3W86 | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with SH-1-96 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	104
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w86A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w86A01

4LS1A 1UUOA 3P67A 1IXOA 1SFLA 3GLCA 3QW3A 3PSVA 1TPH1 2LLEA 2E5CA 1S3HA 3MI2A 3HIJA 4CNPA 2W6RA 2ZDRA 1WXJA 1OVDA 4ZQCA 4M7SA 1VLIA 4JX6A 1TPVA 4UUIA 2C18A 1EPXA 3U2OA 4UFMA 5HINA 4JTGA 2Y7GA 3V1PA 5F1UA 2I14A 1IGSA 3E02A 2CLKA 2PE4A 4O57A 2ZRVA 3W2JA 2CLIA 3L0KA 3INPA 3TDFA 2CZFA 3W7EA 1EP2A 3W1MA 3CIWA 1LM1A 3W71A 4O54A 3D0CA 5I3FA 2NZLA 2QCNA 1TPFA 4PL2A 3G1XA 3F4NA 2E5BA 4ALDA 1HL2A 2X1UA 3NXFA 3MHUA 1FWRA 1W5NA 1ICSA 1OX5A 3KFTA 5BNKA 2Y63A 3MP4A 4LC6A 3EWBX 1TTPA 3ABSA 4N02A 4O0KA 1YADA 4LW7A 3NQ6A 1JUBA 1F5ZA 2G5WA 5AYXA 2WO5A 3TQ0A 4Y96A 4OHQA 3EX4A 1K7EA 1R2RA 1SSDA 5U4NA 1GTEA 3NM3A 5A8GA 3ZR4A 1DVJA 4LWWA 1OFPA 2DP3A 4MUZA 4A22A 5D32A 1B57A 4KFNA 1YLVA 1XFBA 1VHCA 3TSBA 4IX0A 2WV8A 4FNQA 4UFIA 3W7RA 2Y88A 3PF3A 2QCGA 4IMGA 3TH6A 2NV2A 3U8GA 3MP3A 4O1CA 3HB9A 2V81A 4JTLA 1JUKA 1S5VA 3TC7A 3EKZA 1P0NA 3K30A 3DHDA 1SU5A 2TPSA 3O8AA 4FF7A 2NLIA 2XN0A 3NAVA 2B7QA 2CWNA 4NVTA 3NOEA 5AOUA 4JEQA 1ZCOA 3EWZA 1OYBA 4XBSA 3WJYA 4O18A 3W7GA 4IJBA 5FEXA 4LVFA 1JRCA 2GPTA 2QAPA 5CZTA 3GDMA 2Z1BA 2RDTA 5K9XA 1OFDA 4WQ6A 5DN1A 2ZZ3A 1O94A 1KTCA 1EP1A 4X3ZA 4YCPA 3G1HA 3T78A 2Q8LA 3KAOA 5HMSA 1XM3A 4FNRA 1JQXA 2FFCA 3TU9A 1LDCA 1A53A 4NQ1A 3L21A 1LBLA 1VS1A 1GVFA 4Z1BA 3LTSA 4POCA 1K7XA 3TXVA 1TPC1 5D09A 2ZYFA 3LBCA 4LC8A 1FWTA 5DY2A 2GQAA 1QR7A 4QSHA 1M6JA 3NZ1A 2NWRA 3QJAA 4NXSA 3GR8A 5KTLA 5J5DA 4IQLA 4UMAA 1P4CA 5L9FA 4MZ1A 3CT7A 5LGZA 1A5SA 4I7WA 4UIOA 3QSRA 1K8YA 1CI1A 1YDOA 1PHWA 3STGA 3KOFA 3P5ZA 3W1XA 5K4ZA 3UWZA 5BOOA 1WA3A 1MO0A 2X2GA 5F1VA 3QM3A 1VRDA 1H61A 2E6YA 3UWQA 4IMDA 1Q6RA 4K37A 3VFLA 3DENA 2NXHA 2BX7A 4PTNA 4JS3A 5GVJA 1TPDA 1Q6LA 1KM4A 4BFAA 1KFCA 1WOBA 3KX6A 4UNLA 2OMAA 2FPTA 4K6AA 3W1LA 3WK1A 1VCVA 3KVKA 3H53A 4MY1A 4RLIA 4BWLA 4XZ9A 5F4XA 5SWUA 3RNDA 1ONRA 3NA8A 5U7SA 5LNVA 2Y7FA 2QDGA 3DI1A 2QCLA 5AFDA 2H6RA 2Z6IA 3LHVA 3G1YA 1VHNA 4LUJA 3F4WA 5IBXA 5CG7A 1LLZA 2QCEA 1RQHA 2QF7A 3P81A 5I3KA 3DFQA 4MKNA 3TIMA 3SFKA 2FPVA 3UQNA 5EPDA 3JS3A 4PCFA 3NQ2A 3ELFA 3GNDA 2QEZA 2A2IA 4N9EA 1YXDA 5ABTA 1F74A 3LCIA 3LB0A 4FNSA 3ZWSA 4FX8A 3GZ3A 3S9YA 2QCHA 4XKYA 1HUVA 4NZFA 3W23A 4QAIA 4K38A 3IGUA 3EKLA 2ZZ5A 5FESA 3A5FA 3LV5A 1OFAA 4NXKA 3BLFA 3SZ8A 2W79A 3OA3A 4K8EA 3BG5A 1RV8A 1IXNA 2EHHA 4ZQOA 4BI5A 2TRSA 1I2NA 1LRNA 2NXIA 4N9DA 4NJIA 4E0CA 1X1OA 5J5RA 1JJKA 3A21A 4IMCA 2ZTKA 3TFCA 1JCLA 4PL1A 4DEFA 1KFKA 3LGEA 4ZL1A 1IXPA 2ZA3A 2ZA2A 1HFBA 4C1LA 4DF0A 4A29A 3S6DA 4UFLA 3CB8A 1SW7A 2ZRXA 1K3UA 3NR0A 5K7JA 1DORA 1SO3A 3NQFA 2WSRA 3NEVA 1LRQA 2EPHA 3S5OA 1QOPA 4UNKA 2QUTA 1JQVA 1EUAA 5EKYA 3UPWA 3BLEA 1WQ5A 3HG3A 4QISA 4MLJA 4LU0A 4OGZA 3LBMA 1FXPA 1W5QA 2AGKA 3W75A 3W2NA 1NAL1 3TJLA 3S8HA 3I7QA 2B0MA 2QUUA 1YPFA 1KM1A 1W5PA 3GDTA 1EUNA 1Q6OA 2J9ZA 2IQTA 5A5WA 3LTYA 5D37A 2XN2A 2PRMA 4JN6A 1L6WA 2WNZA 3STCA 3N34A 1TMHA 3V75A 3KRZA 2HMCA 2VFEA 1ME9A 1YTEA 1ML1A 2A4AA 3R2GA 3IIPA 4K7VA 1I45A 3DI0A 3R12A 3STEA 6ALDA 3IIOA 4FX6M 2FDSA 3QQ0A 2V2CA 4CQAA 3SSJA 1H7NA 4TMCA 3PR2A 3NQMA 4QNEA 3AO0A 1ZNNA 1GVRA 3MP5A 5HR6A 3CU2A 1OX4B 4AEOA 3C6CA 4PH6A 5DXXA 3N9RA 2RDWA 3NPWA 2FB3A 4A3UA 1G4EA 1J2WA 3LRKA 2Q3RA 1LP6A 3DKLA 4K39A 5FF2A 4BK9A 1VQTA 4O4WA 3HQ1A 6TIMA 4TIMA 4YLWA 4LVGA 1LROA 3M5VA 4JYFA 5MHBA 3UY7A 2QCFA 5HWJA 1GT8A 1OK6A 2H3BA 2YFOA 3HG4A 3G1SA 1EWDA 2Z2UA 1AW5A 3PM6A 4Z0JA 5HJLA 3QRHA 4PC8A 5TBOA 3S1XA 2E68A 1W0MA 4GUGA 1B4EA 4QNWA 1WX0A 3PVFA 4GWEA 1YTKA 2Q8ZA 1GVSA 5CSSA 1SPQA 5KSWA 1MEWA 4NX5A 2RKXA 5LHEA 4JD4A 2QJIA 3TC6A 1X1ZA 3RFAA 3F03K 1K7FA 3KXQA 4O8RA 3DFNA 2ZZ2A 1IIHA 2I1OA 1JULA 4AB4A 2B7NA 1GG1A 4MFDA 2TYSA 3RF9A 3G22A 1DJNA 4E2BA 3W1PA 2NUXA 2X1SA 4ZQMA 4NZJA 3MW7A 1VC4A 1EIXA 5D30A 1KW1A 1TJRA 3B04A 4IPJA 1L9WA 2WPBA 4IGHA 5CZ0A 4QITA 4LV9A 3SY5A 5IM51 1LORA 5G2HA 5KINA 4OWGA 1I8JA 2PURA 4O16A 1EB3A 1T99A 2CU0A 4WY0F 3BVJA 3QF0A 1NF7A 2JGQA 3LCGA 3SW6A 2NV1A 3HG2A 4R33A 1D3HA 3CEPA 5LSMA 4JTKA 4GNJA 3PBWA 2H3DA 2H8ZA 2A6LA 1VZWA 3USBA 5CSRA 3C8FA 5EYWA 3W83A 4MIMA 3KVLA 3B8DA 3T4CA 4YMZA 1TRDA 3DH7A 3IRDA 3ABQA 5C54A 2XN1A 1RQBA 3LM7A 1QAPA 2NWSA 2Y61A 2E6FA 3W88A 3TA6A 3BW4A 1XXXA 3TUUA 1GWJA 4RKAA 1J4EA 4JIPA 2P0OA 1W37A 3W7CA 1RR2A 4N4QA 3TAOA 3TXZA 3N3MA 4YCOA 1X7FA 4WXYA 3W1AA 1BWLA 3LXAA 4OV4A 4MY8A 2ISWA 4WY0B 3FFSA 2Y7EA 1KM0A 3VCRA 1L6SA 1KA9F 1XC4A 2PC4A 5LKYA 1QMLA 3PY2A 5K4XA 3KVJA 2VEIA 3DFPA 3M47A 3NVTA 1VPXA 3BG9A 1RD5A 3QH2A 1U83A 3FA5A 4RK8A 1OJXA 4X9SA 2Y7DA 1JUEA 3E49A 3W74A 3W7IA 1ALDA 2AAMA 1RPXA 2VFHA 2ZRUA 4MVAA 3BK0A 4O13A 2GVLA 4RCXA 1H7PA 3C2OA 2HS8A 2BWGA 1CW2A 1OFEA 1SFJA 1G69A 2WNNA 2C16A 1OX6A 4MYXA 1G4SA 1TV8A 2R94A 2ZZ6A 1ZENA 1R2TA 3L65A 1XBXA 3HBLA 2OT1A 3SR7A 4YXGA 1PHQA 4DF2A 1ME7A 3PB2A 4UFJA 3R13A 1SUXA 1B3OA 5KITA 4E38A 1J5TA 3DFOA 1FDYA 1Q6QA 3HOJA 5HQEA 4S1FA 2C3ZA 2WOQA 3G1DA 4XUGA 1CX9A 1OFQA 1FDJA 3PWAA 1XDMA 3S1WA 1VR6A 3QZEA 2CLMA 4TR9A 3L66A 4TX9A 3I7SA 1FXQA 4GC4A 5DBUA 4DO6A 4YL2A 1AG1O 5F4WA 5AHNA 1KFBA 1JCJA 2H90A 3N2MA 5DCEA 1R47A 4IWWA 1QOQA 1Z48A 2ZZ1A 3EWXA 3FOKA 4O50A 3W7MA 5AHEA 1GG0A 4Q32A 4N9CA 3NL5A 1LYXA 3NL6A 2J6XA 2FB2A 3ZS4A 1TTQA 4Z1AA 3I6RA 2A0NA 2AQWA 3WFAA 3B03A 3N14A 2J24A 3FLUA 2Z0IA 2CLOA 2YGYA 3HPZA 4LVBA 1TYGA 5FF0A 1W56A 3EXTA 4U4MA 2PRHA 3O1NA 3DKJA 1TTIA 3A24A 3B4UA 3DFSA 3G3DA 3PB0A 3PAJA 2QCMA 3W85A 3QW4B 1LZOA 4IMEA 4HNTA 4O15A 2QDHA 3GKFA 5AHLA 1OYCA 5C6MA 3GDKA 3LXCA 3MJYA 2CZEA 4M6PA 4QM1A 3T7VA 4MY9A 5H2ZA 3QMTA 2ZA1A 2EKCA 3ABOA 1FCUA 2VKZG 4LV4A 3L5AA 5TIMA 1JRBA 3U6WA 3VNDA 3P82A 3E0IA 3T44A 1G67A 3W7OA 5I3IA 1DJQA 5F2MA 3W1TA 3DGRA 4WOZA 4FIRA 4O52A 3ZFHA 5AC7A 3HJZA 3G24A 5LNWA 1GOXA 1YDNA 3L67A 3VI2A 3NL2A 4I7UA 4UTWC 2HTMA 2YPIA 5D05A 3W7PA 3M41A 1NSJA 3W7LA 4WUIA 4DQWA 4PEKA 1W8SA 1BWKA 1F7BA 2JBMA 3THQA 3EEGA 4FO4A 4Z08A 3WJZA 2WSYA 1YXCA 1I2PA 5BMXA 3QMRA 4GFSA 1PL9A 1EX5A 1SZFA 3P60A 3B0VC 1WYIA 2E6DA 2A5HA 3PS7A 3LI1A 4Q33A 5D2TA 4O14A 4JTHA 2C13A 3G1FA 4CQ8A 4UMBA 4NNAA 1H1YA 4ICNA 2NXGA 1OHLA 3NG3A 4AAJA 1TJPA 4ZQNA 1SR9A 2HSAA 1GPWA 3GDRA 2V2HA 2A7PA 5D04C 1KLZA 3QQ1A 3FJLA 4NUWA 1QCWA 3LDVA 2Y6ZA 3S5NA 1K8ZA 1A5BA 1OX4A 3O05A 4WXZA 5EBUA 4DPPA 1DQXA 1KV8A 4EWND 1N8FA 3RU6A 1XL9A 3RK8A 3CWOX 2RDUA 3R8RA 1MZHA 5FF4A 3NM1A 3M9YA 4JYDA 8TIMA 1W31A 4ADSA 1L6YA 3LX9A 4JNMA 1DL3A 3LCHA 3TSDA 4UC5A 4C1KA 4DO4A 4Q4KA 1OG0A 1OFBA 4EOUA 1AK5A 2GQ8A 3NQ8A 2X1RA 3BV4A 2YR1A 4DPQA 1QFEA 4AWSA 3TMQA 1WOAA 3UXDA 4ONVA 1F6KA 1PS9A 1NEYA 3LOTA 4UR7A 4N6FA 5D33A 3TSMA 2ZQ0A 5HR7A 2WKJA 1TRIA 4RV8A 3LTPA 2A85A 2BZNA 3N2XA 2NX1A 3W7QA 2PRLA 3M44A 3P8JA 3IIZA 3S5ZA 3HG5A 3GK0A 3BLIA 3W7NA 4XTDA 4GBUA 3IIXA 1SW3A 1Z41A 1W5OA 4JX5A 3QMSA 2QJHA 3ABRA 4H4IA 1Q45A 1WBJA 1EWEA 3IVTA 3GKAA 1V5XA 5DY3A 2RFGA 4PFMA 2CZ5A 4BI6A 5DLCA 3IEBA 3G8EA 1S5WA 2OX1A 2J9YA 3M5YA 1Z42A 3JR2A 3R5EA 2D73A 3P7YA 1KBJA 4HKPA 3MO7A 1L2UA 3OVRA 3IGXA 3Q37A 4WD0A 5LZLA 3W2MA 4CCCA 5LNSA 1DHPA 5LNUA 1O60A 3OVQA 4LRTA 1FBAA 2NX3A 3BG3A 3C0JA 5D2WA 3PSWA 3TX9A 4UTHA 3W2KA 4P2VA 4HNVA 3IVUA 4JTJA 1GVOA 3IV3A 1TPUA 1FWNA 1ICPA 4DXVA 2NUYA 1U5JA 3DAQA 3M1ZA 3NL3A 3TFXA 3C3NA 1F6PA 1X6UA 4GJ1A 3B06A 1VYSX 4NT0A 1H7WA 4AHOA 2V2DA 4IXHA 1HG3A 3LV6A 4NJHA 3UWWA 2Q3OA 4UR8A 5HULA 1K03A 1UBSA 1T8XA 3E9AA 5AHMA 1Q3NA 4ZQPA 1YPIA 3UWVA 1LLWA 1VGAA 4EIVA 2C19A 4FIQA 3BGJA 3PBYA 1ZHAA 2NX9A 3SIZA 4UTUA 3OBKA 4WY0A 2TMDA 3B0UX 4LT9A 1P5BA 3FEMA 2DORA 3P8IA 4MJMA 2DZVA 3LXBA 3SI9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W86A

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