3WJZA

Orotidine 5'-monophosphate decarboxylase d75n mutant from m. thermoautotrophicus complexed with 6-amino-ump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVANIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 83
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wjzA00
2WV8A 5D02A 1QO2A 3T40A 4UTTA 2G5WA 1JUKA 4UXDA 1KV8A 1H1YA 1JRBA 1XC4A 3SR7A 3A24A 5CPLA 4K36A 3L67A 2TRSA 5D05A 4UNKA 3L0NA 2A1YA 1H7WA 3N2XA 2YPIA 4GUGA 4KFNA 4LC8A 4UIOA 3ABRA 3GZ3A 5LHFA 2VFGA 1H63A 3KAOA 3LCWA 3STEA 1C8VA 1LBLA 3DAQA 3E9AA 4HHPA 2ZA2A 3CEPA 1H50A 5EL1A 3WK1A 4KFPA 1VQTA 3QM3A 4ADTA 2CZFA 1LRNA 3W72A 1GG0A 4H6KA 5K9XA 4YWIA 3RK8A 5FF4A 1YDVA 3HGOA 1HG3A 4ORIA 2IQTA 2QCLA 3EWBX 3GDRA 4RZ5A 2AAMA 3DI0A 2ZZ3A 4JDBA 3HPZA 4LUIA 1PIIA 2C18A 4Q4KA 5EPDA 1W5PA 4MFEA 1FCUA 1U5JA 1GYNA 3P8JA 1LZOA 4O17A 4XTDA 1DHPA 2GVLA 2XN0A 4ONVA 3W1UA 1Z48A 3OBKA 4O19A 2DZUA 3EEGA 3W83A 2C1HA 3M41A 3H54A 2DP3A 4JNMA 1Q3NA 3L21A 1H7XA 4ZQCA 5LSMA 3QZEA 2QUTA 2CWNA 1TTIA 1ZAHA 3O16A 2WSQA 4L4LA 3W2NA 2YFNA 1SZEA 3PBUA 1J2WA 3P82A 1OF6A 4Z0JA 4O4VA 5CPNA 2AGKA 2DJLA 5EYWA 5HWJA 2FQIA 2YYUA 3MBDA 4MY8A 3CTLA 1KM4A 4BWLC 4O0KA 1PV8A 3DFOA 4IJBA 5LNSA 3GB6A 3UZJA 1IXQA 1XBXA 1SO6A 4ZQNA 3LI1A 3W6YA 3ZWTA 4UFHA 2DZWA 3TFCA 2QCDB 4GUJA 3NQCA 3EWYA 1ICQA 3SY5A 1TPVA 3HF3A 5BRBA 3GAYA 1AG1O 2OT0A 4OBTA 2JKPA 3M9YA 5TIMA 1TV5A 4GNJA 3PSWA 4ICNA 1AW1A 1FWNA 1Q6LA 1G4PA 4JD4A 3GYEA 5L6UA 4IUOA 3LRLA 2E77A 4Q33A 3I6RA 3BVJA 3NQDA 2WQPA 2AQWA 1YTEA 3HJZA 3L2IA 4B5NA 3DBPA 3NPVA 4UTLA 2X1UA 1TV8A 2X1SA 5F2LA 2CLMA 3UQNA 3NM3A 3BV4A 3LCIA 1WBJA 5KINA 3M7WA 2GJLA 3WJXA 3N9SA 2H6RA 3HG4A 2A7RA 3G3DA 3W7CA 1JULA 3P60A 4WY0A 2RFGA 1OVDA 4LRTA 3ELFA 4JTSA 5DELA 3S9YA 3FEMA 4NNAA 3C8FA 2G96A 5EA9A 3M6YA 5F4XA 3QW3A 4M5PA 3L66A 5F4SA 4O54A 3S5NA 3VCRA 4N02A 5HR7A 2PCQA 5FF3A 4QM1A 2R8WA 3NQ6A 1H62A 3ATZA 1FX6A 1G6CA 3G0UA 2EPHA 3A21A 5HUOA 3G8RA 4JTEA 1XI3A 5D2YA 2NX9A 4YMZA 3W75A 4Y96A 1XBYA 1W37A 3F03K 3W7LA 4M6PA 1F6PA 3CU2A 4C1KA 2QCNA 1I2PA 2NWRA 2Y89A 3MP4A 5HUPA 3I68A 4DELA 1T99A 1FUYA 3ZFHA 1QOPA 3TJLA 3IV3A 1ZNNA 2EGZA 4IX0A 3W1MA 4A2RA 3KVJA 3P7YA 1D3GA 1TPH1 3EKLA 1TQJA 2Z1BA 3BLIA 5LNVA 4GBUA 4UC5A 4LV9A 1HO1A 1O95A 3W1XA 2E6YA 3PUEA 3DENA 3H53A 2VXNA 4X2RA 4EWND 1KFKA 4MY9A 5HULA 3MP3A 4O14A 4N6FA 1IXPA 3BLFA 4MY1A 2NWSA 1VYPX 3DFSA 3RF9A 2VEKA 2V2CA 1QNVA 3W7PA 4UTHA 3C52A 3G1VA 4WD0A 4NX5A 5LNWA 1QWGA 5D03A 1ICSA 1F5ZA 5CSRA 3PBWA 1I4NA 3M5VA 3HQ1A 4LWWA 3W74A 4M6QA 3NAVA 5U4NA 2WNZA 4AXKA 1U83A 1YDOA 5LNUA 4O13A 1OX4A 1WOBA 4BK9A 4NVTA 2ZRYA 3S1XA 3C6CA 3W7IA 4M6VA 5AOUA 4GUHA 3NQGA 3QFEA 3KFTA 1C29A 2VKZG 3L0KA 1OFAA 1X8FA 4JICA 4KKXA 3B4UA 3FKKA 1DQXA 2OZ0A 5KSWA 1EA0A 2VFDA 3KXQA 3MHGA 3KRUA 3W3OA 2ATMA 3NQ8A 4LRSA 3C61A 1GTEA 3PVFA 1SZFA 2OCZA 1VGAA 3C2RA 4JGDA 1SW0A 3LV5A 2BZNA 3N34A 3G18A 4FNPA 4O28A 4JEQA 2ZA3A 5KMYA 3PULA 2OX1A 3PG9A 2NXIA 3ANYA 4ADUA 3N19B 1IXNA 4IMEA 1H7PA 4N4QA 3W7NA 4AF0A 3IRDA 4JY9A 4D2JA 4DPPA 3A22A 3PWAA 5CKSA 1DOSA 3Q37A 3GXPA 1Z42A 2VFFA 3GLCA 3CWOX 3CIXA 3EWZA 1HL2A 3NDOA 5L9FA 1VLWA 3S5ZA 1OABA 4AWUA 4TIMA 3D0CA 3GDMA 3G22A 4JS3A 3CLMA 3DGRA 1A53A 4FNRA 1H7RA 3NM1A 3QMTA 3PUOA 3T78A 2EF9A 5H91A 3W1PA 4O11A 4LNYA 4AHQA 4XBSA 2HTMA 3S42A 2CLOA 5ABTA 2VEIA 4JYEA 3IIZA 4LUJA 3P74A 3W7EA 1WQ5A 5CZ0A 4LT9A 2CLHA 2FB2A 1L6WA 1OX5A 3W1NA 4DF2A 2H8ZA 3EX3A 4LVFA 4A2SA 1EB3A 4K8HA 2ZCGA 2JGQA 4P2VA 1EWEA 2YFOA 5DBUA 1KW1A 1OK4A 4YL2A 3W22A 5G2IA 4P61A 2YX0A 2C3ZA 2P1FA 5SWUA 2ZDRA 1JCLA 5I3FA 4Y9AA 4UFIA 1EEPA 3TMLA 2YSWA 2GUUA 1DV7A 1O4UA 5AHFA 4X3ZA 4WOQA 2RHGA 1PL9A 3LCHA 1RVGA 3R8RA 3G1XA 4EF8A 2V5BA 3V75A 4A3UA 4BI5A 3E02A 4M7SA 1ZHAA 3EWWA 3GNNA 1T8XA 3IIVA 3W7MA 3OVQA 3CB8A 1O94A 3E49A 5DCDA 2Q3OA 3O07A 2C13A 2E5BA 1M5WA 4I7VA 2ZZ7A 1VJIA 1G7UA 4LC6A 3SSJA 5AB3A 2CLLA 3W71A 5CZJA 5F2GA 3HG3A 4NXKA 4PFMA 1KM2A 2KZHA 3BG9A 3R2GA 4JTLA 4TO8A 4MYXA 4XUGA 4QNEA 3BGGA 3SGUA 3W9ZA 1LM1A 1TSIA 2H90A 2TMDA 4CQ8A 4NJJA 2GVJA 3BO9A 1VLIA 2QCFA 4GUIA 5AYXA 2LLEA 4CNPA 3HGSA 1OYCA 3G1DA 1S5WA 2B7QA 3IGSA 4ZQMA 5HINA 5K4ZA 1WAUA 4HKPA 1LOSA 1RV8A 1GT8A 1FCBA 2GQ9A 2E09A 2DU2A 3TAKA 3TNOA 1KLYA 1LRTA 3MO7A 3G1SA 1ADOA 1LROA 1UCWA 3DFNA 4IPIA 2E5CA 4PL2A 2ZQ0A 4WX2A 1EX5A 3NQFA 3Q58A 4UTIA 5BMXA 5C5YA 2J88A 2TPSA 1OFRA 1SZNA 3BG5A 4O12A 1GWJA 3TXVA 3S5YA 3SW6A 1MSSA 1ZFJA 2HS8A 4NJHA 1LP6A 1EIXA 5KZDA 4CCEA 3UWYA 2QCCA 1GYLA 4LV4A 4EVZA 5IBXA 1Z44A 1LORA 4BR1A 4Y6GA 1XCFA 3E12A 3N14A 5FF7A 3QEZA 4RZ4A 3HMJG 5AC6A 1O5KA 4IMGA 3UNDA 1MEHA 2C15A 2PE4A 2C6QA 3MI6A 3DFQA 2RDWA 5C6MA 2ZBTA 1NEYA 3G24A 3MMTA 1VZWA 3C2VA 1GZGA 2ISSA 4PTNA 2CU0A 3CEUA 1G69A 1JCNA 1SUXA 2RDTA 4UTWA 1KTCA 3EXRA 3SIZA 3TSMA 2P10A 2PC4A 4WZHA 5U7SA 4E2DA 4ZZ9A 1YXYA 5EKYA 3TK7A 2C16A 4UR8A 5FEXA 4UTTC 2V81A 1TPDA 3ZR4A 3B03A 3LXCA 4DO5A 3OHIA 5G1TA 1XBVA 1ZALA 1QCWA 3SFKA 5BW6A 2PRMA 5A8GA 4UTUA 3T7VA 3PR2A 1XM3A 1VYRA 3MI3A 4BI6A 2YZRA 1AL7A 2FJKA 2QCGA 4FXRA 2V5LA 4XKYA 4GWEA 5D2XA 3U8GA 1F6KA 5BMWA 2FTPA 1A50A 4FF7A 1DORA 3R12A 1DL3A 3TUUA 2B4GA 2CZ5A 1G4EA 4QAIA 1UJPA 2JKEA 3HGJA 2NX3A 3OEXA 3HPSA 4JTJA 1P4CA 4OWGA 2X30A 1PE1A 1WX0A 2O7QA 3DFTA 1W56A 2NZLA 5F1UA 3A5FA 3F4NA 1J5TA 1EWDA 4M19A 3NQAA 3NL5A 4MKNA 2Y85A 1RPXA 4ZQPA 3NQEA 3M43A 2P0OA 1PHQA 2C19A 4PH6A 3MJYA 1ZY9A 4MZ1A 4NX0A 2ZA1A 4MJZA 3RMJA 3UWZA 3DKJA 3ATYA 4TMCA 3NL3A 1KFJA 4GXMA 4K39A 3W23A 1N7KA 4R53A 3BW4A 4Q32A 5LKYA 3LXAA 3MHUA 2Y7DA 4IPJA 2QAFA 4A29A 4R33A 4NZFA 3LCGA 1UUMA 5CPOA 2FDSA 1G7VA 3GDLA 5C54A 1OFDA 5DCEA 4NNBA 3C0JA 4O1BA 4IXHA 1ME7A 3UWVA 3LRMA 5KZEA 1SFJA 4JIPA 4MIMA 4OT7A 3NVTA 1EP1A 5KITA 4WQ6A 5K9DA 2RDUA 1NF7A 3USBA 4DBDA 1FBAA 1FWTA 2J27A 1KM5A 4TR9A 3MUXA 4IGHA 5DY3A 1F76A 1IGSA 1TPB1 3HG5A 3GNDA 1QPRA 3QSTA 4ALDA 1H1ZA 3MP5A 4O50A 3W87A 1H51A 1EUNA 4FB7A 1HFBA 4TX9A 3LBCA 1BWLA 2UV8G 4FNTA 3LCLA 2Y63A 1GVSA 1KBJA 3B05A 1YTDA 1TO3A 5A5WA 3W88A 4WY0B 2TYSA 1IXOA 1FXPA 3BG3A 1NSJA 1AK5A 1A5BA 3NR0A 1I2QA 4GFSA 4JDYA 3PB2A 4BWLA 1N55A 3TR2A 3PUDA 1WA3A 5I3KA 1VCVA 4DEFA 1KA9F 1K3UA 1GPWA 3QMRA 1YPIA 1T96A 3A23A 4JTGA 5FI8A 1GVQA 1ML1A 1QOQA 3MYPA 1PCWA 3TH6A 4MUZA 4JTIA 1SSDA 1SU5A 1ICPA 1S5TA 3T55A 1SW7A 1F7BA 1CX9A 5KTLA 2E5DA 1RQEA 6TIMA 1VRDA 2C14A 1WBHA 2HMCA 3M44A 4NJKA 3W73A 3DI1A 2BTMA 1P1XA 1XKYA 2YW3A 1C9DA 3QPYA 1FY6A 4O8RA 1I2OA 1Z41A 2F84A 4IMFA 2NUYA 3PM6A 4FX7A 1JCJA 1DKWA 2YDAA 3C4UA 4NXSA 2J9YA 1LLWA 2ZZ4A 1EUAA 2FPYA 4FIRA 1RQHA 4HT3A 4DF1A 4GC4A 4LVAA 1XBZA 3M1ZA 3WFAA 5E93A 1X6UA 2I1OA 3W85A 4CLMA 4UCGA 3TC7A 1OYBA 1K7FA 2QJIA 1VPXA 1D3HA 3CT7A 3FA5A 1F73A 4CNOA 4I9AA 4XZ9A 1G4TA 3TFXA 1W5QA 4U28A 1XUZA 3UY7A 5KZMA 3M5YA 3Q2DA 1TPFA 1T0OA 4ML9A 3ZWSA 3M5ZA 3FS2A 2OJPA 3MBFA 4O10A 2VENA 2A6LA 2Q3RA 3G1FA 3NOEA 4GE8A 2DZPA 3UPWA 2H3DA 4N2YA 2ZZ5A 3PAJA 2CLFA 2ABAA 4K7VA 1O5XA 1XL9A 1SQ7A 1OX4B 3GDTA 1I8JA 7TIMA 3TW7A 5AN7A 4C1LA 1ME8A 2ZRVA 2A7PA 3P81A 4Z0SA 3VNDA 3PBVA 4W9TA 4Y8FA 3CC1A 4AMAA 1NFBA 4YCPA 2DZVA 3YPIA 1EP3A 1ZAIA 3LLFA 3LHYA 1KFLA 1GG1A 3LGEA 3RFAA 1JJKA 3FLUA 4FNUA 2NV2A 1P0KA 5MHBA 1QMLA 1R46A 1TIMA 2A85A 1R2RA 3K30A 1OJXA 2ZRUA 3LBMA 1WXJA 2QCMA 1IIGA 1TJPA 4OHQA 1X1OA 1DBTA 5K4XA 4FNSA 4O52A 1JCMP 4GJ1A 4CCDA 1VC4A 4NNCA 1ZENA 3DH7A 5AFDA 2X16A 3NNTA 2X1TA 3ABQA 1Q6OA 2BXVA 5G5IA 4MVAA 3W70A 2G95A 3W1LA 3LHTA 1YXCA 4NJGA 1JR1A 2A4AA 3LXBA 3L0GA 3R5EA 2ZRZA 3PG8A 3WJYA 3TV8A 4FNQA 3TC6A 4K38A 4KFOA 5D2VA 2R94A 3EX4A 3QH2A 3NL2A 4AWTA 2NV1A 1BEUA 2E1DA 3R89A 4RJEA 3H55A 1QDSA 3NL6A 3P8IA 4R34A 1QR7A 3LOTA 1V7YA 3NPXA 5D37A 1GTHA 4PEKA 4XBKA 1XUUA 5AHNA 3TDFA 3IGUA 1SPQA 3LERA 4HN4A 3C56A 3INPA 2D73A 5G4EA 1AMKA 1KV5A 5CZSA 1HO4A 3G0SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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