3W2N | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-185 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-12-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w2nA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w2nA01

2V9DA 5K4ZA 2RH9A 5DELA 1YYAA 3M5YA 4JIPA 1XC4A 3THQA 3TR2A 1Q6LA 2GQ8A 2QJGA 3FFSA 3K30A 4RCXA 2W0UA 1SU5A 1QCWA 4WX2A 3SGZA 1TV5A 2CZEA 3W1MA 1HUVA 2H3BA 3LV6A 2JGYA 1RVGA 1TRIA 3B8DA 5K9CA 3W7QA 5G1YA 1DL3A 3KHJA 3LRLA 1CI1A 5LGXA 2QJHA 4LC8A 3P81A 5KTLA 3B0VC 2Q3RA 1AMKA 1FCQA 3FS2A 3TH6A 1W3NA 3KVKA 3QQ1A 3HF3A 4MIMA 1KFLA 5L9FA 3P61A 3ATYA 3LBCA 4QNWA 2QUTA 3R2GA 3GXPA 3N3MA 5KZDA 3EKZA 2OT1A 2RFGA 3W2LA 3L68A 3G1XA 1LRTA 4UFMA 4A2RA 3TQ0A 1TO3A 2OT0A 3VKJA 1Q6RA 4YMZA 3D0CA 2QUVA 2B4GA 1N7KA 2ZA3A 4PODA 2ATMA 1M7PA 3ZR4A 1O4UA 1V7YA 1OVDA 3IIVA 2ISSA 1Q3NA 3PS7A 1TJRA 4XBSA 3W74A 4OT7A 2CZFA 3LDVA 3SJ3A 1PE1A 2Z2UA 3P8JA 3SGUA 1XBVA 1W5NA 2PRLA 1OFPA 3MBFA 2XN0A 3GNNA 4UFHA 1FCUA 3P67A 2DZTA 3DGRA 1CW2A 4X9SA 1SSGA 3DFPA 1AL7A 4O1CA 3NQ6A 2VELA 5HINA 5AOUA 4EOUA 1YPIA 4Q33A 3B03A 6ALDA 5I3HA 2C18A 4GRSA 4RZ4A 5F2LA 4ZVJA 3QC3A 4K39A 4JGDA 1Z44A 2QCCA 3NL3A 1QR7A 3TCEA 1ZY9A 2RDUA 2GVLA 3AJXA 1OX5A 1G67A 2J6XA 4IJBA 3KAOA 3HPSA 2V30A 4FNSA 1OYBA 3W6YA 3MWAA 3TA6A 3UYCA 5EL1A 2R91A 4NJGA 2YYUA 4IMCA 1DOSA 3KFTA 3E12A 1VYSX 4DO6A 3CC1A 3WJZA 3B04A 1DHPA 1EP3A 4NZFA 2CLKA 4HSNA 4FEZA 1JR1A 1H7XA 4X3ZA 3IIPA 3KRSA 2NZLA 4E2DA 3S5ZA 3SZ8A 1JCNA 1VCFA 4AXKA 2YGYA 4DPPA 1JUKA 1VH7A 4N9BA 4FB7A 3PSVA 2TSYA 3W7IA 4IMGA 3S8HA 4RZ5A 2QKFA 3BPWA 3SI9A 1U5JA 4ZZ9A 3WFAA 4XBKA 3W85A 1TTQA 1P5BA 4CQ9A 4A21A 3GDMA 1KBIA 3TIMA 1TTJA 3UNDA 1L6YA 1EEPA 1QO2A 5D2WA 2Z1BA 4GBUA 1R2SA 3QW3A 1OK4A 5KZEA 4AH7A 1EWEA 1G7VA 3DU0A 1GOXA 3TFCA 3W1LA 4RK8A 3FKRA 2IQTA 1IIGA 2ZZ5A 1FX6A 4I7VA 4XTDA 3HPZA 2HS8A 1I2RA 3ATZA 2NXIA 3CPRA 1KM5A 3QPYA 1P4CA 1H63A 1PVNA 1N55A 3N2XA 5CZTA 1LLZA 2DZSA 5IBXC 3G3MA 4PH6A 1G69A 4JTEA 1KFCA 1DJNA 4WOZA 3R89A 4DBEA 1VCVA 1OFBA 3T55A 3PY2A 1QPQA 4TR9A 1H7PA 1M6JA 2Q3OA 3VE7A 4QQ3A 1F73A 1DQWA 2ZRXA 3E9AA 1FCBA 2GOUA 4XTIA 1IF2A 3QSTA 1VHNA 2HTMA 4N9DA 3VNDA 2ZBTA 4ZMGA 4YCOA 3G0SA 2WQPA 2JBMA 4DO4A 4HPJA 5HUOA 1XBXA 3GIYA 4OV9A 1P1XA 1GVOA 3C2RA 2A21A 2W79A 5KSWA 4ICNA 1KV8A 1P0NA 1S3HA 4JTLA 5HULA 4FNQA 2FPVA 3BG3A 2GPTA 3DHDA 4RZ6A 2QCDA 1KM2A 3I6RA 3P62A 4J9JA 2Y7FA 5BRBA 2R94A 2WJZA 1OF6A 4JTTA 1RD5A 1H5YA 3TXVA 4AAJA 1JCMP 4DELA 1X8FA 5C54A 4PL2A 3W1NA 3QW4B 5CSRA 3QYQA 2WSQA 4NVTA 3NDOA 5K3VA 4JYEA 4BI5A 4O16A 4IXHA 4O19A 1Z42A 5LZLA 2ISVA 3A23A 4MPQA 4Q4KA 1K8YA 3EKLA 4HSOA 4YL2A 1K8XA 4BF9A 3GK0A 1TSIA 4FXRA 1K8ZA 3QQ0A 3P8IA 3L21A 4LRSA 5FF2A 4E2BA 1R2TA 2PURA 1PCKA 4KWVA 4LVFA 3PBVA 5HWJA 2WOQA 3P60A 3G1AA 5HNRA 1DJQA 3A24A 3SSJA 3PF3A 5AHIA 4ZQCA 3R8RA 2QCLA 1TTPA 4H3DA 2FJKA 3O06A 1ME7A 3H53A 2VC6A 1PL9A 1A50A 4QAIA 1GEQA 1K7XA 1FUYA 1XUUA 2R8WA 4KKXA 1H50A 1BKSA 3NQAA 2RKXA 1NVMA 4HHPA 4K37A 3NG3A 4LVBA 3SR7A 3TAKA 3NO5A 2EF9A 4AVFA 1WDWA 4Y90A 4CCDA 3W7LA 5LGZA 2PE4A 1YPFA 1U83A 2RHGA 3EXSA 4KWWA 3W72A 5DXXA 4O28A 5TQLA 3M43A 3NOEA 1K7FA 3L0KA 1QDSA 4NJKA 1FWWA 1EWDA 3GDTA 2VENA 2B7QA 3LV5A 3MI3A 3W7EA 2V5BA 1C9DA 2E1DA 2ZA2A 2X30A 1LZOA 3GKAA 2WO5A 4D2JA 3O6CA 2X1SA 1JCXA 4A22A 3O1NA 4NJIA 3QJAA 1FXPA 5HJLA 4HT3A 3TKFA 1GYLA 3GDLA 3FKKA 3I68A 1JUEA 1GJPA 4MFDA 4WJEA 3SY5A 2PRMA 2Q8LA 4ZQOA 2I9EA 4R34A 1PHWA 1LCOA 3O07A 2GJLA 1T0OA 3M5ZA 2QUUA 1R2RA 4DF1A 3ABRA 4NNCA 2X1UA 1ZENA 2DU2A 1EB3A 3UXDA 3SECA 2A1YA 4K6AA 4LS2A 1UCWA 1QPRA 3M6YA 4RJEA 3TV8A 1EX5A 1GZGA 3IGUA 1YTKA 1FY6A 1WV2A 1VR6A 1J2WA 1UUMA 3EX2A 2VEMA 3HG5A 4QISA 3EX6A 4AHQA 2Y7DA 2ALDA 1FXQA 1F2JA 3NM1A 3C52A 3LHWA 3W7CA 3LRMA 3L0GA 1ZCOA 1KM6A 1EA0A 1FDYA 1H51A 1ML1A 4NX5A 3TK7A 4M19A 1L6SA 3S0CA 1KLYA 3NM3A 4JTKA 3V1PA 4PCFA 1UUOA 1FWSA 1EPXA 1SO3A 2TPSA 1AW2A 3W73A 3LHYA 1GTHA 5D2TA 3S9YA 2C3ZA 1QWGA 3DFOA 3G18A 3TC6A 1G4EA 3PG9A 2P1FA 4LW7A 3L2IA 3C61A 3HGOA 4QITA 1C8VA 2E5CA 4M5PA 2F7FA 2KZHA 3LX9A 2OCZA 5CG7A 1WBHA 3C6CA 3QF0A 4EIVA 1TPH1 5D2YA 3SIZA 3QPZA 1GWJA 1KW1A 5BMXA 1LLWA 4WOQA 3S5NA 3CHVA 2GJNA 3QSRA 4CCEA 4JYDA 5F2GA 4DPQA 1KM1A 3MYPA 3G3DA 1YTDA 2V2DA 4N6FA 3H55A 5U7SA 2QCMA 2V2CA 3L5AA 4JTFA 4MYXA 1PIIA 1F5ZA 5HQEA 5CPNA 2NWRA 4K36A 2BXVA 1HO1A 3VFLA 3MUXA 2Y88A 3KRZA 1JULA 1TYGA 3FOKA 1WX0A 4RX0A 2VFGA 1A53A 2ZZ2A 5F1UA 4O53A 1VQTA 4R7JA 5K7JA 3LHUA 1VYRA 1AW1A 3LHZA 3CU2A 3IEBA 3L67A 2DZVA 2P10A 4UFKA 3QH2A 3RF9A 5LHEA 3HPXA 1TPDA 1KM4A 3N73A 1NFBA 3BK0A 3O8AA 2ZQ0A 2G96A 3TAOA 3N9RA 4N4QA 3JRKA 3B05A 1H1ZA 2WPBA 3OBKA 1MEHA 1UBSA 2Z6JA 3NGJA 4NJJA 1F74A 4ZQRA 3MI6A 1VRDA 1VJIA 2YR1A 3NQCA 3NVTA 5U4NA 5C5YA 1SQ7A 4JR5A 4OU1A 2TRSA 3Q94A 1A5CA 4U4MA 5C6MA 3GR8A 1EP2A 2WSRA 3CIXA 3ELFA 3NPWA 3WJXA 2E5BA 2ZZ4A 4WQ6A 4O50A 1LOLA 4JN6A 2V2HA 1TV8A 1YXCA 5G2HA 3F4WA 1MEIA 1GG0A 5D2VA 4LV4A 5AC6A 3PB0A 3TXZA 4JNMA 1GPWA 3W3OA 1ZAHA 3C2OA 3L5MA 4AHPA 2CLLA 5DY2A 3TW7A 4Z1AA 2ABAA 4NQ1A 5DCDA 5E1QA 4O18A 2YFNA 3W7PA 1K03A 4ZL1A 2ISWA 3PBUA 3W76A 3NZRA 5D30A 3DENA 4AHOA 3W1TA 2UV8G 1ZALA 3CTLA 4PL1A 2JKAA 4R53A 3NPXA 3P7YA 2FTPA 2A7RA 4L4LA 1ZAIA 2NXHA 1GVRA 1JCJA 3U6WA 5CPMA 4QM1A 1D3GA 2JK2A 1W3IA 1XFBA 2J9YA 2DZXA 2WSYA 4UTHA 3UY8A 5KINA 1NAL1 2GVJA 3LTSA 4O8RA 3W71A 2A7NA 4JTIA 3MBDA 2DJXA 3NPVA 4QIUA 1JRCA 3FEMA 3LLFA 4JTSA 2YPIA 4GC4A 5BMWA 5I3JA 3MW7A 3UXAA 2QAPA 3LGEA 4DF2A 1YDNA 2E6FA 2HS6A 2PCQA 3EWZA 3NAVA 3W9ZA 2H8ZA 2FIQA 1WXJA 3B4UA 3LCXA 5DCBA 4LWWA 3LCWA 3PM6A 3V75A 3M44A 3CIWA 3FYOA 3A5FA 2QAFA 1MSSA 4JEQA 1A5BA 3DAQA 3UWZA 2EGZA 4LS0A 3G1FA 2CLEA 4KFOA 1KM0A 3W1AA 1SSDA 5D09A 1L2UA 4FNTA 4NNBA 3IIXA 4JDBA 3THAA 3U8GA 3JS3A 1P0KA 4Q32A 3CQ0A 4RLIA 4UMCA 1X6UA 5F4WA 4EF9A 1Q6QA 2RDTA 3N19B 3T4CA 5J5DA 3UY7A 1KV5A 1VPXA 1JRBA 1LOQA 3W7DA 1DVJA 1H61A 3NQ8A 3DZ1A 4JTUA 3OVPA 4O17A 2BLEA 3M1ZA 5LNUA 1TPVA 4JTJA 3OA3A 4M7TA 1ADOA 1KFJA 4OHQA 3TROA 4I7UA 1OFAA 3HG4A 1LTDA 3IGSA 3WK2A 4MJZA 4UFJA 1YXYA 1DKWA 3BW4A 2YW4A 3EWXA 4MOZA 4ORIA 3DFSA 3PBYA 4I7WA 1PCWA 1R30A 2E68A 3HGRA 5FEZA 3FLUA 2OMAA 5GVJA 4FIRA 3NL6A 2Z0IA 4GJ1A 1VC4A 2A6NA 1O60A 4LUJA 4O13A 1SUXA 3W86A 4EVZA 2VOMA 4RXGA 3B0PA 2VEKA 3C2VA 5FF4A 4HPXA 1JCYA 1TQJA 4GUIA 4ORMA 5DBUA 3LCIA 5TBOA 3HG2A 1R47A 4GFSA 3UWQA 1XKYA 1VHCA 3F1QA 3W1XA 3R13A 1T96A 2V5LA 5AYXA 2A0NA 3P5YA 4JTHA 3TSBA 5F4SA 2ZZ7A 3DFTA 2ZZ1A 3G8EA 4XWUA 2E6AA 2OX1A 1SR9A 3W70A 3UD6A 1LDCA 5FEXA 5EA9A 3LHTA 5HMSA 2VFDA 2FB3A 1I2PA 3OVQA 1MEWA 4LVAA 1I8JA 1OG0A 3LLDA 4JS3A 1YLVA 3TUUA 3IVUA 3W7HA 4FX6M 5KMYA 5EMUA 2ZTJA 1LM1A 3Q37A 4O1BA 1XDLA 5FF3A 4K7YA 3PC0A 4KFPA 1OFRA 3FA5A 2VFEA 2TMDA 1M5WA 5CZSA 4XUGA 3KRUA 4PEKA 2I1OA 1XBZA 1W56A 1SFJA 3LI0A 2Y61A 1GQNA 2CU0A 4JD4A 4GUJA 4WXYA 1QMLA 4AWSA 3RK8A 5CZ0A 3WJSA 4O11A 4LY8A 5AC7A 4O1DA 1WYIA 4MY1A 2I14A 1DQXA 1W31A 1YXDA 3DI1A 4B5NA 3MHGA 2Q8ZA 5BOOA 4GUFA 3S1UA 5EY5A 3HGSA 4UTIA 1VS1A 3UWUA 5G4WA 4MZ8A 1PHQA 3BO9A 2BSLA 3LCFA 3CEUA 3ZWTA 3UZJA 1SPQA 3LM7A 1DV7A 1EP1A 3HMJG 1OHLA 5DY3A 5D02A 1J4EA 7TIMA 4DXVA 3EX1A 1AG1O 3OHIA 1JQVA 4TMCA 1KTCA 4CLMA 4IGHA 3EWUA 4BK9A 1QOPA 3FYPA 3CT7A 2RDWA 5IBXA 4O15A 5DLCA 3HGJA 5AHEA 2NLIA 2A85A 4YWIA 5E93A 3STEA 4L4MA 2NUYA 3GXNA 4UTWC 4LS1A 4O52A 4O10A 2ZFAA 2WKJA 4O1AA 4JICA 4TX9A 1A5AA 3T7VA 1OYCA 1TPUA 3N9SA 2YDAA 3RMJA 1W3TA 3M5VA 4PFMA 1XI3A 3HO8A 2FFCA 5T26A 4CCCA 3GNDA 3VI2A 4NX0A 3LERA 5D37A 1K02A 4FX8A 2E77A 1A5SA 1D3HA 3FJ6A 3HBLA 4IX2A 2ZZ6A 3PUOA 2J27A 4CQAA 3UWVA 1VLIA 1TPFA 1O94A 2FDSA 3S1XA 4LV9A 4RR4A 4NT0A 2C13A 4P2VA 3LBMA 3C56A 2CLMA 1KA9F 3KXQA 2ZRWA 1Q45A 2Z6IA 5EBUA 4JIQA 1AL8A 4HNTA 1G4TA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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