3W1U | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-111 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w1uA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w1uA01

2ZCGA 4UC5A 1GG0A 3HQ1A 3LRMA 4BI6A 1JVNA 4GRSA 1K03A 3L5AA 3PSWA 3FKKA 1V5XA 3NAVA 5LNSA 4W9TA 3MBDA 4EVZA 1RVGA 5LHEA 1LZOA 4I9AA 1LRQA 5DCBA 4M19A 3CEPA 1TTIA 3M43A 2VC6A 4Y9AA 2CWNA 1PV8A 2OX1A 4NJGA 4LRTA 4NQ1A 3TXZA 2TYSA 1LBFA 1ZAHA 4YMZA 1VHCA 1OF6A 3MJYA 2EHHA 3NZ1A 3WK2A 1HTIA 2QDHA 3SECA 1DHPA 2NV1A 3R8RA 3L5MA 1KV8A 3HPXA 4LVDA 5FESA 5K4XA 3NVTA 2X1UA 3B4UA 3DFPA 1OABA 1ALDA 3QMSA 4XQ6A 4DF0A 3TAOA 4CQ8A 3W2NA 4XBKA 4UTHA 2CZEA 4R53A 4UFHA 3C52A 3DAQA 3WK0A 5EA9A 3PULA 3SY5A 2DP3A 1Z44A 4A2RA 5D30A 5DLCA 3SGZA 1W0MA 3NL5A 2B7QA 2QCLA 1IIHA 3W1MA 5F1UA 4HPJA 2ZA2A 5D05A 1VHNA 2AGKA 1I2QA 1LLZA 2OZ0A 3HPSA 3O6YX 2CLMA 1OX4B 4R33A 3UXAA 2E6DA 1SR9A 4LOCA 3CPRA 3HPZA 1ZCOA 3KVMA 3S0CA 3W7HA 4GFSA 5TBOA 1RQEA 4GUFA 4O10A 2ZRZA 2P1FA 4MZYA 3TAKA 3IGSA 5D03A 5BMXA 1THFD 1TPDA 3H53A 4KFOA 1TREA 3PB2A 1ICQA 5DCEA 2DU2A 2QCCA 3G3DA 1KM6A 3SFKA 2RHGA 4HN4A 3G0UA 3HOJA 2BX7A 4K38A 1IXQA 3LXBA 4RXGA 3VE9A 2A6LA 3STCA 2YZRA 1JQXA 2V2HA 4O53A 1FDJA 1U5JA 1I8JA 1LRTA 3W7OA 2ZTKA 2WOQA 5I3KA 1QCWA 3ZFHA 3NQCA 1XBZA 1N7KA 2ISWA 1ZENA 4ORMA 5FEPA 3KVKA 5F2IA 4DO6A 2HMCA 1W3NA 3LCXA 3W70A 3LLDA 3O15A 1H7OA 1EWEA 3LV5A 3MYOA 1QDSA 1K7FA 4IXHA 1C8VA 3NPUA 2C1HA 3NL2A 2Y88A 4H6KA 4JYFA 3OVPA 3M41A 1E51A 3GIYA 3M5ZA 2C6QA 3RF9A 1WQ5A 4AXKA 3GKFA 1TO3A 5U7SA 1TRDA 4LY8A 3JS3A 3GYEA 5BNKA 5E93A 1ZHAA 5G2WA 3W7LA 3GDMA 1LYXA 3IIZA 4BK9A 4AMAA 4ZZ9A 1M7PA 2VFEA 3M47A 1F05A 4IMFA 4O54A 4WD0A 4NUWA 3C0JA 4UFKA 5KTLA 1M7OA 1XUUA 3OHIA 2HSAA 2CLOA 4HPXA 2V0TA 5I3FA 3NXFA 4GXMA 1XFBA 3O63A 1VCVA 5G2IA 3HG5A 1SW7A 2A1YA 4O11A 2OCZA 5LNWA 3LCHA 3UWYA 1YTDA 1UUMA 4JTTA 2BXVA 3B05A 3LDVA 4TMCA 3W1RA 4A2SA 1FWWA 4OGZA 1EPXA 5C55A 3PF3A 4L4MA 1XBXA 1A5AA 3YPIA 1FDYA 1W1ZA 3DZ1A 4LT9A 5GVJA 4NX5A 3NEVA 2I9EA 1YYAA 1LBLA 2E6FA 1QWGA 5CG7A 4UTMA 3M6YA 1SUXA 4BR1A 2GOUA 4N02A 1SO5A 1B9BA 3W1AA 2CFFA 2QEZA 3C2EA 4RV8A 1OFAA 3OEXA 1H63A 3QF0A 4UTWC 1JCLA 2JK2A 1GYNA 4JX5A 1SFJA 3U8GA 3M5XA 1Z48A 5D02A 4LVGA 1I2RA 2WPBA 4N4PA 5D2WA 4HNNA 3SSJA 5LKYA 4MIMA 3GR8A 3S1XA 1W5NA 4O1AA 2C16A 1GVRA 1XI3A 4JTLA 3HG3A 4QSHA 1BWKA 1Q3NA 2QCMA 3EWBX 3O06A 4TR9A 6TIMA 1JRCA 5EYWA 3PUOA 3C3NA 2J24A 3CU2A 3PG9A 1RPXA 2FPVA 4NXSA 1OX6A 1Q6LA 1FWRA 3ATYA 2VFHA 4NXKA 1GZGA 4QIUA 1OFRA 5AOUA 3LBMA 1TRIA 1EIXA 2X1SA 2WKJA 4Y96A 5D32A 1LM1A 3L0GA 3M16A 3W2UA 3QPYA 1EP3A 3EX1A 1IF2A 3NA8A 3W1UA 4ONVA 5D37A 5KSWA 4FO4A 4H4IA 3QZEA 3B06A 4PL2A 3H54A 4HHPA 3W2MA 1LDCA 4UFIA 1YXCA 1W5OA 1F2JA 3W7GA 1F5ZA 3SIZA 3PBUA 3QW4B 3CEUA 3P8JA 1TMHA 1DBTA 3LERA 1SZFA 2JKAA 3QQ1A 4IXXA 4JS3A 3OIXA 3WJWA 4FB7A 2ZRVA 4FNUA 5E0KA 1LRNA 2DZWA 4DPQA 4ZQPA 5HUOA 3W1XA 4AB4A 5BRBA 3GZ3A 3DFQA 4AHQA 2X1RA 3N9SA 1K8YA 3HG2A 1H51A 1RZMA 3MP4A 4GC4A 3TMQA 4RZ6A 1P4CA 4CCEA 3W76A 3CIWA 3UWZA 1JUEA 3TJLA 3C2VA 4JTHA 5FI8A 4YWIA 3NGJA 3NR0A 3PM6A 4HT3A 3S1UA 4O18A 3IGXA 4Z08A 3QSTA 3DKJA 4QJ1A 3FYPA 3C6CA 3W7NA 3G22A 3E96A 3UZJA 2EKCA 4N4QA 4GUIA 1AW1A 3UQNA 2X2GA 2YFOA 2DZVA 3MUXA 4RXFA 3W73A 1H7PA 2GPTA 3N2MA 4AHOA 1UBSA 1QOQA 2WNQA 2WSQA 3GVGA 4XKYB 4OWGA 4DBDA 3TSDA 5K9CA 3LCWA 1JCJA 2NWRA 1OX4A 3STGA 3HJZA 3LHVA 5EL1A 1K3UA 2C19A 1OFQA 4A22A 1FXPA 3G1FA 1EB3A 4Y6GA 4MY9A 4UIOA 5HR7A 4FIQA 3VE7A 3M7WA 3W75A 1H1YA 3TKFA 3PBYA 2R14A 3ABSA 1OYCA 1H7RA 3O16A 2QCDB 4P61A 3T55A 3IVUA 3SR7A 3P7YA 4LVAA 1WXJA 2A7NA 1SO6A 1SU5A 3GAKA 4LU0A 3V75A 2GJNA 4LNYA 3IIPA 2QJGA 5DXXA 2P0OA 4K37A 1TCDA 1TJPA 1TPFA 2PCQA 2Y89A 3Q94A 1JCXA 5FF4A 4UTTC 1KFEA 3L21A 2LLEA 3W1QA 2ZRWA 2QCEA 3W22A 3BG3A 3EWXA 4JGDA 2BLEA 3G1DA 4UTWA 1A5SA 2ALDA 1NF0A 3EEGA 4QITA 3OVRA 1MEHA 4R34A 5DBUA 4M5PA 4POCA 4NNCA 2C18A 1QO2A 4TMBA 1FQ0A 1PS9A 2J9YA 5AHIA 5AYXA 2CLLA 4JY8A 3TH6A 3ELFA 4UMCA 1N55A 4O15A 1NF7A 4JTJA 4Z0SA 4AF0B 3W7QA 3W7EA 1G4PA 3LXAA 4CQAA 3W2JA 3HGSA 3A24A 5FEXA 4DPPA 4ZQMA 3UPBA 1GT8A 1DV7A 4UTUA 3S5NA 4FX6M 1RQBA 2YW4A 3N14A 4GBUA 1FX6A 1OG0A 3PBWA 3TJXA 1PHQA 3ABRA 2Q3OA 3LGEA 1F6KA 4S2BA 3H55A 3OG3A 4X2RA 1NSJA 1QOPA 4TIMA 4HIBA 5HINA 5I3JA 1MZHA 3BVJA 4Y90A 1MO0A 1ICPA 3RMJA 3T44A 3THAA 4CCDA 4KKXA 2OMAA 4Z0JA 2V81A 4MZ8A 2V82A 3P81A 2B7OA 3IVTA 3BW4A 1FY6A 2ZZ4A 1P0NA 3LCLA 2CU0A 3G8EA 3T7VA 4N6FA 1YDNA 2FLIA 4DQWA 5U4NA 3BO9A 3CLMA 1QAPA 1VCFA 2VFDA 2QJIA 1JR1A 1KM5A 3HMJG 1H50A 3A5FA 2ZRUA 3B03A 3VKJA 2DZPA 3N73A 5AHFA 3W9ZA 2TMDA 4CNNA 2A0NA 2B7NA 2DZXA 1VCGA 2ZA1A 3RU6A 1F7BA 3USBA 3NQMA 1FDZA 3TNOA 2E5BA 1PCKA 2UV8G 1OX5A 3I7SA 2YDAA 5D2VA 5HJLA 3S5YA 3IIXA 5FF7A 3ATZA 1KM1A 3G3MA 3G8RA 1XC4A 1FCUA 2VFGA 4LC6A 3BG9A 1OF8A 1VYRA 1W5MA 3S5OA 1B57A 1VS1A 3DH7A 2Y7DA 3QSRA 3W84A 4AAJA 2CLEA 1JQVA 1WV2A 1SZEA 3N9RA 3LHUA 2Q8LA 3G1HA 3C8FA 4XZ9A 4S1FA 4AHPA 2NX3A 3P84A 2H8XA 5HULA 3ZR4A 1A5CA 1QPNA 3GDRA 3RK8A 3LTYA 3ZS4A 1KBJA 1H61A 2GQ9A 2HS8A 4LUJA 4QM1A 1OFPA 1VYPX 3S9YA 1A5BA 1OFEA 4X3ZA 3IV3A 2QAFA 4L4LA 4K7YA 3QM3A 2TSYA 3G1YA 3NPVA 4XWUA 1FCBA 5AHLA 1RR2A 2EPHA 3U2OA 3LHYA 3G0SA 1IXOA 1GVSA 3PG8A 3L5LA 1GVFA 1D3GA 3NPXA 3MW7A 2ZZ6A 2ZZ1A 2ABAA 3INPA 1GPWA 2A2IA 4RLIA 5C2XA 4O16A 3O07A 4Y8FA 1QNVA 4YL2A 3NYZA 3MI2A 1PIIA 3UNDA 2ZDRA 4Q32A 5LGXA 2VEIA 3N3MA 2RKXA 2A6NA 4NT0A 1H62A 4UTTA 1CW2A 4UTLA 3W7PA 3W74A 1L2UA 2VFIA 2J6XA 4O4VA 1QPQA 2J88A 2JBMA 4ZVJA 3TQVA 2Y63A 2A85A 3BPWA 2ZQ0A 3N19B 1TTQA 2W0UA 4O19A 2I1OA 3FKRA 3BGGA 2NX1A 3C4UA 4MYXA 1DL3A 3P74A 4LS2A 3EXRA 1WOBA 4M6VA 1K02A 2QUVA 3IGUA 1M5WA 4LW7A 3E12A 4NX0A 3I7RA 3TW7A 2Y7EA 4MLRA 1VJIA 2ZZ2A 4KWWA 2WSRA 3UY7A 3ZWSA 3EXTA 4MUZA 3ZWTA 4X22A 1IGSA 3HF3A 3G18A 4GE8A 1XDLA 5K9XA 4DF2A 3EX2A 2RH9A 1TPC1 3PB0A 4O0ZA 3SJ3A 4RZ4A 2Y70A 3WK3A 2QJHA 4JTGA 2W79A 4KFNA 2DZTA 2X30A 4CNPA 4TU1A 2CLIA 3O05A 4GJ1A 4EIVA 3CIXA 1X8FA 4HNVA 3KHJA 5LNUA 3B0VC 4M6QA 3EWYA 1TPUA 1HUVA 1KM0A 3TIMA 4CQ9A 5F1VA 3NL6A 2Z2UA 1W5QA 1JULA 4DO5A 1AG1O 4FNTA 2C3ZA 2R8WA 2A5HA 5FF0A 3IIOA 3PUEA 1NVMA 4FX7A 1QR7A 1W3IA 3NQ7A 3QPZA 4GUJA 5FEZA 1GVOA 3FOKA 2OT0A 1G7UA 1P0KA 2J27A 2NLIA 4I7VA 4WXZA 2GQAA 3TC7A 4EF8A 1JJKA 3GDLA 3S6DA 4BI7A 4OV4A 2TRSA 2B4GA 4FF7A 4GUHA 3BGJA 1W8SA 2WNNA 1TPB1 1DKWA 3NOEA 4O12A 1QFEA 3W1NA 5EY5A 3LRKA 2QCDA 2R94A 1O5XA 2CLHA 3UWWA 4E2DA 4RZ5A 3T4CA 3TQ0A 2EF9A 2GJLA 1YDOA 1KFKA 2NXIA 2ATSA 1R47A 5BMWA 2Y62A 4YCOA 4JEQA 2EGZA 1XUZA 2Y61A 3LX9A 1Z42A 1OFBA 1WAUA 2PRHA 5K3VA 3GDKA 1XXXA 3AO0A 3FIGA 2HTMA 4JX4A 8TIMA 2NWSA 3QQ0A 2B0MA 4IMEA 3NQFA 4A21A 2G97A 1IIGA 3DFTA 3LI0A 4IUOA 3NPWA 3WJZA 1F76A 3QYQA 4TX9A 5G4EA 5LGZA 5AC8A 3O8AA 2ATMA 5G1YA 4NVTA 4N9EA 2CZFA 3O6CA 4ZMGA 3HBLA 3NM3A 3HG4A 3RFAA 1OFOA 2TPSA 3R5EA 3W72A 2C0AA 3U6WA 4WQ6A 2YPIA 1T96A 1WDWA 1TJRA 1LP6A 3M9YA 5FF3A 5CZTA 1W54A 4JIPA 5H91A 1TB3A 3MBFA 1ME8A 3A5VA 3GXNA 5F2MA 4AF0A 2NX9A 4NU7A 3IRDA 4QNWA 3BW3A 2E6YA 4KWVA 1YPIA 3HGJA 4JN6A 1T99A 3HB9A 3DFSA 3W23A 1TPEA 3FA5A 4FEZA 3TE9A 2XN0A 1BWLA 5KMYA 1TV8A 3Q58A 3SZ8A 3GNNA 2E5DA 1H60A 1F6PA 5CZJA 4BF9A 3KOFA 3W6YA 4K39A 4PA8A 3P82A 3DHDA 5G4WA 3HGRA 3RNDA 3W7DA 1MXSA 1G4EA 3W1PA 2E5CA 4IJBA 4IX0A 4UTKA 3NQVA 1TIMA 1W5PA 4MJMA 1R30A 1X1OA 3EB2A 1VC4A 3W7RA 2JGQA 4MOZA 3FS2A 3N2XA 1LOQA 3KX6A 4MJZA 4NZFA 5F2LA 4IX2A 3TSBA 4K36A 1GTHA 1T0OA 1GEQA 3UD6A 3F1QA 1O94A 1VLWA 1GJPA 4RX0A 1EEPA 2DORA 1RV8A 2E09A 1EUAA 1PVNA 4WJEA 3UPWA 4ALDA 1HG3A 4HSNA 2CW6A 4JIQA 2O7QA 3EKZA 1H5YA 4Z1AA 1X7FA 1K7XA 1AK5A 5EKYA 5L9FA 2WJZA 4Z1BA 2A7PA 4PEKA 3LV6A 2V2DA 4U28A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W1UA

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