3W87A

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with sh-1-103
Total Genus 104

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
SMCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV1 (-1-2)S1 (4-6)TIV4 (11-14)S2 (9-11)TIV2 (5-8)S3 (15-17)S16 (267-270)TII1 (18-21)S4 (40-45)TIV5 (20-23)AH1 (26-34)AH2 (76-86)S7 (94-98)TVIII1 (46-49)AH3 (103-120)TIV7 (69-72)S5 (58-61)TIV6 (54-57)3H2 (214-216)S6 (64-67)TI1 (61-64)AH6 (225-239)TIV10 (221-224)AH8 (272-277)TI2 (88-91)TIV8 (89-92)S8 (123-127)S9 (161-164)3H1 (139-141)TII2 (133-136)AH4 (143-157)TI3 (184-187)S10 (187-192)S11 (196-200)AH5 (171-183)TI5 (240-243)S15 (244-248)S14 (217-222)S13 (208-209)TIV9 (203-206)AH7 (254-263)TII3 (304-307)AH9 (280-296)TIV12 (265-268)3H3 (301-303)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with SH-1-103
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 104
structure length 314
sequence length 314
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w87A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w87A01
1G4EA 1TREA 2DZPA 3JR2A 4PC8A 2BX7A 3NQ8A 4MY9A 4Y8FA 2PC4A 1KM1A 3M5XA 4N9DA 2VFIA 1TCDA 3C2EA 1OJXA 3PB2A 3S1UA 3E96A 1EWEA 1GVQA 4Z1AA 4XBKA 2WSYA 2DZVA 2QCMA 3FKKA 4XQ6A 1OFPA 3UZ5A 3G1YA 1YPFA 4O17A 3WK1A 1HUVA 4TMBA 4N6FA 4EOUA 1O5XA 5K9XA 2NUWA 4GNJA 3LHYA 3IEBA 1TPB1 4MZYA 5AFDA 1JVNA 3B0PA 3GZ3A 5G4EA 1MZHA 4EF9A 3B04A 2HS8A 2OMAA 2Y89A 3ANYA 1VJIA 1NSJA 1QPRA 3QW3A 5HJLA 3LHZA 3CHVA 4XTIA 3MBFA 1FDZA 2P10A 4WY0A 4DPQA 1FCUA 1TTQA 1H51A 1EP2A 3L5LA 2V9DA 2NX9A 2QUTA 1KTCA 3NM1A 3N73A 2JBMA 1SFJA 3PUDA 4D2JA 1QDSA 5F2GA 3W2UA 1YTEA 3UPWA 3SZ8A 4UTKA 1FWTA 1YADA 1VCFA 4OQVA 1EB3A 2C16A 3DI0A 2Y7GA 4IJBA 1F05A 5EA9A 2C0AA 4IUOA 3A5VA 1RD5A 4TMCA 4DXVA 3HMJG 3C4UA 3Q58A 4GWEA 3W72A 2QCHA 2YYUA 3W83A 3GDLA 4GJ1A 4OU1A 2QR6A 1JQVA 3P81A 4PL1A 1W3IA 2A6LA 1EWDA 3ZWSA 2CLHA 5LSMA 2W0UA 3U6WA 2F84A 4LVFA 1QCWA 3GXNA 3E0IA 3N9RA 1AG1O 3W2MA 2LLEA 4DO4A 2ZZ3A 4Z1CA 1OYBA 3NGJA 3IIVA 4LUJA 4CNOA 5K2ZA 4QQ3A 3T40A 5I3GA 2TRSA 1TPWA 3LCIA 4QITA 4LVBA 1OFBA 3P67A 1RQHA 1VPXA 5DBTA 2FFCA 4GRSA 4CCDA 1U5JA 5J5RA 5EKYA 4KFNA 2YPIA 1GVRA 2ZZ1A 1H7XA 1JCJA 1NFBA 3QH2A 1GEQA 1G7UA 3GR7A 3M5ZA 3C2VA 3O16A 1XUZA 1NAL1 2ZZ2A 4AAJA 4JTTA 1T0OA 4O18A 1G4SA 3BO9A 1GTHA 2TSYA 1M7PA 4O12A 2PRLA 2OT0A 4JTSA 3W2JA 5EMUA 2QUUA 1XI3A 3C2FA 1N8FA 4FB7A 2GVLA 4HSNA 1GG1A 1M5WA 1MXSA 2HMCA 4X2RA 4O57A 3S6DA 1P0NA 4LTSA 4LC6A 1RQBA 5F4SA 3QF0A 4M6PA 2FQIA 3QQ0A 5K7JA 1XM3A 3THQA 3TA6A 3QC3A 1R2RA 3WJSA 3TJXA 3W7QA 2BZNA 3OEXA 3LV6A 1H7NA 3TXZA 4PL2A 3AO0A 3ABOA 1LBMA 1VC4A 3BLIA 5L6UA 1OF8A 1S5TA 1VYSX 4AHPA 3I6RA 3M41A 1EIXA 5EPDA 2Q8LA 3P5YA 1I2QA 2Y7DA 5AHNA 3CWOX 4O8RA 4BFAA 4WZHA 2RHGA 2EKCA 1Y0EA 1GPWA 3MHGA 5U7SA 3WK3A 4JIPA 1F6KA 2ZTKA 3HPXA 4CCCA 3PBWA 5F2IA 1YYAA 3MMTA 4UTJA 1OX6A 1SW0A 2ZBTA 1LP6A 3W1XA 1IIGA 3W7LA 2ZRYA 1TB3A 3B0VC 3HPSA 1DJQA 1KM2A 3G3MA 3QMTA 4FNUA 4A21A 3VKJA 1G67A 2DZXA 1O4UA 2C18A 2WSRA 4QIUA 4UTHA 1OX4B 3HBLA 2A2IA 2H8XA 1KM5A 2CZ5A 1RQEA 1WA3A 4FF7A 3FKRA 1F5ZA 4YCOA 3MI6A 4HNNA 2WPBA 4NXSA 3NA8A 4GUHA 3QQ1A 4K38A 5FI8A 1KBJA 4ORMA 3FLUA 3NQEA 4LRTA 1EX5A 2PURA 3P80A 2X1TA 3HOJA 3GDKA 2WNZA 2ZQ0A 4QNEA 4GBUA 4DF1A 2OZ0A 4S2CA 3DZ1A 3G0SA 4FNTA 3R13A 5BRBA 5D37A 3DFOA 3QPYA 2JGQA 2ZTJA 3DFSA 1AL7A 1F6PA 2I14A 1L6WA 4IOTA 3W85A 1DVJA 3EX2A 4RXFA 1M7OA 1PHWA 2YR1A 4C1LA 3DFPA 2WJZA 1TTJA 1Q3NA 3G1DA 1JR1A 4KFOA 4LS1A 3IVTA 4NZFA 2V82A 5G1YA 4ONVA 2B7QA 3P84A 3M7WA 4QNWA 4MZ1A 1W1ZA 4I9AA 3L5MA 4O13A 3C52A 3GDTA 4BWLC 1I2OA 3R5EA 3RFAA 1H62A 1BEUA 5CPOA 4CQ8A 2XN0A 3W70A 3HIJA 4O4WA 3W7OA 2J24A 2YX0A 1J5TA 2W79A 4MLRA 3SGUA 2BTMA 3FOKA 3W1UA 2VEPA 4JEQA 4WQ6A 4K7VA 1FWWA 1OABA 1T99A 3O63A 3SJ3A 3MP4A 3QMSA 3GDRA 3HGRA 1WDWA 3L0NA 3PUOA 3W07A 4WXYA 5G2WA 3IVSA 1TRDA 3ZS4A 4YWIA 1LRTA 5HR7A 3NOEA 4LV4A 2Y7FA 3RMJA 4A2SA 2V8ZA 4Y6GA 5HMSA 1VCVA 3OA3A 3EKLA 3TAOA 1PCKA 4NU7A 1L2UA 3QFEA 3W74A 3CTLA 2Z1BA 4KFPA 1LBLA 1IIHA 4ICNA 3O6DA 1SW3A 4XKYB 4UTUA 1W5OA 1K8XA 5K3VA 1H7RA 3NR0A 2ZRZA 2FLIA 1QR7A 1Q6RA 3PUEA 2V0TA 2NUYA 7TIMA 6TIMA 4UXDA 3TX9A 4U28A 1T96A 4YLWA 3W23A 3LERA 3GNNA 2NXIA 3T78A 1P1XA 4S1FA 3TCEA 2DZTA 3ABRA 2DZWA 3CIWA 1LDCA 1YTKA 2JKAA 5C2XA 5D2WA 4Y96A 3NVTA 3NPXA 4M5PA 5AYXA 3M6YA 4JICA 4ADTA 4JYEA 3O06A 2V30A 3ABQA 3LB0A 3G18A 1KM3A 1WOBA 1Q6QA 5ABTA 1TJRA 1IF2A 5TBOA 2FPTA 4EWND 1WXJA 4UTIA 3L0GA 4RR4A 4OHQA 2J9XA 3OVPA 1JJKA 3G24A 3BPWA 4FNQA 4DO5A 3E9AA 3PS7A 3BLEA 3LHTA 3O05A 1WX0A 3WK0A 3DHDA 5K9DA 2G5WA 1G4TA 4RZ6A 1TYGA 4LV9A 3T55A 2ZRVA 3L66A 2J6XA 3MYOA 5K4ZA 2X1UA 5KTLA 2ATMA 4FEZA 1BKSA 1W3TA 3R12A 4IMEA 2QJHA 2A4AA 4O15A 1YXCA 3TROA 1LROA 1RV8A 4O1BA 2CFFA 4RZ4A 2WOQA 4QM1A 2VXNA 3FJ6A 1RPXA 5LNUA 1KFEA 2TYSA 1YTDA 4Q33A 3TFCA 2ATSA 4YCPA 3W73A 1K7FA 1GZGA 1OYCA 3C2OA 4DQWA 3CWNA 2ZFAA 1EUNA 4AF0B 2A0NA 3PVFA 1IXPA 4Y90A 3MWAA 2FTPA 2ZA1A 4ZQNA 3S5NA 1GTEA 3NDOA 2X2GA 2VFFA 1AK5A 1LLWA 1XBXA 3S8HA 5LNSA 2PRHA 4JTUA 4Z08A 2ZA2A 3B4UA 4XBSA 2ZZ4A 4YXGA 1SR9A 5TIMA 1ALDA 1DKWA 3EXRA 5EY5A 4NNCA 4ADSA 2C15A 1OFAA 1ICPA 1I45A 5E93A 4LOCA 5IBXC 3TQVA 2G95A 2W6RA 2WKJA 3OIXA 3F4NA 4JTKA 4OE7A 3P74A 2E6AA 3IRDA 1ZCOA 1GVSA 1QWGA 3NL6A 3A9IA 1F73A 3KFTA 2A6NA 1YDVA 4X9SA 4OBTA 2G96A 3W1AA 2E5CA 2QF7A 1Q6LA 1ZENA 2NX1A 3RF9A 2E77A 4HIBA 3G1AA 2Y62A 1JUEA 3W2LA 1OK6A 1TPEA 4FIQA 4J9JA 3W76A 1GVOA 3G1XA 5F1UA 4BI5A 1MO0A 2X1RA 4JTHA 4O19A 1B9BA 4JTLA 1UB3A 4NX0A 1P0KA 3BGJA 3EXSA 3W7NA 2P1FA 2UV8G 1TPUA 3KRSA 2YSWA 3O1NA 4NT0A 3KVMA 3LDVA 5AC8A 2CLEA 3TKFA 3GKAA 3TFXA 3LBMA 2Z0IA 5DXXA 2EHHA 3NQCA 3RLVA 2VEMA 1X7FA 2C1HA 3K30A 1U83A 4LUIA 5G2HA 4NNBA 3W2NA 1FCBA 5HWJA 4FX6M 5FF0A 5KZMA 3W1NA 1AL8A 1C8VA 4MY1A 1KFLA 3A21A 1I2NA 5FF7A 2DP3A 1OK4A 2AGKA 3D0CA 2B7OA 3HF3A 1O94A 1QPQA 3EKZA 2YFOA 4GUFA 5AOUA 3UXDA 2YYTA 1NF0A 3W87A 5AYYA 4FNSA 1TIMA 2CLLA 1OVDA 3W1QA 4O1CA 1KFBA 1R47A 8TIMA 3BGGA 2Y61A 1EEPA 1OX5A 1GG0A 3CEUA 3EX1A 5D32A 4NX5A 1G69A 1JCNA 2CW6A 4GUJA 3L21A 4NUWA 2Y88A 1KFCA 4M7TA 2I9EA 1UUMA 2O7SA 3STCA 3WJXA 1KM6A 1SZEA 5FF2A 4FXRA 1B4EA 5DCDA 3W71A 3O15A 4U4MA 2QCEA 4TO8A 4AWTA 4MY8A 3GXTA 4JYDA 1IGSA 2XN2A 3W3OA 4O0ZA 1S5WA 4UCGA 3UXAA 4QSHA 1HFBA 3C3NA 4L4LA 5F2MA 5LNRA 1IXNA 2EPHA 4IX0A 5D30A 3NQMA 3S9YA 1F2JA 1H60A 2FPVA 2NXHA 3W86A 3M5YA 4MPQA 1SSDA 1LORA 1LTDA 3IGSA 5D2TA 3L65A 4MOZA 3W88A 3USBA 4UTWA 4UR7A 1JULA 2X30A 5LHEA 5E0KA 3TMLA 1DQWA 5CZJA 5H2ZA 2A5HA 4P61A 4DBEA 3STFA 1LZOA 3NPWA 3PBUA 3G0UA 3C6CA 3STGA 2D73A 3F03K 2G97A 2FIQA 3NO5A 4L4MA 2A7NA 1TPVA 1WQ5A 3TV8A 3W7IA 3G1SA 3NQDA 3FYOA 4OGZA 5F1VA 1A53A 4XUGA 1TV5A 4QAIA 2E09A 5C5YA 5D2XA 1L6YA 3MP5A 2QCDB 4AH7A 2ZZ7A 4K8HA 5KINA 4I7WA 1SU5A 4BF9A 5D02A 3VCRA 3P62A 1ICSA 4LW7A 5AYZA 1MSSA 4LS0A 4Z1BA 2FJKA 4NXKA 5HWMA 5CPNA 5BMXA 3DKJA 1TTPA 3QSRA 3GAYA 2Y70A 1I2RA 3FEMA 2B7NA 3TC7A 3G1FA 2E6YA 1TJPA 4MFDA 4WOQA 3QYQA 2ABAA 5LNVA 3M1ZA 3GXPA 2A85A 1QOPA 4ZL1A 1DHPA 3W7MA 4NJIA 2DU2A 3LI0A 3EX6A 1GYNA 2CWNA 2CLMA 3PM6A 3S5YA 4UNLA 1OG0A 4UTMA 1YXYA 4R33A 4DBDA 4CNNA 3UY8A 4JX5A 4Z1DA 1TPC1 5CPLA 1KFKA 5BMWA 2QCLA 3OG3A 5I3KA 4O16A 1ME8A 3HG5A 2QCNA 3W84A 1FXPA 3TAKA 1PHQA 5IBXA 3G1VA 4EF8A 3QM3A 3WJWA 2VFDA 1A50A 3BW4A 1R30A 5CSRA 1XC4A 4FNRA 3MJYA 3NQFA 3P8IA 3LHUA 2VFHA 4ZQPA 4UTTA 4QISA 4WXZA 5AHEA 4FXSA 1H63A 1K7XA 1VHNA 3TJLA 1ADOA 3R89A 1UASA 5KZDA 3TSDA 4AWSA 4IMCA 4NVTA 4AHQA 4IPJA 4KWWA 4FX8A 2E6DA 3KX6A 3PC0A 2J9YA 2E6FA 1YDOA 2JKEA 3DENA 3HG2A 5FEPA 4JIQA 1HL2A 2CLFA 2WNNA 4ZQCA 1XBYA 2QDGA 3LRKA 4AMAA 1A5AA 2Y63A 1TV8A 3L67A 3DGRA 1KLYA 5G1TA 1YPIA 1HTIA 3LLFA 3I7RA 4CQ9A 4ORIA 4HT3A 2DZUA 4LVAA 4RX0A 1ME7A 3IVUA 1VHCA 3Q2DA 1JCMP 3MI2A 4HKPA 2OCZA 1R46A 1ZAIA 4ZQOA 1FDJA 2EGZA 5IM51 3B06A 1XKYA 2E5BA 1VZWA 5AN7A 4NNAA 3L2IA 3JS3A 4Y9AA 1VCGA 4H3DA 5L9FA 3TXVA 3HB9A 1VLWA 2CLKA 1I4NA 4N6EA 4WOZA 4AVFA 3TSBA 3RNDA 3B8DA 4LVDA 5AHLA 3NYZA 5F2LA 5AC7A 1W5PA 3S1XA 5FEXA 3MP3A 1QOQA 3C2RA 4C1KA 4JDBA 1MEWA 1OFEA 3G22A 3MO7A 5D2VA 3V1PA 4BI7A 1W31A 3DBPA 5J5DA 4DPPA 4WD0A 4O0KA 4CQAA 1KLZA 2Q3RA 2QEZA 1DQXA 3O6YX 2V2DA 3TH6A 3DI1A 3LM7A 2C19A 1G4PA 2RH9A 4WY0B 4DO6A 2CZEA 1ICQA 1W0MA 2FB3A 3PY2A 1LBFA 3W7HA 3OVQA 5LNWA 3PSWA 3OVRA 2GJLA 4KKXA 4CLMA 4R53A 1EPXA 1CW2A 1F74A 2EF9A 3TW6A 2VEKA 5HR6A 4ZQRA 1YLVA 3F4WA 2GQAA 2TMDA 3KRUA 3LHVA 2PCQA 3JRKA 1JUBA 1A5BA 2NWRA 2H8ZA 2VELA 2WNQA 3KOFA 5F4XA 3TNOA 2JKPA 3CC1A 2B7PA 3MHUA 2YW3A 3PBVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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