3W86A

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with sh-1-96
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with SH-1-96
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 104
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w86A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w86A01
3M5ZA 1LORA 1ZHAA 1TB3A 2A7PA 5HWMA 2EF9A 4O11A 2TMDA 3UNDA 2QJGA 4CNOA 1K02A 3M9YA 2QCDA 1W56A 4FB7A 4YCOA 3K30A 3LTPA 1S5VA 4XKYA 1U5JA 1XUZA 3EWXA 1FQ0A 5U7SA 4LV9A 1PHQA 4W9TA 4NT0A 1LLWA 3HOJA 3LXAA 3GDMA 4MYXA 4CNPA 1BWKA 1TPUA 3ABSA 4L4MA 4HPJA 5K9XA 1DJNA 5BRBA 2E09A 4MFEA 3LCXA 5KZMA 4POCA 4AF0B 3PBYA 3W7RA 3QQ0A 2C3ZA 3W7OA 1YLVA 1GVRA 3GXNA 4RLIA 1MXSA 3W88A 3UXAA 1HUVA 3E96A 3DFQA 2HMCA 4MPQA 2VFHA 2A2IA 3DI1A 3PULA 1TQXA 3FFSA 4LVFA 4BI5A 1OFQA 3S1UA 1QFEA 1ICPA 1SSDA 1S5WA 3TCEA 1G67A 1JUKA 3TNOA 4JICA 1RQHA 4AAJA 3W86A 2E6FA 4CQ9A 5D38A 4DBDA 3Q2DA 2Y7FA 4RXFA 1FCUA 5HWJA 3CQ0A 3CIWA 4NNBA 3PG8A 4PA8A 3NL3A 1FWWA 3QMRA 1TPC1 3RMJA 3P8IA 1VS1A 4NJIA 1NF0A 3PSWA 2GJLA 7TIMA 5DBUA 3W7DA 2QUUA 5D37A 4ZQOA 4RZ6A 3UWUA 2Z6IA 1Q6RA 1G7VA 4HSNA 3TX9A 3NEVA 1YDNA 1B9BA 3MP4A 5D2VA 2WO5A 3TW7A 1H7XA 4QNWA 3TSBA 2RDWA 3S5OA 3S1XA 2ZRXA 4JY9A 5CKSA 3QFEA 1VYPX 2FIQA 4NVTA 3M7WA 2V0TA 3C0JA 3LHWA 4DBEA 2X1UA 3PBWA 3R89A 1FDYA 5KMYA 1SZGA 3HPXA 5FEWA 2Y63A 3QM3A 1JCJA 2EGZA 3DENA 4WJEA 3G18A 3N14A 4O8RA 5I3IA 2BWGA 1QPRA 5LHEA 4LVGA 2FB3A 3SGUA 3TC6A 1E51A 1WA3A 4UTWC 2BX7A 3TDFA 4AF0A 4LV4A 1ADOA 1SW3A 2J9XA 3LHTA 3EWWA 1SZFA 4O15A 4B5NA 4N2YA 3QRHA 4GNJA 5DXYA 3UY7A 3EWYA 3LRKA 4LVBA 3EX4A 5LNSA 2ZRVA 1TIMA 4IJBA 3EX6A 4NNCA 2DZWA 5TIMA 1DV7A 3IVTA 1V5XA 2A85A 1XC4A 1XUUA 5H91A 1KBIA 2WV8A 2J6XA 5AC7A 3W84A 4M7SA 3B0PA 1IXQA 4KFPA 1F73A 3UWQA 5HR7A 1TPH1 1O5XA 4I7UA 4WXZA 2AAMA 3PUDA 3PVFA 1TCDA 3PY2A 3LI0A 4A2RA 1GG0A 3LB0A 3O8AA 3GB6A 3O6YX 3NG3A 2ZRWA 1F6PA 3G1YA 4K8EA 1VRDA 5HWNA 1OF8A 3NPUA 4KWWA 1GOXA 4RR4A 3E9AA 3ABQA 1LYXA 5G1YA 1ME7A 1SW7A 3NGJA 3CT7A 2QEZA 4UFHA 1LBMA 3A21A 3W2LA 1TRIA 4MZYA 3GAKA 1PV8A 5HQEA 1KLZA 5F1VA 3B0UX 4Y90A 3G22A 3LRLA 3IIOA 1HFBA 2KZHA 3B06A 1GT8A 1AMKA 4GC4A 1JJKA 5EYWA 4HNUA 5G2WA 4AHOA 1Z48A 3RFAA 3EKZA 1A53A 3CEUA 3LV6A 5HUPA 4TMBA 3N2MA 4A2SA 4N9DA 2ISSA 1JUEA 2CZ5A 3RNDA 2ZZ2A 2OX1A 4M6PA 5G4EA 1ZFJA 2DZUA 1JRCA 1I2NA 1QDSA 4YCPA 3HJZA 2YR1A 1RV8A 1X6UA 4MZ1A 2YFNA 4UFMA 1WYIA 3P62A 1M7OA 1UB3A 5U4NA 4QNEA 3WJSA 2YPIA 3IIXA 3UPBA 5D2XA 4JDYA 1O60A 3BG5A 3NOEA 4JDBA 2BZNA 2R14A 2GVJA 4OE7A 5D02A 1ML1A 1TPWA 4C1LA 2RFGA 3V75A 5AC6A 4UTWA 4IGHA 1KFLA 3TK7A 1OX4B 1P5BA 2O7SA 3E12A 4IXHA 1FWNA 4NJGA 1QAPA 3THAA 1GVOA 3MYOA 5DCEA 3V1PA 5AFDA 1OFAA 5EKYA 5J5RA 3N3MA 1QWGA 3JRKA 1LRNA 2HS6A 3BW2A 4WY0A 2A7NA 3UWYA 3GX9A 3BGJA 4NUWA 1T8XA 3OBKA 4BK9A 2H6RA 3UQNA 2CU0A 4LU0A 3MHGA 4O4WA 3FYOA 4DEFA 3LHUA 3G0SA 1O5KA 3P7YA 4PC8A 2JK2A 4PL1A 1GTEA 3MI6A 1H61A 1K8YA 2TSYA 3GKFA 3U2OA 2PRMA 3PF3A 1VYRA 3MWAA 3DXIA 4BI7A 2E6AA 3TAKA 3NL2A 3QSTA 4MKNA 5H2ZA 2Y70A 1WDWA 1KTCA 4FNPA 2WSQA 1YXYA 2XFWA 1VCGA 4FIQA 2RHGA 4X22A 4NXKA 3UWWA 2OT0A 4LS1A 4I7VA 4TO8A 4DQWA 1VPXA 1W3IA 2VEPA 1KM1A 4MOZA 5CG7A 3FYPA 1ZALA 4EF8A 2D73A 3UD6A 2V8ZA 2VFDA 3NL6A 4CLMA 3MBDA 3LRMA 1GEQA 3W7NA 1VR6A 3MHUA 2NV1A 3NL5A 3KHJA 4GUFA 5LGZA 1FCVA 4CCDA 1EB3A 5K9CA 4OV4A 1XDMA 4OHQA 5I3JA 3OG3A 5C2XA 4Y9AA 4O50A 1TO3A 1W0MA 5BW6A 2CLHA 3UZJA 3LX9A 3LCLA 1Z41A 4GFSA 2PE4A 1AG1O 2C16A 4TR9A 2ZBTA 1RR2A 1P1XA 3SFKA 4XBSA 3N19B 1KV8A 3I6RA 1W5NA 3TFXA 1T0OA 2UV8G 1YXCA 3G0XA 4JTLA 4J9JA 4Q32A 5HULA 3S5NA 4DO6A 1KM6A 1QCWA 3PUOA 2QCDB 4RK8A 3E0IA 3FS2A 2ZTJA 3NQ8A 1KTBA 1W37A 3HBLA 3W7GA 4XKYB 3BPWA 1ZJIA 2Y61A 1SPQA 3N73A 3IGSA 4CQAA 5EMUA 2DP3A 1RVGA 3HGSA 4AMAA 5AB3A 1DVJA 2DZVA 2BTMA 1M7PA 3KRUA 3L66A 3FOKA 4IX0A 2WNZA 3TROA 3T44A 3QW4B 3W1TA 3DI0A 1KM5A 4WOZA 3NYZA 2RDTA 4HN4A 3O16A 5I3GA 1PE1A 4L4LA 1A5CA 3TMLA 5C54A 3W7JA 3W1RA 4QJ1A 4Z1AA 4JTIA 5D32A 3C4UA 2GVLA 2X1TA 1H7PA 4A3UA 5LNUA 4UFIA 1JULA 4JX6A 3STCA 3KOFA 5I3HA 1DQXA 4JYDA 1TPDA 4GUIA 2B7QA 3W2UA 3QH2A 4UR8A 2GVGA 3WK0A 4AXKA 2EKCA 5FF2A 1AW5A 5HR6A 4UTIA 3TKFA 2H90A 3THQA 4RCXA 5C6MA 4IXXA 1UASA 3QZEA 1UUMA 1C8VA 1FXQA 1THFD 4OU1A 4YXGA 1A5AA 3NPWA 1FCBA 5TQLA 3DFSA 1TPFA 4G1KA 3FA5A 5IBXC 3P82A 4PTNA 1UBSA 2ATSA 4O54A 3W22A 1TJRA 3UPWA 1KW1A 3T7VA 5HINA 1SFLA 4YL2A 3KRZA 2C1HA 3O06A 3A5VA 4FXRA 1OYAA 2QJHA 1ZY9A 4IPIA 1VCFA 1GVFA 3PM6A 3N34A 1ZAHA 3QMTA 4ZZ9A 1JCNA 1MSSA 2VKZG 5J5DA 1H50A 1TPVA 4WD0A 1W5MA 4MLRA 2Y6ZA 3BARA 3W70A 2J24A 4TU1A 1H63A 1XXXA 1JVNA 2YSWA 3W73A 1TYGA 1MEWA 4FNTA 4HHPA 4XWUA 5FI8A 4PH6A 4O1AA 5LGXA 3QYQA 1AL8A 2E5DA 1Y0EA 3EXTA 4AVFA 4FNUA 3KX6A 3CPRA 3L21A 4O28A 3O63A 4UUIA 4IPJA 6TIMA 1WQ5A 3B4UA 1ICSA 3M6YA 1UCWA 4O0KA 4PFMA 4AWSA 3W1XA 1ME8A 1JUBA 3R13A 4UFKA 5HMSA 2O7QA 1FX6A 3TSDA 4EVZA 3L5AA 3M5VA 3W1UA 1AK5A 4JTKA 1JCXA 4AH7A 1D3HA 5D2YA 3LCFA 2FDSA 4MY8A 3QF0A 5HNRA 2C13A 3NQAA 3PSVA 3S1WA 2RH9A 3N2XA 4E2BA 3LBCA 1N55A 4O1BA 4EIVA 3CIXA 5G5IA 1AW1A 2A7RA 3DH7A 3A22A 4M5PA 3TMQA 2Q3RA 2FPVA 2OMAA 3YPIA 4EWND 2NUYA 2NXGA 3IIVA 3NQ2A 4ZMGA 3BVJA 3WJXA 4FNRA 1XCFA 4RZ5A 3G24A 2FPYA 1I8JA 1ZAJA 1LLZA 3EKLA 3P81A 3TA6A 1GPWA 3IGXA 1KM3A 5BOOA 1I45A 2YXGA 3P8JA 5AHFA 1VH7A 4A22A 5CSRA 2EPHA 4AWUA 3DKLA 3W7CA 4DELA 4JEQA 4AEOA 3PAJA 2J9ZA 2QKFA 3DGRA 3LERA 4CCCA 1YPFA 5FESA 5IBXA 4JXCA 1IIGA 4U4MA 4XTIA 1L6YA 4LVAA 1CX9A 2PURA 2GQ9A 2QR6A 3LLDA 2H3DA 3W83A 3W23A 2WKJA 4ZQNA 1A5SA 1G69A 5D04C 3P60A 1KM2A 4MIMA 5AHMA 2B0MA 4FF7A 3WJYA 1OYCA 3P74A 1TQJA 3DZ1A 1P0KA 1FWRA 2TRSA 1BKSA 2V5BA 1X1OA 4R34A 3M1ZA 3USBA 1SFJA 1IXPA 2NUWA 3BW3A 3P67A 2C14A 4FNSA 1VHCA 2J27A 2B7OA 5K2ZA 1QPQA 3PB0A 3JS3A 3QQ1A 1KFCA 3LHYA 4GBUA 2NWSA 3HGOA 3MYPA 3W2MA 5DXXA 1CW2A 1R47A 4O13A 2VFEA 1VHNA 1VLWA 2A0NA 3OIXA 2E6YA 1TTPA 3T40A 2GUUA 3N9RA 1SZEA 3GXPA 5EBUA 1YDOA 2QCCA 4NX5A 1KBJA 1RQEA 1FCQA 1HG3A 3ATZA 5EL1A 2FQIA 3GDTA 1BTMA 3I7SA 3NO5A 4O19A 4I7WA 2W79A 2VC6A 2NXHA 3W76A 2WOQA 1I4NA 1I2OA 2CWNA 2Z1BA 4S1FA 2CLMA 1MZHA 3CLMA 4JTEA 2B7PA 1C29A 4X3ZA 3RK8A 1JCMP 4M7TA 2E6DA 3FLUA 2HSAA 2PC4A 2JBMA 4ADTA 5D30A 5LZLA 4FHAA 4JTJA 1KM4A 5C55A 3PC0A 4Q33A 3W9ZA 2Y85A 5FF7A 3O6CA 1KTNA 2X1SA 2F84A 3CEPA 4OV9A 2CLLA 5AHNA 3W7IA 4O52A 3ABRA 2YGYA 4AWTA 1Q45A 1JCLA 3O05A 1XL9A 4S2CA 1RD5A 4WY0B 1EWEA 4YLWA 1PHWA 1LRTA 2CFFA 1LOSA 3GDKA 2NX9A 2ZZ4A 3NQGA 5DBTA 4UXDA 4IWWA 4ORMA 4R53A 1GYNA 2RKXA 2I1OA 2H8ZA 1SO3A 2YDAA 1OK6A 2QCGA 4AHPA 2E68A 2ZA1A 4DF2A 2ISVA 1T99A 4GWEA 4UC5A 5FEXA 2ZRYA 3W3OA 2NUXA 1OFEA 2WPBA 2BSLA 1KA9F 4WUIA 3GIYA 1GYLA 3NQ6A 3HPSA 4TX9A 4FX6M 3LI1A 3TIMA 1YXDA 4ADUA 1F5ZA 2QUVA 3C8FA 5LNRA 3B05A 1G7UA 1EP2A 1MO0A 1SR9A 3EX1A 4ZVJA 3S6DA 1P4CA 1TTJA 4PL2A 3NQDA 1SUXA 3M43A 1H7NA 3H54A 4LY8A 3TQ0A 4IMGA 4TMCA 4IQLA 3HG4A 3C56A 3L0NA 3HO8A 2C19A 3W1MA 2C15A 1VJIA 1AL7A 1W3NA 2ZZ1A 4WY0F 5AYXA 4A21A 1W1ZA 3DU0A 4ONVA 1YYAA 5LNVA 1VQTA 1LDCA 4NJHA 3S5ZA 1OFRA 3I68A 4JX4A 1RQBA 3LCWA 4O53A 5G1TA 3ZFHA 1UJPA 1XBYA 4RZ4A 3NPVA 3L68A 2ZCGA 1SU5A 2WSRA 4N9BA 3SW6A 1ZAIA 3W85A 3UWZA 3ELFA 3M47A 4H6KA 2VFIA 1SSGA 1LTDA 1W31A 1MEIA 4LC6A 3W7KA 2DJXA 3MW7A 5TBOA 3RLVA 3SJ3A 2Y7EA 1Q6OA 4IUOA 2VFFA 4Y96A 3HG5A 3OVRA 4TIMA 3ANYA 1TJPA 1JCYA 1W5QA 2VEIA 3G8RA 5E0KA 3GYEA 3GAYA 3C2OA 4ZQPA 3HIJA 3D0CA 1K03A 3IGUA 4O1CA 2QCNA 3GLCA 3EXSA 3M16A 5AHIA 3TXZA 4RXGA 1NVMA 1LP6A 5GVJA 2V82A 4NX0A 3HMJG 4LVDA 1OX6A 4RJEA 2NX1A 3M41A 3GVGA 2V81A 5IM51 3SR7A 2G95A 5KITA 3RF9A 1KLYA 1WOAA 1FWSA 4K38A 1H1YA 3BG3A 3QC3A 4UNKA 4M6VA 4MY1A 5CZ0A 2H8XA 3Q37A 3P5ZA 4KKXA 4OGZA 2BLEA 3KVLA 1BEUA 2RDUA 4DPQA 3L0KA 4MJMA 5A5WA 1TMHA 3W1PA 4QITA 2CZFA 3FEMA 3QPYA 2A6LA 4GXMA 4LS2A 5CZTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1E1E A;  3ZR5 A;  3CHF A;  1ZHA A;  4QRO A;  5HOS A;  4LXF A;  4O11 A;  3UND A;  2D2O A;  2PDJ A;  4C6Q A;  3M9Y A;  1W56 A;  4FB7 A;  3K30 A;  4F0K A;  3AIU A;  2OLS A;  2XM2 A;  1H1N A;  4DI8 A;  3WQC A;  5U7S A;  4LV9 A;  1KR0 A;  3TWB A;  4RV3 A;  3BAY A;  4YJ5 A;  1UWQ A;  1GOM A;  2W92 A;  1JZ6 A;  2PU1 A;  4BF7 A;  2INE A;  4A4A A;  2GGJ A;  3ABS A;  4HPG A;  1TE6 A;  1GW1 A;  4DZA A;  3CZK A;  3LCX A;  5KZM A;  4AF0 B;  3W7R A;  2GUY A;  3OHM B;  1GVR A;  2BVY A;  1MXS A;  5C70 A;  3T2O A;  3ZOA A;  4DBU A;  3ARV A;  3E96 A;  3GVQ A;  3DFQ A;  4D6D A;  2G50 A;  2C1G A;  4MPQ A;  2A2I A;  3II1 A;  4IMA A;  1OD0 A;  2DT3 A;  1OFQ A;  1EEX A;  1T40 A;  1U2Y A;  1ICP A;  1SSD A;  1B3V A;  1S5W A;  2PF8 A;  3PZN A;  4HMN A;  1LG2 A;  1MI3 A;  4V15 A;  3W86 A;  1PO9 A;  5D38 A;  3Q2D A;  2Y7F A;  1EKO A;  2ZXD A;  1J11 A;  4LYK A;  4HCL A;  2NSO A;  4NJI A;  1NF0 A;  1ZTV A;  2WXD M;  4RZ6 A;  5GQB A;  8A3H A;  3HMC A;  3MKK A;  1VFM A;  3WD0 A;  4ZO9 A;  1YDN A;  3MP4 A;  5D2V A;  4NRR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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