3W6Y | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with TT2-2-199 rcsb
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	105
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w6yA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w6yA01

4WOZA 4CCEA 3N73A 4NJJA 3V75A 2E5CA 3G3MA 1RZMA 3O05A 2WNZA 3W7PA 4HNUA 3C56A 1YLVA 1F5ZA 1GEQA 7TIMA 3RK8A 3EEGA 3S42A 1R30A 3P74A 1GYNA 1P1XA 3FKRA 2WOQA 3GX9A 1A5AA 3IIZA 1XFBA 1AW5A 4OQVA 1LYXA 2FDSA 3M1ZA 3RFAA 2P1FA 5G2WA 4UFIA 4WXZA 3QQ1A 1OX4B 3M5YA 3H53A 3EWWA 1T8XA 3G3DA 3PBVA 3LHYA 1OHLA 5AHFA 5AOUA 3LXCA 4BK9A 4FX7A 3L65A 1TJRA 1R2SA 2BTMA 1XL9A 4GE8A 3LDVA 4JYFA 5BRBA 4NNCA 2Y89A 2H8XA 4GUIA 4QSHA 4NNBA 3UYCA 2V5BA 5HULA 2A2IA 4O11A 4NZFA 1TPDA 1K8XA 5KMYA 4UCGA 5D04C 2FJKA 5U4NA 1GTHA 4JTFA 4A29A 2G97A 3DU0A 1GOXA 2YFNA 3NEVA 3CLMA 1CX9A 3DXIA 4DF2A 1OX4A 1SZNA 2PURA 3EXRA 5EPDA 4JEQA 1XBYA 3E02A 4UUIA 5AHLA 5DY3A 5CSRA 2QDGA 1KTCA 3LLFA 3TDFA 3W7QA 3TXZA 3W23A 5LSMA 1IF2A 4H3DA 2TRSA 1OFRA 2V8ZA 1SU5A 3C52A 4ORMA 1GYLA 3GKAA 1R2TA 1AK5A 3DKLA 4RX0A 3QYQA 5HR6A 5HINA 3EX1A 4JTTA 2Y88A 1S5TA 3HMJG 1XUZA 5KITA 1M5WA 1EUAA 4YWIA 3CEPA 3W7DA 1MO0A 4GJ1A 1RPXA 4JX4A 5DCEA 3QH2A 1W54A 1D3HA 3KRSA 3NQ7A 3HG2A 3GR8A 3LRLA 1WX0A 3NM1A 3ABSA 4E2BA 3DFSA 4WZHA 3W7MA 3UWYA 4PFMA 1QNVA 3M9YA 3ZS4A 3G1YA 2ZZ6A 3MO7A 3PF3A 2X1SA 3TJXA 4RXGA 2DZTA 3F03K 4Q4KA 1JCNA 3LXBA 1VYPX 5F2IA 1N8FA 3L2IA 5D05A 3STEA 4AXKA 5LNSA 4XBSA 2ZZ4A 3N9SA 3MUXA 4DF0A 3GLCA 4AHPA 1F6KA 1EPXA 4MOZA 1ADOA 1KFEA 4E0CA 4ZQRA 4LW7A 3C2VA 4GUHA 2ZTKA 2B0MA 4YMZA 5EBUA 2VC6A 2WSRA 4TO8A 4OBTA 5G4WA 5EL1A 2B7OA 2GUUA 3EKZA 4LU0A 4NVTA 2F7FA 3PVFA 3LRMA 2X2GA 2CLEA 3P8JA 3FLUA 2ZCGA 3GDKA 2DORA 1OVDA 4LUIA 3GXPA 3KHJA 4MY8A 4HHPA 4UTLA 1GVFA 4JTIA 2ZRWA 3NQVA 3QRHA 3TSMA 3BW4A 3A22A 2D73A 1XCFA 1J4EA 4XTDA 2GJNA 3PC0A 4OWGA 3L5LA 3M44A 4IWWA 4NNAA 2F84A 5K2ZA 1I45A 3W7JA 1SR9A 1P5BA 3FEMA 2ZBTA 1C9DA 3B06A 1ZAJA 3M6YA 1HL2A 2EKCA 3NL2A 4DBDA 4O4WA 5LKYA 4M7SA 1N7KA 4M7TA 4KKXA 3KVKA 1P4CA 5DLCA 4PEKA 5I3FA 4FB7A 4JICA 3WJYA 3BPWA 3E49A 3B05A 4IUOA 1YTEA 1L6SA 4I7UA 3UY8A 1C29A 2Y6ZA 4LVBA 1Z41A 3IRDA 3BARA 3WJSA 3MHFA 1UUOA 3WK2A 5K7JA 5GVJA 3TQVA 4HIBA 3PUOA 3NYZA 2V5LA 1I8JA 4GC4A 2FPTA 4UFHA 2VFGA 3T7VA 1JCYA 3GXNA 4MVAA 5E0KA 2Y7GA 5K9CA 1ME7A 1ICQA 3EX2A 3DFTA 4GWEA 1KFJA 4WY0B 3LBCA 4O18A 1SO4A 1KLYA 4N9CA 4WUIA 1H61A 1A53A 2C14A 3KVMA 3HGOA 3I7SA 3LCGA 3PULA 4CQ8A 3GK0A 3HPZA 3W88A 2DZSA 3KRUA 1JUBA 2A1YA 4YXGA 3LB0A 3N34A 2QJHA 2KZHA 2V82A 4QM1A 1G4PA 3L5AA 4JYDA 2E6YA 3TNOA 3JS3A 4JD4A 3CM4A 4I7VA 2HTMA 4RZ4A 1H7PA 5KSWA 1H7NA 2B7NA 3L68A 2XFWA 4FHAA 4MZYA 5AC7A 3PG8A 1JUKA 1XC4A 1YPIA 4UTTA 4C1KA 3KVJA 1OF8A 2X1UA 2ABAA 3PS7A 4ZMGA 4FIRA 3G0UA 4AHOA 4WY0A 2V9DA 3GXTA 2B4GA 5KZMA 1OFOA 3W2MA 1RQHA 1IXNA 2Y85A 4FNPA 4M6QA 2YZRA 3WJXA 2QCHA 1F73A 3NL5A 3P7YA 1Q6LA 2QCLA 2FTPA 1OF6A 1AW1A 2Y70A 1LRNA 4EIVA 4ZQPA 3UWUA 1JUEA 5MHBA 3L21A 3EWUA 3JR2A 1KM5A 3P61A 2AGKA 1QPOA 5FEXA 1TPH1 4KFNA 3LHUA 3PSVA 4M6VA 3UY7A 3T4CA 5AYXA 3FJ6A 1XKYA 5AYZA 1LLWA 1JRCA 4FX6M 4JIPA 2E6DA 4UR7A 4G1KA 4RV8A 3KFTA 2Q3RA 3IIXA 1TQXA 3UNDA 2QJGA 4BI5A 3NQ2A 3PBYA 2XN0A 3OBKA 1S3HA 2ZRVA 1MXSA 3ABQA 2ZZ7A 4XKYA 4JTSA 1EWEA 1RV8A 2R8WA 2ISWA 1EA0A 2HMCA 3TMLA 3SIZA 3CTLA 1F74A 3G1XA 4Z1CA 3WK3A 4O13A 3QEZA 1SW0A 4TR9A 1TPWA 3THQA 4E38A 3T78A 2GOUA 2NLIA 3EX4A 4QISA 3G0SA 1NEYA 3ATYA 4LNYA 3TH6A 4ZQOA 3PSWA 3UWVA 5BNKA 4OV4A 1KLZA 2ISVA 4UTJA 1DHPA 3FKKA 3B0PA 4O12A 1AL7A 3QMRA 2A6NA 2ZFAA 3TJLA 3IVTA 4O8RA 3FFSA 4O17A 4UFLA 3TSBA 5E93A 3MMTA 2DJXA 3LTYA 1FDJA 3MYOA 4UTTC 4RZ6A 4IX0A 5LGXA 4GBUA 5AB3A 3W7EA 1SSDA 4OU1A 4LS0A 4PC8A 2J9YA 5BMXA 4ZL1A 1O5XA 2UV8G 3TR2A 1DKWA 3UPWA 4Z0JA 1W5MA 3FS2A 5CPLA 1TPVA 3SI9A 2YSWA 2CZDA 1BEUA 4JTGA 4PH6A 1FWWA 4S1FA 2QCMA 1X1ZA 4H6KA 3B8DA 3CC1A 4WOQA 2QAPA 1XDMA 3P5ZA 4POCA 5LGZA 4JGDA 3P62A 3VE9A 1Y0EA 4AAJA 1O94A 1S5WA 3TROA 3QFEA 1G4TA 3NPWA 4L4LA 1DJQA 1H1ZA 3P82A 1GQNA 1I2QA 2NXIA 4MFDA 3RNDA 1G4EA 1VLIA 1L9WA 1AMKA 2NV2A 5D32A 1EP3A 2RKXA 2G5WA 5CZSA 2GQ8A 4JY8A 1RQEA 3NQDA 5C2XA 3G8EA 1RQBA 3HIJA 3THAA 5J5DA 3IIVA 3NPUA 4JIQA 4MKNA 2OT0A 4RCXA 3P8IA 4NZJA 3UWWA 3CEUA 5D2VA 3W1LA 4TMCA 1HO1A 2VEMA 3W7LA 1LOQA 2WSYA 3B04A 4UMBA 1OFDA 2ISSA 1WAUA 3S1VA 3BV4A 3HJZA 4NXSA 5BOOA 3LERA 4P61A 1FX6A 5FEPA 2O7QA 1OK6A 3FA5A 1TTQA 3C2RA 1SW3A 2YFOA 4IGHA 3MBDA 3S1UA 3SGUA 3S0CA 3UZJA 4EOUA 1CW2A 3B0VC 3AO0A 2EPHA 4RK8A 1NFBA 5F4WA 3W1PA 4AF0B 1OJXA 3QM3A 4JR5A 4MFEA 3QSRA 1XXXA 2DP3A 5TQLA 3P60A 1B9BA 3HPSA 2VFIA 2TMDA 2V81A 3QMSA 1NSJA 2BWGA 2C0AA 1A50A 4JS3A 1EX5A 2E1DA 4K38A 2CWNA 1TRDA 3EB2A 4R34A 4JN6A 1LTDA 3I65A 1FXPA 3LCHA 5F4SA 3STGA 3O06A 2DZWA 3WJWA 1SZFA 3NR0A 1ALDA 1TPEA 2YGYA 4JYEA 4LRTA 4YCPA 4YL2A 4ALDA 1VCFA 1T0OA 4ORIA 4OGZA 5A5WA 3RF9A 1WDWA 1QWGA 4OHQA 4N6FA 3QW3A 5I3KA 1O4UA 2QCFA 2R91A 4AF0A 3W7OA 4LS1A 3GAYA 5FF0A 2EAWA 2E5DA 1LOSA 4MYXA 3WFAA 5DCBA 3U6WA 1K8ZA 1IXOA 3Q37A 3W86A 1W3TA 3L5MA 4QITA 2NWRA 3GKFA 3OHIA 2G96A 4O57A 1VR6A 2C1HA 3Q94A 3O1NA 1UBSA 3W1TA 1DQWA 3E96A 3NM3A 4JDBA 3NGJA 3BGGA 5D2XA 3STFA 3DI1A 2QEZA 1W5OA 3LM7A 1FDZA 3K30A 2NUXA 4Z08A 1IXQA 1I2RA 3CQ0A 4J9JA 4IOTA 3GYEA 2WV8A 2XN1A 1TB3A 1K7XA 4GNJA 3TC7A 4BF9A 2J9XA 1FCVA 2PRMA 1N55A 3KOFA 3IV3A 1YPFA 1A5BA 3M16A 1YDNA 4QAIA 3W7RA 3HG5A 2PE4A 2X16A 4O19A 3W7NA 1TPUA 2P10A 2WSQA 3NZRA 2FPVA 3TW6A 4AB4A 5SWUA 1L6YA 4TU1A 3L0GA 1YXDA 4M19A 4NQ1A 1PS9A 1EUNA 1KFCA 1PIIA 4YCOA 1PL9A 3S5YA 4NJGA 2CLIA 3MYPA 4RZ5A 3MBFA 5L6UA 1H63A 3B4UA 3TFXA 1VPXA 1UB3A 4GRSA 3W75A 3W3OA 4CCCA 1W31A 5D09A 1Q6QA 3PM6A 5DBTA 3MW7A 3TFCA 1XBZA 5CG7A 1LBLA 3ZR4A 4XZ9A 1H62A 1TJPA 4AMAA 3U2OA 3PUEA 4XBKA 3LRKA 1VRDA 3L66A 3LV5A 4Y8FA 2E68A 2NXGA 3GVGA 1KFKA 4LT9A 1LP6A 3FIGA 4AHQA 2RFGA 4TX9A 1FUYA 2BLEA 4KFOA 2ZRXA 3NZ1A 5LNUA 4O0ZA 1QPNA 2QAFA 2GQ9A 2NXHA 3N3MA 3LHTA 4MJZA 3H54A 1LM1A 3W83A 2OCZA 4JTHA 1MSSA 3CWOX 3R2GA 4CQAA 2E77A 2H6RA 3C8FA 3A5VA 2X1RA 1H7XA 5FF3A 5HWNA 3O16A 4K7YA 1F6PA 1OFAA 2R94A 4UC5A 4NU7A 3UWZA 2H3BA 3IVSA 2ZA3A 2QF7A 3W6YA 3W1QA 3NPXA 2ZZ2A 4GXMA 2J27A 1W3IA 5KTLA 3INPA 4K36A 3QSTA 1XM3A 3DGRA 1JR1A 1HTIA 4QJ1A 3TAKA 2CLHA 4WXYA 1THFD 1Q3NA 1GJPA 3GDMA 4K8EA 5HNRA 3WJZA 1BKSA 3QQ0A 3BW3A 4M6PA 5CPMA 1EB3A 5FI8A 1QR7A 3M43A 3LCXA 3UD6A 3DH7A 1BTMA 4ADTA 2QKFA 1K02A 3EWXA 4HSNA 2CZFA 2VFFA 3PBWA 1OABA 1PHWA 5D37A 3KVLA 1VYSX 1KBJA 1MEIA 1OFEA 3EX6A 1ZFJA 2FB2A 2BXVA 4LS2A 1H7OA 3GAKA 1BWLA 1XI3A 5K4ZA 3PG9A 1DORA 3PUDA 3I7RA 3ELFA 1TTIA 1H5YA 1QPQA 1XUUA 1P0NA 6TIMA 4A2SA 1YTDA 3DI0A 1YXCA 4KWWA 1A5SA 3DFQA 3NL3A 1ZNNA 1G7UA 4UTWA 2OT1A 3G1SA 4NX0A 1GZGA 3HG3A 1FCBA 5K9XA 4EVZA 1PCWA 2JGQA 4MIMA 4ZVJA 5H2ZA 2VFHA 4UTHA 3TU9A 2YYTA 4B5NA 4WX2A 3G1AA 2X30A 4FIQA 3RMJA 5E1QA 1DOSA 4X2RA 3BG5A 2A4AA 3HGRA 3B03A 3W7IA 5I3GA 1TV8A 4LWWA 5DXYA 3EKLA 1FWTA 1WXJA 1I2PA 2NX1A 4FNTA 3LI1A 2VKZG 4MY9A 3KAOA 4W9TA 2C15A 4ZQNA 2YW3A 3S1WA 1GT8A 1QPRA 2JKPA 1V5XA 1YDOA 3L9CA 3VI2A 3QW4B 2I14A 3D0CA 2C6QA 4Z1DA 5FF4A 4JTUA 1V7YA 5G1YA 1WOAA 3HO8A 3MP5A 3GZ3A 3CWNA 4UXDA 1KFBA 5A8GA 4NJKA 4O14A 1WQ5A 1FWRA 4HKPA 3IIOA 4IXXA 1QOPA 3M5ZA 4XKYB 1W5NA 3FJLA 4JNMA 3TV8A 1K8YA 3W1RA 3TW7A 1M6JA 2V0TA 1KM2A 2VOMA 4Y90A 1SUXA 5AC6A 2E6AA 4UFKA 2E5BA 3O15A 4FXSA 3MI6A 2DZPA 4O15A 3STCA 2HS6A 1GG1A 1JJKA 4KWVA 3VCRA 3OEXA 5C5YA 1ZHAA 4RJEA 3W74A 5I3IA 2VEIA 3W2NA 1QO5A 1UJPA 1QOQA 3GNNA 4LV4A 5G4EA 3LXAA 2Y61A 1WBJA 3E0IA 4A3UA 4JX6A 3A23A 4CNPA 1DVJA 1IXPA 4WD0A 3O63A 1CI1A 5LHFA 4UTWC 2QCDA 3NPVA 4JTKA 1PV8A 5BW6A 5CPOA 2YPIA 1Q6OA 1B57A 4Q33A 2YDAA 3G22A 2ZRZA 4HNVA 1JRBA 5D30A 4IPJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W6YA

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