3W2MA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-3-183
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-183.
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 106
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w2mA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w2mA01
1KFKA 2GJLA 1EP2A 3OEXA 2V9DA 5F4WA 4OGZA 3B8DA 2ZTKA 4JYEA 3W23A 1Q6RA 2RHGA 6TIMA 4O12A 3TSMA 1K8YA 2J27A 4M5PA 4QM1A 3FIGA 1LLWA 1M5WA 3MO7A 2P10A 3NPUA 5EBUA 4IJBA 3NQ8A 4RJEA 1CW2A 1P4CA 3W7QA 1YDOA 1U83A 4DQWA 4K8EA 3M43A 5H2ZA 5LNSA 1S5WA 2QCLA 4LS2A 2Y7FA 4P61A 2ALDA 1HTIA 4TMBA 3NQDA 4DBEA 1IF2A 1G7UA 1SPQA 3MI2A 4JTTA 3USBA 3KVKA 3IIOA 7TIMA 5AHIA 1L6YA 3SZ8A 5AHNA 3GK0A 2NWSA 2QUUA 3RFAA 1L6WA 3SGUA 1BKSA 4JY8A 5FF3A 3KX6A 2GOUA 5G4WA 3W2MA 3M9YA 1SFLA 5AHMA 4GUHA 2OCZA 4LTSA 5KMYA 1TIMA 2ZRWA 1OFBA 3LHYA 4ZQMA 5FESA 1H7NA 4S1FA 3W7IA 2PRLA 3EB2A 3W1LA 2NX9A 1W3TA 4UIOA 1H7OA 3QZEA 3S5ZA 4UTTC 3W07A 4HSOA 4O50A 1F76A 2ZRYA 2NV2A 1PHQA 4PA8A 2QCEA 3GXNA 1DL3A 2FQIA 2DORA 1OX4B 2CLEA 1JQVA 2KZHA 3KVLA 5HWJA 3NQVA 3P7YA 3A23A 2ZA3A 2VEKA 1KLZA 2HMCA 3KVJA 3GXPA 3G18A 3GR7A 3THQA 1QOPA 1G67A 4PL1A 2QCFA 5FF0A 3I7QA 3LX9A 2V30A 5EYWA 1XXXA 4O52A 3BLFA 3I7SA 3HB9A 4DPQA 5IM51 3FOKA 3LCGA 3L5MA 1VPXA 1Z42A 3HG2A 3W1TA 2WNQA 2WOQA 3UZ5A 4JD4A 1NSJA 1VJIA 1X1OA 1HO1A 2BSLA 4H3DA 3IVSA 3CTLA 1Q3NA 3SSJA 3UWYA 2FJKA 4Y9AA 4LUIA 2Y6ZA 1QPOA 1VCGA 4FO4A 2I14A 3L0NA 5DY2A 1FWSA 3PC0A 1FQ0A 4O57A 5I3KA 4UR7A 2RDTA 1TCDA 1XDMA 1H7XA 5KZDA 3P60A 3CPRA 1W0MA 4WOZA 4JDBA 1XBXA 2R8WA 1JUEA 3MI3A 2R94A 3BW4A 4PC8A 4UTJA 4NXSA 1WAUA 4GXMA 4LV9A 2NUWA 2Y63A 3VKJA 4O0ZA 1PHWA 3O6CA 4HNUA 3DZ1A 3I6RA 3W7JA 3W22A 5G4EA 4LC8A 2VELA 3C2RA 3KFTA 4JTEA 3IVTA 5D30A 3W1RA 2C16A 1YPFA 1TB3A 3R2GA 4OT7A 3FKKA 3NZRA 1WA3A 4HT3A 5AFDA 4IMGA 3D0CA 1TQJA 3HBLA 1SW0A 2CZDA 3CLMA 5C2XA 1XCFA 5DY3A 1VYSX 5F1UA 3W1QA 2BX7A 1LRNA 4MY8A 1QO5A 2QAFA 1LP6A 5ABTA 2OMAA 1TRDA 5E1QA 1UJPA 1K02A 3PBWA 2PURA 4IOTA 4MFDA 3W2LA 1JCJA 2PRHA 4OV4A 1KM0A 4XUGA 3E02A 3T44A 3MI6A 1ZY9A 2F7FA 2QCMA 1R30A 1JRCA 1GYNA 1SZFA 4Y96A 3DKJA 1RQEA 4PL2A 4RXFA 3Q2DA 1BWLA 1RR2A 1H7PA 1DHPA 3WJZA 2F84A 3CC1A 4NJJA 3ZFHA 4WD0A 3IIVA 5G5IA 4TO8A 2FLIA 1WXJA 1JRBA 2QR6A 2WKJA 3I68A 3PBYA 3TC6A 5HUOA 3EX1A 4AWTA 4YCPA 3MYPA 5MHBA 3GVGA 3TKFA 3S1VA 4EIVA 4UUIA 1QMLA 1IGSA 1KM1A 4GBUA 1LM1A 5BRBA 2X16A 2DP3A 4A22A 1XM3A 2NUYA 1WV2A 3DFPA 1WDWA 2G5WA 3DFNA 4ZVJA 1T96A 2E5DA 4DF0A 1NF0A 3TSDA 3TX9A 5EPDA 4UTHA 4O54A 2QDHA 4CNPA 3H53A 1TO3A 5I3JA 4IPJA 5SWUA 3WFAA 1G4PA 3R5EA 3NQAA 4LVDA 4I7WA 3NL6A 2FTPA 3RF9A 5AN7A 3PY2A 3W87A 2ZZ5A 8TIMA 3STGA 2VEPA 2FPYA 1G4SA 3A21A 3BW3A 3LTPA 4QSHA 2E09A 4N6EA 3NQFA 3E96A 1X7FA 4PEKA 5FEZA 4FXSA 1YADA 3W7DA 5D37A 3QC3A 3OVQA 3M44A 1DBTA 1ADOA 3SI9A 4PH6A 3UXDA 2AAMA 1W5NA 3GNNA 4LV4A 4WY0A 3S5OA 2ZCGA 3R13A 1GVSA 3GLCA 3R8RA 1LYXA 4UFHA 2BZNA 4LU0A 1K7XA 1TJRA 1TTIA 4O1AA 4O28A 5C6MA 3QPYA 1SFJA 1SR9A 4EF8A 4MIMA 3ZS4A 2CLHA 2YX0A 1YDVA 1TREA 2PRMA 3HG4A 4NJGA 4JTLA 2V5BA 2J9YA 4N9EA 3CWNA 4LVFA 5U4NA 2GJNA 3HGOA 1O94A 4JEQA 3KVMA 1HO4A 2A6LA 3PB0A 3N9RA 3TR2A 4ONVA 4AEOA 2VC6A 5CZTA 3QW4B 3W7PA 1JCXA 4UFMA 4FB7A 4HPJA 3NR0A 3ABQA 4RKAA 3EWWA 3TUUA 1VZWA 5D2WA 2FPTA 3EX4A 3M16A 1OFDA 3EX2A 3LRLA 3EWBX 2QCHA 3NEVA 1OF8A 3P8IA 1KBJA 5CSSA 1EIXA 5DBTA 3F4WA 3G22A 1KM6A 4JTKA 3C4UA 4Y8FA 3BLIA 4UTMA 3M5XA 1W5PA 3PBUA 1VRDA 4UNKA 4ZZ9A 1EUNA 2B7PA 4HPXA 4RZ4A 5T26A 1OYCA 4M7SA 3U8GA 3EXSA 3LXAA 2QUVA 3L67A 4IXHA 4K7YA 5AC6A 4WX2A 1A5BA 4AF0B 3BV4A 2YGYA 4DO6A 4POCA 4KFPA 2G95A 1IXOA 1Q6LA 4XTIA 3MW7A 3IIPA 4CCEA 3G1AA 5DXXA 3NQMA 3QSRA 5LNWA 5EY5A 4E0CA 1SZGA 1G7VA 1ONRA 4JIQA 3N34A 4JX5A 4WOQA 4Z08A 3FEMA 5C55A 4GUJA 1PIIA 1PCWA 3LHVA 4O16A 3ABOA 3LHZA 3DI0A 3IVUA 4XTDA 2ZZ1A 2A0NA 5HULA 3B05A 3JRKA 4JIPA 1A53A 2FFCA 4UTWA 3GZ3A 3UNDA 1KFBA 2ZA1A 3GAKA 1F7BA 2V2CA 3THAA 2NWRA 4HN4A 3TIMA 2VFHA 1PVNA 3LLDA 1VH7A 2JGQA 3NQ6A 4BI6A 4LNYA 1EB3A 1M6JA 1LCOA 4DEFA 3A9IA 1GEQA 2EF9A 5CPOA 3N3MA 3OVRA 3S6DA 3EKZA 3P82A 2ZQ0A 3Q37A 2X2GA 1OF6A 4O19A 3L5LA 4K38A 1KTCA 2PC4A 3BG9A 1TPH1 1GWJA 4BK9A 1DOSA 4P2VA 1ME7A 3CHVA 3HIJA 3L0KA 4JN6A 4NNAA 4NX5A 4MYXA 4KKXA 1TPVA 3W3OA 4O1BA 2RKXA 1E51A 3ABRA 4WJEA 4R33A 1Z44A 5AB3A 1EWEA 3C0JA 3W84A 2H8XA 5A5WA 3W9ZA 1PS9A 4C1LA 1OJXA 5I3GA 3ANYA 3CU2A 1H5YA 2Y70A 2DZTA 3TU9A 4MY1A 2CZ5A 4JTUA 3WK1A 3STCA 1TJPA 2YYTA 1QWGA 3C2OA 3MMTA 4KWWA 1T99A 1IXQA 1PE1A 3MYOA 3VNDA 1XI3A 2Y62A 4WQ6A 2V2DA 4YXGA 1V7YA 4PTNA 3STEA 4MLRA 5EKYA 4MUZA 4UCGA 3BGJA 2YYUA 3BPWA 3O8AA 2JKAA 4MZYA 1IIHA 3N14A 4YMZA 1GPWA 3TQKA 4X22A 3JR2A 1LROA 2FDSA 4UXDA 2QJIA 4YWIA 3G1FA 4NQ1A 5D32A 4TU1A 3TJLA 1X8FA 4JTSA 4AF0A 1VLIA 4O15A 2VOMA 3M47A 3QJAA 1A5AA 4AH7A 1RQBA 2DZVA 1SO4A 2FB3A 5I3FA 4BFAA 3L21A 4DPPA 1B4KA 3TV8A 4NT0A 2H90A 3GR8A 2V8ZA 4QISA 3NPWA 4HNVA 4RR4A 2JGYA 3L5AA 4JTJA 3W73A 3TMQA 1FXQA 3OVPA 5CPMA 1G6CA 3O6YX 4IMFA 3W74A 5F1VA 3LCXA 1SQ7A 2TSYA 1TPFA 3NM1A 2YZRA 3G1DA 4A21A 2WV8A 5DBUA 2A4AA 5BOOA 4LOCA 5LNUA 4PCFA 3W7LA 4UC5A 4RCXA 2ZBTA 1UB3A 4Q4KA 3G1SA 1F05A 3K30A 4NUWA 3GX9A 3I7RA 1EUAA 5HQEA 1A50A 3LRMA 3C61A 4Y6GA 3TJXA 2NV1A 2TMDA 3MP3A 4O0KA 2WSYA 4JTGA 5IBXA 1Z41A 3DFOA 3NL2A 4AHPA 4KFOA 4LRTA 5K2ZA 3GDKA 4HNNA 3B03A 1B9BA 1ME9A 4LS1A 1YXDA 2W79A 3CIWA 2OZ0A 1S5TA 3UD6A 2LLEA 1OHLA 1S3HA 1MZHA 3EWXA 1WYIA 1G4TA 3U2OA 4FX7A 2QCDB 2XN1A 1JULA 1XKYA 3OBKA 4MJMA 4LW7A 1OVDA 3HQ1A 2ZZ7A 1H7RA 4ORMA 1G69A 2ZZ3A 3UQNA 3C3NA 3M5VA 1DQWA 4NVTA 4IMDA 3SECA 3TQ0A 2WPBA 1NFBA 1PV8A 5U7SA 4JGDA 3M0ZA 2X1TA 3VCRA 3YPIA 4E38A 1UUMA 4O53A 3O05A 3QMTA 4IQLA 1YYAA 3SR7A 4Z1DA 1VYRA 4WXYA 4ADUA 5FF7A 3P5YA 3CWOX 2X1UA 3W83A 3SY5A 1K7EA 3QRHA 1D3HA 2C14A 4MVAA 2P0OA 4MJZA 2DU2A 4AAJA 1FWRA 3UYCA 2E5CA 2DZXA 2CLMA 3L2IA 4FNRA 4XQ6A 1WBHA 3GXTA 4K36A 1ML1A 3W88A 3BG3A 3BGGA 1UUOA 3WJYA 4ICNA 1LRQA 4R7JA 1JUKA 1K8ZA 3FYPA 4WY0F 4UTUA 3HG3A 3B0PA 4O4VA 2XFWA 1KM5A 1XBYA 3HGRA 1YPIA 3M6YA 3DI1A 3N2XA 5F4XA 1I2NA 1QDSA 1RV8A 1W5MA 4GE8A 2YR1A 2YDAA 1GTEA 3L0GA 2CLOA 3NG3A 4NNBA 1R2TA 1KV5A 2AGKA 5K4ZA 5DELA 1AL8A 2OJPA 1Q6QA 2JK2A 4Q33A 2A1YA 2E6YA 1YLVA 2VFDA 2NUXA 3EWYA 1ICQA 2CZFA 2B7QA 3QMSA 3W1NA 2OX1A 1H1ZA 2GPTA 3QQ1A 5D03A 4BI7A 4CCCA 1YXYA 3LB0A 5L9FA 2Y85A 2O7QA 4MPQA 1IXNA 1A5CA 3GIYA 1M7OA 4IWWA 4EOUA 3NM3A 3TXZA 3O63A 2Y7DA 5D33A 4UR8A 3W75A 3IRDA 3GYEA 5C5YA 4LVBA 2W0UA 1J4EA 1AL7A 3LLFA 2DZWA 3LDVA 5D2TA 3EX6A 3GDMA 4JXCA 3WK2A 2Q8LA 3G3DA 1OX5A 3SGZA 2BLEA 5D2VA 1OX4A 3IIZA 5D38A 3PG9A 3PUEA 3LCIA 4IX0A 4K8HA 1WBJA 5CZ0A 2E6AA 1QPRA 1OG0A 1HG3A 3LHTA 1R2SA 2QCDA 3GAYA 4GFSA 3HG5A 5D2YA 3IGUA 5HWNA 4TR9A 5HNRA 5LKYA 1OFRA 1W3NA 1FDJA 2A6NA 1SO5A 2HS6A 3BARA 1O60A 1SU5A 4N6FA 4X3ZA 1JUBA 2PE4A 4JICA 2QEZA 1O5KA 2C13A 3PWAA 2NLIA 1SSGA 3TNOA 1DJNA 2C18A 3T7VA 3Q94A 4EVZA 1B3OA 3LBCA 2GUUA 3S42A 4Q32A 3PM6A 1AW1A 2P1FA 4DO5A 3TROA 3GDLA 1AK5A 4LVGA 2QJHA 1VLWA 1H50A 3WJWA 3N73A 4UMAA 5K9CA 3WK0A 1EA0A 4WUIA 3PR2A 2CFFA 1F5ZA 5LGXA 1XC4A 1ZAHA 5C54A 5LGZA 1P1XA 5CSRA 1MXSA 1H1YA 2H8ZA 4Z0SA 4JYDA 3PUOA 1TV8A 1NVMA 2GQ9A 1W56A 2VFFA 3U6WA 4E2DA 3WJSA 1RPXA 2C1HA 1W1ZA 3P80A 5TQLA 4HKPA 4J9JA 4BWLA 2EGZA 3RLUA 1GG0A 1GJPA 3P84A 4NX0A 3W1PA 5FI8A 3W85A 1XL9A 1QPQA 4UTKA 3KAOA 4UFIA 2YW3A 2Y7GA 5TIMA 3W6YA 3L68A 3LCWA 1J2WA 3CT7A 3E12A 3HJZA 3QW3A 1RQHA 2ZRVA 3G8EA 2QJGA 2QCNA 3TSBA 2TYSA 4QNEA 3O6DA 1SUXA 3QH2A 4DO4A 3DGRA 1KV8A 1N55A 2G97A 2QF7A 4O1CA 2H6RA 4WZHA 3SJ3A 3W7RA 2VFIA 4JR5A 5KITA 1R47A 3UWQA 5AOUA 2YCEA 4FNQA 5FEXA 2OT0A 1NEYA 3N2MA 3W2UA 1QNVA 3MWAA 3B04A 4U4MA 4WXZA 1DKWA 1SW3A 2G96A 3UXAA 1VHNA 3ELFA 2BTMA 3PSWA 4XBKA 4Z1CA 3LCHA 2CW6A 1H7WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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