3WBEA

Rice os3bglu6 beta-glucosidase e178q mutant in a covalent complex with glc from ga4ge.
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
478
structure length
478
Chain Sequence
GLTRGSFPEGFVFGTASAAYQYEGAVKEDGRGQTIWDTFAHTFGKITDFSNADVAVDQYHRFEEDIQLMADMGMDAYRFSIAWSRIYPNGVGQVNQAGIDHYNKLIDALLAKGIQPYVTLYHWDLPQALEDKYKGWLDRQIVDDFAAYAETCFREFGDRVKHWITLNQPHTVAIQGYDAGLQAPGRCSVLLHLYCKAGNSGTEPYVVAHHFILAHAAAASIYRTKYKATQNGQLGIAFDVMWFEPMSNTTIDIEAAKRAQEFQLGWFADPFFFGDYPATMRARVGERLPRFTADEAAVVKGALDFVGINHYTTYYTRHNNTNIIGTLLNNTLADTGTVSLPFKNGKPIGDRANSIWLYIVPRGMRSLMNYVKERYNSPPVYITENGMDDSNNPFISIKDALKDSKRIKYHNDYLTNLAASIKEDGCDVRGYFAWSLLDNWEWAAGYSSRFGLYFVDYKDNLKRYPKNSVQWFKALLKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
publication title Enzymatic and structural characterization of hydrolysis of gibberellin A4 glucosyl ester by a rice beta-d-glucosidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase 6
total genus 200
structure length 478
sequence length 478
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wbeA00
2WPGA 1I75A 3QHNA 3VGEA 3WNLA 2ZIDA 2WXDM 1TA3A 3CUIA 1HJVA 1IZKA 2VZSA 1TA3B 3MO4A 2UY5A 3MU7A 4KWUA 4ACZA 3DC0A 3L2MA 4ACZB 4F66A 1UR4A 3N17A 3GNPA 5IFPA 4AD3A 1JD9A 3VIKA 4M29A 4RE2A 2WLYA 1E70M 2WK2A 4QCEA 1UD5A 3RDKA 5FOOA 3M7SA 2DT1A 1LQ0A 2J25A 3MKKA 4U5IA 3VDAA 2BNJA 2WKLA 1HNYA 5BRPA 3AIWA 4CVWA 1BYCA 3MSDA 3AIBA 4LPCA 3B8SA 1W3JA 1JL8A 2E40A 4D72A 3EDDA 3WNOA 5ABEA 1W9XA 4CD7A 4JZ5A 1QI5A 1W3LA 2W67A 3AJ7A 2VMFA 4RE3A 4YN5A 3VILA 1TE1A 1LG2A 1M04A 3NIYA 1W1YA 4FK9A 3ZJKA 1D7FA 1BAGA 3WD1A 2J4GA 7TAAA 1VFOA 4GI8A 5A6LA 4MAZA 3W28A 1B3ZA 2WVTA 1ZBKA 2YA1A 1QW8A 2WC7A 3N12A 3VIJA 1NWTA 2VTFA 3EMCA 5CPSA 2TAAA 4PCTA 1US3A 4MDOA 4W8BA 4PTVA 5JBFA 1YQ2A 4GZEA 1C92A 1DWJM 3MMUA 3N04A 4P7QA 1Q6CA 3KE0A 4KGLA 1WZAA 2X0YA 1UD2A 5M17A 4PEEA 3WEZA 4MAVA 1OINA 2VRJA 1UQYA 2AAAA 3VIOA 5E09A 1XHGA 4BZYA 2QF8A 4W88A 4HU0A 3PZTA 4IM4A 2BXZA 3VKKA 3GBEA 3WMCA 4AD2A 5DEZA 1N82A 4ATLA 3L4ZA 4HZ6A 1QNPA 5FCZA 1E55A 2OLHA 4RE4A 5D4YA 4W7WA 5A6JA 3SCVA 1X6LA 2VZVA 3VD3A 1WCGA 1EOMA 5A95A 1K9TA 4TVDA 1OGBA 1FHDA 4B3KA 3L4VA 4Z2HA 3VD4A 3AHZA 4QCFA 2OWWA 2IUZA 4W7UA 3PN8A 5I78A 3W25A 4IPLA 3AIQA 4X0VA 2PC8A 1W9VA 1JG9A 2EPNA 4Y7EA 3G6MA 1WZLA 1E73M 4DUVA 3IANA 1BG4A 4QDMA 1ISYA 4M24A 3WUGA 2D24A 1U33A 1WZMA 4PMZA 1W2VA 5ABFA 1A47A 1H09A 1UHVA 2V5CA 1QI3A 1JF6A 1ZJAA 5ABFB 1FOBA 5JIWA 1R86A 1XYZA 2AMGA 2RGMA 1JFXA 6CGTA 3ZR6A 1OT2A 5IHRA 2DGAA 1GONA 2PWFA 1J12A 4JCMA 4YPJA 3WN6A 1GORA 3VDCA 5I6SA 1CDGA 2NSXA 1EGZA 1OT1A 4LQ1A 4BCEA 1LLOA 1Q6DA 2VX6A 1EDQA 1EDGA 2ZUVA 1KWGA 1OCQA 4MJ2A 2D20A 5D9OA 3LPOA 4Q7NA 4W5UA 4HMEA 3OIHA 3PZOA 2G3JA 3HU7A 4PMRA 3FY1A 2D2OA 1WDSA 5ECUA 4A4AA 1BFNA 3PHAA 1W9BM 4LYQA 1PEZA 1VF8A 1C3FA 1CBGA 3PZMA 5AC5A 4YHEA 2EJ1A 2XFRA 3W82A 2W66A 3KL5A 1E6NA 3K1DA 3N1AA 3SEPA 1X6NA 3WFZA 2ZXAA 4AZCB 4CKQA 4H2CA 3CHDA 1HP4A 1E0VA 4X0NA 5I5RA 4YHGA 1H11A 5CSYA 2ZX6A 2ZX5A 2ZXBA 2BHUA 4AYSA 1MQRA 1HVXA 4GQRA 5A2AA 1E6QM 4P8VA 5IXEA 3VNYA 5C70A 4V28A 3SCWA 1HL8A 4K68A 3W27A 3ZR5A 4J3SA 3EDFA 2CHOA 4P7NA 1H0GA 5CLWA 3WF3A 1GJUA 2VRQA 3AOFA 2J47A 5CPQA 3N13A 3PBGA 4F79A 2XGBA 1GOQA 3WQWA 3DHPA 4AEEA 1JZ8A 1BHGA 2EQDA 4U5KA 5I23A 4OOZA 1ISVA 4DWSA 2BVDA 2GDUA 3O6AA 4HP5A 3WBAA 4DWSB 5DF0A 4JL2A 4GIAA 3OLIA 3GDBA 3CGTA 4OJYA 1ODUA 3IJ9A 1CLVA 3WQ8A 3OLDA 1EHAA 1NARA 2BVTA 2EPOA 1IT0A 4PTMA 2YOCA 3FAWA 3WH9A 1B0IA 3BMVA 4AISA 3ARXA 3F5KA 4JCLA 3AISA 1QVBA 3RM4A 3NYDA 2VX5A 4M8UA 1WDRA 1JAKA 4H7VA 4XZBA 4IUGA 2ZUWA 2J7DA 3GH7A 3POHA 1GOOA 1E4NA 4KRUA 5A6BD 2VCCA 1JNEA 1E40A 3WH5A 1W9PA 1VBUA 1JD7A 1F4AA 3VIGA 5D8WA 4PMNA 3CMJA 2CBJA 3WQVA 4TOQA 1BYAA 2D0GA 3WUEA 4D6GA 1WDQA 2VUYA 4CU8A 5A8OA 1MW3A 1ZS2A 4D1IA 4JFUA 3BC9A 4OOUA 1JDDA 1V0NA 1E72M 1W9DM 3IJ8A 4FLSA 2PWGA 3OGVA 5E0FA 1VBRA 5EFDA 3OGRA 1V3IA 2CETA 4MNKA 2BS9A 5A2CA 4HPGA 4W5ZA 3AQUA 3GBDA 5A6SA 2GK1A 2J7GA 3EDEA 1Q6EA 2XPKA 3QOMA 1NOFA 1VEOA 1NM9A 1TUXA 2VZTA 3UR8A 4EKJA 1AQHA 3CMGA 1G0CA 5KEZA 2DDXA 1GJWA 3MV11 1UA3A 2FH6A 3T2PA 1HF6A 1E6XM 1GOMA 3WUBA 1H3GA 4U3AA 4P8XA 4CD8A 1XSKA 1GUVA 3I3BA 2QLYA 1BF2A 4XX6A 3CUFA 2PWDA 3PZ9A 3VGDA 4W87A 4C7GA 3FAXA 2WC3A 4UCFA 2E4TA 4GZJA 1HKKA 1KQYA 4LX4A 1UD6A 3AMCA 4D6EA 2UY2A 1E3XA 2JF6A 1VAHA 1BYBA 1Q6FA 2X09A 3T08A 1QNQA 4TTUA 5FL1A 1VFMA 4UFJA 4D6CA 2MANA 3AZRA 1WE5A 3VOCA 2DIJA 1TZ7A 1HKMA 2D22A 3A47A 1CYGA 2VQUA 5A3HA 3RILA 1WAWA 7CGTA 2EPLX 1FHLA 1XV8A 2UY3A 3K8MA 2Y8KA 2J7EA 3BSHA 3T2QA 5EBAA 3RM9A 3T0DA 1M01A 5A8PA 1GQKA 4AEFA 3ARTA 3W6MA 1JDAA 4AZGA 5LA0A 1PAMA 1CNVA 3ZQ9A 1UWSA 4L4OA 2VT0A 3PZIA 3WL0A 1HKIA 1QW9A 3VGBA 4HMCA 1Q4NX 3WEMA 3GXDA 1JZ6A 2J8FA 4D6DA 3AHTA 5CGTA 4BA0A 4W86A 1WB0A 1HJQA 3WDJA 2E8YA 4F9JA 2VX4A 2CKRA 2A3AA 4AD5A 1RP8A 3WDHA 4BF7A 3RMEA 3AXIA 1CGYA 1MQPA 3WF4A 3BMWA 2B31A 4B3LA 1UWTA 4HA3A 2J77A 2X05A 1UWIA 3AZSA 4D1JA 5GNYA 4AZIA 2E0PA 1UA7A 2BHZA 3AS3A 1E3ZA 3WD0A 4TTGA 1GQLA 3BGAA 3N9KA 1BQCA 2JIWA 5TD4A 2VZOA 2J78A 3GXIA 2W91A 2DSKA 1QI0A 2YA2A 1U2YA 3ZJ8A 1EO7A 1NOUA 5CPTA 1HJUA 3EDKA 1OIMA 4CN6A 1GZJA 4AZBA 3GTNA 4NRRA 3WELA 1HN1A 1CXHA 4KRTA 2D3LA 1QBAA 3AHYA 1J0JA 4LYPA 1XCXA 2CERA 2WANA 1UOKA 4U3CA 4J7RA 3QGVA 5AYBA 3CIVA 4AZ5A 3AYRA 4UFMA 4ACYA 1QBBA 3BAXA 4J3XA 1AVAA 4EK7A 2OSWA 4JHZA 4LXFA 2O9TA 3CZJA 2WLZA 1CLXA 1H0IA 1OIFA 1KB3A 1W1TA 1EH9A 5GNXA 2DSZA 1EA9C 1R8LA 3W6LA 3BCDA 4EAMA 1SYTA 1UQZA 1V0LA 3MMWA 4GI9A 1VJZA 2ZX7A 3N11A 1ECEA 5HBFA 1B1YA 1EXPA 1K9DA 3WFLA 3T2OA 1L8NA 3UG5A 4JKKA 3UG4A 4IISA 2AOSA 2WZEA 3B9DA 1RPKA 3M07A 1LJYA 3VU2A 2WHLA 1CXKA 1E0WA 4U2ZA 4JAWA 3WDRA 2WZHA 1XYFA 2XVLA 3W38A 3VGHA 3ZT7A 3THDA 1GVYA 3IAQA 4MNMA 4F8XA 5A94A 1CXLA 2XVKA 1KXVA 2FGZA 4XUYA 3W4RA 5A8QA 2QMJA 3SCUA 1VB9A 4ZENA 1SR0A 5M03A 1J9YA 1V6WA 5CSUA 2Y4SA 1KBBA 2ZUNA 1KXQA 4PSPA 1IZJA 2BY1A 1VENA 2Z1SA 1MWOA 3TTQA 3KZSA 1H5VA 1VEMA 1K6AA 4PBGA 3SUWA 2WCGA 3THCA 4WKFA 3BXWA 3WSUA 3D5HA 3WD2A 3DYOA 5A6AA 3EBVA 4HA1A 4ZE4A 4CN1A 1JYVA 1V6XA 2QPSA 4CGTA 1XH0A 2WYSA 2W62A 2J7CA 2F2HA 1W1VA 1XRVA 2YL8A 5EFFA 4LGXA 3VMNA 4OUEA 3GXMA 1MW2A 3FXYA 2PBGA 1DWIM 1PJ9A 4D6HA 3GNOA 4GXPA 5I79A 2WVVB 4M81A 3SCOA 1J0YA 3CZLA 3U5YA 1V3MA 1FH7A 1XC6A 1DEDA 3ZO9A 2E8ZA 2CNCA 2XSBA 5A2BA 3WMSA 2EBNA 3J7HA 1MQQA 3WDIA 2CXGA 4UFLA 3CUHA 1FFRA 2CYGA 1XGZA 2VCBA 4UZUA 1E15A 2A3CA 2CCRA 2BY2A 3M6DA 4HZ8A 1LL7A 5HPOA 3M46A 1JXKA 3OZOA 3ZIZA 1BVZA 2X2YA 4OKDA 4W89A 1BSIA 5ABGA 5CJ5A 3WDQA 4P8WA 1V6VA 1EO5A 4PMQA 4AY1A 4FLOA 2J8GA 5CLTA 2XM1A 1HXJA 2J7FA 2W92A 4WJXA 2W63A 1UD3A 2D0HA 3CHCA 3VVGA 3TA9A 1UKOA 5FL0A 2A3EA 4PUEA 1E1FA 1R85A 3F4VA 1NWUA 4QLLA 4OBSA 2X1IA 1JNDA 2GUYA 3A4WA 2DH2A 2D23A 1FP9A 1NP2A 2G3NA 5AC4A 3UCQA 3CHFA 4OIFA 4ML4A 1ISXA 4HZ7A 1A3HA 5E0CA 3ZT5A 4OZOA 4NRSA 3OLEA 3WQ6A 4AZCA 4PMOA 1U30A 1TR1A 1GOKA 3CH9A 3UG3A 2A3BA 1UH2A 1GNXA 1G1YA 1HJXA 3BCFA 3MUY1 4JFWA 2O9RA 5GNZA 4WLCA 3VIPA 3AMDA 4H41A 1HVQA 3O2LA 3W81A 4S3JA 2YLLA 1G5AA 1V02A 1HX0A 4PMDA 4GQQA 2DEPA 1WZKA 3AIVA 2PBOA 4AZ6A 2CBUA 4PTXA 2V3FA 3GM8A 2XSAA 1JYNA 2OSXA 4PUDA 1NH6A 3LPFA 3WY1A 2PB1A 2FHCA 3N18A 2O9PA 2FHFA 4J3UA 1GCYA 4QFUA 4MPKA 1C7TA 1J10A 2XUCA 1GOWA 4J3WA 1UH4A 1B2YA 3BLKA 4MB4A 2O92A 4B16A 2V3DA 2BV9A 2C7FA 1ODZA 3B9AA 4P8UA 3T0BA 4X9YA 1ISWA 5CGMA 1CGXA 1M7XA 1LWJA 1UD4A 2W61A 1G9HA 4B9ZA 5HDRA 4E4PA 7A3HA 1JXJA 2DT2A 1UR9A 1JZ7A 3A3HA 3MUZ1 2WCAA 1EIBA 2ZUSA 2VQTA 4LYRA 1CWYA 3VMOA 4AXNA 2WHMA 3AMKA 5LA1A 1UZ1A 2PWEA 2JE8A 3N15A 5I77A 2DH3A 3WH8A 1W1PA 2CKSA 4J3TA 4N42A 4Z2JA 2XVGA 3LPGA 4MTVA 1WPCA 3RO8A 5DFAA 1QOXA 4M82A 3RPMA 3L4TA 2VCAA 2WWDA 4IPNB 2GJPA 2EO7A 3APGA 3WQ4A 1I1XA 5CQ1A 3WKZA 3WF2A 3K8LA 5A6KA 3AMGA 3ECQA 2XVNA 1BYDA 1KGUA 5BROA 1E4MM 6A3HA 1LL4A 3BH4A 3EMQA 4PMUA 3MMDA 1BVNP 4AMCA 1XH2A 1C8QA 4H8UA 3W24A 3AHVA 1C8YA 2DSVA 2WMIB 4HMDA 4GI6A 3VDHA 3VX1A 5E6ZA 1W9UA 4PMVA 2YKKA 3I3EA 2W5FA 3VIHA 1F4HA 2ESCA 4W93A 4GO8A 3ALGA 3OBAA 5HNNA 2WMFA 3DHUA 4R27A 1SMAA 4CCCA 4HU8A 4UOJA 3BAJA 4PMXA 1KCKA 1ZBCA 4XZWA 3WH6A 4NI3A 3WNPA 2WW5A 3WUFA 1NWRA 2VVSA 3LPPA 4PYSA 2YBUA 2GJXA 2GJXB 3K46A 5EB8A 4UR9A 4W85A 4UQBA 4JKLA 3PZUA 4W84A 3ZM8A 2OYLA 2OWCA 5ABHA 2YBTA 2WB5A 3CTTA 3VPLA 1G01A 3MV01 1XH1A 1KR1A 1XCWA 3OA5A 1V6YA 2YL9A 1AQ0A 1JDCA 3IK2A 4H8HA 3KWXA 3EYPA 5BYWA 3ZJ7A 2YL5A 4U2YA 3AI0A 3BAKA 4N0RA 2VVNA 3BAWA 3TTOA 2BY3A 1C7SA 1NP0A 3ZT6A 4HA4A 4AW7A 2OYKA 9CGTA 1J0IA 2O9OA 4CD5A 3AMLA 8CGTA 3FW6A 4UQCA 2EEXA 2IXUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WPG A;  1I75 A;  3QHN A;  3VGE A;  3WNL A;  2ZID A;  2WXD M;  1TA3 A;  3CUI A;  1HJV A;  1IZK A;  2VZS A;  1TA3 B;  3MO4 A;  2UY5 A;  3MU7 A;  4KWU A;  4ACZ A;  3DC0 A;  3L2M A;  4ACZ B;  4F66 A;  1UR4 A;  3N17 A;  3GNP A;  5IFP A;  4AD3 A;  1JD9 A;  3VIK A;  4M29 A;  4RE2 A;  2WLY A;  1E70 M;  2WK2 A;  4QCE A;  1UD5 A;  3RDK A;  5FOO A;  3M7S A;  2DT1 A;  1LQ0 A;  2J25 A;  3MKK A;  4U5I A;  3VDA A;  2BNJ A;  2WKL A;  1HNY A;  5BRP A;  3AIW A;  4CVW A;  1BYC A;  3MSD A;  3AIB A;  4LPC A;  3B8S A;  1W3J A;  1JL8 A;  2E40 A;  4D72 A;  3EDD A;  3WNO A;  5ABE A;  1W9X A;  4CD7 A;  4JZ5 A;  1QI5 A;  1W3L A;  2W67 A;  3AJ7 A;  2VMF A;  4RE3 A;  4YN5 A;  3VIL A;  1TE1 A;  1LG2 A;  1M04 A;  3NIY A;  1W1Y A;  4FK9 A;  3ZJK A;  1D7F A;  1BAG A;  3WD1 A;  2J4G A;  7TAA A;  1VFO A;  4GI8 A;  5A6L A;  4MAZ A;  3W28 A;  1B3Z A;  2WVT A;  1ZBK A;  2YA1 A;  1QW8 A;  2WC7 A;  3N12 A;  3VIJ A;  1NWT A;  2VTF A;  3EMC A;  5CPS A;  2TAA A;  4PCT A;  1US3 A;  4MDO A;  4W8B A;  4PTV A;  5JBF A;  1YQ2 A;  4GZE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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