3WSUA

Crystal structure of beta-mannanase from streptomyces thermolilacinus
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
GLHVQGGRLLEGNGNDFVMRGVNHAHTWYPGQTRSLADIKALGANTVRVVLSDGHRWTRNGPADVAAVIDRCKANRLICVLEVHDTTGYGEEPAAGTLDHAADYWISLMDVLAGQEDYVIVNIGNEPWGNTDPAGWTAPTIAAVKKLRAAGLAHTLMIDAPNWGQDWQGVMRADARSVYEADPTGNLLFSIHMYSVFDTAAEIDDYLEAFVDAGLPLVIGEFGGPPDQWGDPDEDTMLAAAERLRLGYLAWSWSGNTDPVLDLAIGFDPDRLSGWGQRVFHGVHGIGETSREATVFGKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The loop structure of Actinomycete glycoside hydrolase family 5 mannanases governs substrate recognition
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-mannanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces thermolilacinus
total genus 119
structure length 300
sequence length 300
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wsuA00
1Q6CA 1R86A 1UWTA 5ABGA 2GDVA 1BLIA 1CTNA 4AIUA 2VR4A 3W29A 2XVPA 4BQ4A 2E9LA 2YJQA 3T09A 1E4MM 2X8RA 2XM1A 1R7AA 3ARZA 5FCZA 1H41A 3PTMA 3BH4A 1E6PA 2BHUA 5CSUA 2X0HA 4UFJA 1KXHA 3FHAA 4ATDA 3A4AA 1S46A 5HPCA 4AZHA 1I1WA 2EJ1A 1CNVA 2WSPA 3GTNA 4M80A 3WDRA 1NWRA 3ARYA 3LPGA 3VNZA 2UY2A 3AS3A 3W82A 1UKPA 2V3DA 4PEEA 1PZ3A 1CLXA 1H49A 1CPUA 1ISYA 4R27A 4JZ5A 4BQ2A 1E6XM 1ISWA 1K9DA 2X0YA 3VIHA 3VGEA 5JBEA 3ZJ7A 1UR4A 5DFAA 3CIVA 3L2MA 2VCAA 1GOWA 2UY4A 3OLGA 5CG0A 4UFIA 1B3YA 1CENA 2OYLA 3JUGA 4J27A 4YPJA 2D23A 1ESWA 3BCDA 4AC1X 4AZ6A 3BAYA 1AQHA 1A47A 1QI0A 2W66A 3SEPA 2BHZA 3OGVA 2WHKA 3U5UA 5M03A 4TVCA 1W3KA 3AIWA 4Y7EA 5FL1A 2VO5A 1UA3A 2ZWZA 3W28A 3CHCA 2EPKX 1C8QA 1V0MA 2A3HA 1Q4NX 4Z2KA 2WBGA 1EHNA 2ZWYA 4DWSC 3WL0A 1Q6FA 4UCFA 5A6BD 3ZJ6A 1W1YA 3AXXA 3CZGA 7TAAA 4UFKA 3CZ8A 3RM9A 3MMWA 4E4PA 3L2LA 1DWIM 1PIFA 2VQTA 1XD0A 3K8MA 2E9MA 2VC9A 2O9TA 2XPKA 3GNRA 1UD6A 3KL0A 1EA9C 4CCCA 4OKDA 2WMIB 3MUAA 1UD4A 3WD3A 3OIHA 4UQDA 2ZUTA 1US2A 2W92A 4PCSA 3TTSA 3WSUA 3WUGA 1FA2A 2DEPA 5A8MA 1EIBA 1J10A 1JG9A 1GJUA 2XWEA 4XB3A 5D9NA 1LLOA 5CXPA 4CCDA 4Z2IA 3PHAA 2UY5A 1VBRA 3WNOA 1US3A 1VJSA 2DSKA 2BY3A 3WL1A 3VMPA 5A6LA 4H8HA 4X0VA 4W7WA 3WIJA 5FKYA 4D71A 1V6WA 1OBAA 1UWQA 2DT0A 3WN6A 3L4UA 1ISXA 5LYRA 4X0NA 3AISA 4WK9A 3BAJA 3AJ7A 5CLTA 3N1AA 1XH1A 4U5IA 3SCUA 5IXEA 5AY7A 5I79A 4Z2LA 4C7GA 1E4NA 2ZUMA 1C8YA 3LPOA 2WHLA 5BRQA 3DC0A 1XD1A 2J8FA 3WH5A 1E6NA 1QOXA 1H1NA 3WH8A 3IJ7A 1WPCA 2ZE0A 1OD8A 3AHVA 3CMJA 5D9MA 1V03A 3KEHA 4F66A 2G8ZA 5A8PA 2XIBA 4AD2A 4HA1A 5BRPA 1UZ4A 2WC3A 2GJRA 2WPGA 2V3EA 4BZYA 4JL2A 4W89A 1W9VA 3K8KA 2A3CA 4S3JA 3WQ5A 1DHKA 9CGTA 2YL5A 1PPIA 3VIPA 2FGLA 4MJ4A 1PAMA 2D3NA 3RMEA 1NOWA 4LPCA 3FW6A 1KXVA 4AEFA 3K1DA 4RE2A 1LG2A 1GNXA 3WFZA 2XG9A 4LYQA 3WELA 1J11A 4CU6A 3TA9A 3ARTA 5EB8A 1UKQA 2PWHA 2CCRA 4MPKA 1EO7A 2DGAA 3RDKA 2NW0A 1W9PA 3SUTA 4EE9A 1UR1A 1TE1A 2YKKA 4OJYA 3SCRA 5ABHA 3DYPA 2OSXA 3J7HA 4AZCB 4BS0A 1ZBKA 2XWDA 3GYCA 1OWQA 4HOXA 1MFVA 3CHEA 4QLJA 2ESCA 3ZJ8A 2XIIA 1GOKA 3B9DA 1CDGA 3SCOA 1KCKA 1ZBWA 1JZ2A 4TTGA 4KRUA 1SMAA 5FD0A 3RO8A 2WM0A 2WVVA 1LL6A 1G94A 4AD1A 4AD3A 3GDBA 4CUCA 4CCEA 4CU7A 3BSGA 2VURA 1E1FA 1JI1A 1WKYA 3VD4A 1BQCA 4PSPA 3N17A 4HA4A 4PMVA 2GJXB 4PTWA 2W61A 5A8QA 1PX4A 1PJ9A 1JI2A 4QLLA 5EMYA 2DH3A 2W5FA 1KXTA 4WLCA 1PZ2A 1EQCA 3CUGA 2ZUNA 1G0CA 4LGXA 1MWOA 2V3GA 2JIWA 3WQWA 3ARSA 4MNLA 1HNYA 4C7FA 4JHZA 2J25A 1W3JA 4HPHA 4JL1A 1UR8A 5ABEA 3A6OA 3LPFA 3CUIA 1UD8A 1B3XA 3EDKA 1R8LA 5GNYA 4HP5A 2VI0A 5E9AA 4ACZA 5A2CA 3RCNA 3PZUA 2VNCA 3I3BA 1NOUA 2A3EA 4J3WA 6A3HA 3AHXA 3AIVA 3U7VA 3BC9A 2GJPA 4RL3A 3T2PA 2IUZA 2DT2A 2PBOA 1UWIA 3WMBA 1C92A 1U2YA 4AWEA 1DWGM 4FLOA 4P8XA 1HN1A 1E3ZA 3WDPP 3BCFA 1SMDA 5A2BA 2PI6A 4B3KA 1JF6A 5C70A 1UWSA 2OWCA 4OUEA 5ECUA 1RD6A 2X2YA 4AY1A 3M7SA 3WEMA 3WH6A 5CZKA 4D6EA 2OYMA 4CD6A 5DT7A 2CYGA 3WNLA 4D1IA 1E0VA 3AI0A 4UFHA 1LF1A 1GQIA 4J3UA 2JEQA 1TA3A 3AQUA 3WEOA 3FHQA 1IV8A 1W3LA 3CLWA 2DPEA 5JIPA 2J7EA 3WNNA 5A6JA 1NM9A 3SCSA 3WENA 4MAZA 5ABFB 2VX4A 2XFFA 3VGFA 3CO4A 3VM7A 5A6KA 1W9UA 2BHYA 4W8LA 3W37A 3ZSSA 2EPMX 1C3FA 5A6AA 4AD4A 1XH2A 3PZMA 4H04A 1BAGA 1BYBA 1JZ3A 1ISVA 1FHLA 4MB3A 4D6FA 3AXHA 2J7FA 1B31A 2DSVA 3IAPA 1V3MA 2VTFA 1OT1A 1U33A 3AFBA 3AYSA 3ALGA 1JYWA 2ZX9A 3VGDA 3ECQA 2YA2A 4N42A 1FHDA 1V6UA 3IK2A 4EAMA 5A94A 5I0DA 2BXZA 4MADA 1KR1A 4J7RA 3PTKA 5AC4A 2E9BA 4KGJA 3CH9A 3PZGA 3GXDA 1XYZA 2WZIA 3WFLA 1QW8A 3L4YA 1CBGA 3POHA 4PSRA 3RPMA 3BAXA 1V6XA 4J3XA 4TVDA 5LA2A 4HMCA 3O9NA 1NARA 2WVSA 2VMFA 3EMQA 3EYPA 3IJ8A 2E4TA 3APGA 1VFMA 1VIWA 3L4ZA 4LYRA 1RP8A 2WKLA 1OSEA 2Z1KA 2JIEA 3BXWA 3A4XA 2BY0A 3F5LA 1E56A 4XX6A 4MB1A 1HP5A 1UZ1A 2ZUSA 4EK7A 1FH7A 1UD3A 4AZ5A 4Z2GA 4W5UA 3WNMA 3T0AA 4QLKA 1WAWA 2WNWA 2AAAA 3AZTA 3S6TA 5IFPA 1BGAA 3WF3A 2ZXQA 2CKSA 4KRTA 4PMYA 5BCAA 2YIHA 2O9OA 1WCGA 1GOQA 5CPSA 1E5NA 4PTMA 3VUPA 1IZJA 2J8GA 2J4GA 3ZM8A 5AYBA 5I78A 3T0DA 3GH7A 3CBWA 1OCQA 3VGBA 2CNCA 3AMGA 2V3FA 4EANA 5EBAA 4GI6A 1ODZA 1GQLA 4CN6A 2WZHA 5KZ6A 1JZ4A 2VL4A 1WDSA 1C93A 4JKKA 2J79A 3DECA 3EBVA 1BVZA 4NRRA 3WH7A 3VINA 5I5RA 2TAAA 2WZEA 4QP0A 3B9EA 2CERA 4MB5A 3RJXA 3F5KA 4OIFA 1E3XA 2QHAA 1E0WA 1SYTA 4PMDA 1TCMA 4JHOA 1K6AA 2ZOXA 3AS2A 3FY1A 1QI3A 3WQ4A 4JFWA 3EDEA 3ZO9A 1CECA 5AYIA 1FH8A 4JIEA 2IXVA 4CD8A 3SIMA 2XHYA 4M81A 1QNPA 3VDBA 3CZJA 1XC6A 3VMNA 1WB0A 4V28A 2CESA 2J75A 3GM8A 5I24A 4D6GA 2GUYA 5IHSA 3DYOA 2YA1A 1JNEA 1W9DM 1LL7A 4QAWA 1B0IA 2G41A 4P7OA 4AEEA 1BVNP 3BGAA 1GOOA 4J3TA 4F9DA 1JYVA 4AD0A 4XUYA 3MO4A 2BFGA 5HPOA 3SCQA 4OOUA 2C7FA 1HKMA 2XFRA 3DHUA 1VRXA 1RP9A 1CXFA 3VIFA 3L4WA 1MXGA 2ZXBA 4E2OA 2ZIDA 3ARQA 1VAHA 2XJ7A 1V3IA 1IZKA 1B90A 2WMHA 3MMDA 4XZBA 4ZFMA 1VEMA 2G3NA 3W6MA 3AMKA 1JZ6A 3ZQ9A 2WC4A 3AXIA 4QCFA 1W1PA 2DQXA 4MTVA 1QI5A 3L4TA 4TTUA 4CD5A 2W91A 1D2KA 2RGLA 4W93A 5E0CA 4PTVA 1H2JA 3W38A 2QPSA 1W3HA 4GO9A 3WD4A 1KGXA 3VX0A 3CMGA 1Q6GA 1BG9A 1OIMA 5I3DA 1JZ8A 1BYDA 1JD9A 3WF4A 3LPPA 1KXQA 4TX8A 1VEOA 2WVUA 1J0KA 1DP0A 1VEPA 5M5DA 3AIQA 1MXDA 2DDXA 2EPOA 3N18A 5A6BA 3N11A 1M53A 4TX6A 1XSJA 1UKTA 4MB4A 3TTQA 4Q7NA 5JUVA 4UOQA 1FFRA 4ZXOA 2E8YA 3UERA 1MQQA 1J9YA 5A6SA 3PBGA 1W32A 1L8NA 1QNSA 1J0HA 1E15A 4K68A 4MDOA 1E71M 2XVKA 4IPLA 4MNJA 4HU8A 3AZSA 4DM2A 2FGZA 1J0YA 2DT3A 4J3VA 3ZR6A 2VRJA 4HOZA 4H41A 2FH6A 5HBFA 2WVTA 1JAEA 1UWRA 1GUVA 1KB3A 4B16A 2WVVB 4W7VA 1VF8A 3PZQA 3L4XA 2YBUA 3SUVA 1MW3A 1H3GA 4M56A 2ZXDA 5A95A 2J47A 3TTOA 2VVSA 3OGSA 2F61A 2G4FA 2YDSA 3PN8A 2PWGA 4U2ZA 3B9AA 1HJSA 3TOPA 2EXOA 3HJEA 3MUZ1 2JEPA 1W1VA 2WK2A 3AS0A 2YLLA 1LQ0A 3RJYA 1WO2A 4KH2A 1HKJA 1TVPA 3NDYA 2C8NA 1J0ZA 2WSKA 2XTKA 3BLPX 3ALFA 5I77A 1MFUA 2OWXA 1JZ5A 2J7GA 3UG3A 5E6ZA 2CBUA 3VD3A 3PZOA 1BYAA 1AMYA 1MVYA 4P7RA 1DWJM 5A3HA 3N9KA 4JFVA 2WMGA 1JZ7A 3VIIA 1H5VA 2VZUA 3ARXA 1WP6A 1JYXA 4S3KA 1LL4A 1J18A 4PUEA 4ACZB 2NT1A 3ZT7A 1GHSA 1B1YA 4XV0A 2VZTA 2CHNA 2VZOA 4PUDA 2D0HA 2WBKA 1R85A 3N04A 1GORA 1HJQA 2WCGA 1KQZA 4W84A 1XGZA 2HISA 3ZOAA 3WD0A 1V0NA 3AHTA 1VJZA 2DSUA 3UESA 4CKQA 2PF0A 2ZX6A 5EFDA 4BQ3A 3WQ6A 4BCEA 2XSAA 2YLAA 3ARUA 5GPRA 3PTQA 1VBUA 1OINA 1ECEA 4U3AA 4UFMA 4WKHA 4Q22A 4P7QA 3ARRA 1C91A 1FOBA 2CPUA 4C7DA 1B9ZA 4CVUA 3OZPA 3OG2A 3T08A 2DIJA 4R5EA 2ZX8A 3MUIA 4Z2HA 3M6DA 3L4VA 3ZSTA 2ZUWA 2QV4A 1TA3B 1L0PA 2UY3A 3GNOA 3PZIA 5I2UA 4ML4A 4PMNA 1KWGA 1RPKA 4GINA 2A3AA 4ZE4A 4MJ2A 3PZ9A 4TVUA 1CXLA 2B31A 1CXEA 3G6LA 1G9HA 2GK1A 4CU8A 1CGXA 3BAIA 3DHPA 3II1A 3IANA 5BYWA 2CEQA 2VR5A 1GOIA 4P8WA 3ARVA 2PWDA 2XVGA 4WIWA 4P8UA 1JDCA 4TUFA 2PB1A 5GNZA 3NUKA 3T2OA 3UR7A 1NH6A 1NWTA 3UG5A 1H11A 5IFTA 2YOCA 2Y8VA 2QLYA 1BG4A 3WD1A 1XSIA 1E40A 2W4XA 7A3HA 4PCTA 3CPUA 2VX6A 1O7AA 4EKJA 5DMYA 2FDMA 2OYKA 3ZT6A 1CXHA 4JCLA 2J78A 3AIEA 1MW0A 1V3JA 4OOZA 2X05A 2PC8A 4W5ZA 1TG7A 4CD7A 4P7LA 3O6AA 1WZAA 3GZAA 4N0RA 1EDTA 1Q6DA 4UQAA 3U7BA 3VO0A 4JKLA 3FN9A 1AVAA 1WNOA 3MMUA 4LQ1A 1M7XA 2ZICA 1TUXA 2W62A 1M04A 4QFUA 5CGMA 1EDGA 2F2HA 3VGHA 1H09A 4TOQA 1F4AA 1J12A 2J7DA 2BS9A 1E43A 2E8ZA 1VB9A 4CVWA 5JBFA 1CGWA 1TFVA 2IXUA 3S2CA 1PBGA 1JL8A 2Y8KA 4M1RA 4RE4A 2YL8A 3CUFA 4J28A 1ZJBA 1OB0A 2FHBA 3KL5A 3NSNA 5A69A 4A3HA 4NZCA 4B15A 2VJXA 3T2QA 4BF7A 1VFOA 5FIPA 3FAXA 3WEZA 3WKZA 2JALA 4D6IA 2G3JA 1W9XA 2WCAA 4H2CA 1FFQA 3NIYA 4DWSB 2CITA 2WW5A 1CEOA 4JAWA 1BTCA 4BQ5A 1UOKA 3IAQA 2WWCA 1E0XA 8CGTA 1N82A 2PBGA 4GZEA 3AIBA 2G3IA 5TD4A 3ZJKA 3GH5A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1Q6C A;  1R86 A;  1UWT A;  5ABG A;  2GDV A;  1BLI A;  1CTN A;  4AIU A;  2VR4 A;  3W29 A;  2XVP A;  4BQ4 A;  2E9L A;  2YJQ A;  3T09 A;  1E4M M;  2X8R A;  2XM1 A;  1R7A A;  3ARZ A;  5FCZ A;  1H41 A;  3PTM A;  3BH4 A;  1E6P A;  2BHU A;  5CSU A;  2X0H A;  4UFJ A;  1KXH A;  3FHA A;  4ATD A;  3A4A A;  1S46 A;  5HPC A;  4AZH A;  1I1W A;  2EJ1 A;  1CNV A;  2WSP A;  3GTN A;  4M80 A;  3WDR A;  1NWR A;  3ARY A;  3LPG A;  3VNZ A;  2UY2 A;  3AS3 A;  3W82 A;  1UKP A;  2V3D A;  4PEE A;  1PZ3 A;  1CLX A;  1H49 A;  1CPU A;  1ISY A;  4R27 A;  4JZ5 A;  4BQ2 A;  1E6X M;  1ISW A;  1K9D A;  2X0Y A;  3VIH A;  3VGE A;  5JBE A;  3ZJ7 A;  1UR4 A;  5DFA A;  3CIV A;  3L2M A;  2VCA A;  1GOW A;  2UY4 A;  3OLG A;  5CG0 A;  4UFI A;  1B3Y A;  1CEN A;  2OYL A;  3JUG A;  4J27 A;  4YPJ A;  2D23 A;  1ESW A;  3BCD A;  4AC1 X;  4AZ6 A;  3BAY A;  1AQH A;  1A47 A;  1QI0 A;  2W66 A;  3SEP A;  2BHZ A;  3OGV A;  2WHK A;  3U5U A;  5M03 A;  4TVC A;  1W3K A;  3AIW A;  4Y7E A;  5FL1 A;  2VO5 A;  1UA3 A;  2ZWZ A;  3W28 A;  3CHC A;  2EPK X; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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