3W7D | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-170 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	106
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7dA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7dA01

3NQCA 1JUBA 3EXSA 1D3HA 5AC7A 1N55A 3HPZA 3NQVA 1G4EA 1KFEA 4QM1A 4UMCA 5KZMA 4FNSA 5KINA 4A2SA 1DBTA 3OEXA 5G4WA 3PF3A 4KWVA 3TW7A 2AQWA 3SFKA 3O6YX 3OVQA 4HT3A 1I4NA 1K7XA 3CWOX 4HPJA 1X8FA 2RDTA 1VGAA 1SZFA 1QPQA 3O05A 4QQ3A 2C1HA 2B7OA 2ZZ3A 1LROA 1SW3A 3A5FA 3JS3A 2JBMA 1VS1A 1SR9A 1FCUA 1EX5A 4RX0A 4N9DA 5I3FA 3EB2A 1W0MA 5C6MA 4JDBA 3Q37A 1LRQA 4Z0JA 1RR2A 1ML1A 1UBSA 2VELA 4UR8A 3TUUA 4ZQCA 3BLIA 3C2OA 3ZWSA 1DQWA 3PY2A 3O06A 2CZDA 4MYXA 5EY5A 3W70A 1KV8A 3P81A 3WK2A 3IIPA 1AMKA 3M1ZA 3R5EA 2H90A 4DF2A 5EMUA 2Z0IA 2ZZ7A 4LU0A 2ZRVA 3TSDA 2V5BA 5LSMA 4AEOA 1KFJA 4IOTA 1N7KA 1OYAA 4K7VA 1VYPX 1S5TA 3EWBX 4POCA 2I1OA 1QCWA 4RXFA 1I2RA 4UFKA 3P84A 4XUGA 3EWYA 3NQMA 3AO0A 3LCFA 3W3OA 3MYOA 3NQFA 4NX0A 3WJZA 2YYTA 1OFDA 3L2IA 3GR8A 3KFTA 3NQ8A 1SSGA 3KVKA 2VEIA 1H63A 3UWVA 3FKKA 2J27A 2GQAA 1QPOA 3SY5A 4RJEA 1FXPA 3VI2A 2FJKA 1ZY9A 3G18A 3KXQA 3STCA 3N9RA 2GQ8A 1EIXA 1PE1A 4O0ZA 3OVPA 4RV8A 4O1CA 3O07A 1AW5A 4DXVA 5E0KA 4M6QA 3HMJG 5HR6A 3KX6A 3L21A 3W7CA 4AHPA 2XN0A 4S2BA 3MP4A 3WK0A 2DZTA 2WJZA 5FEWA 1ZFJA 2FTPA 3NZ1A 3L5MA 3FS2A 4WUIA 3W9ZA 4FX7A 4LT9A 4IGHA 3B06A 1F5ZA 1UJPA 3NQAA 4LNYA 3LLDA 2NXHA 1P0NA 3L65A 4DBDA 4C1KA 3FYPA 3PBYA 4AF0B 4E38A 1Y0EA 2YGYA 3W1LA 1XXXA 5GVJA 3EX6A 3TXZA 1A5SA 4MVAA 3CQ0A 1S5WA 1JRBA 3TK7A 3WJXA 4AHOA 2A7NA 3DAQA 3KOFA 1GT8A 2A0NA 2W0UA 2C18A 5CZTA 2C0AA 1FXQA 1JJKA 4NJKA 2FQIA 3A9IA 4H4IA 2ZA2A 4WXZA 3FEMA 2KZHA 2VEPA 5EPDA 1LYXA 1IXPA 2C19A 4GXMA 1KTCA 5D2WA 1B3OA 2J88A 5LNRA 3UPWA 2EKCA 2HSAA 1LBFA 1LBMA 3CB8A 3L66A 4H6KA 3IGUA 3NM1A 4N02A 1F73A 3ABQA 4ORMA 1QR7A 3HBLA 4A21A 3W83A 1OF6A 1W54A 4LRTA 3T55A 1YXYA 3DXIA 5CPMA 2ISSA 1WQ5A 5DLCA 3W87A 5FF3A 2QCGA 1O94A 2X1UA 1T0OA 3HF3A 3PUDA 2WQPA 1XCFA 3EWWA 3R2GA 2TSYA 1FY6A 2NV1A 2VOMA 2Y63A 4Y90A 4C1LA 1EWDA 5HJLA 4XKYB 1OFQA 2A6LA 4NJIA 1RD5A 3LCHA 5DCBA 3G1XA 3L5LA 1KBJA 4CCEA 1K03A 3GDMA 2AGKA 2EHHA 1HG3A 3N3MA 2BLEA 4UUIA 5FEZA 2ZDRA 3DKJA 3ATZA 3VE7A 1FCQA 3SW6A 5FESA 2E09A 2PRHA 5A5WA 4DBEA 3W7KA 2P10A 2CLEA 3IIZA 3LHYA 3P82A 1ZCOA 2VXNA 2ZZ2A 4DELA 4NJHA 1Q3NA 1SO3A 3LHWA 4JICA 3G1VA 2EPHA 3E49A 2YX0A 4JGDA 1U5JA 5EYWA 3B8DA 2TYSA 4DQWA 4GC4A 1BKSA 3LHZA 3ZR4A 3MHUA 4UFJA 2DZPA 3GXTA 4IMGA 5K9XA 1OFPA 4R34A 1GTHA 1MZHA 2Y85A 3QJAA 3W7GA 4LUIA 3NQ7A 4L4MA 1DV7A 1L6WA 4HSNA 3GYEA 3NQ2A 2AAMA 1W5OA 3C3NA 1VRDA 1G7UA 2OX1A 1L6YA 2OZ0A 3HJZA 4MOZA 4I7VA 2E5CA 1W8SA 2QJHA 2EAWA 3EXRA 4M7TA 1W5MA 1KFCA 5FEPA 3FFSA 1C8VA 1GPWA 5AHNA 3STGA 3GKAA 3I7SA 2FLIA 4Q4KA 4IQLA 2VFDA 1Q45A 3W2KA 3LCXA 4G1KA 2ZZ5A 1EP2A 4UTLA 4WQ6A 3SR7A 5FF7A 3ZFHA 1TJRA 3ZS4A 4UTJA 4Y96A 3LOTA 5DELA 3T4CA 5BMXA 4JY8A 1LDCA 1TRIA 1J5TA 3TX9A 3G0UA 3TJLA 4KFNA 2Z2UA 1F76A 1MEIA 1ZAJA 3N2XA 3PM6A 3UWQA 4Y8FA 3P8JA 1SQ7A 4FIRA 3BV4A 5AC8A 2R91A 4NJGA 3BVJA 3HGJA 4YWIA 3IRDA 1TPDA 3KAOA 1F7BA 2Y88A 4ZQRA 3GK0A 2ZYFA 3C4UA 3EX1A 2CLHA 1F2JA 1RQHA 2RKXA 2ZBTA 4JEQA 4RK8A 3FIGA 3OA3A 2HTMA 1KM6A 1N8FA 1OVDA 3NOEA 5D04C 5HUPA 1LZOA 4B5NA 1GJPA 3LCGA 3LTYA 4LTSA 4QISA 2VFIA 5AYXA 4LS2A 4EIVA 1SO4A 3LCLA 5K9CA 4CNNA 1NSJA 4O11A 4EF8A 4JY9A 3W7JA 2ZA3A 4OT7A 1RZMA 2WOQA 2QCHA 2YR1A 4N6FA 4JTLA 1KFBA 2PE4A 2QCFA 3LTSA 3NVTA 2A2IA 2YZRA 1VZWA 2BTMA 2ZZ6A 4PODA 2RDUA 5BRBA 1IIGA 4O17A 1L2UA 3W84A 3DKLA 1IIHA 3NR0A 3TSMA 4UCGA 4IUOA 3G1DA 3LB0A 4MZYA 1UASA 3WK3A 2BSLA 3U2OA 2DZXA 2QJIA 5LHEA 2Q8LA 3CC1A 5AC6A 4PTNA 1XFBA 5J5DA 2EGZA 5F4XA 1OFBA 3BGGA 3GZ3A 2H8XA 3BLEA 1VQTA 3NL6A 3V1PA 5G1TA 4Z1DA 5HR7A 3SECA 4IWWA 3GVGA 1XI3A 1UCWA 5HMSA 3A21A 3LXBA 2ZCGA 1F05A 1CW2A 2VC6A 3TJXA 5F1VA 1KLYA 3TFXA 4AHQA 4RZ4A 4O1BA 1TPEA 4LV9A 1IF2A 1KV5A 1BEUA 3GB6A 4YLWA 1TPWA 3QQ0A 3UD6A 1PHWA 1EP3A 5DXXA 5D33A 2NUWA 1WBHA 4MJMA 1FWNA 1B57A 4Y6GA 4JTEA 5TBOA 3P80A 1GWJA 1TYGA 3UWWA 1VHNA 2B7NA 2NUYA 2ZTJA 3HGOA 1JCNA 3P62A 1R30A 5BOOA 3B0PA 3FJ6A 4RZ5A 1FWSA 1GVFA 2BX7A 3AJXA 1GVSA 2J9ZA 3W2LA 3G22A 3TH6A 3DU0A 1SZNA 3CEPA 4K8HA 3EKLA 1IGSA 3TC7A 1P4CA 2ZRWA 4JTJA 1Z41A 1NFBA 5AOUA 4IMFA 4P61A 2J6XA 2QCDB 5DY2A 3WFAA 5H2ZA 3A22A 1OJXA 4JTTA 3F4NA 3UXAA 1GTEA 3M5VA 4ZQOA 1G69A 2E77A 1FWRA 1MEWA 3EKZA 2X1SA 3NNTA 1U83A 1QDSA 2YFOA 2YW3A 3LCIA 2QUVA 1H50A 2E5DA 1HFBA 2YYUA 3PBWA 3TSBA 1BWKA 2ZRUA 4YCOA 1W3IA 3W7OA 4Y9AA 1S3HA 1H62A 1YTDA 4HN4A 4E2BA 2NWSA 5DN1A 1OK4A 4M5PA 3FJLA 1QOPA 3R89A 3QFEA 4ZL1A 3GLCA 5DY3A 1ADOA 4JTKA 1DORA 4FNRA 1QNVA 3CIWA 5EL1A 4M19A 1GVOA 3P60A 5U7SA 1KM2A 3BG9A 1HO1A 3A5VA 1GOXA 3LRKA 2JGYA 3C0JA 4FIQA 3HGSA 5D2TA 5CPOA 3R13A 1ME7A 4N2YA 2CLFA 4GNJA 1MSSA 2WPBA 3TCEA 1WXJA 2VKZG 5H91A 2NXIA 5TIMA 4FEZA 4O10A 2QCNA 1ZENA 3WK1A 3CEUA 3O1NA 5MHBA 3IV3A 5KMYA 5F2IA 2FFCA 5HWJA 4R7JA 1DOSA 4O57A 1TTQA 3S8HA 4RZ6A 3SGUA 1LM1A 1I2NA 3TAOA 5AHMA 4MZ8A 3O15A 5G1YA 4JYEA 4R33A 3W6YA 3ATYA 2C16A 5ABTA 1AW2A 4L4LA 3PS7A 2J9YA 5KTLA 4HKPA 3INPA 3STFA 2HMCA 2TPSA 4WY0A 3YPIA 3EX3A 3MP3A 3HG2A 1XC4A 2OJPA 4JIQA 1VLWA 1EP1A 1H7OA 3TV8A 3GDLA 4P2VA 1TQJA 1SFLA 1ME9A 3K30A 4OGZA 4FNUA 4UC5A 1LCOA 2V81A 4UNKA 3NPVA 1VYSX 3KRSA 1VLIA 1W3NA 2CZEA 4UFMA 2DU2A 1O5KA 4O19A 2GVLA 3QQ1A 4YMZA 5LHFA 1JR1A 1FCBA 5KZEA 2V2DA 5FF2A 4ML9A 1H61A 1D9EA 1VH7A 3W2JA 2YW4A 4MFDA 4XZ9A 1FBAA 1QMLA 1YYAA 3VFLA 3S5ZA 1EB3A 3DFSA 4O28A 3W1MA 2BZNA 2WNQA 4MLRA 3L67A 3W7RA 2X1RA 1R2TA 2ABAA 3M41A 1K8ZA 1YTEA 1HO4A 4MY1A 4Z0SA 1AG1O 3HIJA 3L5AA 5AYZA 1NAL1 3M5YA 3ANYA 4K7YA 2Y62A 3MHGA 1FX6A 4FXSA 1OHLA 1TV7A 1O5XA 4DEFA 3TQ0A 1SZGA 2XFWA 1JCYA 2YSWA 1SSDA 5CPNA 1R2RA 4QNWA 2ABBA 1XBYA 2R14A 1VCGA 4Z08A 3NAVA 2QUUA 1OFRA 1IXNA 2E1DA 1SFJA 3HB9A 4NUWA 1RV8A 3QRHA 1SW0A 5D37A 4W9TA 1XUUA 4ALDA 1RQBA 3FOKA 4JX4A 1OK6A 4IMDA 4EF9A 3Q94A 1FDYA 1X1ZA 3NQ6A 1L9WA 2TRSA 3QC3A 3W1AA 2G5WA 4LC8A 4N9BA 3W1XA 3PUEA 5K2ZA 4Q32A 5HNRA 1TTJA 1KM0A 4OE7A 1ME8A 3M9YA 3EWZA 3H54A 3DBPA 1KTNA 4KFPA 5F2LA 3W23A 4QITA 3N73A 3P67A 3UY8A 3UXDA 1QPNA 4UTIA 1RPXA 3E12A 2PRLA 5D02A 1GVRA 4OV4A 5LNVA 2FDSA 1ICSA 2Y61A 2V2HA 3W76A 4EOUA 5LNSA 4IPJA 4MPQA 3B0UX 2GPTA 3TDFA 2G95A 1VPXA 5FF0A 4QSHA 3NXFA 2QAPA 3PBVA 4LOCA 1RQEA 3NDOA 5DCEA 7TIMA 4FO4A 1D3GA 3G8RA 4LV4A 3G1FA 4WXYA 2Q8ZA 4IX2A 3VE9A 3ABOA 1OFEA 2P0OA 4AF0A 3G3MA 2Y89A 4NX5A 1TMHA 5BW6A 2E6YA 1TV8A 3BG5A 1KM1A 2G97A 1I2QA 4OU1A 4ZQPA 1DL3A 5I3KA 3TW6A 4FF7A 3HGRA 2VEKA 1DJNA 1PHQA 5AHIA 1TTIA 4BWLA 4JNMA 4CQ8A 3NYZA 1H60A 1OFAA 3HQ1A 1H51A 3L0KA 3DFPA 1JULA 1A5CA 3NZRA 4BWLC 3QH2A 3DFOA 5KITA 2Y7FA 1XBXA 1GVQA 2A5HA 2PC4A 3UWZA 1QPRA 3FYOA 3LI1A 2G96A 2E68A 2WKJA 2Z1BA 1GG0A 2GQ9A 2X1TA 1C29A 2A7RA 1I8JA 5DCDA 3UNDA 3N19B 4FX6M 2YDAA 1ZALA 2DJXA 3MHFA 3WJSA 1FWWA 1W56A 3BGJA 3I7QA 2C14A 2A4AA 2CU0A 2QUTA 5G5IA 4BF9A 4PL2A 1LP6A 4I7WA 3MBDA 1TPH1 2C15A 4XKYA 4CLMA 2X16A 4GFSA 4UMBA 4IJBA 2NX3A 2FB3A 3W85A 5D2VA 3H55A 1V5XA 3STEA 5F4WA 4DF1A 5D09A 1Q6OA 5EKYA 3T7VA 3Q58A 1OYCA 4MLJA 2W6RA 2Y6ZA 2CZ5A 5CSRA 1NVMA 4MY9A 4UFIA 1THFD 5SWUA 2YPIA 3IGXA 3TR2A 4O1AA 5L9FA 2E6FA 3O6DA 4JS3A 5G2HA 1TPFA 3ELFA 5LNUA 1O4UA 4GE8A 3GDKA 3KVMA 4NNCA 3LXCA 3OG3A 1XKYA 4Z1BA 3W1TA 1W5QA 3TFCA 2CLMA 3W07A 1Q6RA 1K7FA 4UTKA 1H1YA 3LRLA 1QAPA 3M0ZA 1RVGA 4CCCA 3RMJA 4AMAA 1C9DA 1DJQA 1NF0A 3B0VC 1OX6A 2WNZA 3LBCA 3W2MA 4O16A 5K4ZA 4BR1A 1LTDA 1UB3A 4O18A 4IMEA 4GUGA 1DHPA 1CI1A 3I68A 3W22A 1TJPA 3BO9A 2WSQA 2VENA 2QDGA 4QJ1A 5CZSA 3SI9A 3UPBA 4O14A 3CM4A 3PB2A 1A50A 1KM3A 2EF9A 4HPXA 4LWWA 1PCKA 4O12A 2P1FA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7DA

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