3W83 | Genus

Total Genus 108

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	108
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-097 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	108
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w83A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w83A01

4LVAA 4MLRA 4IMGA 3HB9A 3E9AA 3W73A 4NJGA 4XTIA 3OHIA 4ZQCA 3IGXA 3GNDA 1W3IA 4HPJA 3GX9A 4UFHA 1TV5A 2HS6A 4RV8A 4DPQA 1L6WA 4X22A 1JQVA 4UTKA 3TFCA 3C0JA 4K7VA 1D3HA 4GUFA 4O19A 2VFHA 2E6FA 1LM1A 3W76A 3FYPA 3LV6A 2ZRZA 2NUYA 4DPPA 4IWWA 3DFPA 2Z6JA 1W5OA 4LUIA 5CG7A 1MEHA 5AC7A 1WAUA 1Z42A 3ZR4A 5EBUA 1SW0A 2VOMA 3LV5A 3FFSA 5G5IA 4Z1BA 2RDUA 1W5NA 2WNQA 3NYZA 2YXGA 3EXTA 1P5BA 3DZ1A 4LTSA 3M43A 2ABBA 3B0VC 3GNNA 3W1NA 3GLCA 1OYBA 4AAJA 4O8RA 1KM6A 3EX2A 4HHPA 2ZZ7A 3FA5A 1BKSA 4BWLA 3C2VA 4UTTC 2E5BA 3USBA 1WOAA 4TMBA 1JUKA 1DHPA 3MI2A 4X2RA 2J9ZA 3BW3A 3VNDA 4MZ1A 3C61A 3LHYA 5K4XA 3W7NA 3M5ZA 3G3MA 2X1TA 4J9JA 4PL2A 5LNUA 1TCDA 1M7OA 2E6DA 4NJKA 3HGRA 4D2JA 1Q6QA 2AGKA 1H7NA 3M5YA 2VKZG 3LCHA 4FXSA 1T96A 2WNNA 3S5NA 3HGSA 3LB0A 1TREA 3W1RA 1OK6A 5FF0A 1KFEA 1VHCA 2KZHA 3MP4A 4XUGA 2E5DA 1XBXA 3SR7A 1FCBA 2DZUA 4O54A 4OT7A 1VS1A 1G4EA 1ZNNA 3TJLA 4UR7A 5IBXA 3MJYA 3W2NA 4A22A 2NX3A 4LW7A 3GR7A 3QSTA 3C6CA 3FOKA 2PRLA 5HULA 2FJKA 3W2MA 2ZA3A 3S6DA 2ZTJA 3R8RA 5H91A 1GVFA 3I68A 3NM1A 4BFAA 1P0KA 3DAQA 3BK0A 3EWUA 4LVFA 2XN2A 1TTQA 1OJXA 4O53A 4NT0A 5DLCA 3NQMA 4A21A 1G7UA 4FNQA 4IMEA 1FCVA 5D03A 1J4EA 5AHEA 3W7IA 4UNKA 4UC5A 1Q6OA 4P2VA 3TU9A 4AF0B 1XCFA 3TXVA 2HSAA 1G7VA 1GT8A 4MIMA 2BTMA 2QKFA 1ICSA 1DORA 4O1CA 2ZQ0A 1S3HA 1RV8A 3O8AA 3EWZA 2NX1A 5FEXA 4AB4A 4EVZA 2Z6IA 2EPHA 1ZAJA 2DORA 2X30A 3TJXA 1MSSA 1TQXA 3P5YA 2EGZA 1YDOA 3EWBX 1R46A 4BR1A 1NF0A 3K30A 4UMCA 1K03A 5KINA 2GUUA 5D37A 1PVNA 1GVSA 2P10A 4RR4A 2VEKA 3L21A 5FF4A 4DO5A 1UJPA 1F2JA 3GKFA 1NEYA 3LRLA 5I3JA 3EXRA 1KM1A 4JTKA 1QMLA 3NEVA 4MUZA 4UCGA 3DBPA 4RZ5A 5FI8A 1AW5A 1ZAIA 3NGJA 1TV7A 3EWWA 3MMTA 3STCA 2A6LA 3GXTA 2QAPA 5TQLA 2WSYA 3HMJG 2WV8A 1TPUA 3TW7A 4U28A 3C8FA 1LLWA 3PBWA 1C9DA 2F7FA 3IRDA 3R12A 4O10A 3L66A 1QNVA 1PHWA 3RF9A 3LI1A 3HGOA 4O0KA 4QJ1A 3BARA 5FF7A 1Z48A 5DELA 3SGUA 2H90A 1E51A 4MLJA 4AHPA 4PC8A 2ZDRA 2ATSA 4YL2A 4UFIA 1ICQA 5D04C 3NQ6A 1H60A 2VFDA 3P81A 4NXKA 4POCA 1IXOA 1J5TA 4QNWA 2VELA 2TMDA 5F2IA 1GYNA 2OT0A 2ZZ5A 8TIMA 1TIMA 4NJHA 4JY9A 3G1YA 4LUJA 1G67A 2EAWA 4PCFA 4DXVA 5D30A 1K8YA 4N6FA 4XBKA 3UWQA 1H50A 2ZA2A 3EX3A 4XTDA 3CIWA 3MI3A 4NZJA 3VFLA 1YXYA 3BLEA 3W1LA 3OG3A 3PC0A 1P0NA 2P1FA 4PFMA 3I7RA 3DI1A 4AVFA 4O18A 1OABA 1T99A 5F2LA 2B4GA 5K9DA 2RDTA 1FWTA 5F1VA 3LXCA 4FX7A 3GK0A 1FCUA 3L9CA 1YLVA 3CB8A 3LGEA 3HG5A 1KM2A 2V2HA 4E2DA 3L67A 1KFCA 4ICNA 5CPMA 4MVAA 1PCWA 4H6KA 2V2CA 4FNSA 4P61A 4ZQNA 1THFD 5K9XA 4A2RA 4GFSA 2ZZ1A 3A5FA 1SSGA 4O52A 1G4TA 2Y62A 1FXPA 1TPH1 4XWUA 3IVUA 1QOPA 1R2RA 1LZOA 4KFNA 1TB3A 1VYRA 3ANYA 4Z1CA 3P7YA 3VE9A 4DBDA 5I3FA 2NXIA 3WJWA 2CLMA 5G1YA 1VCVA 2Y70A 1SO4A 2JKEA 3NPWA 1RQBA 3O06A 4XBSA 4AEOA 1HO4A 3P74A 5LKYA 3TIMA 3IIZA 2CLFA 3E0IA 4LU0A 3KX6A 1QAPA 3UPWA 3CLMA 4CNPA 1T8XA 1EP3A 1XDMA 4O13A 1YTDA 3W23A 4GRSA 2YFNA 2FDSA 4JDYA 4YLWA 5ABTA 1W3NA 1O60A 4GBUA 1U5JA 2QDGA 3LTPA 3MW7A 3L0GA 2ISSA 1PIIA 2CU0A 1CW2A 4YCOA 2UV8G 1J2WA 3I7SA 2GVLA 2ZRWA 3PBVA 4Q4KA 2G95A 3BPWA 3SIZA 1B4KA 1FQ0A 3A24A 3ZS4A 3TSMA 1ADOA 3W7MA 3NOEA 5CZSA 3ATYA 4EOUA 3SY5A 1N7KA 2R14A 1GTHA 3P5ZA 4RX0A 3NL5A 1YTKA 2ZZ2A 4ZMGA 4O28A 5E1QA 4CNNA 4ZQRA 4IQLA 3LCLA 3U2OA 3L5LA 4UTUA 3G1DA 3GR8A 4A2SA 1JULA 3BG5A 2Q3RA 4KKXA 4AWSA 1H51A 4WUIA 1JUEA 3OVRA 1AL7A 4LS0A 2A4AA 4CCCA 1S5WA 1QPNA 4JX5A 1FDJA 3PUEA 2NXGA 2BWGA 3G22A 4LV4A 1F6KA 1LOSA 4WY0A 1SR9A 1GVRA 1IXPA 4OWGA 1SSDA 1GEQA 1TQJA 3NL3A 2B7NA 2A0NA 2GVJA 1QPRA 3S5OA 4LVDA 4OBTA 1XBZA 2W0UA 4NQ1A 2XN0A 4RCXA 4FXRA 4IXXA 1KLZA 1QDSA 1X1OA 2V9DA 1GQNA 1WA3A 5AHMA 1L2UA 3QRHA 3HG2A 1K8ZA 4JTSA 1OK4A 3RU6A 4O14A 3LOTA 2CLOA 1LP6A 3WFAA 3T55A 4FIRA 5LSMA 5EA9A 1UB3A 3SGZA 3D0CA 3N3MA 5EY5A 5G2IA 2EHHA 3NO5A 4DELA 3G1AA 5D2WA 1JCLA 2WQPA 3HIJA 1LOQA 2DZWA 1LCOA 5D2TA 4K37A 2VFEA 4RLIA 3UXAA 1H7RA 1ZFJA 4ZZ9A 2Y7FA 2EKCA 1XUZA 1ZAHA 3FJLA 1DQWA 2JKAA 3UY8A 5GVJA 2VXNA 3N9RA 3GVGA 4RZ6A 1A5BA 4H4IA 4RZ4A 3KAOA 4UMBA 1JVNA 1O4UA 3EWXA 2ZCGA 2J24A 2DJXA 2A5HA 2I9EA 1F05A 3B03A 3M1ZA 3IVTA 3M5VA 5BW6A 5HWJA 2GQ9A 1WQ5A 5MHBA 2QJIA 3TC6A 3HO8A 4E2BA 1JUBA 4HNTA 3BLIA 1EPXA 3S1VA 3UY7A 2YDAA 4FEZA 1B3OA 2B7OA 4CLMA 1X1ZA 3KVJA 5CZJA 1XDLA 4M7TA 3NQCA 3R13A 4OQVA 4X3ZA 3W7GA 4EF9A 2C13A 2JBMA 4TO8A 1I2QA 1XUUA 5E93A 3MBDA 2V0TA 2Y63A 2H8XA 2V5BA 4IMFA 1LDCA 3IGSA 1X7FA 4M6PA 5D05A 3TMQA 5A5WA 4CCDA 2OZ0A 3GAKA 4CCEA 4R7JA 1KFBA 3MUXA 2QCNA 1EEPA 3TA6A 3H53A 4NU7A 3LHUA 3W2JA 3P80A 1MEWA 3STEA 3C2EA 2A85A 3QPZA 3TAKA 1TTIA 3LHVA 4DQWA 1YPIA 1SFLA 2BLEA 2FPTA 4FX8A 4JTFA 4PA8A 4LC6A 3DFQA 3T44A 2DZPA 2ZA1A 1B57A 5BMXA 4OV9A 2NUXA 3PBUA 4JICA 1FUYA 2QCEA 3GZ3A 3NL6A 3KFTA 1LRNA 3W7CA 1EWDA 1KTBA 2H6RA 5CPLA 2A6NA 1QWGA 1SW3A 3DH7A 3TR2A 2ZBTA 4BF9A 3TK7A 1W5QA 3V75A 5LNWA 5AC6A 4WXZA 5EPDA 5CPNA 3RMJA 3IIVA 3M0ZA 5K4ZA 3DFNA 2WJZA 3DFSA 4G1KA 3O05A 4H3DA 2Z2UA 1UCWA 3STFA 4AHOA 3TV8A 3VCRA 3IGUA 3HPXA 5I3GA 3L5AA 1FY6A 3LRKA 1FX6A 3DI0A 3BW4A 4HN4A 2EF9A 1DOSA 3QC3A 2FLIA 3A23A 4UTIA 1X8FA 3TFXA 3NQEA 2FPYA 4PH6A 3NQ2A 2X1UA 3RNDA 4QISA 2ZZ3A 3W1QA 1SFJA 1MXSA 3DFOA 3LCXA 2FB2A 4UTWC 3R2GA 3LDVA 4DBEA 3E02A 1KFKA 3W07A 3LCGA 1G69A 1XC4A 2GPTA 5C6MA 2ZZ6A 2FFCA 2RKXA 1F7BA 4TIMA 1ICPA 5D32A 3MHFA 3W1PA 3P67A 4FNRA 1JQXA 2C15A 4M7SA 5C55A 1RPXA 2B7PA 2NWSA 2C3ZA 3A22A 3E96A 1HFBA 5BRBA 3PS7A 4QAIA 2V30A 3LHWA 1SPQA 3GXPA 3HPSA 4M6VA 3UWYA 2CZDA 1SZGA 4I7UA 1TTJA 4GE8A 3MWAA 3WK2A 2NWRA 3QW4B 3QM3A 5EL1A 1GTEA 4JDBA 4HT3A 3ZWTA 5LNRA 4HNVA 3UPBA 2YCEA 1QOQA 4NZFA 4JTTA 1MZHA 3HGJA 3S42A 4FNUA 1KTNA 1PS9A 3C4UA 3M16A 3TE9A 2ZRYA 4DF1A 3W70A 4ORIA 2R8WA 4DF0A 1UASA 3W3OA 3IEBA 4TMCA 4K8HA 3EX6A 3UYCA 1SO3A 2IQTA 4Q33A 3WJSA 2DJLA 5CSRA 4N9EA 3SW6A 3SSJA 3DENA 1SQ7A 4OV4A 3S0CA 2W6RA 2E68A 1S5TA 2A1YA 5EYWA 3RLUA 4XZ9A 3QJAA 3C56A 3OBKA 3MBFA 5DN1A 3G1FA 5HR7A 1IGSA 3FJ6A 2WSRA 5DXYA 4UTTA 5SWUA 1NSJA 1EUAA 2NX9A 4NUWA 1OFQA 3CU2A 1EB3A 3TAOA 5U4NA 3U6WA 3W88A 3S5YA 3G0UA 3N34A 3PF3A 5AHFA 2JGYA 2RDWA 5DBTA 2V81A 3FYOA 2VEIA 1F5ZA 5CZTA 2X1RA 1XFBA 2H3DA 3L2IA 4L4LA 4UTHA 2VFFA 1WBJA 4WQ6A 4UTJA 4GUIA 5D33A 1QPOA 3BGJA 1JJKA 2DZXA 3PSWA 4O15A 5G4EA 4KWVA 2NZLA 3O6DA 1S5VA 4UFKA 3WK1A 4HNNA 1KV8A 3PM6A 5FEPA 1YXDA 5AB3A 4C1KA 3TMLA 4JS3A 2R94A 5F1UA 4LC8A 4IPJA 3P60A 5DCBA 1EP1A 1LBMA 3UWUA 4UTLA 1FWRA 3CTLA 4O16A 3NQVA 1W56A 1O5XA 4QM1A 2CZEA 4JTUA 3M41A 3CEUA 3LRMA 4QQ3A 4GXMA 1B9BA 3LCWA 4MKNA 2QUUA 4S2CA 4FF7A 1QO2A 4Y9AA 1JRCA 1H7OA 1UBSA 2PCQA 4JN6A 3G1VA 3EKZA 4I7VA 3HOJA 2C6QA 4QSHA 2OMAA 1K7XA 1XM3A 4JIPA 1VYSX 4CQ9A 4IJBA 4AHQA 4LS1A 1ALDA 4UFJA 3W22A 1K7FA 1LOLA 1VCGA 1O95A 3CT7A 3W1AA 1DL3A 4MYXA 5D2YA 4OU1A 2FB3A 3NR0A 4ADTA 4IUOA 1O5KA 5KITA 1KM3A 4N4QA 5G4WA 3NPXA 2TYSA 3N19B 4JTHA 3INPA 2YGYA 1G6CA 1Y0EA 2ISWA 4K8EA 1I2NA 1B4EA 2ALDA 3FKRA 2E6AA 3A5VA 2C14A 3HG4A 4XKYB 1SZNA 2E1DA 1K02A 4PODA 3W1MA 1KBIA 3TNOA 3NVTA 3PUOA 4ORMA 3FEMA 3OVQA 1RQEA 4AF0A 3LLDA 3JRKA 1DJNA 2YFOA 3B06A 4AWUA 4DF2A 3S1UA 3L0KA 1WDWA 1LTDA 1OX4B 3LLFA 3BVJA 5AYZA 5F4WA 3YPIA 4O1AA 2CW6A 1H1YA 5EMUA 2GQ8A 3Q94A 4Z1AA 3QQ1A 2Y85A 3Q58A 1KW1A 3G0SA 2V2DA 1ZCOA 4MYAA 1ME9A 5FEZA 4ONVA 4FB7A 1W37A 4JIQA 1FXQA 1IXQA 2QCHA 2XFWA 3G8EA 3LM7A 1YTEA 5DCDA 1I2OA 4QIUA 5HUPA 2PE4A 1HG3A 4ZQMA 3W1UA 1QO5A 3P84A 1VC4A 5LNSA 4LRTA 4TR9A 4GUHA 3PSVA 2G96A 1P4CA 2NV2A 3SI9A 1FDYA 3S5ZA 2NV1A 1LYXA 5DCEA 3P8JA 5C2XA 5J5DA 1OFEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W83A

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