3W7K | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-066 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7kA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7kA01

3KVLA 1X6UA 1GTHA 3NPXA 3O63A 3M5YA 3DKLA 4TO8A 3HOJA 1G67A 2JKAA 2J27A 2QUUA 1DQXA 1DJNA 3PBUA 2JBMA 2B7PA 2HS8A 5TQLA 1K7FA 1I4NA 5I3IA 5FI8A 3PBVA 3FLUA 4QISA 3EX1A 3NQ8A 2E6FA 4I7UA 4JY9A 1KFLA 1YTKA 3P67A 3VI2A 2OCZA 3UXDA 5I3HA 4DBDA 4XQ6A 3IIZA 3DHFA 3M47A 1WOAA 1BTMA 4ORMA 5E0KA 1NVMA 2P1FA 1TTIA 3MUXA 5AB3A 5K9CA 1KBIA 2X30A 3G24A 1QPOA 4GUFA 4NJJA 3NL2A 4YXGA 1ZY9A 2C19A 3NPUA 4LW7A 3DU0A 3CLMA 4TU1A 4PFMA 2OZ0A 3KRZA 3NEVA 2ZRVA 2E5DA 3GNNA 3P84A 2P0OA 1IF2A 3GVGA 4CCEA 4UIOA 1MEIA 1W37A 3C52A 3EWZA 1G7VA 3UWQA 1QAPA 3IIVA 1SUXA 3G22A 2QCDB 4IJBA 3TUUA 4JTLA 1DHPA 5D32A 1KA9F 2NXHA 2WJZA 2J9ZA 4MLRA 1NEYA 3OVRA 3FS2A 1SPQA 4NVTA 3CM4A 3EX4A 2CLMA 3L0NA 1F7BA 3P60A 1R46A 3C3NA 4FXSA 4B5NA 5HWJA 3GKFA 4NUWA 1RQBA 4WY0A 4CNPA 1I2NA 2EAWA 3STFA 3W74A 4E38A 4FNQA 4X2RA 3EXRA 5K4XA 1AL8A 3WJZA 1U83A 2Z6IA 1YYAA 2NV2A 2FB2A 4U28A 3A9IA 3N3MA 3QPZA 3C2RA 3N14A 3LRMA 4BK9A 3W87A 3GZ3A 3IV3A 3O6CA 4O4WA 5FF2A 2BX7A 2RDTA 5CPLA 1OG0A 3MI6A 2QCDA 3SW6A 1WXJA 1VZWA 2WPBA 4AWTA 2YCEA 4N9BA 3W6YA 5I3KA 1D3HA 3W1PA 1SW3A 3W7NA 1QFEA 4PC8A 3E02A 2DJLA 1W8SA 3CT7A 2YZRA 1EIXA 3DFOA 1TTJA 3O6YX 2YGYA 1I2RA 1XUZA 1ZNNA 1FXQA 3G1HA 3W1LA 1CI1A 1H7NA 1VS1A 4O1CA 1YXYA 1Z42A 3LOTA 2B0MA 5C2XA 3M16A 3R89A 4CQ8A 5F2GA 3GNDA 1NSJA 2FIQA 2DZXA 3W1TA 3DKJA 5KZEA 5EBUA 4GRSA 3A5FA 3NPVA 3W2KA 3W7KA 3BGJA 2GOUA 1QPNA 2RDWA 4O52A 3UWWA 1SZEA 2H90A 1IXNA 1FWNA 3NQEA 4H3DA 4A22A 2VFHA 4Y9AA 1A53A 4LVDA 4XZ9A 4DXVA 3S1XA 3UY8A 3L0KA 4CQ9A 3MYOA 3SGUA 4NNCA 1IIGA 3C8FA 3EKLA 2V5BA 4TMBA 2X1UA 3S1VA 1H1YA 3TIMA 1E51A 5KTLA 3D0CA 3P8JA 2ZRYA 3KAOA 3DH7A 1Q3NA 2ATSA 4N4PA 1JUBA 2VKZG 1JJKA 2ZDRA 2EPHA 4AHQA 3QH2A 3LCGA 2V30A 3HG3A 4EVZA 3UZJA 1PL9A 2YFOA 4KWWA 2ZZ1A 3M1ZA 4PL1A 4UTIA 5HULA 2ZYFA 1HUVA 4DF2A 4ZQPA 1F74A 2NXIA 4NJGA 1IXQA 1LM1A 4ZQCA 5DCBA 1NFBA 1PVNA 3THQA 5AN7A 5HWNA 3RLUA 2Y70A 3K30A 4MVAA 4LWWA 1RQHA 4MIMA 1HO1A 3ABSA 3W1AA 2NX1A 4UXDA 1ONRA 1LBMA 4PTNA 5FEXA 4HHPA 3L68A 4FNUA 3KX6A 1YDOA 3I7SA 2FPTA 3NR0A 3FJLA 4UFKA 1TV7A 4PA8A 5U4NA 2ZA3A 1KFBA 1S5WA 5FF3A 2A21A 2YR1A 3N9SA 4M7SA 3DFPA 3G18A 3W22A 4QITA 3GR8A 2GVJA 3LCIA 5E1QA 5H2ZA 1T99A 2QAFA 3R8RA 3A22A 4L4LA 4M7TA 5C55A 1F2JA 3VCRA 3LXAA 2HMCA 3TAKA 3HQ1A 4GXMA 4S2CA 4IUOA 2BXVA 4HNNA 4ORIA 4DPPA 1XKYA 1VRDA 3N19B 4DF1A 4JX4A 3M5VA 4LS2A 3WK3A 3THAA 1AG1O 3NQ2A 2BTMA 4FNTA 4YCOA 1M7OA 1JCJA 3L65A 2A5HA 3HPZA 2VENA 4Q32A 3P5YA 1BWKA 2NWRA 2NWSA 2Y7FA 1SO3A 4Z0SA 2VFDA 4HSNA 3PC0A 5F1VA 4O1BA 2GVLA 3DGRA 1GVOA 1NF7A 1GQNA 1K8XA 4PEKA 2E6YA 3MP5A 3TA6A 3VE7A 2Y85A 4MFDA 3SZ8A 1O5KA 4LUIA 3TX9A 3IVUA 3QF0A 4E0CA 4O14A 4JXCA 2J88A 3VE9A 2WSQA 1YLVA 1G4TA 1OFRA 4CNOA 1EB3A 1XBVA 1FDZA 1ML1A 2C1HA 2V82A 4QJ1A 5AHEA 3W86A 1DQWA 1TQJA 3IIPA 2ISSA 4GUIA 4EWND 2CFFA 1JUKA 5K9DA 4TIMA 1GT8A 3QMTA 2CLOA 5AYZA 3TU9A 2ZZ4A 3E12A 3C61A 2ZA1A 1BEUA 2H3DA 1W5PA 5EY5A 1QOQA 1X1ZA 1GWJA 3HG5A 3M41A 1JCNA 1O5XA 3Q94A 3GDLA 1VJIA 4HNVA 3RNDA 4LC6A 4JYFA 2Q3OA 2A7PA 3T4CA 3W7GA 4LRTA 4TX9A 1TTPA 3QPYA 5SWUA 3G0UA 2Y6ZA 4JYEA 4OE7A 5HMSA 4UFJA 3MBFA 3FYPA 4Z08A 3TROA 1G4EA 1OFEA 2CU0A 1H5YA 4R34A 4BI6A 3I65A 3DFTA 5D2XA 3HB9A 2QCNA 3CQ0A 3OA3A 5L9FA 3NYZA 4ADTA 2QUTA 4O54A 5HJLA 1OFDA 5LHFA 4RR4A 1O94A 3LI1A 1GVQA 4WX2A 2ABAA 1JUEA 3CEUA 3PS7A 3C56A 1KTCA 2QDHA 1X1OA 4BWLC 1B57A 2G97A 2TYSA 3LCFA 4X9SA 2PE4A 3M9YA 2RHGA 3LCLA 3QMSA 3GR7A 1KFCA 1MXSA 3FEMA 5G5IA 3PG9A 2R94A 4O19A 2QCHA 2Q8ZA 1H62A 4N6FA 1EWDA 2OMAA 5FF4A 1HFBA 3NZ1A 5FF7A 4O13A 4KKXA 5BW6A 1OK4A 3IGXA 4P2VA 4MZ8A 4JICA 2CLIA 3NQGA 4ZL1A 2BLEA 4O28A 1N55A 3P7YA 1RVGA 1DV7A 4RZ4A 2VFGA 1QWGA 2LLEA 3MWAA 5H91A 3IRDA 4MPQA 4MY1A 4N2YA 3IIXA 3TKFA 4XWUA 4JTFA 4NX0A 3W1QA 1UCWA 5AFDA 1FWWA 1CW2A 5BOOA 2BSLA 1JCXA 4NXKA 4O0KA 1GZGA 1Q6QA 3R13A 4LV9A 5KMYA 3O1NA 1KW1A 5KZMA 2I14A 2VFEA 1JULA 3A24A 2WO5A 5AYXA 3UZ5A 3LX9A 1W5QA 1PCKA 1TPUA 4LRSA 3A5VA 1ICSA 4UUIA 1EUNA 3MYPA 1EEPA 3SJ3A 5DELA 3W7JA 1PIIA 1X7FA 3SY5A 2ISVA 3S6DA 1SW0A 3CEPA 4FEZA 2VELA 2FPYA 1OX4A 1LOQA 4O16A 3LRKA 5IBXC 1GJPA 4QNWA 2V2CA 3F4WA 3GYEA 4K8HA 5CPNA 2ZA2A 1OF6A 1FQ0A 3HBLA 3L9CA 3PVFA 1TPWA 5DCDA 1XBYA 1XL9A 3LV5A 4CLMA 2O7SA 5HQEA 4NQ1A 5A8GA 4NT0A 3OIXA 3W2UA 3PBWA 1VR6A 3BW3A 3UPWA 3S9YA 5F4SA 5D09A 3G0SA 3CWNA 4O10A 2Y7EA 1IGSA 1TRIA 2VEMA 4KWVA 5LNUA 3NQVA 5G2HA 4DF0A 3LI0A 4CCDA 4I7WA 1F6PA 2NZLA 1YXCA 1I2QA 5HINA 4ZQOA 2RFGA 3DFQA 3IVTA 3HGRA 3W72A 2YYUA 2GJLA 4P61A 4UTTC 1XC4A 2CZFA 3INPA 1H7PA 1W56A 4LVBA 2GJNA 5G4WA 5D02A 3NOEA 1P1XA 2A4AA 3S1WA 2RDUA 2GVGA 5DCEA 1KM1A 3IEBA 3LHYA 3F1QA 1FUYA 4UR8A 5CPMA 3E0IA 4O8RA 1ZAJA 3P82A 1PS9A 2FQIA 3GX9A 3W85A 3PB0A 2NXGA 3NL3A 2QAPA 4UFLA 2H3BA 4S2BA 4WY0B 3MHUA 3N73A 2I1OA 1PE1A 3MP3A 4GC4A 5I3JA 3W73A 4GWEA 2CZ5A 2A7RA 4IOTA 2DZTA 3PSWA 5K9XA 4IX2A 4UTKA 3FJ6A 3LGEA 4RJEA 5DXXA 3W1MA 3PUOA 3L2IA 4RKAA 3UXAA 2ZZ7A 1J5TA 1G4PA 2GQ9A 2YX0A 3ZS4A 4UTMA 1EWEA 1EP2A 3GAKA 1TB3A 5HUPA 3CB8A 1PHWA 1H7OA 3TCEA 4DO5A 3QRHA 4AF0A 2VFFA 3GKAA 3M43A 1YDNA 4CCCA 1KFJA 1B9BA 2F7FA 4RZ5A 1A5SA 3NL5A 3LHWA 4ICNA 1FCVA 1H50A 3MP4A 4MFEA 3UWUA 1TPEA 1EPXA 5LHEA 2ZBTA 1AMKA 3O16A 1LLWA 3BK0A 4JTTA 1YTDA 2QCGA 3C6CA 2YFNA 3L66A 1WAUA 2CLKA 4UFMA 3TV8A 1XUUA 2V2HA 2YW4A 4M6PA 3OEXA 4XBSA 1YXDA 2X16A 4A2SA 3EEGA 3U8GA 1JCMP 1GEQA 1R30A 4EF8A 2FFCA 1M6JA 1QMLA 1ZJIA 2IQTA 3P80A 1JCLA 1S5VA 4MKNA 3N9RA 5DN1A 3LV6A 4HIBA 3BGGA 1LYXA 2NLIA 3LHTA 4MLJA 4ADUA 4AH7A 4JIPA 1EP1A 4R33A 3G1DA 4XBKA 4UTLA 2E09A 1Z41A 2G95A 4QQ3A 4FB7A 4DO4A 3NAVA 2C15A 3L5AA 3ABQA 1QPQA 1WA3A 4QSHA 2FDSA 1SW7A 2Y89A 4DPQA 3C2FA 3DENA 3FFSA 3QJAA 1VHCA 4N6EA 3W2JA 1WDWA 3M44A 1TPH1 3NQCA 1WOBA 2ZZ3A 4UTUA 1FXPA 3G3MA 2GUUA 4O1DA 2Z0IA 1VGAA 4S1FA 2VEKA 4KFNA 4O0ZA 4LVFA 3W7MA 4O50A 1VQTA 3GLCA 2TMDA 1VLIA 4NX5A 5I3GA 1G4SA 5D03A 2FTPA 2QCLA 3NO5A 4HN4A 4AWSA 4JD4A 5LKYA 4WQ6A 1AW1A 3S5NA 1WYIA 3NZRA 3VFLA 2PRLA 5C5YA 4GNJA 4O15A 1X8FA 2CLLA 3NM3A 4JIQA 5LGXA 1EX5A 1TJRA 3PG8A 1TRDA 2Z2UA 2Q3RA 2W79A 2DORA 4WOQA 3WJYA 4UTWC 1K02A 4JTKA 1ZCOA 1VYRA 1DL3A 3LCHA 5DY2A 5BRBA 2HS6A 2DZUA 3VKJA 1LDCA 4IPIA 5AHNA 1OFAA 3EWWA 2A6NA 3LXCA 1LORA 1H1ZA 1FX6A 2D73A 3TQVA 5G1YA 2ZZ2A 5CGQA 2EHHA 3TJXA 4K7YA 2E5BA 2OT0A 1H7WA 3GB6A 2P10A 1SSDA 4JS3A 5AHMA 1F05A 3W7QA 2NUXA 2WQPA 4MJZA 1JQXA 3I7RA 3LBCA 4IMEA 4YLWA 3MI3A 3WJSA 5HNRA 3R2GA 4LC8A 4NJIA 3DHDA 5EL1A 3V1PA 3MJYA 3DXIA 5CZTA 4IX0A 1OVDA 4BWLA 1G7UA 2YPIA 4RXFA 1UUMA 2JGQA 3A21A 3TW6A 1TQXA 1AW5A 2BZNA 4RX0A 4YCPA 3LHZA 3TNOA 1ZALA 1R2TA 1LRQA 2DZWA 3EX3A 3JR2A 3MHFA 4J9JA 4EF9A 4N9EA 2WKJA 1DOSA 4AWUA 2QCFA 3KHJA 5K2ZA 3EXTA 1XI3A 1M5WA 3NNTA 1B4KA 1KBJA 1O4UA 3FA5A 1OF8A 2ZZ6A 3W1XA 1CX9A 3PM6A 5J5RA 1VCGA 4HPJA 1VYPX 2ALDA 4GBUA 4RCXA 4POCA 3BW2A 3A23A 3PF3A 2OX1A 1L6WA 4MZYA 4KFPA 1P0NA 1OX6A 3G1SA 1GVRA 3C2VA 1GYLA 1SZFA 3FIGA 4MZ1A 3HO8A 1PHQA 3P81A 4OHQA 1HL2A 1A5AA 5F2LA 4IMFA 4A21A 1VPXA 3G8EA 4OBTA 2J9XA 2R91A 3MMTA 2Y88A 4Z1DA 3S0CA 3ABRA 4O17A 2Z6JA 1DVJA 3LXBA 1U5JA 2C16A 4GFSA 3B8DA 5D38A 4CNNA 4K7VA 1W0MA 4MJMA 1UUOA 1Z44A 1KV8A 4N02A 4LVAA 4BFAA 4FX8A 1O60A 4H6KA 3NDOA 5F2IA 2ZRZA 1LRNA 1TPB1 4MY9A 1K8ZA 4LT9A 1A50A 1TPVA 2DJXA 4O18A 5D30A 3G3DA 4TR9A 1OK6A 4LS1A 4QAIA 2WV8A 4E2BA 3QZEA 3S42A 3ATYA 1VCVA 3P62A 3MBDA 1LLZA 5HR6A 5IBXA 2Y61A 5KSWA 1JVNA 2NX9A 2O7QA 3DFNA 4LTSA 4ZQRA 2OJPA 3LM7A 4JTUA 3FKKA 4RXGA 1JCYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W7KA

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