3WMBA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with naphthalimide derivative q1
Total Genus 190

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTLHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERFVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
publication title A crystal structure-guided rational design switching non-carbohydrate inhibitors' specificity between two beta-GlcNAcase homologs
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
total genus 190
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wmbA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3wmbA01
3DHUA 2QPSA 4EAMA 4WSJA 5DMYA 3G6LA 2WCAA 1JYVA 5D8ZA 4TVDA 2X2YA 1B3XA 4CVUA 1GZJA 1IZJA 5EBAA 3RCNA 4AMCA 4AZGA 4BCEA 4YPJA 4MAZA 1QNOA 5A8PA 3ZSTA 1C93A 4LX4A 2Y2WA 2O9OA 1GJWA 4QLLA 4M81A 3PZVA 2ZWYA 4PMRA 4U3AA 1O7AA 2NSXA 4AWEA 1W2VA 4P7QA 3TP4A 1FOBA 5DFAA 2FH6A 2VNCA 2J4GA 1ISVA 2VURA 5AC5A 3UCQA 1KR0A 1PZ3A 3O2LA 3VGFA 1Y7VA 3AIUA 5BWFA 4UQAA 4LGXA 2BY1A 3AHZA 3SCNA 1EDGA 1BTCA 1XD1A 1F4AA 2WW5A 3PN8A 4D6CA 1US3A 2E9LA 2XFRA 4FLQA 5JIPA 1HT6A 3VIMA 4UNIA 4URIA 5D9MA 1UH3A 3NYDA 1HVQA 1V0KA 1AQ0A 1QI3A 1NWRA 3L4WA 3L4XA 2GSJA 2HISA 2FHFA 2G41A 2GUYA 3BAWA 4GO9A 1XSKA 5A8OA 3VDHA 1ZB5A 4CCDA 3SCWA 1C8QA 5E9AA 3EDJA 1JZ3A 3AIVA 1CXKA 2WZHA 5IDIA 2J8GA 2G8ZA 1G01A 3WH7A 1L0PA 1B0IA 1SR0A 2E4TA 4EKJA 2PWEA 5DEZA 3K8LA 4J7RA 4AISA 5DT7A 1OWQA 1C7TA 3WF4A 3WL0A 1NQ6A 4W8BA 1TG7A 4E2OA 2WMIB 3E1F1 5A2CA 3WEZA 2XG9A 3FAWA 4U2ZA 1HKMA 3ZT5A 2DGAA 3WQ4A 3WF0A 1UR8A 5LA1A 2BY0A 2PBOA 2PB1A 2EPLX 4PMQA 1JDAA 3WEMA 4H04A 5DT5A 2FDMA 4W7WA 3WF2A 2DIEA 1UR0A 4Z2GA 3GH5A 4PSPA 5GQBA 1QNRA 3EDDA 1BVZA 1W1YA 4AW7A 1HJQA 2VRJA 3BAXA 4H8UA 4MJ4A 3W24A 1DEDA 2GK1B 3ECQA 5LA0A 1UA3A 1OBAA 4NRSA 5A3HA 3B9DA 1R85A 3O9NA 3MMUA 1HP4A 2VZTA 4XX6A 1ZJBA 1BGGA 3WD0A 1BYBA 2JF7A 1XCWA 3NSNA 1MQRA 3VGGA 3FN9A 1GHRA 1OCQA 3WQ5A 1H41A 5HBFA 1J0IA 3AYRA 3ZR5A 2G3JA 3AS3A 1OIMA 5I23A 2EEXA 4D1JA 4TVCA 4BA0A 1W3HA 1VB9A 4P8VA 4DWSD 3ARYA 3GNRA 1E6ZA 4JHOA 2OYMA 3AHVA 3VIKA 5A8MA 4W5UA 3A47A 2A3EA 1JFHA 5ABFB 1CTNA 1UHVA 1XC6A 2WLYA 2ZXBA 4UCFA 1VJSA 4F9JA 4AZ5A 3T0BA 4C91A 1JDDA 1KGUA 1PX8A 2O92A 1ISXA 1UUQA 4EK7A 3VGBA 4LYRA 1E55A 1VJZA 1H5VA 3BCFA 3CTTA 4H8HA 3CUJA 2V3DA 4KGJA 3SCSA 4C90A 2VQUA 3N12A 1WZLA 1MW1A 4AZHA 4WKAA 1V0LA 2CHOA 3S6TA 1J9YA 8CGTA 5CLTA 2WBGA 1FFRA 1XH2A 3RM9A 1G1YA 1QI4A 1ZBCA 3WBEA 2HVMA 2XYLA 2O9RA 1QI0A 3AMGA 1V3IA 2DSKA 4XZBA 3MSDA 3U5UA 3M7SA 2E8YA 5A6KA 4HOZA 4CGTA 2D0HA 6A3HA 3WUBA 3MMDA 2ZXDA 1B1YA 4IUGA 3ARQA 1QHZA 4PBGA 3WDJA 4PTWA 3ZJKA 1NWUA 5IXEA 2G3IA 1V3HA 1LWJA 4Z2HA 3A4XA 2XGIA 2X09A 2J75A 1WPCA 1ZBWA 1HJXA 2JF6A 1E0VA 3SUUA 1V3MA 3OLEA 2E8ZA 4D6EA 1Q4NX 2A3BA 1XCXA 2W4XA 3SCVA 4DUWA 2WWCA 1RD6A 1FH8A 4UFKA 4DM1A 1BVNP 1C91A 2W91A 1MXDA 2VL4A 1GPFA 1E5JA 3AS2A 3W27A 5FD0A 3U57A 4KRTA 5E6YA 1E70M 3MU7A 3PZOA 1GOOA 4ZENA 1QOXA 1VENA 1PX4A 1QI2A 1WDQA 4ACYA 1I75A 2DSWA 1BFNA 3VM7A 3WDQA 4XB3A 3VIPA 3M46A 1XSJA 2VVSA 4D1IA 3A3HA 2OSWA 5BRQA 4UQDA 3VD5A 2VJXA 1OM0A 1JIBA 5A6BA 1QW9A 3CZLA 1UD3A 5GNZA 1H11A 4ML4A 4Q22A 3ZJ7A 1E56A 1X6NA 2CBJA 1BQCA 4BS0A 4CU7A 2CBVA 1KCLA 2WZEA 1V6UA 1NOFA 1PEZA 3BAKA 2CITA 1KQZA 2OYKA 3RPMA 3WMCA 1LL4A 3RDKA 1J01A 3WDRA 2GJPA 5D9NA 1B9ZA 4JAWA 4HP5A 1HVXA 2JFEX 3PZGA 2J7HA 1J12A 1E6SM 3HMCA 4M56A 1H09A 1UR1A 1W1VA 2QLYA 1B2YA 4J3XA 2CPUA 1W3LA 5C8BB 1CIUA 2XSAA 1R86A 1J0KA 1EHAA 1K9EA 1UWTA 1GUVA 2F2HA 3DECA 2D22A 1VIWA 3GTNA 4CN4A 4JZ5A 3AIEA 1JZ8A 4LXFA 3MV01 3PTKA 2DSVA 5D9PA 1UR4A 2A3HA 5A8NA 3AHYA 4AD1A 2WWDA 2QMKA 2D23A 3WDHA 4C7GA 4UOQA 3PZ9A 5FL0A 2X05A 4X9YA 4F66A 4ZEPA 3EDKA 2CKRA 1YHTA 2DSZA 2ZUTA 1UKPA 1U33A 1E6QM 1J0ZA 4U33A 2VI0A 1V02E 5C70A 3W37A 1KXHA 4WJXA 4MNKA 2FH8A 1NWSA 2WC7A 2WVVB 4HA4A 1ZBVA 5KZ6A 1FH9A 4BF7A 1CPUA 5A6SA 1G94A 1B3ZA 4AD4A 1WDSA 4AD3A 5AY7A 3IAQA 1ITXA 1E4MM 1HJUA 4HA3A 2QMJA 1E5NA 1XGZA 1FFQA 3EBVA 3WF3A 4AD0A 3KL3A 4PMXA 1CGVA 2AMGA 3APGA 4GZEA 3VNYA 4GXPA 1C90A 2PWHA 2WNWA 3AIBA 1QNPA 2GJXB 1A3HA 3LPOA 4J3WA 1UZ1A 4QCEA 3HN3A 3CPUA 3BAJA 1TMQA 3MANA 3RJYA 2VQTA 3SUSA 1JI2A 1C8XA 1K9DA 1SFSA 1PX3A 2GDVA 2VCAA 2ZXQA 1UKTA 2J7FA 4D6FA 1JYNA 1XSIA 2VVNA 3WN6A 1KR1A 5E09A 2Y5EA 2A3CA 4XUYA 1ISZA 1MQPA 3AMCA 4W8AA 4HU8A 4JFSA 2BNJA 1RP9A 3UR7A 1NP0A 1DWFM 2J8FA 2YBTA 4M82A 3TONA 3F5KA 3NIYA 2WAGA 4A3HA 1YQ2A 1TCMA 4TTUA 1KBKA 4ATLA 3O6AA 1B30A 4P7LA 4D6GA 2D3LA 3AICA 1VBUA 1R8LA 2WMGA 3ARPA 2PC8A 4JKMA 4UQ9A 4QAWA 3VD3A 4UZUA 3TTSA 4J3SA 3CZKA 1WDPA 2NT0A 2VT0A 2J7BA 1TA3B 2D1ZA 4MTVA 3PZQA 4PUEA 4TTGA 4TX8A 1E4IA 4W7UA 3DC0A 4HZ8A 3WQWA 1GQIA 3VIHA 4S3JA 4B9ZA 2WB5A 3OIHA 4ATWA 1UR9A 3N18A 3PHAA 1NARA 1UD6A 3EMQA 4W8LA 2WVUA 3A6OA 3OG2A 2WKLA 4PUDA 1WZMA 2V5DA 2CBIA 5EFDA 2V3FA 3FW6A 1GW1A 3N15A 3WF1A 2GK1A 1DWIM 2C7FA 1VEOA 3AHTA 3AS0A 3DHPA 4MAVA 1HX0A 5A6AA 2PF0A 4FF5A 1PBGA 2CETA 1BG4A 4F9DA 4FLRA 3PZNA 3TTYA 5IHSA 4NSBA 1FP9A 3W53A 1EQCA 3HJEA 2E9BA 4IPNB 3WDIA 3WFLA 3KEHA 2TAAA 2J7DA 1PIGA 1HP5A 1W91A 1C7SA 2Z1SA 1JL8A 2QF8A 5M03A 2YBUA 5A6JA 2VRQA 3UG4A 1WZAA 5I79A 1E71M 2YA0A 4LPCA 5BXTA 1XD0A 3VD9A 4DM2A 1RH9A 5CSUA 4BQ4A 1FA2A 4ZFMA 5A6MA 1NOWA 3AS1A 2ZWZA 3ALGA 4IM4A 4J28A 1JZ4A 5I77A 2QPUA 2EO7A 3I3EA 3L4TA 3RMEA 4HPHA 1C8YA 4MB4A 2BV9A 1JXKA 3L4ZA 1UWRA 2OWXA 4WIWA 2XVPA 3K4AA 1CZ1A 1RP8A 1DWJM 2VRKA 2EPKX 2YL8A 1QW8A 3CZ8A 1M53A 1E40A 2YL9A 5JUVA 4C7DA 1JI1A 3WQ6A 1VBRA 3NCOA 3BAYA 4OZOA 3N04A 2WCSA 1V0MA 4EE9A 2V5CA 2ZX6A 5F7UA 3MO4A 1CXFA 5JBDA 1U2YA 2JALA 5CLWA 4AIUA 2EQDA 2FHBA 4GO8A 3VX1A 3AXHA 1BYDA 4RL3A 3ZMRA 3L2LA 2F8QA 5C71A 4X0VA 3ZT7A 2NW0A 5EMYA 2W61A 1B3YA 3LPGA 1LJYA 3OZPA 1V0NA 1XRVA 4PTMA 1W9BM 1BSIA 2ZICA 4PTVA 3RILA 5IFPA 4MNLA 2DT0A 3CHEA 3AIWA 3AISA 5BRPA 3W81A 3QHNA 1CWYA 3U7BA 1J11A 3L2MA 2CIPA 2WVSA 1LG2A 2WMKA 1CENA 2OWWA 2J47A 1BHGA 1I1WA 3WELA 2GJRA 1Q6DA 1H49A 4JHZA 4J3VA 1G5AA 2XPKA 5HOSA 4Z2LA 1J0JA 4GINA 3PZTA 1ODUA 1OSEA 1JZ2A 3ARVA 4CD4A 4UQBA 4V27A 2XWEA 3ARWA 3T09A 2YA2A 5EFFA 1ODZA 5CPTA 4QDMA 3BSHA 4TX6A 1D3CA 1E1FA 1ZS2A 2OWCA 2IXUA 2DT2A 1KGWA 3OLGA 1E3XA 3MUZ1 3WNKA 4GQQA 1LWHA 5M3WA 1UD2A 5HPOA 3ALFA 4R5EA 2D0FA 3WDPP 5E0FA 4AIOA 3QOMA 2XVKA 5KEZA 1UKOA 1J0YA 4H8VA 1SMDA 1ZJAA 4L4OA 3N1AA 3WKZA 3L4YA 5CJ5A 3GDBA 3SCQA 4KWUA 1US2A 3WBAA 1J0HA 1KXTA 4XZWA 2CBUA 2DDXA 2BHYA 2FGLA 3ARZA 2J7GA 4OJYA 3SEPA 3VGDA 1W9DM 1V3LA 3W29A 1JFXA 2J74A 3MKKA 1VF8A 3QR3A 4D72A 3MS8A 1JDCA 5AC4A 1TUXA 2JIWA 4WKHA 1UYQA 2DH2A 1ZU8A 1QHPA 1EOKA 1CXHA 3GNOA 3OGVA 4AYSA 1E15A 5GNXA 1JYXA 2YOCA 1HXJA 1JAEA 4JCMA 1WKYA 1HJWA 4MNJA 3S2CA 1MVYA 4AIEA 1HF6A 2VCCA 4HMEA 1M7XA 3GXFA 4FMVA 1OT2A 1I1XA 3THCA 4W89A 3CZEA 3N9KA 4CD6A 3K46A 4J27A 1X6LA 3ZO9A 1JZ6A 3AROA 1LF1A 1OD0A 4D71A 4P7NA 1S46A 2Y8KA 1GQKA 5M5DA 2DSUA 3VDAA 4W86A 2YDQA 1NOUA 3VILA 2W63A 3AMDA 1LG1A 3T08A 2WK2A 5CSYA 1HKKA 1OB0A 2BHUA 2WLZA 2ZUNA 1JGIA 4W87A 2YA1A 2ZE0A 3FY1A 1D7FA 1UA7A 3VGHA 3W4RA 2DH3A 1V02A 5CPSA 1Q6GA 1E73M 2V3GA 4P8XA 4OKDA 3CBWA 3VD4A 2BFGA 5DO8A 1BPLB 3VIGA 3WSUA 4PMDA 1BG9A 3SCUA 2CCRA 4W88A 1FP8A 1GOKA 3UEQA 2UY5A 2JE8A 3HU7A 2AAAA 3AZSA 3WNLA 2YL5A 1WB0A 3B8SA 4J3UA 5A6BD 5ABEA 1WCGA 3BSGA 4B9YA 2BVYA 1AQHA 2OLHA 1CBGA 2IUZA 1WDRA 2ZUVA 2WANA 4L4PA 1GHSA 1KFWA 1J10A 4K68A 4H41A 2G3NA 3K8KA 5BROA 2WKGA 4E8DA 3KZSA 3QHOA 3TA9A 2OYLA 3VMNA 2WMJA 3DYPA 5GPRA 1H3GA 1UR2A 2X1IA 2WVTA 1MW2A 4HOWA 1CGXA 4U5IA 1KB3A 2YLAA 1PZ2A 3AYSA 4WF7A 3UG5A 3EDEA 1EDTA 1R87A 2RGMA 3CMGA 4LYPA 1CDGA 5DF0A 4JIEA 2XM2A 4JKKA 4QLJA 1H0GA 2XWDA 1HL8A 3OLDA 4DWSB 4LQ1A 3AMKA 4GIAA 5AYIA 4Z2IA 2XVNA 1TE1A 1E6XM 2XFFA 4CU8A 8A3HA 2WBKA 4DUVA 3A4AA 2BXYA 3DYOA 3BH4A 1MQQA 2MANA 2GFTA 4A3YA 4C7FA 1E3ZA 2O9TA 1UWUA 2QHAA 4PMOA 1W9UA 1W1TA 3LPPA 1RPKA 1KGXA 3AIQA 1MXGA 3CO4A 1OGGA 1UZ4A 3SUWA 4HZ6A 1JD9A 4UQCA 3F4VA 1M01A 1V6YA 3VU2A 4UFJA 4D6HA 4F8XA 1KBBA 4UFLA 2C8NA 4HU0A 3ZQ9A 3WD1A 3WY1A 1IZKA 1PAMA 1Q6CA 1VEMA 4KGLA 2WC3A 4WLCA 1IT0A 4EANA 2J78A 3GM8A 4PMZA 5FL1A 2DPEA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3DHU A;  2QPS A;  4EAM A;  4WSJ A;  5DMY A;  3G6L A;  2WCA A;  1JYV A;  5D8Z A;  4TVD A;  2X2Y A;  1B3X A;  4CVU A;  1GZJ A;  1IZJ A;  5EBA A;  3RCN A;  4AMC A;  4AZG A;  4BCE A;  4YPJ A;  4MAZ A;  1QNO A;  5A8P A;  3ZST A;  1C93 A;  4LX4 A;  2Y2W A;  2O9O A;  1GJW A;  4QLL A;  4M81 A;  3PZV A;  2ZWY A;  4PMR A;  4U3A A;  1O7A A;  2NSX A;  4AWE A;  1W2V A;  4P7Q A;  3TP4 A;  1FOB A;  5DFA A;  2FH6 A;  2VNC A;  2J4G A;  1ISV A;  2VUR A;  5AC5 A;  3UCQ A;  1KR0 A;  1PZ3 A;  3O2L A;  3VGF A;  1Y7V A;  3AIU A;  5BWF A;  4UQA A;  4LGX A;  2BY1 A;  3AHZ A;  3SCN A;  1EDG A;  1BTC A;  1XD1 A;  1F4A A;  2WW5 A;  3PN8 A;  4D6C A;  1US3 A;  2E9L A;  2XFR A;  4FLQ A;  5JIP A;  1HT6 A;  3VIM A;  4UNI A;  4URI A;  5D9M A;  1UH3 A;  3NYD A;  1HVQ A;  1V0K A;  1AQ0 A;  1QI3 A;  1NWR A;  3L4W A;  3L4X A;  2GSJ A;  2HIS A;  2FHF A;  2G41 A;  2GUY A;  3BAW A;  4GO9 A;  1XSK A;  5A8O A;  3VDH A;  1ZB5 A;  4CCD A;  3SCW A;  1C8Q A;  5E9A A;  3EDJ A;  1JZ3 A;  3AIV A;  1CXK A;  2WZH A;  5IDI A;  2J8G A;  2G8Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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