3W2KA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-3-165
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-165
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 106
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w2kA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w2kA01
2E6AA 4Z1DA 3BGGA 3BG5A 2GVJA 3NOEA 1WQ5A 4MJZA 3PUDA 3MWAA 1EEPA 4K7YA 1GJPA 3E96A 2QCEA 1KM4A 2FFCA 4UMBA 1JCMP 1S5VA 4MZYA 5ABTA 2H3DA 4H6KA 4KWWA 1A5AA 1K8ZA 4AB4A 1JCYA 5CSRA 3S1VA 3HGSA 1VPXA 4ZQOA 3EX1A 5CZJA 1YDOA 1YDVA 1MO0A 5FI8A 4Q33A 3LCGA 2J24A 3LRKA 3G1VA 2CLKA 3N9RA 3G3DA 4RR4A 4NJGA 4FX8A 1M7OA 3OVRA 1JUEA 3HB9A 6ALDA 3T55A 3GAYA 3GLCA 1GT8A 4OBTA 2EGZA 1R2RA 3N2XA 3GXTA 3NL2A 2GJLA 1UASA 1WXJA 1LM1A 4WXZA 3STCA 1GVOA 4IMGA 1P4CA 1JCXA 3IGSA 4ZQPA 2BTMA 5BNKA 2R14A 1WOAA 1TSIA 2WOQA 3LTSA 5DCEA 3KFTA 5I3GA 4FNPA 2QUTA 2R94A 3NO5A 3NQDA 2JKPA 1I2NA 1NF7A 3L68A 2Y89A 2AGKA 5LHFA 3JRKA 1NVMA 1GZGA 1JRBA 1QAPA 4UFLA 3VNDA 4JTLA 4PC8A 2QCNA 1TV5A 3LB0A 4XQ6A 3LX9A 1Z48A 3LM7A 1FWWA 2A6NA 2I9EA 1J4EA 1QPOA 2V9DA 1TTQA 2P0OA 4GUFA 3TAOA 3S1WA 4UTHA 3W1TA 3LCWA 2VENA 4X2RA 2DZWA 2NUYA 1GYLA 2EAWA 4CCDA 1W5PA 4IX0A 1XDMA 3FLUA 3G1FA 5AFDA 2C14A 2QCMA 3KVLA 4ICNA 5FF3A 1XM3A 1FDYA 1JUKA 1TPEA 3PBYA 4DF1A 3SZ8A 3LCFA 2CLMA 4XBKA 3QPZA 4ZVJA 3KVJA 1YADA 2QJHA 5MHBA 3B03A 3C4UA 3DU0A 4IX2A 5KMYA 4M7TA 3LTYA 3GKFA 5K9CA 2ATMA 2QAPA 5AHNA 3CU2A 1TO3A 3EX6A 3N9SA 1WA3A 3TX9A 3IRDA 2E77A 1I2RA 1TQJA 1LRTA 3MUXA 5AHFA 3DGRA 2VFDA 3H53A 4Z0JA 3C2OA 2VOMA 5IBXA 3TR2A 5I3IA 2WNZA 2A7RA 3TAKA 1FWSA 1KFEA 4A2RA 4DBEA 1VHNA 2OCZA 5AHLA 2DP3A 1AK5A 1TPC1 2FLIA 2X16A 1V5XA 3MYPA 3CT7A 2G5WA 2CLEA 4L4MA 1F05A 5FEXA 3NDOA 5D33A 3KVKA 3BG3A 3WFAA 2D73A 4O50A 3T78A 1O5XA 4R7JA 1YPFA 2QUUA 5F2IA 4MLRA 1VJIA 4PODA 3PSVA 4Z1CA 3W6YA 1J2WA 1P1XA 2B0MA 1OX6A 3G3MA 3GNDA 3LCIA 2JGYA 4DPQA 3UWWA 1G4TA 4AAJA 2V2CA 1S3HA 1LTDA 1XUUA 1RQEA 4XKYB 5F4WA 1HO4A 2ZZ2A 1OK4A 3EWWA 1FXPA 1FBAA 1VLIA 3VE9A 1Q6RA 1VR6A 2HSAA 5C5YA 3FKRA 4K39A 4N9EA 1THFD 2OT1A 3NPUA 2A6LA 4WJEA 4P61A 4OV9A 1AMKA 4FIQA 3GR8A 5D2YA 5SWUA 2B7PA 3WJYA 1NFBA 5HULA 3W1NA 1H7WA 1MSSA 1X1OA 1QPNA 4O19A 5CKSA 2J9ZA 3D0CA 1IXNA 4DF2A 5LGZA 4UFHA 1VYRA 3W7IA 1TRIA 4KFOA 4N6FA 1PCKA 4MY9A 4FXSA 1PHQA 4O10A 1IXOA 3OVQA 3NXFA 4NUWA 4FNTA 3LHYA 4JYDA 4NJIA 2J9YA 2DZUA 2Y70A 4EVZA 4PL1A 3UZJA 5HUPA 1YLVA 3IVSA 5FF4A 2VFHA 4GNJA 1F76A 3QMRA 4OT7A 2X1UA 3H54A 3UWZA 4LS0A 3S8HA 3IVTA 3TA6A 1RD5A 4HNVA 3VE7A 3W88A 2V81A 1EUNA 3HO8A 4N9BA 4ZL1A 1TTJA 1A5SA 1LRQA 4TO8A 4IOTA 4RXGA 1O5KA 1KM2A 3TC6A 5FF2A 3ATYA 3A21A 1OF8A 4TMBA 1TPVA 1OFQA 5K4ZA 4MUZA 1DQWA 1VCVA 1W3IA 5EY5A 4K37A 5U7SA 1VYPX 2PCQA 4WOQA 1KV8A 4AEOA 4CLMA 1T99A 1TMHA 3W7JA 2V5BA 2E5CA 1XL9A 2NX9A 4O15A 4O13A 4Y8FA 4BI5A 4KFPA 3HIJA 2DU2A 4X3ZA 5HNRA 3EWBX 1SU5A 2GQ8A 3S5YA 3IIXA 1H63A 5HR6A 1S5WA 5LZLA 2V82A 1LCOA 4X9SA 1LP6A 1OX5A 3UPBA 2B4GA 2Y63A 1QR7A 3W1RA 3PVFA 4FNSA 3TKFA 3EWXA 5LNVA 2GJNA 4JTUA 3THAA 3EX4A 2NUWA 1D9EA 1DQXA 1KM6A 1DHPA 4BWLA 3P74A 3DKJA 3W2NA 3W2LA 2A5HA 5KZEA 2GUUA 1QPQA 2QKFA 1G4PA 5D2XA 2ZZ1A 1GTHA 4R34A 4LU0A 3DZ1A 1R47A 3L2IA 4JX5A 1OABA 3B0PA 4ORIA 3EKZA 2ATSA 3ABQA 2JKAA 3UZ5A 2ZZ7A 1T96A 3I65A 3SGUA 4N4PA 1SFLA 3LI0A 1H60A 1N55A 2VEPA 3R13A 1H62A 3L0GA 1RPXA 1FCUA 3S0CA 2FPYA 1Q6OA 2Q8LA 2FPTA 4AMAA 3LHVA 4RX0A 3UWQA 2WSRA 3F4WA 4JTKA 1XUZA 3M44A 3S42A 3HPSA 2TPSA 3C2RA 4IMCA 5CPMA 4LVGA 3WJXA 1OFEA 1W5OA 4BI7A 4MKNA 3DFTA 1I2QA 1YTKA 5K9DA 2XN2A 4QM1A 1B9BA 1VZWA 2CLFA 3LGEA 3TQ0A 1B4KA 4RXFA 3SW6A 2A2IA 3LXCA 1NAL1 1X6UA 4UTWA 4RZ5A 4LS1A 3W83A 5FF7A 4RK8A 4WXYA 1KLYA 4HSOA 4JTTA 2WKJA 3VKJA 3TJLA 1X1ZA 2HS6A 3BW2A 5HWNA 2BX7A 1L6WA 3LTPA 4HN4A 1G7UA 2H90A 1SZFA 4UFKA 3HQ1A 3KX6A 1H51A 1H1ZA 2X2GA 3GDKA 4FIRA 1KM5A 1K03A 3IIZA 3RU6A 3PUEA 4LV4A 2QCCA 3PS7A 1YXCA 4P2VA 5DY2A 1FXQA 3GKAA 4JX6A 2CLHA 5D2TA 2X1SA 3O15A 5BMXA 2VELA 1OG0A 2DJLA 2WJZA 4RZ4A 5D05A 3FEMA 4DELA 1B57A 4UNKA 5KSWA 3NM1A 3HPXA 3CPRA 3W2JA 4BWLC 1XKYA 2WNNA 1SZEA 4HPXA 3M0ZA 1CI1A 1B4EA 4K6AA 1ML1A 3QJAA 1Z42A 3KOFA 3G1HA 2KZHA 2FJKA 1EA0A 1QDSA 5G4WA 1EX5A 2YYTA 3A22A 2CZ5A 3HGJA 3ANYA 3HBLA 4JXCA 1GOXA 1NSJA 4K7VA 4Q4KA 4MIMA 3M5VA 3MO7A 3M5YA 4CQAA 1SO3A 3BLFA 2ABAA 3UXDA 1OVDA 3INPA 1UBSA 4BF9A 4O28A 2ABBA 1HL2A 4DXVA 3H55A 3T7VA 1QOPA 1QO5A 2QDHA 4O14A 1LDCA 5DN1A 3W1QA 4LVFA 5BW6A 1BEUA 3JS3A 4K36A 4A3UA 5G4EA 1ZENA 4M6QA 1FX6A 1GVRA 4IXHA 1G7VA 4PA8A 3R5EA 2Y7EA 2GQAA 3LXBA 3NQVA 2G96A 3S5OA 3WK2A 2ZDRA 3W1MA 5TBOA 4UNLA 1OF6A 3GAKA 4UTWC 3W7HA 5D32A 3LHTA 2QJGA 3W1XA 2VFGA 3CC1A 5EYWA 4OV4A 2EHHA 2RHGA 5KZMA 3EKLA 4EIVA 1TPDA 4ZQNA 1KM1A 1UUMA 2QCLA 2DZXA 3P84A 1L9WA 1JR1A 4Z0SA 2W0UA 1KTNA 4Y9AA 5DBTA 3VFLA 4AHPA 1YXYA 4DO5A 3NPXA 5J5RA 5K7JA 1EP3A 4O16A 1UUOA 3W9ZA 4WD0A 5CSSA 4YLWA 4ZZ9A 3HOJA 3NPVA 5D38A 1ZFJA 2ZFAA 3P8JA 3QC3A 5DLCA 2E5DA 2V2DA 4HPJA 4J9JA 3O6CA 4CNOA 5I3FA 3EWUA 1IXQA 5G5IA 2E6DA 5AHEA 4JN6A 3MHFA 4WY0A 4XBSA 3UYCA 4EWND 4ZQCA 1AL7A 3SI9A 4UTTA 1W31A 3S5NA 2GQ9A 3W7NA 1ZALA 1KBJA 3STEA 1TTPA 1GPWA 2RKXA 5G2IA 2BXVA 3NM3A 1C29A 2IQTA 2VC6A 2QDGA 3R2GA 1TTIA 3UPWA 2Z1BA 2Y7GA 5FEPA 1DKWA 1IIGA 2C19A 3EEGA 4JYFA 1I8JA 3S9YA 1ALDA 3NQ6A 1O95A 4YCPA 3W1PA 3QEZA 5G2WA 3I7RA 2LLEA 3N34A 3NQ8A 2PE4A 3LBCA 5LSMA 3ZR4A 3I7SA 1GWJA 4UXDA 1GVQA 4ADTA 5K3VA 3C52A 5AB3A 2NXIA 4LRSA 4LWWA 2AAMA 1U5JA 3ZS4A 3G8RA 4UTMA 1WV2A 3M16A 3MP5A 3C61A 1F73A 4UMCA 5HR7A 1GG1A 2ZQ0A 2C0AA 1ICQA 1G4EA 1WYIA 4RLIA 4O0KA 2ZZ6A 1JCJA 1HG3A 3W71A 4RZ6A 4NJKA 1ZAHA 1H7PA 3DHFA 1ZAJA 2A21A 3G1DA 1H7NA 2JKEA 1W1ZA 4FNUA 4JIQA 3W23A 1L6SA 4PEKA 4GFSA 5D2VA 4LRTA 2H8ZA 1RVGA 2WSQA 3WK0A 2GVLA 4UTJA 5EPDA 2RDTA 4MY1A 3G1AA 1RQHA 3A5FA 1A50A 1XI3A 4YXGA 1FQ0A 1KTCA 2PRHA 2YFOA 4O4VA 5DXXA 1FCVA 1RQBA 1JVNA 1M6JA 2P10A 2NLIA 2YW3A 4N4QA 1TB3A 5TQLA 4JTHA 5LGXA 3VCRA 2Q8ZA 4O52A 2I14A 3CB8A 1SW3A 5E93A 3I6RA 1XCFA 3GXNA 4UTTC 3BW4A 2RH9A 1K8YA 3WK1A 3IVUA 3QPYA 1TPB1 3UD6A 3P82A 1YTEA 2Z6IA 3M47A 2FTPA 4CNPA 4QQ3A 3B04A 3QMTA 3C8FA 2QAFA 1OK6A 4I9AA 7TIMA 4N9CA 2E5BA 4AVFA 3W07A 1TPFA 3MHGA 4O12A 4UUIA 2V0TA 4R33A 2FIQA 4GBUA 3CHVA 4FX7A 3CLMA 3LOTA 5LNWA 5D09A 1VLWA 3USBA 3BARA 4HNNA 4LUJA 5I3JA 2FB3A 5HWJA 1FCQA 1QFEA 3PG8A 3TW6A 2Q3RA 1VS1A 3UWVA 4HKPA 1OFBA 5HMSA 1FWTA 2CU0A 1K7FA 5KINA 2A1YA 5CPNA 3TSDA 4RCXA 1R2SA 4OHQA 3EX2A 3FJ6A 3IIOA 2HTMA 3UY8A 2E09A 3GK0A 3W85A 5BRBA 4K8EA 2V5LA 1AL8A 4K8HA 3TW7A 3TFXA 3PY2A 3LV5A 3B06A 3HJZA 2NX3A 4AXKA 4TMCA 4IMFA 3W22A 3LHZA 4CNNA 4EF9A 4NZJA 3UQNA 3MW7A 4IUOA 1P5BA 2A4AA 1W54A 1T8XA 1T0OA 3WJSA 3SY5A 4OQVA 1XXXA 4O1BA 4TR9A 1Y0EA 1TREA 5LNRA 3Q94A 1GVFA 3Q58A 3P80A 3KAOA 1EP2A 3IEBA 1K7EA 4K38A 2ZRWA 1W0MA 5F2LA 1K8XA 3L5LA 4FNQA 2NWRA 3MI2A 2A85A 3CWNA 1XBYA 4OU1A 4R53A 5TIMA 4O1AA 3KRUA 2CFFA 4DO4A 3TMQA 2FDSA 4D2JA 1WDWA 4LVAA 2Y7DA 1HTIA 5G2HA 2EPHA 2CZFA 3FJLA 2YDAA 4H4IA 3BK0A 1HFBA 2QCHA 2JBMA 3SIZA 3QW4B 2ALDA 3NNTA 2BZNA 3G24A 3STFA 4MFEA 5HQEA 4IPJA 1PV8A 2F7FA 5KTLA 4IGHA 2E6YA 4I7WA 3IGUA 3NQEA 5DELA 4NNCA 3R89A 3S5ZA 1RR2A 4JTGA 1XBVA 3F4NA 4N02A 4WQ6A 4JY9A 3S1UA 4O1DA 1SO6A 3C2EA 2YZRA 3OEXA 2FPVA 2H3BA 3TQKA 1OFPA 3N14A 3L9CA 3M43A 2CWNA 1Z41A 5FEZA 2NZLA 3IIVA 3A24A 5AC8A 3L0NA 4YCOA 3G1XA 4JX4A 1QOQA 4LVDA 1OFRA 4N2YA 1ME7A 3BPWA 3L5AA 1BWKA 4ONVA 1LOSA 4NNBA 4LC8A 4NU7A 4Y90A 3GYEA 1D3GA 3W7GA 2NX1A 3W87A 1FUYA 2J88A 5E1QA 3W1UA 3LCXA 2Z2UA 1F74A 4JEQA 1SUXA 3QM3A 4LNYA 5CG7A 4JDYA 3PG9A 2DZVA 5KZDA 3W7PA 5F1VA 2ZBTA 1GYNA 1JUBA 3UWUA 1R2TA 3KVMA 4QNEA 1SPQA 4G1KA 3RLVA 3QF0A 3RLUA 3TU9A 2VFIA 2XN0A 2X30A 3GIYA 4QISA 3N19B 1P0NA 4KWVA 1F2JA 3NZ1A 2NUXA 3NG3A 1ZHAA 4QAIA 2VKZG 2PC4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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