3W7Q | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with TT2-5-127 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	110
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7qA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7qA01

3P60A 5LNSA 1EEPA 2J24A 1GVSA 2V5BA 2TRSA 1AK5A 1PS9A 5DY3A 1B9BA 4JX5A 3W7MA 5BNKA 1S5WA 3B04A 2Y7DA 4KFOA 4OE7A 3UYCA 3KRZA 1FWTA 4BF9A 2C15A 2BSLA 1V7YA 2QCDB 1Y0EA 1OFQA 2YYUA 3BG5A 3MBFA 3W71A 1OFAA 4OV9A 2JKEA 2DU2A 5CZJA 4UTTA 3DKJA 3VKJA 2NXGA 3NQDA 5IBXC 5AHIA 1VC4A 1OFBA 3PSWA 4CCEA 5D03A 1DQWA 3EB2A 2CW6A 4KWVA 1JUEA 2FFCA 5FESA 3BK0A 4IPIA 4HIBA 2RHGA 1ZNNA 3TNOA 2WOQA 4O1AA 3FEMA 1THFD 4AH7A 4XKYA 3C4UA 3PBVA 5I3KA 3O63A 2I14A 4O53A 5G4WA 1UASA 3FA5A 2J6XA 4WD0A 5I3IA 4L4MA 2I9EA 4GWEA 3S1UA 1MEHA 1OJXA 3WJYA 1GWJA 3KOFA 1OFEA 1JRCA 2EGZA 1VGAA 3L0GA 5AHLA 5TBOA 1TRDA 4LS0A 1TSIA 2A1YA 2XN0A 4YCPA 1K7XA 4UTWA 3W1QA 1TV7A 4NZJA 4PODA 4K8EA 3ABQA 1I8JA 1KBJA 4RLIA 4JTJA 1OABA 4ONVA 1E51A 2JK2A 3BGGA 1XI3A 1MZHA 3M43A 3SZ8A 4WQ6A 1PE1A 3UZ5A 1YXCA 2ISSA 1KFCA 2FDSA 3DBPA 1WX0A 1EWEA 2CLIA 2OJPA 4RR4A 3F4WA 5D37A 4YLWA 1OX4A 1CI1A 4XBSA 3W86A 1Z42A 1TQJA 4JEQA 1EWDA 3JRKA 5F1VA 1QWGA 1D3HA 3R5EA 4O28A 5HMSA 1JQVA 5DELA 3O1NA 1GZGA 3LLDA 2OMAA 2YFOA 5AFDA 1OYCA 2V81A 5F2GA 2RDUA 3W1AA 3E12A 4OWGA 3VNDA 1K03A 4MPQA 3FFSA 5DXYA 3MI2A 1SU5A 4LWWA 4ORIA 4FIRA 1QOPA 3LXAA 3ATZA 3LRLA 4O0KA 3GYEA 2QCFA 3P8JA 3T44A 4PH6A 3TMLA 1XBVA 3W07A 3P61A 5F4WA 1Q45A 3BW2A 2RH9A 5G2WA 4DF1A 5D2WA 3OVRA 3V1PA 2J27A 3N2MA 2PURA 1RV8A 4MY9A 3Q37A 3KAOA 1QPOA 1JJKA 3O15A 3Q2DA 3E02A 1H51A 3P62A 3G1DA 5L9FA 4JYDA 1H1ZA 3DAQA 4UMAA 2P10A 3OEXA 1TV5A 3O6YX 5K4XA 4IUOA 1XBZA 4C1KA 3WFAA 1EIXA 4UNLA 4K7VA 3O07A 4PA8A 3TA6A 2P1FA 3IVSA 1JUBA 3SIZA 3KX6A 3PSVA 1SFJA 1YLVA 4LTSA 1DV7A 1K8ZA 2B7QA 2ZA1A 4Q4KA 3KVLA 3HG4A 5AHMA 4L4LA 2PE4A 2PCQA 3FYPA 1QDSA 3NDOA 3LERA 3S5YA 4LS2A 1K02A 4RXFA 1TPC1 3PG8A 4HSOA 4N9EA 1M7PA 3UZJA 3LTPA 1KV5A 2V0TA 4WUIA 4JXCA 1ZAJA 1GVOA 4OT7A 2V8ZA 4CNNA 5E1QA 2CLLA 5D33A 3NYZA 1JCLA 4LV4A 5HWNA 1GG1A 2WSQA 4WY0A 4EF9A 5LNVA 3TU9A 1VCFA 3EKZA 2VC6A 2YYTA 4O13A 3U6WA 1XCFA 4N02A 1QPNA 3A9IA 5I3HA 3EWBX 3UWVA 1FCVA 3I65A 1BWLA 1X8FA 1I2PA 4P2VA 1LROA 2Y63A 5DCBA 4I9AA 4QQ3A 1G4EA 2H3BA 1DKWA 4UFJA 5LHEA 5AB3A 4E2BA 2Y61A 5HUOA 3PY2A 1L9WA 1O94A 3NPXA 2X30A 4FX6M 3C2FA 2FPVA 1G69A 3WK0A 3BW4A 1OFOA 1I2NA 2NWSA 1PCKA 4NNCA 4JICA 4N4QA 2R94A 2A7NA 4N6EA 1I2OA 3C2RA 3W22A 3N73A 5DY2A 5GVJA 1YTEA 4NJKA 4Z1BA 2ZZ2A 1ZALA 2FPTA 1XDMA 4N4PA 1YPFA 2YX0A 1ME9A 2J88A 3W3OA 2ZZ3A 1R46A 4YWIA 2YZRA 1KFLA 4OHQA 3NPVA 4WY0F 3EWYA 3S1VA 3UWUA 2ALDA 4G1KA 3I7QA 3G22A 2V5LA 3HMJG 2ZZ6A 3PF3A 5TIMA 5CZTA 3LCWA 1H50A 1HO4A 2ZZ5A 5KMYA 2YSWA 3GDKA 3GR7A 2V9DA 3RFAA 3MYPA 2WV8A 3FOKA 2QCDA 4XWUA 3NA8A 1MEWA 1JCJA 3EX4A 4UTJA 4MIMA 4AVFA 1GVQA 3ELFA 4XKYB 3PUOA 3PS7A 5FF0A 5AHEA 5HR6A 4O54A 5G1TA 4UR8A 1FWRA 3RNDA 1F74A 2QCHA 3VI2A 1EUNA 4LVDA 4LRSA 4UTHA 3USBA 1ALDA 1H7OA 2QAFA 2HTMA 3OBKA 5LNWA 4JR5A 1SSDA 2E6DA 4FHAA 5BMXA 1K3UA 3VFLA 3QPYA 2Y6ZA 3NGJA 4J9JA 3W7LA 2ZZ7A 3IIXA 4R34A 4ADUA 5HNRA 4UTMA 1SO6A 1F73A 3G1XA 5HR7A 2NWRA 2YDAA 3LBMA 1W37A 1AL8A 4KWWA 5FF4A 3G8RA 1YADA 2TSYA 5LZLA 4CNPA 3SW6A 1TREA 1SPQA 3HGJA 1M6JA 1VLWA 3C52A 5D2XA 5K7JA 2JGQA 4IMCA 4MVAA 3WK3A 3G1FA 4BI5A 5FEWA 5H2ZA 2G97A 3CPRA 2OZ0A 4EWND 1WOAA 2DP3A 3TAKA 1ICPA 2JGYA 3GR8A 2CLEA 3IGUA 2NXHA 4KFNA 2OT0A 4A22A 4ALDA 2ZA2A 2GPTA 1SFLA 3NQAA 5EMUA 1IGSA 1K7FA 3G3DA 3L21A 3LHTA 1FXPA 2FQIA 1O4UA 1QNVA 3W73A 3STEA 1QCWA 2PRLA 3P74A 3EEGA 3N9RA 2W6RA 1QR7A 3C2OA 3B4UA 3IGSA 1JVNA 5C2XA 2VFDA 3DHFA 3NG3A 4JS3A 1W3TA 1GPWA 1A5CA 1P0KA 4UFKA 5H91A 2EF9A 3W7CA 3MI6A 4AMAA 1LM1A 4QITA 3DFOA 3TCEA 2CFFA 3PBYA 3WK2A 3PG9A 4OGZA 4UMCA 3K30A 3BGJA 5U7SA 1M5WA 3LCIA 2FPYA 1OK4A 1YXDA 2QDGA 3NM1A 3WJWA 1YXYA 4JNMA 4TO8A 3TR2A 2TMDA 4K37A 4XTIA 2H6RA 3W1XA 4JTGA 1RVGA 1M7OA 2ZDRA 1X7FA 1LYXA 3TMQA 2RFGA 2CLMA 4LVBA 4UXDA 5BW6A 2ZBTA 1LTDA 1HFBA 3FJLA 4NVTA 3TROA 5K9XA 1ZHAA 3W2KA 3KVKA 4OQVA 1HO1A 2V2DA 3L9CA 2GJNA 3SI9A 2V82A 3MHGA 1H7RA 3BO9A 3CWNA 2E77A 1N8FA 1L6YA 4LT9A 1OFDA 2TYSA 3DU0A 1J4EA 5KINA 4M5PA 4MFDA 2QF7A 1N7KA 3IIZA 4LW7A 1VCGA 2FTPA 3G0XA 3LHWA 4BWLA 3DGRA 3C0JA 1DVJA 3H55A 4WY0B 4NX5A 2AQWA 5HJLA 1ZAHA 3CTLA 3G8EA 4KFPA 3MP4A 2OCZA 3DI1A 1KFKA 2ABBA 1Q6RA 1TIMA 3LHVA 3WJZA 1VLIA 1T99A 5MHBA 3CB8A 3I7RA 1XDLA 1TYGA 3P84A 4MZYA 4X2RA 1DBTA 4GJ1A 2ZRXA 3RU6A 3S6DA 4Z0SA 2EPHA 2YR1A 3W87A 4FIQA 1KM2A 1HTIA 3LXCA 3CT7A 4O15A 1A5BA 4H4IA 3GDMA 1KM0A 3E96A 3VCRA 4LRTA 2DORA 3MHUA 2C0AA 1QPQA 3TSBA 3M1ZA 4IXHA 3DFSA 3W7PA 1HG3A 3O6CA 2GUUA 2WPBA 4C1LA 2IQTA 1G67A 1S5TA 2VFGA 2R14A 4LC8A 1OX6A 1Z44A 5CPNA 4Y8FA 3TE9A 1W0MA 1ADOA 4XBKA 3GB6A 2H8XA 1UBSA 1OK6A 3STGA 1OFPA 2XFWA 1XKYA 1S5VA 3NAVA 4JTIA 5D2TA 1KFJA 1RPXA 3BLIA 1R2TA 4FEZA 4FF7A 2I1OA 4O1BA 2QAPA 4PTNA 1GTHA 4IMEA 5C5YA 5KSWA 3U2OA 3N9SA 1W54A 2NUXA 1GVFA 1KTNA 4MY1A 2ZA3A 5CKSA 4JDBA 3SGZA 4PEKA 4LUIA 3O05A 3UNDA 3OVQA 3T4CA 1XUUA 3V75A 1RQHA 1KLYA 3HG5A 5J5RA 3DFTA 4Z08A 4WOZA 3N19B 3PB2A 1PV8A 2A0NA 3P81A 4UMBA 2ISVA 4HNUA 1N55A 4AWTA 4O1CA 3GDLA 4EOUA 2Y7EA 2CZFA 4MYXA 2VFEA 3WJXA 2V30A 5DLCA 2ZRWA 4RKAA 3GKAA 3QPZA 3C2EA 2C14A 3PR2A 2VFHA 4QIUA 1FX6A 3IIOA 3T78A 4LUJA 5G5IA 3SECA 3BG3A 5FI8A 3UPBA 4UFMA 3W7HA 2C18A 1EX5A 2RKXA 3FJ6A 4H3DA 3IEBA 1VCVA 1OVDA 1D9EA 2H8ZA 3EX2A 5G1YA 5I3GA 2NZLA 3UQNA 1FXQA 4AEOA 3LB0A 1LLWA 3NL3A 2VFFA 1VYPX 4UTKA 4GXMA 1DHPA 1L2UA 4UTTC 2BTMA 1H7NA 4K36A 3ZWSA 3UWZA 4GUGA 1EP1A 1NEYA 4YCOA 1W3IA 2E6YA 1H63A 4HPJA 1DOSA 3R2GA 2Y85A 4AHPA 5G4EA 4S2BA 4MYAA 1TJPA 1LCOA 3EX6A 4IWWA 3TH6A 4R33A 3CQ0A 5AYYA 5CPMA 3QSTA 5TQLA 3G24A 4O0ZA 3CEPA 1RQBA 3QMRA 4PL1A 5F4SA 3NXFA 1YTKA 1H60A 2DZWA 4Z0JA 1X1ZA 3E9AA 2ZTKA 3MBDA 1R47A 2D73A 3TQVA 5EBUA 5FEXA 2E09A 5HWJA 1R30A 1WXJA 3GIYA 4JTHA 2VKZG 4JTSA 4P61A 5FF7A 2X1SA 5F1UA 3M5YA 2WNNA 4RZ5A 4UTWC 3W7KA 4BI7A 4N9BA 1GJPA 1W5QA 3UY8A 2WO5A 4JYEA 3GAYA 4PC8A 1PL9A 3NM3A 1GYLA 1A5SA 1TCDA 5G2IA 3CHVA 4NT0A 1GVRA 4A2SA 4QNWA 2GVJA 2NXIA 3LTYA 3M16A 3QFEA 4NJGA 1TJRA 5K3VA 1XC4A 1PHWA 2EKCA 2A7PA 2R8WA 2WKJA 3M9YA 5CSRA 1P1XA 3STFA 4UIOA 4A3UA 1OG0A 4KKXA 2WNZA 1SSGA 3PC0A 2BWGA 3IGXA 2FJKA 3M6YA 4WOQA 3LV5A 3HJZA 4WX2A 1YPIA 3QF0A 3S0CA 3UY7A 2X2GA 4JIQA 4M7SA 3TXZA 1WQ5A 4GUJA 1JR1A 4O12A 1XFBA 4M6VA 4EVZA 5LNUA 1SO3A 4GNJA 3QQ0A 2CLHA 2GVGA 4O17A 1I4NA 2CU0A 2E5DA 2A6LA 4FNQA 1JCYA 5L6UA 4U28A 3Q58A 1A53A 4IX0A 3QQ1A 1DL3A 1G7UA 3IVUA 4JY8A 5D04C 2C3ZA 2QDHA 3HO8A 5EA9A 2C6QA 2QCCA 3NOEA 3QMSA 4DPPA 5D02A 3BV4A 3C56A 3O8AA 1SW7A 3R13A 1SO5A 2DZXA 4FXSA 3G1VA 1BTMA 1IF2A 3LBCA 4ZQCA 3EWZA 4CCDA 5I3FA 1Z41A 2ISWA 2E6AA 3JS3A 5K9CA 1GG0A 3T55A 1T8XA 1FBAA 3M5XA 2XN2A 2ZRVA 4JX6A 3W2JA 3DI0A 3QM3A 2V2HA 4HNVA 1YYAA 3DZ1A 3P80A 3W9ZA 3B0UX 2GQAA 2A6NA 1GYNA 4GUHA 4WZHA 1B4KA 1GT8A 4BFAA 3W1PA 4Y9AA 4M7TA 4YMZA 2NUWA 2QEZA 1AL7A 3CEUA 4AWSA 1JRBA 3LCXA 2P0OA 3DH7A 3NQ2A 3R8RA 5D32A 5DCEA 3TQKA 4CLMA 3GNDA 2ABAA 1TTPA 4JX4A 2Y62A 3B0VC 4YXGA 2E5BA 1XUZA 3W88A 3BW3A 5KZMA 3TAOA 4BR1A 3S5ZA 3DFPA 3P7YA 3KVMA 1EP3A 3UXAA 1W1ZA 3W7IA 4LNYA 1P4CA 1WV2A 1W3NA 3ABOA 5FEPA 1H61A 1ML1A 5HQEA 2W79A 4N2YA 1TPH1 2QJHA 3LM7A 3L5MA 3NZ1A 3NNTA 4DF2A 2ZRYA 3N2XA 4CQ9A 1DJNA 1QO2A 4JN6A 3L5LA 3QZEA 4FNTA 3QW4B 3KRSA 1Q6OA 3LHZA 3N3MA 2QKFA 3T7VA 3KVJA 4M19A 1PCWA 3L0KA 4AB4A 2NUYA 3CC1A 1I2QA 3DHDA 3WK1A 5AC6A 1OX5A 3WJSA 3MMTA 3FYOA 1KM4A 1T0OA 1OYAA 2ZCGA 3N34A 3IIPA 5CPLA 1PIIA 3EX1A 1F05A 4IMGA 3O6DA 3W2UA 3W7NA 4OV4A 3LV6A 1KM3A 2VEIA 2XN1A 1ICQA 3LI0A 5HINA 2FB3A 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3R12A 4MZ8A 1KM6A 4O18A 3UXDA 5KZDA 1KV8A 4O14A 4FO4A 5DCDA 3LHYA 1O5KA 4I7VA 2Y89A 3EX3A 5E0KA 3BLFA 1UUOA 4JDYA 1O60A 3L66A 2ZZ4A 1QFEA 2DZPA 2EAWA 4ZQNA 2ZQ0A 4DO6A 1JQXA 2VFIA 5LGXA 1TPVA 4LS1A 3TFXA 3HGRA 2Q8ZA 3G1AA 4TX9A 2Y70A 3OHIA 3HG2A 5AYZA 1SZNA 3EKLA 3GXPA 1LRQA 4QM1A 5AHFA 3EXSA 4N6FA 3NQEA 2CLKA 3GK0A 3THQA 1P0NA 3EXTA 3SSJA 5DXXA 3W72A 1H7PA 2QCNA 3G1SA 4DXVA 4HHPA 1PVNA 5I3JA 3GZ3A 3W84A 3GDTA 1IXOA 3TV8A 4JYFA 3GXNA 4O11A 4O50A 1K8YA 3C2VA 2VELA 1C8VA 5AC8A 5F2MA 1ME8A 3GDRA 1W8SA 2QUUA 3TJLA 5IBXA 2LLEA 1F76A 3SJ3A 4HNNA 2E68A 3W7EA 1XXXA 3GLCA 3GAKA 4R53A 3BVJA 3W7OA 3F1QA 4ICNA 1WBHA 5KITA 2OX1A 4QAIA 4MUZA 3TK7A 4FNRA 4UC5A 4UFIA 2A4AA 3P67A 2QR6A 5J5DA 1VR6A 4CQ8A 1VZWA 3A5FA 4BWLC 3QYQA 1TV8A 1DQXA 4AF0A 4MZ1A 2TPSA 1A5AA 1VS1A 3VE9A 3LCGA 3MW7A 3NL2A 2BXVA 2G96A 3NR0A 1KFBA 3MJYA 2F84A 4IPJA 3I68A 2C19A 2CZEA 1KA9F 5F2IA 4RXGA 3ZWTA 1O5XA 5BMWA 3HPSA 3GVGA 4Y90A 4EIVA 4IOTA 1W5NA 2GQ9A 1T96A 3QRHA 2FIQA 2HSAA 3BLEA 4NXSA 2Z6JA 2JKPA 3RF9A 3EWXA 3TX9A 4K38A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7QA

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Chord Diagram

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