3W7GA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-5-013
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-013
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w7gA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w7gA01
3WJSA 1SO6A 3LRLA 2V2HA 1NAL1 1QPOA 2ZCGA 3M5VA 1EIXA 3HG3A 2E09A 5F1VA 3LBMA 2E5BA 4UTJA 1AW2A 1XDMA 4K8HA 3E02A 4Y6GA 2VFHA 3MI6A 2NX9A 2YDAA 3C8FA 4WZHA 4RKAA 1N55A 2VFEA 4KKXA 1OK6A 1TPEA 6TIMA 1G4EA 1VC4A 4CCDA 4ZQOA 2W6RA 3W2NA 2RH9A 3R2GA 4OQVA 3DFOA 1L6SA 3USBA 1O94A 4K39A 4E2DA 4JN6A 3MWAA 1X7FA 4JD4A 4PH6A 3EWZA 5KTLA 1YXCA 4IQLA 3MI2A 1LOLA 5AOUA 3DFNA 3FOKA 4N4QA 4JY8A 1XFBA 1WBJA 5SWUA 2XN0A 1GZGA 1SUXA 4O0KA 3ELFA 1EWEA 5G1YA 4HIBA 3LCGA 3LTSA 2VEIA 3IIOA 4MFEA 3SFKA 5KSWA 5LGXA 1ME7A 3UWQA 3ABQA 1T0OA 2QJHA 3C52A 3DKJA 5IBXC 2VFDA 2A6LA 4DO6A 2C16A 2Z6IA 3C2FA 3RK8A 1S5TA 5I3GA 4ADSA 3TMQA 4JTUA 2CLEA 2AGKA 1OYBA 3LV6A 4W9TA 2DJLA 4TU1A 4XWUA 3W7JA 2FB2A 3VFLA 4HNUA 3LBCA 3BW2A 3QMTA 4O1BA 3LCWA 2QCGA 3TMLA 4WOQA 2VFGA 1MEWA 3B06A 1EEPA 2C1HA 2DZSA 2Z6JA 3CEUA 1OFDA 3PUDA 3Q58A 1JQXA 1C8VA 4FX7A 3STFA 1I2RA 4JYEA 4LY8A 4O4WA 4PCFA 2GVLA 1TIMA 5LZLA 3IGXA 3CHVA 3TQ0A 2G95A 4O0ZA 1B4KA 4FIQA 3M0ZA 4BI7A 4JTEA 3LHZA 1JCXA 1PHWA 4PFMA 4JYDA 3W2KA 1NEYA 1YPFA 2CLIA 4E38A 5CPLA 3NQGA 2C13A 1JCJA 2FPTA 3W7QA 5HUPA 4JTTA 3HG2A 3P80A 3Q2DA 2B4GA 2PRMA 2QCMA 3G0SA 3MW7A 4JX4A 3W1TA 2AAMA 1H7OA 3QSTA 1RQEA 2FTPA 4DO5A 1XL9A 1K8XA 1F5ZA 2QDGA 4QSHA 3IIZA 1IIHA 1TB3A 3G0UA 5HJLA 2WOQA 1JR1A 3UY8A 4DXVA 4Y90A 1P4CA 3LB0A 1ZCOA 3LX9A 2YX0A 1S3HA 1LDCA 3T40A 3EKZA 4PEKA 4CQ8A 1SO5A 3MHUA 2QCDA 3M5ZA 2G97A 1ZY9A 2HSAA 3TSMA 1HFBA 1I45A 3ZR4A 4DELA 3QW3A 1OFOA 3NQEA 4N6FA 4HSOA 4H3DA 4KWWA 4OV4A 2CZEA 4Z1CA 3KVLA 1TTPA 2ZTJA 3W7CA 2EAWA 1WXJA 1VYSX 4KWVA 4O8RA 1H63A 2BX7A 1S5WA 3A5VA 5DLCA 1JUBA 3TROA 4KFPA 1WQ5A 1OYCA 1TPWA 1WAUA 4IXHA 3PBWA 2NLIA 5CZJA 2VEKA 2GPTA 3HF3A 1I4NA 1L6WA 3I6RA 3MO7A 1KFBA 1LOSA 5G2HA 1LLZA 1O4UA 2ABBA 2NWRA 5AHEA 1ME8A 4RZ4A 3EXTA 3OHIA 2WPBA 1I2PA 3GDKA 4LU0A 1WDWA 2J88A 3IVTA 4K36A 3W1XA 1MEIA 1W37A 1T99A 2V5BA 1SFJA 2QUTA 4BWLA 1JCYA 1GVQA 1YLVA 4ZL1A 1NVMA 1SZNA 3W7NA 3N2MA 4U28A 3G1DA 1R2SA 1G4TA 1RPXA 3QFEA 4WD0A 3QM3A 4UIOA 4Y8FA 4AWTA 3WK1A 4GE8A 2Y61A 3RLVA 1TTIA 1KBIA 1FCQA 1SSDA 1EPXA 3E12A 3T7VA 1TPDA 1NSJA 5C55A 1V5XA 2UV8G 3N19B 4XKYA 3MHGA 1BWLA 3FFSA 1EWDA 2OZ0A 1ZAHA 3GIYA 2X1UA 2Y7GA 1ZJIA 1NF7A 3I65A 3PB2A 4NVTA 2PRHA 3RLUA 4BR1A 4FIRA 4NJJA 4CNNA 3LCIA 2V2DA 3LERA 3LHWA 1H7NA 5D38A 3EEGA 1QDSA 2PURA 5BNKA 2ZFAA 3LCLA 4Y96A 4AB4A 2E1DA 2ISSA 2WSYA 2QJGA 3N14A 3GXNA 4NXKA 4O1AA 4DF2A 2BXVA 3KRZA 2DORA 3W7OA 3BLEA 1OG0A 2Y7FA 4NT0A 1WOBA 3L0GA 4M5PA 4ZQPA 1EA0A 3THQA 1LTDA 3R89A 3S0CA 2CLLA 3W74A 3DI1A 4LRTA 4LC8A 3W2UA 3BARA 5F4XA 1XI3A 5U4NA 1ZNNA 4TX9A 4IUOA 3LV5A 7TIMA 1ML1A 4O52A 4UTUA 1TTQA 3LM7A 3BPWA 2QCEA 3O1NA 1XBVA 3CLMA 5TIMA 3S5ZA 2YYTA 4G1KA 3CQ0A 5GVJA 2E6DA 2CLMA 2VXNA 1VHCA 4RCXA 1RD5A 3DFQA 3W7GA 3LLDA 4LNYA 3G1VA 5FF0A 1LBLA 4JTIA 2YGYA 3W85A 4A22A 1X1OA 2J24A 2X1SA 3MMTA 5HR7A 3W2MA 3B05A 1KV8A 5D03A 3LHTA 4JX6A 5FF3A 3C4UA 4RXGA 3NQ2A 3PAJA 1Z48A 1QCWA 2E6AA 3MBFA 1A5SA 2HS6A 3M43A 3BG5A 4BI5A 1FQ0A 3DHFA 3R13A 5E1QA 2ZRWA 3GR8A 2VFFA 1M5WA 1B57A 4LT9A 1RV8A 1U83A 4FNSA 3G8RA 1Q45A 2A2IA 3EWXA 4WXZA 1ZAIA 4MFDA 1WX0A 2D73A 4WX2A 5D32A 3DH7A 3NQCA 4X9SA 5C54A 3W7EA 3PUOA 4AHPA 3NM3A 1PE1A 4LVDA 2QCCA 1XBZA 1YXDA 4HT3A 4NJIA 3C2VA 4H6KA 4QNEA 1J5TA 3UWUA 4YCOA 5F2LA 2E77A 3PG9A 1R2RA 2C18A 2GQ8A 1AW5A 1W5QA 2QR6A 1DV7A 1H62A 1SW7A 5BW6A 4QIUA 3GKFA 1LOQA 4N9CA 4UMCA 1BTMA 4QM1A 5E0KA 5FEZA 4NNBA 3P5ZA 3UYCA 2ZZ2A 3GAYA 3IRDA 3GZ3A 1SR9A 2H6RA 1H50A 2WKJA 5AN7A 3HG4A 3M47A 3W7PA 1GG0A 4QQ3A 4ADUA 4Z1AA 2V0TA 2FPVA 4Z08A 5FI8A 1F73A 2W79A 3QQ1A 4O17A 4LW7A 5AB3A 1A5AA 3QSRA 1H51A 2DU2A 3L21A 1P0NA 4N02A 4O28A 3GLCA 5I3JA 3P84A 4JGDA 3TXVA 3UD6A 2EF9A 2JGQA 1FX6A 1GOXA 3P81A 5F2MA 3HPZA 4GUIA 1LBMA 5KZMA 1FUYA 3UXDA 1TJPA 1KV5A 1JUEA 1JULA 5DCEA 4JDYA 4DF0A 1HO4A 2V9DA 2ZRVA 4MKNA 1LROA 3N34A 1QPRA 4OE7A 5F4SA 2NUXA 2Z1BA 3TK7A 5C2XA 4AH7A 3HOJA 4HN4A 4ICNA 2ZZ4A 3GYEA 4IGHA 3NQ6A 1PCWA 4FEZA 2J6XA 4H4IA 4EOUA 4AF0B 3NPXA 3W88A 4K38A 1A50A 2WNZA 4UR7A 4NZFA 1QR7A 3I7QA 1SSGA 1OX5A 3C2RA 4JS3A 3DBPA 1KM5A 1QNVA 4RXFA 3GAKA 5D04C 4IMCA 4QNWA 2VEPA 3GKAA 4ORMA 5HR6A 1H7WA 3IGUA 2QF7A 2GVGA 4IWWA 1O95A 1PIIA 5K9DA 4WY0A 4AWSA 1ZENA 2NWSA 3LLFA 2R91A 3FJLA 3W22A 3WJYA 3BK0A 1ZFJA 3CWOX 2BSLA 4HNNA 4A2SA 3CC1A 1C9DA 3AJXA 4LS1A 1W3TA 4O53A 1XDLA 3O07A 4LOCA 3JS3A 5D2YA 2CZFA 3OA3A 5G2IA 1LYXA 1R30A 3PBYA 3VNDA 3KHJA 2B7QA 4PC8A 1OVDA 4OT7A 1ME9A 4R7JA 3HBLA 4FXSA 2NX3A 1SO4A 3UZJA 1X6UA 2QCNA 1W3NA 4UFMA 1KTCA 5D33A 1EP1A 1JVNA 5CZSA 3DU0A 1QAPA 3QPYA 5FF2A 2P1FA 2PCQA 1H61A 3CWNA 3IV3A 4GBUA 3UNDA 3FA5A 4Y9AA 3F4WA 1GYLA 1KA9F 3BO9A 1W5PA 4MJMA 3TQVA 4HPXA 3PC0A 3G1SA 3HMJG 4RLIA 2GJNA 1W1ZA 5L6UA 1G67A 3O05A 3MYPA 4IMDA 4FB7A 4EIVA 5EBUA 2ABAA 5AHNA 3TR2A 1P1XA 5C6MA 1D3GA 2WSQA 4LRSA 3M44A 3HG5A 3VKJA 3TW7A 4OU1A 1I2QA 4IX0A 4JTJA 4UCGA 3W1NA 2WV8A 1XUZA 5EL1A 2PE4A 1GVFA 1EB3A 3B03A 1Y0EA 3UXAA 1KFEA 1BEUA 3BW3A 5D37A 1HL2A 3EX2A 4UC5A 4DQWA 3W1UA 3W7MA 3W1RA 4MVAA 1YPIA 4XTIA 1TV8A 2CWNA 1UASA 2FFCA 3M16A 1CX9A 3NPVA 3BVJA 4RZ5A 4O18A 3SI9A 3G18A 1N8FA 1B4EA 1QPQA 4UFLA 4N4PA 1TPB1 1R47A 3HGSA 1K3UA 3L5MA 4LVFA 3EX6A 4FO4A 3TSDA 4K7YA 1WBHA 3BW4A 3N9RA 2VEMA 3SSJA 1RR2A 3SECA 3QRHA 5G1TA 3PY2A 3LCXA 1NF0A 2LLEA 2PRLA 4IMEA 4NZJA 5CG7A 3S8HA 4K8EA 2DP3A 2JKPA 5CPNA 2ATSA 2W0UA 2YW4A 1FWWA 3W86A 1DJQA 2BWGA 4GJ1A 1AG1O 5E93A 4RX0A 2JGYA 5KZEA 3R5EA 5D09A 3KVMA 1SPQA 4NXSA 4NJHA 3NQAA 4ZMGA 2Q3RA 4YLWA 1SW0A 3QH2A 3EWWA 1LRNA 4Z0JA 2V8ZA 4MUZA 2I1OA 1Q6OA 4MLRA 1FWRA 2CLFA 4PTNA 4PA8A 2DZXA 3TKFA 4HPJA 1KM3A 4TMCA 1DOSA 2VENA 3A9IA 4DPPA 3G1AA 3THAA 2NV2A 1EP3A 5FF4A 2DZPA 1QO5A 3KVJA 3DKLA 4K6AA 2H90A 3NM1A 1ICQA 5D2XA 1VZWA 3B8DA 4LVBA 3EXRA 5A8GA 2VELA 4S1FA 1ONRA 3G1XA 3C61A 2JBMA 4WXYA 3ZWTA 2V82A 5CPOA 5G5IA 3NQ8A 4HNVA 1OFPA 3T4CA 2QCFA 3C2EA 2X2GA 3KRSA 1Q6QA 3TQKA 2YXGA 2RDWA 1TSIA 5D02A 1JCNA 1XCFA 2DZWA 1A53A 2A5HA 5G4EA 2C6QA 3W3OA 1FWNA 2Y7EA 3F03K 2Q8LA 5FEPA 5AYZA 4A21A 3N9SA 1W0MA 3M5YA 5HQEA 3DAQA 1VS1A 1JRCA 4ZZ9A 4NX0A 5KMYA 1BWKA 1VHNA 3EKLA 2Y85A 2ZZ7A 1L9WA 1EX5A 1VYPX 3L0NA 4UFKA 2QCDB 1H1YA 5K3VA 1W54A 3WK3A 2CU0A 2YYUA 1N7KA 5G4WA 3TIMA 3BV4A 2X30A 3G22A 2YR1A 3NL5A 3S1UA 3M1ZA 3EWYA 4MY9A 1GPWA 4MZ1A 4MZYA 1ALDA 4RZ6A 5AC8A 2P10A 1OX4A 5AYYA 1KLYA 3ANYA 3G24A 2FB3A 4FHAA 1T96A 1VH7A 3E9AA 4OBTA 4PL1A 2H8XA 4O16A 1KFCA 3LI0A 4ZQMA 1WYIA 5EYWA 1EUAA 5AHMA 4XBKA 4A2RA 3NA8A 4JX5A 3S42A 2JKAA 2TSYA 4JXCA 3PULA 2DJXA 3HB9A 4MJZA 1KM4A 3ATZA 1M7PA 3TU9A 2Q3OA 1KFKA 5EMUA 2YW3A 1YDVA 4FX6M 2NXIA 2NUYA 4Q4KA 3JR2A 2RHGA 3QF0A 3NQ7A 4R34A 1G69A 1FXQA 1W5MA 3NXFA 1Z41A 3L0KA 1E51A 2GQAA 3G1FA 1AMKA 3IIVA 4AHQA 3I68A 3QZEA 4N9BA 1H7XA 3NGJA 4U4MA 5D2VA 2J27A 3DFTA 1FWSA 3KRUA 3UWWA 3HIJA 1AW1A 4MOZA 2ISWA 3GR7A 4MY8A 1DKWA 1VCVA 5LNRA 1IXQA 4N2YA 1KFJA 1DJNA 3OIXA 1QO2A 3P8IA 4N6EA 3QMSA 5DXYA 3A23A 3L68A 1S5VA 1QWGA 4GUJA 1IGSA 2WNQA 3LXAA 4AXKA 1H7RA 2PC4A 4XKYB 2J9YA 5DXXA 1TV7A 3ABOA 1G4SA 2H3BA 4MYXA 1MZHA 3SY5A 1SZGA 3PWAA 4NNCA 3A24A 1UUOA 1KTNA 2OJPA 1AL8A 3K30A 1GQNA 4IMGA 3SW6A 2A7RA 4NJGA 4I9AA 1LLWA 4N9EA 4ZQNA 2KZHA 4Z1DA 2ZZ6A 1TPC1 1A5BA 4CCCA 5AC7A 3NL2A 3STGA 2BTMA 1YDNA 4UTTC 5G2WA 2CLHA 1T8XA 4NU7A 4IJBA 4DBEA 5H2ZA 2R8WA 1IXNA 3WK2A 4Z1BA 4XTDA 1OK4A 3LCFA 4O1CA 2FPYA 1TO3A 2QCLA 4FXRA 4DEFA 4L4MA 3W7KA 2ALDA 2DZUA 3DGRA 1I8JA 1DL3A 3MYOA 3OVPA 2Y88A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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