3W7L | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-075 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	106
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7lA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7lA01

3G1YA 2VELA 5E1QA 4DEFA 3PY2A 2QJIA 1A5BA 1YYAA 5AN7A 3DFSA 1GT8A 5C6MA 2GQ8A 1TRDA 4ZMGA 2ZTKA 2QEZA 2ZQ0A 4JGDA 1LOSA 1RV8A 4FXSA 2ZZ6A 3Q2DA 4YCPA 4O13A 5AC6A 1MEHA 3PUEA 5I3IA 4WX2A 1TPFA 4NXKA 2PRLA 5EL1A 3U2OA 4JY8A 2ZRVA 4LVGA 2YW3A 5LNVA 2NV1A 3QQ1A 3USBA 2V5BA 4XQ6A 1JCNA 1K3UA 3LV6A 1KFEA 3KXQA 3W7JA 3G1HA 1HO4A 4X22A 3LRLA 2G96A 4MKNA 4LV4A 1SSGA 3TFXA 2E6DA 5CPMA 4I7UA 5HMSA 1FCUA 2ZDRA 4DBEA 2X30A 4WY0F 1I8JA 3G1XA 3UWYA 4LVAA 4UFJA 5BRBA 2C1HA 3W73A 3U6WA 1OK4A 2JBMA 1OJXA 3WJZA 2Z6JA 3KRZA 3W7GA 3F4NA 3M5XA 4XKYA 3UD6A 3PUDA 4HHPA 5LZLA 3N19B 1RD5A 3S5OA 5C54A 5LGXA 3CQ0A 4FNPA 3N2XA 5HJLA 5FI8A 1FDYA 2Y61A 1VYPX 3L65A 1JR1A 1YXCA 1DKWA 4H4IA 3ZS4A 4GBUA 2DZSA 3MO7A 1LROA 1H7RA 2DORA 3G1DA 3ZWSA 2QDGA 3G0XA 4FEZA 1TPVA 2QJGA 4DF0A 5D02A 3MJYA 2WNZA 3WK2A 4LWWA 2A6LA 2YCEA 5K9CA 2A7NA 4JTTA 4KFNA 1TO3A 1SW0A 5D05A 1KM5A 2PC4A 4K7YA 4BFAA 4EOUA 2C0AA 3HOJA 3G0UA 1W3NA 2FLIA 4GUIA 5HWJA 3CHVA 3NO5A 3NNTA 1EUAA 3MMTA 3W07A 3QF0A 4FIRA 4RZ6A 5J5DA 1J5TA 1TB3A 6TIMA 3W7RA 3TIMA 1FQ0A 4E0CA 4GNJA 3LXBA 3STFA 1VHNA 3CWOX 4MLRA 5EMUA 4OBTA 5K9DA 2A6NA 5AHMA 4WUIA 3GZ3A 4UNLA 3GXTA 2GJNA 1X1ZA 5MHBA 3SSJA 2VFDA 3GDRA 1LYXA 5G4EA 2Y6ZA 3NDOA 4ONVA 3A23A 3N34A 2VXNA 3B04A 2H3DA 3T4CA 4O12A 4ADUA 3MI2A 2XN0A 5F4SA 3H54A 2RDTA 3W72A 2XN1A 3EXTA 1ZCOA 3N9RA 2WSYA 1ICSA 1EP3A 1W1ZA 1GG0A 3LCIA 3RU6A 1LOQA 3LCHA 2QUTA 1ZAJA 1OX6A 5HINA 4IQLA 3TSMA 1D9EA 2OX1A 3NM1A 1VCGA 4EF8A 1TRIA 3L0GA 4FIQA 3P7YA 1KM4A 3DGRA 2ZA3A 4JTJA 4WD0A 3HB9A 3HMJG 1SZFA 3S1WA 3MI6A 1SUXA 5K9XA 1GVQA 3TXVA 4WY0B 3IGSA 3TQ0A 3TK7A 1OK6A 3M16A 1Q45A 1XBXA 2VFEA 4TIMA 1P0NA 1TQJA 4NNAA 3LGEA 3MUXA 5D30A 7TIMA 4NUWA 1KFJA 1W3IA 1F05A 4UUIA 2H8ZA 2C13A 1RVGA 4NXSA 5D2XA 2GVLA 3G8RA 2C19A 1Q3NA 1MEIA 4E2BA 1KFKA 2HS6A 4U28A 2E6FA 4UR8A 4X2RA 1OVDA 1NFBA 3TKFA 3HPSA 3TSBA 1YDOA 1RQHA 3T78A 3HG3A 3BW2A 1QPQA 2GVGA 5I3JA 3W7CA 1DVJA 5G5IA 3I6RA 3MHFA 4WQ6A 5I3KA 3HG2A 2QCHA 1JCYA 4MY9A 1PCKA 1M7PA 3G1VA 4WZHA 1R47A 2YX0A 4L4LA 4IXHA 5K3VA 4O14A 3W7DA 3TH6A 3LLDA 1W0MA 4PH6A 3W83A 2DZWA 1G7UA 3TW6A 4HT3A 5C2XA 3CU2A 2VEIA 3LCFA 1XXXA 2E5BA 2NXIA 2V2DA 4O52A 4K38A 3EWWA 4LVBA 1VLIA 3NQEA 1YADA 1OHLA 3W2NA 4NJJA 1R30A 1OFOA 4OV9A 1HTIA 3W7IA 2RFGA 1ALDA 3BVJA 3UY8A 4OGZA 1WAUA 4YWIA 1YTKA 1H7NA 3B4UA 4N6EA 5DXXA 4UTJA 3TV8A 1GVSA 3TMQA 1OFAA 4PTNA 3O63A 3LI1A 1W54A 4OT7A 5KZMA 3SZ8A 3SGUA 4M19A 3EXRA 1VRDA 3ABOA 2E77A 1PS9A 1FCQA 1XBVA 1SW7A 2E1DA 3DI0A 2X1UA 3LTYA 2ZZ1A 4AMAA 5F2GA 4JXCA 3CIWA 4R33A 4JTKA 5J5RA 1SO4A 2YPIA 3NQCA 5CZSA 2C16A 3VE7A 3W7MA 3NZRA 2J24A 4IJBA 5LHEA 1KM6A 3FFSA 4Y90A 3R2GA 1SFLA 1U5JA 4NX0A 3BLIA 1K03A 3HPZA 1VC4A 4JYEA 2NXHA 3W7LA 2X2GA 1H50A 4ORMA 5GVJA 2GUUA 4HKPA 2Y89A 2RDUA 3SY5A 3S8HA 3W76A 1W37A 2ZZ7A 3O6YX 1H7WA 3S1UA 2A0NA 4DELA 1QNVA 3NL5A 3NAVA 1KTNA 3AO0A 1E51A 3W1RA 1DORA 4UTKA 4O4VA 3BG3A 1KA9F 2JK2A 2RH9A 1H63A 4UMAA 2DU2A 2NUYA 4LS2A 2P0OA 1YDVA 3W7OA 3S5NA 3I7RA 3W71A 4GUJA 3WFAA 2VFGA 1F74A 1RQBA 1XC4A 5AC8A 3NQDA 1WV2A 1TQXA 3IRDA 3VFLA 3SGZA 2CWNA 5AYZA 5EPDA 2JKAA 1N55A 3UPBA 1P5BA 3TQKA 4UCGA 1W31A 2CLLA 3GDKA 1G67A 3KRSA 3GIYA 1ZNNA 3W3OA 4W9TA 3UZ5A 3W2MA 1VCVA 1Z42A 3QJAA 2FPTA 3BLEA 3OVRA 4OE7A 2X1RA 1R2SA 5G2WA 1LLZA 4KKXA 3TC6A 1BKSA 4CLMA 5CPOA 2QCDA 3TFCA 1FX6A 2CZDA 3P61A 4UXDA 4TX9A 3P8IA 1D3GA 4ORIA 3UXDA 4DO4A 4E38A 4A21A 2J27A 1LP6A 3BGGA 4RV8A 4O0ZA 1DL3A 1W5QA 2YYTA 1YTEA 2LLEA 4JYDA 2X1TA 4QM1A 1F76A 2V0TA 4GFSA 2WSQA 2AQWA 1ZAIA 4UR7A 4YMZA 2YW4A 2YR1A 1H1ZA 4M5PA 3UWWA 4QQ3A 2WNNA 1FUYA 1IF2A 5DCEA 5AHFA 4RCXA 3NZ1A 3FLUA 1RZMA 5DCDA 3OVPA 3FJLA 1JULA 1W5PA 2JGQA 2JGYA 4PC8A 4NX5A 1W8SA 1SO5A 4FNQA 3DFOA 2A1YA 1SZGA 5I3FA 2W79A 4M6VA 4Z0SA 1UB3A 4A29A 1PVNA 1TPEA 2QCFA 4HPXA 1AK5A 5DY3A 3W2KA 1EWEA 3LXCA 4BWLA 3W7HA 4UTMA 2NWSA 1LLWA 2YXGA 2VEKA 4LUJA 4N2YA 4HNVA 1HG3A 1Y0EA 2FB3A 3W23A 2A5HA 1ICQA 3BLFA 2DZXA 3OHIA 1W56A 2QKFA 4X3ZA 2PCQA 2ATMA 2ZA1A 2G97A 4IMEA 4UMCA 4Z08A 4K8HA 3SECA 3PC0A 1QOPA 4C1KA 3N2MA 1BEUA 1U83A 3DHDA 3EWYA 4GWEA 4M6QA 4ADTA 4LV9A 3VNDA 1QFEA 2Z6IA 4YLWA 3GK0A 4O10A 1SPQA 1S5VA 4XZ9A 2J88A 1W5NA 2FTPA 3M6YA 1XBZA 4LNYA 2VOMA 1Z44A 3ANYA 1WBJA 3M5VA 2CLEA 4O8RA 3M41A 1ME7A 4AF0B 5D04C 4RXFA 1C9DA 1KM2A 1G4TA 3G24A 1VLWA 1DQWA 2ZCGA 1EX5A 3A5VA 3PUOA 2ZFAA 6ALDA 2Y7EA 3M1ZA 1NF7A 2WSRA 1UUOA 2DP3A 1OFDA 3JS3A 2QCLA 2NWRA 1JJKA 1RR2A 4A2RA 4EF9A 2CLMA 2E09A 1EB3A 3IGXA 4RR4A 5BW6A 4JX4A 1IIGA 1DJNA 1CX9A 3JR2A 2JKPA 3C2OA 3G3DA 5G1TA 1HL2A 2V82A 1SR9A 4FF7A 3W2LA 3WJYA 3W1LA 3LI0A 1AL7A 1F7BA 3MW7A 4NJGA 4O1CA 3HO8A 1I2OA 3DU0A 4PODA 3O15A 3W9ZA 3W85A 4EWND 5KITA 3P8JA 3C2VA 2Y88A 3P84A 1P0KA 3EX3A 3G18A 3P67A 2ZRXA 4MUZA 2CLKA 1F6KA 1ZFJA 5HUPA 1QPRA 3PSWA 1Q6OA 4HNNA 2H8XA 4M7SA 5CZTA 3W88A 1VQTA 1DJQA 1F5ZA 1QO5A 4J9JA 4K37A 1ME8A 1B3OA 2AGKA 3TAKA 3QZEA 4QNWA 2ABAA 4BWLC 2W6RA 1YPIA 4R34A 4XUGA 1GYNA 2QAPA 3NQ2A 3LCWA 2FPVA 3R13A 2R8WA 4FX6M 2CLHA 3C6CA 3IVTA 3LHUA 4PA8A 1I2PA 3W74A 4K8EA 3GXPA 3GXNA 2WPBA 5I3HA 1YTDA 3TR2A 2W0UA 3W1MA 5D09A 4JEQA 2YYUA 2QCEA 5AYYA 4IUOA 1VS1A 1SQ7A 4Z0JA 1H51A 2DZPA 3WK3A 4IOTA 4UNKA 4UTIA 4IXXA 4HPJA 3P74A 5IM51 4NJIA 3W7PA 1L2UA 1AMKA 1VGAA 2D73A 5AB3A 1VJIA 5G4WA 4AAJA 5E0KA 5AHIA 2TRSA 3ATZA 3BV4A 4JIQA 4KFOA 2YDAA 3BARA 1IXQA 2WNQA 2J9ZA 5AOUA 2OZ0A 2RKXA 1OYCA 2B7QA 3QW3A 4IMGA 3SI9A 1PHQA 1QPNA 3UWVA 3ATYA 3VKJA 2VEPA 1EP1A 1MO0A 3K30A 3QSTA 3M47A 1KLZA 3TCEA 3FKKA 4TU1A 5D33A 3M0ZA 3R89A 1YLVA 2CLOA 1ICPA 2YFOA 2HSAA 1SZEA 4WJEA 3LDVA 2V5LA 1JQXA 4MJZA 5F1UA 3W22A 2ZRUA 3GVGA 3DKJA 2NUXA 3T40A 4PFMA 3L2IA 2NV2A 1H62A 1OYBA 2JKEA 1ZHAA 2TPSA 4MYXA 1W3TA 5D2WA 2DZVA 2Q8LA 4Z1AA 1AW1A 4ZQNA 2PRHA 5KMYA 5F2MA 3DFNA 1GG1A 1OX4B 1SW3A 4PEKA 5DBUA 1AG1O 1Q6QA 3HG4A 5SWUA 2XFWA 3G1FA 1O94A 5EY5A 4Y9AA 1WDWA 1N8FA 3NQ6A 3LV5A 2VFHA 4LVFA 3CEPA 3W75A 3QW4B 4QAIA 3DI1A 3IIOA 5CKSA 3GR8A 1JUEA 2H6RA 4IMCA 5F2IA 4UFKA 2B7OA 3E0IA 2NX9A 3Q94A 4QNEA 4DPPA 3NL2A 1BWKA 3WJWA 3C8FA 3IIZA 3TDFA 2CFFA 4UTUA 1KTBA 3DAQA 1KM0A 4FX8A 1LRQA 2EKCA 4MVAA 5HUOA 5FF2A 1JRBA 5DBTA 5D2VA 5AFDA 2NX3A 1PCWA 4GUGA 1TREA 2FPYA 5FEZA 3THQA 5EA9A 4FNTA 1M6JA 1SZNA 1O4UA 1FDZA 1LBLA 1HO1A 4TO8A 2E5CA 3LTSA 5CSSA 1NSJA 4PL2A 4XWUA 4GJ1A 1THFD 5IBXC 1EEPA 2B0MA 2DZUA 1X8FA 3HGJA 2FQIA 2ATSA 3LLFA 4AEOA 1QMLA 3NXFA 3QQ0A 5FF0A 1PE1A 1KW1A 1JUKA 1OFQA 1K02A 1R46A 2EGZA 4IWWA 4JTGA 4QISA 4GRSA 3RLUA 3L0NA 3QYQA 2ALDA 5CG7A 2ISSA 4RLIA 4QITA 1TPB1 5KTLA 2V9DA 3OA3A 3HPXA 4A2SA 3W86A 4UFLA 3INPA 1QCWA 1OFBA 5FEWA 1TJPA 3GNDA 4ALDA 3WJSA 1TSIA 5FF3A 2OMAA 1FWSA 1XKYA 4ZQCA 1H60A 3I65A 4MZYA 2CLFA 1OX5A 1NEYA 1VHCA 3G22A 1DV7A 5DLCA 5BMXA 5U7SA 3MYPA 2WQPA 3BG5A 4S1FA 1ADOA 2J9XA 1XUZA 3GAKA 3QFEA 3S1VA 3NQFA 4RZ5A 2X16A 1JCLA 1KTCA 3DFQA 2DZTA 3NQ8A 1T0OA 1JQVA 3IV3A 3L5AA 3PBVA 5CZJA 4LC8A 4H6KA 2HMCA 4O1BA 3GDTA 5LNRA 2R94A 1H7PA 2P10A 3KVMA 1V7YA 1JVNA 4MFDA 1ZAHA 3LCXA 4JDBA 4RJEA 2YSWA 4LC6A 3EEGA 3UNDA 4PCFA 1UASA 2WKJA 2BLEA 3G1AA 1IXNA 2E6AA 3MYOA 3KX6A 3B06A 2V81A 3NQVA 3HBLA 2NZLA 1M7OA 4ZZ9A 2DJXA 4HNUA 3R8RA 3C2RA 1KV8A 4RKAA 1K8ZA 3QPZA 3L5LA 3PG9A 2ZTJA 1MSSA 3L5MA 4QSHA 5HQEA 4A22A 1AW2A 4K36A 3W1QA 1VCFA 2H90A 4AHPA 4MYAA 5CSRA 3O1NA 2OT0A 3OEXA 3GX9A 4LVDA 2CZEA 2PURA 4LW7A 4LRTA 3TE9A 1LBFA 3PF3A 3QC3A 3C61A 3IVSA 5C55A 2NLIA 1LTDA 1UUMA 3CTLA 3F1QA 5AHNA 3VI2A 1NF0A 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1HFBA 4O0KA 3UWZA 3TW7A 1YXDA 5G1YA 3ABQA 1IXPA 2FFCA 4UFIA 2R14A 1WOAA 3P81A 1KLYA 3W1UA 1PHWA 3EB2A 4POCA 2CZFA 2A4AA 1EP2A 5BNKA 3OIXA 4BI6A 1LRNA 3RNDA 3TX9A 4GC4A 5CPNA 3E49A 4YXGA 2A7RA 1NVMA 4Z1CA 2QCCA 4O15A 5LHFA 4NVTA 1FWNA 3LERA 1I2NA 3DZ1A 4KFPA 3NQAA 3UXAA 4HIBA 3W1PA 2Y7FA 3G1SA 3A24A 3QM3A 5K4XA 2X1SA 3U8GA 3MP3A 4LS0A 4AB4A 4NQ1A 1S5TA 2Z2UA 1FY6A 3C2FA 2ABBA 3P5ZA 3P62A 2B4GA 3MHGA 4JTSA 4DO5A 4UFHA 2QDHA 3PAJA 2TYSA 4M7TA 2GOUA 2NUWA 3PBWA 1W5OA 3YPIA 1GEQA 3FEMA 1GYLA 1MEWA 4B5NA 5FF4A 3V75A 2ZZ3A 1G4SA 3N14A 1KM1A 5EYWA 3W1NA 1XM3A 1LBMA 2ZA2A 4D2JA 3NQMA 1DQXA 1FBAA 1A53A 2FIQA 2WV8A 3MP4A 1IGSA 4MPQA 4AXKA 3KRUA 2F7FA 8TIMA 5U4NA 2OT1A 1V5XA 2V2HA 4H3DA 3BW4A 3BK0A 5D2YA 2EPHA 3O16A 3MHUA 4NZFA 1F2JA 3S6DA 5EKYA 2GQ9A 3KVJA 4Z1DA 3E9AA 3NR0A 2BSLA 3QEZA 2PE4A 3W7KA 4JN6A 4JY9A 2VEMA 4DF2A 1G4EA 1TTJA 3B0UX 4UTTC 3ELFA 1Z41A 1CW2A 4O17A 4WOQA 2Z0IA 3PSVA 4O1AA 2FJKA 3M44A 3OBKA 4JICA 2F84A 3BGJA 3W7EA 3TU9A 1GTEA 4RZ4A 3MBFA 1YXYA 4TMCA 4ZQOA 3L21A 3ZFHA 4N9CA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W7LA

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Chord Diagram

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