3W7KA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-6-066
Total Genus 107

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (4-6)TIV2 (11-14)S2 (9-11)TIV1 (5-8)S3 (15-17)EMPTYS4 (40-45)TII1 (18-21)TIV3 (20-23)AH1 (26-34)AH2 (76-86)S7 (94-98)TVIII1 (46-49)TIV7 (100-103)AH3 (103-120)S5 (58-61)TIV4 (54-57)TIV5 (69-72)AH8 (272-277)S6 (64-67)TI1 (61-64)AH6 (225-239)TII'1 (221-224)S14 (217-221)TI2 (88-91)TIV6 (89-92)S10 (187-192)S8 (123-127)S16 (267-270)TIV8 (127-130)AH4 (143-157)TII2 (133-136)3H1 (139-141)TI3 (184-187)AH5 (171-183)S15 (244-248)S11 (196-200)TI4 (203-206)TI5 (204-207)S13 (208-209)TI6 (240-243)AH7 (254-263)AH9 (280-296)TII3 (304-307)TIV10 (265-268)3H3 (301-303)S9 (161-164)3H2 (214-216)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-066
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 107
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w7kA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w7kA01
3U2OA 4O11A 4JD4A 2X1TA 3G22A 3R2GA 4KFOA 4UTHA 1XKYA 3G8EA 4DF0A 3O6CA 4O15A 4R53A 4JNMA 4UTWC 4EF8A 4NJGA 3C3NA 2ZYFA 5HWJA 2DZTA 2CW6A 3L2IA 4NXKA 3LHZA 4R33A 3M7WA 4S2CA 2NXHA 4O19A 1I2NA 3WK1A 4TMBA 1LOSA 3TQVA 2E5DA 3LTYA 3A5FA 6ALDA 3W86A 1EUNA 4HIBA 3I7RA 1MSSA 4UMCA 3FIGA 2QAPA 4P2VA 3OA3A 1L6YA 4BI7A 1VRDA 3SI9A 1W37A 1KLZA 5FF7A 2WSRA 2ZCGA 3W85A 4A3UA 4FNRA 4JTLA 2CLOA 5AHEA 2E5CA 1FQ0A 3DFOA 5FEPA 1JUKA 3W2NA 2FDSA 2VFIA 3RLUA 4FX7A 2F84A 1R2TA 5AC6A 1WOAA 1TJRA 3LRLA 2HS6A 1BWLA 4IX0A 3W1QA 3I65A 2TMDA 3L21A 3I6RA 4UFLA 3F4NA 1SSDA 1OFPA 2FB3A 3W83A 1BTMA 2A6LA 4BK9A 3W1PA 3M5XA 3OVRA 3WK2A 3LLFA 3ZWTA 4UTTC 1S5WA 3PBUA 5HWNA 8TIMA 4K37A 4MLJA 4JN6A 4A22A 1SZGA 4RZ4A 1JQVA 3F4WA 3EXSA 1KFEA 4XQ6A 4GUGA 4UNKA 4UFHA 5MHBA 1LP6A 1J4EA 1TCDA 4NNBA 3V75A 3PUOA 2HMCA 1A50A 3WJZA 5C2XA 5HWMA 1Q6OA 2ISSA 2ZRUA 3UWQA 4O53A 3LCWA 4WQ6A 1PHQA 2IQTA 2ZTKA 2EF9A 4O17A 3DFSA 2VELA 3MP5A 5D2WA 4PCFA 3RLVA 3W76A 3C2OA 3B4UA 5C5YA 3LDVA 3M5ZA 3G1YA 3V1PA 3TW7A 3S1WA 3R13A 3O1NA 3E96A 2FIQA 1X1OA 1QPQA 5LNRA 4GXMA 1JJKA 1TPVA 1PHWA 1OHLA 4NJHA 3NGJA 1JVNA 3DBPA 4O14A 5KZMA 3DFTA 2CLFA 3G0UA 3LCLA 3JRKA 1WBJA 2VFGA 4UMBA 5EPDA 3N14A 3PSVA 4TR9A 4GUHA 3UZJA 3TFXA 2QJHA 3TA6A 1OABA 3E0IA 4G1KA 1W54A 2AGKA 2W0UA 3P81A 1VPXA 3NQ8A 1PE1A 3IEBA 3HGRA 3DKJA 4JR5A 3NL2A 2Q8ZA 1UBSA 2E77A 3CQ0A 4BR1A 3I7QA 5G1YA 1WV2A 4DBDA 4AF0A 2QF7A 3N34A 3WJSA 3P80A 2YW4A 5DLCA 4JY8A 1G7VA 3S1XA 3USBA 4JGDA 1TTPA 2VFFA 3T44A 4WZHA 2EKCA 1GYNA 2E09A 4QISA 5A5WA 2EAWA 4CCDA 1F6KA 3W7MA 2V9DA 4LV9A 1XBVA 2EGZA 2TYSA 1TQXA 2J6XA 3QW4B 1VR6A 4UC5A 4AEOA 2X1SA 3H53A 3GXTA 3PWAA 4C1KA 4JYDA 2CLIA 4UFJA 4FIRA 4K38A 4BF9A 3W22A 3T4CA 5D04C 3N19B 3ELFA 2C16A 2P1FA 1QOPA 3C61A 2OT0A 3UWYA 4Z0SA 4IMFA 2G5WA 4M6QA 3NQ6A 3DI0A 4RZ5A 2Y70A 4CNNA 1M7OA 1KBJA 3NQDA 2VEMA 3ABQA 2CZ5A 4Z1DA 3L9CA 4AVFA 4QIUA 2NZLA 4FNSA 5EBUA 4TO8A 2Y85A 1KTCA 3ABSA 3N2MA 5D2YA 5L9FA 2Q3OA 1QFEA 3LOTA 3N73A 1JCNA 3S0CA 1X6UA 4MY1A 4MJMA 3B04A 1UUOA 4Z1CA 4IUOA 5IBXA 1E51A 2H8XA 3DFNA 3PS7A 3MO7A 3MWAA 4A2RA 4TU1A 1QPRA 3STCA 4NJKA 1XCFA 2ZRYA 3WJYA 4AWTA 3G3MA 1GTHA 3KVKA 4L4LA 4K7VA 3UD6A 3HB9A 2FQIA 5KZEA 2NUWA 2ISWA 4K7YA 1SZEA 5FI8A 4UTLA 1UASA 3W7CA 1SFJA 1HL2A 4DO6A 1GG1A 4AHQA 2TRSA 3QRHA 2ABBA 4WUIA 4Y6GA 3E9AA 5LNWA 2V82A 4Q4KA 1M6JA 2CWNA 4FNTA 3O63A 1ZNNA 1JR1A 1FWWA 3NL3A 4RLIA 3NA8A 3W72A 2WKJA 5TIMA 3HF3A 4DQWA 1DOSA 2Y7EA 3PM6A 3SECA 3PB0A 3IIPA 4ADSA 3LCGA 1J2WA 1XBZA 2QCDA 2GUUA 1TPWA 1QOQA 3G18A 3TSMA 1YDNA 2NV1A 3S5NA 4IWWA 3MP4A 5HR7A 2BLEA 2PURA 1FDJA 1LOQA 1N8FA 4D2JA 2J24A 2CLLA 1SSGA 2QUTA 4AWSA 4GWEA 1I2RA 3CIXA 3NM3A 3QC3A 1WYIA 2WPBA 1LRQA 5K4ZA 2EHHA 4E38A 1LOLA 2X2GA 3LHTA 3W1LA 2VXNA 1NAL1 1GVRA 4UTUA 1H7XA 1G4EA 2GQ9A 4O28A 4HHPA 5DBTA 2WO5A 3QZEA 2ZA3A 1IXQA 1GOXA 3S5OA 3YPIA 4ONVA 3Q94A 2B7QA 5FEXA 4ADUA 1WAUA 1HFBA 5DCBA 3W7JA 3TX9A 5F2LA 1QMLA 3W1TA 2ZZ1A 1JRCA 2XFWA 2PRMA 1C9DA 1QCWA 1JUBA 3DHDA 2CLEA 3KRSA 5BMWA 1H60A 4ORMA 3NEVA 2XN2A 4OGZA 3L0GA 2HS8A 2QUVA 1I2OA 1I8JA 3W7GA 4RCXA 3QPYA 1P0KA 4BFAA 2ALDA 3NAVA 3LLDA 4X3ZA 5G5IA 1KFJA 2ZZ3A 3NNTA 2A7RA 3G0XA 3UXAA 2UV8G 1K8YA 4O18A 3U6WA 4K8HA 7TIMA 1UCWA 4JTUA 1DBTA 4N6EA 1YYAA 1K7EA 3HG5A 4AAJA 1OX6A 4KWWA 1H63A 3LRKA 1T96A 4GUFA 3QSRA 3P84A 3NQEA 1IF2A 5FEWA 1F5ZA 3NR0A 1ZENA 3DI1A 3TR2A 3G0SA 3KVLA 2X1RA 2ZBTA 3CB8A 3QSTA 4LRTA 5EYWA 3KRUA 2VKZG 3LGEA 4MJZA 5GVJA 3TW6A 4FX8A 1VYRA 1KM4A 3SY5A 3LBCA 2YW3A 4CCEA 2Z1BA 3W88A 3DFQA 2FPVA 3LV6A 1F73A 5KMYA 3PBWA 3BPWA 1U83A 3AJXA 3W7LA 2WQPA 3INPA 5F2IA 3IIOA 3QYQA 1KBIA 3S42A 3VFLA 3ZS4A 5FF3A 5D30A 4AWUA 4BWLC 1LBFA 3LCHA 2A21A 2I14A 1HO1A 3HGJA 5KSWA 2NUXA 2QCFA 3HQ1A 4BI5A 4WY0A 4EIVA 3BVJA 3L68A 1B4KA 4YMZA 2DZUA 1LORA 5LGXA 3DU0A 1FWRA 3UY8A 4NX5A 3LCIA 3PUDA 4O13A 1L6WA 3D0CA 4IMDA 4K39A 5D2XA 1VGAA 5AYZA 5AFDA 2JKAA 4RXFA 3NQCA 1YDVA 1H5YA 2R94A 3C2RA 3FYOA 3GVGA 2JKEA 5G4EA 4IXHA 4X2RA 1JRBA 4DO4A 1TV5A 1GT8A 4EWND 1D3GA 2C18A 4JIQA 4JTIA 1IGSA 2A4AA 3PF3A 3OIXA 3GR7A 3IRDA 2PRHA 1FDZA 2YX0A 2BX7A 3KAOA 4FNUA 4UNLA 3W1RA 4DEFA 1YPFA 3UPWA 1CW2A 1TSIA 3A23A 1JCYA 2JK2A 2DZXA 2Z2UA 1NEYA 4DXVA 5CPLA 5T26A 1SW0A 4FXSA 1X1ZA 2A0NA 3R12A 3TJLA 2E5BA 3TCEA 1OFRA 1SO5A 1TIMA 1A5SA 3G8RA 4U4MA 2C3ZA 2C1HA 3EKZA 1H7OA 1KA9F 2OJPA 1RR2A 4M19A 3TSDA 3A22A 3P8IA 4ZQPA 3F1QA 3NPVA 5F1VA 2ZTJA 1VHNA 3HPZA 1O95A 4GUJA 3RNDA 1EWDA 3GKAA 3LTPA 3LXCA 1JUEA 3UXDA 5HUPA 1TRIA 3NG3A 3I7SA 4H4IA 3P60A 3TSBA 3FKRA 4C1LA 2QEZA 5E1QA 1VH7A 3O05A 3ABOA 3NZRA 1UUMA 2DZWA 2J9XA 4O1AA 4IOTA 1LM1A 2PCQA 1FCVA 4X9SA 2JBMA 2Y88A 3W3OA 2QAFA 4QM1A 1EA0A 3SIZA 4ZQOA 4JDYA 4FB7A 5I3FA 1ME8A 5CPMA 1D3HA 5AHLA 1Y0EA 4JTKA 1ME7A 4QJ1A 4Y90A 1LLZA 3OVPA 4ML9A 1NF7A 1S5TA 3DXIA 4LUJA 3W73A 2Y63A 1H7WA 4E2BA 1W0MA 4MLRA 1KTBA 4JY9A 1RQBA 3THQA 1Z41A 2RDTA 4GC4A 3G1AA 3PULA 5AHMA 3A21A 2A1YA 1DJNA 3KHJA 5D09A 3EX3A 1O4UA 1SZNA 3PR2A 1SR9A 3UYCA 4XWUA 1ZY9A 4MZ1A 2BTMA 4MOZA 3QEZA 4Z08A 4ZQCA 4S1FA 3TXVA 3KRZA 3DGRA 3GNNA 1P0NA 1F2JA 1K8ZA 3TC6A 4PODA 1X7FA 1N7KA 1QR7A 1HUVA 2ATSA 1ZCOA 3N9RA 1K7FA 1Q6RA 4JS3A 3NO5A 1TV7A 3TDFA 1GPWA 1ICPA 3LV5A 3C8FA 3P8JA 3TC7A 3UWUA 3W7IA 1GVSA 1OVDA 4XUGA 3MYPA 3W2KA 2GVLA 4FX6M 3HPSA 1G67A 5HUOA 3K30A 1PCKA 3B0PA 5DY3A 2E6AA 4XBKA 4M5PA 3MMTA 1KV5A 4H3DA 3W2UA 1GJPA 4KKXA 5FF2A 4KFNA 4LC6A 2CLMA 1EEPA 1GVQA 1V5XA 2J88A 3QQ0A 4DO5A 2FFCA 3DKLA 3P62A 3MYOA 5CGQA 2QR6A 4IPIA 3LHYA 4PC8A 1PVNA 3CC1A 4O52A 4P61A 1QWGA 4QAIA 2VFDA 2GVGA 1W5OA 1ICQA 4ZQNA 3STGA 4GUIA 2E68A 3G1DA 1Z48A 4JICA 3TJXA 3RK8A 4N4PA 1W3TA 2O7SA 4FIQA 4RR4A 3GNDA 1OF8A 1J5TA 2NWSA 3TK7A 1WXJA 4IMGA 4JX6A 4Q33A 3PAJA 1H1YA 1KM6A 4IMCA 1DKWA 3CM4A 2AQWA 3SR7A 1PL9A 4CQ8A 3LX9A 1Z44A 3P5ZA 1ALDA 2W6RA 3WK0A 1EIXA 1S3HA 1ZAIA 2BXVA 5G4WA 3VE9A 4I9AA 4MYAA 1KM2A 3TFCA 1JCLA 1XM3A 4NUWA 4LT9A 3GB6A 4OT7A 4JX5A 1VHCA 3W7QA 1VQTA 4CNOA 1B4EA 1BWKA 3LI1A 1N55A 1TPH1 1NVMA 1TPUA 1DL3A 1IXPA 3W7RA 4N2YA 4N9BA 3RF9A 3T55A 3W7EA 2GVJA 1TRDA 5E93A 3UPBA 1MEHA 3G1VA 3P82A 3M44A 3T78A 2NV2A 4Q32A 4GBUA 5HNRA 2A2IA 1A5CA 5I3HA 2O7QA 1K7XA 5AC7A 3CT7A 4NVTA 3W7HA 2B4GA 3BW3A 1OJXA 5I3IA 3MI3A 4OE7A 5DY2A 4Z1BA 5C54A 2ZFAA 3M16A 3LXAA 2Q8LA 3PY2A 3THAA 4B5NA 1T99A 1YTEA 1K8XA 5AHIA 3Q37A 3HO8A 3W1XA 4NNCA 1EPXA 1O60A 1AL7A 4N02A 1A5BA 2V8ZA 3HMJG 4AF0B 1OFAA 2C19A 4WOZA 1YTDA 4OV9A 5TBOA 4FHAA 1D9EA 4YCOA 2NX1A 3MUXA 5EL1A 4UR8A 3IVUA 2XN0A 3A5VA 3SZ8A 1LROA 3IVSA 5EMUA 3LCFA 5D2VA 1OFBA 5J5RA 4IJBA 4RV8A 3NXFA 1O5KA 3FOKA 1YXDA 1XI3A 4LVDA 4NZFA 5ABTA 1GEQA 2CLKA 5CPNA 3WFAA 4JTSA 4M6PA 1Q45A 2ZDRA 1H62A 1WOBA 3FEMA 5IBXC 1KM1A 3SGUA 5DCDA 3H55A 3C2VA 1UJPA 3BARA 2ZRWA 3OG3A 4PEKA 5HQEA 3W1AA 2Q3RA 2RDWA 3QFEA 3HGOA 1C29A 1W5NA 1G4SA 2QDGA 4GNJA 3EWUA 1ZAJA 3NQFA 1EX5A 2WNZA 4QNWA 3EX1A 5D02A 1GQNA 2YFNA 3QMRA 5F1UA 3IVTA 1FDYA 3T40A 3CU2A 1GG0A 1FY6A 3PB2A 4XKYA 3TE9A 2ZRZA 4OHQA 1EP2A 2V5BA 1XXXA 5K3VA 3W1UA 3TAOA 1OK4A 1TQJA 2V2DA 4EF9A 1IIHA 3KXQA 5KZDA 1U5JA 2OT1A 4HNTA 2YZRA 4ADTA 4YXGA 5BNKA 1KV8A 3CWNA 1F76A 1L9WA 3CIWA 3W2LA 2Y7DA 3SJ3A 4MKNA 2A5HA 1JCJA 2DZSA 3EKLA 1TTQA 3OHIA 4LVBA 1ZHAA 1TO3A 1I4NA 2QCNA 5CZTA 4ZZ9A 1W5PA 2P10A 4KWVA 4O0KA 1ADOA 1LTDA 1OX4A 2OZ0A 2WSYA 2DU2A 4DBEA 2R8WA 3BW2A 3NQ7A 2H3BA 3HOJA 1GZGA 4JYEA 4LS2A 5KTLA 1YADA 2B0MA 1KTNA 4Y8FA 2QCDB 4LTSA 2DJXA 1P5BA 3NL5A 2QCEA 5AN7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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