3W6Y | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with TT2-2-199 rcsb
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	105
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w6yA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w6yA01

4TX9A 2GVLA 3CB8A 4O4VA 4ZQOA 4GFSA 1VYRA 1K7XA 2ZYFA 5K7JA 2YZRA 1A53A 3N14A 4NQ1A 4CQAA 1Q6OA 3ATZA 1W31A 3EXRA 1ZAHA 5D30A 2VENA 3ABQA 1DORA 1TB3A 4JDBA 1H63A 2FPVA 1F05A 4N6FA 1DVJA 5AHLA 2NWRA 3SGZA 4E2DA 2P0OA 1OX6A 5C5YA 3T55A 3IVSA 3HO8A 4EWND 2Z6IA 3DZ1A 3GKFA 4JY9A 3UWYA 4LW7A 4A2RA 4AEOA 3NPXA 1A5AA 4JS3A 1NF7A 1EWEA 2DZPA 3FFSA 1H1ZA 2CLOA 3YPIA 5K9DA 1K3UA 2RHGA 4JYFA 1UB3A 4HSNA 2CZEA 5CG7A 4IMDA 4ZL1A 4JTHA 3M7WA 4HIBA 3LERA 1G4TA 4JTSA 3P61A 4MY9A 1EB3A 3O8AA 4A22A 1OVDA 3W2KA 3I7QA 4O1CA 1F7BA 1AG1O 3W75A 2Q8ZA 3N3MA 1YDVA 2PE4A 2VC6A 2ZZ6A 5K4XA 5EYWA 3NQEA 5D38A 1I4NA 2CW6A 2D73A 3NL2A 2NX9A 2Y7FA 1RZMA 2RDUA 3G22A 4I7VA 5D37A 4O54A 1X7FA 1IXPA 3EXSA 1TTIA 1H60A 5IBXC 4ZZ9A 5AC6A 3L65A 2C3ZA 2OMAA 2QR6A 3DFQA 4G1KA 1EUAA 3LM7A 1H62A 1VRDA 1OABA 5D04C 3VI2A 4PC8A 3BGGA 5AC7A 4UTWA 1LORA 2Y7GA 2DP3A 4I7WA 4O10A 2R14A 5EMUA 4AWUA 2ZZ5A 2HS6A 3JR2A 1SFJA 3B0UX 3Q94A 4PA8A 2GJNA 4NJHA 3CEPA 2DZXA 4RZ5A 1QMLA 4MLRA 4Z0SA 3M9YA 3L0NA 3TXVA 1M5WA 2GVGA 2NWSA 4MY1A 3HPZA 4WY0F 1BKSA 4O0KA 4LS1A 3TQVA 1KM6A 3WJZA 1ALDA 3OIXA 2WKJA 5AN7A 1TTPA 1FCVA 2V2CA 3FS2A 2V5LA 4O28A 3TQ0A 3TAOA 3H54A 1XUUA 3O15A 4AWSA 1G6CA 5CGQA 4A21A 1O5KA 4RXGA 2NUWA 3RLVA 5IM51 3DGRA 3SGUA 2NLIA 4XBKA 4CLMA 1KV5A 4JR5A 3LHYA 4W9TA 1W3TA 4FNUA 3E96A 1TQXA 4IMGA 1KFBA 3WK0A 1H5YA 2CLIA 2V8ZA 1LCOA 4TO8A 3D0CA 3IVUA 1B3OA 1M7PA 2V82A 1YDOA 2ZDRA 2ZFAA 3MP5A 1I2NA 5EL1A 3MI2A 4O16A 5FEPA 4MFDA 1SO3A 2A7PA 3NM3A 5F1VA 3CPRA 1EA0A 3C2VA 3SI9A 3TV8A 2IQTA 3DI1A 1TPEA 1GVQA 4R33A 4UTLA 4JTFA 2FPTA 5KZEA 3TFCA 3F4WA 4Y96A 3W1RA 1VGAA 2W79A 3HB9A 4AXKA 4MJZA 4OV4A 2ATMA 5TIMA 4O1AA 3W7GA 4K7VA 1KA9F 1GG0A 4JTUA 4XTDA 3IRDA 1YADA 2QCNA 3CM4A 4PEKA 2C14A 3G1XA 3DI0A 3GXTA 3C56A 2GVJA 5D2WA 3C8FA 3LCFA 2FIQA 1DHPA 3KVJA 4LNYA 1SSDA 2VOMA 1XM3A 1OK4A 1F2JA 3P74A 5DLCA 3STEA 3E02A 4AHPA 1TMHA 1PCKA 4O11A 2X16A 1IIGA 4E0CA 4YCPA 3UWUA 2CLKA 3L9CA 1THFD 3PBYA 2Y89A 4AB4A 1B4EA 3LBMA 2NX1A 1KTCA 4UTWC 2J9ZA 1WA3A 3RMJA 1GVFA 1SQ7A 1F73A 4K39A 4NXSA 1I45A 3BW3A 4ZQPA 1OHLA 2C18A 3PBVA 1HO1A 2ABBA 1FWSA 1HO4A 3STFA 1PE1A 4JDYA 4JNMA 2VXNA 3G8EA 2LLEA 1A5CA 1XXXA 2AQWA 3TR2A 3W84A 4UTIA 5H91A 5BMXA 2ZA1A 3M5XA 3FKKA 2EGZA 4TIMA 4MZ1A 3S5OA 1BWKA 4OV9A 1AW1A 1SUXA 2OJPA 3WK2A 4UR8A 5DY3A 3PC0A 3WK3A 4FO4A 4LC8A 2QF7A 5CPOA 4YXGA 2AAMA 2NXHA 4AF0A 3NQ6A 4RZ6A 4FNQA 4FX8A 1OK6A 3M43A 1VHCA 3LI1A 1MZHA 4M6PA 1PV8A 3UWQA 3CEUA 1GJPA 3TJLA 2A2IA 1LBFA 1OF6A 4EOUA 1W54A 1I2OA 1JUEA 3IV3A 3ANYA 5F2GA 4FXRA 1XBXA 5G2IA 1G4SA 2A7RA 2ZA3A 5G5IA 4Y6GA 1FCQA 1R46A 4LTSA 1VLIA 1W8SA 3PSWA 3N19B 3KVKA 3GK0A 4U28A 2JKPA 1GYLA 1YTKA 1KBJA 4JIPA 3HPSA 2EKCA 2QCGA 2BTMA 1NVMA 1DJNA 5I3IA 3N9RA 3P80A 1LRQA 1PVNA 4LOCA 3LB0A 4ML9A 3NQ2A 4UXDA 4MPQA 1LOLA 3EWYA 1KM0A 1KLZA 3NPWA 5F2IA 4LC6A 1FWRA 1KTNA 4JYEA 2QAFA 4K6AA 5DCEA 3W7MA 2V30A 5FEXA 3PSVA 2QAPA 1NSJA 4GBUA 1XUZA 3G3DA 3QF0A 4O1DA 4P61A 3I7RA 3MI3A 4M6VA 4A3UA 1QCWA 5AHMA 3W1XA 3G1FA 4CQ9A 3W23A 3G3MA 1DKWA 1TJRA 2GUUA 3DENA 2VFGA 1UJPA 4TMBA 5HNRA 1JRBA 5LNSA 4O19A 3UPBA 1QWGA 2ISWA 3VKJA 5F4WA 4JGDA 1GEQA 2ISSA 2EPHA 4AVFA 5AFDA 5H2ZA 2A6LA 3VFLA 3ZR4A 1PL9A 2WOQA 1XBZA 1KM1A 4NNBA 1TV7A 3LXAA 1XDLA 1MEHA 4JTGA 4ADSA 3W2LA 1LBMA 1RVGA 5F2LA 4MLJA 3UQNA 3W7CA 4O17A 1D3GA 4AHOA 1OFDA 2BWGA 4HSOA 1LLZA 3IIPA 4R7JA 3HG5A 3W76A 4Z08A 3W2MA 1H50A 3NQ8A 4HNVA 2P1FA 2FQIA 1YTEA 3N34A 5CZTA 4O50A 4LVAA 3TK7A 4UMAA 4M7TA 5LKYA 2CLMA 2EHHA 1VCFA 5K3VA 3C3NA 1ZCOA 1SW0A 1VH7A 3DU0A 3GYEA 3CIWA 3CQ0A 2FTPA 4UFIA 4HPXA 4AF0B 3C2EA 3T78A 5HWMA 1XBVA 3QSTA 4FX7A 4DQWA 4MFEA 4FX6M 4Z1BA 1A5SA 3TU9A 2V2DA 2WSQA 2QCLA 3W1TA 3B0VC 3GNNA 3NQVA 4O52A 5AHNA 1ZNNA 2QCCA 2TPSA 2YDAA 2YYTA 3G1VA 4HNNA 3PR2A 1WDWA 4RKAA 3NPUA 2WSYA 1LP6A 5DCBA 4DXVA 2V5BA 2VEMA 3JS3A 1XC4A 2CLHA 3WFAA 4HNUA 1H7RA 6TIMA 2YFOA 4UTTC 2V9DA 1SW7A 2ABAA 1WOAA 4Z1CA 3NXFA 1X6UA 2W0UA 4O0ZA 5FF7A 1YDNA 1EX5A 3GX9A 1FWWA 1L2UA 3B8DA 1Z41A 2CLFA 3NYZA 5C55A 3W85A 4ADUA 4DPQA 2X1UA 1O95A 4MYXA 2GJLA 3QH2A 4FNSA 2ZBTA 5HR6A 1Z42A 3QMSA 4NX5A 4HT3A 3WJYA 3W74A 1H1YA 3QZEA 2Y70A 2FPYA 4CCEA 4PL1A 2TMDA 4DELA 1JCYA 5FF3A 2A21A 4PFMA 1VCGA 1J2WA 3E9AA 3N2MA 4GUJA 4O18A 4X9SA 3TW6A 4LUIA 1G69A 4ORMA 5D2VA 4DO6A 3FKRA 3EX6A 1E51A 3G1HA 1YPFA 4N9DA 3C2RA 3DAQA 1CX9A 1H51A 4GRSA 1Z48A 1TTJA 4O4WA 3UWWA 1BWLA 3WK1A 2WJZA 4HKPA 5CPMA 1YYAA 1K7EA 4NXKA 1EIXA 4C1KA 1JULA 1MO0A 4N6EA 4WXYA 5CSRA 3W7IA 1XCFA 1ME7A 3G1SA 2C6QA 4ZVJA 2E09A 2H90A 2UV8G 5BW6A 3TIMA 4NJIA 1FDYA 5KZMA 1N55A 1VS1A 1XL9A 3M16A 2CFFA 5DY2A 4A2SA 1VLWA 3QFEA 3DFTA 3GXPA 3NQAA 1YXYA 1BEUA 1ICPA 3HJZA 4PCFA 3GKAA 4JD4A 2CLEA 4YLWA 4LRSA 3L0GA 4QQ3A 3GDLA 1NF0A 1B9BA 5DXYA 3S5NA 1SO6A 1NAL1 3CHVA 2G97A 3QEZA 4GUIA 1SO5A 1TCDA 3BLIA 1JQXA 4RXFA 2FB2A 1RV8A 4OHQA 2YCEA 4JY8A 1TQJA 1XI3A 1SSGA 1KM5A 3DFOA 3SW6A 5HUPA 4DBDA 4OT7A 3TAKA 4DF0A 2H8ZA 4UTJA 1OG0A 3O05A 1OJXA 2WPBA 3MO7A 1FQ0A 1LDCA 3LHUA 4JYDA 1T8XA 3PS7A 3W72A 2VFDA 4FXSA 5EKYA 3W7NA 3LOTA 5FF0A 3QPYA 4O14A 5LNRA 1ZY9A 3S42A 5AHFA 1YXDA 3LCGA 3EX2A 4KFOA 2OZ0A 1SO4A 1ADOA 3W70A 1KM2A 4LS2A 2BX7A 1ZFJA 3ABSA 1QOPA 3R2GA 2P10A 4GUGA 4K38A 3W7KA 3UY8A 3R12A 4JX4A 2QUTA 3S1WA 4N9EA 3W86A 1L6SA 4XZ9A 2RFGA 1IXOA 2NV2A 4UFKA 3IIXA 3TA6A 3F03K 1ICSA 3PB2A 1R47A 2PCQA 4N9BA 2A7NA 1RPXA 1I2QA 3NQMA 4IWWA 5C54A 4UFHA 3BGJA 2O7SA 3GB6A 1G4EA 1N8FA 2JGYA 3W7HA 3W1AA 3W1LA 1A50A 2QJHA 4MVAA 3GXNA 2YXGA 4BWLA 5K9CA 1O5XA 1TPUA 3EWWA 2A1YA 4NUWA 4EF9A 2CZFA 2WNQA 3W7QA 3LRKA 3SJ3A 2Q3OA 3LLDA 4MOZA 1S5TA 5TBOA 4POCA 1ZJIA 1G4PA 4UC5A 3NQDA 3W1MA 3WJXA 4O53A 1D9EA 4DF1A 3RK8A 1O60A 3W2UA 1AW5A 3OEXA 3SR7A 3DFPA 5I3HA 2H8XA 3TQKA 2EF9A 1DBTA 2F84A 3H55A 3TC7A 2JBMA 3OG3A 5D05A 2QDGA 3L68A 4TU1A 3SSJA 1LOSA 1GQNA 2JK2A 2QJGA 3EB2A 5DELA 1W5PA 2VFIA 1OFAA 1RQHA 2ZRUA 1FXPA 4NNCA 1HUVA 3LTSA 1EP1A 4FF7A 1SZEA 4TR9A 1TRIA 1F6PA 5AHEA 1CW2A 4CCDA 4JTKA 4LUJA 2A0NA 3KVMA 3NQGA 4RLIA 5U7SA 3L67A 1OX4A 4Q33A 1SW3A 3MYOA 4X3ZA 1KTBA 1ZAIA 2J9XA 3QC3A 3AJXA 4WUIA 1AL7A 1HG3A 1DL3A 3NL5A 5D2TA 3P67A 1Q6LA 4RZ4A 2Q8LA 5LZLA 2XN2A 1TPC1 4XKYA 4MKNA 3UZ5A 3KAOA 1Q6RA 4RK8A 1TYGA 4GE8A 5L6UA 1ZHAA 4Y90A 3TDFA 1KM3A 1B57A 3HF3A 2ZRWA 1EP2A 3LCHA 3TX9A 3IIVA 1BTMA 1D3HA 5EY5A 1SZGA 3MBFA 4FEZA 5BMWA 4QITA 2I1OA 4UR7A 4NT0A 1KBIA 1DV7A 4KWWA 4WOQA 5LHFA 1GZGA 3P8IA 2I9EA 1TPVA 3CWOX 1S3HA 1LOQA 4LVGA 3R89A 3S6DA 1TV5A 4O13A 2YYUA 3LHZA 4YCOA 3P5ZA 1X8FA 1JCXA 2DZTA 1EWDA 2E6YA 2DJXA 1K02A 3GR7A 3ATYA 4OBTA 4UFLA 3UNDA 1AL8A 4ONVA 2B7OA 5FESA 3LI0A 3GIYA 3TSDA 1JCMP 3TXZA 1RD5A 1TV8A 2WNNA 2ISVA 4R34A 1L9WA 2A5HA 1AW2A 5HWNA 5DBTA 3THAA 5D03A 5K4ZA 4ORIA 1FCBA 3RLUA 3SY5A 3A24A 1HL2A 2VEIA 5CKSA 3W7PA 3OA3A 4DEFA 1YPIA 3IVTA 1OFQA 1LBLA 2FDSA 5DCDA 1ME9A 3BG9A 4ZQCA 2YX0A 3QPZA 3O06A 2Y85A 1RR2A 1ZENA 1V7YA 3BW4A 2YW3A 3S5ZA 3A5VA 2GQ9A 5KZDA 3W88A 2GQ8A 4JTLA 1LRTA 1J5TA 4QNEA 3O16A 4EIVA 4UFJA 2ZRXA 3ZWTA 1Y0EA 4GC4A 1OYAA 4NJKA 1P1XA 3HOJA 3PUOA 3ELFA 1A5BA 2DZVA 3EWXA 2CU0A 3NO5A 3MP4A 3LTPA 4GUHA 4TMCA 4FHAA 1LROA 3E0IA 3QQ1A 3N9SA 3HG3A 1TPWA 3PAJA 1WV2A 2R94A 4WD0A 5A8GA 3BG5A 3BVJA 1HFBA 3KFTA 4Y9AA 4XWUA 5D2XA 1WAUA 2YSWA 1ONRA 3THQA 1OX4B 3UZJA 2PURA 1WXJA 3LGEA 3STCA 1VJIA 2VFHA 2QDHA 1O94A 3HBLA 4HNTA 3UXAA 4UTMA 3A22A 1H7NA 1T96A 3MBDA 3C61A 1ZAJA 4XKYB 2G95A 1OYBA 1XKYA 4FB7A 3C6CA 3RF9A 2X1SA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W6YA

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Chord Diagram

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