3W2N | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-185 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-12-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w2nA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w2nA01

3HGOA 3LRLA 3JS3A 4AHPA 1J4EA 1PL9A 3PF3A 3QW3A 3SR7A 1BKSA 4N6EA 1B4EA 4C1KA 1PS9A 4ZMGA 1GVQA 4I7VA 4AWSA 3HPZA 1EP3A 2NUYA 5HR7A 4HKPA 3NQ2A 2FPTA 4XTIA 4AF0A 1FDJA 1W54A 3A21A 1BTMA 5CPNA 1JCJA 3O16A 3DFTA 1XFBA 3W2MA 4NJHA 2ISWA 3NPUA 1AG1O 3F4WA 1OG0A 1AW2A 3W7DA 4RZ4A 2YFOA 4AHOA 3R8RA 1W3NA 3G1AA 1OFAA 3RFAA 4RXGA 4IGHA 1PHWA 1ZALA 3W1MA 3CEUA 4AB4A 4GE8A 3FIGA 4UFKA 4MY1A 2G95A 3N14A 4M5PA 3GLCA 3TFCA 2NUWA 4NJJA 2DZTA 4EVZA 3GR8A 5HINA 1ONRA 5CZ0A 2HSAA 1KA9F 4PL2A 2PURA 3BG3A 3EKLA 2X1SA 1OF6A 1ZAIA 1AMKA 3W70A 4UTIA 3GAKA 1H7OA 4YCOA 2A7NA 4X9SA 3ATZA 2IQTA 1ME8A 5G2IA 4ADTA 2C18A 2OT0A 1MO0A 2JBMA 2VFFA 3HG2A 3JRKA 4IPIA 1JCLA 3KX6A 4K7VA 1OJXA 3W1NA 3F1QA 4GUFA 1LBFA 5AFDA 3M5VA 3VKJA 3TE9A 3LHYA 3TH6A 1OFEA 1VYRA 2V5BA 5D37A 4IMGA 4FF7A 1Q6RA 2Y62A 3T4CA 4HPXA 3LCGA 5E1QA 3NZ1A 5HJLA 3TJLA 2X1RA 2FB3A 1XM3A 1ME9A 3S5OA 4UR7A 4TX9A 4IX0A 4O52A 4CQ8A 1VJIA 4RXFA 5AC7A 1N8FA 3TUUA 1FCQA 1W1ZA 1PHQA 2EHHA 2BLEA 2ZRVA 3BW4A 2VC6A 3RLUA 1HG3A 1HTIA 5L9FA 5FF3A 2VENA 2QCNA 3BO9A 2QCFA 1Z48A 3G1FA 1VYPX 2I1OA 3ZS4A 5C6MA 3R89A 2FIQA 2GVJA 2GUUA 2J6XA 1WA3A 4XUGA 3I65A 2YYUA 2QJIA 1OFOA 2E6FA 5EY5A 3OVRA 4I7WA 1TB3A 3G1VA 4NNAA 2B0MA 1NF7A 3TW7A 4RKAA 3P82A 1O95A 3G1HA 4HNTA 1KFLA 2VFIA 3L5MA 4JS3A 4JR5A 3W1UA 3P67A 1OX6A 1B57A 3I7RA 4WXZA 5FEZA 4HNUA 4HIBA 5HULA 1K3UA 3NEVA 3STFA 3E0IA 4LS0A 1TPWA 1I45A 3IGXA 4XBSA 5FEWA 1G4PA 1YDOA 3E96A 3W6YA 1HL2A 1ZJIA 1EP1A 3TX9A 3TQ0A 4AXKA 4QQ3A 1BEUA 3UY7A 4FXSA 3W74A 2Z0IA 2V5LA 4DF2A 1VZWA 3CC1A 3NDOA 4AWUA 1L9WA 4HHPA 1TQJA 1PCWA 3H55A 1ZAJA 4MFDA 3W7LA 5F4SA 1OABA 2H3BA 1KTNA 2EKCA 1OHLA 4UFLA 3DFSA 4FO4A 3MBDA 4K37A 5I3IA 1JUBA 2RHGA 5GVJA 2R14A 2WJZA 2A6LA 2CZ5A 2DZPA 2Y85A 4JX4A 1H61A 4JX6A 1W3IA 4RJEA 4JTFA 4TR9A 2NX1A 2J9YA 3A5FA 3TC7A 4Z1AA 2FB2A 3DZ1A 3GVGA 4AWTA 2B7PA 3U2OA 4Z0SA 2A85A 3KRZA 2V2HA 3B05A 1W5QA 3UD6A 3VE7A 4AVFA 4O19A 4RCXA 3W7MA 2EGZA 4LVDA 4A22A 3GKAA 1WQ5A 5BW6A 3U8GA 4OHQA 3W2LA 4GXMA 2WNQA 2YZRA 3SI9A 1T96A 5H91A 4JGDA 3G18A 4JICA 3GDRA 2ZZ2A 3UY8A 2ABAA 4WY0F 2OT1A 2DU2A 4A3UA 1IF2A 3EWWA 3TQKA 2CLKA 5CZJA 4DQWA 4O1BA 5EBUA 1FQ0A 5DLCA 1D3HA 4OV9A 4LY8A 3TU9A 4LC6A 4K8HA 2A7RA 4D2JA 1OX5A 3LRMA 3S5NA 3M43A 5BOOA 3W71A 4GUHA 1E51A 1M5WA 3FKRA 1TPFA 1G6CA 1EPXA 4LNYA 3NQ7A 4UXDA 4KFNA 2H90A 5F1VA 4BI5A 3C61A 4DO4A 5LHEA 4MOZA 4LWWA 1KW1A 2E68A 3W1PA 3W23A 2QDGA 5F2GA 1ZNNA 1B4KA 1X1ZA 2VFEA 1GVRA 4DBEA 4UR8A 3TMLA 4UTHA 3ZFHA 4M19A 2JKPA 1OK6A 3NO5A 1O5XA 1KM4A 2VOMA 3DKJA 2Y89A 3PS7A 3MI2A 3W83A 2NV1A 3IIPA 2ZZ5A 3Q37A 1MSSA 1OVDA 4O4WA 3NPWA 1DKWA 1W56A 5G1TA 3W7QA 1N7KA 2QAFA 4XZ9A 3W07A 5I3KA 3E12A 1I2RA 1WX0A 2WNZA 2QCCA 5KINA 2NUXA 3VI2A 4NXKA 3NQMA 1LOQA 2VEIA 1DL3A 1XBXA 4IXXA 4ALDA 1FWTA 3G3MA 1YTEA 4X2RA 3HBLA 4UMAA 4BWLC 3IRDA 3LBCA 1KTCA 4O13A 3S0CA 2Y6ZA 3VNDA 2ABBA 1ZHAA 3FS2A 1YPFA 3CWNA 3NOEA 1MZHA 4G1KA 4O12A 3PULA 3LV6A 2A1YA 1X7FA 4A2SA 1ICSA 4CLMA 3LHWA 2CW6A 4Z08A 1JQXA 4LVGA 2ZTJA 3A22A 3C6CA 3EXSA 2O7QA 5J5RA 1VHCA 5LSMA 3HIJA 2J9ZA 2G5WA 3H54A 3VFLA 4GJ1A 3W7JA 3BK0A 2TMDA 1OFPA 4KWWA 5EL1A 2V2CA 3D0CA 1KFEA 1IIGA 4O18A 2PRMA 1C9DA 4MFEA 1GG1A 1GG0A 2QCDB 3C8FA 1J2WA 3S42A 1P0KA 3FOKA 2ZCGA 3Q2DA 1VLWA 3EX3A 1OYCA 3QSRA 3HG5A 3O05A 1I4NA 1OYAA 1ICPA 4JY9A 4UTTA 4AHQA 3L2IA 4DO6A 4IUOA 4WD0A 4JTHA 3C2FA 4IPJA 1H1ZA 3GR7A 4ZL1A 3C2RA 3P7YA 1FXQA 3LGEA 4LVAA 3MBFA 1UJPA 1I2QA 5KMYA 1UB3A 5HNRA 3RMJA 3I68A 2ISSA 3NL3A 1R2SA 4YMZA 3O6DA 1LDCA 2V82A 5G1YA 1X6UA 1K03A 3NQCA 3TC6A 1VR6A 3UXAA 2GVLA 4A2RA 3MI6A 4Z1DA 3P60A 3OBKA 4UTLA 3BLFA 3DI0A 3OG3A 2YX0A 3ABQA 1UCWA 1VC4A 3KRSA 2R91A 3MHUA 3H53A 4UFHA 4IMDA 4JXCA 5D05A 3LHUA 1WV2A 3N3MA 3RNDA 3UWQA 1SO3A 3ELFA 4OT7A 4CNPA 4KWVA 4A21A 1GJPA 1CI1A 1R46A 4ZVJA 4JX5A 1Q3NA 1UBSA 2QAPA 1MEIA 5FF0A 4HN4A 3DFPA 1FBAA 3R2GA 2B7QA 2WOQA 5DCEA 4OWGA 3BARA 2FQIA 1FCVA 1A53A 3SGUA 5LNVA 5KITA 2EF9A 2C1HA 5D2VA 4O4VA 3SIZA 2HS6A 3KVMA 2F84A 3FLUA 4R33A 4ORIA 4ADSA 4UTUA 3P61A 3HJZA 1G69A 5HUOA 4N9DA 2WNNA 4LV9A 1XDLA 1LZOA 3TAKA 1XUZA 4UUIA 1V5XA 3UPWA 2WSQA 4E2DA 2FDSA 1PIIA 2ZZ7A 1UASA 3EWBX 1WOAA 3DAQA 4NJKA 3W7HA 4WX2A 2YW4A 3PR2A 1SO5A 4OBTA 1A5AA 5HR6A 2BSLA 1Z44A 2A6NA 1WBJA 3NL5A 1SR9A 3CHVA 3KRUA 4TO8A 5H2ZA 5LZLA 1THFD 2PCQA 2WO5A 4LU0A 4DXVA 3GDLA 2H3DA 3B0PA 1W8SA 1GVSA 3KHJA 4GFSA 3S1WA 1JVNA 3NPVA 4N02A 3S5YA 1LBMA 3LTSA 1YTKA 1H1YA 2Q3OA 3B0VC 3O8AA 3EXTA 1JRCA 5F2IA 3A5VA 3O6YX 5G2WA 1EUNA 4LVBA 1G4TA 1SW0A 5K4XA 3WK1A 3MYOA 1F7BA 4I7UA 3DBPA 3PM6A 1KLYA 1R30A 3QYQA 5K4ZA 4R7JA 5D2TA 1LOSA 4ZZ9A 1B3OA 1XL9A 4H4IA 2BWGA 3M5YA 1QPRA 3LHZA 4XWUA 4ML9A 5D2XA 4NZJA 1FWWA 4GUGA 2A2IA 3DHDA 4OQVA 3P81A 3NA8A 3PVFA 3M9YA 3PC0A 1DOSA 1IIHA 1N55A 2GJNA 3I7QA 4JEQA 1UUMA 3NL6A 4CCCA 5LHFA 3SGZA 4FNRA 4HSOA 2WSYA 3S5ZA 6TIMA 1XBVA 2Z6IA 2J27A 5DBUA 3ATYA 3UWZA 4R53A 3W7PA 4MY8A 5F4XA 3C0JA 1KFJA 4ZQCA 1IGSA 3NNTA 5CKSA 4LRSA 3JR2A 2JGQA 3GNNA 4ZQMA 4M6QA 4LUIA 2ISVA 3HPSA 3QFEA 4YWIA 3W73A 2E5DA 3W1XA 1FX6A 1ML1A 1AL8A 3W22A 4HPJA 3DFNA 3CTLA 2H6RA 2HS8A 5CZTA 4LVFA 3MHGA 3LCIA 1I2OA 1Y0EA 3DFOA 3R13A 3OVPA 1JRBA 2NZLA 3SJ3A 3LTYA 4N9CA 1DVJA 2W79A 2ZTKA 4I9AA 1DQXA 4BI7A 4DELA 1W5MA 2CWNA 2Y70A 3QF0A 5E93A 5F2MA 2V0TA 4LW7A 5K3VA 3QQ1A 3MP3A 3BVJA 4Q33A 3WJSA 2CLOA 4O57A 1LROA 4GBUA 4QJ1A 5G4EA 4JYDA 1TPVA 2QCGA 1CW2A 1VYSX 2NLIA 5KZDA 3BG9A 1P1XA 1QPNA 1X1OA 1PV8A 5AHFA 3RLVA 1FWSA 2QCLA 1H7WA 2YCEA 1I2PA 4UMCA 4FIQA 4IXHA 2C14A 4UIOA 2GQ8A 4EOUA 3P74A 2C19A 1LLZA 1QO5A 5I3HA 4O14A 5LNUA 2A5HA 3STEA 1KBIA 3KOFA 3GAYA 3M0ZA 5CSRA 1KM1A 3G1DA 3BW2A 2OMAA 3LCWA 2QCDA 1JCNA 1HUVA 2ATMA 3GDMA 4FXRA 4JDBA 5SWUA 4PA8A 1Q6LA 3E02A 3DENA 4FX8A 1OX4A 4CNNA 2Y88A 4HT3A 3LCHA 1J5TA 2LLEA 3CM4A 3IIVA 1TV5A 1V7YA 4GC4A 3Q94A 3QM3A 1G67A 1EEPA 1QNVA 5AYXA 3DU0A 4LC8A 4NNCA 2A21A 1TTJA 2VELA 3M47A 5D04C 1TSIA 1WXJA 4N9BA 2ZA2A 5AHMA 1H7PA 1VPXA 4N2YA 1TO3A 4O53A 7TIMA 5LNRA 1EWDA 1TV8A 2BXVA 2E5CA 4M6VA 1QPOA 2Z1BA 3LRKA 1GEQA 2OCZA 5HQEA 4UTWC 1YXYA 1T0OA 4UNLA 5BMXA 2DZUA 1XBZA 2QUVA 4QNEA 2O7SA 3W7RA 2PE4A 2CFFA 1T8XA 2WQPA 3TKFA 3W76A 4MUZA 3QC3A 2J9XA 4FNPA 3G0SA 4NJGA 1OYBA 3A24A 3CQ0A 2XFWA 2EPHA 3BGJA 5AHNA 4JTLA 2DZXA 1DHPA 3EWZA 4JIPA 4JTUA 1LBLA 1YXCA 4OU1A 2ZDRA 4NX0A 1ZENA 2V30A 4O28A 3L21A 3ZWTA 2TSYA 3TA6A 1H51A 1RQEA 1OFBA 3GKFA 1KM5A 4RV8A 1JCXA 3KXQA 4K8EA 1GT8A 2TRSA 1C29A 3P8IA 1SU5A 1SO4A 3W7GA 4DO5A 4POCA 1RR2A 3QMRA 3SW6A 1K8ZA 4QIUA 3W86A 3NM3A 5LKYA 4DPPA 3NQAA 3O06A 2VEKA 4DEFA 1F74A 4FX7A 1W3TA 2R8WA 4RLIA 4B5NA 3TNOA 1Q6QA 4MYXA 3S9YA 1OFDA 1DORA 1GOXA 3LI1A 3NZRA 2X1UA 1ICQA 4WJEA 3LCLA 3RU6A 4UFIA 1NFBA 1FWNA 3CPRA 3M7WA 2ZRYA 3DKLA 5BMWA 2NXIA 1K8XA 2OZ0A 4S2CA 4PODA 4TMCA 1EWEA 1TTPA 3MWAA 1IXNA 1ZY9A 5K9CA 3TAOA 3A9IA 5DCBA 5F2LA 3PG8A 4JTSA 3QQ0A 3GZ3A 3I7SA 5FESA 3M6YA 3AJXA 3FYOA 4IMFA 3PAJA 1VCFA 1I2NA 4N6FA 4PC8A 2G96A 2FPYA 5CPOA 4L4LA 3LLFA 1FUYA 2FPVA 3CWOX 1FDZA 1EA0A 2XN0A 2Y63A 3QMTA 5CPMA 3N9RA 3F4NA 4MZ8A 4UMBA 1SZNA 1YXDA 3IVTA 4YXGA 5C5YA 4Q32A 4MY9A 3TR2A 3LHVA 3T40A 3EX6A 3MP4A 3P62A 2ZA3A 1EB3A 1NAL1 3KAOA 1XC4A 1JR1A 2J88A 3HQ1A 5CSSA 2TYSA 1L2UA 4FIRA 1JJKA 4M7TA 5U4NA 3P84A 1A5CA 1TRDA 3WJYA 1JUKA 4AEOA 2G97A 1SFJA 1W5PA 4BK9A 5D33A 4BFAA 3E9AA 2V9DA 2C15A 3OIXA 1SO6A 1AW5A 2C6QA 3EXRA 1KFCA 3NPXA 1TTQA 4LTSA 1LORA 4PL1A 4JN6A 1F5ZA 1KM2A 5D02A 1K8YA 3WJWA 3FEMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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