3W6MA

Contribution of disulfide bond toward thermostability in hyperthermostable endocellulase
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETCNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPKNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
publication title The role of disulfide bond in hyperthermophilic endocellulase
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
total genus 147
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2013-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3w6mA00
4LGXA 1UWSA 4XZWA 2UY5A 1W1TA 2O9OA 3T2PA 1BPLB 2VZOA 3PHAA 4JCLA 1E55A 1ITCA 5GNXA 1XYFA 1FH9A 3VGDA 4BCEA 4GQQA 2QV4A 3JUGA 4R27A 2HVMA 3UG4A 1HL9A 1NWUA 3QHMA 5DT5A 3VDBA 2A3CA 1OGBA 1TA3B 1W9XA 4HOXA 3CUJA 4PMYA 4JKKA 4DWSB 4NSBA 2J4GA 4AISA 4TVUA 5ECUA 1TUXA 2CESA 1HF6A 1EDGA 4CN1A 2DQXA 1GQJA 3L4TA 2D1ZA 3AQUA 2X1IA 1QI5A 1W1PA 3UR8A 3VGFA 3W25A 5E09A 1V3KA 1OGSA 2X0HA 5BCAA 1BG4A 1D7FA 4AYSA 5A6LA 4UQCA 1UKSA 1UWRA 5JUVA 1HVQA 3CHEA 1UA3A 3RO8A 1EQCA 1OINA 3WDJA 2ZIDA 4PTMA 3OLGA 4F9JA 4AWEA 4OBSA 1Q4NX 2GK1A 2JEQA 3FAWA 1EHAA 4K68A 2E40A 1YQ2A 1C8XA 4LYRA 4MNKA 2AOSA 3W4RA 3AIUA 1JFXA 1BGAA 1MXGA 5A6BD 2E9BA 1PJ9A 4V27A 1JZ7A 4W85A 3KL5A 2D2OA 1FFRA 4UQEA 3B9AA 2WMGA 1BVNP 2DH2A 3AFBA 3KEHA 1GVYA 4PBGA 4CD8A 4P8WA 3BGAA 3ARWA 1HJVA 2J79A 1BYBA 5A69A 2HISA 4QCFA 3EDKA 1K9FA 3ECQA 1PPIA 1LF1A 3MMWA 2ESCA 1WDSA 4XX6A 4PMUA 5GQBA 5GNZA 3TTQA 2WCAA 1GONA 4IM4A 5CLWA 1UQZA 1WPCA 4DM2A 4BS0A 5AC5A 3OIHA 3NDYA 1JZ3A 2WCSA 1TE1A 1M03A 3MU7A 4L4OA 6CGTA 1LL4A 2VC9A 4IUGA 4OBRA 3MSGA 2VMFA 2VR4A 1E73M 3SCUA 3ZJKA 2BY2A 1E6XM 1BHGA 1QI0A 3FHAA 4E8DA 1KWKA 1WZKA 2E9LA 2OYLA 1HN1A 3GH4A 3W6LA 1JNEA 4D6DA 3SUUA 2UY4A 2G4FA 1KR1A 1E40A 1A47A 1E6QM 5M5DA 1QNPA 2UY2A 2BXZA 4BA0A 4PTVA 2YA0A 2WC7A 5KZ6A 4MJ4A 1ZJBA 3MS8A 2NW0A 4H8HA 1WB0A 1IT0A 2GDUA 4GKLA 1H0GA 1B31A 2O9PA 4AIOA 1GOMA 1QOXA 1GHRA 5E0FA 3AMDA 4J3SA 4MDPA 4W84A 4MAVA 4QLLA 4FLQA 2J74A 3J7HA 5FCZA 2YL9A 3CMJA 3CZKA 4M81A 3WUFA 4AZ7A 3MANA 1G9HA 4D1IA 1HJUA 2VZVA 3B9EA 4BQ4A 2VQTA 1QNOA 1UD3A 4ML4A 1C7TA 3GTNA 3SUTA 5A8QA 2YLLA 2DT2A 4OJYA 3OGVA 5A8MA 1Q6EA 1GJWA 3AMCA 4AD2A 2D0HA 4M82A 4URIA 1CECA 3CZJA 2GK1B 4W7WA 1J10A 4RE3A 1JD9A 2CITA 2MANA 1X6LA 1BVZA 4ZENA 1ESWA 4PMNA 3NUKA 1XH2A 3SCWA 4LX4A 3WH9A 2ZICA 2A3AA 2PWGA 5HOSA 3VD9A 2C0HA 2V3EA 1B3VA 3RIKA 1F4AA 5FOOA 1EOMA 3L4XA 1E0XA 5I0DA 1G0CA 3UEQA 3CZ8A 3BCDA 4MNJA 4W87A 3AZTA 3U5YA 5CGTA 1B3XA 1RD6A 4KMQA 2PC8A 3VD4A 3IK2A 1V0KA 3EYPA 1E6RA 3G6MA 4PMZA 4A3YA 5EBAA 1JZ2A 1B90A 1UKQA 4PYSA 2E0PA 1CXLA 5IFPA 1V0MA 3RM9A 3WL1A 1EXPA 1H2JA 1W3KA 5IDIA 4PCTA 4JL2A 4JFSA 3GBDA 5DT7A 4E2OA 1WCGA 1J0YA 2XSBA 2GUYA 3T0AA 2RGMA 4HU8A 3WEMA 2A3HA 2AAAA 3T2OA 1TVNA 3RCNA 4MB4A 1W9DM 4FLOA 5A8OA 3OGSA 2E8ZA 3W81A 3N1AA 4CD5A 3WFLA 4AC1X 2YL6A 3VOCA 1E6PA 1V3LA 1JZ5A 3QHNA 1VRXA 3VIKA 1QHZA 3SCPA 3WDRA 4KGJA 3WNKA 1E6NA 3IANA 3PBGA 3WQ4A 3OBAA 3UETA 1AMYA 1H11A 4PRWA 4WSJA 3AIVA 2W66A 2DIEA 4B9ZA 4D6FA 4X0VA 1CXKA 4JL1A 4Z2HA 5BRQA 1JF6A 5AY7A 4TX6A 5D9MA 2J7BA 5GNYA 4BF7A 3K8LA 3VVGA 1TZ7A 1QBAA 2YDQA 1QI4A 3OLEA 2WSPA 3VX1A 3DC0A 5E0CA 5ABGA 5D9NA 4E8CA 4JFVA 3AMLA 1LG2A 3OB8A 3VGGA 4HU0A 3EDJA 1KXVA 5I3DA 3VMOA 2YDSA 1PAMA 6TAAA 4PEEA 1V3MA 1JZ6A 5CJ5A 5IXEA 1VENA 3K4DA 3LPOA 3WELA 2VUYA 4WKFA 4GO9A 4J3XA 1QNQA 2BHUA 4KWUA 4DUVA 4D6GA 3GM8A 2DSZA 2BVYA 3RDKA 2J77A 1B3YA 3ZSSA 4HP5A 3GNPA 1C8QA 1CLVA 4C7GA 2VCBA 4NRSA 5A95A 4PTWA 3UG5A 1UH2A 3NYDA 4BQ3A 5A2AA 3CUIA 2GJXA 1ZS2A 5CPTA 1MYRA 2PWEA 2XGBA 4EKJA 1HJSA 1LG1A 5CQ1A 1JI2A 3WMSA 5CSYA 2PWFA 2VCCA 1UD2A 3POCA 4N0RA 1MQRA 1H4PA 1B3ZA 5HNNA 1V08A 2XIBA 3CZLA 2WMHA 3RMEA 1BGGA 1UD5A 2CKRA 3UG3A 7TAAA 4AXNA 2QPSA 2CERA 1ZB5A 2ZUMA 1W2VA 3O2LA 1UH4A 2CHOA 3AMKA 3MMUA 2IXUA 3AZRA 4AEFA 4W89A 4EK7A 2VCAA 1J11A 3ARSA 3VNYA 1CGXA 4MNLA 3AMGA 5CLTA 3K1DA 3WSUA 1J18A 1HNYA 1H41A 4GIAA 1W2PA 3GXFA 3RILA 1JL8A 3NSXA 1GQIA 4UOQA 1R7OA 2D3NA 1QPKA 2PB1A 3BXWA 3VDCA 5BXRA 4UQ9A 5EB8A 1VJSA 1PIFA 3K46A 5DMYA 1UR0A 1U33A 2DT3A 4CD6A 4X9YA 5DF0A 4PUDA 4P7NA 5A6BA 2OSXA 3WNLA 1A3HA 1PX4A 4Q7NA 1B30A 3WMCA 5M17A 1KQYA 4Z2LA 5A8PA 4AD4A 5BROA 4BZYA 2DT1A 2BFGA 4U5KA 4LQ1A 1BFNA 2F2HA 3ARXA 1CWYA 5DFAA 1W9UA 3AI0A 5I23A 3GH5A 1GUVA 4RE4A 2VRKA 3M7SA 1ITXA 4U31A 2O92A 2XVKA 1QW9A 1ZBWA 2WKLA 3ZOAA 4CVUA 1DWFM 1JAEA 2XM1A 4HTYA 1HIZA 4FMVA 1FP9A 1R7AA 1FA2A 1TCMA 2V38A 1NOWA 1JI1A 2VO5A 4WSKA 4J28A 1JD7A 3CHFA 2GDVA 2JEPA 3VM7A 1XCWA 8A3HA 1K9EA 2OSWA 1JYNA 1CGTA 4J3VA 1ODUA 4UZUA 3TP4A 2FHCA 1GVIA 4WLCA 2BHYA 1H1NA 3TTSA 4YPJA 3W26A 1V6WA 3WD1A 2VL4A 5A6MA 3THCA 1UR1A 1B9ZA 3OGRA 2YKKA 3VGBA 1W3JA 1MW1A 3PZMA 3ZM8A 3L4ZA 2GSJA 2WWCA 5E6YA 5TD4A 4D71A 1WP6A 3WDPP 4CGTA 4JAWA 3ARYA 3VIOA 5BXPA 3SCVA 4Z2KA 1R85A 2OWCA 2CIPA 1E56A 1LL7A 4TUFA 3L4UA 3PTKA 1UUQA 4NZCA 2Y8VA 2EPLX 3BCFA 4UTFA 4W8AA 1J0JA 3RJYA 1Q6FA 4FLRA 5A8NA 2ZUNA 3W6MA 1R87A 4D6JA 2CKSA 4W7UA 2XFFA 3U57A 1P6WA 2J7HA 2YOCA 4YHGA 2WMJA 3WQ5A 2XGIA 2WHKA 3MV11 4TVDA 1PEZA 1WZLA 4KRUA 1HKKA 2WW5A 3TONA 4OOZA 5AYIA 3D3AA 4HZ6A 5I78A 3W38A 4M56A 1RP9A 4UFIA 1BYAA 3W53A 2GFTA 1D2KA 1BLIA 4PSRA 2ZX7A 1KXHA 4AD5A 3VM5A 1PIGA 4XZBA 4UQBA 1UD4A 2DSUA 5HBFA 4NF7A 3ZR6A 3VNZA 2YLAA 2BHZA 4HMCA 4N42A 1VFUA 5CPSA 3WQWA 1KCKA 2GJRA 1JNDA 1GOIA 1E0VA 1JF5A 3FY1A 3KZSA 1GOOA 3ARTA 5ABFB 1GJUA 2E3ZA 2XSAA 4P7QA 2EO7A 5DEZA 3WY1A 1UKOA 2BVDA 2NSXA 1BF2A 4W7VA 4B3KA 4D1JA 4AIUA 3WD2A 1UR9A 1UR8A 1B2YA 1M53A 2PWDA 1XV8A 2JALA 4LPCA 1WO2A 4DWSC 3RM8A 1HX0A 1E9LA 1SMDA 3U7BA 2CCRA 1E70M 1CXIA 3BC9A 3SCSA 4L4PA 2VVSA 4ATDA 3OZPA 3WEZA 3MUIA 1XRVA 3DHPA 2Q8XA 8CGTA 2EBNA 4B15A 2W91A 2CBJA 5I6SA 4A3HA 2QMKA 3EBVA 5JIWA 3I3DA 1UH3A 2X05A 3KWXA 5AYBA 4EE9A 1GHSA 3ZT5A 5CZKA 3W37A 2WXDM 3AHTA 1BTCA 1FH8A 3ZO9A 4GI6A 3BH4A 5HPOA 1V02E 4JFUA 5I24A 1JDDA 3VD3A 1X1NA 2WSKA 3CHCA 3PZIA 1OWQA 1E71M 2WMIA 1S46A 2FH6A 2VQUA 1LL6A 3W28A 4F9DA 3AYRA 1EDQA 4PTXA 2W92A 4S3KA 3VGEA 4IISA 3T09A 5E70A 4BQ5A 1HVXA 1GPFA 3QHOA 5CSUA 3ARZA 3FNDA 3PZNA 4GZIA 4OIFA 3HJEA 5IHRA 3ZR5A 2FGLA 3TTYA 5E9AA 1W1VA 3APGA 3BAKA 3O6AA 1R86A 2WC4A 5EMYA 2XVPA 1OD8A 4P8UA 2OWWA 1ISVA 2DSKA 1E5JA 1EGZA 1J0ZA 1E6SM 1WDQA 3NSMA 2VX7A 4U3CA 4AZHA 1UKTA 4CD4A 1OD0A 2DH3A 1DWAM 3AIRA 1HKJA 1UA7A 1NWTA 5CXPA 3AHZA 1C8YA 4D6HA 1J12A 3WNNA 5CPQA 1VFOA 1CPUA 2ZUUA 4OZOA 1CGWA 2FH8A 3N15A 1JXJA 5ABHA 5D9OA 1IV8A 1MW0A 1OT2A 4CN6A 3E1F1 5ABEA 3F5JA 3VIMA 4ZE4A 3F5KA 1KGWA 4JHZA 4AZBA 3ARQA 1KCLA 2EEXA 4AD3A 2X0YA 1DHKA 1QNSA 1CENA 2G3NA 5BWFA 1UR4A 5JBEA 3G6LA 4W88A 3BLKA 1VBRA 3AJ7A 4HPGA 4GQRA 4MDOA 2ZUTA 3VIGA 3AISA 5F7UA 2TAAA 1JAKA 3AXXA 2DEPA 2VZTA 3WKZA 1KXQA 3ALGA 2NT0A 1H0IA 1WDRA 1X6NA 1CXFA 2W5FA 4RE2A 1JZ8A 1KB3A 4CKQA 4W5ZA 2PWHA 1FHLA 3LPPA 5CGMA 4CVWA 4V28A 2CPUA 1EHNA 1LQ0A 2NT1A 1ISZA 1JXKA 1UWIA 3N12A 2IUZA 2ZUSA 3N04A 1BQCA 1OSEA 4W86A 2VX5A 3IAQA 4TXEA 4HZ7A 1HJXA 5HXMA 3F4VA 4WK9A 4P8XA 2UY3A 3SCOA 4CU7A 1E72M 1V6XA 4ZXLA 1VBUA 3DHUA 3NSNA 1SFSA 4MPKA 3TA9A 4WKAA 1OB0A 4HA1A 1GOWA 2FHFA 3M46A 5BXTA 1UKPA 3VPLA 3WUGA 1PX3A 4WKHA 1EOKA 1V6YA 3NDZA 4MTVA 3AIEA 1HKMA 2OYKA 4TOQA 2WMIB 3PTMA 2VT0A 3HU7A 2DT0A 2PBOA 2QLYA 3W82A 3N17A 2V3FA 2F61A 2ZWYA 3MUY1 3LMYA 2BY1A 4QDMA 4PMRA 3PZVA 2OWXA 2G8ZA 4JCMA 2BXYA 1RP8A 3OZOA 4B3LA 2XUCA 2W62A 2BS9A 1MW2A 4AIEA 3EDFA 4FLSA 1V6VA 4UOJA 3O9NA 1EH9A 4M8UA 4P7LA 1C91A 3VD7A 2ZX8A 5BRPA 3UESA 4U2ZA 4AMCA 3A47A 3WD4A 4F8XA 4H7VA 3AIWA 4HPHA 4OKDA 2F8QA 1XSJA 4M1RA 1W3LA 4ZEPA 2X2YA 2QMJA 4WJXA 1K9DA 3EMZA 1L0PA 4PN2A 4HZ8A 1G94A 3L4VA 2Y5EA 4UFMA 3SCRA 3VO0A 1XCXA 2EPOA 2XIIA 5JBFA 3MO4A 3W0KA 2W4XA 5I79A 3AHXA 4Z2IA 3PZGA 1F4HA 3N18A 3VGHA 3L4YA 3UCQA 3VIIA 5FL1A 3VIFA 3FAXA 4D6IA 3FW6A 2WLZA 2WNWA 2WVSA 1H09A 1GNXA 1H49A 4YN5A 2ZUVA 3PZOA 3UR7A 4YHEA 1BAGA 1JDAA 3IJ9A 1QHOA 2BNJA 2D22A 2OSYA 3OA5A 3ARVA 3GZAA 4GINA 1OT1A 3HMCA 1V3HA 2XTKA 1PX8A 2WB5A 1UWTA 2DDXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LGX A;  1UWS A;  4XZW A;  2UY5 A;  1W1T A;  2O9O A;  3T2P A;  1BPL B;  2VZO A;  3PHA A;  4JCL A;  1E55 A;  1ITC A;  5GNX A;  1XYF A;  1FH9 A;  3VGD A;  4BCE A;  4GQQ A;  2QV4 A;  3JUG A;  4R27 A;  2HVM A;  3UG4 A;  1HL9 A;  1NWU A;  3QHM A;  5DT5 A;  3VDB A;  2A3C A;  1OGB A;  1TA3 B;  1W9X A;  4HOX A;  3CUJ A;  4PMY A;  4JKK A;  4DWS B;  4NSB A;  2J4G A;  4AIS A;  4TVU A;  5ECU A;  1TUX A;  2CES A;  1HF6 A;  1EDG A;  4CN1 A;  2DQX A;  1GQJ A;  3L4T A;  2D1Z A;  3AQU A;  2X1I A;  1QI5 A;  1W1P A;  3UR8 A;  3VGF A;  3W25 A;  5E09 A;  1V3K A;  1OGS A;  2X0H A;  5BCA A;  1BG4 A;  1D7F A;  4AYS A;  5A6L A;  4UQC A;  1UKS A;  1UWR A;  5JUV A;  1HVQ A;  3CHE A;  1UA3 A;  3RO8 A;  1EQC A;  1OIN A;  3WDJ A;  2ZID A;  4PTM A;  3OLG A;  4F9J A;  4AWE A;  4OBS A;  1Q4N X;  2GK1 A;  2JEQ A;  3FAW A;  1EHA A;  4K68 A;  2E40 A;  1YQ2 A;  1C8X A;  4LYR A;  4MNK A;  2AOS A;  3W4R A;  3AIU A;  1JFX A;  1BGA A;  1MXG A;  5A6B D;  2E9B A;  1PJ9 A;  4V27 A;  1JZ7 A;  4W85 A;  3KL5 A;  2D2O A;  1FFR A;  4UQE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4LGX A;  1UWS A;  4XZW A;  2UY5 A;  1W1T A;  2O9O A;  3T2P A;  1BPL B;  2VZO A;  3PHA A;  4JCL A;  1E55 A;  1ITC A;  5GNX A;  1XYF A;  1FH9 A;  3VGD A;  4BCE A;  4GQQ A;  2QV4 A;  3JUG A;  4R27 A;  2HVM A;  3UG4 A;  1HL9 A;  1NWU A;  3QHM A;  5DT5 A;  3VDB A;  2A3C A;  1OGB A;  1TA3 B;  1W9X A;  4HOX A;  3CUJ A;  4PMY A;  4JKK A;  4DWS B;  4NSB A;  2J4G A;  4AIS A;  4TVU A;  5ECU A;  1TUX A;  2CES A;  1HF6 A;  1EDG A;  4CN1 A;  2DQX A;  1GQJ A;  3L4T A;  2D1Z A;  3AQU A;  2X1I A;  1QI5 A;  1W1P A;  3UR8 A;  3VGF A;  3W25 A;  5E09 A;  1V3K A;  1OGS A;  2X0H A;  5BCA A;  1BG4 A;  1D7F A;  4AYS A;  5A6L A;  4UQC A;  1UKS A;  1UWR A;  5JUV A;  1HVQ A;  3CHE A;  1UA3 A;  3RO8 A;  1EQC A;  1OIN A;  3WDJ A;  2ZID A;  4PTM A;  3OLG A;  4F9J A;  4AWE A;  4OBS A;  1Q4N X;  2GK1 A;  2JEQ A;  3FAW A;  1EHA A;  4K68 A;  2E40 A;  1YQ2 A;  1C8X A;  4LYR A;  4MNK A;  2AOS A;  3W4R A;  3AIU A;  1JFX A;  1BGA A;  1MXG A;  5A6B D;  2E9B A;  1PJ9 A;  4V27 A;  1JZ7 A;  4W85 A;  3KL5 A;  2D2O A;  1FFR A;  4UQE A; 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