3ZFHA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
467
structure length
299
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Pseudomonas Aeruginosa Inosine 5'-Monophosphate Dehydrogenase
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE 5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus 101
structure length 299
sequence length 467
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3zfhA00
4LC6A 2QJGA 3R8RA 3BGGA 1GVFA 4GFSA 3E49A 3PBYA 3IIPA 5I3KA 3LHUA 4AB4A 2QCNA 1K8XA 2Z6IA 5BW6A 2CLIA 3W73A 1O94A 1JJKA 3EWXA 3CEUA 4FIQA 4BFAA 1F5ZA 1ZJIA 1T8XA 2ATSA 4O12A 2X30A 5CPNA 1IXQA 1H7XA 3PB2A 4JTJA 4Z1BA 3MP4A 4Z1CA 3IV3A 4NJIA 1N7KA 5TQLA 1G67A 4LW7A 4XZ9A 3P8IA 3LCWA 4BWLC 1LORA 4J9JA 2ZZ1A 1SZEA 2VFIA 3CHVA 2Y63A 4JYFA 1WAUA 3GDMA 1H7PA 1IXPA 4UTMA 3NPXA 4O15A 3W7GA 3IGXA 2E1DA 3USBA 1ONRA 2ISVA 1QAPA 4RXFA 4LVDA 1A5AA 3LHZA 1X1ZA 2Q3RA 3Q94A 1P0KA 3CTLA 3L65A 3NQAA 3LBMA 5D30A 3UXAA 5DXXA 1T99A 4N4PA 3LCIA 4M6QA 4MY1A 3NXFA 2FTPA 2A0NA 3LHTA 3WJSA 3TJXA 1VCGA 5F2LA 3HG3A 5F4XA 4UUIA 4JX6A 1ICQA 3W7NA 2J9YA 2ZYFA 1KV5A 2WQPA 4QJ1A 3EWYA 4IXXA 3FFSA 1KTBA 3AO0A 5A5WA 1PHQA 3G3DA 4N4QA 4UR7A 4UTTC 2H90A 1LBLA 3TXVA 3W1PA 1DQXA 3L0NA 2CLEA 1SSGA 1O4UA 1F74A 2ABBA 1VS1A 4RX0A 3G1FA 1YDOA 3NM1A 4AH7A 1UUOA 3QFEA 4KWWA 3W2NA 3PUOA 1H5YA 2CLOA 3W1LA 2Z2UA 1RD5A 1KM6A 4X2RA 4JTGA 4AF0B 4UNKA 3HGJA 4M19A 3W9ZA 3NPVA 3M5XA 2YX0A 3EKLA 4PEKA 4EVZA 3QQ0A 3PAJA 1GZGA 2XN2A 4EF9A 4RR4A 1YDVA 5IM51 4FB7A 4IX2A 4FXSA 3CC1A 1PCKA 4O0KA 2W79A 4KFOA 1WBJA 3M1ZA 4RJEA 5F2GA 4YCPA 4ZZ9A 2NXGA 1FWWA 3THAA 4ONVA 4UIOA 3W7DA 4EIVA 4E2DA 2VXNA 4H6KA 2NXHA 2RFGA 3W76A 4N02A 1KLYA 4FNRA 5G1YA 1OF6A 1VCFA 2ZBTA 4FX7A 3BW3A 1U83A 2X1TA 3DI1A 5E93A 2QJHA 2ISSA 4MZ1A 4QNWA 3BG3A 1H63A 4IQLA 1GYNA 2WSRA 3ABRA 5AFDA 4NQ1A 3IIOA 4TO8A 5CKSA 3W88A 3FIGA 3T40A 3EX2A 3QRHA 1IIGA 3DH7A 3G0UA 3B4UA 4CQ9A 4ZQRA 5C2XA 1P5BA 3MP3A 1UB3A 5L6UA 3KVKA 3LCHA 4IX0A 3HB9A 1WYIA 1LM1A 4YWIA 1V5XA 5FF7A 4HNTA 4NX0A 4NX5A 5I3HA 3C4UA 3DFSA 3EX1A 3GIYA 5C55A 2CZFA 1F2JA 3R12A 1Q6OA 4O28A 4P61A 2NUWA 3L66A 3W6YA 2AQWA 3QMRA 4OU1A 4NNAA 1F7BA 4KFNA 1ZHAA 1EB3A 3W07A 1W56A 3FJ6A 4JYDA 4UFJA 1MXSA 4N6FA 4A21A 1ME9A 1AL8A 4A3UA 5I3FA 2QCLA 4IUOA 2P1FA 4EF8A 5KZMA 3PULA 4JGDA 2ZRXA 1QO2A 3E9AA 3MBFA 3OBKA 4HNNA 2BWGA 2G5WA 4L4LA 2CU0A 1PVNA 5A8GA 4K38A 3C0JA 5IBXA 2PURA 1SO5A 3TU9A 3I7SA 5ABTA 1XCFA 2TPSA 2CLHA 2V5LA 4NNBA 1R30A 3P8JA 4N9EA 3E0IA 3NEVA 2EAWA 3HG4A 1FUYA 2F84A 2YYUA 5HR6A 3M5YA 1JULA 1ML1A 4LS1A 5LKYA 3PUEA 3E96A 4IPIA 3SSJA 4HPXA 3TMLA 1VYSX 3LLDA 3U6WA 4OV9A 3A21A 2X2GA 3HPXA 1P4CA 4LVBA 1KW1A 3UZJA 1MZHA 3AJXA 1S3HA 1VYRA 4UTHA 3A22A 2NX3A 3H54A 4Z1AA 2ZFAA 3NM3A 5CG7A 5K4XA 4DBEA 4LRTA 2GOUA 4BI7A 4N2YA 1QPNA 3P84A 4XKYB 2DP3A 3UWQA 4G1KA 3FJLA 1X8FA 1LYXA 3GYEA 3M41A 1N55A 3NQVA 5HMSA 3W83A 4DO4A 4K6AA 3NG3A 3ELFA 3TQVA 2Y7GA 3TV8A 5LGZA 4JTEA 2QEZA 2VKZG 1KA9F 5AYZA 1M5WA 1HL2A 1PL9A 1FWSA 3A9IA 3W7IA 5T26A 2VFDA 4MFEA 3ZR4A 3BO9A 1E51A 4CQAA 3TH6A 5AN7A 1C9DA 2BZNA 1R2RA 3TQ0A 3EWUA 4ZVJA 1LDCA 4PC8A 4DQWA 1ZAJA 1OYCA 2Y6ZA 3G1YA 4PCFA 5LSMA 2DZVA 2NWRA 2VFEA 4TIMA 5BMWA 1VHNA 1FCBA 2RH9A 1DQWA 3NL3A 4JTHA 2QJIA 2O7SA 4JTTA 1GEQA 1LLZA 1QOQA 5AYYA 4JY9A 3TK7A 2WNZA 3C61A 3DENA 2NWSA 5GVJA 2ATMA 2Z0IA 3GDLA 3TCEA 2E5DA 1L6YA 1I2PA 3B03A 5U4NA 1Z44A 3OVRA 2WKJA 1U5JA 4LNYA 2ZTJA 3PY2A 3RU6A 2XFWA 3EX4A 1D3HA 2VEPA 4LOCA 2FB2A 4Z0SA 1NSJA 3GVGA 3N3MA 3TIMA 1NF0A 2NX1A 2YYTA 3T4CA 3QPZA 4WD0A 4MLRA 4OWGA 2CLFA 1OG0A 5D2YA 4DPPA 5LHFA 2DZPA 1EUNA 1H51A 1FCVA 4GC4A 5CPMA 4GRSA 2FIQA 2ABAA 3S1XA 4UTWC 3W75A 3OVPA 4O13A 3WFAA 3MBDA 5I3GA 1KFLA 3M43A 3SW6A 1YTDA 3RF9A 4FNSA 2TYSA 4GE8A 3W7OA 3HPSA 4XQ6A 4NJJA 1FY6A 3RNDA 1H7NA 3UD6A 1G4SA 5EPDA 1H7OA 2ZZ6A 3PB0A 4Z08A 3CEPA 3NPWA 4WQ6A 1BEUA 4UTWA 3HIJA 3C2EA 2QCFA 1L2UA 1QWGA 4O1AA 5E0KA 3DFTA 4ZMGA 1TV7A 2XN1A 2ZDRA 2V5BA 3IVSA 2ZA2A 2CZDA 5KINA 1IIHA 3W2LA 2ZZ5A 5AB3A 4WOZA 3HMJG 1OX4A 1R2TA 3DXIA 3FLUA 3L5MA 3TAKA 3EXTA 2DU2A 3QJAA 2NUYA 3UWZA 4DF1A 1HTIA 2GVLA 4FO4A 4DPQA 3G1HA 2YW3A 3CB8A 1FWNA 5FEXA 2GVGA 3MP5A 4HIBA 1VRDA 1I8JA 3VFLA 4AXKA 2NLIA 3MW7A 2B4GA 4XBSA 3UPBA 2JBMA 2GJLA 2W0UA 1ZY9A 4FEZA 4I7VA 3VCRA 3HOJA 1XDLA 2CW6A 2VEIA 1KBIA 3NZ1A 4YCOA 2OT1A 4QAIA 5D38A 5DCEA 3LRKA 1EP1A 4UTKA 3DU0A 1H1YA 3H55A 3JR2A 5C6MA 4MKNA 4PTNA 3A5FA 5DXYA 3TAOA 2QCCA 3L5AA 4LTSA 5K2ZA 4U4MA 3G1XA 5MHBA 4RV8A 3S5NA 1BKSA 2PRHA 3LCXA 4O0ZA 2B7NA 2TMDA 3O06A 3FYPA 1H60A 1JVNA 3P74A 5K3VA 3VE9A 1H7WA 4RKAA 1FXPA 5TIMA 3LXAA 2YXGA 4JS3A 3C2RA 1TIMA 1YPFA 1VQTA 4WOQA 3UWVA 4JTLA 3RMJA 1ICSA 1DJQA 3W7HA 3I7RA 1MEIA 3O07A 3W2UA 2VFHA 3LXCA 5D04C 4GJ1A 3TC7A 4WUIA 1TSIA 1SW0A 3LXBA 3PR2A 1SSDA 1XM3A 4EOUA 1KTCA 2KZHA 3KVLA 1R2SA 2EKCA 1ME7A 2CWNA 3TW7A 1GOXA 2ZZ3A 2B7QA 3O05A 1OABA 5AC8A 3PF3A 4JX5A 1QCWA 1QR7A 3SI9A 2Y85A 1T0OA 1A5SA 1KFEA 1VCVA 1I45A 1UCWA 4JTKA 4A2SA 2A21A 3NR0A 2ZCGA 1GQNA 4Y96A 2FB3A 3BG9A 1V7YA 3IIVA 3QQ1A 4I7UA 1VLIA 2CZEA 5D03A 3SIZA 3R2GA 4UTUA 3NL5A 2E68A 2ZRUA 5DLCA 3BV4A 4GUFA 3EWWA 1W0MA 2VFFA 4H3DA 3LDVA 5AYXA 1ADOA 1PE1A 1G7VA 1SO4A 4LC8A 3SFKA 1H1ZA 4PFMA 1GPWA 1OFBA 1VJIA 1TTIA 4O53A 2HSAA 3W1AA 1BWLA 4HSNA 1OFDA 3W2JA 3MUXA 4NT0A 3UYCA 2E77A 1SZFA 4FXRA 3QZEA 2VC6A 3LERA 3H53A 2C14A 3G8RA 3V75A 3KX6A 2DZXA 4BWLA 3BW4A 3MO7A 1F73A 1R47A 1TB3A 2WPBA 4JTIA 1DVJA 1TPWA 3ZS4A 1YTKA 1B3OA 1PCWA 1AW2A 3BW2A 5HWMA 1JCYA 5G2HA 3S0CA 3CIXA 3WK2A 3O6YX 3DKJA 3C2OA 1OFRA 1P0NA 1KFBA 2QUVA 3R89A 3UZ5A 4CCCA 4GUJA 4MZYA 3GLCA 1IF2A 3QC3A 1JCLA 4IWWA 1NFBA 5HJLA 3A23A 2HMCA 4I7WA 1TPC1 3FOKA 3W2MA 2RDUA 2W6RA 4CNOA 2J24A 5G1TA 4O1DA 4FIRA 4MY9A 1QPQA 1GVQA 3G1VA 5F2MA 3SR7A 3DHFA 3NL6A 3E02A 4LVFA 4MIMA 3QF0A 4K7YA 4QISA 1PV8A 4KFPA 3LCGA 1ZFJA 1AMKA 1DL3A 3R13A 2YSWA 3CPRA 4R33A 6ALDA 3M16A 3NQFA 5K9DA 3QW4B 4DO6A 1X6UA 4UTTA 4JDYA 5HUPA 3GR7A 4UMBA 4LUJA 1JCNA 1LZOA 1M7PA 1RV8A 1YDNA 5G5IA 3KFTA 1O5KA 2FLIA 1I2RA 1XBZA 4C1LA 2H8ZA 2R8WA 4OV4A 3S5ZA 4O18A 1S5TA 1SR9A 3UY8A 2Y7FA 3TKFA 2A7NA 3KHJA 1SO3A 4R53A 3WK3A 1LRTA 4MJMA 3EX6A 1AL7A 2V9DA 2Y89A 5D2TA 1UUMA 2J27A 2YW4A 5EKYA 3RK8A 3CQ0A 4WX2A 5AHNA 4UFLA 1GTEA 2FDSA 1OHLA 4AF0A 1VH7A 3QPYA 2QCEA 1I4NA 3NL2A 1QMLA 2V2HA 3A24A 3LRLA 1JCJA 1W31A 5I3JA 2ZZ7A 2NZLA 4YXGA 1Q6QA 1A5BA 4QNEA 4WY0A 4O8RA 5D09A 1EPXA 4BR1A 1BTMA 4K36A 2V81A 3NDOA 4Q32A 2A2IA 4AWSA 1QDSA 2FFCA 5BNKA 1DBTA 3LTPA 4NXKA 1OJXA 2LLEA 5DCBA 2C13A 2D73A 4WY0F 2YZRA 1QOPA 2DZTA 4Y9AA 1O5XA 2E09A 2WJZA 3GNNA 4UMCA 1TTQA 3NQCA 3WJXA 5DBTA 1WOBA 2JGQA 4TMCA 1DOSA 3W74A 5FF0A 2V2DA 4OBTA 1W3TA 3DI0A 3R5EA 5CZTA 1QNVA 1FQ0A 2YGYA 3OEXA 3UWUA 1VLWA 4JR5A 2YFOA 3GXPA 2Y88A 4PA8A 4W9TA 3P62A 2FQIA 1Z41A 2NV1A 5BMXA 4LWWA 1CX9A 3NGJA 3RLVA 4Y90A 3HJZA 1O60A 1UASA 1LOQA 3BK0A 5F2IA 1KM3A 2WV8A 4M6VA 2ISWA 2X1SA 1YYAA 1H50A 1IXNA 3SJ3A 3CIWA 4LY8A 3NVTA 3G8EA 5J5RA 3OG3A 5AHLA 3O6CA 1SFJA 1SW3A 1TPB1 1M6JA 3W70A 3GK0A 3W87A 1W5PA 4LV4A 2TRSA 3O15A 3ZWSA 1A50A 1LLWA 3BPWA 4H4IA 3RFAA 3LCLA 4FF7A 3GZ3A 3N2XA 1H61A 1TQJA 2J6XA 2QAFA 1KM1A 3Q37A 5KITA 2E6AA 4K8EA 1EX5A 3GB6A 4M6PA 2V2CA 1UJPA 2QCGA 1WQ5A 1K02A 2B7OA 4K39A 4NZJA 3TSMA 3BARA 4O14A 3EKZA 3M0ZA 2PCQA 4HPJA 1W54A 2WNQA 1EIXA 3CT7A 1I2OA 1XXXA 2E6YA 4RK8A 3I7QA 3NYZA 3LTSA 7TIMA 4GNJA 3WK0A 2YDAA 5LNUA 2NXIA 3MYPA 1AW1A 2TSYA 4K8HA 3NNTA 1DORA 3W7JA 4CQ8A 1SQ7A 4ORMA 3LHVA 1VGAA 2G97A 4JY8A 3DKLA 1LOLA 1TJRA 3F03K 2ZRYA 3W1TA 3I6RA 1OFEA 3IIZA 4OQVA 2DZSA 2P0OA 3ZFHA 4D2JA 4WXZA 2Q8ZA 4HHPA 1VZWA 1VR6A 2ZRZA 3W71A 3F4NA 1KM0A 2YCEA 3P67A 1RZMA 3KRUA 3MYOA 2FPYA 3O1NA 4EWND 3EXRA 3STEA 3N14A 3SY5A 3T55A 3EXSA 3FKKA 4Y8FA 3M44A 1FWRA 2V82A 4NU7A 5TBOA 3RLUA 2C19A 2A6LA 5CZSA 3M5VA 5U7SA 1TTJA 3KRZA 1SO6A 2A7RA 4RXGA 4UFHA 4S2CA 3LB0A 3I65A 2Z1BA 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 4O50 A;  3OA3 A;  4GWE A;  1HO1 A;  2DJX A;  3GDK A;  4XTD A;  2H3D A;  4N9D A;  5CSS A;  4DO5 A;  3G24 A;  3O63 A;  1TYG A;  1PII A;  2QR6 A;  3ABS A;  1LCO A;  4O1B A;  2QDH A;  3QEZ A;  1W5M A;  2JK2 A;  5CPO A;  2BXV A;  5LNW A;  2H6R A;  4Y6G A;  3DFP A;  3IGU A;  3EX3 A;  2CLK A;  2C16 A;  4IPJ A;  1DHP A;  1JUE A;  4BI5 A;  3CU2 A;  3CM4 A;  3F1Q A;  3HGR A;  2UV8 G;  3MI6 A;  1JQX A;  1XUU A;  4IME A;  1LRN A;  2B7P A;  3UWY A;  2NX9 A;  3L9C A;  3HGO A;  3PUD A;  4QSH A;  1OFP A;  5DY3 A;  4O4W A;  4JN6 A;  2X1R A;  3LLF A;  3W7C A;  5D37 A;  5FEZ A;  4O11 A;  4OGZ A;  1F76 A;  4DBD A;  3G18 A;  4ORI A;  3HO8 A;  1HFB A;  1ZCO A;  1J5T A;  1I2N A;  1YAD A;  5HIN A;  4XWU A;  4OE7 A;  4MFD A;  4MYX A;  4WJE A;  2QCD A;  3C8F A;  3GR8 A;  2A85 A;  5HUO A;  1WDW A;  2BLE A;  2DOR A;  2QKF A;  1XDM A;  2VEM A;  3QMS A;  4FNQ A;  4NXS A;  3BLF A;  3W7P A;  3LV5 A;  5HWJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JD7 A;  4LC6 A;  1CEO A;  4J3T A;  3R8R A;  1R86 A;  3BAJ A;  1WKY A;  3E49 A;  3IIP A;  3VC5 A;  2D23 A;  3WNN A;  3CXO A;  3L4Z A;  1PZ0 A;  4IGM A;  2QCN A;  3PN8 A;  1AD1 A;  3M0Y A;  5C9R A;  4OBR A;  3VDH A;  3W73 A;  2D2G A;  2C8N A;  1JJK A;  2FVK A;  4FIQ A;  4BFA A;  1ZJI A;  1T8X A;  2ATS A;  2E25 A;  1IXQ A;  1H7X A;  3ID7 A;  4Z1B A;  1VPY A;  4HTB A;  4NJI A;  2BS9 A;  1NAR A;  4DWS B;  2ZAD A;  1YNY A;  1VFL A;  3CHV A;  1IWB A;  3OZO A;  3SO7 A;  1U22 A;  1H7P A;  1Z9A A;  3JUG A;  2E1D A;  1IZK A;  4LEQ A;  1RA0 A;  2XU2 A;  4UOZ A;  1P0K A;  3WQW A;  5AKQ A;  3NQA A;  3B9E A;  3UXA A;  1T99 A;  3S83 A;  4N4P A;  5ABG A;  3LHT A;  1GGO A;  1EO5 A;  1Q85 A;  2P3E A;  1QPK A;  1QNP A;  3HG3 A;  4PMY A;  1JZ6 A;  1I60 A;  3WQD A;  2REQ B;  4H00 A;  2BDQ A;  3E74 A;  3ZT6 A;  4QJ1 A;  4RUB A;  1PHQ A;  4XB3 A;  4TTG A;  2Y4S A;  4N4Q A;  4UTT C;  2H90 A;  1LBL A;  2BXZ A;  3N6J A;  1DQX A;  4UQB A;  3L0N A;  4HOZ A;  2PLC A;  1P0E A;  3N12 A;  3TTE A;  5C9Z A;  2ABB A;  1XGD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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