3W7C | Genus

Total Genus 108

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	108
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-077 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	108
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7cA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7cA01

4JS3A 3GX9A 3TJLA 3W83A 3W74A 2FIQA 4O8RA 4JYDA 4PH6A 4LVAA 2V5BA 3W70A 1GG1A 1V7YA 3DI0A 1PHWA 5DBTA 5HWMA 2X1SA 3HIJA 3F03K 4O11A 1R47A 2QCDB 1GT8A 3S5ZA 3O6CA 3FJ6A 1E51A 5F2MA 3STGA 1RR2A 4Z1BA 5C5YA 5AHIA 5FF0A 1LOQA 3TUUA 5FESA 2WOQA 3NQFA 2QAPA 2CLFA 3F4WA 1VHCA 2YPIA 1ZNNA 2CWNA 2NV1A 4ONVA 2TSYA 4GBUA 5D2WA 4CQ8A 1NAL1 3O15A 1W37A 5DLCA 4ZQPA 3VE9A 5H2ZA 3E12A 2NXHA 3C3NA 5K9DA 3B4UA 4YMZA 1U5JA 3V1PA 1EA0A 1KV8A 1SW0A 1OYBA 3N2MA 4JYEA 1I4NA 3P5ZA 4JX6A 1BWLA 4FB7A 1IXPA 3M5YA 5EA9A 3CHVA 5FEWA 2BWGA 2JKPA 3WJYA 1H7NA 3NZ1A 4NNAA 3GKFA 1KFCA 3EWYA 2ZA2A 2DZPA 4UC5A 4PA8A 4A2SA 1JUEA 1Q6QA 1SUXA 1AMKA 3PB2A 1L2UA 4BK9A 4Y96A 4O54A 3NXFA 1BEUA 4PTNA 3PSWA 4FIRA 3NQVA 5F1UA 3OVQA 4ZQMA 3MBFA 1TJPA 1KBJA 3BG9A 3E96A 4GC4A 5D33A 2V2CA 3A24A 3KVMA 4JTKA 1NF0A 2XN2A 1TRDA 3MP3A 4O12A 2I14A 2ZZ3A 5KITA 3STCA 4ZQCA 3HMJG 3DFSA 4MY9A 3BPWA 5AC8A 3M5ZA 2OT1A 5CPNA 1K7FA 3GR8A 2DZUA 1F73A 1VYRA 3PSVA 4JY8A 2RKXA 3C2EA 1X7FA 4ORIA 3HBLA 4TU1A 2CZFA 4IGHA 1I2OA 4LVDA 3UPWA 1S5TA 3GDMA 2AQWA 5LNWA 2ZBTA 2GJNA 1YTEA 1UCWA 3W7OA 3I68A 3DFTA 4AEOA 1XM3A 3WJSA 5LKYA 3L5MA 1ML1A 1V5XA 2CLHA 3DI1A 4Y9AA 3IGXA 2JGQA 5DBUA 4N9CA 4MYAA 2FPTA 5G1TA 1P4CA 3C61A 3DXIA 3M41A 4CLMA 1LZOA 1SFLA 1THFD 1VPXA 3LV5A 3TR2A 3W7RA 4WOQA 3TMQA 3MWAA 5D03A 1VHNA 5E1QA 1X1OA 1MXSA 1G4TA 5EPDA 1OFBA 1VLIA 2ZRZA 4TX9A 4FO4A 3UWVA 4O18A 4NJJA 3MO7A 4H6KA 3UNDA 1T8XA 4R7JA 1AW5A 4HSNA 3TDFA 4LY8A 2QF7A 4I7UA 4KWVA 1W5PA 3TX9A 1W3NA 3EX4A 5BRBA 1B9BA 3C2RA 4K7YA 2V82A 2YX0A 3EWXA 4NU7A 3KFTA 5C2XA 4K7VA 1KTBA 2B7OA 5F4XA 1SO6A 3CIWA 5KMYA 5G2IA 1TTPA 1W31A 2FQIA 2EKCA 4O1BA 4UXDA 3P80A 5DY3A 1GG0A 4NJHA 2QEZA 3WK1A 3T44A 3UWZA 2FB3A 2G96A 3BLEA 2CU0A 1YDOA 1VZWA 5KZDA 3DHDA 1KFBA 3MHFA 3G3MA 4KKXA 1SZFA 4OHQA 4G1KA 3NL6A 4LS0A 2WSYA 1R2TA 3LV6A 2QDHA 3MHUA 2E6AA 5I3KA 1SQ7A 2BLEA 2YR1A 5CZSA 1M6JA 4ZL1A 1LOSA 5A8GA 4UTTC 3ATZA 3B0VC 3QW4B 2DJXA 4WJEA 5KINA 1WAUA 1QMLA 2HS8A 1GPWA 2HS6A 3GYEA 1YPIA 3O63A 1M5WA 1QPQA 4PC8A 3NAVA 4JD4A 1TRIA 2QJHA 1VRDA 2A6LA 3P8JA 1RQHA 3DZ1A 2ZRVA 3CM4A 4LVGA 4NNBA 2YYUA 3PR2A 2R94A 4AHOA 2VENA 3U8GA 3R8RA 3QPYA 4E2DA 3KVJA 3M43A 5IBXC 2NUWA 5C55A 3N2XA 1WX0A 3LCXA 3JR2A 5AHLA 1VC4A 3CTLA 4EF8A 3SI9A 5EBUA 4AWSA 1ZALA 3TU9A 3W7JA 2R91A 2E6FA 1VR6A 1LORA 4WZHA 4OV4A 3E9AA 4ZQOA 3W7GA 2QCFA 1GEQA 3W7DA 3LBCA 3NQ6A 4HPJA 1OFQA 3K30A 1FXQA 4EIVA 4O4VA 2X1RA 4FX8A 2WNNA 4IMFA 4AWTA 5CZJA 5K4XA 1OF8A 2CLLA 5GVJA 3G1AA 2HSAA 1HO1A 3CIXA 4X9SA 2J9ZA 1AW1A 2C13A 3EWWA 3PG9A 5I3JA 3EX1A 2ZTJA 5I3GA 2ATMA 5C54A 4O1CA 4QISA 3GDRA 2QUUA 3W7EA 5EYWA 1ZAJA 3T40A 1H7WA 5AHNA 1TREA 4ZMGA 1G4EA 4AB4A 3TJXA 3RMJA 1L6SA 1LCOA 3S9YA 2YW3A 2E5CA 3M16A 1I8JA 3ZWTA 5G1YA 3QF0A 1SW3A 4KFPA 2A7NA 5U7SA 3JS3A 4IMGA 4UR7A 4WY0A 2ZZ5A 3NPUA 4MYXA 1W5OA 3O06A 4LU0A 5LNVA 4I7VA 3KVLA 1OABA 1Q3NA 2WQPA 3Q94A 3DFNA 3N14A 1G6CA 1Q6LA 1TPUA 3BGGA 1TTQA 4ZQNA 1OX5A 3P8IA 4WX2A 2ZRYA 1FDJA 4XTIA 3FYOA 4KWWA 3HGRA 4N6FA 3EWBX 1WYIA 5CZTA 1F05A 3DH7A 4HIBA 3MMTA 4Z08A 3G1XA 3C2VA 4K38A 5CSRA 4IMDA 3UXAA 1TPB1 4NX5A 4Y6GA 1FCBA 3L68A 3LHYA 1GWJA 3QSRA 1CW2A 4QJ1A 1A5AA 3TKFA 4M6VA 1LYXA 1YDNA 5CSSA 4IWWA 4XBKA 2C0AA 3RLVA 1IIGA 1N8FA 2V8ZA 4LTSA 1LRQA 4RK8A 2DU2A 2EAWA 1JCJA 4LW7A 3W07A 1KFLA 3NL3A 3VI2A 2ZA1A 3BVJA 4RXFA 3UQNA 3NQ7A 1K8YA 3C2OA 3W7KA 2ABAA 1G7VA 2NUXA 4UFHA 4P2VA 2VEKA 1IXOA 4NX0A 3W7IA 4AH7A 3O1NA 3CLMA 1TPEA 1B57A 4J9JA 3HOJA 1NF7A 3WJWA 2A5HA 1QO5A 5TBOA 5HWJA 2Y85A 3M5XA 3TH6A 5DCDA 3MJYA 2BZNA 5K3VA 3EKZA 1FWTA 2C15A 2GJLA 5H91A 1OK6A 1LBLA 3L5LA 1M7OA 3G24A 3FLUA 3QW3A 4NT0A 1J2WA 4HNNA 3L0NA 3T7VA 1W5MA 2PRMA 2P10A 3UZJA 3NO5A 3S42A 4DPQA 1FWWA 1QAPA 1TQJA 3TAOA 3TC6A 2X2GA 5AB3A 3L21A 5LHFA 5CPLA 4UNKA 1HUVA 1O60A 1H62A 2C14A 5I3HA 1LP6A 4FNRA 3TQVA 3A9IA 3W3OA 4DO6A 5LHEA 5L6UA 1OFAA 2A21A 4O57A 3M44A 4IXHA 3BK0A 4GUGA 2Y89A 2VFDA 4K8EA 4BWLC 3H53A 2QCCA 4JTSA 4AWUA 2VELA 3H55A 2ALDA 3W22A 4N02A 3EX3A 5HUOA 3S0CA 2LLEA 1BTMA 3R89A 3FA5A 1TTJA 4HT3A 3LTPA 4O0KA 3W23A 1A5BA 3UZ5A 1VGAA 1ICQA 3OIXA 4UTUA 2YZRA 3GAKA 2FPYA 4BI6A 1ME7A 4LC6A 1TPFA 2ZDRA 2J24A 5G5IA 3BW3A 1ZAHA 5G2HA 3NPVA 1KV5A 4Y90A 2H6RA 1O5KA 4MIMA 1HO4A 3HQ1A 4O15A 4N9EA 2E77A 1P0KA 1FBAA 5AHMA 3CWNA 2AGKA 3R12A 4IOTA 4C1KA 1EIXA 2E5BA 4XKYB 3U2OA 2ZRUA 3LHVA 1H60A 1WBHA 2V2DA 4UTWC 2FTPA 2GPTA 3IEBA 1IGSA 3PM6A 3I7QA 4ADSA 3O6DA 4NNCA 5AOUA 2Z1BA 4MFEA 4JN6A 3TFXA 4S1FA 1SU5A 4UCGA 2O7QA 4M6QA 3GZ3A 4O0ZA 1VLWA 3RFAA 3QC3A 4UFIA 1TV5A 4S2CA 2FB2A 4M7SA 3C2FA 4Y8FA 3WJZA 3W2UA 3ZS4A 1LROA 3G0UA 5L9FA 1XBXA 1XL9A 3BW4A 2KZHA 2TYSA 5D32A 2QCHA 4N4QA 2JBMA 2ZZ7A 4DBEA 4RCXA 4O19A 3QJAA 4JYFA 4ZQRA 1MSSA 4O17A 3DFPA 3GLCA 1R2SA 3OHIA 2ISVA 4TMBA 3SIZA 3N19B 4LWWA 3T4CA 1QOQA 4ADUA 5HR6A 1J5TA 4JY9A 1JRCA 4O14A 5BW6A 2E68A 1TPH1 4NXSA 1D3HA 3LDVA 3DHFA 1XC4A 3MYPA 3HB9A 1ME9A 2OZ0A 3O6YX 5F1VA 3GNDA 3IVSA 1QDSA 3IVTA 4OE7A 2Y6ZA 1CX9A 1WXJA 2JKAA 1FWSA 1GVFA 2QJGA 3VNDA 5SWUA 2WJZA 2OT0A 4UR8A 3LCGA 4XTDA 4A2RA 1Q6OA 1RQBA 5D2YA 5AHFA 2H3DA 3W1XA 2GVLA 3TCEA 2I9EA 4UTMA 4IMEA 3CC1A 2ZZ1A 1ZFJA 3SJ3A 3UPBA 1K8ZA 1DV7A 2F84A 1WOBA 3MUXA 3E49A 1JCNA 2WSQA 3N73A 1KBIA 2VEIA 4GE8A 4K36A 4MOZA 5U4NA 1PE1A 4GXMA 2E09A 2ZQ0A 1GYNA 2H90A 2ZRXA 1NFBA 2VFFA 4YLWA 3BO9A 3TMLA 4O53A 1FDZA 1YYAA 3PBYA 2BX7A 1LLZA 3ZFHA 3CU2A 2E1DA 3TW7A 3EXRA 2R8WA 1OYAA 1I45A 3MHGA 3QRHA 4IX2A 1GJPA 5CPOA 4A22A 1G69A 4WD0A 5HINA 1L9WA 2PCQA 5LZLA 2Z2UA 3MI2A 2ZYFA 2GUUA 1SZGA 3NQEA 3LERA 5F2IA 3P81A 1H63A 3PBUA 1VQTA 2C16A 3TXZA 3W71A 2FJKA 2X16A 5D30A 1TIMA 3HG4A 3UYCA 1L6WA 2CLKA 3LCHA 1DBTA 2DZVA 4X3ZA 2EHHA 3IRDA 3UD6A 3W86A 3UY8A 3TAKA 3OEXA 3IV3A 4O52A 1AG1O 1OX4B 1DJNA 2QCNA 5F2LA 3R5EA 5TQLA 1YTDA 3LHZA 2A0NA 3QMRA 1FQ0A 1EPXA 2H3BA 3NQCA 3E02A 4QIUA 4JDBA 3A23A 4ML9A 2F7FA 1SO4A 1W3IA 3WFAA 3G1VA 4OT7A 2X1UA 1Q6RA 3SR7A 1TJRA 3WK2A 2YGYA 1C29A 3P61A 2H8ZA 2ISSA 3P60A 1H5YA 1YDVA 1X8FA 3SZ8A 1K3UA 3W1LA 1FX6A 4RV8A 2DORA 1N55A 3LTSA 3HJZA 3I7RA 2Y7EA 4U28A 4XUGA 3IGUA 2PE4A 5HWNA 5K2ZA 1NVMA 1XUZA 1SW7A 1IF2A 2B7NA 1H7OA 2CZDA 2EF9A 2Y88A 2WKJA 1QFEA 2Z6IA 4NJKA 1OFOA 3C52A 4M6PA 3EWZA 1A50A 3THAA 5FF7A 4LOCA 4MLJA 3W7MA 2E5DA 5G2WA 5EKYA 4MY1A 1I2QA 1W0MA 2VOMA 4FX6M 3T55A 1XDLA 2DZSA 4CQAA 5LNRA 1RZMA 3W7QA 3NEVA 2B4GA 5HNRA 5I3FA 4D2JA 4I9AA 2EPHA 5I3IA 3OVPA 4UFMA 5D37A 5DCBA 3FFSA 4QSHA 4HSOA 4UIOA 1DQWA 3UXDA 1JRBA 2CLEA 1F6PA 1SR9A 2Z0IA 3QEZA 4NJIA 4DQWA 2EGZA 3S1WA 4WUIA 1XBYA 1OK4A 2GQ8A 2ISWA 3TROA 5DELA 1WV2A 3S1XA 3M0ZA 1EP1A 6ALDA 3LX9A 4AMAA 1F6KA 2BTMA 3ABQA 5FF3A 4O4WA 1HL2A 4M7TA 3HG2A 3LCIA 3LCWA 3LHUA 3RK8A 3NM1A 1M7PA 3NL2A 3UWWA 1LRNA 3Q37A 1H1YA 5HUPA 4O50A 3GR7A 2OX1A 3W1RA 3H54A 1S3HA 5AC7A 4GNJA 3CB8A 4CCDA 3B03A 1FCVA 1TYGA 2TMDA 3QPZA 2PRLA 3M9YA 4EOUA 4MZYA 3HF3A 4HN4A 3L65A 2J9YA 3BLFA 1K02A 1J4EA 1O5XA 4JTJA 4JXCA 1LBFA 1H50A 3B06A 2QAFA 4Z0SA 1MEIA 2OMAA 3LLDA 3NQDA 1W56A 3P5YA 4ZZ9A 3W6YA 2CZ5A 1TCDA 3DKJA 2ZCGA 1JJKA 2VFHA 3W7NA 3USBA 3PVFA 5AC6A 1MZHA 1WOAA 3W2KA 4CCEA 4QITA 3N9RA 4UFJA 4NUWA 5C6MA 4CNNA 1TPDA 3L2IA 1XXXA 1UUOA 4AF0A 2B0MA 1N7KA 1UB3A 3ABRA 2O7SA 1KM0A 2X30A 5CPMA 2CZEA 3W2MA 2J27A 3W7LA 1D3GA 2C3ZA 1H61A 4YXGA 1B4KA 4B5NA 4IJBA 1TPC1 4EVZA 1A5CA 4R33A 4MJZA 3BLIA 2TPSA 7TIMA 2V30A 4LVFA 2TRSA 3ZWSA 5DCEA 4LUJA 5FI8A 5F4WA 3A5FA 1BWKA 2PURA 4XBSA 2RDWA 1MEHA 4IQLA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7CA

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Chord Diagram

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