3W7L | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-075 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	106
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7lA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7lA01

1TPEA 1ZALA 3W07A 1RR2A 1SW7A 3S5YA 4JTTA 4LUIA 3MJYA 2VFIA 4LC6A 1H7RA 1F7BA 4HHPA 1KTCA 3W3OA 3S5NA 3DFSA 3TR2A 3PS7A 4WY0A 3M9YA 3L68A 3L0KA 5CPOA 1B4EA 3MP5A 1OHLA 2R14A 3NG3A 3EWXA 3P7YA 3FKKA 4M6PA 3NQCA 4MYAA 4NUWA 4NXSA 3G0SA 3C2FA 3ATZA 2FPVA 4ADTA 2V82A 4UTWC 1SO5A 4RK8A 1KFLA 4UTTC 1SO3A 1I2PA 1ONRA 3GR8A 1WX0A 2Q8ZA 1ZNNA 5EY5A 1D9EA 4IMEA 1JCLA 4UC5A 1UASA 3UWWA 2ZTJA 4AHOA 4BWLC 1RQHA 4Z0SA 2VXNA 4AF0B 2GQ8A 4MFEA 3W72A 1ICSA 5AC7A 4MOZA 1ME8A 2JK2A 3QM3A 4QSHA 1SZNA 1JRCA 3NQMA 2B7PA 1FDZA 3F4NA 1QR7A 4MJMA 1HO1A 3STFA 3M44A 2OMAA 3TFCA 1JUEA 2GUUA 4RZ4A 3UPBA 5BRBA 5TIMA 1OK6A 5HMSA 2VFEA 3CEUA 1NF7A 2CFFA 3L2IA 3PUEA 3HGJA 3E12A 2E6YA 2QR6A 4M6QA 3QQ1A 3W7LA 1TV8A 3GR7A 1GVSA 2WSRA 1I2OA 2V5LA 1R30A 1OX5A 1YXDA 2C6QA 4UFHA 4WXYA 1C9DA 4ALDA 4NNBA 1MSSA 2V9DA 1W3IA 1KBIA 1OVDA 1M5WA 1VS1A 4UIOA 4ML9A 5HUPA 4LVBA 1ML1A 4AVFA 2ISSA 2RKXA 3N2XA 4CLMA 2FIQA 3PBVA 2JGYA 1H1ZA 1EUAA 1EEPA 2QJIA 3M41A 3W86A 2DJLA 4ZMGA 4PFMA 2JGQA 1G67A 2VFHA 3NVTA 1F6KA 2DZVA 1YPIA 4UTKA 1W1ZA 2DZTA 2DJXA 1AW5A 1UB3A 5HR6A 1D3GA 1QPOA 1Z41A 3DH7A 4U28A 1PVNA 1T96A 3Q94A 3WJZA 3IRDA 5FEZA 3HJZA 3TMLA 2E5BA 4HNTA 3CM4A 4QNWA 3THAA 1BWLA 1NVMA 3DHFA 1L2UA 5D32A 3NZ1A 4OGZA 2EAWA 5D09A 2GQ9A 3S1UA 2WJZA 1FWSA 2ZRVA 4DF0A 4Z0JA 2FPYA 1FCVA 1QCWA 4GC4A 3MP4A 3NGJA 1YYAA 1EA0A 1RQEA 4PL2A 2YZRA 5HWJA 4NX0A 2CZDA 3UQNA 5IBXA 1XDLA 3BVJA 1A50A 2NV2A 3R12A 1VR6A 5D37A 3CTLA 5AYYA 3G18A 1XUUA 3OHIA 2H8XA 1GOXA 3NR0A 1JCNA 1I4NA 4AH7A 3PULA 3A5VA 1EP3A 3FOKA 1YXYA 2CZEA 1G4PA 2VKZG 3ZR4A 5CPLA 3DI0A 5K4XA 2BTMA 3LI1A 4RR4A 2PE4A 3GX9A 2Y88A 5CZSA 1QWGA 2P10A 4LT9A 1JVNA 3GLCA 1R2RA 3W1UA 2C16A 3HBLA 2B0MA 1BEUA 1I2NA 1W37A 5EL1A 2X1TA 4IX0A 3B0UX 4TIMA 4AEOA 2CLEA 1QOQA 2X1SA 3R2GA 4JNMA 3EXSA 2CU0A 2C13A 2WV8A 2PC4A 1GWJA 4B5NA 3PG8A 2BX7A 3Q2DA 2HTMA 5K9XA 3F4WA 5HR7A 4DF2A 3K30A 3RF9A 4WY0F 3NZRA 3KVKA 3WK3A 2ZQ0A 4O8RA 4X3ZA 2O7QA 2E68A 1NFBA 2FLIA 3OG3A 1LCOA 2UV8G 4FO4A 3CLMA 1SFJA 1VCFA 3HMJG 4JTKA 2TSYA 3LI0A 3GYEA 3CEPA 3TSBA 3FYOA 4FEZA 5G2HA 1GVRA 4LV9A 2RHGA 1IXNA 1IF2A 5EKYA 1KM3A 3EWWA 3OVPA 2BZNA 3EXRA 3SW6A 1W54A 4YXGA 4KFOA 3QYQA 2YX0A 4IOTA 3W7RA 3BO9A 5HNRA 3KXQA 4M7TA 5LNWA 1VLIA 3P60A 4XTIA 3GDRA 1UCWA 4O1DA 2QCMA 2NZLA 1PIIA 4QJ1A 3W7EA 4WY0B 4NXKA 1VYRA 1RZMA 1FX6A 2VFFA 4MZ8A 1DJNA 4YL2A 1OFRA 1W31A 1KFBA 4UTIA 3NQVA 1AW2A 1EP2A 5D2TA 4QISA 1EPXA 1WA3A 3CC1A 4K8HA 4K37A 1Y0EA 1XM3A 4IMGA 1SZFA 3VE7A 4POCA 1M7PA 4O57A 2QF7A 2TRSA 5AHIA 5MHBA 1DJQA 5CSSA 3PG9A 3W71A 5LNSA 5ABTA 2XN1A 3DENA 1SQ7A 3N14A 5A8GA 3G1AA 1I2RA 3S5OA 3G0XA 2AQWA 4PL1A 4UTMA 3UY7A 3IGUA 2CZFA 3P80A 4JTSA 3FA5A 3EWBX 3QRHA 4LS1A 4XZ9A 1YLVA 1W0MA 2NUYA 1VH7A 1IIGA 3QMSA 4ICNA 4MJZA 1WOBA 5L6UA 3W7GA 3TCEA 1I2QA 3R5EA 2Y70A 3TC6A 3W1TA 1FQ0A 3NL2A 4UMAA 1VZWA 4LVGA 3G1DA 4O18A 4DEFA 5DELA 2VC6A 2TYSA 2NUXA 2FPTA 3E49A 3FEMA 4GUIA 3USBA 1GYNA 3O1NA 1A5SA 2YW3A 2ZZ3A 1THFD 2TMDA 5E0KA 3PB2A 2QUVA 4ADUA 4DO5A 4XKYA 2IQTA 3O07A 2FTPA 4JX5A 3DGRA 2GVJA 4HPJA 1P4CA 3W2KA 1XFBA 2FDSA 4DF1A 4JIQA 4C1KA 3G8RA 2FB3A 4CQ8A 1OYCA 1R46A 4UTLA 5DBTA 2H3DA 5KITA 4JYEA 4CNOA 3F03K 3N73A 4WX2A 3ZWSA 3KHJA 2Z6IA 4AAJA 1QAPA 4JX4A 4UMCA 4ZQRA 3LBMA 2ZA3A 3RLVA 1HG3A 2F84A 5SWUA 4HKPA 4MLJA 3PR2A 4MVAA 2CZ5A 4O17A 5K4ZA 5E93A 3EX4A 2VELA 4XTDA 1O95A 3W84A 3LXAA 3W2NA 4NQ1A 1B9BA 4TR9A 5LNVA 2VFDA 3QSRA 3UWYA 1ICQA 1WDWA 1LLWA 1PCWA 4ADSA 1WQ5A 5G2IA 5I3IA 4QITA 3TQVA 4UNKA 4R7JA 3CT7A 1OF6A 1PS9A 5LKYA 4FNUA 4RXFA 3B04A 1GVOA 1VYPX 1OK4A 2B7OA 3NM3A 3OVRA 4BFAA 1Z44A 2D73A 4O50A 5A5WA 2GQAA 3HQ1A 4O11A 2P1FA 2YR1A 3L21A 1YDVA 2ALDA 4CNPA 2TPSA 2X16A 1J5TA 3O15A 5C2XA 2W6RA 3UXAA 1P1XA 1YTKA 4GUHA 3UZ5A 1QMLA 3BARA 5BOOA 2NXHA 1SPQA 2CLFA 3M5ZA 4O16A 2GPTA 3PVFA 4FNPA 2QAFA 3AO0A 2PURA 3GAKA 1M6JA 1TJRA 5HWNA 3NPXA 2ZZ6A 4K38A 4DBEA 3IIVA 1OYAA 5DXYA 2E6DA 3OEXA 5D2XA 3GK0A 4GE8A 2F7FA 3G1XA 4IQLA 2ZBTA 1HO4A 2B7NA 1N7KA 1UUOA 4A22A 2ZCGA 5DBUA 2B7QA 1OJXA 2WO5A 2FQIA 2C18A 1GTEA 4UFMA 4ZQMA 4HSNA 3CU2A 4FXSA 4JTHA 3TAOA 1T8XA 1H50A 2VEKA 1OFDA 3MBDA 3L5LA 4LTSA 3HOJA 4XBKA 1YDOA 3C6CA 2VENA 1KFJA 4ONVA 3DFNA 1TTJA 2HS8A 4JS3A 3UWQA 4M19A 3NPVA 1LOQA 4ZZ9A 3M16A 2X1RA 3SJ3A 2YFNA 3LCHA 1LORA 5D2YA 3ZS4A 5EYWA 2XFWA 2ZZ2A 5D05A 3TMQA 4H3DA 1ZAJA 1L6YA 3L66A 1WBHA 4GFSA 3G3DA 3C2OA 3LB0A 4LWWA 4XWUA 4N2YA 5H91A 3M43A 5LNRA 2V2CA 4AXKA 5AHNA 3C2RA 3DAQA 2NXIA 3D0CA 1P0KA 3N2MA 4NVTA 3TNOA 1IXQA 2BXVA 4TMCA 1HL2A 2DU2A 3PF3A 5CZ0A 3NM1A 4IPIA 4IWWA 3TKFA 2H3BA 4YWIA 3LRMA 3BK0A 3R13A 3THQA 3EX6A 1H51A 5FEWA 4N6EA 1XUZA 1FCQA 3O6YX 3LLFA 6ALDA 3CQ0A 3TAKA 3LTPA 1GZGA 1H63A 3HIJA 4M7SA 1OX4A 2HMCA 1DL3A 1Q6RA 3EWYA 3P84A 1LRTA 5CPNA 2ABBA 2H8ZA 3ABQA 3PM6A 4GUGA 2OT0A 4O1CA 3FIGA 4BI6A 3W1LA 2CWNA 3C0JA 5J5RA 5AN7A 1TTPA 3FS2A 3GXNA 3UWUA 3GXTA 5KINA 3TSDA 4WOZA 1J4EA 2FFCA 1SUXA 4JTIA 4GRSA 3SSJA 4PA8A 1K8YA 1YTDA 4XKYB 3U8GA 5I3GA 3W88A 1K03A 3MHGA 3W7OA 4IX2A 1QPQA 2RDWA 4U4MA 1H7XA 2V5BA 4H6KA 3S8HA 3KVLA 1F2JA 2A7NA 1KM2A 4O0ZA 4YLWA 4I7VA 4UFKA 2J9XA 2DORA 4JIPA 1TQXA 1QFEA 4IMDA 2V2DA 3LCXA 4P2VA 2QJHA 1WYIA 1D3HA 1YTEA 3G1FA 1MEIA 2AAMA 5E1QA 1R2TA 1PCKA 1QDSA 3P62A 2PRLA 3W7KA 1PHQA 2CW6A 1DHPA 4JICA 4O19A 1OFBA 4MZ1A 5TQLA 4L4LA 5CZJA 4ZQCA 3GKFA 3W7PA 3GDKA 1XDMA 3HB9A 3QZEA 2WPBA 4WQ6A 3TA6A 3OBKA 3LRLA 3S1VA 3UYCA 3GXPA 4UTWA 4WD0A 5D02A 3SY5A 2C14A 4IUOA 4HNVA 3BV4A 4UTTA 4JTUA 3I68A 2LLEA 3RFAA 4BI5A 1O5KA 3NOEA 4S2BA 4AHPA 4OV4A 1EWDA 3WJWA 2I9EA 2E5DA 3EXTA 1JCJA 4BWLA 1VLWA 3NYZA 4LS0A 5AYXA 3LCGA 4RLIA 3VE9A 4JR5A 3TJXA 3I7SA 3QH2A 4OT7A 1MO0A 4CCCA 2YW4A 3ABSA 3W22A 1MZHA 1CX9A 4HIBA 1W8SA 5C5YA 3NXFA 4Z1BA 1X8FA 1Q45A 1XKYA 4JTFA 3C52A 1DVJA 1MXSA 2H6RA 4CCDA 3DKLA 1O60A 3LBCA 3Q37A 2YPIA 1KV5A 5D04C 4UUIA 1OABA 5DCBA 4IXXA 3NQGA 5FEPA 3BG3A 3HGRA 4Z08A 1X6UA 4DPQA 4O12A 2QDHA 3M5VA 4O4VA 4O15A 1QPRA 3NAVA 1FWRA 3R89A 5DCEA 5K2ZA 1LRQA 4RJEA 5CGQA 1OFEA 5G4WA 2QCEA 3W1RA 1KFKA 2NLIA 4N9EA 5AC6A 1KLYA 1W5OA 1HFBA 3LV5A 5TBOA 3L0GA 3L5MA 3LGEA 3UZJA 2A7RA 4XBSA 1JCMP 2OX1A 3KX6A 5C54A 1RV8A 4NJGA 2Y85A 3HG3A 4IGHA 4EOUA 2ZA1A 2QAPA 3ABOA 2ZRYA 3VI2A 3L65A 2Y63A 3YPIA 2BWGA 2QUUA 1PE1A 4J9JA 3V1PA 2A2IA 3ZFHA 3SFKA 1W5MA 4FIRA 2Y7DA 3VCRA 3N34A 2Q3RA 1MEHA 1IIHA 3IGSA 3L5AA 4X2RA 2A21A 3G1SA 2NV1A 1N55A 3CHVA 2E1DA 3W74A 1C8VA 1KTBA 2GVLA 2ZZ4A 1L9WA 1VJIA 4A21A 2XN2A 2YSWA 4O53A 1QNVA 1B3OA 3W2LA 4UXDA 4PTNA 2ZZ5A 3A5FA 1TJPA 1OFQA 3B8DA 2BSLA 1TIMA 4JTGA 1GG0A 4MIMA 3M0ZA 2QCHA 4CCEA 4O4WA 2EHHA 1T99A 3EWZA 4IJBA 3SGZA 4MPQA 2WNNA 3I6RA 3LCLA 4AHQA 3WJYA 4A29A 4UR8A 1ZJIA 1VGAA 1QOPA 4WXZA 4ORMA 1TSIA 3I65A 3M7WA 4HNUA 3P8JA 3S42A 2NWRA 3EB2A 1DQWA 4XQ6A 3A9IA 5KZEA 3H53A 1Q6QA 1SZGA 5AOUA 4EIVA 2R91A 1AL8A 4JDBA 3B05A 3NDOA 2CLMA 5AC8A 3W83A 3P8IA 5D38A 1TPVA 3GDTA 3HPSA 3TQKA 2E77A 1VCGA 5I3JA 3IIXA 5F2MA 4FNSA 1EP1A 1OX4B 1FCUA 2WQPA 1JULA 4NZJA 3HPZA 3TC7A 4W9TA 1BWKA 3LXCA 4Q33A 4MKNA 4LOCA 4TU1A 3W2JA 2R8WA 3WK2A 3BLEA 1YXCA 1FWNA 1EUNA 1I8JA 1K3UA 3AJXA 2Z1BA 5D33A 5I3FA 3LDVA 3IVSA 3UPWA 4HN4A 3LHVA 1VYSX 2CLHA 5EBUA 1TPH1 5KZMA 3DI1A 3TIMA 1NAL1 4ZVJA 2A0NA 3W1MA 1Q6OA 1DV7A 5FEXA 1LTDA 4UFJA 1TPC1 1EX5A 4FB7A 8TIMA 4R34A 2ISVA 2ABAA 2YCEA 3PSVA 2NX9A 2ISWA 4GWEA 4MY1A 2V8ZA 3LERA 1RPXA 3M5YA 2Z6JA 1E51A 2EKCA 3PBWA 2GVGA 3B0PA 1TRIA 3M47A 1SFLA 1XI3A 3QW4B 1KM4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7LA

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Chord Diagram

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