3WMCA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with naphthalimide derivative q2
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTLHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERFVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure-guided rational design switching non-carbohydrate inhibitors' specificity between two beta-GlcNAcase homologs
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 198
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wmcA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3wmcA01
1WDPA 1E3XA 4PRWA 2G41A 3WDPP 2XHYA 2O9OA 3PZIA 4QFUA 2J7FA 3CUJA 1XSKA 1E72M 2CHOA 2DQXA 4A3HA 4CU8A 3LMYA 3MKKA 1B9ZA 3SCRA 4MDPA 4UFLA 1EHNA 3CZEA 4H8VA 3SCPA 1I1WA 4JKLA 1HKJA 4LYRA 4D71A 3A4XA 3I3EA 3QHOA 3AHXA 1J0YA 1HX0A 2ZUNA 5JIPA 1I1XA 1J0HA 2A3BA 4ACZB 4ATDA 2CBIA 3M7SA 3GDBA 4PTVA 5JBDA 3BLPX 1JZ6A 3EMCA 1XC6A 3VD3A 2GDUA 2YKKA 1IZJA 1H0GA 5DFAA 4GZJA 3K1DA 3N12A 3U7BA 2D22A 4B3KA 4PMQA 2UY4A 3ARZA 4FLRA 2QHAA 3N15A 3K4AA 2V3FA 1CGVA 1H0IA 4BF7A 1CXFA 4QP0A 3O6AA 1PJ9A 3GM8A 5DO8A 3VIGA 4TOQA 2G3NA 1E55A 2J25A 1QI5A 2CITA 3VIOA 5I77A 4UFIA 2BV9A 3OGVA 4OOUA 4MNKA 3T0BA 1HL9A 1TA3B 1WDSA 3ECQA 5KZ6A 1B0IA 2VX5A 2VNCA 1J12A 2ZXQA 1NWUA 3KE0A 3GBDA 4E8DA 3WDRA 1J0ZA 4HZ8A 3CZJA 4J7RA 1C91A 2F8QA 2WVVA 4GI8A 3ZSSA 3ZM8A 4D6HA 1GQIA 3EDFA 1ZBVA 4QAWA 4H7VA 1BGAA 4HA4A 1XD0A 1OIFA 2D3NA 2WKGA 4C90A 1CGXA 3WQWA 4H04A 3PZ9A 4PMUA 1JGIA 1VRXA 1WDQA 4QCFA 1LL7A 1CEOA 1JXJA 4WKAA 3F5JA 3OBAA 3OIHA 2YBUA 4Z2KA 1V3MA 3AIWA 5I6SA 1GOQA 3L2LA 2E9BA 1UD3A 4RL3A 1HVQA 2ZX6A 3WD1A 1IV8A 3W37A 3VNYA 1QW9A 3PZGA 4PMZA 1J0IA 2WMIB 3A3HA 2OSXA 4J3UA 3G6MA 1E71M 3AMKA 2BHUA 3W4RA 2XIBA 3BAWA 1VEMA 4FLOA 1KGWA 1UD2A 3BLKA 3L4ZA 2CEQA 2EPMX 2VZOA 1Q6GA 3POCA 3NSMA 5BWFA 1LL4A 4LXFA 3RPMA 5BRPA 3T2OA 1B90A 1KGXA 4JFWA 4FK9A 4WK9A 1UD8A 4GZEA 1BYCA 3VGBA 5CQ1A 2VTFA 4TX6A 4DWSD 3IJ8A 2W61A 1G94A 1W1TA 2DDXA 2J7EA 4AYSA 3VIJA 1VIWA 2A3CA 2O9RA 1ISVA 2OWCA 3VOCA 2GSJA 2J79A 3NCOA 3VDAA 2OYLA 2XUCA 3VKKA 3TTOA 3VIIA 3W28A 3RM8A 1XV8A 1E1EA 1KGUA 1GZJA 1XHGA 2ZICA 1A47A 1QNOA 4YHEA 3W29A 4DUXA 2ZX7A 4M81A 4PMDA 1NWTA 4MDOA 4C7GA 1VB9A 1CZ1A 2QPUA 1HL8A 1WZAA 1EQPA 4W87A 5D4YA 1NWRA 4B16A 1JL8A 1QNPA 5FL1A 2WBGA 3MUIA 1C90A 3SUSA 3MS8A 3WKZA 1OGGA 1TMQA 3L2MA 5D8ZA 4CU7A 2ESCA 1JZ3A 2D20A 3L4TA 4W5ZA 5E9AA 1RP8A 3OG2A 3PN8A 2VZTA 3M6DA 1UR0A 2W66A 4OBRA 2ZX9A 4S3JA 3J7HA 1ESWA 1MWOA 4N0RA 4P7NA 3UERA 7CGTA 1H11A 4RE4A 3RJYA 4TUFA 2GDVA 2VVNA 1ZJAA 5A6KA 5CSYA 1R7AA 3I3DA 4W7WA 1G1YA 2WZEA 4D6DA 2EPLX 3AIVA 2BS9A 4J27A 2VURA 2PI6A 1VENA 1J9YA 1GONA 5HPCA 4UQEA 2W4XA 1GOKA 2WZIA 3OLGA 2FHFA 3CO4A 2YL6A 1TG7A 3WQ5A 1GOWA 3W0KA 1JYWA 4AXNA 1CXHA 2BFGA 3VD7A 4DWSB 1E4LA 3OZOA 1BVZA 1J11A 2W67A 3RMEA 1WPCA 1HJVA 3MMWA 4UQBA 1B2YA 4AEEA 4PTMA 2XGIA 1MVYA 1H09A 3MUY1 5BXRA 2GJPA 1ZBCA 3ZJ8A 4U5IA 4GO9A 3THCA 2NW0A 2ZUUA 2WLYA 4CD4A 4E8CA 1UWQA 4UZUA 3SUVA 5FIPA 3ARRA 1D3CA 1JI1A 3D5HA 2WBKA 3WNLA 2ZWZA 2YA2A 1E0WA 5BRQA 1TE1A 4AEFA 4HPGA 2NT1A 1V6UA 3WNNA 2EXOA 2XYLA 1PEZA 4AIOA 4KRUA 5E70A 2CXGA 5A8OA 1E15A 3BSHA 4TX8A 4GINA 3KWXA 2VQUA 1UKTA 2PWDA 1JAKA 4Z2HA 3CHFA 2ZUMA 2QMKA 3OGRA 2YIHA 1J01A 3OLIA 3ARYA 2A3AA 5E09A 2J4GA 3SUWA 3WF0A 1JZ2A 1EO7A 5DMYA 3MV11 2IXVA 3U5YA 2YDSA 3VIPA 1W9DM 1Q6DA 1C8YA 1EA9C 5I78A 1DWHM 3WUGA 3ZT5A 1B30A 1Q6CA 2WMGA 3NDZA 1TVNA 2O9TA 1J18A 1UKSA 1L8NA 3AXHA 4P7OA 3WNPA 4AZHA 4D6FA 1UR8A 2OWXA 2VZSA 2C8NA 3UCQA 2VVSA 3L4XA 3W24A 4M8UA 4AZBA 1AVAA 5IHRA 2CHNA 2CCRA 1V3HA 4OBSA 1CXEA 2WYSA 3K8MA 1TFVA 2PF0A 2OYKA 5M3WA 3DHUA 4WKFA 3ZT7A 3VM5A 2YDQA 5AYBA 1WZLA 2CNCA 3BCDA 1P6WA 5CJ5A 1GQKA 3BH4A 3GNPA 2CBJA 1ISXA 1C7TA 1KBKA 4NI3A 3VX0A 1LF1A 2J74A 4UQAA 4PCTA 4TVCA 3MSGA 3GXDA 4QLKA 1VFFA 5CPQA 1GNXA 1UD4A 2BVDA 3L4WA 4N42A 4X0NA 4KRTA 2OSWA 4P7RA 1BTCA 2GK1A 3U57A 2VZUA 2DH2A 2WC3A 1EO5A 1WO2A 1KQYA 4NRSA 2D0GA 4KGJA 1HJQA 1MW3A 1JNDA 2WNWA 1JYNA 3QHNA 3A47A 3WD2A 2VOTA 5M17A 1VBUA 3RCNA 1RP9A 3BC9A 3WFZA 3JUGA 4UQCA 1PIFA 1E4NA 3QR3A 5HXMA 2FHCA 4U2YA 1HKMA 1QBBA 1UQYA 2DGAA 3WN6A 1R87A 1JZ4A 1E6SM 2ZOXA 1JF5A 4MNLA 1GVYA 4UFJA 1E5JA 4F79A 1CIUA 1KXVA 4D6IA 2IUZA 2BVYA 1GORA 2FHBA 2UWFA 2AMGA 3K46A 1OSEA 3BSGA 1W1YA 3KL5A 3WNMA 2PC8A 1TCMA 1QI3A 5E0CA 3WQ8A 1V3JA 4MTVA 3EMQA 1XD1A 3W6MA 4URIA 1NP2A 2JF6A 1ECEA 2QF8A 4CN6A 2ZUSA 3AIRA 1E3ZA 4MB4A 1V02E 9CGTA 1D7FA 3GNRA 4MJ2A 1MXDA 3ARVA 2C7FA 4PCSA 3BXWA 3VDBA 5DT7A 1K9TA 4WKHA 3I3BA 3PZNA 4M56A 4D6CA 4J3SA 6A3HA 2X0YA 4W8AA 4JL2A 3BAJA 4W89A 5CPSA 1KXQA 1FFQA 1G9HA 3ZR5A 2BY0A 1KR1A 3ALGA 1CBGA 1W9UA 4LGXA 4W8BA 2DSVA 1JF6A 4CD6A 1LQ0A 1AQMA 4ACZA 3VIFA 3DHPA 3ZMRA 1EOMA 3AROA 4XZWA 3WH7A 1QVBA 5A8MA 1V0LA 5A95A 1RH9A 4AD2A 4UCFA 1XYFA 3WD4A 5A6JA 3E1F1 4B3LA 3G6LA 3TA9A 4X9YA 3N9KA 4OOZA 1E6ZA 1SR0A 4H8HA 1IZKA 1XCXA 1G5AA 3VILA 1W3KA 2DH3A 4H2CA 4AZ5A 5JUVA 1RPKA 2XJ7A 4P8UA 2J7HA 1TA3A 3OB8A 4CVUA 1SMDA 2VC9A 4UZSA 1JI2A 4ZENA 1E4IA 4IUGA 4JFTA 3WL1A 4DM1A 3CBWA 1W1PA 3TONA 5BYWA 2VL4A 4UOZA 3FXYA 4HZ6A 4LYQA 4D1JA 5A8NA 2XWDA 4K68A 4H41A 3CLWA 1XSJA 1HF6A 3AMLA 4HOWA 3KL0A 3FN9A 5A2BA 1CGTA 1E0XA 1UWIA 2WW5A 1US2A 2J77A 3MU7A 3MUAA 3WDJA 4GPNA 3W81A 3PTQA 2CERA 3ZSTA 3AHYA 3MMUA 1CYGA 1H1NA 1E6QM 3DYMA 4YHGA 4BCEA 1UUQA 2E8YA 4XX6A 4EE9A 4CVWA 1GJWA 1UKQA 3UR7A 2VO5A 1XGZA 5HNNA 2WMIA 1JDDA 1Y7VA 1DWGM 1JNEA 4JKKA 1E6PA 1V3LA 5ABHA 2RGMA 1UH3A 1XH1A 2E40A 1E56A 2YL8A 1K9FA 4R5EA 5AC4A 7TAAA 4Z2JA 2VCCA 2X05A 4JCMA 1PBGA 2PBGA 1W3LA 3AMDA 3CUFA 3ZIZA 1J0JA 1HP5A 4D6JA 2VR4A 3AIUA 2O92A 2E9MA 1OB0A 2E4TA 3VGEA 4A3YA 1K6AA 3ZJ7A 2XFRA 1PX4A 4V28A 4C91A 2JE8A 4AIUA 1FH8A 5EMYA 3CZLA 1CPUA 1ZBWA 1WNOA 4ZXOA 2XFFA 2E3ZA 2W5FA 3ARXA 4HU0A 1Q6EA 1CGYA 2ZUTA 4CUCA 1WAWA 2XVNA 1GQLA 2YLAA 1E73M 4AD5A 5ABFB 4J3WA 2WLZA 2RGLA 3BMWA 5DF0A 2NT0A 3APGA 3S6TA 1JYXA 5GNYA 3WQ4A 1XCWA 3WMCA 2EEXA 1H5VA 2G8ZA 4XUYA 3M46A 4FLQA 3WQ6A 3GNOA 4QLJA 1YHTA 3PZTA 3N13A 3RM9A 4UFHA 3OGSA 2EPKX 3UG5A 1E4MM 4KH2A 1UHVA 1BG4A 1CXLA 3GYCA 1VF8A 3PZMA 4MPKA 1O6IA 1NOUA 3ARWA 4EK7A 1HKKA 3WELA 2WCAA 4HP5A 1OBAA 2WVTA 3MO4A 3WNKA 4MB5A 2VRQA 3TTQA 1WKYA 4JCLA 2AAAA 3VMPA 1W9PA 3MANA 2WANA 1V03A 4UOJA 5A2CA 2BXZA 4ZE4A 4W5UA 3AHVA 2ZXAA 1EQCA 3ZR6A 1EDTA 2DEPA 5M5DA 2BNJA 5D8WA 3CZGA 3GTNA 1E0VA 5GNZA 5A8PA 6TAAA 3A6OA 1W2VA 4E2OA 1LL6A 1MQRA 2VRKA 4Z2IA 3DC0A 2XWEA 3WEMA 4U33A 2J47A 2WPGA 2D2OA 2JEQA 3NSXA 1KR0A 2GJXB 3ARSA 3AIEA 3TTSA 4CCCA 1KQZA 2CBUA 2J8GA 5A6BD 2V5DA 1BAGA 5TD4A 2UY2A 1CENA 2VZVA 4UOQA 3WMBA 1HXJA 3OZPA 1KFWA 4P8VA 1QNQA 4UR9A 1PZ3A 3GXMA 4P8XA 1V6VA 1X6LA 4WF7A 3VX1A 2Y5EA 5HOSA 3B8SA 4RE3A 1JD7A 1ITXA 3T09A 3T2QA 3UG4A 4GO8A 3F5KA 3VD9A 2WVSA 3F5LA 4HZ7A 3RDKA 4EAMA 2YBTA 1CECA 2EPNA 1UA3A 5JBFA 2WMJA 5A6LA 4CCDA 3AMGA 3WIJA 3WF1A 3CGTA 3SEPA 4ML4A 1AMYA 2XGBA 4M80A 2D23A 2JALA 4TVUA 3AS0A 1ZL1A 2ZXBA 4QCEA 4HU8A 4Q7NA 1OIMA 3BAYA 4PSRA 1BF2A 1IT0A 5LA2A 4UTFA 2D24A 1GHSA 3RM4A 2VUYA 1UKPA 1ITCA 1E1FA 3BAXA 3AYRA 2PB1A 1QHPA 3VGDA 1JIBA 3VD5A 2XM1A 1HJSA 4IPNB 2DSUA 1XH2A 2XSBA 3AQUA 5JBEA 2CIPA 2WHLA 4WIWA 4CN1A 1GQJA 5F7UA 3WUEA 5C71A 3WNOA 1AQHA 3WF2A 4GQRA 2ZX8A 4PBGA 4U5KA 1MQQA 1KCLA 3NYDA 1FP9A 1ZB5A 3WUBA 1F4AA 2O9PA 1CXKA 1BYDA 3EDEA 2JF7A 3WEZA 2CYGA 3EMZA 1ZBKA 3GH7A 4P7LA 3AMCA 4WLCA 5I3DA 2VQTA 2EQDA 3O9NA 2J78A 1U33A 3PBGA 1SFSA 2XG9A 1FH7A 4ZE5A 4AW7A 1CGWA 2V38A 1PIGA 3AIQA 5FL0A 3IANA 5CXPA 5IHSA 1H4PA 4XB3A 3FAXA 2QMJA 3AZRA 3VNZA 4BA0A 1K9DA 4MB1A 1EH9A 1R86A 3PZQA 1MFUA 3HU7A 1DP0A 3PZUA 1V6WA 4AD3A 1DEDA 1H2JA 1V3IA 3MV01 2YOCA 1CNVA 2YA0A 1X6NA 3CIVA 4IISA 1C3FA 3GXIA 1ZS2A 3VGFA 3AHTA 5D9OA 1MW1A 1QPKA 4D1IA 2DSWA 1WDRA 4M82A 2WAGA 5IDIA 4LQ1A 3WFLA 4FLSA 3EBVA 1GOIA 3SUUA 3WQVA 3KZSA 2Z1KA 2XVPA 1FH9A 4CD5A 2V3DA 2W92A 4W93A 4U3CA 1X1NA 3ARTA 1OM0A 3CMGA 4KWUA 4B15A 2YL5A 1C92A 3W6LA 3T0DA 5CPTA 3ALFA 1VFUA 5FD0A 4W84A 5A2AA 4GZIA 2WMHA 4A4AA 2BHYA 3SCNA 3IAQA 1QHOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1WDP A;  1E3X A;  4PRW A;  2G41 A;  3WDP P;  2XHY A;  2O9O A;  3PZI A;  4QFU A;  2J7F A;  3CUJ A;  1XSK A;  1E72 M;  2CHO A;  2DQX A;  4A3H A;  4CU8 A;  3LMY A;  3MKK A;  1B9Z A;  3SCR A;  4MDP A;  4UFL A;  1EHN A;  3CZE A;  4H8V A;  3SCP A;  1I1W A;  4JKL A;  1HKJ A;  4LYR A;  4D71 A;  3A4X A;  3I3E A;  3QHO A;  3AHX A;  1J0Y A;  1HX0 A;  2ZUN A;  5JIP A;  1I1X A;  1J0H A;  2A3B A;  4ACZ B;  4ATD A;  2CBI A;  3M7S A;  3GDB A;  4PTV A;  5JBD A;  3BLP X;  1JZ6 A;  3EMC A;  1XC6 A;  3VD3 A;  2GDU A;  2YKK A;  1IZJ A;  1H0G A;  5DFA A;  4GZJ A;  3K1D A;  3N12 A;  3U7B A;  2D22 A;  4B3K A;  4PMQ A;  2UY4 A;  3ARZ A;  4FLR A;  2QHA A;  3N15 A;  3K4A A;  2V3F A;  1CGV A;  1H0I A;  4BF7 A;  1CXF A;  4QP0 A;  3O6A A;  1PJ9 A;  3GM8 A;  5DO8 A;  3VIG A;  4TOQ A;  2G3N A;  1E55 A;  2J25 A;  1QI5 A;  2CIT A;  3VIO A;  5I77 A;  4UFI A;  2BV9 A;  3OGV A;  4OOU A;  4MNK A;  3T0B A;  1HL9 A;  1TA3 B;  1WDS A;  3ECQ A;  5KZ6 A;  1B0I A;  2VX5 A;  2VNC A;  1J12 A;  2ZXQ A;  1NWU A;  3KE0 A;  3GBD A;  4E8D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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