GXTA 5AB3A 1I45A 1VHNA 1JCMP 1K8ZA 2A5HA 2DP3A 5AHIA 3G3DA 3LBMA 2WJZA 5CPNA 4N9DA 4E2DA 5F1UA 3UWQA 3P84A 4ZL1A 5TBOA 3UYCA 3PAJA 1OYCA 1HUVA 4R34A 3S6DA 3PULA 1R30A 5HR7A 3E9AA 5FESA 4K6AA 4O4WA 2ZZ4A 1QOQA 4LUIA 5AC7A 2FDSA 4NZJA 1CI1A 3R5EA 1Q6RA 4IXXA 5A5WA 1LDCA 3HB9A 4LVAA 2CFFA 2NX1A 4KFPA 1KM5A 4MFDA 2VFEA 5L6UA 3M5VA 4WJEA 5HR6A 1R2SA 3G1VA 5J5DA 2H3DA 1I4NA 4HNVA 4KWVA 4CNNA 1LROA 4P61A 3W1PA 2B7NA 3L65A 4UCGA 3VI2A 2WNQA 4TU1A 4E0CA 2ZCGA 4M19A 1K03A 1NEYA 3CC1A 4ADUA 3TFCA 4IJBA 4FNPA 3TQVA 3KRUA 3LCHA 1VYSX 1XFBA 1G7UA 3NVTA 1TTPA 2CZEA 2GVLA 3TJXA 2PRHA 1JQVA 5KINA 4XZ9A 5D02A 5LZLA 4GC4A 1D3GA 1ICPA 3W7QA 4Q4KA 3A5FA 3NQCA 2NZLA 3CM4A 2PRLA 5HWJA 4XKYA 1IXPA 2Y61A 1OFRA 2B7QA 3W7EA 3G3MA 4O8RA 1R46A 2CZFA 2RDWA 1W5QA 1PCKA 2ZRZA 2J9YA 4QITA 1FWSA 3LOTA 4HT3A 3G1YA 2QDHA 1TJRA 3EKZA 2QUVA 1M7PA 1DQXA 5G2HA 4UFMA 2PURA 3W7NA 2BWGA 4OV4A 3EX3A 1C8VA 1ME9A 3G0XA 2O7QA 1WAUA 1RR2A 3FJLA 1WV2A 5CSSA 2E6YA 1WXJA 1ZY9A 3GX9A 3C2RA 3LCWA 2VEPA 4BI6A 1VCGA 3W2UA 5LNUA 5F2IA 2C15A 1C29A 1SW3A 3N3MA 3LCGA 2F7FA 1NF0A 4O1CA 4H3DA 1JCLA 3W1MA 4LRTA 1S5WA 3IGSA 4GJ1A 1I2PA 3G1AA 5EY5A 1X1OA 2QKFA 4UMCA 3G1DA 3GNDA 1VS1A 1GPWA 3Q2DA 1SZNA 4NT0A 5DLCA 4IMFA 1DV7A 3W23A 6TIMA 3L66A 1V5XA 1DQWA 4WOQA 1L9WA 3PSVA 1YTDA 1R2TA 5C2XA 4RXGA 3SGUA 5CSRA 4MY8A 3HGRA 4O15A 2DZUA 1NSJA 3DFTA 3W7PA 3TQKA 1FCBA 2RKXA 3PBUA 3DKLA 1OFPA 3M0ZA 4RX0A 4A2SA 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